Научная статья на тему 'Популяционный полиморфизм эфедры хвощевой'

Популяционный полиморфизм эфедры хвощевой Текст научной статьи по специальности «Биологические науки»

CC BY
519
66
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
Ключевые слова
E. EQUISETINA / ЭФЕДРА / БИОЛОГИЧЕСКИ АКТИВНЫЕ ДОБАВКИ / ЭФЕДРИН / АЛКАЛОИД / ТОНКОСЛОЙНАЯ ХРОМАТОГРАФИЯ / СИЛУФОЛОВЫЕ ПЛАСТИНКИ / БИОЛОГИЯЛЫқ БЕЛСЕНДі қОСПАЛАР / ЖұқА қАБАТТЫ ХРОМАТОГРАФИЯ / СИЛУФОЛДЫ ПЛАСТИНКАЛАР / EPHEDRA / BIOLOGICALLY ACTIVE ADDITIVES / EPHEDRINE / ALKALOID / THIN-LAYER CHROMATOGRAPHY / SILIFOL PLATES

Аннотация научной статьи по биологическим наукам, автор научной работы — Кожамжарова Л. С., Кожамжарова А. С., Есимсеиитова З. Б.

Изучены популяции эфедры хвощевой E. equisetina. на юго-востоке Казахстана. Показаны различия между популяциями по продуктивности, накоплению алкалоидов эфедрина и псевдоэфедрина, компонентному составу пероксидазы, неспецифичной эстеразы и кислой фосфатазы. Обнаружены различие между популяциями в структуре ДНК. Применение нуклеотидных и изоферментных маркеров позволило предположить, что исследованные популяции различаются друг от друга генетически.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по биологическим наукам , автор научной работы — Кожамжарова Л. С., Кожамжарова А. С., Есимсеиитова З. Б.

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

POPULATIONAL POLYMORPHISM OF THE EPHEDRA

Biochimical features of the different populatious of Ephedra equisetina was studied. It was found that on south-east part of Kazakhstan concentration of alkaloids, ephedrine, pseudoephedrin, compound complex of acid phosphatase, peroxidase, nonspecific esterase differ in different population. Analisis of DNA structure by RAPD-methode showed specific complex of acuplicons in ezch population. Proposed than the population task difference on genetical leril.

Текст научной работы на тему «Популяционный полиморфизм эфедры хвощевой»

УДК 31.27.21

Л.С.Кожамжарова, А.С.Кожамжарова, * З.Б.Есимсеиитова**

Таразский Государственный университет имени М.Х.Дулати *Казахский Национальный медицинский университет имени СД.Асфендиярова **Казахский Национальный университет имени аль-Фараби

ПОПУЛЯЦИОННЫЙ ПОЛИМОРФИЗМ ЭФЕДРЫ ХВОЩЕВОЙ

Изучены популяции эфедры хвощевой Е. вдш8випа. на юго-востоке Казахстана. Показаны различия между популяциями по продуктивности, накоплению алкалоидов эфедрина и псевдоэфедрина, компонентному составу пероксидазы, неспецифичной эстеразы и кислой фосфатазы. Обнаружены различие между популяциями в структуре ДНК. Применение нуклеотидных и изоферментных маркеров позволило предположить, что исследованные популяции различаются друг от друга генетически. Ключевые слова: Е. вдш8випа, эфедра, биологически активные добавки, эфедрин, алкалоид, тонкослойная хроматография, силуфоловые пластинки.

Растения из рода Эфедра привлекают внимание исследователей в связи с высоким содержанием таких биологически активных веществ, как алкалоиды. Эфедрин широко применяется в медицине при гипотонии, послеоперационных шоках, бронхиальной астме, коклюше, сенной лихорадке, крапивнице и других заболеваниях. Эфедра, по сей день является наиболее заготовляемой из всех лекарственных растений.

Запасы эфедры Казахстана достаточно богаты и в лекарственном ресурсоведении это самостоятельное научное направление. Кроме того заросли E. equisetina укрепляют горные склоны, каменистые и щебнистые осыпи, т.е. также эфедра имеет и большое экологическое значение. В связи с этим вопросы рационального использования и сохранности популяций эфедры имеют первостепенное значение [1].

