Научная статья на тему 'ХАРАКТЕРИСТИКА ЦИТОГЕНЕТИЧЕСКИХ И МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИХ НАРУШЕНИЙ ГЕНА CIITA У ПАЦИЕНТОВ С ПЕРВИЧНОЙ МЕДИАСТИНАЛЬНОЙ (ТИМИЧЕСКОЙ) В-КРУПНОКЛЕТОЧНОЙ ЛИМФОМОЙ'

ХАРАКТЕРИСТИКА ЦИТОГЕНЕТИЧЕСКИХ И МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИХ НАРУШЕНИЙ ГЕНА CIITA У ПАЦИЕНТОВ С ПЕРВИЧНОЙ МЕДИАСТИНАЛЬНОЙ (ТИМИЧЕСКОЙ) В-КРУПНОКЛЕТОЧНОЙ ЛИМФОМОЙ Текст научной статьи по специальности «Фундаментальная медицина»

CC BY
82
22
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
Ключевые слова
ПЕРВИЧНАЯ МЕДИАСТИНАЛЬНАЯ (ТИМИЧЕСКАЯ) B-КРУПНОКЛЕТОЧНАЯ ЛИМФОМА / CIITA / FISH-ИССЛЕДОВАНИЕ / ХРОМОСОМНЫЕ АБЕРРАЦИИ / СЕКВЕНИРОВАНИЕ ПО СЭНГЕРУ

Аннотация научной статьи по фундаментальной медицине, автор научной работы — Кузнецова Светлана Александровна, Сурин В.Л., Мангасарова Я.К., Новикова Т.Ю., Гребенюк Л.А.

Актуальность. Первичная медиастинальная (тимическая) В-крупноклеточная лимфома (ПМВКЛ) относится к агрессивным злокачественным лимфопролиферативным заболеваниям и составляет 2-3 % всех неходжкинских лимфом. В 40 % случаев ПМВКЛ встречаются перестройки гена-активатора МНС II класса CIITA. В результате нарушений CIITA происходит снижение экспрессии белка и поверхностной экспрессии MHC II класса, что приводит к отсутствию адаптивного клеточного иммунитета, направленного на клетки опухоли. Цель. Оценить частоту и спектр цитогенетических и молекулярно-генетических нарушений гена CIITA у больных ПМВКЛ. Материалы и методы. В настоящее исследование включено 37 пациентов с диагнозом ПМВКЛ, среди них 10 мужчин и 27 женщин в возрасте 21-61 год (медиана 31 год). Секвенирование по Сэнгеру выполнялось 36 пациентам. FISH-исследование CIITA/16p13.13 проведено 20 больным, стандартное цитогенетическое исследование - 15. Результаты. По результатам секвенирования у 3 (8,3 %) из 36 больных выявлены мутации, нарушающие функцию гена CIITA, микроделеция в экзоне 1, делеция донорного сайта сплайсинга и нуклеотидная замена в этом же сайте. Множественные соматические вариации в интроне 1 обнаружены у 21 (58,3 %) больного: в 11 (52,4 %) случаях - делеции и однонуклеотидные варианты (SNV), в остальных 10 (47,6 %) - только SNV. В 13 (61,9 %) из 21 случая нарушения затрагивали промотор IV и/или альтернативный экзон 1. При FISH-исследовании у 5 (25 %) из 20 больных выявлена транслокация гена CIITA. По результатам стандартного цитогенетического исследования у 7 (46,6 %) из 15 пациентов выявлен комплексный кариотип. При сопоставлении данных показано, что у 8 из 10 пациентов с хромосомными аберрациями, обнаруженными при FISH-исследовании, наблюдался гипермутагенез, причем у 3 (37,5 %) из них в сочетании с комплексными нарушениями кариотипа. Заключение. С помощью молекулярно-генетических методов исследования определены различные соматические вариации в гене CIITA, затрагивающие его функционально важные участки, что представляет интерес для дальнейшего изучения биологии опухоли, в т. ч. ПМВКЛ.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по фундаментальной медицине , автор научной работы — Кузнецова Светлана Александровна, Сурин В.Л., Мангасарова Я.К., Новикова Т.Ю., Гребенюк Л.А.

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

CYTOGENETIC AND MOLECULAR GENETIC ABNORMALITIES OF CIITA GENE IN PATIENTS WITH PRIMARY MEDIASTINAL (THYMIC) LARGE B-CELL LYMPHOMA

