CC BY
8
Оригинальные статьи
Original articles
Инфекция и иммунитет Russian Journal of Infection and Immunity = Infektsiya i immunitet
2023, Т. 13, № 1, с. 100-106 2023, vol. 13, no. 1, pp. 100-106
ГЕНОТИПИРОВАНИЕ РИККЕТСИЙ, ЦИРКУЛИРУЮЩИХ НА ТЕРРИТОРИЯХ РЕСПУБЛИКИ АЛТАЙ И ХАБАРОВСКОГО КРАЯ
С.В. Штрек1,2, Н.В. Рудаков1,2, С.Н. Шпынов1,2, А.В. Санников1, И.Е. Самойленко1, Л.Д. Щучинова3, О.Е. Троценко4, А.Г. Драгомерецкая4, Е.В. Матущенко1,2
1ФБУН Омский НИИприродно-очаговых инфекций Роспотребнадзора, г. Омск, Россия
2 ФГБОУ ВО Омский государственный медицинский университет Минздрава России, г. Омск, Россия
3 Управление Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека по Республике Алтай, г. Горно-Алтайск, Россия
4 Хабаровский НИИ эпидемиологии и микробиологии Роспотребнадзора, г. Хабаровск, Россия
Резюме. Цель — верификация возбудителя сибирского клещевого тифа (СКТ) при микст-инфицированности иксодовых клещей на территории Республики Алтай и Хабаровского края с применением комплексного моле-кулярно-биологического подхода. Материалы и методы. Материалом для исследования служили 304 имаго иксодовых клещей шести видов. Сбор клещей проводился на территории Республики Алтай и Хабаровского края в 2014—2022 гг. ДНК риккетсий идентифицировали методом двухраундовой ПЦР с использованием родо- и видо-специфических праймеров генов gltA и ompA с последующим секвенированием и с помощью ПЦР с использованием наборов реагентов «РеалБест ДНК R. sibirica/R. heilongjiangensis» (ЗАО «Вектор-Бест», Новосибирск). Результаты. Частота выявления ДНК риккетсий в иксодовых клещах в Республике Алтай составила 82,6% (ДИ: 69,1—96,1), в Хабаровском крае — 53,1% (ДИ: 44,9—61,3). Видовой состав риккетсий в различных видах иксодовых клещей на этих территориях, эндемичных по сибирскому клещевому тифу, характеризуется наличием микст-инфицированности. ДНК Rickettsia sibirica и R. raoultii удалось обнаружить в клещах Dermacentor nuttalli, Haemaphysalis concinna, D. silvarum. В клещах Ixodespersulcatus, I. pavlovskyi и в гибридах I. pavlovskyi/persulcatus выявлена ДНК только Candidatus R. tarasevichiae. ДНК R. heilongjiangensis обнаружена в клещах H. concinna в Хабаровском крае. В клещах D. nuttalli и H. concinna из Республики Алтай выявлена только ДНК Candidatus R. tarasevichiae. ДНК «классического» патогенного вида — R. sibirica выявлена в клещах D. nuttalli и H. concinna в Республике Алтай, клещах D. silvarum, H. concinna и H. japonica douglasi — в Хабаровском крае. Кроме того, в Хабаровском крае в клещах H. concinna обнаружена ДНК — R. heilongjiangensis, в клещах H. japonica douglasi выявлен фрагмент ДНК, общий для R. sibirica subsp. mongolitimonae и R. conorii, что требует дальнейшего изучения. ДНК Candidatus R. tarasevichiae детектирована в клещах рода Ixodes (I. persulcatus, I. pavlovskyi и их гибридах), в Республике Алтай — в клещах D. nuttalli и H. concinna. ДНК R. raoultii выявлена в клещах рода Dermacentor — D. nuttalli — в Республике Алтай и D. silvarum в Хабаровском крае. Выводы. При молекулярно-биологическом мониторинге риккетсий на эндемичных территориях выявление R. raoultii «маскирует» присутствие этиологического агента СКТ — R. sibirica. Этот феномен позволяет объяснить высокий уровень заболеваемости СКТ на изучаемых территориях при редкой выявляемости ДНК R. sibirica при молекулярно-биологическом скрининге в иксодовых клещах.
Ключевые слова: Rickettsia sibirica, Rickettsia heilongjiangensis, Candidatus Rickettsia tarasevichiae, Rickettsia raoultii, Республика Алтай, Хабаровский край.
