CC BY
12крови и плазмы производилось методом хлороформ-фенольной экстракции. Биоптат изучали на количество циркулирующих копий ДНК ВЭБ с помощью полиме-разной цепной реакции (ПЦР) в реальном времени.
Результаты
По результатам исследования было обнаружено, что жидкостная биопсия имеет значительную корреляцию между размером опухоли и количеством циркулирующей ДНК ВЭБ, а так же проводимым лечением. В данном исследовании отбиралась плазма и кровь, в которых число копий ДНК ВЭБ превышало 500 копий на 0,5 мл исходного биоптата.
Список литературы
Выводы
Молекулярное исследование образцов плазмы и крови с высокой концентрацией циркулирующей ДНК было подтверждено иммуногистохимическим анализом на вирусный белок EBER ВЭБ. Было установлено, что жидкостная биопсия обладает таким клиническим преимуществом, как неинвазивный контроль эффективности терапии и прогрессирова-ния опухоли, однако не обладает достаточной чувствительностью для золотого стандарта. Поэтому продолжается работа по увеличению эффективности данного метода для получения более достоверных и точных результатов.
Поиск наследственных патогенных мутаций в генах иммунодефицитов у больных BRCA1-позитивным раком молочной железы: влияние на возраст-зависимую пенетрантность BRCA1
Авторы
Горгуль Юлий Андреевич, gorgul.yuliy@gmail.com, ФГБУ «НМИЦ онкологии им. Н.Н. Петрова» Минздрава России, Санкт-Петербург
Мартьянов Александр Сергеевич, aleksandr.s.martianov@gmail.com, ФГБУ «НМИЦ онкологии им. Н.Н. Петрова» Минздрава России, Санкт-Петербург
Романько Александр Андреевич, romanko.aleksandr.a@gmail.com, ФГБУ «НМИЦ онкологии им. Н.Н. Петрова»Минздрава России, Санкт-Петербург
Суспицын Евгений Николаевич, evgeny.suspitsin@gmail.com, ФГБУ «НМИЦ онкологии им. Н.Н. Петрова» Минздрава России, Санкт-Петербург
Соколенка Анна Петровна, annasokolenko@mail.ru, ФГБУ «НМИЦ онкологии им. Н.Н. Петрова» Минздрава России, Санкт-Петербург
Кулигина Екатерина Шотовна, kate.kuligina@gmail.com, ФГБУ «НМИЦ онкологии им. Н.Н. Петрова» Минздрава России, Санкт-Петербург
Ключевые слова:
рак молочной железы, рак яичников, BRCA1, наследственные мутации, противоопухолевый иммунитет
Актуальность
Известно, что у носительниц наследственных дефектов гена BRCA1 практически неизбежно в течение жизни развивается рак молочной железы или яичника (РМЖ/РЯ). Тем не менее пенетрантность патогенных вариантов BRCA1 не достигает 100%, а возраст манифестации BRCA1-ассоциированного РМЖ широко варьирует. Предполагается, что неоплазмы, развившиеся на фоне дефицита системы репарации ДНК, отличаются высокой хромосомаль-ной нестабильностью, имеют выраженную неоантигенную нагрузку и, как следствие, иммуногенны [1]. Мы выдвинули гипотезу о том, что наследственные мутации в генах — регуляторах иммунного ответа могут подавлять эффективность противоопухолевого иммунитета и таким образом влиять на возраст проявления онкологического заболевания.
Цель
Исследовать влияние наследственных дефектов в генах, связанных с иммунным ответом, на возраст манифестации BRCA1-зависимого РМЖ.
Материалы и методы
С помощью таргетного секвенирования нового поколения (NGS) была проанализирована полная кодирующая последовательность 353 генов иммунного ответа у 54 молодых (младше 39 лет) и 59 пациенток — носительниц мутаций BRCA1 (старше 57 лет). Частоты предположительно патогенных мутаций были валидированы в расширенном исследовании с использованием дополнительных групп BRCA1-носительниц с ранним (Ы = 185) и поздним (М = 167) дебютом РМЖ.
