CC BY
27
4. Эпидемиологическая обстановка по при-родно-очаговым инфекционным болезням в Южном и Северо-Кавказском федеральных округах в 2019 г. (Аналитический обзор) / А.Н. Куличенко [и др.] Ставрополь, 2020. 96 с.
4. Epidemiologicheskaya obstanovka po prirod-no-ochagovym infekcionnym boleznyam v Yuzhnom i Severo-Kavkazskom federal'nyh okrugah v 2019 g . (Analiticheskij obzor) / A.N. Kulichenko [i dr.] Stavropol', 2020. 96 s.
Василенко Надежда Филипповна - доктор биологических наук, профессор, главный научный сотрудник лаборатории эпидемиологии; Прислегина Дарья Александровна - кандидат медицинских наук, научный сотрудник лаборатории эпидемиологии; Манин Евгений Анатольевич - кандидат медицинских наук, врач-эпидемиолог лаборатории эпидемиологии; Цапко Николай Владимирович - кандидат биологических наук, биолог лаборатории медицинской паразитологии; Ашибоков Умар Мухадинович - кандидат биологических наук, биолог лаборатории медицинской зоологии; Малецкая Ольга Викторовна - доктор медицинских наук, профессор, заместитель директора по научной и противоэпидемической работе; Куличенко Александр Николаевич - доктор медицинских наук, профессор, член-корр. РАН, директор; ФКУЗ Ставропольский противочумный институт.
УДК 616.98:579.881.11(571.1)
Власов В.В.1, ИголкинаЯ.П.1, Рар В.А.1, Краснова Е.И.2, Филимонова Е.С.2, Тикунов А.Ю.1, Епихина Т.И.1, Тикунова Н.В.1
1 Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН, Новосибирск, Россия
2ФГБОУ ВО Новосибирский государственный медицинский университет Минздрава России, Новосибирск, Россия
КЛЕЩЕВЫЕ РИККЕТСИОЗЫ В ЗАПАДНОЙ СИБИРИ. ПЕРВЫЕ РОССИЙСКИЕ СЛУЧАИ РИККЕТСИОЗОВ, ВЫЗВАННЫХ RICKETTSIA AESCHLIMANNII, RICKETTSIA RAOULTIIИ RICKETTSIA SLOVACA
В ходе многолетних исследований были проанализированы клинические образцы от 1281 пациента, госпитализированного в инфекционную больницу г. Новосибирска в 2016-2019 гг. с признаками инфекционных заболеваний после присасывания клещей. Впервые на территории России были установлены случаи инфицирования пациентов R. raoultii, R. aeschlimannii и R. slovaca, а также "Ca. R. tarasevichiae" в виде моноинфекции. Суммируя данные по всем выявленным в этой работе возбудителям риккетсиозов, видно, что среди 35 пациентов с сыпным клещевым тифом только два пациента имели смешанные инфекции или сопутствующие тяжелые заболевания (один пациент был инфицирован вирусом клещевого энцефалита, а другой - ВИЧ).
Ключевые слова риккетсиозы, Новосибирская область, Rickettsia aeschlimannii, Rickettsia raoultii, Rickettsia slovaca.