Адрес для переписки:
Штрек Сергей Владимирович 644080, Россия, г. Омск, пр. Мира, 7, ФБУН Омский НИИ природно-очаговых инфекций Роспотребнадзора. Тел.: 8 (3812) 65-14-77. E-mail: studi1990@mail.ru
Для цитирования:
Штрек С.В., Рудаков Н.В., Шпынов С.Н., Санников А.В., Самойленко И.Е., Щучинова Л.Д., Троценко О.Е., Драгомерецкая А.Г., Матущенко Е.В. Генотипирование риккетсий, циркулирующих на территориях Республики Алтай и Хабаровского края // Инфекция и иммунитет. 2023. Т. 13, № 1. C. 100-106. doi: 10.15789/2220-7619-GOR-2014
© Штрек С.В. и соавт., 2023
Contacts:
Sergey V. Shtrek
644080, Russian Federation, Omsk, Mira pr., 7, Omsk Research Institute of Natural Focal Infections. Phone: +7 (3812) 65-14-77. E-mail: studi1990@mail.ru
Citation:
Shtrek S.V., Rudakov N.V., Shpynov S.N., Sannlkov A.V., Samoylenko I.E., Shchuchlnova L.D., Trotsenko O.E., Dragomeretskaya A.G., Matushchenko E.V. Genotyping of rickettsias circulating in the territories of the Altai Republic and Khabarovsk Krai // Russian Journal of Infection and Immunity = Infektsiya i immunitet, 2023, vol. 13, no. 1, pp. 100-106. doi: 10.15789/2220-7619-G0R-2014
DOI: http://dx.doi.org/10.15789/2220-7619-G0R-2014
Статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 The article can be used under the Creative Commons Attribution 4.0 License
GENOTYPING OF RICKETTSIAS CIRCULATING IN THE TERRITORIES OF THE ALTAI REPUBLIC AND KHABAROVSK KRAI
Shtrek S.V.ab, Rudakov N.V.ab, Shpynov S.N.ab, Sannikov A.V.a, Samoylenko I.E.a, Shchuchinova L.D.c, Trotsenko O.E.d, Dragomeretskaya A.G.d, Matushchenko E.V.ab
a Omsk Research Institute of Natural-Focal Infections, Omsk, Russian Federation b Omsk State Medical University of the Ministry of Health of Russia, Omsk, Russian Federation
c Office of the Federal Service for Surveillance on Consumer Rights Protection and Human Wellbeing in the Altai Republic, Gorno-Altaisk, Russian Federation
d Khabarovsk Research Institute of Epidemiology and Microbiology of Federal Service for Surveillance on Consumer Rights Protection and Human Wellbeing, Khabarovsk, Russian Federation
Abstract. The aim of the study was to verifícate of the causative agent of Siberian tick-borne typhus (STT) upon ixodic tick mixed infection on the territory of the Altai Republic and Khabarovsk Krai using an integrated molecular biological approach. Materials and methods. The material for the study was presented as 304 imago of ixodic mites of six species. The ticks were collected on the territory of the Altai Republic and the Khabarovsk Krai in the years 2014—2022. Rickettsia DNA was identified by two-round PCR using genus- and species-specific primers for gltA and ompA genes, followed by sequencing and using PCR reagent kits "RealBest DNA R. sibirica/R. heilongjiangensis" (Vector-Best, Novosibirsk). Results. The detection of rickettsia in ticks in the Altai Republic was 82.6% (CI: 69.1-96.1), in the Khabarovsk Krai — 53.1% (CI: 44.9-61.3). The species composition of rickettsias in various species of ixodic mites in these territories, endemic to Siberian tick typhus, is characterized by the presence of mixed forms. Rickettsia sibirica and R. raoultii were found in ticks Dermacentor nuttalli, Haemaphysalis concinna, D. silvarum. Only Candidatus R. tarasevichiae were detected in Ixodes persulcatus, I. pavlovsky mites and I. pavlovsky/persulcatus hybrids. The DNA of R. heilongjiangensis was found in H. mites. concinna in the Khabarovsk Krai. The DNA of Candidatus R. tarasevichiae is also present in the ticks of D. nuttalli and H. concinna from the Altai Republic. The DNA of the "classic" pathogenic species, R. sibirica, was detected in ticks D. nuttalli and H. concinna in the Altai Republic, ticks D. silvarum, H. concinna and H. japonica douglasi in the Khabarovsk Krai. In addition, in the Khabarovsk Krai, the DNA of R. heilongjiangensis was detected in H. concinna ticks, and a DNA fragment common to R. sibirica subsp. mongolitimonae and R. conorii was detected in H. japonica douglasi ticks, which requires further study. Candidatus R. tarasevichiae is common in Ixodes mites (I. persulcatus, I. pavlovsky and their hybrids), in the Altai Republic in D. nuttalli and H. concinna. R mites. raoultii was detected in ticks of the genus Dermacentor — D. nuttalli in the Altai Republic and D. silvarum in the Khabarovsk Krai. Conclusions. During molecular biological monitoring of rickettsias in endemic territories, the detection of R. raoultii "masks" the presence of the etiological agent of STT — R. sibirica. This phenomenon makes it possible to explain the high incidence of STT in the studied territories, with the rare detectability of R. sibirica DNA during molecular biological screening in ixodic mites.
Key words: Rickettsia sibirica, Rickettsia heilongjiangensis, Candidatus Rickettsia tarasevichiae, Rickettsia raoultii, Altai Republic, Khabarovsk Krai.
Введение
Впервые описанные случаи ранее неизвестного риккетсиального заболевания, возникающего на эндемичных территориях Азиатской части России после присасывания клещей и протекающего с высокой температурой, первичным аффектом, розеолезно-петехиальной сыпью, изменениями со стороны центральной нервной системы, выявлены практически одновременно (1934—1935 гг.) в Приморье — «клещевая лихорадка Приморья», в Хабаровском крае — «дальневосточная сыпная клещевая лихорадка», в Красноярском крае — «клещевая сыпная лихорадка» [6].
