Научная статья на тему 'Изучение конкурентного взаимодействия ионов серебра с цистеинсодержащими пептидами и серосодержащими аминокислотами c помощью ESI-MS'

Изучение конкурентного взаимодействия ионов серебра с цистеинсодержащими пептидами и серосодержащими аминокислотами c помощью ESI-MS Текст научной статьи по специальности «Химические науки»

CC BY
91
11
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
Журнал
Научное приборостроение
ВАК
RSCI
Область наук

Аннотация научной статьи по химическим наукам, автор научной работы — Новиков А. В., Бубляев Р. А., Краснов Н. В., Козьмин Ю. П., Кураева Т. Е.

Проведено исследование особенностей взаимодействия ионов серебра с серосодержащими аминокислотами и цистеинсодержащими пептидами. С помощью времяпролетного масс-спектрометра с электрораспылением и ортогональным вводом ионов (ESI-о-TOF) доказано, что наибольшим сродством к ионам серебра обладают цистеин (Cys) и гомоцистеин (Hcy), причем как по отношению к метионину, так и по отношению к остаткам цистеина в пептидах. Впервые обнаружен эффект преимущественного образования ионов, содержащих два атома серебра на одну сульфгидрильную группу цистеинсодержащего пептида, если этому не мешает ближайшее микроокружение.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по химическим наукам , автор научной работы — Новиков А. В., Бубляев Р. А., Краснов Н. В., Козьмин Ю. П., Кураева Т. Е.

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

ESI-MS studies of silver ion competitive interaction with cysteine-containing peptides and sulfur-containing amino a

Investigation of silver ion interaction with sulfur-containing amino acids and cysteine-containing peptides has been performed. Using an electrospray ionisation orthogonal ion introduction time-of-flight (ESI-O-TOF) mass spectrometer, it has been shown that Cys and Hcy exhibit the largest affinity for silver ions with respect to both methionine and cysteine residues in peptides. The effect of predominant formation of ions containing two silver atoms per a sulfhydryl group of cysteine-containing peptides, provided the nearest microenvironment does not hinder this, was revealed for the first time.

Текст научной работы на тему «Изучение конкурентного взаимодействия ионов серебра с цистеинсодержащими пептидами и серосодержащими аминокислотами c помощью ESI-MS»

ISSN 0868-5886

НАУЧНОЕ ПРИБОРОСТРОЕНИЕ, 2007, том 17, № 4, c. 29-36

ОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИ

УДК 621.384.82: 546.57

© А. В. Новиков, Р. А. Бубляев, Н. В. Краснов,

Ю. П. Козьмин, Т. Е. Кураева, О. А. Миргородская

ИЗУЧЕНИЕ КОНКУРЕНТНОГО ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ ИОНОВ СЕРЕБРА С ЦИСТЕИНСОДЕРЖАЩИМИ ПЕПТИДАМИ И СЕРОСОДЕРЖАЩИМИ АМИНОКИСЛОТАМИ С ПОМОЩЬЮ Е81-М8

Проведено исследование особенностей взаимодействия ионов серебра с серосодержащими аминокислотами и цистеинсодержащими пептидами. С помощью времяпролетного масс-спектрометра с электрораспылением и ортогональным вводом ионов (ESI-о-TOF) доказано, что наибольшим сродством к ионам серебра обладают цистеин (Cys) и гомоцистеин (Нсу), причем как по отношению к метионину, так и по отношению к остаткам цистеина в пептидах. Впервые обнаружен эффект преимущественного образования ионов, содержащих два атома серебра на одну сульфгидрильную группу цистеинсодержащего пептида, если этому не мешает ближайшее микроокружение.

ВВЕДЕНИЕ

В настоящее время во всем мире интенсивно изучается влияние ионов серебра на здоровье человека и окружающую среду [1]. Ряд исследований посвящен изучению бактерицидных свойств этих ионов [2-6]. Отмечено также токсическое действие ионов серебра, обусловленное способностью накапливаться в организме человека, что приводит к возникновению такого заболевания, как аргироз, или аргирия [1].