Background. Primary mediastinal (thymic) large B-cell lymphoma (PMBCL) is an aggressive malignant lymphoproliférative disease which accounts for 2-3 % of all non-Hodgkin’s lymphomas. In 40 % of PMBCL cases rearrangements of the MHC class II activator, i.e. CIITA gene, are observed. CIITA abnormalities lead to decreasing protein expression and surface expression of MHC class II, which results in lack of adaptive cell immunity targeted at tumor cells. Aim. To assess the rate and spectrum of cytogenetic and molecular genetic abnormalities of CIITA gene in PMBCL patients. Materials & Methods. The study enrolled 37 patients with diagnosed PMBCL: 10 men and 27 women aged 21-61 years (median of 31 years). Sanger sequencing was performed in 36 patients. In 20 patients CIITA/16p13.13 FISH and in 15 patients standard cytogenetic analysis were carried out. Results. In 3 (8.3 %) out of 36 patients the sequencing method detected mutations impairing CIITA gene function, as well as microdeletion in exon 1, deletion and nucleotide substitution in a splice donor site. Multiple somatic variations in intron 1 were identified in 21 (58.3 %) patients: in 11 (52.4 %) cases there were deletions and single nucleotide variants (SNV); the other 10 (47.6 %) patients showed only SNVs. In 13 (61.9 %) out of 21 cases the abnormalities of promoter IV and/or alternative exon 1 were observed. In 5 (25 %) out of 20 patients the FISH assay identified CIITA gene translocation. Standard cytogenetic analysis detected complex karyotype in 7 (46.6 %) out of 15 patients. The comparison of data showed hypermutagenesis in 8 out of 10 patients with FISH-detected chromosome aberrations, and in 3 (37.5 %) of them complex karyotype aberrations were found as well. Conclusion. Molecular genetic methods identified different somatic variations in CIITA gene affecting its functionally important regions, which can be of special interest for further studying the biology of tumors, including PMBCL.

Текст научной работы на тему «ХАРАКТЕРИСТИКА ЦИТОГЕНЕТИЧЕСКИХ И МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИХ НАРУШЕНИЙ ГЕНА CIITA У ПАЦИЕНТОВ С ПЕРВИЧНОЙ МЕДИАСТИНАЛЬНОЙ (ТИМИЧЕСКОЙ) В-КРУПНОКЛЕТОЧНОЙ ЛИМФОМОЙ»

Клиническая онкогематология. 2021;14(2):173-8

Clinical oncohematology. 2021;14(2):173-8

ЛИМФОИДНЫЕ ОПУХОЛИ LYMPHOID TUMORS

Характеристика цитогенетических и молекулярно-генетических нарушений гена CIITA у пациентов с первичной медиастинальной (тимической) В-крупноклеточной лимфомой

С.А. Кузнецова, В.Л. Сурин, Я.К. Мангасарова, Т.Ю. Новикова, Л.А. Гребенюк, А.У. Магомедова, С.К. Кравченко, О.С. Пшеничникова, А.М. Сергеева, Т.Н. Обухова

ФГБУ «НМИЦ гематологии» Минздрава России,

Новый Зыковский пр-д, д. 4, Москва, Российская Федерация, 125167

РЕФЕРАТ

Актуальность. Первичная медиастинальная (тимиче-ская) В-крупноклеточная лимфома (ПМВКЛ) относится к агрессивным злокачественным лимфопролифера-тивным заболеваниям и составляет 2-3 % всех неходж-кинских лимфом. В 40 % случаев ПМВКЛ встречаются перестройки гена-активатора МНС II класса CIITA. В результате нарушений CIITA происходит снижение экспрессии белка и поверхностной экспрессии MHC II класса, что приводит к отсутствию адаптивного клеточного иммунитета, направленного на клетки опухоли. Цель. Оценить частоту и спектр цитогенетических и мо-лекулярно-генетических нарушений гена CIITA у больных ПМВКЛ.

Материалы и методы. В настоящее исследование включено 37 пациентов с диагнозом ПМВКЛ, среди них 10 мужчин и 27 женщин в возрасте 21-61 год (медиана 31 год). Секвенирование по Сэнгеру выполнялось 36 пациентам. FISH-исследование CIITA/16p13.13 проведено 20 больным, стандартное цитогенетическое исследование — 15. Результаты. По результатам секвенирования у 3 (8,3 %) из 36 больных выявлены мутации, нарушающие функцию гена CIITA, микроделеция в экзоне 1, делеция донорного сайта сплайсинга и нуклеотидная замена в этом же сайте. Множественные соматические вариации в интроне 1 обнаружены у 21 (58,3 %) больного: в 11 (52,4 %) случаях — делеции и однонуклеотидные варианты (SNV), в остальных 10 (47,6 %) — только SNV. В 13 (61,9 %) из 21 случая нарушения затрагивали промотор IV и/или альтернативный экзон 1. При FISH-исследова-нии у 5 (25 %) из 20 больных выявлена транслокация гена CIITA. По результатам стандартного цитогенети-ческого исследования у 7 (46,6 %) из 15 пациентов выявлен комплексный кариотип. При сопоставлении данных показано, что у 8 из 10 пациентов с хромосомными аберрациями, обнаруженными при FISH-исследовании, наблюдался гипермутагенез, причем у 3 (37,5 %) из них в сочетании с комплексными нарушениями кариотипа.