Эфедра относится к подотделу гнетовых голосеменных растений, семейству Ephedraceae, порядку Ephedrales, и роду Ephedra. Это обычно или невысокие, сильно ветвистые кустарники или небольшие деревья высотой до 6 м. Побеги прутьевидные, членистые; листья обычно редуцированные (функция фотосинтеза переходит к молодым ветвям), мелкие, супротивные. Большинство видов накапливает алкалоиды. Эфедрин, используемый в медицине, накапливается только у нескольких видов. В Казахстане произрастает 9 видов эфедры, из которых практическое применение имеют эфедра хвощевая (каз «;ылша»)- Ephedra equisetina Bunge и эфедра средняя Ephedra intermedia, т.к. только в них накапливается большое количество эфедрина.

В последние годы интерес к натуральному сырью из эфедры сильно возрос в связи с тем, что высушенные и растолчённые веточки эфедры являются основным компонентом биологически активны добавкок для похудения. БАДы на основе эфедрина изготавливаются в Китае и других странах юго-восточной Азии и продаются в США и Европе. В другой композиции, в виде чая, эфедра используется для повышения работоспособности и тонуса человека. Этот чай особо популярен в США среди выходцев из Азии. После его употребления человек способен активно работать около 20 часов в сутки [2]. Рынок эфедры огромен. Постоянно приходят заявки в Казахстан на приобретение значительного количества травы. В последние 10 лет не производится заготовка эфедры. Мы не знаем современных запасов эфедры в Казахстане, а самое главное, мы не знаем качества сырья в различных популяциях этого растения. Исходя из этого, основной целью наших исследований являлось изучение популяционного полиморфизма и биохимических особенностей эфедры хвощевой в местах массового её произрастания.

Объекты и методы исследования. Объектом нашего исследования являлась эфедра хвощевая (горная, Е.equisentina Bge.), которую собирали в Алматинской (в Саркандском и Алакольском районах), Жамбылской (Кордайском и Меркенском районах) областях на каменистых склонах гор. Эфедра хвощевая - кустарник до 1,5 м высоты, с серым стволом до 4 см в диаметре. Как исключение встречаются древовидные экземпляры до 2,5 м высот, со стволом до 20 см толщины. Веточки прямые, гладкие, тонкобороздчатые, 1-2 мм в диаметре, с междоузлиями 1,5 - 3 см длины. Листья имеют вид

небольших пленок и располагаются супротивно по два, причем внизу на треть и более срастаются. Растение двудомное: на одних кустах развиваются лишь мужские генеративные органы, на других - женские. Мужские колоски одиночные или скучены по 2-3, на ножках 1-2 мм длины, 2-4-цветковые, 4-5 мм длины, почти шаровидные. Наружные прицветники округлоовальные, притупленные, в основании на треть спайные, тонкие, с узкой окраиной; внутренние- округлые, более длинные. Тычинка едва выставляется, пыльники в числе 6-8, почти сидячие. Женские колоски на прямых или вниз отогнутых ножках, длиной от 1до 12 мм, одноцветковые, с выставляющейся прямой или слегка изогнутой, цельной или лопастной трубочкой. Прицветников 2-3 пары, нижние, широкоовальные, по краю узкоперепончатые, внизу на одну треть спайные; внутренние - спайные на две трети или почти до половины. Зрелые шишкоягоды удлиненные, 67мм длины, красные или оранжевые, мясистые, односемянные. Семена округлые, каштановые, с обеих сторон выпуклые, слегка выступают из шишки, 4-6 мм длины; абсолютный вес семян (1000 штук) - 7-9 г [1,3]. Сбор эфедры производили в июле-августе.

Морфологические различия отдельных особей весьма значительны. Варьируют размеры кустов, толщина ветвей, длина члеников и другие показатели. Цвет ветвей в основном ярко зеленый, но иногда встречаются сизоватые и редко, совершенно сизые ветви. Причина вызывающая сизую окраску, не ясна. Эфедра хвощевая имеет мощную, хорошо развитую корневую систему, благодаря чему может селиться на участках с маломощными почвами, на каменистых и щебнистых осыпях, в расщелинах скал и на других субстратах, мало подходящих для жизни более требовательных растений. Она обычно размножается вегетативно, образуя парциальные кусты [4]. Определение содержания алкалоида. Для количественного определения алкалоидов использовали не общепринятый титрометрический метод, а вариант метода Р.В. Лыковой (1985), усовершенствованный М.Ж. Журиновым и др. (1990 г.) с применением тонкослойной хроматографии на силуфоловых пластинках. Для очистки алкалоидов от примесей их переводили в соответствующие соли и далее в основания. Десорбции алкалоидов с хроматограмм производилась цитратно-фосфатным буфером с рН 8,0. Для проявления алкалоидов применялась качественная реакция с периодатом калия, в результате которой образуется бензальдегид. Концентрация последнего легко определяется спектрофотометрически.

