Особенности мутаций в гене PIK3CA при раке молочной железы с низкой экспрессией Her2/neu Текст научной статьи по специальности «Фундаментальная медицина»

а в прямой кишке — в 33,3% (р <0,05). В опухолях правой и левой половины ободочной кишки мутации были у 27,5 и 48,3% пациентов соответственно. При III-IV стадии колоректального рака мутации обнаружены в 85%. Анализ спектра KRAS-мутаций выявил 12 типов в 2, 3 и 4-м экзонах. При этом подавляющее большинство (78,4%) наблюдалось в 12-м кодоне 2-го экзона (р <0,05). Мутации в 3-м и 4-м экзонах констатированы в 5 и 8,3% соответственно. У большинства пациентов была мутация G12V — 25 %, за которой следовали мутации G12D — 20,0 % и G12A — 16,6 %. В 13-м кодоне 2-го экзона у 8,3% отмечались KRAS G13D мутации. Мутация KRAS A146 обнаружена у 4 (6,7%) больных. Редкая мутация — миссенс-вариант А59Т был у пациентки с опухолью сигмовидной кишки.

Выводы

По нашим данным, на долю драйверных мутаций в гене KRAS при колоректальном раке приходится 39,2%. Причем они достоверно чаще встречаются у женщин. Наибольшая частота KRAS-мутаций (86,7%) наблюдается в 12-м и 13-м кодонах. Среди миссенс-мутаций KRAS G12 лидируют: точечная аминокислотная замена на валин G12V — 25%, на аспарагиновую кислоту G12D — 20% и на аланин G12A — 16,6%. Полученные данные свидетельствуют о преобладании KRAS-мутаций при опухолях ободочной кишки. При этом они чаще наблюдаются при злокачественных образованиях левой половины, составляя 66,7%. Молеку-лярно-генетические исследования при колоректальном раке — основа для реализации персонализированной терапии.

Список литературы

1. Zhu, G ., Pei, L . , Xia, H . et al . Role of oncogenic KRAS in the prognosis, diagnosis and treatment of colorectal cancer // Mol Cancer 20, 143 (2021) .

2 . van de Haar, J ., Ma, X. , Ooft, S . N . et al . Codon-specific KRAS mutations predict survival benefit of trifluridine/tipiracil in metastatic colorectal cancer // Nat Med 29, 605-614 (2023) .

Особенности мутаций в гене Р1К3СА при раке молочной железы

с низкой экспрессией Her2/neu

Авторы:

(1) Павленко Ирина Аркадьевна, pavlenko.ir@gmail.com, ГБУ РО «Пагологоанагомическое бюро», Ростов-на-Дону

(2) Повилайтите Патриция Едмундовна, info@ropab.net, ГБУ РО «Пагологоанагомическое бюро», Ростов-на-Дону

(3) Макаревич Наталья Станиславовна, info@ropab.net, ГБУ РО «Пагологоанагомическое бюро», Ростов-на-Дону

(4) Кацияев Владимир Юрьевич, info@ropab.net, ГБУ РО «Пагологоанагомическое бюро», Ростов-на-Дону

(5) Петров Алексей Владимирович, info@ropab.net, ГБУ РО «Пагологоанагомическое бюро», Ростов-на-Дону

Ключевые слова

рак молочной железы, экспрессия Her2/neu, мутации гена Р1К3СА, экзон 9

Актуальность

Возникновение мутаций в гене Р1К3СА, кодирующем каталитическую субъединицу р110а белка Р13К класса 1А, является распространенным механизмом активации сигнального каскада PI3K/Akt/mTOR при раке молочной железы (РМЖ) [1]. Обнаружение этих мутаций у пациенток с гормонопозитивным №г2-отрицательным РМЖ имеет важное клиническое значение, поскольку они служат фактором неблагоприятного прогноза [2], а также предиктором чувствительности опухоли к ингибитору Р13К — алпелисибу [3]. По статусу экспрессии белка Шй/геи пациентки с гормонопозитивным Шй-отрицательным РМЖ не являются однородной группой. Часть из них — так называемые Her2-low РМЖ — характеризуются низкой экспрессией Шй/геи (ИГХ оценка 1+ или 2+ при отрицательном результате ШН). В других же Шй-отрицательных РМЖ экспрессия Шй/гаи отсутствует полностью (ИГХ оценка 0) [4].

