Научная статья на тему 'Программный комплекс управления клиническими данными трансплантации гемопоэтических стволовых клеток'

Программный комплекс управления клиническими данными трансплантации гемопоэтических стволовых клеток Текст научной статьи по специальности «Медицинские технологии»

CC BY
522
81
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
Ключевые слова
МЕДИЦИНСКАЯ ИНФОРМАТИКА / ПРОГРАММНЫЕ СРЕДСТВА УПРАВЛЕНИЯ КЛИНИЧЕСКИМИ ДАННЫМИ / ТРАНСПЛАНТАЦИЯ ГЕМОПОЭТИЧЕСКИХ СТВОЛОВЫХ КЛЕТОК / MEDICAL INFORMATICS / SOFTWARE FOR CLINICAL DATA MANAGEMENT / TRANSPLANTATION OF HEMATOPOIETIC STEM CELLS

Аннотация научной статьи по медицинским технологиям, автор научной работы — Абросимов Андрей Борисович, Илюшина Мария Александровна, Шеховцова Жанна Борисовна, Никонов Роман Олегович, Старичкова Юлия Викторовна

Актуальность и цели. Объектом исследования являются сложноструктурированные клинические данные, накапливаемые в процессе оказания высокотехнологичной медицинской помощи с акцентом на трансплантации стволовых клеток. Цель разработки и внедрения программного комплекса оптимизация процессов управления сложноструктурированными клиническими данными и поддержка научно-клинических исследований в области трансплантации гемопоэтических стволовых клеток. Материалы и методы. Исследовались процессы формирования и накопления сложноструктурированных данных научно-клинического исследования в области трансплантации гемопоэтических клеток. Результаты. Приведен обзор текущего состояния области развития медицинских информационных систем с акцентом на информационные системы управления процессами и клиническими данными в процессах оказания медицинской помощи и проведения научно-клинических исследований. Разработан оригинальный программный комплекс НSСТ СDВ. Отличительной особенностью разработки является реализация надежного версионированного хранилища данных, мощного модульного интерфейса, гибких многоуровневых справочников, модуля аналитической обработки клинических данных и интеграции с лабораторными информационными системами. Приведены результаты внедрения программного комплекса НSСТ СDВ в научно-исследовательскую деятельность отделений трансплантации гемопоэтических стволовых клеток ФГБУ «Федеральный научно-клинический центр детской гематологи, онкологии и иммунологии имени Дмитрия Рогачева» Минздрава России. Выводы. Результаты внедрения программного комплекса НSСТ СDВ на примере отделений трансплантаций гемопоэтических стволовых клеток ФГБУ «Федеральный научно-клинический центр детской гематологи, онкологии и иммунологии имени Дмитрия Рогачева» Минздрава России показали эффективность применения информационных систем управления клиническими данными как средств поддержки процессов проведения научно-клинических исследований и организации сбора сложноструктурированных данных конкретного научно-клинического исследования.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по медицинским технологиям , автор научной работы — Абросимов Андрей Борисович, Илюшина Мария Александровна, Шеховцова Жанна Борисовна, Никонов Роман Олегович, Старичкова Юлия Викторовна

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

SOFTWARE FOR MANAGING CLINICAL DATA ON TRANSPLANTATON OF HEMATOPOIETIC STEM CELLS

Background. The research object is highly structured clinical data accumulated in the process of high-tech medicine with a focus on stem cell transplantation. The purpose of development and implementation of the program complex is optimization of processes of management of complicated-structured clinical data and support of scientific research in the field of hematopoietic stem cells. Materials and methods. The authors researched the processes of formation and accumulation of complexly structured data of scientific and clinical research in the field of hematopoietic stem cell transplantation. Results. The article provides an overview of the current state of development of medical information systems with an emphasis on information systems management processes and clinical data in the process of providing medical care and conducting scientific and clinical research. The researchers have developed an original software complex HSCT CDB. A distinctive feature of development is implementation of a reliable versioning data storage, a powerful modular interface, flexible multi-level directories, a module for analytical processing of clinical data and integration with laboratory information systems. The article gives the results of the HSCT CDB program implementation into research activities of divisions of hematopoietic stem cells transplantation at «FSCC PHOI n.a. Dmitry Rogachev» of the Ministry of Healthcare of the Russian Federation. Conclusions. The results of the HSCT CDB program complex implementation on the example of divisions of hematopoietic stem cells transplantation at «FSCC PHOI n.a. Dmitry Rogachev» of the Ministry of Healthcare of the Russian Federation has shown the effectiveness of clinical data management systems as a means to support the processes of conducting research and clinical trials and organizing collection of complexly structured data for certain scientific investigations.