Cytogenetic and Molecular Genetic Abnormalities of CIITA Gene in Patients with Primary Mediastinal (Thymic) Large B-Cell Lymphoma

SA Kuznetsova, VL Surin, YaK Mangasarova, TYu Novikova, LA Grebenyuk, AU Magomedova, SK Kravchenko, OS Pshenichnikova, AM Sergeeva, TN Obukhova

National Research Center for Hematology, 4 Novyi Zykovskii pr-d, Moscow, Russian Federation, 125167

ABSTRACT

Background. Primary mediastinal (thymic) large B-cell lymphoma (PMBCL) is an aggressive malignant lymphoprolifer-ative disease which accounts for 2-3 % of all non-Hodgkin's lymphomas. In 40 % of PMBCL cases rearrangements of the MHC class II activator, i.e. CIITA gene, are observed. CIITA abnormalities lead to decreasing protein expression and surface expression of MHC class II, which results in lack of adaptive cell immunity targeted at tumor cells. Aim. To assess the rate and spectrum of cytogenetic and molecular genetic abnormalities of CIITA gene in PMBCL patients.

Materials & Methods. The study enrolled 37 patients with diagnosed PMBCL: 10 men and 27 women aged 21-61 years (median of 31 years). Sanger sequencing was performed in 36 patients. In 20 patients CIITA/16p13.13 FISH and in 15 patients standard cytogenetic analysis were carried out. Results. In 3 (8.3 %) out of 36 patients the sequencing method detected mutations impairing CIITA gene function, as well as microdeletion in exon 1, deletion and nucleotide substitution in a splice donor site. Multiple somatic variations in intron 1 were identified in 21 (58.3 %) patients: in 11 (52.4 %) cases there were deletions and single nucleotide variants (SNV); the other 10 (47.6 %) patients showed only SNVs. In 13 (61.9 %) out of 21 cases the abnormalities of promoter IV and/or alternative exon 1 were observed. In 5 (25 %) out of 20 patients the FISH assay identified CIITA gene translocation. Standard cytogenetic analysis detected complex karyotype in 7 (46.6 %) out of 15 patients. The comparison of data showed hypermutagenesis in 8 out of 10 patients with FISH-detected chromosome aberrations, and in 3 (37.5 %) of them complex karyotype aberrations were found as well.

© 2021 практическая медицина

173

Заключение. С помощью молекулярно-генетических методов исследования определены различные соматические вариации в гене CIITA, затрагивающие его функционально важные участки, что представляет интерес для дальнейшего изучения биологии опухоли, в т. ч. ПМВКЛ.

Conclusion. Molecular genetic methods identified different somatic variations in CIITA gene affecting its functionally important regions, which can be of special interest for further studying the biology of tumors, including PMBCL.

Ключевые слова: первичная медиастинальная (тимическая) B-крупноклеточная лимфома, CIITA, FISH-исследование, хромосомные аберрации, секвенирование по Сэнгеру.

Keywords: primary mediastinal (thymic) B-cell large cell lymphoma, CIITA, FISH, chromosomal aberrations, Sanger sequencing.

Получено: 1S декабря 2020 г. Принято в печать: 11 марта 2021 г.

Received: December 1S, 2020 Accepted: March 11, 2021

Для переписки: Светлана Александровна Кузнецова, Новый Зыковский пр-д, д. 4, Москва, Российская Федерация, 125167; тел.: +7(985)170-61-83; e-mail: svetakuznetsova83@mail.ru Для цитирования: Кузнецова С.А., Сурин В.Л., Мангасарова Я.К. и др. Характеристика цитогенетических и молекулярно-генетических нарушений гена CIITA у пациентов с первичной медиастинальной (тимической) В-крупноклеточной лимфомой. Клиническая онкогематология. 2021;14(2):173-8.

DOI: 10.21320/2500-2139-2021-14-2-173-178

For correspondence: Svetlana Aleksandrovna Kuznetsova, 4 Novyi Zykovskii pr-d, Moscow, Russian Federation, 125167; Tel.: +7(985)170-61-83; e-mail: svetakuznetsova83@mail.ru For citation: Kuznetsova SA, Surin VL, Mangasarova YaK, et al. Cytogenetic and Molecular Genetic Abnormalities of CIITA Gene in Patients with Primary Mediastinal (Thymic) Large B-Cell Lymphoma. Clinical oncohematology. 2021;14(2):173-8. (In Russ).

DOI: 10.21320/2500-2139-2021-14-2-173-178

ВВЕДЕНИЕ

Первичная медиастинальная (тимическая) В-крупно-клеточная лимфома (ПМВКЛ) составляет примерно 2-3 % всех неходжкинских лимфом и 10 % среди В-крупноклеточных лимфом. Медиана возраста больных составляет 35 лет [1, 2]. ПМВКЛ выделена в отдельную нозологическую форму в классификации ВОЗ на основании клинических, иммунофенотипи-ческих и молекулярных характеристик. Опухолевые клетки при ПМВКЛ характеризуются уникальным профилем экспрессии генов, имеющим большее сходство с клетками Березовского—Рид—Штернберга, чем c опухолевым субстратом диффузной В-крупно-клеточной лимфомы.

