CC BY
16
Short communications
Краткие сообщения
Russian Journal of Infection and Immunity = Infektsiya i immunitet 2021, vol. 11, no. 6, pp. 1173-1178
Инфекция и иммунитет 2021, Т. 11, № 6, с. 1173-1178
КЛИНИКО-ЛАБОРАТОРНАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА КЛЕЩЕВОГО РИККЕТСИОЗА, СВЯЗАННОГО С МИКСТ-ИНФИЦИРОВАНИЕМ RICKETTSIA SIBIRICA И CANDIDATUS RICKETTSIA TARASEVICHIAE
Н.В. Рудаков1,2, И.Е. Самойленко1, С.В. Штрек1,2, С.А. Рудакова1, Л.В. Кумпан1,2, Я.П. Иголкина3, В.А. Рар3, Е.В. Жираковская3, С.Е. Ткачев3, Н.В. Тикунова3, Т.В. Кострыкина4, И.А. Блохина5, П.А. Ленц6
1ФБУН Омский НИИприродно-очаговых инфекций Роспотребнадзора, г. Омск, Россия 2ГБОУВПО Омский государственный медицинский университет, г. Омск, Россия 3Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН, г. Новосибирск, Россия
4 Управление Роспотребнадзора по Красноярскому краю, г. Красноярск, Россия
5 ФБУЗ Центр гигиены и эпидемиологии в Красноярском крае, г. Красноярск, Россия
6КГБУЗ Курагинская центральная районная больница, р.п. Курагино, Красноярский край, Россия
Резюме. Сибирский клещевой тиф (СКТ) является наиболее распространенным клещевым риккетсиозом (КР) в России, регистрируемым на 17 административных территориях юга Сибири и Дальнего Востока. Целью данного исследования было описание клинической картины, патологоанатомических данных и результатов лабораторной диагностики закончившейся летальным исходом микст-инфекции, вызванной двумя видами наиболее распространенных в России видов риккетсий — патогенной Rickettsia sibirica и недостаточно изученной Candidatus R. tarasevichiae, включая идентификацию ее этиологического агента. У четырехлетней девочки в Красноярском крае в гиперэндемичном очаге СКТ после присасывания клеща выявлены типичные симптомы КР (струп в месте присасывания, лихорадка, пятнистая сыпь, миалгия) и менингеальный синдром, не характерный для СКТ. Ребенок скончался на седьмой день с момента заболевания. Данные аутопсии (гепато-спленомегалия; отек мозга, который стал непосредственной причиной смерти) и результаты гистологического обследования (продуктивный васкулит головного мозга, спинного мозга и кожи, полиморфно-клеточные периваскулярные инфильтраты в печени и легких, серозный менингит, миелоидная гиперплазия селезенки и лимфатических узлов, интерстициальная лимфоидная инфильтрация в миокарде) подтвердили клинический диагноз клещевого риккетсиоза. Образцы крови и головного мозга пациента были исследованы на наличие широкого спектра клещевых патогенов и кишечных вирусов, вызывающих поражение головного мозга, с помощью ПЦР с последующим секвенированием положительных проб. ДНК Rickettsia sibirica и Candidatus R. tarasevichiae была обнаружена как в образцах крови, так и головного мозга. R. sibirica идентифицирована
Адрес для переписки: Contacts:
Рудаков Николай Викторович Nikolay V. Rudakov
644080, Россия, г. Омск, пр. Мира, 7, ФБУН Омский 644080, Russian Federation, Omsk, Mira pr., 7,
НИИ природно-очаговых инфекций Роспотребнадзора. Omsk Research Institute of Natural Focal Infections.
Тел.: 8 (381) 265-16-33. E-mail: [email protected]
Phone: +7 (381) 265-16-33. E-mail: [email protected]
Для цитирования:
Рудаков Н.В., Самойленко И.Е., Штрек С.В., Рудакова С.А., Кумпан Л.В., Иголкина Я.П., Рар В.А., Жираковская Е.В., Ткачев С.Е., Тикунова Н.В., Кострыкина Т.В., Блохина И.А., Ленц П.А. Клинико-лабораторная характеристика клещевого риккетсиоза, связанного с микст-инфицированием Rickettsia sibirica и Candidatus Rickettsia tarasevichiae // Инфекция и иммунитет. 2021. Т. 11, № 6. C. 1173-1178. doi: 10.15789/2220-7619-CAL-1597
Citation:
Rudakov N.V., Samoylenko I.E., Shtrek S.V., Rudakova S.A., Kumpan L.V., Igolkina Ya.P., Rar V.A., Zhirakovskaya E.V., Tkachev S.E., Tikunova N.V., Kostrykina T.V., Blokhina I.A., Lents P.A. Clinical and laboratory characteristics of tick-borne rickettsiosis related to Rickettsia sibirica and Candidatus Rickettsia tarasevichiae // Russian Journal of Infection and Immunity = Infektsiya i immunitet, 2021, vol. 11, no. 6, pp. 1173-1178. doi: 10.15789/2220-7619-CAL-1597
Исследование было частично поддержано грантом Министерства образования и науки России (проект VI.55.1.1:0309-2016-0002). The study was partially supported by a grant from the Ministry of Education and Science of Russia (project VI.55.1.1:0309-2016-0002).
