Научная статья на тему 'Особенности генетического полиморфизма антигенов гистосовместимости банка образцов пуповинной крови ГБУЗ «Станции переливания крови Департамента здравоохранения города Москвы»'

Особенности генетического полиморфизма антигенов гистосовместимости банка образцов пуповинной крови ГБУЗ «Станции переливания крови Департамента здравоохранения города Москвы» Текст научной статьи по специальности «Фундаментальная медицина»

CC BY
80
47
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по фундаментальной медицине , автор научной работы — Лебедева Л. Л., Пухликова Т. В., Чумак А. А., Павленко С. В., Зинкин В. Ю.

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Текст научной работы на тему «Особенности генетического полиморфизма антигенов гистосовместимости банка образцов пуповинной крови ГБУЗ «Станции переливания крови Департамента здравоохранения города Москвы»»

ВЕСТНИК ГЕМАТОЛОГИИ, том XI, № 2, 2015

Лебедева Л. Л., Пухликова Т. В., Чумак А. А., Павленко С. В., Зинкин В. Ю., Майорова О. А.

ГБУЗ «Станция переливания крови Департамента здравоохранения города Москвы», г. Москва

ОСОБЕННОСТИ ГЕНЕТИЧЕСКОГО ПОЛИМОРФИЗМА АНТИГЕНОВ ГИСТОСОВМЕСТИМОСТИ БАНКА ОБРАЗЦОВ ПУПОВИННОЙ КРОВИ ГБУЗ «СТАНЦИИ ПЕРЕЛИВАНИЯ КРОВИ ДЕПАРТАМЕНТА ЗДРАВООХРАНЕНИЯ

ГОРОДА МОСКВЫ»

Введение. Поиск и подбор неродственного донора гемопоэтических стволовых клеток для нуждающихся пациентов — сложный и многоступенчатый процесс, зависящий от многих факторов, и в первую очередь, гистосовместимости пары донор-реципиент. Известно, что система HLA отличается высокой полигенностью и экстремальным полиморфизмом, а частоты встречаемости как аллелей, так и её гаплотипов значительно варьируют между расами и этническими популяциями. Поэтому знание особенностей иммуногенетического профиля региональных донорских регистров костного мозга и банков пуповинной крови имеет важное значения для оценки вероятности нахождения подходящего HLA совместимого донора, что особенно актуально для многонациональной России.

В настоящее время в банке СПК хранится около 5000 единиц пуповинной крови (ПК), ти-пированных по HLA-А, Б, С, DRB1 и DQB1 генам, внесенных в реестр неродственных доноров ГСК.

Целью исследования явилось изучение характера распределения специфических аллель-ных групп и гаплотипов системы HLA донорских образцов банка пуповинной крови СПК.

Материал и методы. Были проанализированы 2000 образцов ПК, типированных по HLA-системе молекулярно-генетическими методами — ПЦР с использованием аллель-спец-

ифических праймеров (SSP) и с помощью гибридизации с олигонуклеотидными зондами (SSO) на платформе мультиплексного анализатора Luminex. Статистическую обработку результатов типирования проводили по трем локусам HLA-A, B и DRB1. Частоты встречаемости ал-лельных групп и их гаплотипов определяли методом максимального правдоподобия с использованием программы Arlequin 3.1

Результаты. В результате исследования в банке пуповинной крови СПК были выявлены все известные группы аллелей генов HLA за исключением крайне редко встречаемых во всех этнических популяциях. Частота встречаемости (в долях единицы) HLA-аллелей представлена в таблице 1. По гаплотипам HLA-A/B/DRB1 были выявлены 927 их вариантов (сумма частот которых составляет 0,999996), наиболее часто встречаемые из них, представлены в таблице 2. Сравнительный анализ полученных результатов с данными международной базы Allele Frequency Net Database выявил как общие тенденции в частоте встречаемости групп HLA-аллелей и га-плотипов в славянских популяциях, так и их особенности в московском банке пуповинной крови. Так, гаплотип A*02/B*41/DRB1*13 у доноров ПК московского региона встречается значительно чаще (2,6 %), чем в других этнических популяциях мира (0,0 %-0,42 %).

Таблица 1.

Частота встречаемости HLA-A, B, DRB1 генов в банке ПК СПК г. Москвы.