Согласно литературным данным, одним из наиболее важных патогенетических механизмов является нарушение регуляции иммунного ответа в микроокружении ПМВКЛ. Опухолевые клетки ПМВКЛ обладают способностью ускользать от иммунного надзора, осуществляемого клетками тимического микроокружения, накапливая генетические повреждения, которые способствуют защите опухоли от распознавания Т-клетками. Механизм ускользания от иммунного контроля заключается в блокировании активации Т-клеток и нарушении экспрессии молекул главного комплекса гистосовместимости II класса (MHC-II) [3]. Транскрипция локуса MHC-II строго контролируется мультибелковым комплексом, включающим RFX, X2BP, NF-Y и CHTA. Последний считается основным транскрипционным регулятором экспрессии MHC-II [4, 5]. Согласно имеющимся публикациям, повторяющиеся перестройки CIITA могут быть звеном генетического механизма, лежащего в основе взаимодействия опу-

холи с микроокружением при лимфомах. Последствия перестроек гена CUTA, по-видимому, разнообразны, о чем свидетельствует наличие множественных транслокационных партнеров (включая гены PD-L1 и PD-L2), а также сопутствующие хромосомные нарушения. Функциональные последствия слияния CIITA с генами-партнерами, согласно данным литературы, представляют собой гиперэкспрессию лигандов рецептора программируемой клеточной гибели (PD-L1 и PD-L2). Это влияет на противоопухолевый иммунный ответ [6] и снижение экспрессии молекул МНС-II [7], что связано со снижением иммуногенности опухолевых клеток [8].

Нарушение функции гена CIITA, гиперэкспрессия его транслокационных партнеров и делеция ге-нов-супрессоров опухолей, расположенных в непосредственной близости от гена CIITA, могут быть одновременными последствиями одного события — несбалансированной транслокации [3].

Нарушения в гене CIITA могут быть представлены транслокациями, которые встречаются в 40-50 % случаев ПМВКЛ [3, 9], а также делециями и мутациями кодирующей последовательности. Вероятной причиной большинства мутаций является деятельность одноце-почечной ДНК-специфической цитидиндезаминазы (AID) [10, 11]. В норме AID опосредует соматическую гипермутацию и рекомбинацию с переключением классов иммуноглобулинов путем преобразования остатков цитозина в остатки урацила. Помимо этого мишенью AID могут выступать и транскрипционно активные гены. Гипермутации, затрагивающие неим-муноглобулиновые гены, приводят к аберрантному соматическому гипермутагенезу и подавлению поверхностной экспрессии MHC-II [12].

Экспрессия гена CIITA в разных типах клеток регулируется различными промоторами. Описаны че-

тыре промотора и транскрипты, регулируемые этими промоторами, которые имеют разные первые экзоны. Промотор I активен в дендритных клетках, промотор III (pIII) ограничен В-клетками, тогда как экспрессия CIITA от промотора IV (pIV) может индуцироваться при стимуляции интерфероном-у в самых разных типах клеток, даже без антигена [13]. Согласно исследованиям зарубежных авторов, наиболее часто нарушения в гене CIITA затрагивают экзон 1, прилегающий к нему участок интрона 1 и следующий фрагмент интрона 1, который содержит промотор IV и альтернативный экзон 1 [12]. В связи с этим исследование данных областей гена представляется наиболее актуальной задачей.

При ПМВКЛ до настоящего времени не определены значимые прогностические факторы. Проводится поиск генетических маркеров, которые позволят выделить группу пациентов с высоким риском для разработки индивидуальных подходов к лечению. В ряде исследований показано, что наличие реаранжировок гена CIITA и снижение экспрессии MHC-II коррелируют с более короткой продолжительностью жизни больных ПМВКЛ, демонстрируя потенциальную клиническую значимость этих перестроек при данном варианте заболевания [14].

С другой стороны, понимание патогенеза опухоли открывает возможности назначения таргетных препаратов [15]. Одним из перспективных направлений является включение ингибиторов иммунных контрольных точек в протокол лечения пациентов с ПМВКЛ, учитывая ключевое участие Т-клеточной анергии в патогенезе заболевания за счет гиперэкспрессии и хромосомных нарушений с участием PD-L1/2 и CIITA.

Цель настоящей работы — оценить частоту и спектр цитогенетических и молекулярно-генетиче-ских нарушений гена CIITA у больных с ПМВКЛ.

МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ

В настоящее исследование включено 37 пациентов с диагнозом ПМВКЛ, установленным согласно критериям классификации опухолей кроветворной и лим-фоидной тканей ВОЗ 2017 г. Среди них было 10 мужчин и 27 женщин в возрасте 21-61 год (медиана 31 год), которые наблюдались в ФГБУ «НМИЦ гематологии» МЗ РФ с июня 2007 г. по июнь 2019 г. (табл. 1).

Исследование проводилось на ретроспективном материале (парафиновые блоки), а также на текущем диагностическом биопсийном/операционном материале.