Vlasov V.V. 1, Igolkina Ya.P. 1, Rar V.A.1, KrasnovaE.I. 2, FilimonovaE.S. 2, Tikunov A.Yu.1, Epikhina T.I. 1, Tikunova N.V. 1
'Institute of Chemical Biology and Fundamental Medicine SB RAS, Novosibirsk, Russia 2FSBEI HE Novosibirsk State Medical University of the Ministry of Health of Russia, Novosibirsk, Russia
© Власов В.В., Иголкина Я.П., Рар В.А., Краснова Е.И., Филимонова Е.С., Тикунов А.Ю., Епихина Т.И., Тикунова Н.В., 2021
ПРИРОДНО-ОЧАГОВЫЕ ИНФЕКЦИИ И ИНВАЗИИ
TICK-BORNE RICKETSIA IN WESTERN SIBERIA. FIRST RUSSIAN CASES OF RICKETSIOSES CAUSED BY RICKETTSIA AESCHLIMANNII, RICKETTSIA RAOULTII AND RICKETTSIA SLOVACA
In the course of many years of research, clinical samples from 1281 patients admitted with signs of infectious diseases after tick bite to the infectious diseases hospital in Novosibirsk in 2016-2019 were analyzed. For the first time in Russia we described cases of infection of patients with R. raoultii, R. aeschlimannii and R. slovaca, as well as "Ca. R. tarasevichiae "as monoinfection. Summarizing the data on all the causative agents of rickettsioses identified in this work, it can be seen that among 35 pa tients with tick-borne spotted fever, only two patients had mixed infections or concomitant severe diseases (one patient was infected with the tick-borne encephalitis virus, and the other with HIV).
Keywords: rickettsioses, Novosibirsk oblast, Rickettsia aeschlimannii, Rickettsia raoultii, Rickettsia slovaca.
Клещевые риккетсиозы широко распространены в России. На территории Азиатской части России регистрируются клещевой рик-кетсиоз, вызываемый Rickettsia heilongjiangen-sis, и сибирский клещевой тиф (СКТ), вызываемый Rickettsia sibirica subsp. sibirica [1-3]. Однако спектр риккетсий, которые выявляют в клещах, обитающих в Западной Сибири, существенно шире [4, 5]. Целью данной работы являлось выявление и анализ клинических проявлений различных клещевых риккетсиозов в Западной Сибири.
В ходе многолетних исследований были проанализированы клинические образцы от 1281 пациента, госпитализированного в инфекционную больницу г. Новосибирска в 2016-2019 гг. с признаками инфекционных заболеваний после присасывания клещей. У всех пациентов при поступлении были взяты образцы крови; у части пациентов также были взяты образцы цереброспинальной жидкости, кожных биоптатов с места присасывания клещей и/или повторные образцы крови. Большинство пациентов (1168; 91,2 %) отмечало присасывание клещей на территории Новосибирской области (НСО), 89 (6,9 %) пациентов - на территории Алтая и 24 пациента (1,9 %) - на территории других регионов Сибири. ДНК риккетсий выявляли методом двухраундовой ПЦР с использованием праймеров из области гена gltA. У всех положительных образцов были определены нуклеотидные последовательности гена gltA, а у ряда образцов также секвени-ровали последовательности генов 16S рРНК, ompA и ompB.
ДНК Rickettsia spp. была обнаружена в клинических образцах от 66 (5,1 %) пациентов, включая 49 образцов крови, 7 образцов цереброспинальной жидкости и 15 образцов кожных биоптатов с места присасывания клещей. Из них 53 (4,5 %) пациента отмечали присасы-
вание клещей в НСО, 12 (13,5 %) - на Алтае и 1 - в Республике Хакассия. Всего в клинических образцах была обнаружена ДНК пяти видов риккетсий - R. sibirica (n = 35), R. raoultii (n = 18), Rickettsia aeschlimannii (n = 3), "Candidatus Rickettsia tarasevichiae" (n = 2) и Rickettsia slovaca (n = 1). Кроме того, у семи пациентов была обнаружена ДНК рик-кетсий, которых нельзя отнести ни к одному из известных видов. Все эти виды и новые ге-новарианты риккетсий были обнаружены у пациентов из НСО. Из них R. sibirica (n = 23) и R. raoultii (n = 17) были наиболее распространенными видами. Один пациент с Алтая был инфицирован R. raoultii, в то время как остальные 11 пациентов с Алтая и пациент из Республики Хакассия были инфицированы R. sibirica. Таким образом, СКТ достоверно более часто (P < 0.001) выявлялся у пациентов с Алтая (11/89; 12,4 %) по сравнению с НСО (23/1168; 2,0 %).