Текст научной работы на тему «Программный комплекс управления клиническими данными трансплантации гемопоэтических стволовых клеток»

УДК 004.9:616-006.6

А. Б. Абросимов, М. А. Илюшина, Ж. Б. Шеховцова, Р. О. Никонов, Ю. В. Старичкова, М. А. Масчан, А. Г. Румянцев

ПРОГРАММНЫЙ КОМПЛЕКС УПРАВЛЕНИЯ КЛИНИЧЕСКИМИ ДАННЫМИ ТРАНСПЛАНТАЦИИ ГЕМОПОЭТИЧЕСКИХ СТВОЛОВЫХ КЛЕТОК

Аннотация.

Актуальность и цели. Объектом исследования являются сложноструктурированные клинические данные, накапливаемые в процессе оказания высокотехнологичной медицинской помощи с акцентом на трансплантации стволовых клеток. Цель разработки и внедрения программного комплекса - оптимизация процессов управления сложноструктурированными клиническими данными и поддержка научно-клинических исследований в области трансплантации гемопоэтических стволовых клеток.

Материалы и методы. Исследовались процессы формирования и накопления сложноструктурированных данных научно-клинического исследования в области трансплантации гемопоэтических клеток.

Результаты. Приведен обзор текущего состояния области развития медицинских информационных систем с акцентом на информационные системы управления процессами и клиническими данными в процессах оказания медицинской помощи и проведения научно-клинических исследований. Разработан оригинальный программный комплекс HSCT CDB. Отличительной особенностью разработки является реализация надежного версионированного хранилища данных, мощного модульного интерфейса, гибких многоуровневых справочников, модуля аналитической обработки клинических данных и интеграции с лабораторными информационными системами. Приведены результаты внедрения программного комплекса HSCT CDB в научно-исследовательскую деятельность отделений трансплантации гемопоэтических стволовых клеток ФГБУ «Федеральный научно-клинический центр детской гематологи, онкологии и иммунологии имени Дмитрия Рогачева» Минздрава России.

Выводы. Результаты внедрения программного комплекса HSCT CDB на примере отделений трансплантаций гемопоэтических стволовых клеток ФГБУ «Федеральный научно-клинический центр детской гематологи, онкологии и иммунологии имени Дмитрия Рогачева» Минздрава России показали эффективность применения информационных систем управления клиническими данными как средств поддержки процессов проведения научно-клинических исследований и организации сбора сложноструктурированных данных конкретного научно-клинического исследования.

Ключевые слова: медицинская информатика, программные средства управления клиническими данными, трансплантация гемопоэтических стволовых клеток.

A. B. Abrosimov, M. A. Ilyushina, Zh. B. Shekhovtsova, R O. Nikonov, Yu. V. Starichkova, M. A. Maschan, A. G. Rumyantsev

SOFTWARE FOR MANAGING CLINICAL DATA ON TRANSPLANTATON OF HEMATOPOIETIC STEM CELLS

Abstract.

Background. The research object is highly structured clinical data accumulated in the process of high-tech medicine with a focus on stem cell transplantation. The purpose of development and implementation of the program complex is optimization of processes of management of complicated-structured clinical data and support of scientific research in the field of hematopoietic stem cells.

Materials and methods. The authors researched the processes of formation and accumulation of complexly structured data of scientific and clinical research in the field of hematopoietic stem cell transplantation.

Results. The article provides an overview of the current state of development of medical information systems with an emphasis on information systems management processes and clinical data in the process of providing medical care and conducting scientific and clinical research. The researchers have developed an original software complex HSCT CDB. A distinctive feature of development is implementation of a reliable versioning data storage, a powerful modular interface, flexible multi-level directories, a module for analytical processing of clinical data and integration with laboratory information systems. The article gives the results of the HSCT CDB program implementation into research activities of divisions of hematopoietic stem cells transplantation at «FSCC PHOI n.a. Dmitry Rogachev» of the Ministry of Healthcare of the Russian Federation.

Conclusions. The results of the HSCT CDB program complex implementation on the example of divisions of hematopoietic stem cells transplantation at «FSCC PHOI n.a. Dmitry Rogachev» of the Ministry of Healthcare of the Russian Federation has shown the effectiveness of clinical data management systems as a means to support the processes of conducting research and clinical trials and organizing collection of complexly structured data for certain scientific investigations.

Key words: medical informatics, software for clinical data management, transplantation of hematopoietic stem cells.