Планомерное изучение новой инфекции в 1937—1938 гг. в Красноярском крае под руководством М.К. Кронтовской позволило выделить клещевой сыпной тиф (в настоящее время регистрируют как сибирский клещевой тиф — СКТ) в самостоятельную нозологическую форму. Установлена риккетсиозная этио-
логия заболевания (по современной номенклатуре Rickettsia sibirica subsp. sibirica), классический переносчик — клещи Dermacentor nuttalli Ol, основные эпидемиологические закономерности. В 1940 г. экспедицией, возглавляемой М.К. Кронтовской, в Хабаровском крае выделены штаммы риккетсий от больных, клещей Haemaphysalis concinna и Dermacentor silvarum [4].
В результате многолетних исследований выявлен широкий нозоареал СКТ с наибольшим эпидемическим потенциалом очагов на юге Сибири и Дальнего Востока России. Применительно к эндемичным территориям число эпидемически значимых переносчиков в очагах колеблется от одного-двух (D. nuttalli — горные степи Алтая, лесостепи Минусинской и Канской котловин, Тувы, Предбайкалья и Забайкалья; D. marginatus и в меньшей степени D. reticulatus — равнинные степные и лесостепные ландшафты Западно-Сибирской низменности, D. silvarum и H. concinna — лесостепи Салаира, Кузнецкой котловины, юга Дальнего
Востока) до четырех видов (D. marginatus,
H. concinna, D. silvarum, D. reticulatus — северная лесостепь Алтайского края, Северный Алтай) [7]. В Республике Алтай находятся наиболее эпидемически активные очаги СКТ и отмечается наиболее высокий уровень заболеваемости в России: среднемноголетний показатель заболеваемости достигает 72 на 100 тыс. населения, что примерно в 50 раз превышает аналогичный показатель по РФ [9].
Уже в первый период изучения клещевых риккетсиозов (КР) возникли вопросы об отличиях циркулирующих на очаговых территориях штаммов риккетсий. Удалось установить этиологию случаев КР на юге Хабаровского края как вызванных R. heilongjiangensis [2, 17]. Эта риккет-сия выявлена в «пятнах» H. concinna в пределах нозоареала КР в Приморском, Хабаровском, Алтайском и Красноярском краях, в последнем — также в клещах D. nuttalli [18, 19]. В Хабаровском крае в клещах Ixodes persulcatus молекулярными методами выявляли Candidatus R. tarasevichiae, R. helvetica и R. heilongjiangensis [1, 3]
По современным представлениям, основанным на многолетнем изучении штаммов риккет-сий из коллекции Омского НИИ природно-оча-говых инфекций, на Дальнем Востоке России, наряду с классическим возбудителем СКТ R. sibirica subsp. sibirica, циркулируют R. heilongjiangensis и геновариант R. sibirica subsp. BJ-90 [5].
Целью данного исследования является верификация возбудителя СКТ при микст-инфици-рованности риккетсиями иксодовых клещей на территории Республики Алтай и Хабаровского края с применением комплексного моле-кулярно-биологического подхода.
Материалы и методы
Материалом для исследования служили 304 имаго клещей шести видов (D. nuttalli, D. silvarum, H. concinna, H. japonica douglasi,
I. persulcatus, I. pavlovskyi, I. pavlovskyi/persulcatus). Сбор клещей проводился на флаг на территории Республики Алтай и Хабаровского края в 2014—2022 гг. (табл. 1). Идентификацию клещей осуществляли по морфологическим признакам по Филипповой [10]. Из клещей, полученных в 2014, 2018 и 2019 гг. готовили гомогенизированную суспензию, у клещей, собранных в 2022 г., для исследования забирали гемолимфу с последующим выделением ДНК.
Выделение нуклеиновых кислот проводили наборами «АмплиПрайм РИБО-преп» компании «ИнтерЛабСервис» (Москва, Россия) и набором реагентов «РеалБест экстракция 100» ЗАО «Вектор-Бест» (Новосибирск, Россия). ДНК риккетсий выявляли (табл. 2) методом двухраундовой ПЦР с использованием родо-
и видоспецифических праймеров генов gltA и ompA [15] с последующим секвенировани-ем и в ПЦР-РВ с помощью наборов реагентов «РеалБест ДНК R. sibirica/R. heilongjiangensis» (ЗАО «Вектор-Бест», Новосибирск).
95% доверительный интервал (ДИ) уровня выявляемости риккетсий в клещах был рассчитан в программе MS Excel.
Результаты
В результате ПЦР-анализа установлена суммарная выявляемость ДНК риккетсий в 82,6% (ДИ: 69,1—96,1) иксодовых клещей на территории Республики Алтай. ДНК риккетсий была выявлена в 84,4% (ДИ: 69,0-99,8) исследованных клещей D. nuttalli. Самым распространенным видом риккетсий в клещах этого вида оказалась R. raoultii, обнаруженная в 47,4% (ДИ: 38,8-56,0) иксодид. В D. nuttalli также в высоком количестве выявлена ДНК R. sibirica в 35,3% (ДИ: 28,9-41,7) и Ca. R. tarasevichiae в 1,7% (1,4-2,0). В 21,6% (ДИ: 17,7-25,5) этого вида клещей установлена микст-инфицированность R. sibirica и R. raoultii. ДНК риккетсий была выявлена в 73,9% (ДИ: 43,7-100) клещей H. concinna. Среди выявленных риккетсий преобладающим видом была Ca. R. tarasevichiae (39,1%; ДИ: 23,2-55,0). Реже была выявлена ДНК R. sibirica и R. raoultii. В одной пробе выявлены одновременно Ca. R. tarasevichiae и R. raoultii. В клещах I. persulcatus идентифицировали только Ca. R. tarasevichiae.