Разделение ферментов. Компонентный состав ферментов определяли с помощю метода изофокусирования в пластинчатом ПААГе [Wrigley, 1968] использовали амфолины с широким рН 3,5-9. Размер пластинки 160х160, ширина трека 4 мм. На каждый трек наносили по 15-20 мкл вытяжки в зависимости от активности. Сила токо 20 мА на пластинку, продолжительность изофокусировали 3 ч. Фермент экстрагировали из хвои 0,05 М ацетатным буфером, рН 5,2. Компоненты пероксидазы в чем проявляли 0,2 мМ бензидином в 0,2 ацетатном буфере, рН 5,2. При этой рН активность пероксидазы максимальна. [6]. Неспецифичной эстеразу проявили в геле - по методу Яаска [7]. Гели инкубировали 30 мин при комнатной температуре в 0,2 М малеинатном буфере с рН 6,0-6,5 для снижения рН

геля, затем окрашивали в смеси, содержащей 2,002 М свежий гексаазотированный основной фуксин и 0,5 мг/мл а-нафтилацетата в 0,1 М малеинатном буфере с конечным рН 6,0-6,5.

Кислую фосфатазу определяли с методом Яаска [8]. Гели инкубировали 30 мин в 0,2 М малеинатном буфере рН 5,2 для снижения рН геля. Затем переносили гель в реакционную смесь, содержащую 0,25 мг/мл 1-нафтилфосфата и 0,001 М гексоазотированного основного фуксина в 0,1 М малеинатном буфере рН 5,0. Выделение ДНК из хвои эфедры. 100 мг сухого растительного материала растирали в ступке вместе с 20 мг окиси алюминия, затем полученный гомогенат переносили в пробирки типа Эппендорф и экстрагировали 700 мкл СТАВ-буфером, содержащим 50мМ трис-HCl, pH 8,0; 0,7 М NaCl; 10 мМ ЭДТА; 1%-ный (по весу) цетилтриметил аммониум бромид (СТАВ) и 20 мМ 2-меркаптоэтанол. Гомогенаты экстрагировали 15 мин при 65°С, периодически перемешивая содержимое пробирки. После 15 минут экстракции пробирки охлаждали при комнатной температуре и добавляли в них равный объем смеси хлороформ:изоамиловый спирт (24:1), осторожно перемешивали и центрифугировали при 8000g при комнатной температуре.

Водные фазы переносили в чистую пробирку и к оставшемуся осадку добавляли 200 мкл буфера для гомогенизации и проводили реэкстрацию. Полученные водные фазы объединяли, добавляли 0.1 объема 10% СТАВ, тщательно перемешивали и депротенизировали смесью хлороформ:изоамиловый спирт. После центрифугирования супернатант отбирали в чистую пробирку типа эппендорф. Для осаждения ДНК к полученной водной фазе добавляли равный объем буфера, содержащего 50мМ трис-HCl pH 8,0; 10 мМ ЭДТА; 1% (по весу) СТАВ. После двухчасовой инкубации осадок, состоящий из комплекса нуклеиновые кислоты: СТАВ осаждали в бакет- роторе при 1500g в течение 10 - 15 мин при комнатной температуре. Полученный осадок подсушивали и растворяли в 1мл 1М NaCl. После полного растворения осадку добавляли равный объем холодного изопропанола. Для получения ДНК через 60 мин пробирки центрифугировали, и полученный осадок ДНК промывали 70% этанолом охлажденным до -20С0 для удаления следов детергента. Осадок подсушивали и растворяли в стерильной, деионизированной воде. Чистоту полученных препаратов ДНК проверяли

электрофоретическим разделением в агарозном геле [15]. Проведение ПЦР реакций использовали двадцать 10-членных случайных праймеров, наиболее подходящими из них являлись следующие: Pr-3 - CCGAATTCGC; Pr-12 -CCGGCACGCA; Pr-15 - GCCTCGCCCA; Pr-23 - GGTGCCGTAC. Реакционная смесь для ПЦР объемом 20 мкм содержала 2.5 ед. Таg-полимеразы (Бион, Россия), 10мМ трис-HCL pH 8.3; 50мМ KCL; 0.01% Tween 20; по 100 млМ dATP, dGTP, dCTP и dTTP ("Pharmacia", Щвеция); 1мкМ праймера; 4мМ MgCl и до 25 ng ДНК.