Специфичность взаимодействия ионов серебра с компонентами биологических систем до сих пор мало изучена, что во многом обусловлено рядом методических сложностей. Настоящая работа призвана заполнить пробел в понимании специфичности связывания ионов серебра с серосодержащими группами, входящими с состав пептидов и белков. В качестве метода исследований использована масс-спектрометрия с ионизацией электрораспылением (Б81-М8), которая в настоящее время широко используется для изучения взаимодействия ионов металлов с различными биологически значимыми пептидами и белками [7, 8]. Этот тип ионизации является наиболее "мягким", поскольку не разрушает комплексы (т. е. фрагментация комплексов может произойти лишь при специальных условиях), и, кроме того, позволяет анализировать вещества непосредственно в растворах. К тому же характерное распределение изотопного состава распространенного в природе серебра (51.35 % Ag и 48.65 % Ag ) позволяет однозначно выявлять ионы, образующиеся с его участием.

В качестве лигандов для изучения взаимодействия с ионами серебра нами выбраны серосодержащие аминокислоты — цистеин (Cys), гомоцистеин (Hcy) и метионин (Met), а в качестве модельных пептидов — цистеинсодержащие синтетические пептиды. Выбор пептидов в качестве таких объектов представляется весьма удачным, т. к. они являются фрагментами белковых молекул, а также удобны с методической точки зрения.

Трудности при изучения взаимодействия ионов серебра с лигандами во многом обусловлены тем, что при регистрации комплексообразования проблематично оценить количественные соотношения свободных и связанных ионов металлов в растворе. С помощью ESI-MS оказалось возможным изучить распределение ионов серебра между ли-гандами как при достаточной концентрации ионов металла, так и в условиях конкурентной борьбы за "обладание" металлом при недостаточной его концентрации.

РЕЗУЛЬТАТЫ ЭКСПЕРИМЕНТОВ И ИХ ОБСУЖДЕНИЕ

Серебро из раствора AgNO3 в водно-ацетонитрильной смеси (1:1 по объему) в присутствии 1 %-й уксусной кислоты регистрировалось в виде однозарядных кластерных ионов с одной (m/z = 147.93 и 149.93) или двумя (m/z = 187.95 и 189.95) молекулами ацетонитрила (рис. 1).

Это свидетельствует о "склонности" ионов серебра к образованию комплексных соединений, в данном случае с ацетонитрилом, концентрация которого в данном случае на 5 порядков превышает

100 120 140 160 180

Рис. 1. Масс-спектр раствора AgNО3 в CH3CN

Табл. 1. Результаты масс-спектрометрической регистрации ионов серебра и гомоцистеина в сульфгидриль-ной форме (Нсу) и в виде дисульфида (Нсу2) при различных соотношениях их концентраций

Концентрация Отношение

№ реагентов (мкмоль) интенсивно-стей в масс- Интенсивности комплексных соединений

спектре

Hcy AgNO3 Hcy/Hcy2 Ag+ Ag(CH3CN) + Ag(CH3CN)2+

1 0 30 0 823 11681 14485

2 25 0 1.3 0 0 0

3 25 10 1.1 0 0 0

4 25 20 0.2 0 0 0

5 25 30 0 0 1535 3214

концентрацию ионов серебра. Интенсивности (площади соответствующих пиков с учетом его изотопного распределения) масс-спектров всех комплексных соединений с ионами серебра представлены в табл. 1.

Масс-спектрометрическое исследование взаимодействия серосодержащих аминокислот с серебром

Выбранные аминокислоты — Cys, Hcy и Met легко регистрируются в ESI-MS в виде протони-рованных ионов.

Для гомоцистеина отмечено спонтанное обра-

зование его дисульфида (Нсу2) (см. рис. 2, а). При внесении в раствор гомоцистеина AgNOз в концентрациях, меньших чем аминокислоты, в масс-спектре наблюдается уменьшение интенсивности Нсу по сравнению с Нсу2 (см. рис. 2, б). Отметим, что в спектре отсутствуют любые ионы, содержащие серебро. При внесении избытка AgNО3 по сравнению с гомоцистеином в спектре регистрируется только Нсу2 и кластеры серебра с ацето-нитрилом. Интенсивности всех регистрируемых ионов представлены в табл. 1.