Цель

Целью нашей работы было установить, существуют ли отличия в характере мутаций гена Р1К3СА при РМЖ с низкой экспрессией Шй/гаи по сравнению с опухолями, в которых экспрессия Шй/ши отсутствует.

Материалы и методы

Исследование проведено на 96 образцах РМЖ с люминальным Her2-негативным иммунофенотипом, которые по характеру экспрессии Her2/neu были разделены на две группы — с низкой экспрессией Her2/neu (n=43) и с полным отсутствием экспрессии Her2/neu (n=53). Шличие мутаций PI^CA определяли с помощью коммерчески доступного набора cobas PIK5CA MutationTest (Roche, Германия) методом ПЦР в режиме реального времени на анализаторе cobas z 480.

Результаты

Мутации гена PIK5CA выявлены в 41,6% случаев, что соответствует литературным данным [1, 2]. Большинство мутаций PI^CA локализовалось в 9-м и 20-м экзонах, кодирующих спиральный (p.E542K, p.E545X) или киназный (p.H1047X) домен PI3, соответственно. Мутация p.E542K была выявлена в 17,5% случаев, Р.Е545Х — в 27,5%, p.H1047X — в 42,5%. Частота мутаций p.E542K и p.E545X варьировала от 26,3% в опухолях с отсутствием экспрессии Her2/neu до 61,9% в Her2-low РМЖ (p&lt;0,05), что указывает на возможные различия в механизмах активации сигнального пути PI3K/Akt/mTOR в этих двух группах. В отношении мутаций в 20-м экзоне, соответствующих киназному домену белка р110а, статистически значимых различий выявлено не было.

Выводы

В группе больных РМЖ с Her2-low статусом обнаружено статистически значимое увеличение частоты мутаций в 9-м экзоне гена PI^CA, кодирующем спиральный домен каталитической субъединицы р110а белка PI3K. Эти данные свидетельствуют о том, что Her2-low и РМЖ с отсутствием экспрессии Her2/neu могут отличаться как минимум некоторыми механизмами активации сигнального пути PI3K/Akt/mTOR. Характер мутаций гена PI^CA и особенности активации каскада PI3K/Akt/mTOR в различных типах РМЖ заслуживают дальнейшего всестороннего изучения.

Список литературы

1. Martínez-Sáez O ., Chic N . , Pascual T et al . Frequency and spectrum of PIK3CA somatic mutations in breast cancer. Breast Cancer Res . 2020;22:45 . https://doi.org/10.1186/s13058-020-01284-9

2 . Fillbrunn M ., Signorovitch J ., André F., et al . PIK3CA mutation status, progression and survival in advanced HR+/HER2- breast

cancer: a meta-analysis of published clinical trials . BMC Cancer. 2022;22(1):1002 . https://doi . org/10 ,1186/s12885-022-10078-5

3 . Modi S ., Jacot W. , Yamashita T et al . Trastuzumab Deruxtecan in Previously Treated HER2-Low Advanced Breast Cancer.

N Engl J Med . 2022;387:9-20 https://doi.org/10.1056/NEJMoa2203690

4 . Grassini D . , Cascardi E ., Sarotto I . et al . Unusual Patterns of HER2 Expression in Breast Cancer: Insights and Perspectives .

Pathobiology. 2022;89(5):278-296 . https://doi . org/10 .1159/000524227

Опыт применения биоинформатических методов анализа структуры метилирования генома на этапе морфологической диагностики в нейроонкологии

Авторы:

(1) Петрова Екатерина Игоревна, petrovaei@nsi.ru, ФГАУ «^МИНЦ нейрохирургии им. академика H.H. Бурденко» Минздрава России, Москва

(2) Рыжова Марина Владимировна, MRizhova@nsi.ru, ФГАУ «^М^Щ, нейрохирургии им. академика H.H. Бурденко» Минздрава России, Москва

(3) Галстян Сюзанна Андраниковна, SGalstyan@nsi.ru, ФГАУ «^МИД нейрохирургии им. академика H.H. Бурденко» Минздрава России, Москва

(4) Телышева Екатерина Николаевна, telisheva_k@mail.ru, ФГАУ «^МИи, нейрохирургии им. академика H.H. Бурденко» Минздрава России, Москва

Ключевые слова

нейроонкология, молекулярная диагностика, эпигенетика, классификация опухолей, метилирование ДИК, машинное обучение

Актуальность

По новой классификации ВОЗ опухолей UHC (2021) [1], оценка структуры метилирования генома с помощью специальных микрочипов —перспективный метод определения молекулярных классов опухолей