© Рудаков Н.В. и соавт., 2021
DOI: http://dx.doi.org/10.15789/2220-7619-CAL-1597
по нуклеотидным последовательностям фрагментов генов gltA, ompA и ompB, а Candidatus R. tarasevichiae — по последовательностям фрагментов генов gltA и ompB с использованием nested-ПЦР и секвенирования. Все амплифицированные фрагменты секвенировали в обоих направлениях; полученные последовательности депонированы в базе данных GenBank под инвентарными номерами MK048467—MK048475. Мы не выявили в образцах другие передаваемые клещами патогены или кишечные вирусы, которые также могут приводить к менингеальному синдрому. Район, в котором произошло присасывание клеща у ребенка, относится к регионам с высоким уровнем заболеваемости СКТ. В этом районе сосуществуют несколько видов клещей; из них Haemaphisalis concinna, переносчик R. sibirica, доминирует в популяциях иксодовых клещей, в то время как Ixodes persulcatus, основной резервуар Candidatus R. tarasevichiae, встречается реже. В результате проведенных исследований впервые в Российской Федерации выявлен и описан верифицированный случай летальной инфекции, ассоциированной с риккетсиями двух видов — Rickettsia sibirica и Candidatus R. tarasevichiae.
Ключевые слова: Candidatus Rickettsia tarasevichiae, Rickettsia sibirica, этиологические агенты, риккетсиозы, клинические проявления, иксодовые клещи.
CLINICAL AND LABORATORY CHARACTERISTICS OF TICK-BORNE RICKETTSIOSIS RELATED TO RICKETTSIA SIBIRICA AND CANDIDATUS RICKETTSIA TARASEVICHIAE
Rudakov N.V.ab, Samoylenko I.E.a, Shtrek S.V.ab, Rudakova S.A.a, Kumpan L.V.ab, Igolkina Ya.P.c, Rar V.A.c, Zhirakovskaya E.V.c, Tkachev S.E.c, Tikunova N.V.c, Kostrykina T.V.d, Blokhina I.A.e, Lents P.A.f
a Omsk Research Institute of Natural Focal Infections, Omsk, Russian Federation b Omsk State Medical University, Omsk, Russian Federation
c Institute of Chemical Biology and Fundamental Medicine SB RAS, Novosibirsk, Russian Federation
d Krasnoyarsk Office of the Federal Service for Surveillance on Consumer Rights Protection and Human Wellbeing, Krasnoyarsk, Russian Federation
e Center for Hygiene and Epidemiology of Krasnoyarsk Krai, Krasnoyarsk, Russian Federation f Kuraginsky Central District Hospital, Kuragino, Krasnoyarsk Krai, Russian Federation
Abstract. The Siberian tick-borne typhus (STT) is the most common tick-borne rickettsiosis (TBR) in Russia, registered in 17 administrative territories of the S outhern Siberia and the Far East. The aim of this study was to describe clinical picture, pathological data and results of laboratory diagnostics during fatal mixed infection caused by two Rickettsia species most common in Russia — pathogenic Rickettsia sibirica and poorly examined Candidatus R. tarasevichiae, including identification of its etiological agents. A four-year-old girl in Krasnoyarsk Krai in a hyperendemic focus of the Siberian tick-borne typhus after tick sucking revealed typical TBR symptoms (scab at the site of tick suction, fever, spotted rash, myalgia) and meningeal syndrome, which is not typical for the Siberian tick-borne typhus. The child died on the seventh day of illness. Autopsy data (hepatosplenomegaly; cerebral edema, which was the immediate cause of death) and the results of histological examination (productive vasculitis of the brain, spinal cord and skin, polymorphic cell perivascular infiltrates in the liver and lungs, serous meningitis, myeloid hyperplasia of the spleen and lymph nodes, interstitial lymphoid infiltration in the myocardium) confirmed the clinical diagnosis of tick-borne rickettsiosis. The patient's blood and brain samples were tested for a wide range of tick-borne pathogens and enteric viruses that cause brain damage using PCR followed by sequencing of the positive samples. The DNA of Rickettsia sibirica and Candidatus Rickettsia tarasevichiae was found in both blood and brain samples. R. sibirica was identified by the nucleotide sequences of gene fragments gltA, ompA and ompB, and Candi-datus R. tarasevichiae — by the gltA and ompB genes using nested PCR and sequencing. All amplified fragments were se-quenced in both directions; the obtained sequences were deposited in the GenBank database under the inventory numbers MK048467—MK048475. We have not identified other tick-borne pathogens or intestinal viruses in the patient samples able to result in meningeal syndrome. The area where the child was sucked by the tick belongs to the regions with a high incidence of STT. Several species of mites coexist in this area; of these, Haemaphisalis concinna, the carrier of R. sibirica, dominates the populations of Ixodes mites, while Ixodes persulcatus, the main reservoir of Candidatus R. tarasevichiae, is less common. As a result of the conducted studies, for the first time in the Russian Federation, a verified case of a lethal infection associated with two species of Rickettsia — Rickettsia sibirica and Candidatus R. tarasevichiae — was identified and described.