Аналогичным образом ведет себя и Су8. Как в случае гомоцистеина, так и в случае цистеина при концентрациях AgNO3, меньших концентраций

ТОО

Рис. 2. ESI-спектр 25 мкмоль гомоцистеина без AgNO3 (а) и с добавлением 20 мкмоль AgNO3 (б)

Met+

(CH3CN)2 Ag+

(Met) Ag+

(Met)2 Ag+

.....L ilb .

Met+

(Met)2 Ag+

(Met) Ag+

jJUu

1

Рис. 3. ESI-масс-спектр Met в присутствии 30 мкмоль AgNO3 при соотношении их концентраций 1:1 (а) и 10:1 (б)

150 200 250 300 350 400 450

m/z

а

б

аминокислот, регистрируются только их сульф-гидрильные формы, а при избытке AgNO3 регистрируются только комплексы серебра с ацетонит-рилом. При эквивалентном соотношении реагентов в спектре не видно ни ионов серебра, ни соответствующих ионов аминокислот. Можно полагать, что осуществляется ковалентная модификация сульф-гидрильных форм этих аминокислот серебром с образованием нерастворимых продуктов.

Совершенно по-иному ведет себя Met. В экви-молярных концентрациях помимо протонирован-ной формы Met в спектре появляются комплексы ионов серебра как с одной молекулой Met, так и с двумя (рис. 3, а).

Увеличение концентрации Met в 10 раз приводит к увеличению выхода ионов с Ag+, при этом значительно возрастает интенсивность ионов ди-мера Met по сравнению с его мономерной формой (рис. 3, б).

Масс-спектрометрическое исследование взаимодействия пептидов P1 и P2 с серебром, в том числе для Pi в присутствии Cys или Met

Для изучения взаимодействия пептидов с ионами серебра были использованы синтетические пептиды в виде амидов, аминокислотная последовательность которых и соответственно аминокислотный состав представлены в табл. 2.

Табл. 2. Характеристика пептидов, использованных для изучения взаимодействия с AgNOз

№ Пептид Аминокислотная последовательность М**(Да)

1 P1 Ac-DAEFRHDSGYEVHHQKGGGC 2267.97

2 P2 YCAAAACRL 938.44

3 P2* YCAAAACRL 936.44

Примечание. * — дисульфидная форма (SS) P2, — моноизотопная масса.

Рис. 4. ESI-масс-спектр 8 мкмоль P1 без (а) и в присутствии 30 мкмоль AgNO3 (б)

^aLinMri1 ,ll ilJililAlii.in^iifk'i nii-JL-.-.,

m/z

Табл. 3. Состав и интенсивности регистрируемых ионов Pi в присутствии AgNO3, и в том числе Cys или Met

№ Состав смеси (мкмоль) Нормированные интенсивности ионов

Р1 AgNO3 Met Cys Р1

1 8 0 0 0 1 0

2 8 8 0 0 0.84 0.16

3 8 30 0 0 0.34 0.66

4 8 30 0 10 0.72 0.28

5 8 30 0 20 0.81 0.19

6 8 30 0 30 1 0

7 8 30 220 0 0.51 0.49

8 8 30 550 0 0.55 0.45

Пептид с массой 2267.97 (Pj) представлен широким набором аминокислот, в том числе теми, которые могли бы (помимо Cys) выступать в качестве сайтов для комплексообразования. Эксперимент показал, что этот пептид регистрируется в виде 2-5-зарядных ионов в зависимости от условий ионизации. Однако наиболее интенсивными во всех случаях являются 4- и 3-зарядные ионы, как это показано на рис. 4, а.

В присутствии ионов серебра в эквивалентных концентрациях и выше (использованные концентрации реагентов указаны в табл. 3 под № 2, 3) в масс-спектре этого пептида появляются дополнительно 3- и 4-зарядные ионы с серебром, причем эти ионы преимущественно содержат два атома Ag, как это следует из рис. 4, б. Учитывая этот факт, а также способность Cys к ковалентному связыванию, можно полагать, что оба атома Ag связаны именно с Cys: один — ковалентно по сульфгидрильной группе в виде SAg, другой — в виде иона Ag+.