Амплификацию проводили в программируемом термостате в следующих условиях: 2 цикла: денатурация - 95°, 3мин; отжиг-30°, 1мин; синтез-72°, 1 мин и 35 циклов при значениях соответствующих процессов 94°, 1мин; 37°, 1мин и 72°. Электрофорез проводили в 8%- ном

полиакриламидном геле и анализировали с помощью прибора Gel-Doc фирмы Bio-Rad в проходящем

ультрафиолетовом свете при длине волны от 260 до 360 нм. Генетические дистанции RAPD - спектров для популяций были рассчитаны программным пакетом

Quantity One-4.1.1 (GelDoc, BioRad) и построены генеалогические дендрограммы с помощью невзвешанного парногруппового метода с арифметическим усреднением -UPGMA.[9,15].

Результаты исследования. Морфологические особенности и накопление алкалоидов. Сравнительный анализ накопления алкалоидов в шести образцах хвоии эфедры показал наличие во все образцах алкалоидов эфедрина и псевдоэфедрина. Визуальная оценка тонкослойных хр омото грамм по казала, что эфедрин преобладал в образцах из: а) из ущелья Теректы и б) 61 км от ущелья Теректы, а псевдоэфедрин, который содержался в значительно меньших количествах, преобладал в образцах из ущелья Теректы (вглубь 2 км) и горы Кзыл-тал (у речки). Отмечено, но в очень малых количествах (следы), наличие других алкалоидов с Rf=0,8 и Rf=0,55. По этим алкалоидам выявлены различия между образцами. Например, по алкалоиду с Rf=0,8 между образцами взятыми из точки расположенной в 61 км от ущелья Теректы и горы Кзыл-тал, (у речки). Концентрация этого неидентифицированного алкалоида у них была немного меньше псевдоэфедрина, но выше, чем у других образцов. Различия имеются и по алкалоиду с Rf=0,55. У образца из ущелья Теректы концентрация его была значительнее, чем у других растений. Кроме того, в образце из точки взятой в 61 км от ущелья Теректы отмечено присутствие в ощутимых количествах еще одного не идентифицированного алкалоида с Rf=0,65. У других образцов данный алкалоид отсутствовал.

Спектрофотометрически было показано, что содержание эфедрина у образцов колеблется от 2,16 до 4,6%. Максимальное его количество содержится в образце из ущелья Теректы (4,6%) и горах Кзыл-тал (3,6%). Минимальное - в образце, взятого у горы Кзыл-тал, возле сухого русла реки (2,16%).

Таким образом, образцы эфедры хвощевой содержат группу эфедриновых алкалоидов, в которую входят эфедрин, псевдоэфедрин и другие не идентифицированные алкалоиды. Концентрация их довольно значительная. В среднем около 3%, что свидетельствует о пригодности данных зарослей эфедры для промышленной заготовки. Кроме качественного и количественного определения алкалоидов мы также замеряли морфометрические показатели у растений из различных популяций. В качестве показателей были взяты высота растения, количество побегов, толщина стебля, длина хвои, вес надземной части. Было обнаружено, что наиболее развитыми являются растений из горного массива Кзыл-тал. Их высота составляла 107 см, число побегов - 5, толщина стебля у основания побега - 2,8 см, длина хвои - 24,5 см, вес надземной части куста - 2,4 кг. В массиве эфедры, расположенной в предгорьях близ аула Билжан, ростовые процессы менее активны - высота составляла - 48 см, число побегов - 9, толщина стебля у основания побегов - 0,8 см, длина хвои - 23,5 см, вес надземной части - 0,3 кг. Отсюда следует, что эфедра хвощевая в условиях высокогорья произрастает лучше и превышает по морфометрическим показателям растения, произрастающие в низине. У растений, произрастающих на Кордайском перевале морфометрические показатели ниже, чем у образцов из Джунгарского Алатау. (рис. 1, 2) Анализ накопления эфедрина показал, что его содержание у них не превышает 0,9%.