Key words: Candidatus Rickettsia tarasevichiae, Rickettsia sibirica, etiological agents, rickettsioses, clinical manifestations, ixodid ticks.
Введение
В России выявлено несколько клещевых рик-кетсиозов (КР), наиболее распространенным из которых является сибирский клещевой тиф (СКТ), регистрируемый на 17 административных территориях Сибири [2, 5]. Клинические
проявления СКТ включают лихорадку, первичный аффект (струп) в месте присасывания иксо-дового клеща, лимфангоит, региональный лимфаденит, пятнисто-папулезную сыпь, головную боль и миалгию [3]. Этиологическим агентом СКТ является Rickettsia sibirica subsp. sibirica, что было подтверждено идентификацией штаммов
из клещей и от пациентов [16]. R. sibiricaпередается преимущественно клещами родов Dermacentor и Haemaphysalis; этот агент иногда выявляют в клещах Ixodes persulcatus [13, 17].
В дополнение к R. sibirica, в иксодовых клещах в Сибири выявлены и другие агенты, которые могут вызывать КР, а именно Rickettsia heilongjiangensis, Rickettsia helvetica, Rickettsia raoultii и Candidatus Rickettsia tarasevichiae [9, 13, 17]. На юге Западной Сибири в последние годы лабораторно подтверждено несколько случаев риккетсиозов, вызванных R. heilongjiangensis и R. raoultii [2, 7, 8]. До настоящего времени клинические случаи, вызванные Candidatus R. tara-sevichiae, в России не были описаны.
Сибирский клещевой тиф в России считают доброкачественной инфекцией, приводящей к летальным исходам крайне редко [3]. Тем не менее в 2017 г. в Красноярском крае был зарегистрирован случай риккетсиальной инфекции после присасывания иксодового клеща у четырехлетней девочки с типичными симптомами КР (лихорадка, сыпь, струп в месте присасывания клеща, миалгия) и менингеальным синдромом, закончившийся летально. Краткое описание случая представлено ранее [15]. Целью настоящего исследования было описание клинической картины и результатов лабораторной диагностики микст-инфекции, вызванной двумя видами наиболее распространенных в России видов риккет-сий — патогенной Rickettsia sibirica и недостаточно изученной Candidatus R. tarasevichiae, включая идентификацию ее этиологического агента.
Материалы и методы
Тотальная ДНК была экстрагирована из 100 мкл образцов крови и головного мозга, взятых после вскрытия. Экстракция выполнялась дважды для каждой ткани. Выделение нуклеиновых кислот (НК) проводили с помощью наборов «АмплиПрайм РИБО-преп» (ООО «ИнтерЛабСервис», Россия) и «РеалБест экстракция 100» (ЗАО «Вектор-Бест», Россия).
Выявление НК возбудителей клещевого энцефалита (КЭ), инфекционного клещевого бор-релиоза (ИКБ), гранулоцитарного анаплазмоза человека (ГАЧ), моноцитарного эрлихиоза человека (МЭЧ) проводили методом ПЦР в режиме реального времени на амплификаторах СFX96 (Bio-Rad, США), «ДТ-96» (ООО «НПО ДНК-технология», Россия) и Rotor-Gene 6000 (Qiagen, Германия), при этом использовали набор «АмплиСенс TBEV, B. burgdorferi s.l., A. phago-cytophilum, E. chaffeensis/E. muris-FL», применяя предварительно для проведения обратной транскрипции комплект «Реверта-L» (ООО «Интер-ЛабСервис», Россия), и наборы «РеалБест ДНК Borrelia burgdorferi s.l./РНК ВКЭ», «РеалБест ДНК Anaplasma phagocytophilum/Ehrlichia muris, Ehrlichia chaffeensis» (ЗАО «Вектор-Бест», Россия).