1. Информационные системы управления процессами

и клиническими данными в процессах оказания медицинской помощи и проведении научно-клинических исследований

В настоящее время происходит активная трансформация здравоохранения и подходов к оказанию медицинской помощи. Как отдельный класс медицинской помощи выделяют высокотехнологичную медицинскую помощь (ВМП) с применением высоких медицинских технологий для лечения сложных заболеваний [1]. В процессе реализации ВМП важную роль играет внедрение информационных технологий оптимизации и поддержки процессов, накопления и анализа данных, экспертные системы, интеграция инструментальных средств, специальные средства человеко-машинного взаимодействия. Задачи, сформулированные на стыке медицины и компьютерных наук, оформились и активно развиваются как одно из направлений развития прикладной науки - медицинская информатика [2]. Одним из важнейших направлений медицинской информатики является комплексное решение задач управления клиническими данными процессов оказания медицинской помощи и проведение научно-клинических исследований. Внедрение информационных технологий в медицине уже более 40 лет (международная ассоциация медицинской информатики была основана в 1967 г. [2]) является очень популярным и приносящим все большую отдачу направлением, что позволило унифицировать и упорядочить огромный объем биологических и клинических

данных, резко повысив качество их анализа. Все эти данные накапливаются в медицинских информационных системах (МИС), автоматизирующими процессы оказания медицинской помощи. В частности, наиболее объемные неструктурированные данные в медицине представлены историями болезни, ежедневно пополняемыми врачами, включая анамнезы, эпикризы, текстовые части осмотров, назначений и др. МИС выделились в крупный класс корпоративных информационных систем в области здравоохранения, а их рынок растет очень быстро [3].

Особое место при организации ВМП занимает организация и проведение научно-клинических исследований (НКИ) как основной инструмент изучения и повышения эффективности новых методов диагностики, лечения, медицинской реабилитации и других медицинских вмешательств [4]. Рассмотрим область организации и проведения НКИ, представляющие собой научно обоснованные экспериментальные клинические исследования лекарственных средств и их комбинаций, протоколов лечения, методов лечения, популяционные (исследования в определенных группах населения страны, округа, субъекта Федерации) [5], требующие информационно-технической поддержки при организации сбора структурированных данных конкретного исследования, обеспечения доступа к информации всем участникам исследования и последующего применения статистического аппарата. Одно из крупнейших международных НКИ - мультицентровое исследование в области трансплантации гемопоэтических стволовых клеток (ТГСК), организованное под эгидой Европейской группы по трансплантации крови и костного мозга (EBMT) [6]. EBMT сформировалась и активно развивается с 1965 г. как одно из крупнейших профильных сообществ специалистов области ТГСК, являясь центром развития ТГСК в части разработки рекомендаций организации трансплантационной службы, организации научных исследований в областях биологических основ ГСК, разделов иммуногенетики, основ и методик HLA-типирования, принципов кондиционирования и ведения пациентов на ранних и поздних сроках после ТГСК, включая профилактику и лечение вирусных инфекций, лечение и профилактику реакции трансплантат против хозяина (РТПХ), иммунотерапию и клеточную терапию после ТГСК, психосоциальных аспектов, протоколы проведения ТГСК с учетом особенностей различных нозологий. Под эгидой EBMT организован мультицентровый реестр трансплантаций, сбор данных и их последующий анализ с применением программных средств. Целью разработки и внедрения информационной системы (ИС) EBMT является поддержка международного мультицентрового научно-клинического исследования в области ТГСК и обеспечение регистрации и хранения данных пациентов с акцентом на конкретный метод лечения с параметрами, ориентированными на конкретное клиническое исследование.

Рассмотрим архитектуру (рис. 1) и особенности реализации ИС EBMT.

ИС EBMT реализована в системе ProMISe (Project Manager Internet Server) с акцентом на цели и задачи мультицентрового исследования без учета особенностей конкретного клинического учреждения. Функционал ИС EBMT обеспечивает возможность клиническим учреждениям, сотрудничающим с EBMT, вносить, просматривать и изменять внесенные конкретным учреждением данные. Отметим, что функция экспорта полных данных исследования EBMT доступна всем учреждениям в формате файловой реляционной базы данных Microsoft Office Access.

З1

<о 3'

ГО

го

3' <о

(л О

го'

о ГО

3 тз с:

и о

Х"

о ^

о о

3 тз с:

05

з

2' 05 05

3'

О

О. О О 3

СП

Клиника (участник исследования)

Данные клинического учреждения

Идентификационная карточка пациента

Персональные данные, и идентификаторы, данные о трансплантации, событии и др.

Исследование

Данные о пациенте, если он вклюячен в проспекхи вное исследование

Диагноз

Содержит данные о диагнозе, но не включает

промежуточные данные

Лечение

Содержит инфорамцию о всех процедурах лечения

Лабораторные исследования

Содержит данные о результатах лабораторных исследований

ЕВМТ

исследование

Данные о пациенте, если он вклюячен в ЕВМТ исследование

Л С ^

Осложнения Трансппантация

Содержит

данные об

осложнениях,

которые

считаются

следствием

лечения

Данные пациента в процессе трансплантации

Донор

Содержит данные донора.