Таблица 1 - Морфометрические показатели эфедры хвощевой

№ участ. Место произрастания Высота растения (см) Число побегов (см) Толщина стебля у основа-ния (см) Длина листьев (хвои, в см) Вес надземной части (кг)

1 Аул Билжан, (Саркандский р-н) 48± 3,9 9,0± 0,2 0,8± 0,2 23,5± 0,4 0,3±0,1

2 Горы Кызыл-Тал (Саркандский р-н) 107± 2,3 15± 1,3 2,8± 0,6 24,5±0,2 2,4± 0,3

3 Ущелье Теректы 67± 3,1 13± 0,2 2,4± 1,2 11,2± 0,1 0,5± 0,1

(Саркандский р-н)

4 Ущелье Теректы вглубь, 2 км (Саркандский р-н) 80± 1,9 17± 1,8 3,0± 0,9 18,5± 0,1 1,0± 0,2

5 Сухая речка 61 км от ущелья Теректы (Саркандский р-н) 57± 31 10±0,9 1,1± 0,4 18,5± 0,2 0,5± 0,1

6 Горы Кзыл-Тал у речки (Саркандский р-н) 51± 2,9 10± 1,9 1,0± 0,3 21,7± 0,7 0,4± 0,2

7 Курдайский перевал (Джамбульская область) 57 ± 3,9 12 ± 0,4 2,0 ±0,5 26,0±0,5 0,3±0,1

8 Тургеньское ущелье 74 ± 3,9 14 ± 0,3 3,1 ± 1,0 21,0±0,1 1,2±0,3

9 Горы Кетмень 45 ± 1,2 9,1 ± 0,5 2,0 ± 0,1 17,0±0,2 0,8±0,1

Наличие морфологических различий между популяциями эфедры позволило предположить, что они различаются между собой биохимически и генетически. Для выяснения этого вопроса мы использовали молекулярные маркёры: компонентный состав ферментов и структуру ДНК. Компонентный состав ферментов. В веточках эфедры с помощью метода изофокусирования в ПААГе определили компонентный состав пероксидазы, фосфатазы и неспецифичной эстеразы. Было выявлено, что спектр

фермента у неспецифичной эстеразы более гетерогенен [13], чем у других исследуемых ферментов. Число компонентов колеблется от 19 до 21. Различия, в основном, касаются компонентов с нейтральной рН. У «кордайских» образцов число компонентов в спектре - 19. Меньше, чем у образцов из Джунгарского Алатау - варианты 1 и 2. Можно отметить высокую активность компонентов у образцов из вариантов - ущелье Теректы, в начале и в конце ущелья, 114 км от Уш-Арала (рисунок 1).

Рисунок 1

Компонентный состав неспецитфичной эстеразы у популяций эфедры хвощевой. Изофокусирование проводили при рН 4-10. Варианты: 1-ущелье Теректы, вначале, 2-вход в ущелье, 114 км от Уш-Арала, 3- близ аула Билжан, 4-Кзыл тал, у речки, 5-Ущелье Теректы , 2 км вглубь, 6- сухое русло реки, 7-популяция 1 из Кордая, 8- популяций 2 из Кордая.

Компонентный состав кислой фосфатазы у исследуемых популяций также неодинаков. Число компонентов в спектре 17-18. Общее расположение фракций одинаково. Различия касаются 1 компонента в нейтральной рН. Можно отметить неодинаковую активность компонентов в средней части геля (рисунок 2).

Компонентный состав фосфатазы у популяций эфедры хвощевой. Изофокусирование проводили при рН 4-10. Варианты: 1-ущелье Теректы,в начале, 2-вход в ущелье, 114 км от Уш-Арала, 3- близ аула Билжан,, 4-Кзыл-тал, у речки, 5-Ущелье Теректы , 2 км вглубь, 6- сухое русло реки, 7-популяция 1 из Кордая, 8- популяций 2 из Кордая. Компонентный состав пероксидазы у исследуемых образцов также неодинаков. Число компонентов в спектре колеблется

к 2

от 3 до 9. Наиболее гетерогенный спектр у образца из Кордая - 9. Интересно, что спектр пероксидазы менее богатый, чем у неспецифичной эстеразы. Это, обычно, не характерно для видов накапливающих фенольные соединения. У вариантов - ущелья Теректы, в начале и вход в ущелье, 114 км от Уш-Арала - спектр состоит только из 3-х компонентов (рисунок 3).