Кроме того, ДНК Rickettsia spp. была обнаружена с использованием двухраундовой ПЦР с праймерами для гена gltA (табл.), как описано ранее [8]. Для правильного определения в случае возможных микстов двухраундовые реакции проводили независимо, используя прайме-ры, специфичные для Candidatus R. tarasevichiae и риккетсий группы клещевой пятнистой лихорадки (РГ КПЛ). Для последующего секвениро-вания фрагменты гена ompA амплифицировали с использованием двухраундовой ПЦР; фрагменты гена ompB амплифицировали независимо, используя двухраундовую ПЦР с праймерами, специфичными для Candidatus R. tarasevichiae и риккетсий группы КПЛ (табл.). Полученные фрагменты ДНК были секвенированы и депонированы в GenBank.
Образцы были исследованы в двухраундовой ПЦР на присутствие агентов, передающихся клещами, включая вирус клещевого энцефалита (TBEV), вирус Кемерово, Borrelia burgdorferi sensu lato, Borrelia miyamotoi, бактерии семейства Anaplasmataceae, как описано ранее [13]. Кроме того, образцы подвергали скринингу с помощью ПЦР на наличие НК кишечных вирусов: ротави-русной группы A (RVA) и группы C (RVC), норо-вируса (NoV GII), астровируса (HAstV) и энтеро-вируса [12, 18].
Результаты
В мае 2017 г. четырехлетняя девочка была госпитализирована в Идринскую районную больницу через четыре дня после присасывания клеща за левым ухом с жалобами на лихорадку до 39,5°С, головную боль, резкую слабость и сыпь на верхних конечностях. На следующий день сыпь распространилась по всему телу. Пациентка жила в деревне на юге Красноярского края. При поступлении: лихорадка (38,6°C), увеличение до 0,5 см и болезненность заднешейных лимфатических узлов и макулопапулезная сыпь. Обследование сердца, легких и органов брюшной полости не выявило патологии. Предварительным диагнозом был клещевой риккетсиоз, тяжелая форма. Назначенное лечение включало цефотаксим (2 х 650 мг). На четвертый день лечения у девочки наблюдалось снижение температуры до 37,4°C, слабость, анорексия; элементы сыпи становились бледнее. Лабораторные тесты показали лейкопению (2,7 х 109 клеток на литр) и лимфопению (9%); остальные показатели крови были в норме. Через пять дней после начала болезни у ребенка начались судороги и брадикардия. На шестой день заболевания лечение было скорректировано: отменен цефотаксим, назначены тетрациклин (3 х 0,05 г) и бензилпенициллин (4 х 500 тыс. ЕД). В течение дня состояние ребенка оставалось среднетяжелым, но ночью резко ухудшилось, развился инфекционно-токсический шок с кло-нико-тоническими судорогами и брадикардией.
Больная была переведена в отделение интенсивной терапии Курагинской центральной районной больницы. Через несколько часов девочка умерла, несмотря на продолжающуюся интенсивную терапию.
Данные аутопсии (гепатоспленомегалия; отек мозга, который стал непосредственной причиной смерти) и результаты гистологического обследования (продуктивный васкулит головного мозга, спинного мозга и кожи, полиморфно-клеточные периваскулярные инфильтраты в печени и легких, серозный менингит, миелоидная гиперплазия селезенки и лимфатических узлов, интерсти-циальная лимфоидная инфильтрация в миокарде) подтвердили клинический диагноз КР.
ДНК как R. sibirica биЪбр. sibirica, так и Сапёь ёаШБ R. tarasevichiae были идентифицированы в образцах крови и мозга с использованием пе81её-ПЦР и секвенирования. Все амплифи-цированные фрагменты секвенировали в обоих направлениях; полученные последовательности депонированы в базе данных ОепБапк под инвентарными номерами МК048467-МК048475. Определенные последовательности генов gltA, ompA и ompB R. sibirica (827, 782 и 745 п.н. соответственно) были идентичны соответствующим последовательностям R. sibirica биЪбр. sibirica штамм 246 (ОепБапк ^_ААБ^Ш000001); выявленные последовательности генов gltA и ompB Сап^ёаШБ R. tarasevichiae (575 и 741 п.н. соответственно) были идентичны известным последователь-
ностям Candidatus R. tarasevichiae из клещей I. persulcatus (GenBank AF503167, KR150783).
Все клинические образцы были отрицательными в ПЦР с праймерами, специфичными для других клещевых агентов, включая вирус клещевого энцефалита, вирус Кемерово, B. burgdorferi sensu lato, B. miyamotoi, Anaplasma spp., Ehrlichia spp. и Candidatus Neoehrlichia mikurensis и кишечные вирусы (ротавирусы человека групп А и С, норовирус, астровирус, энтеровирус, пикорна-вирусы и аденовирус).