Результаты
Анализ данных NGS позволил выявить 54 аллельных варианта с популяционной частотой (MAF) <5% по данным базы gnomAD и ш silico показателем патогенности CADD-score >/=25, которые были найдены либо у молодых, либо у пожилых пациенток; 26 наиболее вероятных «кандидатов» были направлены на валидационное тестирование. Единственной достоверной находкой оказалась патогенная миссенс-мутация в гене перфорина PRF1 р.А1а91Уа1, которая была представлена значительно чаще у молодых больных РМЖ по сравнению с пожилыми пациентками [20/239 (8,4%) 8/226 (3,5%); p = 0,032]. Данная мутация в гетерозиготном состоянии оказалась ассоциирована со статистически значимым увеличением риска развития BRCA1-зависимого РМЖ в возрасте до 39 лет ДО = 2,49, 95% С1 1,073-5,771;
р = 0,034]. Перфорин — один из цитотоксических белков, играющий ключевую роль в клеточном лизисе, который опосредуют Т-лимфоциты и НК-клетки. Замена аминокислоты аланина на валин в 91 положении приводит к 10-кратному снижению активности белка [2]. Будучи в гетерозиготном состоянии, мутация PRF1 р.А1а91Уа1 может вызывать субклинические симптомы иммунодефицита [3] и, вполне вероятно, негативно сказываться на противоопухолевом иммунитете.
Выводы
На основании полученных нами данных можно предположить возможность миссенс-мутации PRF р.А1а9^а1 нарушать противоопухолевый иммунный ответ и способствовать развитию злокачественных новообразований у носительниц мутаций в гене BRCA1.
Список литературы
1. Nolan E . , Savas P, Policheni A . N . , Darcy P K. et al . Combined immune checkpoint blockade as a therapeutic strategy for BRCAI-mutated breast cancer // Sci Transl Med . 2017 . Jun 7 . Vol . 9 (393) . P.: eaal4922.
2 . Voskoboinik I . , Trapani J . A . Perforinopathy: a spectrum of human immune disease caused by defective perforin delivery or
function // Front Immunol . 2013 Dec 12 . Vol . 4 . Р 441.
3 . Martínez-Pomar N ., Lanio N ., Romo N . , Lopez-Botet M . et al . Functional impact of A91V mutation of the PRF1 perforin
gene // Hum Immunol . 2013 . Jan . Vol . 74 (1) . Р 14-17 .
Полногеномный анализ опухоли молочной железы с тройным негативным фенотипом
Авторы
Ибрагимова Марина Константиновна, imk1805@yandex.ru, НИИ онкологии ФГБНУ «Томский национальный исследовательский медицинский центр РАН», Томск
Цыганов Матвей Михайлович, tsyganovmm@yandex.ru, НИИ онкологии ФГБНУ «Томский национальный исследовательский медицинский центр РАН», Томск
Литвяков Николай Васильевич, nvlitv72@yandex.ru, НИИ онкологии ФГБНУ «Томский национальный исследовательский медицинский центр РАН», Томск
Ключевые слова:
рак молочной железы, микроматричный анализ, прогноз
Актуальность
Идентификация молекулярно-генетического фенотипа карцином молочной железы является важным прогностическим фактором заболевания и позволяет персонифицировать лечение больных. Согласно данным литературы, рак молочной железы (РМЖ) с тройным негативным фенотипом среди всех молекулярных подтипов составляет порядка 10-24% и обладает наибольшей агрессивностью течения и, как следствие, наихудшим прогнозом [1, 2].
Цель
Целью представленного исследования стало проведение полногеномного анализа РМЖ трижды негативного молекулярного подтипа (ТН РМЖ).
Материалы и методы
В исследование включено 25 больных с морфологически верифицированным диагнозом ТН РМЖ, средний возраст 47,6±0,4 года. ДНК из биопсий-ного материала опухоли до лечения выделялась с использованием набора QIAamp DNA mini Kit (Qiagen, Germany). Для изучения CNA использована микроматрица высокой плотности CytoScan HD Array (Affymetrix, USA). Для биоинформатического анализа использовалась программа Chromosome Analysis Suite 4.0.
Результаты
Установлено, что наибольшее количество ам-плификаций (более 64,0%) (при отсутствии де-
