Научная статья на тему 'ИТОГИ КВАЛИФИКАЦИОННОЙ ПРОГРАММЫ VQC-2002 по ГЕНОДИАГНОСТИКЕ ВИРУСНЫХ ГЕПАТИТОВ'

ИТОГИ КВАЛИФИКАЦИОННОЙ ПРОГРАММЫ VQC-2002 по ГЕНОДИАГНОСТИКЕ ВИРУСНЫХ ГЕПАТИТОВ Текст научной статьи по специальности «Компьютерные и информационные науки»

CC BY
35
7
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по компьютерным и информационным наукам , автор научной работы — А. Х. Aсади Мобархан

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Текст научной работы на тему «ИТОГИ КВАЛИФИКАЦИОННОЙ ПРОГРАММЫ VQC-2002 по ГЕНОДИАГНОСТИКЕ ВИРУСНЫХ ГЕПАТИТОВ»

ИТОГИ КВАЛИФИКАЦИОННОЙ ПРОГРАММЫ VQC-2002 по ГЕНОДИАГНОСТИКЕ ВИРУСНЫХ ГЕПАТИТОВ. Квалификационные программы VQC (viral quality control) проводятся с 1992 г. в Нидерландах на базе отдела диагностических служб Sanquin в г.Алкмаар и диагностической лаборатории в г.Дельфт при участии национальной серологической референс-лаборатории в Мельбурне (Австралия). Целью программы является межлабораторное сравнение и стандартизация методов генодиагностики вирусных инфекций, применяемых в клинической и трансфузионной микробиологии.

Организаторы программы готовят вирусные стандарты, входящие в состав закодированных панелей для количественной оценки диагностических наборов в лабораториях-участниках испытаний. Стандарты на вирусные гепатиты готовятся из плазмы инфицированных больных. Панели предоставляются участникам испытаний за небольшую плату. Полученные участниками результаты обрабатываются и анализируются организаторами программы, после чего результаты испытаний публикуются на сайте www.vqc.nl.

В программе 2002 г. результаты испытания тестов на гепатит С были получены от 39 лабораторий, па гепатит В - от 24 лабораторий и на гепатит А - от 9 лабораторий. Количество данных для заключительного анализа превышало число лабораторий, т.к.некоторые из них использовали несколько различных методов генодиагностики или несколько повторений одного анализа.

Вирус гепатита С (ВГС). Квалификационная панель 2002 включала два отрицательных образца и 10-кратные разведения стандартов РНК ВГС генотипов 1, 2 и 3. Концентрации стандарта генотипа 1 были определены с помощью набора Quantiplex bDNA v2.0 и откалиброваны в международных единицах (ME) путем сравнения с аналогичным стандартом ВОЗ. Таким образом, концентрация в 3800 геном-эквивалентов (гэ)/мл соответствовала 1000 МЕ/мл. Стандарты ВГС генотипов 2 и 3 были откалиброваны в ME с помощью стандарта ВГС генотипа 1 в серии экспериментов с использованием набора Versant bDNA v2.0. Целью программы 2002 являлось количественное определение различных генотипов ВГС в лабораториях-участниках испытаний.

В Таблице 1 представлены методы (наборы) для выявления РНК ВГС в образцах квалификационной панели. В большинстве лабораторий панель тестировали один или два раза.

Таблица 1

Методы (наборы), использованные в 39 лабораториях для тестирования РНК ВГС в _образцах панели VQC__

Метод (набор) Качественное Количественное

определение определение

Авиценна-НСУ-ПЦР 1

Байер Квантиплекс bDNA V3.0 4

Ген-Проб TMAV 1.05 1

Рош Ампликор КОБАС 27

Рош Ампликор MWP 5

Рош Ампликор Монитор КОБАС 5

Рош Ампликор Монитор MWP 2

Рош Амплискрайб Мультипреп 1

"домашний" ПЦР в реальном времени 2

"домашний",количественная кДНК-ПЦР 6

"домашний", количественнаякД НК-ПЦР 2

Всего: 43 13

Критериями квалификации лаборатории по качественному определению являлись правильная идентификация отрицательных контролен и положительных образцов с концентрацией РНК ВГС 3800 гэ/мл (1000 МЕ/мл) или выше. Для количественных исследований требовалась правильная идентификация отрицательных контролей и положительных образцов в концентрации 38 000 гэ/мл и выше. В Таблицах 2, 3, 4 и 5 представлены результаты, полученные различными методами.