Некоторые пациенты кроме риккетсий были инфицированы и другими возбудителями: R. sibirica/ВКЭ, R. raoultii/ВКЭ, R. aeschli-mannii/B. burgdorferi и "Ca. R. tarasevichiae"/ ВКЭ. Кроме того, у пяти пациентов в первых образцах крови была выявлена только ДНК B. miyamotoi, а в повторно взятых образцах -ДНК R. raoultii (n = 1) или новых геновариан-тов риккетсий (n = 4).
Таким образом, впервые на территории России были установлены случаи инфицирования пациентов R. raoultii, R. aeschlimannii и R. slovaca, а также "Ca. R. tarasevichiae" в виде моноинфекции. Подтверждено, что R. sibirica — основной этиологический агент клещевых риккетсиозов в Западной Сибири, по крайней мере, на территории НСО (43,4 %) и Алтая (91,7 %). Впервые показано, что R. raoultii является частым возбудителем клещевого риккетсиоза в НСО (17/53; 32,1 %), и его
встречаемость схожа со встречаемостью рик-кетсиоза, вызываемого R. sïbirica (23/53; 43,4 %). Интересно, что R. aeschlimannii и R. slovaca до настоящего времени не были обнаружены в клещах на территории Западной Сибири. Это несоответствие может быть объяснено низкой встречаемостью R. aeschlimannii и R. slovaca в клещах, мозаичным распространением данных видов риккетсий или их ассоциацией с редкими и недостаточно исследованными видами клещей. Следует отметить, что R. helvetica и R. heilongjiangensis не были обнаружены у пациентов, несмотря на их наличие в клещах, обитающих в Западной Сибири.
Определенные в данной работе нуклео-тидные последовательности большинства видов риккетсий (R. sïbirica, "Ca. R. tarasevi-chiae", R. aeschlimannii и R. slovaca) были высококонсервативны и соответствовали известным последовательностям данных видов. Напротив, в случае R. raoultii, 11 вариантов последовательностей gltA гена были обнаружены; последовательности R. raoultii от 4 пациентов соответствовали R. raoultii strain Marne (RpA4 genotype), последовательности от 4 пациентов - R. raoultii strain Khabarovsk (DnS14 genotype), а последовательности от 9 пациентов отличались друг от друга и от последовательностей R. raoultii, доступных в базе данных GenBank (99,3-99,8 % сходства). Последовательности gltA гена новых генетических вариантов риккетсий, обнаруженных в образцах от 7 пациентов, нельзя отнести ни к одному из известных видов. Все они отличались между собой и от доступных в базе данных GenBank последовательностей и были наиболее схожи с R. sibirica, R. aeschlimannii и R. slovaca (99,5-99,9 % сходства).
Анализ клинических проявлений рик-кетсиозов, вызванных R. sibirica и R. raoultii (без учета случаев смешанных инфекций), показал, что:
1) у всех пациентов наблюдалась лихорадка;
2) сыпь и/или первичный аффект наблюдались достоверно более часто (P < 0.001) у пациентов с СКТ (30/34; 88,2 %) по сравнению с пациентами, инфицированными R. raoultii (4/16; 25 %);
3) высокий уровень печеночных тран-саминаз (ALT/AST) наблюдался достоверно более часто (P < 0.001) у пациентов с СКТ
(20/27; 74,1 %) по сравнению с пациентами, инфицированными R. raoultii (2/14; 14,3 %);
4) неврологические симптомы (менингит, скованность шеи, тремор, головокружение и тошнота), напротив, достоверно более часто (P < 0.001) были отмечены у пациентов, инфицированных R. raoultii (11/16; 68,8 %) по сравнению с пациентами с СКТ (7/34; 20,6 %) (табл.).