При исследовании клещей, собранных на флаг в 2018 г. на территории Хабаровского края, уровень выявляемости ДНК риккетсий составил 53,1% (ДИ: 44,9-61,3). ДнК риккетсий была выявлена в 22,2% (ДИ: 11,9-32,5) исследованных клещей H. concinna. Чаще всего в клещах этого вида выявлялась ДНК R. sibirica, в одном экземпляре генотипировали R. heilongjiangensis. ДНК риккетсий была обнаружена в 13,0% (ДИ: 7,7-18,3) исследованных клещей H. japonica douglasi. Чаще выявлялась ДНК R. sibirica, фрагмент последовательности гена gltA у одного из образцов был идентичен последовательности R. sibirica subsp. mongolitimonae/R. conorii (GenBank: KT345979.1). В 60,0% (ДИ: 47,6-72,4) исследованных клещей I. pavlovskyi была выявлена ДНК риккетсий, идентифицированная как Ca. R. tarasevichiae. Схожая картина наблюдалась в клещах I. persulcatus и гибридах I. pavlovskyi/persulcatus, где так же выявляли ДНК Ca. R. tarasevichiae, уровень выявляемо-сти составил 90,9% (ДИ: 37,2-100), и 68,8% (ДИ: 35,1-100) соответственно. В клещах D. silvarum выявлена ДНК R. sibirica, в том числе одновременно с R. raoultii.
Обсуждение
В данной работе установлено, что у основных переносчиков возбудителя СКТ (D. nuttalli, H. concinna, D. silvarum) [7] с применением комплексного молекулярно-биологического подхода ДНК R. sibirica выявляется значительно чаще при микст-инфицированности с R. raoultii, чем индивидуально. В единичных случаях может встречаться микст-инфицированность Ca. R. tarasevichiae и R. raoultii клещей вида H. concinna, при этом первый вид риккетсий является преобладающим. В одном экземпляре клеща H. japonica douglasi из Хабаровского края получен сиквенс фрагмента (512 п.о.) гена цитратсинтазы (gltA) имеющий 100% гомологии по 501 нуклеотиду с R. sibirica subsp. mongolitimonae и с R. conorii, что требует дальнейшего изучения.
Установлена суммарная выявляемость риккетсий в 82,6% (ДИ: 69,1—96,1) клещей на территории Республики Алтай, что подтверждает полученные нами ранее данные при исследовании иксодовых клещей на наличие антигенов рик-кетсий группы КПЛ с помощью разработанной ИФА тест-системы [11].
Удалось доказать ранее высказанное предположение о недостаточной информативности применения ПЦР с «классическими» (gltA, OmpA) праймерами в очагах СКТ [20], не позволяющее выявлять в индивидуальных пробах иксодовых клещей R. sibirica при более массовом присутствии копий ДНК R. raoultii [8].
Таблица 1. Характеристика исследованных клещей
Table 1. Characteristics of the studied ticks
При очевидных преимуществах метода секве-нирования по Сэнгеру, на этапе ПЦР с применением родоспецифичных праймеров осуществляется амплификация варианта гена только одного вида риккетсий, при этом ДНК остальных видов не выявляется. Комплексный подход, основанный на применении различных модификаций ПЦР с разными видами праймеров, включая родо- и видоспецифичные, с последующим сек-венированием позволило получить более объективную информацию при скриннинге ДНК различных видов риккетсий в индивидуальных пробах иксодовых клещей. В результате применения этого подхода ДНК «классического» патогенного вида — R. sibirica выявлена в клещах D. пиШШ и H. concinna в Республике Алтай, клещах D. silvarum, H. concinna и H. japonica douglasi в Хабаровском крае. В то же время при генотипи-ровании риккетсий в пробах клинического материала от пациентов в очагах СКТ в Республике Алтай, Алтайском и Хабаровском краях удалось выявить ДНК R. sibirica и R. heilongjiangensis [12, 13, 16]. При этом на территории Новосибирской области в пробах клинического материала от пациентов с подозрением на «клещевые» инфекции ДНК R. sibirica выявлялась в 2,3 раза чаще, чем R. raoultii [14].