Таблица 2

Квалификация лаборатории на панелях ВГС: ложноположительные результаты на отри нцательных контролях

Метод (набор) Качественное определение Количественное определение

Авиценна-НСУ-ПЦР 0/1

Байер Квантиплекс ЪБМЛ У3.0 0/4

Ген-Проб ТМЛ У 1.05 0/1

Рош Ампликор КО БАС Один/27

Рош Ампликор MWP 0/5

Рош Ампликор Монитор КОБАС 0/5

Рош Ампликор Монитор MWP 0/2

Рош Амплискрайб Мультипреп 0/1

"домашний" ПЦР в реальном времени 0/2

"домашний" количественная кДНК-ПЦР Два/6

"домашний",количественная кДНК-ПЦР 0/2

Всего: Три/43 0/13

Таблица 3

Квалификация лабораторий на панелях ВГС: ложноотрицательные результаты на

положительных образцах

Метод (набор) Качественное Количественное

определение определение

Авиценна-НСУ-ПЦР 0/1

Байер Квантиплекс ЪБМЛ У3.0 0/4

Ген-Проб ТМЛУ 1.05 0/1

Рош Ампликор КОБАС Один/27

Рош Ампликор MWP 0/5

Рош Ампликор Монитор КОБАС 0/5

Рош Ампликор Монитор MWP 0/2

Рош Амплискрайб Мультипреп 0/1

"домашний" ПЦР в реальном времени 0/2

"домашний",количественная кДНК-ПЦР 0/6

"домашний",количественная кДНК-ПЦР Дт/о

Всего: Один/43 0/13

Таблица 4

Квалификация лабораторий на панелях ВГС: отрицательные результаты на

образцах, содержащих 3800 гэ/мл

Метод (набор) Качественное определение Количественное определение

Авиценна-НСУ-ПЦР 0/1

Байер Квантиплекс ЪБМЛ У3.0 Четыре/4

Ген-Проб ТМА У1. 05 0/1

Рош Ампликор КОБАС Два/27

Рош Ампликор MWP 0/5

Рош Ампликор Монитор КОБАС 0/5

Рош Ампликор Монитор MWP 0/2

Рош Амплискрайб Мультипреп 0/1

"домашний" ПЦР в реальном времени 0/2

"домашний", количественная кДНК-ПЦР Два/6

" домашний" количественная кДНК-ПЦР 0/2

Всего: Пять/43 Четыре/ 13

Таблица 5 ьности методов на

Квалификационные результаты апа.гатической чувствител серийных разведе ни их стандартов ВГС

Метод (набор) Качественное определение Количественное определение

Авиценна-НСУ-ПЦР Один/1

Байер Квантиплекс ЪБМЛ У3.0 Четыре/4

Ген-Проб ТМА У1. 05 Один/1

Рош Ампликор КОБАС 26/27

Рош Ампликор MWP Пять/5

Рош Ампликор Монитор КОБАС Пять/5

Рош Ампликор Монитор MWP Два/2

Рош Амплискрайб Мультипреп 0/1

"домашний" ПЦР в реальном времени Два/2

"домашний",количествениая кДНК-ПЦР Четыре/6

"домашний",количественная кДНК-ПЦР Два/2

Всего: 40/43 13/13

Правильное определение положительных образцов (стандартов) в разведениях

получено в 100%, правильное определение отрицательных контролен в 95% и достаточная аналитическая чувствительность в 98% использованных методов. При сравнении 'домашних' методов и коммерческих наборов, использованных в испытаниях, последние не показали преимущества над первыми. Отмечалось расхождение в количественной оценке стандартов в МЕ/мл между различными коммерческими методами. В течение периода с 1992 по 2002 гг. лаборатории повысили качество диагностики гепатита С.

Вирус гепатита В (ВГВ).

Квалификационная панель была составлена из серийных разведений стандарта ДНК ВГВ генотипа А с шагом разведений в 0.5 log. Первое разведение, содержавшее 3x10 гэ/мл, представляло собой 10-кратное разведение исходного стандарта, откалиброванного по стандарту Eurohep и стандарту ВОЗ. Одна ME стандарта ВОЗ эквивалентна 7.4 гэ стандарта VQC. Панель позволяла оценивать методы, основанные на ПЦР или гибридизации, с чувствительностью определения соответственно 3x104 гэ/мл и 106 гэ/мл.