Обсуждение
Красноярский край является одним из эндемичных регионов для СКТ. Идринский район, в котором произошло присасывание клеща, относится к регионам с высоким уровнем заболеваемости CKT (среднемноголетний показатель — 80,2 случая на 100 000 человек в 2000— 2016 гг.). В этом районе сосуществуют несколько видов клещей; из них Haemaphisalisconcinna, переносчик R. sibirica, доминирует в популяциях ик-содовых клещей, в то время как Ixodes persulcatus, основной резервуар Candidatus R. tarasevichiae, встречается реже. В некоторых исследованиях R. sibirica была обнаружена у клещей I. persulcatus, а Candidatus R. tarasevichiae — у H. concinna [6, 13].
Клинические симптомы микст-инфекции, описанные в этом исследовании, отличаются от типичных симптомов CKT наличием менин-
Таблица. Праймеры, использованные для ПЦР
Table. PCR design primers
Гены-мишени Target genes Реакция Reaction Последовательность праймера (5'^3') Primer sequence (5'^3') Размер Length (bp) Температура отжига Annealing temperature (°C) Ссылка Reference
Rickettsia spp. gltA Первичная Primed glt1 (gattgctttacttacgaccc) glt2 (tgcatttctttccattgtgc) 1087 52 [7]
Двухраундовая Nested glt3 (tatagacggtgataaaggaatc) glt4 (cagaactaccgatttctttaagc) 667 53 [7]
Candidatus R. tarasevichiae gltA Двухраундовая Nested RT1 (tactaaaaaagtcgctgttcattc) RT2 (tgttgcaaacatcatgcgtaag) 300 56 [7]
РГКПЛ gltA Rickettsia of the group of tickborne spotted fever gltA Двухраундовая Nested RH1 (gtcagtctactatcacctatatag) RH3 (taaaatattcatctttaagagcga) 906 54 [9]
Rickettsia spp. ompA Первичная Primed A1 (taacattacaagctggaggaagcc) A2 (ttcagagcctgaccaccgg) 1335 58 [7]
Двухраундовая Nested A5 (caagtgctggtgatgttacta) A6 (tagttacatttcctgcacctac) 975 56 [9]
Rickettsia spp. ompB Первичная Primed B1 (atatgcaggtatcggtact) B2 (ccatataccgtaagctacat) 1270 56 [7]
Двухраундовая Nested B3 (gcaggtatcggtactataaac) B4 (aatttacgaaacgattacttccgg) 843 56 [7]
Candidatus R. tarasevichiae ompB Двухраундовая Nested Btar1 (gcaggtctgtttactgtaaatgacg) Btar2 (gcgaaacgaaccccgccttgg) 800 59 [9]
РГКПЛ ompB Rickettsia of the group of tickborne spotted fever ompB Двухраундовая Nested BSFG1 (ctaggtcttggaagcgataacg) BSFG2 (ccgttaaatctagcaccacc) 842 56 [10]
геального синдрома, воспаления сосудов головного и спинного мозга и повреждением печени, легких, селезенки и сердца.
Ранее основным морфологическим объектом в изучении клещевого сыпного тифа являлась биопсированные элементы кожной сыпи, так как отсутствие смертельных случаев исключало возможность широкого морфологического исследования. Только материал с описанием двух секционных случаев СКТ, зарегистрированных в 1950-е гг. в том же Красноярском крае, позволил получить описание патоморфологии СКТ [1]. В протоколе вскрытия отмечается умеренное набухание мозга, гиперплазия селезенки, дистрофические изменения паренхиматозных органов с острым венозным полнокровием. Анемический инфаркт с геморрагическим поясом в левой почке. Патоморфологические изменения в головном мозге представлены в виде эндопериваскулита, отмечаются участки диапедезного кровоизлияния и плазморрагии, тромбо-эндоваскулита с очаговой деструкцией сосудистой стенки и периваскуляр-ным отеком. В спинном мозге — перицеллюляр-ный отек и очень умеренное набухание клеток [1].
Ранее инфекция, вызванная СапйёаШБ Я. 1ага-sevichiae, были выявлена в Китае. При этом клинические проявления менингита были описаны в летальном случае риккетсиоза, вызванного СапйёаШБ Я. tarasevichiae [10]. Позднее был описан 61 случай этой инфекции, при этом в 34 случаях наблюдалась коинфекция буньявирусом рода Phlebovirus, который вызывает тяжелую лихорад-
Список литературы/ЯеТегепсеБ
ку с синдромом тромбоцитопении и связан с присасыванием клещей видов Haemaphysalis longicornis и Rhipicephalus microplus. Смертельный исход был зафиксирован в девяти случаях; восемь из них были вызваны смешанной инфекцией Candidatus R. tarasevichiae с буньявирусом [10, 11]. В России этот вирус до настоящего времени не выявлен.
Примечательно, что риккетсии группы тифа и представитель предковой группы R. canadensis, ближайший родственник Candidatus R. tarase-vichiae, поражают главным образом сосуды головного мозга [5].
