Научная статья на тему 'NGS-ТЕХНОЛОГИИ В ДИАГНОСТИКЕ PH-НЕГАТИВНЫХ ПАЦИЕНТОВ С МИЕЛОПРОЛИФЕРАТИВНЫМИ НОВООБРАЗОВАНИЯМИ'

NGS-ТЕХНОЛОГИИ В ДИАГНОСТИКЕ PH-НЕГАТИВНЫХ ПАЦИЕНТОВ С МИЕЛОПРОЛИФЕРАТИВНЫМИ НОВООБРАЗОВАНИЯМИ Текст научной статьи по специальности «Клиническая медицина»

CC BY
0
0
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по клинической медицине , автор научной работы — А.Н. Кириенко, Е.В. Мотыко, Д.В. Кустова, И.В. Леппянен, Т.Н. Герт

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Текст научной работы на тему «NGS-ТЕХНОЛОГИИ В ДИАГНОСТИКЕ PH-НЕГАТИВНЫХ ПАЦИЕНТОВ С МИЕЛОПРОЛИФЕРАТИВНЫМИ НОВООБРАЗОВАНИЯМИ»

РОССИЙСКИЙ Willi НШОШЕСКШ 11VII ШГРЕСС 2D23 АЛ I II

Онкогематология

прогрессирования в зависимости от полученного ответа выполняется (химио) лучевая терапия (ХЛТ). Результаты: В исследование включен 81 пациент возрастом от 36 до 78 лет (медиана 60 лет), из них 68 (84%) мужчин, 13 (16%) женщин. У 55 пациентов (68%) — рак ротоглотки (в 45% случаев — HPV-позитивный), у 13 (16%) — рак гортаноглотки, у 8 (10%) рак гортани, у 5 (6%) рак ротогортаноглотки. По стадиям T и N пациенты распределены следующим образом: Т1 — 8 чел. (10%), Т2-13 (16%), Т3 — 20 (25%), Т4 — 40 (49%), N0 — 13 (16%), N1 — 14 (17%), N2 — 32 (40%), N3 — 22 (27%). Опухоли 25 пациентов (31 %) имеют высокий уровень экспрессии PD-L1 (CPS > 20), у остальных 56 (69%) — CPS > 1-19. На момент анализа 77 пациентов (95%) завершили иХИТ, у 72 выполнена оценка эффективности: 11 (15%) пациентов достигли полного ответа, у33 (46%) — частичный ответ, у25 (35%) — стабилизация, и 3 (4%) — прогрессирование. Частота объективного ответа составила 61%. 63 пациента (78%) завершили курс ХЛТ, 9 (11%) пациентов — в процессе ХЛТ, 1 пациент получает паллиативную химиотерапию. 4 пациента(5%) не получили ХЛТ по причине смерти (2 — прогрессирование, 2 — вирусная пневмония). Данные по оценке эффекта после 2 этапов лечения доступны для 48 человек: полный ответ — 32 (67%), частичный ответ — 14 (29%), у2 (4%) — стабилизация. Нежелательные явления 3-4 степени на фоне индукционной терапии зарегистрированы у 23% пациентов, чаще встречалась гематологическая токсичность. 12 (14,8%) пациентов умерли за период наблюдения: 6 (7%) — от прогрессирования процесса, 3 (4%) — обострение хронических заболеваний, 3 (4%) — осложнения на фоне проводимого лечения (2 — пневмонии, 1 — острое нарушение мозгового кровообращения). Заключение: высокая частота объективного ответа и сравнительно более низкая токсичность режима позволяет продолжить изучение роли иХИТ в лечении местно-рас-пространенного рака головы и шеи.