Секвенирование по Сэнгеру выполнено у 36 из 37 больных. ДНК выделяли из ядерных клеток биопсийного материала после селективного лизиса эритроцитов в 0,8% растворе хлорида аммония по стандартной методике, включающей обработку додецилсульфатом натрия (0,5 %) и протеиназой K (200 мкг/мл) в течение ночи при температуре 37 °C или 2 ч при 65 °C с последующей фенольной экстракцией. Для анализа генетических аберраций были выбраны две области гена CUTA: первый экзон и прилегающий к нему участок интрона 1 (983 пн), а также следующий

Таблица 1. Характеристика больных ПМBКЛ

Показатель Пациенты, n = 37

Соотношение мужчин/женщин 10:27

Медиана (диапазон) возраста, лет 31 (21-61)

Риск по aalPI

Низкий/низкий промежуточный 2 (5 %)

Высокий промежуточный/высокий 35 (95 %)

ЛДГ

Норма 5 (14 %)

Выше нормы 32 (86 %)

Схема химиотерапии

РД-ЕРОСН-Р 25 (67 %)

т^Н1_^М-90-Р 12 (33 %)

Результат лечения

Ремиссия 28 (76 %)

Прогрессирование 9 (24 %)

Соотношение живых/умерших 32:5

Медиана (диапазон) периода наблюдения, мес. 21 (7-144)

aalPI — международный прогностический индекс, скорректированный по возрасту < 60 лет; ЛДГ — лактатдегидрогеназа.

фрагмент интрона 1, содержащий промотор IV и альтернативный экзон 1 (1104 пн). Амплификацию функционально важных участков в гене CIITA проводили в системе PCR Master Mix (ThermoScientific, США) с 0,010,02 мкг геномной ДНК и 10 пкмоль каждого из прай-меров в усредненных условиях (94 °C — 2 мин, 62 °C — 1 мин, 75 °C — 3 мин, 30 циклов), используя праймеры CIITA pD (5'-CTGGAGTGTACAATGGACCTGT-3'), CIITA pR (5'-CAGACTTGCTGTGTGACCTTGA-3'), CIITA D (5'-TGATC-CCTCACTTGTTTCTTTGCA-3'), CIITA R (5'-CCTATGAGCT-CAATTCCAGTT-3'). Олигонуклеотидные праймеры синтезировали в ЗАО «Синтол» (Москва). Визуализацию продуктов полимеразной цепной реакции (ПЦР) проводили с помощью регистрации в УФ-свете после разделения электрофорезом в 6% полиакрила-мидном геле и прокрашивания бромистым этидием. ПЦР-фрагменты для секвенирования очищали на колонках Wizard (Promega, USA). Секвенирование проводили в ЦКП «Геном» ИМБ РАН с помощью набора реактивов BigDye Terminator v.3.1 (Applied Biosystems, США) с последующим анализом продуктов реакции на автоматическом секвенаторе ABI PRISM 3100Avant (Applied Biosystems, США).

Флюоресцентная гибридизация in situ (FISH) выполнена у 20 из 37 больных в соответствии со стандартными протоколами на фиксированных клеточных препаратах. Для выявления хромосомных нарушений с вовлечением локуса гена CIIT4/16p13.13 применяли ДНК зонд CIITA Breakapart Probe (CYTOCELL, Великобритания). Для анализа препаратов использовали флюоресцентный микроскоп Zeiss Axioscope (Zeiss, Германия) и документировали с использованием системы визуализации ISIS (Metasystems, Германия). В каждом препарате анализировалось по 200 интерфазных ядер с хорошим качеством сигналов.

Стандартное цитогенетическое исследование (СЦИ) выполнено у 15 из 37 больных. Проводили краткосрочное культивирование (18-24 ч) гомогенизированной клеточной взвеси биопсийного материала. Анализ хромосомных препаратов осуществляли с помощью микроскопа Zeiss Axioscope (Zeiss,

Германия), используя систему визуализации IKAROS (Metasystems, Германия). В каждом препарате анализировали не менее 20 метафаз.

РЕЗУЛЬТАТЫ

По результатам секвенирования множественные соматические вариации (соматический гипермутагенез) в интроне 1 обнаружены у 21 (58,3 %) больного: в 11 (52,4 %) случаях — делеции и однонуклеотидные варианты (SNV), в остальных 10 (47,6 %) — только SNV. В 13 (61,9 %) из 21 случая нарушения затрагивали промотор IV и/или альтернативный экзон 1. У 3 (8,3 %) из 36 больных выявлены мутации, нарушающие функцию гена CIITA, микроделеция в экзоне 1, делеция донорного сайта сплайсинга и нуклеотидная замена в этом же сайте. Одно из этих нарушений сочеталось с гипермутагенезом.

По данным СЦИ у 7 (46,6 %) из 15 пациентов выявлен комплексный кариотип; из них у 4 (57,1 %) пациентов обнаружены перестройки хромосомы 3. В 2 случаях хромосомные аберрации были представлены делециями, в 2 других — дериватами. У 3 (42,8 %) из 7 пациентов выявлены дериваты хромосомы 7. В 1 случае обнаружен дополнительный хромосомный материал на коротком плече хромосомы 9(p24). Повторяющихся точек разрыва хромосом при структурных аберрациях не наблюдалось. Ни в одном из 7 случаев не выявлено аберраций хромосомы 16, затрагивающих локус гена CIITA/16p13.13. У 1 пациента (6,6 %) был нормальный кариотип. У остальных 7 пациентов кариотип проанализировать не удалось, т. к. не было делящихся клеток.