Случай смешанной инфекции R. sibirica и Candidatus R. tarasevichiae был описан впервые, и этот случай привел к летальному исходу. Мы не выявили в образцах другие, передаваемые клещами патогены или кишечные вирусы, которые также могут приводить к менингеальному синдрому [14].
Несмотря на высокую распространенность Candidatus R. tarasevichiae в клещах I. persulcatus в разных областях ареала их обитания [9, 13, 16], мы описываем первый случай летального рик-кетсиоза, связанного с Candidatus R. tarasevichiae. Мы предполагаем, что тяжелые клинические проявления развиваются главным образом в случаях микст-инфекции.
Конфликт интересов
Авторы заявляют об отсутствии конфликта интересов.
1. Никонов В.А. Патологоанатомические изменения при клещевом сыпном тифе // Сборник научных трудов Красноярского медицинского института. 1958. № 5. С. 143—144. [Nikonov V.A. Pathological changes in tick-borne typhus. Sbornik nauchnykh trudov Krasnoyarskogo meditsinskogo institute = Collection of Scientific Papers of the Krasnoyarsk Medical Institute, 1958, no. 5, pp. 143-144. (In Russ.)]
2. Рудаков Н.В. Риккетсии и риккетсиозы: руководство для врачей. Омск: ИЦ «Омский научный вестник», 2016. 424 с. [Rudakov N.V. Rickettsia and rickettsioses: a guidebook for doctors. Omsk: Omsk Science Bulletin, 2016. 424p. (In Russ.)]
3. Рудаков Н.В., Оберт А.С. Клещевой риккетсиоз. Омск: Изд-во Омской государственной медицинской академии, 2001. 120 с. [Rudakov N.V., Obert A.S. Tick-borne rickettsiosis. Omsk: Omsk State Medical Academy Publishing, 2001. 120p. (In Russ.)]
4. Рудаков Н.В., Шпынов С.Н., Самойленко И.Е., Кумпан Л.В., Коломеец А.Н., Абрамова Н.В., Решетникова Т.А., Околелова Н.А. Актуальные аспекты изучения Candidatus Rickettsia tarasevichiae // Эпидемиология и инфекционные болезни. Актуальные вопросы. 2015. № 6. С. 14—19. [Rudakov N.V., Shpynov S.N., Samoylenko I.E., Kumpan L.V., Kolomeets A.N., Abramova N.V., Reshetnikova T.A., Okolelova N.A. Actual aspects of studying Candidatus Rickettsia tarasevichiae. Epidemiologiya i infektsionnye bolezni. Aktual'nye voprosy = Epidemiology and Infectious Diseases. Current Items, 2015, no. 6, pp. 14-19. (In Russ.)]
5. Рудаков Н.В., Шпынов С.Н., Самойленко И.Е., Оберт А.С. Клещевой риккетсиоз и риккетсии группы клещевой пятнистой лихорадки в России. Омск: ИЦ «Омский научный вестник», 2011. 232 с. [Rudakov N.V., Shpynov S.N., Samoylenko I.E., Obert A.S. Tick-borne rickettsiosis and rickettsia of the group of tick-borne spotted fever in Russia. Omsk: Omskij nauchnyj vestnik Publishing Centre, 2011. 232p. (In Russ.)]
6. Cheng C., Fu W., Ju W., Yang L., Xu N., Wang Y.M., Li H., Wang Y.L., Hu M.X., Wen J., Jiao D., Geng C., Sun Y. Diversity of spotted fever group Rickettsia infection in hard ticks from Suifenhe, Chinese-Russian border. Ticks Tick Borne Dis., 2016, vol. 7, no. 5, pp. 715-719. doi: 10.1016/j.ttbdis. 2016.02.023
7. Granitov V., Shpynov S., Beshlebova O., Arsenjeva I., Dedkov V., Safonova M., Stukolova O., Pantjukhina A., Tarasevich I. New evidence on tick-borne rickettsioses in the Altai region of Russia using primary lesions, serum and blood clots of molecular and serological study. Microbes Infect., 2015, vol. 17, no. 11-12, pp. 862-865. doi: 10.1016/j.micinf.2015.08.011