Таким образом, клинические проявления риккетсиоза, вызванного R. raoultii, в основном неспецифичны; это может объяснить то, почему эту инфекцию ранее не регистрировали в РФ. Интересно, что более частое выявление неврологических симптомов у пациентов с R. raoultii коррелирует с достоверно более частым (P = 0,002) обнаружением R. raoultii в цереброспинальной жидкости (6/19 образцов; 31,6 %) по сравнению с R. sibirica (1/38 образцов; 2,6 %).
Следует отметить, что более тяжелые формы инфекции, вызванной R. raoultii, наблюдались у пациента в возрасте 89 лет и у двух пациентов с ВИЧ. У этих пациентов была отмечена лихорадка 38,5-39 оС и неврологические симптомы.
Среди двух пациентов, инфицированных "Ca. R. tarasevichiae", у одного была отмечена лихорадка (37,8 оС), первичный аффект, головная боль. Второй пациент был ко-инфицирован ВКЭ и имел тяжелую форму заболевания с высокой температурой (39 С) и неврологическими симптомами; пациент умер, несмотря на проведение интенсивной терапии. Ранее на территории Красноярского края был установлен случай смешанной инфекции "Ca. R. tarasevichiae" и R. sibirica, который также привел к летальному исходу [6]. В обоих этих случаях сложно оценить вклад "Ca. R. tarasevichiae" в развитие инфекций с летальным исходом. Аналогично, летальные исходы были описаны в случае смешанной инфекции "Ca. R. tarasevichiae" и вируса SFTS (сем. Bunyaviridae) в Китае [7].
У пациента, инфицированного R. slo-vaca, была отмечена высокая температура (39 оС) и головная боль. Однако никаких специфических симптомов SENLAT, характерных для R. slovaca, не наблюдалось.
Ни у одного из семи пациентов, инфицированных новыми геновариантами риккетсий, не было сыпи или первичного аффекта. У четырех из них Rickettsia spp. была
ПРИРОДНО-ОЧАГОВЫЕ ИНФЕКЦИИ И ИНВАЗИИ
обнаружена только во вторых образцах крови, тогда как ДНК В. т1уатвШ была обнаружена в первых образцах. У этих четырех пациентов была высокая температура (38,7-39 оС), что, вероятно, связано с
инфекцией В. т1уатвШ. У остальных трех пациентов, инфицированных новыми геновариантами риккетсий, заболевание протекало в легкой форме с температурой 37,5-38,2 оС.
Таблица
Клинические и лабораторные данные о пациентах с различными риккетсиозами
Пациенты с ДНК риккетсий в клинических образцах
R. sibirica R. raoultii R .aeschl. Ca.R. taras.(+TBEV)* R. slovaca R. spp new (+B.m.) **
Кол-во пациентов 35 17 3 1 (1) 1 3 (4)
Кол-во образцов, из них: 38 18 3 1 (1) 1 3 (4)
- кровь 28 10 2 0 1 3 (4)
- СМЖ 1 6 0 0 0 0
- биоптат кожи 9 2 1 1 (1) 0 0
Инкубационный период (дни) 2-18 1-23 3 1 (10) Nd 4-17 (10-21)
Специфические симптомы:
- температура, oC 38.4-40.0 37.2-39.7 37.3-39.0 37.8 (39.0) 39.0 37.5-38.2 (38.7-39.3)
- сыпь 28 3 2 0 0 0
- первичный аффект 24 3 1 1 0 0
- лимфоаденопатия 3 3 2 0 0 0
- головная боль 30 15 3 1 (1) 1 1 (4)
- миалгия 13 6 3 0 0 0
- артралгия 8 0 2 0 0 0
- повышение ALT (>43 u/L) 20/28 2/14 1 Nd 0 0
- повышение AST (>34 u/L) 21/28 2/14 1 Nd 1 0
Неспецифические симптомы:
- эритема (<5sm) 2 2 1 1 (0) 0 1 (0)
- неврологические симптомы 9 11 0 0 (1) 0 0
- гиперемия лица 1 3 0 0 0 0
- кашель 0 0 1 0 0 0
- пневмония 0 2 0 0 0 0
- диарея 0 0 1 0 0 0
- тошнота 0 1 0 0 0 0
R.aeschl - R. aeschlimannii; Ca.R.taras - "Candidatus R. tarasevichiae; R. spp new - новые Rickettsia геноварианты; B.m. - Borrelia miyamotoi.
