Научная статья на тему 'МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ДИАГНОСТИКА СУПРАТЕНТОРИАЛЬНЫХ ЭПЕНДИМОМ МЕТОДОМ ПЦР В РЕЖИМЕ РЕАЛЬНОГО ВРЕМЕНИ'

МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ДИАГНОСТИКА СУПРАТЕНТОРИАЛЬНЫХ ЭПЕНДИМОМ МЕТОДОМ ПЦР В РЕЖИМЕ РЕАЛЬНОГО ВРЕМЕНИ Текст научной статьи по специальности «Фундаментальная медицина»

CC BY
97
10
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
Журнал
Вопросы онкологии
Scopus
ВАК
RSCI
Ключевые слова
НЕЙРООНКОЛОГИЯ / ЭПЕНДИМОМА / РНК / ПОЛИМЕРАЗНАЯ ЦЕПНАЯ РЕАКЦИЯ
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по фундаментальной медицине , автор научной работы — Галстян Сюзанна Андраниковна, Рыжова Марина Владимировна, Телышева Екатерина Николаевна, Котельникова Анастасия Олеговна, Шайхаев Евгений Гаджирамазанович

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Текст научной работы на тему «МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ДИАГНОСТИКА СУПРАТЕНТОРИАЛЬНЫХ ЭПЕНДИМОМ МЕТОДОМ ПЦР В РЕЖИМЕ РЕАЛЬНОГО ВРЕМЕНИ»

2 . Улитин, А . Ю . , Мацко Д . Е . , Олюшин В . Е . Нейроэпителиальные опухоли головного мозга / А . Ю . Улитин, Д . Е . Мацко,

В . Е . Олюшин . СПб . : Синтез Бук, 2014 .

3 . Ostrom Q . T CBTRUS Statistical Report: Primary Brain and Other Central Nervous System Tumors Diagnosed in the United

States in 2012-2016 / Q .T. Ostrom, C . Cioffi, H . Gittleman et al . // Neuro-oncol . 2019 . Vol . 21 (5) . P 1-100 .

4 . Stupp, R . Radiotherapy plus concomitant and adjuvant temozolomide for glioblastoma / R . Stupp, W. P. Mason, M . J . van

den Bent et al . // N . Engl . J . Med . 2005 . Vol . 352 . P 987-996 .

Молекулярно-генетическая диагностика супратенториальных эпендимом методом ПЦР в режиме реального времени

Авторы

Галстян Сюзанна Андраниковна, [email protected], ФГАУ «НМИЦ нейрохирургии им. академика Н.Н. Бурденко» Минздрава России, Москва

Рыжова Марина Владимировна, [email protected], ФГАУ «НМИЦ нейрохирургии им. академика Н.Н. Бурденко» Минздрава России, Москва

Телышева Екатерина Николаевна, [email protected], ФГАУ «НМИЦ нейрохирургии им. академика Н.Н. Бурденко» Минздрава России, Москва

Котельникова Анастасия Олеговна, [email protected], ФГАУ «НМИЦ нейрохирургии им. академика Н.Н. Бурденко» Минздрава России, Москва

Шайхаев Евгений Гаджирамазанович, [email protected], ФГАУ «НМИЦ нейрохирургии им. академика Н.Н. Бурденко» Минздрава России, Москва

Ключевые слова:

нейроонкология, эпендимома, РНК, полимеразная цепная реакция

Актуальность

Согласно классификации Всемирной организации здравоохранения, эпендимомы подразделяются на 3 большие группы в зависимости от локализации: су-пратенториальная, задней черепной ямки и спиналь-ные [1, 2]. Супратенториальные эпендимомы отличаются от остальных групп наличием генетической детерминантой, обусловливающей последующий онкогенез. Другой особенностью супратенториаль-ных эпендимом является преимущественно паренхиматозный рост опухоли, что осложняет возможность радикального удаления и ухудшает прогноз. Еще одним немаловажный аспект — сложность дифференциальной диагностики ввиду низкодиффе-ренцированного нейбластического паттерна, а также зачастую неоднозначного иммуногистохимического профиля.

Цель

Разработка системы молекулярно-генетической диагностики супратенториальных эпендимом, позволяющая достоверно верифицировать супратенто-риальные эпендимомы относительно дешевым и быстрым методом полимеразной цепной реакции (ПЦР) в режиме реального времени.

Материалы и методы

Нами были отобраны 54 образцов супратенториальных эпендимом: 28 образцов из подобранной когорты являлись контрольной группой с ранее генетически подтвержденным диагнозом методом анализа метиляционного профиля. 51 образец пред-

ставлял собой опухолевую ткань, фиксированную в 10% забуфференном формалине, проведенную по стандартной программе и залитую в парафиновый блок, 3 образца — в виде свежезамороженной опухолевой ткани. Были подобраны и изготовлены праймеры c флуоресцентными зондами для слияний ZFTA-RELA, ZFTA-MAML2, YAP1-MAMLD1, YAP1-FAM118B [3]. Из опухолевой ткани выделялась РНК, затем путем реакции обратной транскрипции получалась одноцепочечная кДНК. Поиск целевых слияний проводился с использованием полученной кДНК и изготовленными праймерами с флуоресцентными зондами методом ПЦР в режиме реального времени.