Рисунок 3

Компонентный состав пероксидазы у популяций эфедры хвощевой. Изофокусирование проводили при рН 4-10. Варианты: 1-ущелье Теректы, вначале, 2-вход в ущелье, 114 км от Уш-Арала, 3- близ аула Билжан,, 4-Кзыл тал, у речки, 5-Ущелье Теректы , 2 км вглубь, 6- сухое русло реки, 7-популяция 1 из Кордая, 8- популяций 2 из Кордая. Попытка проанализировать компонентный состав растворимых белков и полипептидов была неудачной. Полученный экстракт был желеобразным. Выделить белки и полипептиды из этой массы не удалось. Вероятно, происходит связывание белков алкалоидами и образование нерастворимых в растворах со слабой ионной силой комплексов. Чувствительность изоферментного анализа намного выше, белкового, поэтому удалось проявить только ферменты.

Полиморфизм ДНК. Для изучения генетических особенностей исследуемых популяций мы изучали структуру ДНК с помощью ПЦР-анализа. Явление полиморфизма ДНК делает возможным разрешение спорных вопросов систематики и филогении в разных таксономических группах растений [9,11,12]. В ряду существующих молекулярно-генетических методов изучения полиморфизма ДНК центральное место занимает ПЦР анализ основанный на применении произвольных олигонуклеотидов, направленных на обращенные повторяющиеся последовательности (Randomly Amplified Polymorphic DNA - RAPD) [12,14].

RAPD - анализ широко используется для изучения генетического полиморфизма растений. В список растений, исследованных RAPD методом, уже в 2003 году входили представители 150 родов. В настоящее время RAPD-технология отработана на целом ряде сельскохозяйственных культур: капуста, лук, виноград, картофель, томат, морковь, фасоль и ячмень. Она широко используется в изучении растительного генома при конструировании генетических карт, анализе генетической структуры популяции, генотипировании, маркировании признаков, а также в селекционных программах для быстрой идентификации важных для селекции признаков [9, 11,12]. RAPD-технология является уникальным инструментом, позволяющий проводить экспресс-идентификацию любых организмов. Для этого можно использовать один из универсальных праймеров, который даёт возможность детально изучать структуру генома отдельных организмов и генетическую структуру популяции и видов любых организмов по локусам, ранее не подлежащих анализу. Выявленный по ряду праймеров ПЦР полиморфизм может быть использован в качестве генетических маркеров сортов, популяций, особей, клонов и других внутривидовых структур. С помощью кластерных методов анализа осуществляют построение дендрограмм, отражающих степень различий или сходства между RAPD -спектрами исследуемых объектов, что важно для изучения меж- или внутривидовых взаимоотношений. Наиболее широко используются методы UPGMA: невзвешенный парногрупповой метод с арифметическим усреднением [15].

При решении конкретных задач сопоставления геномов с помощью RAPD- метода существует проблема выбора праймера, позволяющего получать достаточно информативные, т.е. содержащие полиморфные фрагменты, RAPD- спектры.[11,15] Из 20 ранее использовавшихся нами при анализе геномов эфедры праймеров только 4 дают полиморфные фрагменты ДНК и вполне пригодны для выявления генетического полиморфизма у популяций эфедры.

Нами было обнаружено, что каждая из исследуемых популяций эфедры имеет специфический спектр RAPD -продуктов, характеризующиеся определенным количеством фрагментов, их размерами и степенью выраженности. Все используемые праймеры эффективно обеспечивали синтез специфических и воспроизводимых наборов фрагментов (ампликонов). Число ампликонов в зависимости от использованного праймера составляло от 5 до 20, их размеры варьировали в пределах 100-2000 пн [14]. Наряду с наличием общих ампликонов, большую часть спектров составляют фрагменты, которые присутствуют в одних и отсутствуют в других геномах. Эти фрагменты являются полиморфными маркерами исследуемых ДНК[11, 12, 15]. На рисунках 6 - 9 представлены RAPD- спектры разных популяция вида E. equisetina, полученные при использовании праймеров инициировавших синтез наибольшего числа полиморфных фрагментов различных линий.