Групповая иН1А совместимости, сведения одонациях и клеточный состоав трансплантата

Терапия

Данные протокола терапии и сведения о назначениии лекарственных средств

мро-

исследование

ША-тии и ров ан и е

Цигогенетическое исследование

Инфекционный статус

Осложнения после ТГСК

Химиризм

История болезни донора

Рис. 1. Архитектура ИС ЕВМТ: распределение информации между таблицами хранилища данных

ю

Оо ^

N0 О

I

С ■С ГО

0 *

С ГО

1

о ^

с

-8-о

43 §

0 3

с *

С5 <»

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

о; с

3

с

3 §

о-

1

8

I

С *

О

Приведем опыт разработки и внедрения программного комплекса управления клиническими данными трансплантаций гемопоэтических стволовых клеток с учетом особенностей научно-клинического исследования клинического учреждения на примере ФГБУ «Федеральный научно-клинический центр детской гематологи, онкологии и иммунологии имени Дмитрия Рогачева» Минздрава России [7].

2. Программный комплекс управления клиническими данными трансплантации гемопоэтических стволовых клеток

Цель разработки и внедрения программного комплекса управления клиническими данными трансплантации гемопоэтических стволовых клеток (ПК HSCT CDB) [8] - хранение, сбор и аналитическая обработка клинических данных пациентов, лечение которых проводилось методом ТГСК с учетом рекомендаций ведущих организаций в области доказательной медицины, международной ассоциации детских онкологов, законодательной базы Министерства здравоохранения Российской Федерации в области клинической деятельности, особенностей и потребностей ФГБУ «Федеральный научно-клинический центр детской гематологи, онкологии и иммунологии имени Дмитрия Рогачева» Минздрава России и конкретного научно-клинического исследования. Отметим, что ИС EBMT и ПК HSCT CDB имеют схожую логическую структуру базы данных, что связано с общей предметной областью внедрения ИС.

Основные задачи и особенности реализации ПК HSCT CDB:

1. Надежное версионированное хранилище данных с возможностью гибкой первоначальной настройки и изменения схемы данных без потери ранее внесенных данных.

2. Механизм предоставления доступа к данным и внешним функциям системы согласно ролевой модели. Создание удобного интерфейса с пользователем и реализация мощного модульного интерфейса и гибких многоуровневых справочников.

3. Механизмы аналитической обработки данных, генераторы отчетов, графического представления.

4. Развитые инструменты импорта/экспорта данных.

5. Интеграция с внешними ИС с акцентом на лабораторные информационные системы.

Для решения вышеперечисленных задач для реализации ПК HSCT CDB была выбрана архитектура web-приложения, включающая в себя хранилище данных, серверное приложение и доступный через web-браузер интерфейс доступа к ИС (рис. 2).

В качестве основного хранилища данных была выбрана документо-ориентированная система управления данными MongoDB [9]. Информация в данной системе представлена в виде документов, описываемых в близком к спецификации JSON формате, что не требуется обязательного описания схемы таблиц и позволяет обеспечить гибкость первоначальной настройки и изменение схемы структуры хранения данных при модификации модели предметной области. База данных проекта содержит следующие коллекции документов: dictionaries - справочники; entities - сущности предметной области и их структура: поля, связи; history_trackers - журнал изменений; records -

непосредственно клинические данные; users - пользователи информационной системы.

Рис. 2. Архитектура и компоненты ПК HSCT CDB

На уровне приложения, реализованного на языке программирования Ruby (версии 2.2), разработана функциональность обработки и контроль корректности данных, авторизация пользователей системы, ведение журнала событий, вычисление производных полей, формирование интерфейса системы и взаимодействие с внешними источниками данных ПК HSCT CDB.

Интерфейс с пользователем ИС реализован как web-приложение с набором доступных web-страниц, код которых формируется приложением

ИС на языке HTML на основе шаблонов на языке Slim. Для реализации динамических элементов интерфейса с пользователем используется код на языке программирования JavaScript, соответствующий стандартам ECMAScript 5.1 и ECMAScript 2015.

Рассмотрим основные сценарии использования ПК HSCT CDB, реализацию основного функционала и примеры интерфейса с пользователем. Для обеспечения контроля доступа к клиническим данным ПК HSCT CDB содержит модуль авторизации пользователей, обеспечивающий получение доступа к системе. Пользователь, прошедший данный этап, получает доступ к основному функционалу ПК HSCT CDB; полученный в процессе авторизации уникальный идентификатор будет записан в журнале редактирования клинических данных (рис. 3).

гж

/ Р] Клиническая база даннь Ж '

C D rpdtOl.fccho-moscow.ru/rec

Список записей

Создать запись

Фильтр Зкспор

Количество записе!