При FISH-исследовании у 5 (25 %) из 20 больных выявлена транслокация гена CIITA (рис. 1): у 3 (15 %) — один дополнительный сигнал от локуса гена CIIT4/16p13.13 (трисомия 16 или дупликация 16p13.13/CIIT4); у 1 (5 %) — отсутствие сигнала от цен-тромерной части локуса гена CIIT4/16p13.13 (делеция центромерной части локуса гена CIIT4/16p13.13?); у 1 (5 %) — один слитный сигнал от локуса гена CIIT4/16p13.13 и два сигнала от центромерной части локуса гена CIIT4/16p13.13 (делеция теломерной части локуса гена CIIT4/16p13.13?). Результаты представлены в табл. 2.

При сопоставлении результатов, полученных разными методами, показано, что у 8 из 10 пациентов с хромосомными аберрациями, обнаруженными при FISH-исследовании, наблюдался гипермутагенез, причем у 3 (37,5 %) из них в сочетании с комплексными нарушениями кариотипа. Из 9 больных с прогрессиро-ванием заболевания в 4 случаях выявлено нарушение функционально значимых участков интрона 1, в 1 — мутация в экзоне 1, еще в 1 — транслокация гена CIIT4.

ОБСУЖДЕНИЕ

ПМВКЛ представляет собой достаточно редкое и агрессивное заболевание с уникальными клинико-морфологическими особенностями. Генетический ландшафт ПМВКЛ характеризуется часто встреча-

Рис. 1. Транслокация с вовлечением локуса гена С//ТА/16р13.13 (стрелки): один красный сигнал от центромерной части локуса гена С//ТА, один зеленый сигнал от теломерной части локуса гена С//ТА и один слитный сигнал от неперестроенного локуса гена С//ТА

Fig. 1. Translocation involving CIITA/16p13.13 gene locus (arrows): a red signal from the centromeric part of CIITA gene locus, a green signal from the telomeric part of CIITA gene locus, and a fusion signal from the non-rearranged CIITA gene locus

Таблица 2. Результаты молекулярно-генетических исследовании

Метод исследования Пациенты, n = 37

Стандартное цитогенетическое исследование

Комплексный кариотип Нормальный кариотип 7/15 (46,6 %) 1/15 (6,6 %)

Секвенирование по Сэнгеру Мутации в экзоне 1 Мутации в промоторе IV и/или альтернативном экзоне Мутации в интроне 1 3/36 (8,3 %) 13/36 (36,1 %) 8/36 (22,2 %)

Флюоресцентная гибридизация in situ

Транслокация гена С//Ш6р13.13 Дополнительный сигнал от гена С//Ш6р13.13 Делеция центромерной части локуса гена С//Ш6р13.13 5/20 (25,0 %) 3/20 (15,0 %) 2/20 (10,0 %)

ющейся гиперплоидией [16-18], а также транслокациями с вовлечением локуса 9p24.1, которые приводят к гиперэкспрессии PD-L1, PD-L2. Кроме того, согласно литературным данным, при ПМВКЛ часто встречаются генетические аберрации, обусловливающие снижение экспрессии гена CIITA и MHC-II. Повторяющиеся мутации при ПМВКЛ часто затрагивают гены, кодирующие белки сигнальных путей JAK/STAT и NF-кВ [3, 12, 19-21].

В последнее время в патогенезе ПМВКЛ все большее значение придают опухолевому микроокружению, а именно механизмам ускользания от иммунного надзора, которые осуществляются различными подтипами Т-клеток. В нескольких исследованиях было показано, что генетические аберрации гена CIITA участвуют в реализации механизма ускользания опухоли от иммунного контроля. Кроме того, наличие генетических нарушений было связано с более неблагоприятным прогнозом для пациентов с ПМВКЛ [12]. На сегодня патогенез ПМВКЛ изучен недостаточно, в связи с чем представляется актуальным исследование генетических аберраций CIITA, что может помочь в

значительной степени расширить понимание биологии и патогенетических механизмов ПМВКЛ.

С целью оценить нарушения гена CIITA в нашей работе мы использовали различные лабораторные методы исследования: секвенирование по Сэнгеру, FISH-исследование и кариотипирование. По результатам секвенирования показано, что мутации CIITA часто затрагивали промотор IV и в анализируемой когорте встречались в 36,1 % случаев. В нашем исследовании выявлено 3 случая с нарушениями гена CIITA в экзоне 1 и прилегающем к нему участке интрона 1, представля ющими собой микроделецию в кодирующей области, мутацию сплайсинга и делецию 19 пн, которая захватывает донорный сайт сплайсинга. Ми-кроделеция приводит к полной потере функции гена, а обе сплайсинговые мутации могут в значительной степени снижать его активность. В 1 из этих 3 случаев нарушение в области экзона 1 сочеталось с транслокацией, обнаруженной при FISH-исследовании. Следствием этого, возможно, является гиперэкспрессия гена транслокационного партнера.

