CC BY
22
НАЦИОНАЛЬНЫЕ ПРИОРИТЕТЫ РОССИИ. 2011. № 2 (5). СПЕЦИАЛЬНЫЙ ВЫПУСК
биологического материала различной природы на наличие патогенных лептоспир. Данная диагностическая система может быть использована для диагностики лептоспироза у людей и животных, выявления леп-
тоспироносительства у животных и контроля эффективности лечения, а также получения данных о наличии патогенных лептоспир в полевом биологическом материале.
МОЛЕКУЛЯРНАЯ ЭПИДЕМИОЛОГИЯ ЗООНОЗНОГО САЛЬМОНЕЛЛЕЗА НА ЮГЕ ЗАПАДНОЙ СИБИРИ
Ф.Н. Шубин, Н.А. Кузнецова, А.В. Раков, О.Ю. Якунина НИИ эпидемиологии и микробиологии СО РАМН, г. Владивосток, ФГУЗ «Центр гигиены и эпидемиологии в Новосибирской области», ФГУЗ «Центр гигиены и эпидемиологии в Томской области», ФГУЗ «Центр гигиены и эпидемиологии в Омской области»
В современных условиях эпидемиологический надзор получил возможность использовать достоверные сведения о генетическом родстве циркулирующих штаммов возбудителей инфекций путем применения молекулярно-генетических методов внутривидового типирования микроорганизмов. При этом методы различаются по их воспроизводимости, дифференцирующей способности, сложности интерпретации результатов и трудоемкости. Нашими исследованиями обоснована целесообразность создания системы централизованного микробиологического молекулярно-генетиче-ского мониторинга за сальмонеллами, основанного на данных плазмидного анализа микроба.
Изучение молекулярной эпидемиологии сальмо-неллеза в Приморском крае позволило раскрыть основные закономерности развития эпидемического процесса сальмонеллезной инфекции, вызванного гетерогенной популяцией Salmonella enteritidis (S. enteritidis).
Актуальность исследований, направленных на изучение характеристики популяций сальмонелл на других административных территориях Дальнего Востока, определяется, с одной стороны, их неизученностью, а с другой - их значимостью для цельного понимания молекулярной эпидемиологии сальмонеллеза и профилактики инфекции.
Цель исследования - изучение плазмидной характеристики популяций сальмонелл в Новосибирской, Томской и Омской областях и закономерностей развития эпидемического процесса среди населения, вызванного гетерогенной популяцией возбудителя сальмонеллеза.
Материалы и методы исследования. Изучена плаз-мидная характеристика у 1246 штаммов S. enteritidis, выделенных в 2005-2010 гг. в Новосибирской, Томской и Омской областях из различных экологических источников, в том числе от 961 больного сальмонеллезом при спорадической заболеваемости, от 216 человек во время вспышек болезни и из 69 проб продукции предприятий промышленного птицеводства, в том числе из мяса кур, субпродуктов, полуфабрикатов. Результаты обработаны статистически с использованием критерия Стьюдента.Внутривидовое типирование штаммов S.enteritidis выполнено методом плазмидного анализа бактерий.
Результаты и обсуждение. Плазмидный анализ штаммов S.enteritidis, изолированных в указанных областях в 2006-2010 гг. от 961 больного при спорадической заболеваемости (табл. 1), показал, что по плазмид-ным характеристикам популяции микроба в каждой из областей гетерогенны и представлены 34 плазмид-ными типами. При этом штаммы микроба, выделенные от больных, дифференцированы на две группы: основные и редко выявляемые. Первая из них включала штаммы девяти плазмидных типов, на долю которых пришлось 91,2 % культур, и они изолированы от 876 больных.
В соответствии с частотой выделения от больных среди основных плазмидных типов выделен явно доминирующий тип, маркированный плазмидами 38:1,4 Mda, на долю которого пришлось 49,5 % штаммов микроба. Вторыми по частоте встречаемости были два плазмидных типа микроба 38 Mda и 38:2,6:1,4 Mda, каждый из которых выявлен соответственно у 12,8 и 8,6 % больных. Частота выделения от больных остальных плазмидных типов S.enteritidis, отнесенных в группу основных, была значительно ниже, а редко выявляемые типы не имели сколько-нибудь существенной этиологической значимости в заболеваемости населения.