Имя

Мялхазни

Эльвира

Сандуй

Артур

Михаил

Михаил

Дата

рождения

01.01.1898 18.06 1993 22.10 1997 02.07.2006 02.02 2011 02.02.2011

Диагно

в-олл

В-ОЛЛ

я база j.j п.

О D rpdt01.fccho-moscow.rj/changes

Клиническая база данных ТГСК Г

Дата Событие r^b30B3Tej

2015-10-16 23:43:36 update milushina

2015-10-16 23:41:17 update milu&hina

2015-10-16 15:57:44 update zshekhovtsovi

2015-10-16 14:00:18 update zshekhovtsovi

Миелодисппатмческий синдром

Острый миело&астный лейкоз Ювеннпьный мнепомоноцнтарный лейкоз Ювенильный миеломоноцитарный лейкоз

CR2 AD

G rpdt01.fccho-moscow.ru; <линическая база данных ТГСК Е

Авторизация

Логин

Пароль

Рис. 3. Интерфейс авторизации пользователя, журнал редактирования клинических данных, настройка рабочего стола

После прохождения авторизации функционал ПК HSCT CDB предусматривает два основных сценария использования:

1. Создание, редактирование, удаление и просмотр записей пациента.

2. Аналитическая обработка и экспорт данных для последующего анализа результатов.

Интерфейсы с пользователем модуля создания и редактирования записей пациентов содержат следующие типы полей: текстовые, числовые, даты, выпадающие списки с возможностью выбора одного или нескольких значений из справочников, расчетные поля (рис. 4).

Приведем набор основных разделов и полей ПК HSCT CDB, реализованных в структуре модулей ПК HSCT CDB (рис. 5). Архитектура и реализация ПК HSCT CDB позволяет реализовать гибкую первоначальную настройку схемы данных и ее изменение без потери ранее внесенных данных.

Отметим, что количество полей, содержащих текстовую информацию и неформализованных в справочники, минимизировано, что позволило максимально повысить качество данных для последующего их анализа.

rn

<Q

3' re re

<o

o fo'

o re

y> ?

3

T3

c <-+■

re (/>

Q

re'

o o

o 3

T3

c

re <Q

3'

re re

<o

Q

a.

o

o

3

a

o

g ■J\

a a i?

a

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

sS o

5

a X ta 02

ta O

fa o

a a

a o

E »

X a

a E X

« ta

X w

in to

O a¡

H ti o

O M

o a

tü a

o

ti

O)

at

i!l!

!fff|¡ . ni lili

i l=fl 11 s. n E 5 si

3! 1 = «

'II !

Ip

B

II!

i S S i i I

a!

O B = ?.

S | S

a i g

9 S g

* ¡U jjl

í!f s ?

.....

£ 3

s s 5 S

líf !h >i II

3 1111 i

¡j1J.il 1 i 1 Mí h i jji 8 1 l| =

II ¡t!

a a s i =

•¡í I

i ta S = I l|l

í

I»i ™ £ a

I i

B Isa

a ¥11

0 = Q => > I 3

mil 111 »SajMl

1 ¡ ¡1 I|

s h ? 1 !

SOI

1 0 1

i S ™ id

»ti É.

1« SI g 1 s

¡ í ji £

ala a| f 5

a¡ | í

i i

í

ft

' i *|f ifl .a i ||| lili

lililí ¡ifl!

gjq oj-e-sx; ^ a s ©

3 ¡I I I íi 1 i

I i íI? i ¡i¡I

0 o ÍÍ qf » s } •

1 ií¡1 iSí

í i s g 1 -g í í¡ I¡ f! ¡f

3 = ° «

III

II

1 * í

¡¡

3 "q i j o -¡llsi

i 3 ...

1 i" 1' I

¡!¡l ¡SM

¡J i if

¡lili!¡fl lililí ¡h f a||¡ ¡ ¡-ii ff^ii

lili la;; 5 |

¡h ! s g °> 3

í Idj

¡ i 11 h w » a

i 3 i i

lili • 3 ' lili 'ilií fifi

¡l|s 3B| I¡|a i i

&11 ¡ í [

¡ti

i ¡1

¡I¡

i I? MI

a

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

o

s

a

H

a> V

e-

a¡ St o o o

ti PS

a

ta

a¡ ta PS

3

o »

a

a

o

at a

PS G

a

a

H

o »

lo l-i

Uj Nj

s

ai

I

c

re

0 X: C re

1

Q ^

C ?

-8-

0

1 Q

3 c

X: Cj

OD o;

c

s

c

§

o-

I §

s

Q

Рассмотрим реализацию классификатора диагнозов ПК ШСТ СББ -элемент, объединяющий высокие требования к уровню формализации предметной области, удобству интерфейса с пользователем и гибкости в реализации справочников (рис. 6).