В нашей работе при FISH-исследовании хромосомные аберрации были обнаружены в 50 % случаев, что согласуется с литературными данными [3]. Транслокации гена CIITA составили 25 % случаев, дополнительный сигнал от гена CIITA/16p13.13 (три-сомия 16 или дупликация 16p13.13/CIIT4) обнаружен в 15 % случаев, делеция центромерной части локуса гена CIIT4/16p13.13 — в 10 %. У 1 пациента выявлена транслокация с делецией центромерной части локуса гена CIIT4/16p13.13, вероятные последствия которой могут включать сочетание гиперэкспрессии транслокационного партнера CIITA и делеции генов-супрес-соров опухолей, находящихся в непосредственной близости к гену CIITA [3]. Все обнаруженные при секвенировании мутации в сочетании со структурными изменениями локуса CIITA, включающими транслокации и делеции, составили 67,5 %.

При кариотипировании у 46,6 % пациентов выявлен комплексный кариотип, в половине случаев характеризующийся полиплоидией со множественными структурными аберрациями. Из повторяющихся хромосомных перестроек отмечались дериваты хромосом 3 и 7. В 1 случае обнаружен дополнительный хромосомный материал на коротком плече хромосомы 9 (локус гена PD-L1/2), однако ни в одном случае не было выявлено хромосомных аберраций, затрагивающих хромосому 16 в локусе гена CIITA/16p13.13. СЦИ позволяет получить представление о количественных и структурных нарушениях всего кариотипа, однако ограничено низкой разрешающей способностью. По этой причине для поиска транслокаций CIITA и обнаружения субмикроскопических перестроек необходимо обязательное проведение FISH-исследования и секве-нирования по Сэнгеру у пациентов с ПМВКЛ.

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

Результаты нашей работы показывают, что генетический ландшафт нарушений гена СИТА весьма разнообразен и включает в себя гипермутагенез, микроделеции в кодирующей области, мутации

сплайсинга, делеции, захватывающие донорный сайт сплайсинга, а также транслокации, в т. ч. с де-лецией центромерной части локуса гена СИТА/16р13. При СЦИ выявлена высокая частота комплексных кариотипов при ПМВКЛ. Опираясь на данные литературы [3, 6-8], можно говорить о том, что функциональные последствия этих перестроек различные. На данный момент проводить какие-либо клинические параллели в исследуемой нами группе пациентов не представляется возможным из-за ее небольшого размера и широкого разнообразия встречающихся в ней генетических нарушений гена СИТА. В связи с этим необходимы дальнейшие исследования для формирования в будущем более многочисленных клинических групп с однообразными генетическими нарушениями.

КОНФЛИКТЫ ИНТЕРЕСОВ

Авторы заявляют об отсутствии конфликтов интересов.

ИСТОЧНИКИ ФИНАНСИРОВАНИЯ

Исследование не имело спонсорской поддержки.

ВКЛАД АВТОРОВ

Концепция и дизайн: С.А. Кузнецова, В.Л. Сурин, Я.К. Мангасарова, Т.Н. Обухова.

Предоставление материалов исследования:

Я.К. Мангасарова.

Анализ и интерпретация данных: С.А. Кузнецова, В.Л. Сурин, Т.Н. Обухова. Подготовка рукописи: С.А. Кузнецова. Окончательное одобрение рукописи: все авторы.

БЛАГОДАРНОСТИ

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

Авторы выражают благодарность всем сотрудникам лаборатории кариологии, лаборатории генной инженерии, отделения интенсивной высокодозной химиотерапии гемобластозов ФГБУ «НМИЦ гематологии» МЗ РФ.

ЛИТЕРАТУРА/REFERENCES

1. Cazals-Hatem D, Lepage E, Brice P, et al. Primary Mediastinal Large B-Cell Lymphoma A Clinicopathologic Study of 141 Cases Compared with 916 Nonme-diastinal Large B-cell Lymphomas, a GELA ("Groupe d'Etude des Lymphomes de l'Adulte") Study. Am J Surg Pathol. 1996;20(7):877-88. doi: 10.1097/00000478199607000-00012.

2. Мангасарова Я.К., Магомедова А.У. Нестерова Е.С. и др. Первые результаты терапии первичной медиастинальной В-крупноклеточной лимфомы по программе R-DA-EPOCH-21. Терапевтический архив. 2016;88(7):37-42. doi: 10.17116/terarkh201688737-42.

[Mangasarova YaK, Magomedova AU, Nesterova ES, et al. Therapy for primary mediastinal large B-cell lymphoma in accordance with the R-DA-EPOCH-21 program: the first results. Terapevticheskii arkhiv. 2016;88(7):37-42. doi: 10.17116/ terarkh201688737-42. (In Russ)]

3. Steidl C, Gascoyne RD. The molecular pathogenesis of primary mediastinal large B-cell lymphoma. Blood. 2011;118(10):2659-69. doi: 10.1182/blood-2011-05-326538.