Для количественной оценки RAPD-полиморфизма и определения уровня дивергенции между популяциями, полученные матрицы состояния ампликонов были обработаны программным пакетом Quantity One-4.1.1 (GelDoc, BioRad) и представлены в виде матрицы состояний бинарных признаков. В них наличие или отсутствие в RAPD

- спектрах одинаковых по размеру ампликонов рассматривалось как состояние 1 и 0 соответственно и переводилось в процентное соотношения вариации. По матрицам состояний тем программным пакетом были рассчитаны матрицы различий. При этом использовался коэффициент Жаккарда Dj = Na + Nb/N a + Nb + Nab, где Na -число полос, имеющихся в спектре а, но отсутствующих в спектре b, Nb - число полос в спектре b, но не в спектре а, и Nab

- число полос, общих для обоих спектров. Исходя из этой матрицы, невзвешанным парно-групповым кластерным методом (UPGMA) была построена дендрограммы генетического родства между разными популяциями (рис 8).

Для определения внутривидового полиморфизма были исследованы 5 популяций E. equisetina. Более сходными по генетической дистанции (0.90) были образцы, собранные в популяциях, произрастающих в ущелье Теректы. Распределение коэффициента кластерного сходства с остальными популяциями было равно соответственно: горы Тургень - 0.74; горы Кетмень - 0.68; Кордайский перевал -0.64. Очевидно, что наименьшая дивергенция по RAPD -маркерам, наблюдаемая в популяциях, произрастающих в ущелье Теректы, связана с общностью их происхождения.

1 2 3 4 5 М

1000

450

250

1-Горы Кетмень, 2 - ущ Теректы, 3 - ущ Теректы 4 - Кордайский перевал, 5 - Тургень

Рисунок 4 - ЯАРО-спектры полученные с РЯ-15

1 2 3 4 5 М

1-Горы Кетмень, 2-ущ Теректы, 3-ущ Теректы, 4-Кордайский перевал, 5-Тургень

Рисунок 6 - ЯАРБ-спектры полученные с РЯ-23

1 2 3 4 5 М

тЯ ф

Г

1020

1 2 3 4 5 М

Я

650 600 550 500 450

400 350 300 250

200

150

100

700

11000 — 700

500 450 400

350 300 250 200

150

1-Горы Кетмень,2-ущ Теректы, 3-ущ Теректы, 4-Кордайский

перевал,

5-Тургень

Рисунок 5 - ЯАРБ-спектры полученные с РЯ-3

100

1-Горы Кетмень, 2 - ущ Теректы, 3 - ущ Теректы, 4 Кордайский перевал, 5 - Тургень

Рисунок 7 - ЯАРБ-спектры полученные с РЯ-12

Рисунок 8 - Кластерный анализ состояния ампликонов УРСМА-методом в НАРБ-спектрах 5 популяций Е. equisetina

Таким образом, нами показаны различия между популяциями по продуктивности, накоплению алкалоидов, компонентному составу пероксидазы, неспецифичной эстеразы, кислой фосфатазы и структуре ДНК. Показано, что у популяций эфедры из Джунгарского Алатау накапливается больше алкалоидов и ростовые процессы активнее, чем у растений из других популяций. Достоверные различия

между популяциями также показаны по биохимическим маркерам. Использованные в работе праймеры достаточно надежно дифференцируют популяции Е. equisetina. Применение нуклеотидных и изоферментных маркеров позволило предположить, что исследованные популяции различаются друг от друга генетически.

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

1 Иллюстрированный определитель растений Казахстана. - Алма-Ата.: 1969. Т.1 -С 40-41.

2 www.fito.nnov.ru/special/alkaloids/alkaloids.phtml - 24 k.

3 Атлас ареалов и ресцурсов лекарственных растений СССР. - М.: 1980. -С 334-335.

4 Губанов И А., Синицин Г.С. Биологические и экологические особенности эфедры хвощевой. Тр. Ин-та ботаники. АН КазССР. 1966. -С 1-20.

5 Wrigley J. Jel electrofocusing. A technique analyzing multiple proteins camples by isoelectrofocusing. // Science tools, 1968. V 15. P17-23.

6 Сарсенбаев К.Н., Полимбетова Ф.А. Роль ферментов в устойчивости растений. - Алматы.: Наука, 1986. 184 с.

7 Jasska V, Jasska V. Soluble phosphohydrolases and esterases in maize seedlings.// Eesti NSV TA Toimet. 1968. Т 17. №3. Р 274-283.

8 Jasska V, Genetic polimorhism of acid phosphatase in population of Rye, Secale cereale L. // Eesti NSV TA Toimet. 1979. V 28. N 3. P 185193.

9 Хавкин Э. А. Молекулярные маркеры в растениеводстве // Сельскохозяйственная биология. - 1997. - №5 -C. 3-21.