О Опухоли оболочек

Опухоли из меникготелиальных клеток \

О Атипическая менингиома О Анапластическая менингиома

О Менингиома

ВОЗ классификация опухолей ЦНС

Combined immunodeficiencies

О Combined immunodeficiencies unspecified О Ottoer combined immunodeficiencies

T-B+ Severe Combined immunodeficiency (SCID) >

О Острый монобластный лейкоз (М5) v

О Острый монобластный лейкоз (М5а) О Острый моноцитарный лейкоз (М5Ь)

О Острый эритроидный лейкоз (Мб)

Острый мегакариобластный лейкоз (М7)

SCETIDE классификатор иллму н о де ф и цито в

РАВ система классификации ОМЛ

Рис. 6. Пример реализации классификатора диагнозов

Базовыми источниками для структуры классификатора диагнозов являются Международная классификация болезней и проблем, связанных со здоровьем (МКБ), Франко-американско-британская классификация, 8СЕТГОЕ классификация иммунодефицитов [9]. В качестве дополнения реализованы справочники клинических диагнозов с утонениями параметров заболевания с акцентом на специфику клинического учреждения [10, 11].

Приведем основные результаты внедрения ПК И8СТ СББ.

3. Результаты внедрения программного комплекса управления клиническими данными трансплантаций гемопоэтических стволовых клеток

Рассмотрим основные результаты и полноту введения исследования в области ТГСК с применением ПК И8СТ СББ на примере статистических данных работы отделений ТГСК ФГБУ «ФНКЦ ДГОИ имени Дмитрия Рога-чева» Минздрава России в период 2012-2015 гг. из медицинской информационной системы и данных количества записей по пациентам ПК И8СТ СББ.

Сравнительный анализ показал, что число записей пациентов в МИС соответствует числу записей ПК И8СТ СББ, что подтверждает полноту данных исследования (рис. 7).

Приведем пример анализа клинических данных, хранящихся в ПК И8СТ СББ, что позволит оценить их качество. В качестве примера взято исследование: ТГСК с применением деплеции популяции ТСЯа1рЬа/Ье1а и СБ19 лимфоцитов, выполненная пациентам с диагнозом апластическая анемия сверхтяжелой формы от неродственных и гаплоидентичных доноров. В этом исследовании был реализован новый метод обработки трансплантата -ТСЯа1рЬа/Ье1а и СБ19 деплеция, цель - уменьшение риска развития реакции РТ ПХ и повышение выживаемости в группе пациентов рефрактерных к проводимой ранее терапии. В группу исследования вошли: 26 пациентов, из которых 16 мальчиков, 10 девочек. Из всей группы пациентов 20 получили

ТГСК от неродственных доноров, 6 - от гаплоидентичных. Все пациенты группы получили одинаковое кондиционирование. Для каждой из задач были построены функции дожития и кумулятивного риска. Данные функции являются ключевыми показателями оценки подобных задач.

Рис. 7. Сравнительный анализ количества данных о ТГСК, проведенных в отделениях ТГСК и количества записей по пациентам в ПК ИБСТ СББ за 2012-2015 гг.

На рис. 8 представлена диаграмма Каплан - Майера бессобытийной выживаемости у пациентов, получивших данный вид терапии. Кривая отражает значение в 82 и 83 % соответственно при ТГСК от неродственных или гаплоидентичных доноров.

»мио Ьар1о

Рис. 8. График функции дожития

На рис. 9 представлен график кумулятивного риска развития реакции РТПХ, демонстрирующий низкий уровень развития клинически значимой РТПХ. Таким образом, можно сделать вывод, что данный вид процессинга трансплантата является весьма эффективным способом профилактики развития РТ ПХ и может использоваться при ТГСК от альтернативных доноров.

1 1,5

years

Рис. 9. График кумулятивного риска

Приведены результаты показавшие, что внедрение ПК И8СТ СББ позволяет значительно упростить процесс сбора, хранения и оценки полученных клинических данных ТГСК.

Заключение

Приведен обзор текущего состояния области развития медицинских информационных систем с акцентом на информационные системы управления процессами и клиническими данными в процессах оказания медицинской помощи и проведения научно-клинических исследований. Разработан оригинальный программный комплекс И8СТ СББ. Целью разработки и внедрения программного комплекса И8СТ СББ является оптимизация процессов управления сложноструктурированными клиническими данными и поддержка научных исследований в области трансплантаций гемопоэтических стволовых клеток. Отличительной особенностью разработки является реализация надежного версионированного хранилища данных, мощного модульного интерфейса, гибких многоуровневых справочников, модуля аналитической обработки клинических данных и интеграции с лабораторными информационными системами.