8. Igolkina Y., Krasnova E., Rar V., Savelieva M., Epikhina T., Tikunov A., Khokhlova N., Provorova V., Tikunova N. Detection of causative agents of tick-borne rickettsioses in Western Siberia, Russia: identification of Rickettsia raoultii and Rickettsia sibirica DNAin clinical samples. Clin. Microbiol. Infect, 2018, vol. 24, no. 2,pp. 199.e9-199.e12. doi: 10.1016/j.cmi.2017.06.003
9. Igolkina Y.P., Rar V.A., Yakimenko V.V., Malkova M.G., Tancev A.K., Tikunov A.Y., Epikhina T.I., Tikunova N.V. Genetic variability of Rickettsia spp. in Ixodes persulcatus/Ixodes trianguliceps sympatric areas from Western Siberia, Russia: Identification of a new Candidatus Rickettsia species. Infect. Genet. Evol., 2015, vol. 34, pp. 88-93. doi: 10.1016/j.meegid.2015.07.015
10. Jia N., Zheng Y.C., Ma L., Huo Q.B., Ni X.B., Jiang B.G., Chu Y.L., Jiang R.R., Jiang J.F., Cao W.C. Human infections with Rickettsia raoultii, China. Emerg. Infect. Dis, 2014, vol. 20, pp. 866-888. doi: 10.3201/eid2005.130995
11. Liu W., Li H., Lu Q.B., Cui N., Yang Z.D., Hu J.G., Fan Y.D., Guo C.T., Li X.K., Wang Y.W., Liu K., Zhang X.A., Yuan L., Zhao P.Y., Qin S.L., Cao W.C. Candidatus Rickettsia tarasevichiae Infection in Eastern Central China: a case series. Ann. Intern. Med, 2016, vol. 164, no. 10,pp. 641-648. doi: 10.7326/M15-2572
12. Oberste M.S., Maher K., Flemister M.R., Marchetti G., Kilpatrick D.R., Pallansch M.A. Comparison of classic and molecular approaches for the identification of untypeable enteroviruses. J. Clin. Microbiol., 2000, vol. 38, no. 3, pp. 1170-1174. doi: 10.1128/ JCM. 38.3.1170-1174.2000
13. Rar V., Livanova N., Tkachev S., Kaverina G., Tikunov A., Sabitova Y., Igolkina Y., Panov V., Livanov S., Fomenko N., Babkin I., Tikunova N. Detection and genetic characterization of a wide range of infectious agents in Ixodes pavlovskyi ticks in Western Siberia, Russia. Parasites Vectors, 2017, vol. 10, no. 1:258. doi: 10.1186/s13071-017-2186-5
14. Renaud C., Harrison C.J. Human Parechovirus 3: the most common viral cause of meningoencephalitis in young infants. Infect. Dis. Clin. North. Am, 2015, vol. 29, pp. 415-428. doi: 10.1016/j.idc.2015.05.005
15. Rudakov N., Samoylenko I., Shtrek S., Igolkina Y., Rar V., Zhirakovskaia E., Tkachev S., Tikunova N. A fatal case of tick-borne rickettsiosis caused by mixed Rickettsia sibirica and "Candidatus Rickettsia tarasevichiae" infection in Russia. Ticks Tick Borne Dis, 2019, vol. 10, no. 6:101278. doi: 10.1016/j.ttbdis.2019.101278
16. Shpynov S., Fournier P.E., Rudakov N., Tarasevich I., Raoult D. Detection of members of the genera Rickettsia, Anaplasma and Ehrlichia in ticks collected in the Asiatic part ofRussia. Ann. NYAcad. Sci., 2006, vol. 1078, pp. 378-383. doi: 10.1196/annals.1374.075
17. Shpynov S.N., Fournier P.E., Rudakov N.V., Samoilenko I.E., Reshetnikova T.A., Yastrebov V.K., Schaiman M.S., Tarasevich I.V., Raoult D. Molecular identification of a collection of spotted fever group rickettsiae obtained from patients and ticks from Russia. Am J. Trop. Med. Hyg., 2006, vol. 743, pp. 440-443.