*Данные о пациенте с ко-инфекцией Candidatus R. tarasevichiae и вируса клещевого энцефалита приведены в скобках (пациент умер).
**Данные о пациентах с ко-инфекцией R. spp new и B. Miyamotoi.
Суммируя данные по всем выявленным в этой работе возбудителям риккетсиозов, видно, что среди 35 пациентов с СКТ только два пациента имели смешанные инфекции или сопутствующие тяжелые заболевания (один
пациент был инфицирован вирусом клещевого энцефалита, а другой - ВИЧ). Однако среди 31 пациента с другими риккетсиозами случаи смешанных инфекций или сопутствующих заболеваний были частыми и включали
смешанные инфекции с ВКЭ (два пациента), B. miyamotoi (пять пациентов), ВИЧ (два пациента) и одновременно B. burgdorferi и ВИЧ (один пациент). Можно предположить, что эти «не СКТ риккетсиозы» при отсутствии смешанного инфицирования или сопутствующих
БИБЛИОГРАФИЧЕСКИЙ СПИСОК
l.Mediannikov O., Sidelnikov Y., Ivanov L., Fournier P., Tarasevich I., Raoult D. Far eastern tickborne rickettsiosis: identification of two new cases and tick vector. Ann. N.Y. Acad. Sci. 2006. 1078: 80-88.
2.Shpynov S., Fournier P., Rudakov N., Ar-sen'eva I., Granitov M., Tarasevich I., Raoult D. Tickborne rickettsiosis in the Altay region of Russia. Clin. Microbiol. Infect. 2009. 15 Suppl 2:313-314.
3.Dedkov V., Simonova E., Beshlebova O., Safonova M., Stukolova O., Verigina E., Savinov G., Karaseva I., Blinova E., Granitov V., Arsenjeva I., Shipulin G. The burden of tick-borne diseases in the Altai region of Russia. Ticks Tick Borne Dis. 2017. 8 (5): 787-794.
4.Igolkina Y., Rar V., Vysochina N., Ivanov L., Tikunov A., Pukhovskaya N., Epikhina T., Golovljova I., Tikunova N. Genetic variability of Rickettsia spp. in Dermacentor and Haemaphysalis ticks from the Russian Far East. Ticks Tick Borne Dis. 2018. 9 (6): 1594-1603.
5.Rar, V., Livanova, N., Tkachev, S., Kaverina, G., Tikunov, A., Sabitova, Y., Igolkina, Y., Panov, V., Livanov, S., Fomenko, N., Babkin, I., Tikunova, N. Detection and genetic characterization of a wide range of infectious agents in Ixodes pavlovskyi ticks in Western Siberia, Russia. Parasit. Vectors. 2017. 10 (1): 258.
6.Rudakov N., Samoylenko I., Shtrek S., Igolkina Y., Rar V., Zhirakovskaia E., Tkachev S., Kostrykina T., Blokhina I., Lentz P., Tikunova N. A fatal case of tickborne rickettsiosis caused by mixed Rickettsia sibirica subsp. sibirica and "Candidatus Rickettsia tarasevichiae" infection in Russia. Ticks Tick Borne Dis. 2019. 10 (6): 101278.
7. Liu W., Li H., Lu Q.B., Cui N., Yang Z.D., Hu J.G., Fan Y.D., Guo C.T., Li X.K., Wang Y.W., Liu K., Zhang X.A., Yuan L., Zhao P., Qin S.L., Cao W.C. Can-didatus Rickettsia tarasevichiae Infection in Eastern Central China: A Case Series. Ann. Intern. Med. 2016.164: 641-648.