Выводы
При молекулярно-биологическом мониторинге риккетсий на эндемичных территориях выявление R. moulШ «маскирует» присутствие этиоло-
Вид клещей Species of ticks Год сбора Year of collection Место сбора Gathering place Количество Quantity
D. nuttalli 2014 Кош-Агачский р-н Р.А.*/Kosh-Agachsky district A.R.* 65
2019 Усть-Коксинский р-н Р.А./Ust-Koksinsky district A.R. 1
2022 Онгудайский р-н Р.А./Ongudai district A.R. 50
H. concinna 2019 Горно-Алтайский р-н Р.А./Gorno-Altaisky district A.R. 3
Майминский р-н Р.А./Maiminsky district A.R. 4
Чойский р-н Р.А./Choysky district A.R. 16
2018 Хабаровский р-н Х.К/VKhabarovsk district Kh.K.** 18
I. persulcatus 2019 Чойский р-н Р.А./Choysky district A.R. 5
2018 Хабаровский р-н Х.К./Khabarovsk district Kh.K. 9
Р-н имени Лазо Х.К./Lazo District Kh.K. 2
H. japonica douglasi 2018 Хабаровский р-н Х.К./Khabarovsk district Kh.K. 23
I. pavlovskyi 2018 Хабаровский р-н Х.К./Khabarovsk district Kh.K. 63
Р-н имени Лазо Х.К./Lazo District Kh.K. 27
I. pavlovskyi/persulcatus 2018 Хабаровский р-н Х.К./Khabarovsk district Kh.K. 12
Р-н им. Лазо Х.К./Lazo District Kh.K. 4
D. silvarum 2018 Р-н им. Лазо Х.К./Lazo District Kh.K. 2
Примечание. 'Республика Алтай; "Хабаровский Край. Note. *Altai Republic; "Khabarovsk Krai.
Таблица 2. Результаты исследования иксодовых клещей, собранных на территориях Республики Алтай и Хабаровского края на наличие ДНК риккетсий
Table 2. The results of the study of ixodic ticks collected in the territories of the Altai Republic and the Khabarovsk Krai for the presence of Rickettsia DNA
Вид клеща Species of tick Республика Алтэй/Altai Republic Хабаровский край/Khabarovsk Krai
Вид возбудителя Species of pathogen Количество Quantity % (ДИ/CI) Вид возбудителя Species of pathogen Количество Quantity % (ДИ/ci)
D. nuttalli R. sibirica* 16 13,8% (11,7-15,9) Данный вид клещей отсутствует на указанной территории This species of ticks is not present in the specified territory
Candidates R. tarasevichiae** 2 1,7% (1,5-2,0)
R. raoultii* 55 47.4% (40,1-54,8)
R. sibirica****/R. raoultii* 25 21,6% (18,2-24,9)
H. concinna R. sibirica**** 1 4,4% (2,8-5,9) R. sibirica**** 3 16,7% (10,1-23,2)
R. raoultii*** 5 21,7% (14,2-29,3) R. heilongjiangensis**** 1 5,6% (3,4-7,7)
Candidatus R. tarasevichiae** 8 34,8% (22,7-46,9)
R. sibirica****/R. raoultii*** 2 8,7% (5,7-11,7) Риккетсия не идентифицирована* Rickettsia has not been identified 1 5,6% (3,4-7,7)
R. raoultii***/R. tarasevichiae** 1 4,4% (2,8-5,9)
1. persulcatus Candidatus R. tarasevichiae** 4 80,0% (20,3-100) Candidatus R. tarasevichiae** 10 90,9% (45,2-100)
H. japonica douglasi Данный вид клещей отсутствует на указанной территории This species of ticks is not present in the specified territory R. sibirica subsp. mongolitimonae/R. conorii** 1 4,4% (2,8-5,9)
R. sibirica**** 2 8,7% (5,7-11,7)
1. pavlovskyi Данный вид клещей в этой работе не исследовался This species of mites has not been studied in this work Candidatus R. tarasevichiae** 54 60,0% (49,5-70,6)
1. pavlovskyi/ persulcatus Данный вид клещей в этой работе не исследовался This species of mites has not been studied in this work Candidatus R. tarasevichiae** 11 68,8% (40,1-97,5)
D. silvarum Данный вид клещей в этой работе не исследовался This species of mites has not been studied in this work R. sibirica**** 1 50,0% (0-100)
R. sibirica****/R. raoultii** 1 50,0% (0-100)
Примечание. * — ПЦР с видоспецифическими праймерами к гену отрА] ** — ПЦР+секвенирование фрагмента гена gltA] *** — ПЦР+секвенирование фрагмента гена отрА] **** — Наборов реагентов для ПЦР в режиме реального времени «РеалБестДНКЯ. sibirica/R. heilongjiangensis».
Note. *— PCR with species-specific primers for the OmpAgene; ** — PCR+sequencing of gltA gene fragment; *** — PCR+sequencing of OmpA gene fragment; **** — Sets of reagents for real-time PCR "RealBest DNA Я. sibirica/R. heilongjiangensis".
гического агента СКТ — R. sibirica. Этот феномен позволяет объяснить высокий уровень заболеваемости СКТ на изучаемых территориях при редкой выявляемости ДНК R. sibirica при молекулярно-биологическом скрининге в иксодовых клещах.
Необходимо внедрение комплексного моле-кулярно-биологического подхода для совершенствования эпидемиологического надзора за природными очагами СКТ за счет молеку-
Список литературы/ЯеТегепсеБ
лярно-биологического скрининга ДНК риккет-сий в иксодовых клещах и изучения значимости различных видов риккетсий в структуре региональной инфекционной патологии.
Конфликт интересов
Авторы заявляют об отсутствии конфликта интересов.