■ ОНКОГЕМАТОЛОГИЯ

NGS-ТЕХНОЛОГИИ В ДИАГНОСТИКЕ РН-НЕГАТИВНЫХ ПАЦИЕНТОВ С МИЕЛОПРОЛИФЕРАТИВНЫМИ НОВООБРАЗОВАНИЯМИ

А.Н. Кириенко1, Е.В. Мотыко1, Д.В. Кустова1, И.В. Леппянен1, Т.Н. Герт1, Е.В. Ефремова1, В.А. Шуваев12, С.В. Сидоркевич1, И.С. Мартынкевич1

Место работы: 1. ФГБУ «РосНИИ гематологии и транс-фузиологии ФМБА», Санкт-Петербург, Россия; 2. ФГБОУ ДПО «РМАНПО» Минздрава России, Москва, Россия Эл. почта: kirienkoann@yandex.ru

Цель: Оценить возможности использования NGS в диагностике и определении прогностических особенностей течения заболевания у Ph-МПН пациентов на основе выявляемых патогенных и мутаций неясного значения (VUS). Материалы и методы: В исследование включено 58 пациентов (21 мужчина и 37 женщин, Me = 51 год). Диагноз Ph-МПН был ранее установлен у всех больных: ПМФ (33/58), ИП (1/58), ЭТ (18/58). Мутации в гене JAK2 была выявлена у 32/58, CALR — 8/58, MPL — 3/58, тройной негативный статус — у 15/58 пациентов. У всех пациентов секвениро-вание выполнялось с использованием панели из 121 генов со средней глубиной прочтения 200х или 1000х на приборе MiSeq (Illumina). При анализе полученных данных применялся 3% порог частоты встречаемости аллеля. Клиническая значимость мутаций устанавливалась по базам данных COSMIC и Varsome. Для анализа выживаемости использовали метод Каплана-Мейера с оценкой статистической значимости с помощью теста Кокса-Мантела. Результаты: Патогенные мутации, помимо драйверных, были выявлены у 25/58 пациентов, в среднем определялось 2 мутации (от1 до5уодного пациента). Данные гены выполняют различные функции — эпигенетической регуляции (ASXL1 (11/58), TET2 (8/58), IDH1 (2/58), EZH2 (1/58), SETBP1 (1/58)), сплайсинга РНК (SRSF2 (3/58), U2AF1 (2/58), DDX3X (1/58)), передачи сигнала (CBL (1/58), EP580 (1/58), RAS-семейство (5/58), APC (2/58)) и ремоделирования хроматина (ATRX (2/58). Было показано достоверное влияние (p = 0,0103) данных мутаций на прогрессию заболевания совместно с драйверными мутациями по сравнению с группой пациентов с мутациями только в драйверных генах. У 6/15 пациентов c тройным негативным статусом выявили патогенные мутации в генах ASXL1 (2/6), SRSF2 (2/6), IDH1 (1/6), NRAS (1/6), HRAS (1/6), RUNX1 (1/6), что позволило подтвердить клональность заболевания. У 51/58 (88%) пациентов были выявлены VUS, в среднем определялось 3 мутаций (от 1 до 10 мутации у одного больного) в 53 генах. Аннотация данных генов с помощью сервиса gprofiler показала, что 16/53 являются участниками сигнальных путей — JAK-STAT, PI3K-Akt, HIF1, NOTCH1, Hedgehog. Сочетание VUS в генах-участниках сигнальных путей c драйверной или патогенной мутацией было достоверно ассоциировано с снижением медианы времени до прогрессии заболевания (p = 0,05) и со снижением общей выживаемости (p = 0,0024) по сравнению с группой, у которых были обнаружены только драйверная или патогенная мутации.

Заключение: Данные, полученные при применении NGS технологии, позволяют подтвердить клональную природу заболевания и оценить прогноз течения заболевания для пациентов с Ph-МПН. Показано влияние мутаций неясного значения в генах-участниках сигнальных путей совместно с патогенными мутациями на общую выживаемость и прогрессию заболевания. На сегодняшний день актуальным является расширение панели секвенируемых генов для пациентов сдиагнозом Ph-МПН и изучение мутаций с неизвестным пока клиническим значением.

ЗЛОКАЧЕСТВЕННЫЕ ОПУХОЛИ Российское общество клинической онкологии

том/vol. 13 #3s1 • 2023

MALIGNANT TUMOURS

Russian Society of Clinical Oncology

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.