заболеваний часто могут протекать в легкой форме или бессимптомно. Это может объяснить относительно редкую регистрацию риккетсио-зов, вызванных R. raoultii и "Ca. R. tarasevichiae", несмотря на высокую встречаемость этих микроорганизмов в клещах.
REFERENCES
1. Mediannikov O., Sidelnikov Y., Ivanov L., Fournier P., Tarasevich I., Raoult D. Far eastern tickborne rickettsiosis: identification of two new cases and tick vector. Ann. N.Y. Acad. Sci. 2006. 1078: 80-88.
2. Shpynov S., Fournier P., Rudakov N., Ar-sen'eva I., Granitov M., Tarasevich I., Raoult D. Tickborne rickettsiosis in the Altay region of Russia. Clin. Microbiol. Infect. 2009. 15 Suppl 2:313-314.
3. Dedkov V., Simonova E., Beshlebova O., Safonova M., Stukolova O., Verigina E., Savinov G., Karaseva I., Blinova E., Granitov V., Arsenjeva I., Shipu-lin G. The burden of tick-borne diseases in the Altai region of Russia. Ticks Tick Borne Dis. 2017. 8(5): 787-794.
4. Igolkina Y., Rar V., Vysochina N., Ivanov L., Tikunov A., Pukhovskaya N., Epikhina T., Golovljova I., Tikunova N. Genetic variability of Rickettsia spp. in Der-macentor and Haemaphysalis ticks from the Russian Far East. Ticks Tick Borne Dis. 2018. 9(6):1594-1603.
5. Rar, V., Livanova, N., Tkachev, S., Kaverina, G., Tikunov, A., Sabitova, Y., Igolkina, Y., Panov, V., Livanov, S., Fomenko, N., Babkin, I., Tikunova, N. Detection and genetic characterization of a wide range of infectious agents in Ixodes pavlovskyi ticks in Western Siberia, Russia. Parasit. Vectors. 2017. 10 (1): 258.
6. Rudakov N., Samoylenko I., Shtrek S., Igolkina Y., Rar V., Zhirakovskaia E., Tkachev S., Kostrykina T., Blokhina I., Lentz P., Tikunova N. A fatal case of tickborne rickettsiosis caused by mixed Rickettsia sibirica subsp. sibirica and "Candidatus Rickettsia tarasevichiae" infection in Russia. Ticks Tick Borne Dis. 2019. 10 (6): 101278.
7. Liu W., Li H., Lu Q.B., Cui N., Yang Z.D., Hu J.G., Fan Y.D., Guo C.T., Li X.K., Wang Y.W., Liu K., Zhang X.A., Yuan L., Zhao P., Qin S.L., Cao W.C. Candidatus Rickettsia tarasevichiae Infection in Eastern Central China: A Case Series. Ann. Intern. Med. 2016.164:641-648.
Власов Валентин Викторович - академик РАН, доктор химических наук, профессор, научный руководитель, Иголкина Яна Петровна - кандидат биологических наук, научный сотрудник лаборатории молекулярной микробиологии, Рар Вера Александровна - кандидат биологических наук, старший научный сотрудник лаборатории молекулярной микробиологии, Тикунова Нина Викторовна - доктор биологических наук, заведующий лабораторией молекулярной микробиологии, Епихина Тамара Ивановна - ведущий инженер лаборатории молекулярной микробиологии; Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН,
Краснова Елена Игоревна - доктор медицинских наук, профессор, заведующий кафедрой инфекционных болезней, Филимонова Евгения Сергеевна - ассистент кафедры инфекционных болезней; Новосибирский государственный медицинский университет,
Тикунов Артем Юрьевич - кандидат биологических наук, старший преподаватель кафедры молекулярной биологии и биотехнологий Новосибиского государственного университета.