1. Бондаренко Е.И., Мокрецова Е.В., Здановская Н.И., Высочина Н.П., Пуховская Н.М., Тимофеев Д.И., Иванов М.К. Выявление возбудителей клещевого риккетсиоза в клещах и крови пациентов на Дальнем Востоке с помощью ПЦР-анализа в режиме реального времени. Поликлиника. 2014. № 4—1. С. 44—48. [Bondarenko E.I., Mokrecova E.V., Zdanovskaya N.I., Vysochina N.P., Puhovskaya N.M., Timofeev D.I., Ivanov M.K. Detection of tick-borne rickettsiosis pathogens in ticks and blood of patients in the Far East using real-time PCR analysis. Poliklinika = Polyclinic, 2014, no. 4-1, pp. 44—48. (In Russ.)]
2. Григорьева Я.Е., Карань Л.С., Мокрецова Е.В., Щучинова Л.Д., Федорова М.В., Журенкова О.Б., Шипулин Г.А., Малеев В.В. Сравнительный анализ ПЦР- и ИФА-методов в лабораторной диагностике риккетсиозов группы КПЛ на примере трехлетних исследований в Республике Алтай и Хабаровском крае // Молекулярная диагностика. 2017. Т. 2. С. 192—194. [Grigor'eva Ya.E., Karan' L.S., Mokrecova E.V., Shchuchinova L.D., Fedorova M.V., Zhurenkova O.B., Shipulin G.A., Maleev V.V. Comparative analysis of PCR and ELISA methods in laboratory diagnostics of rickettsioses of the KPL group on the example of three-year studies in the Altai Republic and Khabarovsk Krai. Molekulyarnaya diagnostika = Molecular Diagnostics, 2017, vol. 2, pp. 192—194. (In Russ.)]
3. Иголкина Я.П., Бондаренко Е.И., Рар В.А., Епихина Т.И., Панов В.В., Высочина Н.П., Пуховская Н.М., Малькова М.Г., Василенко А.Г., Якименко В.В., Танцев А.К., Иванов М.К., Тикунова Н.В. Молекулярно-генетический анализ рик-кетсий, переносимых клещами Ixodes persulcatus schulze на территории юга Западной Сибири и Дальнего Востока // Национальные приоритеты России. 2014. № 3 (13). С. 100—103. [Igolkina Y.P., Bondarenko E.I., Rar V.A., Epikhina T.I., Panov V.V., Vysochina N.P., Pukhovskaya N.M., Malkova M.G., Vasilenko A.G., Yakimenko V.V., Tantsev A.K., Ivanov M.K., Tikunova N.V. Molecular genetic analysis of Rickettsia spp. Transmitted by Ixodes persulcatus ticks in the south-Western Siberia and the Far East. Nacional'nyeprioritety Rossii = Russia's National Priorities, 2014, no. 3 (13), pp. 100—103. (In Russ.)]
4. Рудаков Н.В. К 75-летию открытия Rickettsia sibirica — возбудителя клещевого сыпного тифа: история изучения и современные представления // Эпидемиология и вакцинопрофилактика. 2014. № 1. С. 4—5. [Rudakov N.V. 75th anniversary of the Rickettsia sibirica discovery: history of study and modern ideasi. Epidemiologiya i vaktsinoprofilaktika = Epidemiology and Vaccine Prevention, 2014, no. 1, pp. 4—5. (In Russ.)]
5. Рудаков Н.В. Риккетсии и риккетсиозы: руководство для врачей. Омск: ИЦ «Омский научный вестник», 2016. 424 с. [Rudakov N.V. Rickettsia and rickettsioses: a guidebook for doctors. Omsk: Omsk Science Bulletin, 2016. 424p. (In Russ.)]
6. Рудаков Н.В., Оберт А.С. Клещевой риккетсиоз. Омск: Изд-во Омской государственной медицинской академии, 2001. 120 с. [Rudakov N.V., Obert A.S. Tick-borne rickettsiosis. Omsk: Omsk State Medical Academy Publishing, 2001. 120p. (In Russ.)]
7. Рудаков Н.В., Рудакова С.А. Клещевые трансмиссивные инфекции Сибири. Практическое руководство. Омск: ООО ИЦ «Омский научный вестник», 2019. 146 с. [Rudakov N.V., Rudakova S.A. Tick-borne vector-borne infections of Siberia. Practical guide. Omsk: LLC Omskiy nauchnyy vestnik Publishing Center, 2019. 146p. (In Russ.)]
8. Рудаков Н.В., Самойленко И.Е., Решетникова Т.А. Проблемы лабораторной диагностики риккетсиозов группы клещевой пятнистой лихорадки в России // Клиническая лабораторная диагностика. 2015. № 1. С. 50—52. [Rudakov N.V., Samoilenko I.E, Reshetnikova T.A. The problems of laboratory diagnostic of rickett siosis ofgroup spott ed tick-bite fever in Russia. Clinicheskay laboratornay diagnostika = Russian Clinical Laboratory Diagnostics, 2015, no. 1, pp. 50—52. (In Russ.)]