Результаты

Из 54 образцов выделить достаточное количество РНК удалось в 53 случаях: из них 28 из контрольной группы и 25 образцов ранее не подтвержденных супратенториальных эпендимом. В контрольной группе искомые слияния были обнаружены в 18 образцах, что составляет 78,6%. В группе генетически неподтвержденных эпен-димом слияния были обнаружены в 13 образцах, что составило 52%. Итого из 53 образцов слияния были обнаружены в 35 образцах, что составило 66%.

Выводы

Несмотря на достигнутые нами результаты, часть образцов осталась неверифицированной с подобранными нами праймерами. Данная методи-

ка определенно повышает качество диагностики супратенториальных эпендимом, однако необходима дальнейшая работа по ее усовершенствованию с целью обнаружения и более редких партнеров в

слиянии с геном ZFTA, что позволит с высокой чувствительностью и специфичностью верифицировать супратенториальные эпендимомы без использования дорогостоящих исследований.

Список литературы

1. WHO Classification of Tumours Editorial Board . World Health Organization Classification of Tumours of the Central Nervous

System . 5th ed . Lyon: International Agency for Research on Cancer, 2021. 2 . Ellison D .W., Aldape K . D ., Capper, D . et al . (2020), cIMPACT-NOW update 7: advancing the molecular classification of

ependymal tumors // Brain Pathol . 2020 . Vol . 30 . Р 863-866 . https://doi . org/10 . 1111/bpa.12866 . 3 . Zschernack V., Jünger S ,T, Mynarek M et al . Supratentorial ependymoma in childhood: more than just RELA or YAP // Acta Neuropathol . 2021. Mar. Vol . 141 (3) . Р 455-466. DOI: 10 ,1007/s00401-020-02260-5 . Epub 2021 Jan 22 . PMID: 33481105; PMCID: PMC7882569 .

Клинические и молекулярно-генетические особенности нейробластом и ганглионейробластом центральной нервной системы у взрослых пациентов

Авторы

Нечаева Анастасия Сергеевна, [email protected], ФГБУ «НМИЦ им. В.А. Алмазова», Санкт-Петербург

Улитин Алексей Юрьевич, [email protected], ФГБУ «НМИЦ им. В.А. Алмазова», Санкт-Петербург Мацко Марина Витальевна, [email protected], ГБУЗ «Санкт-Петербургский клинический научно-практический центр специализированных видов медицинской помощи (онкологический)», Санкт-Петербург

Ключевые слова:

нейробластома, ганглионейробластома, центральная нервная система, адъювантное лечение, молекулярная генетика

Актуальность

По данным литературы, для взрослых пациентов с нейробластомами и ганглионейробластомами центральная нервная система (ЦНС) (ЦНС-НБ и ЦНС-ГНБ) характерна значительная вариабельность продолжительности жизни (от 2 месяцев до 5 лет) [1]. При этом стандарты лечения для данной группы опухолей отсутствуют из-за низкой изученности их клинических, морфологических и молекулярно-гене-тических особенностей [2-4].

Цель

Изучить влияние клинических и молекулярно-ге-нетических характеристик ЦНС-НБ и ЦНС-ГНБ на прогноз для жизни у взрослых пациентов.

Материалы и методы

В исследование включено 15 пациентов с ЦНС-НБ и 16 пациентов с ЦНС-ГНБ 18 лет и старше, проходивших лечение с 2008 по 2020 г. Проанализированы демографические, клинические, радиологические данные, хирургические результаты, проведено молекулярно-генетическое профилирование опухолей с анализом частоты уровней экспрессий мРНК генов, мутаций в генах ГОН1/2 и ко-делеции 1p19q в материалах от первой операции.

Результаты

Безрецидивная продолжительность жизни (БПЖ) и общая продолжительность жизни (ОПЖ) у пациентов с ЦНС-НБ оказались выше, чем у больных с ЦНС-ГНБ (р = 0,022 и р = 0,000 45 соответственно). Статистические значимые различия для ОПЖ в группе больных с ЦНС-НБ получены при удалении опухоли в объеме более чем 50% с медианой ОПЖ 541 неделя (р = 0,042) по сравнению с пациентами с биопсией. У пациентов с ЦНС-ГНБ тотальное удаление опухоли увеличивало как БПЖ, так и ОПЖ по сравнению с пациентами с субтотальной резекцией (р = 0,014 и р = 0,017 соответственно). У пациентов с ЦНС-НБ в первой линии химиотерапии различные схемы не имели статистически значимого преимущества (р >0,05). В группе пациентов с ЦНС-ГНБ терапия 6 циклами темозоломидом увеличивала медиану БПЖ по сравнению с другими химиоте-рапевтическими режимами (р = 0,026). В ЦНС-НБ высокий уровень экспрессии наблюдался только в гене рш-тубулин (54%, 7/13). В ЦНС-ГНБ высокие уровни экспрессии выявлены в 3 генах: PDGFR-a (54%, 7/13), VEGF (54%, 7/13), рШ-тубулин (85%, 11/13). На БПЖ больных с ЦНС-НБ и ЦНС-ГНБ оказал влияние низкий/средний уровень экспрессии гена VEGF (р = 0,006), а на ОПЖ влияли 3 гена: ERCC1 (р = 0,03), MGMT (р = 0,029) и VEGF (р =

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.