Группы аллелей Частота Группы аллелей Частота Группы аллелей Частота

HLA-A B*13 0,06325 B*55 0,00950

A*01 0,11950 B*14 0,02650 B*52 0,02450

A*02 0,29500 B*15 0,06050 B*53 0,00125

A*03 0,13850 B*17 0,00025 B*56 0,01275

A*11 0,06550 B*18 0,07775 B*57 0,02550

A*23 0,02300 B*27 0,04500 B*58 0,01200

A*24 0,10575 B*35 0,10999 B*73 0,00100

A*25 0,04525 B*37 0,01150 HLA-DRB1

A*26 0,04825 B*38 0,04450 DRB1*01 0,11850

A*29 0,01575 B*39 0,02275 DRB1*03 0,08250

A*30 0,02600 B*40 0,06050 DRB1*04 0,10685

«АКТУАЛЬНЫЕ ВОПРОСЫ ИММУНОГЕНЕТИКИ И ТКАНЕВОГО ТИПИРОВАНИЯ»

Санкт-Петербург 24-25 июня 2015 г.

Группы аллелей Частота Группы аллелей Частота Группы аллелей Частота

A*31 0,01950 B*41 0,03025 DRB1*07 0,14050

A*32 0,02850 B*42 0,00100 DRB1*08 0,03475

A*33 0,02450 B*44 0,09400 DRB1*09 0,01225

A*66 0,00775 B*45 0,00325 DRB1*10 0,01300

A*68 0,03550 B*46 0,00175 DRB1*11 0,14375

A*69 0,00175 B*47 0,00250 DRB1*12 0,02350

A*74 0,00025 B*48 0,00375 DRB1*13 0,13700

HLA-B B*49 0,01575 DRB1*14 0,02150

B*07 0,11075 B*50 0,01475 DRB1*15 0,12100

B*08 0,06475 B*51 0,04950 DRB1*16 0,04500

Таблица 2.

Частота встречаемости HLA-A/B/DRB1 гаплотипов в банке ПК СПК г Москвы.

Гаплотипы Частота Гаплотипы Частота

A *01/B *08/DRB1*03 0,041292 A *02/B*41/DRB1*13 0,013057

A *03/B *07DRB1*15 0,024050 A *25/B *18/DRB1 *15 0,012475

A *02/B *13/DRB1 *07 0,018070 A *30/B *13/DRB1 *07 0,010696

A *03/B *35/DRB1 *01 0,017853 A *11/B *35/DRB1 *01 0,010569

A *02/B *18/DRB1 *11 0,014590 A *33/B *14/DRB1 *01 0,010467

A *02/B *07/DRB1 *15 0,013092 A *24/B *13/DRB1 *07 0,009671

Выводы. Полученные данные свидетельствуют, что распределение частот встречаемости HLA-аллелей и гаплотипов в банке пуповинной крови СПК имеет свои характерные особенно-

сти, которые необходимо учитывать при подборе пары донор-реципиент для трансплантации ГСК.

Павленко С. В., Лебедева Л. Л., Чумак А. А., Пухликова Т. В., Зинкин В. Ю., Майорова О. А.

ГБУЗ «Станция переливания крови Департамента здравоохранения города Москвы», г. Москва

ГЕНЕТИЧЕСКИЙ ПРОФИЛЬ KIR-РЕЦЕПТОРОВ СРЕДИ ОБРАЗЦОВ БАНКА ПУПОВИННОЙ КРОВИ ГБУЗ «СТАНЦИИ ПЕРЕЛИВАНИЯ КРОВИ ДЕПАРТАМЕНТА

ЗДРАВООХРАНЕНИЯ ГОРОДА МОСКВЫ»

Введение. KIR система характеризуется высоким уровнем полиморфизма, как и ее HLA-лиганды, и обладает выраженным разнообразием в частоте встречаемости как самих KIR-генов, так и KIR-гаплотипов у различных народностей и этнических группах. KIR-генотип донора может влиять на эффективность трансплантации гемопоэтических стволовых клеток при онко-гематологических заболеваниях. Ввиду неоднозначности имеющихся данных о влиянии несоответствия KIR-генотипа на клинический исход трансплантации, популяционные исследования этой полиморфной системы представляются актуальными.

Цель исследования. Охарактеризовать распределение KIR-генов и KIR-генотипов среди образцов банка пуповинной крови СПК, полу-

ченных от условно здоровых новорожденных потенциальных доноров в Московском регионе и сравнить частоты этих генов с показателями в других популяциях.

Материалы и методы. Было проведено мо-лекулярно-генетическое типирование 188 образцов пуповинной крови славян. Генотипирование проводили методом PCR-SSO на платформе Lu-minex с использованием наборов Life Codes KIR Typing KIT (Immucor USA). Частоту встречаемости KIR-генов и генотипов определяли методом прямого подсчета. Наименование KIR-генотипов определяли согласно номенклатуре базы данных Allele Frequencies KIR Database. Статистический анализ частотных различий KIR-генов в разных популяционных группах проводили с использованием критерия %2 и точного критерия Фишера.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.