Приведены результаты внедрения программного комплекса И8СТ СББ в научно-исследовательскую деятельность отделений трансплантации гемо-поэтических стволовых клеток ФГБУ «ФНКЦ ДГОИ имени Дмитрия Рогаче-ва» Минздрава России. Результаты внедрения программного комплекса И8СТ СББ на примере отделений трансплантаций гемопоэтических стволо-

вых клеток ФГБУ «ФНКЦ ДГОИ имени Дмитрия Рогачева» Минздрава России показали эффективность применения информационных систем управления клиническими данными как средств поддержки процессов проведения научно-клинических исследований и организации сбора сложноструктурированных данных конкретного научно-клинического исследования.

Список литературы

1. Приказ Минздрава России от 22 августа 2013 г. № 588н. - URL: http://medafarm.ru/sites/default/files/Prikaz_588n_ot_22.08.2013.pdf

2. Международная ассоциация медицинской информатики (IMIA). - URL: http://www.imia-medinfo.org (дата обращения: 11.10.2015).

3. Annual Report of the U.S. Hospital IT Market, HIMSS Analytics, 2013. - URL: http://apps.himss.org/foundation/docs/2013HIMSSAnnualReportDorenfest.pdf (дата обращения: 20.09.2014).

4. Международный реестр клинических исследований. - URL: https://clinicaltrials.gov/ (дата обращения: 15.09.2014).

5. Принципы и инструменты доказательной медицины в детской гематологии/онкологии / А. Г. Румянцев, С. Р. Варфоломеева, Н. С. Грачев, А. И. Карачун-ский, Г. А. Новичкова // Доктор.Ру. - 2015. - № 10. - С. 6-13.

6. Европейская группа по трансплантации костного мозга (EBMT). - URL: http://www.ebmt.org/ (дата обращения: 15.09.2014).

7. Федеральное государственное бюджетное учреждение «Федеральный научно-клинический центр детской гематологи, онкологии и иммунологии имени Дмитрия Рогачева». - URL: http://www.fnkc.ru.

8. Свидетельство о государственной регистрации программы для ЭВМ. Управление клиническими данными трансплантаций гемопоэтических стволовых клеток / Никонов Р. О., Абросимов А. Б., Старичкова Ю. В., Шеховцова Ж. Б., Илюшина М. А., Масчан М. А., Масчан А. А. - № 2015616430 ; опубл. 09.06.2015.

9. MongoDB mongodb.org. - URL: http:// mongodb.org (дата обращения: 15.09.2014).

10. International Classification of Diseases (ICD). - URL: http://www.who.int/ classifications/icd/en (accessed: 20 September 2015).

11. Незнанов, А. А. Развитие классификации клинических диагнозов в медицинских информационных системах / А. А. Незнанов, Ю. В. Старичкова // Бизнес-информатика. - 2015. - № 2 (32). - С. 39-47.

References

1. Prikaz Minzdrava Rossii ot 22 avgusta 2013 g. № 588n [The order of the Russian Ministry of Healthcare from 22 August 2013 №588n]. Available at: http://medafarm.ru/sites/default/files/Prikaz_588n_ot_22.08.2013.pdf

2. Mezhdunarodnaya assotsiatsiya meditsinskoy informatiki (IMIA) [International Medical Informatics Association]. Available at: http://www.imia-medinfo.org (accessed 2015, October 11).

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

3. Annual Report of the U.S. Hospital IT Market, HIMSS Analytics, 2013. Available at: http://apps.himss.org/foundation/docs/2013HIMSSAnnualReportDorenfest.pdf (accessed 2014, September 20).

4. Mezhdunarodnyy reestr klinicheskikh issledovaniy [International register of clinical research]. Available at: https://clinicaltrials.gov/ (accessed 2014, September 15).

5. Rumyantsev A. G., Varfolomeeva S. R., Grachev N. S., Karachunskiy A. I., Novichko-va G. A. Printsipy i instrumenty dokazatel'noy meditsiny v detskoy gema-tologii/onkologii

[Principles and instruments of evidence-based medicine in pediatric hematolo-gy/oncology]. Doktor.Ru. 2015, no. 10, pp. 6-13.

6. Evropeyskaya gruppa po transplantatsii kostnogo mozga (EBMT) [European society for blood and marrow transplantation]. Available at: http://www.ebmt.org/ (accessed 2014, September 15).

7. Federal'noe go sudarstvennoe byudzhetnoe uchrezhdenie «Federal'nyy nauchno-klinicheskiy tsentr detskoy gematologi, onkologii i immunologii imeni Dmitriya Roga-cheva» [Federal research and clinical center of pediatric hematology, oncology and immunology named after Dmitry Rogachev]. Available at: http://www.fnkc.ru.