Для выявления других потенциальных сайтов связывания ионов серебра данный пептид был обработан трипсином таким образом, чтобы была отделена часть, содержащая Cys. К полученному гидролизату был добавлен AgNO3. Как следует из масс-спектра, представленного на рис. 5, регистрируются ионы, соответствующие следующим триптическим фрагментам Pj однозарядного иона Ti_5 с miz = 679.3 и Т1-16 в виде двухзарядного и трехзарядного ионов с miz = 998.9 и miz = 666.3 соответственно. Ионов с Ag+ не наблюдается, что свидетельствует, что при выбранных концентрациях компонентов комплексообразования не происходит. Вместе с тем в спектре отсутствует соответствующий ион пептида GGGCNH2, который, по-видимому, теряет растворимость аналогично Cys и Hcy после взаимодействия с AgNO3.

Для оценки конкурентного взаимодействия

Рис. 5. Масс-спектр триптического гидролизата 8 мкмоль Pj в присутствии 30 мкмоль AgNO3

остатка Cys в Р1 с серосодержащими аминокислотами приготовлены смеси Р1 с Cys и Р1 с Met при концентрациях реагентов, указанных в табл. 3 под № 4-8.

Исходное соотношение концентраций Р1 и AgNO3 было выбрано тем же, что и в предыдущем эксперименте (табл. 3, № 3). Из полученных данных (табл. 3, № 4-6) следует, что введение Cys приводит к уменьшению интенсивности иона комплекса пептида с двумя атомами серебра (Р1-

Ti \+3; +4 -1-т

2Ag) . При достижении эквимолярного соотношения концентраций Cys и AgNO3 ионы (Р1-2Ag)+3' 4 полностью исчезают.

В той же таблице (табл. 3, № 6, 7) приведены результаты масс-спектрометрического анализа поведения другого конкурентного лиганда — Met. В этом случае даже при гораздо более высоких концентрациях Met (см. № 8), нежели в присут-

ствии Cys (см. № 4-6), интенсивность ионов (Р1-

т А \+3; +4

2Ag) лишь несколько снижалась относительно интенсивности ионов Р1.

Несмотря на то что спектральные интенсивности не могут отражать абсолютные концентрации, тем не менее зависимость относительных концентраций разных типов ионов от состава среды способна выявить тенденцию. Однозначным во всех случаях является присутствие или отсутствие какого-либо иона. Так, полное исчезновение ионов ^^Ag^3' +4 в присутствии аминокислоты Cys указывает на то, что сродство серебра к свободному Cys выше, чем к Cys, присутствующему в Pi.

На тех же основаниях является убедительным заключение о том, что Met является заведомо более слабым конкурентом для Pi, чем Cys.

Использование другого модельного пептида — Р2 для изучения взаимодействия с AgNO3 пред-

ставлялось целесообразным из нескольких соображений. Во-первых, в этом пептиде присутствуют два остатка Су8. Во-вторых, этот пептид максимально способен образовывать двухзарядные ионы, что удобно для их интерпретации. В-третьих, этот пептид благодаря способности к спонтанному образованию дисульфидных связей в растворе присутствует в двух формах (см. табл. 2, № 2), что позволяет сопоставить сродство к серебру сульфгидрильных групп и дисульфид-ных связей.

Для масс-спектрометрического изучения взаимодействия пептида Р2 с серебром были выбраны два раствора в которых к 22 мкмоль пептида было добавлено в первом варианте — 50 мкмоль AgNOз, во втором — 150 мкмоль AgNOз, масс-спектры которых представлены на рис. 6.

Рис. 6. ESI-масс-спектры смесей 22 мкмоль Р2 с AgNO3 в концентрациях 50 мкмоль (а) и 150 мкмоль (б)

Табл. 4. Состав и интенсивности регистрируемых ионов в растворах, содержащих 22 мкмоль пептида в двух формах (Р2 и *Р2) в присутствии AgNO3

№ AgNÜ3 Типы ионов и их интенсивности

(мкмоль) *P2 (P2-1Ag)+2 (P2-2Ag)+2 (P2-3Ag)+2 (2P2-4Ag)+3

1 50 6250 2829 3750 3987 2385

2 150 7270 0 2533 4341 0

Предварительные эксперименты показали, что пептид, содержащий два Cys, присутствует в растворе в виде двух форм — сульфгидрильной (P2) и дисульфидной ( P2) с соотношениями интенсивно-стей ~ 2:1 соответственно (данные не показаны).