18. Zhirakovskaia E., Tikunov A., Klemesheva V., Loginovskikh N., Netesov S., Tikunova N. First genetic characterization of rotavirus C in Russia. Infect. Genet. Evol., 2016, vol. 39, pp. 1-8. doi: 10.1016/j.meegid.2016.01.001
Авторы:
Рудаков Н.В., д.м.н. профессор, директор ФБУН Омский НИИ природно-очаговых инфекций Роспотребнадзора, г. Омск, Россия; зав. кафедрой микробиологии, вирусологии и иммунологии ГБОУ ВПО Омский государственный медицинский университет, г. Омск, Россия; Самойленко И.Е., к.м.н., ведущий научный сотрудник лаборатории зоонозных инфекций отдела природно-очаговых бактериальных зоонозов (ПОБЗ) ФБУН Омский НИИ природно-очаговых инфекций Роспотребнадзора, г. Омск, Россия; Штрек С.В., к.м.н., старший научный сотрудник, зав. лабораторией зоонозных инфекций отдела природно-очаговых бактериальных зоонозов ФБУН Омский НИИ природно-очаговых инфекций Роспотребнадзора, г. Омск, Россия; доцент кафедры микробиологии, вирусологии и иммунологии ГБОУ ВПО Омский государственный медицинский университет, г. Омск, Россия; Рудакова С.А., д.м.н., зав. лабораторией молекулярной диагностики с группой клещевых боррелиозов отдела ПОБЗ, ФБУН Омский НИИ природно-очаговых инфекций Роспотребнадзора, г. Омск, Россия; Кумпан Л.В., к.м.н., доцент кафедры микробиологии, вирусологии и иммунологии, ГБОУ ВПО Омский государственный медицинский университет, г. Омск, Россия; Иголкина Я.П., к.б.н., младший научный сотрудник лаборатории молекулярной микробиологии, Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН, г. Новосибирск, Россия; Рар В.А., к.б.н., старший научный сотрудник лаборатории молекулярной микробиологии, Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН, г. Новосибирск, Россия; Жираковская Е.В., к.б.н., научный сотрудник лаборатории молекулярной микробиологии, Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН, г. Новосибирск, Россия; Ткачев С.Е., к.б.н., ведущий научный сотрудник лаборатории молекулярной микробиологии Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН, г. Новосибирск, Россия; Тикунова Н.В., д.б.н., доцент, зав. лабораторией молекулярной микробиологии Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН, г. Новосибирск, Россия; Кострыкина Т.В., эпидемиолог, зам. начальника отдела эпидемиологического надзора, Управление Роспотребнадзора по Красноярскому краю, г. Красноярск, Россия; Блохина И.А., врач-эпидемиолог отдела обеспечения эпидемиологического надзора ФБУЗ Центр гигиены и эпидемиологии в Красноярском крае, г. Красноярск, Россия; Ленц П.А., врач-патологоанатом КГБУЗ Курагинская центральная районная больница, р.п. Курагино, Красноярский край, Россия.
Поступила в редакцию 19.09.2020 Принята к печати 10.01.2021
Authors:
Rudakov N.V., PhD, MD (Medicine), Professor, Director of Omsk Research Institute of Natural Focal Infections, Omsk, Russian Federation; Head of the Department of Microbiology and Virology and Immunology, Omsk State Medical University, Omsk, Russian Federation; Samoylenko I.E., PhD (Medicine), Leading Researcher, Laboratory of Natural Focal Infections, Department of Natural Focal Bacterial Zoonoses, Omsk Research Institute of Natural Focal Infections, Omsk, Russian Federation;
Shtrek S.V., PhD (Medicine), Senior Researcher, Head of the Laboratory of Zoonotic Infections, Department of Natural Focal Bacterial Zoonoses, Omsk Research Institute of Natural Focal Infections, Omsk, Russian Federation; Associate Professor, Department of Microbiology and Virology and Immunology, Omsk State Medical University, Omsk, Russian Federation; Rudakova S.A., PhD, MD (Medicine), Head of the Laboratory of Molecular Diagnostics with a Group of Tick-borne Borreliosis, Department of Natural Focal Bacterial Zoonoses, Omsk Research Institute of Natural Focal Infections, Omsk, Russian Federation; Kumpan L.V., PhD (Medicine), Assistant Professor, Department of Microbiology and Virology and Immunology, Omsk State Medical University, Omsk, Russian Federation; Igolkina Ya.P., PhD (Biology), Junior Researcher, Laboratory of Molecular Microbiology, Institute of Chemical Biology and Fundamental Medicine SB RAS, Novosibirsk, Russian Federation; Rar V.A., PhD (Biology), Senior Researcher, Laboratory of Molecular Microbiology, Institute of Chemical Biology and Fundamental Medicine SB RAS, Novosibirsk, Russian Federation; Zhirakovskaya E.V., PhD (Biology), Researcher, Laboratory of Molecular Microbiology, Institute of Chemical Biology and Fundamental Medicine SB RAS, Novosibirsk, Russian Federation; Tkachev S.E., PhD (Biology), Leading Researcher, Laboratory of Molecular Microbiology, Institute of Chemical Biology and Fundamental Medicine SB RAS, Novosibirsk, Russian Federation; Tikunova N.V., PhD, MD (Biology), Associate Professor, Head of the Laboratory of Molecular Microbiology, Institute of Chemical Biology and Fundamental Medicine SB RAS, Novosibirsk, Russian Federation; Kostrykina T.V., Epidemiologist, Deputy Head of the Epidemiological Surveillance Department, Krasnoyarsk Office of the Federal Service for Surveillance on Consumer Rights Protection and Human Wellbeing, Krasnoyarsk, Russian Federation;
Blokhina I.A., Epidemiologist of the Epidemiological Surveillance Department, Center for Hygiene and Epidemiology of Krasnoyarsk Krai, Krasnoyarsk, Russian Federation; Lents P.A., Pathologist, Kuraginsky Central District Hospital, Kuragino, Krasnoyarsk Krai, Russian Federation.
Received 19.09.2020 Accepted 10.01.2021