Таблица 6

Методы (наборы), использованные в 24 лабораториях для правильного определения

ДНК ВГВ в разведениях стандарта

Метод (набор) Качественное Количественное

определение определение

Авиценна-HBV DNA Один/1

Байер Квантиплекс bDNA V3.0 Один/1

Ампликор HBV монитор 16/18

Дайджин Гибрид Шесть/б

Дайджин Гибрид Сверхчувств Один/1

"домашний"ПЦР реального времени 3/4

"домашние" ПЦР наборы 13/14 Один/1

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

В Таблице 6 представлены методы (наборы), использованные лабораториями-участниками квалификационной программы. 24 лаборатории представили 44 результата. Правильное определение отрицательных образцов получено в 96%, положительных образцов разведений стандарта в 96% всех результатов,

В Таблице 7 представлены результаты соответствия лабораторий квалификационным критериям.

Таблица 7

Методы (наборы), использованные в 24 лабораториях для правильного определения

ДНК ВГВ в разведениях стандарта

Метод (набор) Качественное Количественное

определение определение

Авиценна-HBV DNA 0/1

Байер Квантиплекс bDNA V3.0 0/1

Ампликор HBV монитор 0/18

Дайджин Гибрид О/б

Дайджин Гибрид Сверхчувств 0/1

"домашний" ПЦР реального времени 1/4

"домашние" ПЦР наборы 1/14 0/1

Аналитическая чувствительность качественных методов (наборов) представлена в Таблице 8, количественных методов в Таблице 9.

Таблица 8

Процент положительных результатов, полученных разными методами на разведениях VQC стандартов ВГВ: качественные тесты

HBV-DNA (гэ/мл) «домашние» (n=3) ПЦР в реальном Авиценна

времени (n=3) (n=1)

30 000 000 100% 100% 100%

10000000 100% 100% 100%

3 000 000 100% 100% J00%

1 000 000 100% 100% 100%

300 000 100% 100% 100%

100000 100% 100% 100%

30000 100% 100% 100%

10000 100% 100% 100%

-3-000- 85% 1 00% 100%

1 000 77% 33% 0%

Таблица 9

Процент положительных результатов, полученных разными методами на разведениях

VQC стандартов ВГВ: количественные тесты

HBV-DNA «домашние» bDNA Ампликор Дайджи Дайджин

(гэ/мл) (n=1) (n=1) (n=16) н Сверхчувстви-

(n=6) тельный (n=1)

30000000 100% 100% 100% 100% 100%

10000000 100% 100% 100% 100% 100%

3 000 000 100% 100% 100% 100% 100%

1 000 000 100% 0% 100% 100% 100%

300 000 100% 100% 100% 83% 100%

100000 100% 0% 100% 0% 100%

30000 100% 0% 100% 0% 100%

10000 100% 0% 88% 0% 0%

3 000 100% 0% 94% 0% 0%

1 000 100% 0% 81% 0% 0%

Сравнение результатов в Табл. 8 и 9 показывает, что 'домашние' тесты более чувствительны по сравнению с коммерческими наборами.

Вирус гепатита А (ВГА). Квалификационная панель состояла из разведений (шаг 0.5 log) стандарта VQC, откалиброванного в МЕ/мл при использовании теста Roche LightCycler.

В испытаниях принимало участие 9 лабораторий, большинство из которых использовало коммерческие методы определения РНК ВГА, основанные на ПЦР в реальном времени. Предел аналитической чувствительности для оценки квалификации лаборатории был установлен в 50 МЕ/мл. Из 9 лабораторий только одна, использовавшая коммерческий набор для количественной ПЦР, не удовлетворяла установленным критериям. Данная лаборатория показала два ложноположительных результата на отрицательных контролях. Количественный метод Roche продемонстрировал линейную зависимость в диапазоне концентраций от 17 до 16 700 МЕ/мл (1 ME соответствует 5.1 копии РНК ВГА).

Кроме вирусных гепатитов квалификационная программа VQC включала панели для определения РНК ВИЧ-1, ДНК цитомегаловируса, ДНК парвовируса В19, ДНК вируса герпеса простого 1 и 2 типов и ДНК хламидии трахоматис. К сожалению, от России в данных испытаниях из года в год принимает участие только одна лаборатория медицинского центра «Авиценна», Москва. В 2003 г. программа VQC будет включать в себя инактивированные образцы (стандарты) и обеспечивать участникам доступ к интернет-системе для межлабораторного сравнения результатов и их статистической обработки, А.Х.Асади Мобархан, Медицинский центр «Авиценна», Москва.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.