10 Karp A., Edwards K.J. Molecular techniques in the analysis of the extent and distribution of genetic diversity // Analysis, Characterization and conservation of PGR, P. 11-22.

11 Дорохов Д.Б., Клоке Э. Быстрая и экономичная технология RAPD-анализа растительных геномов // Генетика, 1997, Т.33, -C 476-483.

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

12 Klin Lankhorst R.M., Vermunt A., Weide R. e.a. Isolation of molecular markers for tomato (L.esculentum) using random amplified polymorphic DNAs (RAPDs). // Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1992. V 89. P 1477-1481.

13 Shaw.C.R, Pzasad. R., Starch gel elektrophoresis of enzymes-A complitation of zecipes.,1970. USA P 14-21.

14 Гостимский С.А., Кокаева З.Г., Боброва В.К. Использование молекулярных маркеров для анализа генома растений // Генетика. 1994. Т.35, N11, C. 1538-1549.

15 Маниатис Т. Молекулярное клонирование. - М.: Мир, 1984. - 100 с.

Л.С. Кожамжарова, А.С. кожамжарова,* З.Б. Есимсеиитова**

М.Х.Дулати атындагы Тараз мемлекетт!к университет! *С.ЖАсфендияров атындагы К,азац улттыц медицина университетi **Эл-Фараби атындагы К,азац улттыцуниверситетi

КЫРЬЩБУЫН КЫЛШАНЫН, ПОПУЛЯЦИЯЛЬЩ ПОЛИМОРФИЗМ1

tywh: Казак;станныц оцтустш-шыгыс белшнщ E.equisetina к;ырык;буын к;ылшасыныц популяциясы зерттелшдъ Эфедрин жэне псевдоэфедрин алкалоид жина;тарыныц, пероксидаза, арнайыландырылмаган эстераза жэне ;ышк;ыл фосфатаза компоненттш курамыныц популяция араларындагы айырмашыльщтары корсетшдь Популяция араларындагы айырмашыльщтарымен ДНК курамы ай;ындалды. Нуклеотидт жэне изоферментп маркерлермен зерттелшген популяциялардыц б1р-б1ршен генетикалы; ерекшелешлетшше болжау жасалды.

TYffiH^ свздер: E. equisetina, эфедра, биологиялы; белсенд1 ;оспалар, эфедрин, алкалоид, жу;а ;абатты хроматография, силуфолды пластинкалар.

L.S. Kozhamzharova, A.S. Kozhamzharova,* Z.B. Yesimseiitova**

M. Kh. Dulatty TarazState University *Asfendiyarov Kazakh National Medical University ** al-Farabi Kazakh National University

POPULATIONAL POLYMORPHISM OF THE EPHEDRA

Resume: Biochimical features of the different populatious of Ephedra equisetina was studied. It was found that on south-east part of Kazakhstan concentration of alkaloids, ephedrine, pseudoephedrin, compound complex of acid phosphatase, peroxidase, nonspecific esterase differ in different population. Analisis of DNA structure by RAPD-methode showed specific complex of acuplicons in ezch population. Proposed than the population task difference on genetical leril.

Keywords: E. equisetina, ephedra, biologically active additives, ephedrine, alkaloid, thin-layer chromatography, silifol plates.

УДК 581.5; 581.19; 577.15;633.88

А.С. Кожамжарова, Л.С. Кожамжарова,* З.Б. Есимсеиитова**

Казахский Национальный медицинский университет имени С.Д.Асфендиярова * Таразский Государственный университет имени М.Х.Дулати **Казахский Национальный университет имени аль-Фараби

МЕЖВИДОВОЙ ПОПУЛЯЦИОННЫЙ ПОЛИМОРФИЗМ ВТОРИЧНЫХ МЕТАБОЛИТОВ НА ПРЕДСТАВИТЕЛЯХ РОДА EPHEDRA L.

ФЛОРЫ КАЗАХСТАНА

Впервые масс-селективнодетекторным газохроматографическим методом исследован качественный и количественный состав 7 видов эфедры, произрастающих в различных регионах Казахстана. Установлен полный спектр алкалоидов эфедринового ряда. Исследованы биохимические и генетические особенности растений.

Ключевые слова: эфедра (Ephedra), морфологические и генетические особенности, алкалоид, масс-спектрометр, хроматограмма, газожидкостная хроматография, спектр.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.