4. Masternak K, Muhlethaler-Mottet A, Villard J, et al. CIITA is a transcriptional coactivator that is recruited to MHC class II promoters by multiple synergistic interactions with an enhanceosome complex. Genes Dev. 2000;14(9):1156-66. doi: 10.1101/gad.14.9.1156.

5. Scholl T, Mahanta SK, Strominger JL. Specific complex formation between the type II bare lymphocyte syndrome-associated transactivators CIITA and RFX5. Proc Natl Acad Sci USA. 1997;94(12):6330-4. doi: 10.1073/pnas.94.12.6330.

6. Blank C, Gajewski TF, Mackensen A. Interaction of PD-L1 on tumor cells with PD-1 on tumor-specific T cells as a mechanism of immune evasion: Implications for tumor immunotherapy. Cancer Immunol Immunother. 2005;54(4):307-14. doi: 10.1007/s00262-004-0593-x.

7. Steidl C, Shah SP, Woolcock BW, et al. MHC class II transactivator CIITA is a recurrent gene fusion partner in lymphoid cancers. Nature. 2011;471(7338):377-83. doi: 10.1038/nature09754.

8. Rimsza LM, Roberts RA, Miller TP, et al. Loss of MHC class II gene and protein expression in diffuse large B-cell lymphoma is related to decreased tumor immunosurveillance and poor patient survival regardless of other prognostic factors: A follow-up study from the Leukemia and Lymphoma Molecular. Blood. 2004;103(11):4251-8. doi: 10.1182/blood-2003-07-2365.

9. Twa DDW, Chan FC, Ben-Neriah S, et al. Genomic rearrangements involving programmed death ligands are recurrent in primary mediastinal large B-cell lymphoma. Blood. 2014;123(13):2062-5. doi: 10.1182/blood-2013-10-535443.

10. Jiang Y, Soong TD, Wang L, et al. Genome-wide detection of genes targeted by Non-Ig somatic hypermutation in lymphoma. PLoS One. 2012;7(7):e40332. doi: 10.1371/journal.pone.0040332.

11. Khodabakhshi AH, Morin RD, Fejes AP, et al. Recurrent targets of aberrant somatic hypermutation in lymphoma. Oncotarget. 2012;3(11):1308-19. doi: 10.18632/oncotarget.653.

12. Mottok A, Woolcock B, Chan FC, et al. Genomic Alterations in CIITA Are Frequent in Primary Mediastinal Large B Cell Lymphoma and Are Associated with Diminished MHC Class II Expression. Cell Rep. 2015;13(7):1418-31. doi: 10.1016/j. celrep.2015.10.008.

13. Muhlethaler-Mottet A, Otten LA, Steimle V, et al. Expression of MHC class II molecules in different cellular and functional compartments is controlled by differential usage of multiple promoters of the transactivator CIITA. EMBO J. 1997;16(10):2851—60. doi: 10.1093/emboj/16.10.2851.

14. Roberts RA, Wright G, Rosenwald AR, et al. Loss of major histocompatibility class II gene and protein expression in primary mediastinal large B-cell lymphoma is highly coordinated and related to poor patient survival. Blood. 2006;108(1):311-8. doi: 10.1182/blood-2005-11-4742.

15. Balzarotti M, Santoro A. Checkpoint inhibitors in primary mediastinal B-cell lymphoma: a step forward in refractory/relapsing patients? Ann Transl Med. 2020;8(16):1035. doi: 10.21037/atm.2020.04.06.

16. Rosenwald A, Wright G, Leroy K, et al. Molecular diagnosis of primary mediastinal B cell lymphoma identifies a clinically favorable subgroup of diffuse large B cell lymphoma related to Hodgkin lymphoma. J Exp Med. 2003;198(6):851-62. doi: 10.1084/jem.20031074.

17. Miao Y, Medeiros LJ, Li Y, et al. Genetic alterations and their clinical implications in DLBCL. Nat Rev Clin Oncol. 2019;16(10):634-52. doi: 10.1038/ s41571-019-0225-1.

18. Joos S, Otano-Joos M.I, Ziegler S, et al. Primary mediastinal (thymic) B-cell lymphoma is characterized by gains of chromosomal material including 9p and amplification of the REL gene. Blood. 1996;87(4):1571-8.

19. Feuerhake F, Kutok JL, Monti S, et al. NFkB activity, function, and target-gene signatures in primary mediastinal large B-cell lymphoma and diffuse large B-cell lymphoma subtypes. Blood. 2005;106(4):1392-9. doi: 10.1182/blood-2004-12-4901.

20. Guiter C, Dusanter-Fourt I, Copie-Bergman C, et al. Constitutive STAT6 activation in primary mediastinal large B-cell lymphoma. Blood. 2004;104(2):543-9. doi: 10.1182/blood-2003-10-3545.

21. Lees C, Keane C, Gandhi MK, et al. Biology and therapy of primary me-diastinal B-cell lymphoma: current status and future directions. Br J Haematol. 2019;185(1):25-41. doi: 10.1111/bjh.15778.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.