9. Рудаков Н.В., Шпынов С.Н., Транквилевский Д.В., Пакскина Н.Д., Савельев Д. А., Самойленко И.Е., Решетникова Т. А., Кумпан Л.В., Пеньевская Н.А. Особенности эпидемической ситуации по сибирскому клещевому тифу и другим клещевым риккетсиозам в Российской Федерации, прогноз на 2019 г. // Проблемы особо опасных инфекций. 2019. № 1. С. 89-97. [Rudakov N.V., Shpynov S.N., Trankvilevsky D.V., Pakskina N.D., Savel'ev D.A., Samoylenko I.E., Reshetnikova T.A., Kumpan L.V., Pen'evskaya N.A. Features of the epidemiological situation on siberian tick typhus and other tick-borne ricketsioses in the Russian Federation, prognosis for. Problemy osobo opasnyh infekcij = Problems of Particularly Dangerous Infections, 2019, no. 1, pp. 89-97. (In Russ.)] doi: 10.21055/0370-1069-2019-1-89-97
10. Филиппова Н.А. Таксономическая внутривидовая дифференциация у иксодовых клещей (Acari: Ixodidae) с позиций морфологической концепции вида // Паразитология. 2007. Т. 41, № 6. С. 409-427. [Filippova N.A. Intraspecific taxonomic differentiation in ticks (Acari: Ixodidae) in the view of the morphological conception of species. Parazitologiya = Parasitology, 2007, vol. 41, no. 6, pp. 409-427. (In Russ.)]
11. Шпынов С.Н., Рудаков Н.В. Иммуноферментная тест-система для выявления риккетсий группы клещевой пятнистой лихорадки // Лабораторное дело. 1991. № 11. С. 67-69. [Shpynov S.N., Rudakov N.V., Enzyme immunoassay system for detecting rickettsias of the tick-spot fever group. Laboratornoe delo = Laboratornoe Delo, 1991, no. 11, pp. 67- 69. (In Russ.)]
12. Щучинова Л.Д., Злобин В.И., Ечешева А.В., Бондаренко Е.И. Современные эпидемиологические черты сибирского клещевого тифа в Республике Алтай // Современные проблемы науки и образования. 2017. № 6. [Schuchinova L.D., Zlobin V.I., Echesheva A.V., Bondarenko E.I. Modern epidemiological featuresof the siberian tick typhus in the Altai Republic. Sovremennye problemy nauki i obrazovaniya = Modern Problems of Science and Education, 2017, no. 6. (In Russ.)] URL: https:// science-education.ru/ru/article/view?id=27089 (19.02.2023)
13. Granitov V., Shpynov S., Beshlebova O., Arsenjeva I., Dedkov V., Safonova M., Stukolova O., Pantjukhina A., Tarasevich I. New evidence on tick-borne rickettsioses in the Altai region of Russia using primary lesions, serum and blood clots of molecular and serological study. Microbes Infect., 2015, vol. 17, no. 11-12, pp. 862—865. doi: 10.1016/j.micinf.2015.08.011
14. Igolkina Y., Krasnova E., Rar V., Savelieva M., Epikhina T., Tikunov A., Khokhlova N., Provorova V., Tikunova N. Detection of causative agents of tick-borne rickettsioses in Western Siberia, Russia: identification of Rickettsia raoultii and Rickettsia sibirica DNA in clinical samples. Clin. Microbiol. Infect, 2018, vol. 24, no. 2,pp. 199.e9-199.e12. doi: 10.1016/j.cmi.2017.06.003
15. Igolkina Y., Rar V., Yakimenko V., Malkova M., Tancev A., Tikunov A., Epikhina T., Tikunova N. Genetic variability of Rickettsia spp. in Ixodes persulcatus/Ixodes trianguliceps sympatric areas from Western Siberia, Russia: Identification of a new Candidatus Rickettsia species. Infection, Genetics and Evolution, 2015, no. 34, pp. 88—93. doi: 10.1016/j.meegid.2015.07.015
16. Mediannikov O., Sidelnikov Y., Ivanov L., Fournier P.E., Tarasevich I., Raoult D. Far eastern tick-borne rickettsiosis: identification of two new cases and tick vector. Ann. NY Acad. Sci., 2006, vol. 1078, pp. 80—88. doi: 10.1196/annals.1374.010
17. Mediannikov O., Sidelnikov Y., Ivanov L., Mokretsova E., Fournier P.-E., Tarasevich I., Raoult D. Acute tick-borne rickettsiosis caused by Rickettsia heilongjiangensis in Russian Far East. Emerg. Infect. Dis., 2004, vol. 10, no. 5, pp. 810—817. doi: 10.3201/ eid1005.030437
18. Shpynov S., Fournier P.E., Rudakov N., Tankibaev M., Tarasevich I., Raoult D. Detection of a rickettsia closely related to Rickettsia aeschlimannii, "Rickettsia heilongjiangensis", Rickettsia sp. strain RpA4, and Ehrlichia muris in ticks collected in Russia and Kazakhstan. J. Clin. Microbiol, 2004, vol. 42, no. 5,pp. 2221—2223. doi: 10.1128/JCM.42.5.2221-2223.2004
19. Shpynov S., Fournier P.E., Rudakov N., Tarasevich I., Raoult D. Detection of members of the genera Rickettsia, Anaplasma, and Ehrlichia in ticks collected in the Asiatic part of Russia. Ann. NY Acad. Sci., 2006, vol. 1078, pp. 378—383. doi: 10.1196/an-nals.1374.075