8. Svidetel'stvo o gosudarstvennoy registratsii programmy dlya EVM. Upravlenie klinich-eskimi dannymi transplantatsiy gemopoeticheskikh stvolovykh kletok [The certificate of computer software registration. Management of clinical data on transplantation of hemopietic stem cells]. Nikonov R. O., Abrosimov A. B., Starichkova Yu. V., Shekhovtsova Zh. B., Ilyushina M. A., Maschan M. A., Maschan A. A. № 2015616430; publ. 09 June 2015.

9. MongoDB mongodb.org. Available at: http:// mongodb.org (accessed 2014, September 15).

10. International Classification of Diseases (ICD). Available at: http://www.who.int/ classifications/icd/en (accessed 2015, September 20).

11. Neznanov A. A., Starichkova Yu. V. Biznes-informatika [Business informatics]. 2015, no. 2 (32), pp. 39-47.

Абросимов Андрей Борисович аспирант, Федеральный научно -клинический центр детской гематологии, онкологии и иммунологии имени Дмитрия Рогачева (Россия, г. Москва, ул. Саморы Машела, 1)

E-mail: [email protected]

Илюшина Мария Александровна аспирант, Федеральный научно -клинический центр детской гематологии, онкологии и иммунологии имени Дмитрия Рогачева (Россия, г. Москва, ул. Саморы Машела, 1)

E-mail: [email protected]

Шеховцова Жанна Борисовна

научный сотрудник, отдел оптимизации лечения и профилактики осложнений трансплантаций гемопоэтических стволовых клеток, Федеральный научно-клинический центр детской гематологии, онкологии и иммунологии имени Дмитрия Рогачева (Россия, г. Москва, ул. Саморы Машела, 1)

E-mail: [email protected]

Abrosimov Andrey Borisovich Postgraduate student, Federal research and clinical center of pediatric hematology, oncology and immunology named after Dmitry Rogachev (1 Samory Mashela street, Moscow, Russia)

Ilyushina Mariya Aleksandrovna Postgraduate student, Federal research and clinical center of pediatric hematology, oncology and immunology named after Dmitry Rogachev (1 Samory Mashela street, Moscow, Russia)

Shekhovtsova Zhanna Borisovna Researcher, division of treatment optimization and prophylaxis of hemopoietic stem cell transplantation complications, Federal research and clinical center of pediatric hematology, oncology and immunology named after Dmitry Rogachev (1 Samory Mashela street, Moscow, Russia)

Никонов Роман Олегович аспирант, Московский технологический университет (Россия, г. Москва, проспект Вернадского, 78)

E-mail: [email protected]

Старичкова Юлия Викторовна

кандидат технических наук, заведующий отделом математических методов и информационных технологий, Федеральный научно-клинический центр детской гематологии, онкологии и иммунологии имени Дмитрия Рогачева (Россия, г. Москва, ул. Саморы Машела, 1)

E-mail: [email protected]

Масчан Михаил Александрович

доктор медицинских наук, профессор, заведующий отделом оптимизации лечения и профилактики осложнений трансплантаций гемопоэтических стволовых клеток, Федеральный научно-клинический центр детской гематологи, онкологии и иммунологии имени Дмитрия Рогачева (Россия, г. Москва, ул. Саморы Машела, 1)

E-mail: [email protected]

Румянцев Александр Григорьевич

доктор медицинских наук, академик РАН, генеральный директор, Федеральный научно-клинический центр детской гематологи, онкологии и иммунологии имени Дмитрия Рогачева (Россия, г. Москва, ул. Саморы Машела, 1)

E-mail: [email protected]

Nikonov Roman Olegovich

Postgraduate student, Moscow Technological University (78 Vernadskogo avenue, Moscow, Russia)

Starichkova Yuliya Viktorovna Candidate of engineering sciences, head of division of mathematical methods and information technologies, Federal research and clinical center of pediatric hematology, oncology and immunology named after Dmitry Rogachev (1 Samory Mashela street, Moscow, Russia)

Maschan Mikhail Aleksandrovich Doctor of medical sciences, professor, head of division of treatment optimization and prophylaxis of hemopoietic stem cell transplantation complications, Federal research and clinical center of pediatric hematology, oncology and immunology named after Dmitry Rogachev (1 Samory Mashela street, Moscow, Russia)

Rumyantsev Aleksandr Grigor'evich Doctor of medical sciences, academician of RAS, general manager, Federal research and clinical center of pediatric hematology, oncology and immunology named after Dmitry Rogachev (1 Samory Mashela street, Moscow, Russia)

УДК 004.9:616-006.6

Программный комплекс управления клиническими данными трансплантации гемопоэтических стволовых клеток / А. Б. Абросимов, М. А. Илюшина, Ж. Б. Шеховцова, Р. О. Никонов, Ю. В. Старичкова, М. А. Масчан, А. Г. Румянцев // Известия высших учебных заведений. Поволжский регион. Технические науки. - 2016. - № 1 (37). - С. 64-77.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.