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

Из масс-спектра, представленного на рис. 6, а, видно, что при добавлении AgNO3 в концентрации 50 мкмоль к раствору пептида с содержанием 30 мкмоль SH-групп следует:

• полностью исчезает сульфгидрильная форма пептида (P2);

• P2 регистрируется исключительно в виде ионов, содержащих атомы серебра; типы регистрируемых ионов и их интенсивности представлены в табл. 4 под № 1;

• дисульфидная форма пептида ( P2) регистрируется в виде одно- и двухзарядных ионов без атомов серебра.

Увеличение концентрации ионов серебра в ~ 3 раза (см. рис. 6, б) изменяет и состав регистрируемых ионов P2, содержащих атомы серебра, и их интенсивности (см. табл. 4, № 2).

Удивительной особенностью пептида P2 явилось отсутствие у него способности образовывать ионы с 4 атомами серебра, несмотря на наличие у него двух сульфгидрильных групп, даже при избытке (150 мкмоль) в растворе AgNO3. По аналогии с поведением пептида P1, казалось бы, можно было ожидать присоединения по паре атомов серебра на каждый из двух остатков цистеина, в то время как в действительности образовывались ионы лишь с тремя атомами серебра. Кроме того, при меньшей концентрации AgNO3 (50 мкмоль) зарегистрированы ионы с одним атомом серебра (P2-1Ag)+2.

Такое поведение пептида P2 легко объясняется наличием остатка аргинина (Arg) в непосредственной близости от одного из остатков цистеина. Это соседство не влияет на образование ковалент-ной связи цистеина с первым атомом серебра, но мешает образованию заряженного комплекса со следующим ионом Ag+. Присоединению Ag+ здесь мешает уже имеющийся в этих условиях положительный заряд на протонированной гуанидиновой

группе соседнего аргинина. Таким образом, присоединение иона Ag+ оказывается здесь возможным лишь к удаленному от аргинина остатку Cys, уже связанному ковалентной связью с атомом серебра.

Таким образом, модельный пептид Р2 дополнил наши представления о взаимодействии серебра с цистеинсодержащими пептидами, указывая на особое влияние микроокружения вблизи остатков Cys.

ВЫВОДЫ

ESI-масс-спектрометрия показала себя превосходным методом для исследования особенностей конкурентного взаимодействия ионов серебра с аминокислотами и пептидами.

Проведенное нами исследование взаимодействия серосодержащих аминокислот с ионами серебра показало, что наибольшим сродством к ионам серебра обладают Cys и Hcy. Причем, это преобладание наблюдалось как по отношению к метионину, так и по отношению к остаткам цис-теина в пептидах.

Впервые обнаружен эффект преимущественного образования ионов, содержащих два атома серебра на одну сульфгидрильную группу цистеин-содержащего пептида, если этому не мешает ближайшее микроокружение.

МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ

В работе использована уксусная кислота и аце-тонитрил производства фирмы Merck; аминокислоты: L-метионин, L-цистеин и D-, L-гомоцистеин (Sigma).

Синтез пептидов осуществляли на твердофазном синтезаторе (Intavis AG, Германия) аналогично схеме, описанной в работе [9]. Оба пептида были синтезированы в виде амидов. По завершении синтеза смолу промывали три раза дихлорметаном (Merck, Германия) и высушивали в токе азота в течение 15 мин. Последующее отщепление пепти-

да от смолы и снятие защитных боковых групп выполняли при 21 оС в смеси TFA (Fluka, Германия), триизопропилсилана и воды MilliQ (Millipore, США) в объемном соотношении 95 : 2.5 : 2.5. По истечении двух часов пептиды осаждали холодным (0 оС) трет-бутилметиловым эфиром (Fluka). Пептидный преципитат перерастворяли в 1%-й водной уксусной кислоте и лио-филизовали.