20. Shpynov S., Parola P., Rudakov N., Samoilenko I., Tankibaev M., Tarasevich I., Raoult D. Detection and identification of spotted fever group rickettsiae in Dermacentor ticks from Russia and central Kazakhstan. Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis., 2001, vol. 20, no. 12, pp. 903—905. doi: 10.1007/s10096-001-0638-4
Авторы:
Штрек С.В., к.м.н., старший научный сотрудник, зав. лабораторией зоонозных инфекций отдела природно-очаговых бактериальных зоонозов ФБУН Омский НИИ природно-очаговых инфекций Роспотребнадзора, г. Омск, Россия; доцент кафедры микробиологии, вирусологии и иммунологии ГБОУ ВПО Омский государственный медицинский университет, г. Омск, Россия;
Рудаков Н.В., д.м.н. профессор, директор ФБУН Омский НИИ природно-очаговых инфекций Роспотребнадзора, г. Омск, Россия; зав. кафедрой микробиологии, вирусологии и иммунологии ГБОУ ВПО Омский государственный медицинский университет, г. Омск, Россия; Шпынов С.Н., д.м.н., главный научный сотрудник лаборатории зоонозных инфекций отдела природно-очаговых бактериальных зоонозов (ПОБЗ) ФБУН Омский НИИ природно-очаговых инфекций Роспотребнадзора, г. Омск, Россия; профессор кафедры микробиологии, вирусологии и иммунологии ГБОУ ВПО Омский государственный медицинский университет, г. Омск, Россия;
Санников А.В., младший научный сотрудник лаборатории зоонозных инфекций отдела ПОБЗ ФБУН Омский НИИ природно-очаговых инфекций Роспотребнадзора, г. Омск, Россия;
Самойленко И.Е., к.м.н., ведущий научный сотрудник лаборатории зоонозных инфекций отдела ПОБЗ ФБУН Омский НИИ природно-очаговых инфекций Роспотребнадзора, г. Омск, Россия;
Щучинова Л.Д., д.м.н., начальник отдела Управления
Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав
потребителей и благополучия человека по Республике Алтай,
г. Горно-Алтайск, Республика Алтай;
Троценко О.Е., д.м.н., директор ФБУН Хабаровский НИИ
эпидемиологии и микробиологии Роспотребнадзора,
г. Хабаровск, Россия;
Драгомерецкая А.Г., к.м.н., начальник отдела природно-очаговых инфекций ФБУН Хабаровский НИИ эпидемиологии и микробиологии Роспотребнадзора, г. Хабаровск, Россия; Матущенко Е.В., к.м.н., доцент кафедры микробиологии, вирусологии и иммунологии ГБОУ ВПО Омский государственный медицинский университет, г. Омск, Россия.
Поступила в редакцию 12.08.2022 Принята к печати 11.02.2023
Authors:
Shtrek S.V., PhD (Medicine), Senior Researcher, Head of the Laboratory of Zoonotic Infections, Department of Natural Focal Bacterial Zoonoses, Omsk Research Institute of Natural Focal Infections, Omsk, Russian Federation; Associate Professor, Department of Microbiology and Virology and Immunology, Omsk State Medical University, Omsk, Russian Federation; Rudakov N.V., DSc (Medicine), Professor, Director of Omsk Research Institute of Natural Focal Infections, Omsk, Russian Federation; Head of the Department of Microbiology and Virology and Immunology, Omsk State Medical University, Omsk, Russian Federation;
Shpynov S.N., DSc (Medicine), Head Researcher, Laboratory of Natural Focal Infections, Department of Natural Focal Bacterial Zoonoses, Omsk Research Institute of Natural Focal Infections, Omsk, Russian Federation; Professor, Department of Microbiology and Virology and Immunology, Omsk State Medical University, Omsk, Russian Federation;
Sannikov A.V., Junior Researcher, Laboratory of Natural Focal Infections, Department of Natural Focal Bacterial Zoonoses, Omsk Research Institute of Natural Focal Infections, Omsk, Russian Federation;
Samoylenko I.E., PhD (Medicine), Leading Researcher, Laboratory of Natural Focal Infections, Department of Natural Focal Bacterial Zoonoses, Omsk Research Institute of Natural Focal Infections, Omsk, Russian Federation;
Shchuchinova L.D., DSc (Medicine), Head of the Department of the Federal Service for Supervision of Consumer Rights Protection and Human Welfare in the Republic of Altai, Gorno-Altaisk, Russian Federation;
Trotsenko O.E., DSc (Medicine), Director of Khabarovsk Research Institute of Epidemiology and Microbiology of the Rospotrebnadzor, Khabarovsk, Russian Federation;
Dragomeretskaya A.G., PhD (Medicine), Head of the Department of Natural Focal Infections, Khabarovsk Research Institute of Epidemiology and Microbiology, Khabarovsk, Russian Federation; Matushchenko E.V., PhD (Medicine), Associate Professor, Department of Microbiology and Virology and Immunology, Omsk State Medical University, Omsk, Russian Federation.
Received 12.08.2022 Accepted 11.02.2023