Частота выделения от больных в различных областях Западной Сибири основных плазмидных типов S. enteritidis неоднозначна. Среди представленных трех областей наиболее близкая плазмидная характеристика S. enteritidis в Новосибирской и Томской области. Из выявленных на территории областей 33 плазмидных типов микроба 14 являются общими для обеих территорий, а основная часть заболеваемости обеспечивается участием трех типов микроба 38 Mda, 38:1,4 Mda и 38:2,6:1,4 Mda, на долю которых приходится свыше 70 % больных. Напротив, популяция микроба у больных в Омской области имеет существенные отличия. Прежде всего, среди штаммов микроба, выделенных от больных, не дифференцируется доминирующий плазмидный тип, а у 72,8 % заболевших выявлены штаммы S. enteritidis плазмидных типов 38 Mda, 38:1,4 Mda и 38:2,3 Mda, при этом микроб последнего плазмидного типа не играет существенной роли в этиологии саль-монеллеза в Новосибирской и Томской области.
МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИЕ ИССЛЕДОВАНИЯ В ДИАГНОСТИКЕ И ТИПИРОВАНИИ ПАТОГЕНОВ
Таблица 1
Частота выделения от больных основных плазмидных типов S.enteгitidis в областях Западной Сибири
Плазмидные типы (в Mda) Области Западной Сибири и частота выделения штаммов плазмидных типов, % Суммарная частота выделения
Новосибирская Томская Омская
38 15,1 4,5 21,7 12,8
38 : 1,4 47,8 62,1 23,9 49,5
38 : 2,6 : 1,4 9,1 7,8 7,6 8,6
38 : 30 : 1,4 8,0 3,7 4,3 6,4
38 : 2,3 3,8 1,1 27,2 5,3
38 : 26 : 1,4 1,0 3,7 2,2 2,1
38 : 35 : 1,4 2,3 4,5 2,7
38 : 4,2 2,2 0,7 4,3 2,0
38 : 3,0 : 1,4 2,2 1,1 1,7
Всего основных типов 92,0 89,2 91,3 91,2
Всего 600 100 % 269 100 % 92 100 % 961 100 %
Таким образом, представленные данные позволяют полагать, что, несмотря на географическое соседство анализируемых территорий, в Омской области имеются отличия в характеристике микроба, что может быть связано с особенностями обеспечения населения продукцией птицеводства.
Плазмидный анализ 216 штаммов S.Enteritidis, выделенных от больных во время 13 вспышек сальмонел-леза в Новосибирской и Томской областях, показал, что они вызываются различными типами микроба, хотя каждая из вспышек обусловлена каким-либо одним плазмидным типом возбудителя. При этом все вспышки были вызваны микробом только основных плазмид-ных типов, а изучение плазмидной характеристики штаммов S. enteritidis, выделенных из пищевых продуктов, послуживших факторами передачи инфекции, также показало их однотипность со штаммами микроба, выделенными от больных.
Плазмидный анализ штаммов S. enteritidis, выделенных из продукции предприятий промышленного
птицеводства в 2006-2010 гг., показал, что штаммы микроба на большинстве предприятий гетерогенны по плазмидным характеристикам и в целом они представлены плазмидными типами микроба, наиболее часто выявляемыми у больных.
Таким образом, проведенные исследования показали, что в Новосибирской, Томской и Омской областях популяция S. enteritidis у больных при спорадической и вспышечной заболеваемости гетерогенна по плазмид-ным характеристикам и включает основные типы микроба, среди которых выделяются доминирующие. Популяция обладает определенной стабильностью существования основных плазмидных типов микроба. Штаммы S. enteritidis четырех из десяти плазмидных типов микроба выявлены у больных на протяжении всех четырех лет наблюдений. В соответствии с представленными результатами можно полагать, что причина четырехлетней связи заболеваемости населения с основными плаз-мидными типами микроба состоит в циркуляции их на местных предприятиях промышленного птицеводства.
ИЗУЧЕНИЕ ГЕНЕТИЧЕСКОЙ ВАРИАБЕЛЬНОСТИ A.PHAGOCYTOPHILUM
В.А. Рар, Т.И. Епихина
Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН, Новосибирск
Возбудитель гранулоцитарного анаплазмоза человека A.phagocytophilum широко распространен в различных регионах мира. На территории России ДНК А.р]^осуюрЫ1ит была обнаружена в образцах от клещей и от мелких млекопитающих в различных частях
ареала таежного клеща I.persulcatus (Шпынов и др. 2004, Rar et al. 2010).
Внутривидовое разнообразие A.phagocytophilum изучают при сравнении нуклеотидных последовательностей как вариабельных, так и консервативных генов,