Масс-спектрометрические измерения проводились на времяпролетном масс-спектрометре с электрораспылением и ортогональным вводом ионов МХ5303 (ESI-o-TOF), разработанном в Лаборатории биомедицинской масс-спектрометрии ИАнП РАН. Все спектры получены в режиме съемки положительных ионов. Объем анализируемой пробы составлял 10-50 мкл, скорость подачи раствора образца 1-5 мкл/мин.

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

1. Howe P.D., Dobson S., Wood M. Silver and Silver Compounds: Environment Aspects // Concise International Chemical Assessment Document 44. World Health Organisation. Geneva, 2002.

2. Gupta A., Maynes M., Silver S. Effects of Halides on Plasmid-Mediated Silver Resistance in Es-cherichia coli Silver // Applied and Environmental Microbiology. 1998. V. 64, N 12. P. 50425045.

3. Collins Y.E., Stotzky G. Factors Affecting the Toxicity of Heavy Metals to Microbes // Metal ions and bacteria / Eds. Beveridge T.J., Doyle R.J. N.Y.: John Wiley and Sons, Inc., 1989. P. 31-90.

4. Russell A.D., Hugo W.B. Antimicrobial Activity and Action of Silver // Progress in medicinal chemistry. 1994. V. 31. P. 351-370.

5. Lansdown A. Silver in Health Care: Antimicrobial Effects and Safety in Use // Biofunctional Textiles and the Skin. Curr. Probl. Dermatol. Basel, Karger, 2006. V. 33. P. 17-34.

6. Berthet B., Amiard J.C., Amiard-Triquet C., Mar-toja M., Jeantet A.Y. Bioaccumulation, Toxicity and Physico-Chemical Speciation of Silver in Bivalve Molluscs: Ecotoxicological and Health Consequences // Sci. Total Environ. 1992. V. 125. P.97-122.

7. Vrkis A.K., Taverner T., James P. F., O'Hair R.A.J. Gas Phase Ion Chemistry of Charged Silver(I) Adenine Ions via Multistage Mass Spectrometry Experiments and DFT Calculations // Dalton Transactions. 2004. P. 197-208.

8. Li H., Sui K.W.M., Guevremont R., Le Blanc J.C.Y. Complexes of Silver(1) with Pep-tides and Proteins as Produced in Electrospray Mass Spectrometry // JASMS. 1997. P. 781-792.

9. Kaselmann K.F., Budnik B.A., Kjeldsen F., et al. Electronic Excitation Gives Informative Fragmentation of Polypeptide Cations and Anions // Eur. J. Mass. Spectrom. 2002. V. 8. P. 117-121.

Институт аналитического приборостроения РАН, Санкт-Петербург (Новиков А.В., Бубляев Р.А., Краснов Н.В., Миргородская О.А.)

Институт биоорганической химии им. М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН, Москва (Козьмин Ю.П.)

Государственное учреждение Научно-исследовательский институт биомедицинской химии РАМН, Москва (Кураева Т.Е.)

Материал поступил в редакцию 15.05.2007.

ESI-MS STUDIES OF SILVER ION COMPETITIVE INTERACTION WITH CYSTEINE-CONTAINING PEPTIDES AND SULFUR-CONTAINING

AMINO ACIDS

A. V. Novikov, R. A. Bublyaev, N. V. Krasnov, 1 2 Ju. P. Kozmin , T. E. Kuraeva , O. A. Mirgorodskaya

Institute for Analytical Instrumentation RAS, Saint-Petersburg

lM.M. Shemyakin and Ju.A. Ovchinnikov Institute of Bioorganic Chemistry RAS, Moscow

2Research Institute of Biomedical Chemistry RAMS, Moscow

Investigation of silver ion interaction with sulfur-containing amino acids and cysteine-containing peptides has been performed. Using an electrospray ionisation orthogonal ion introduction time-of-flight (ESI-O-TOF) mass spectrometer, it has been shown that Cys and Hcy exhibit the largest affinity for silver ions with respect to both methionine and cysteine residues in peptides. The effect of predominant formation of ions containing two silver atoms per a sulfhydryl group of cysteine-containing peptides, provided the nearest microenvironment does not hinder this, was revealed for the first time.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.