Научная статья на тему 'Генотипическое разнообразие вируса гепатита с, циркулирующего среди населения Нижегородской области'

Генотипическое разнообразие вируса гепатита с, циркулирующего среди населения Нижегородской области Текст научной статьи по специальности «Клиническая медицина»

CC BY
256
48
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
Журнал
Медицинский альманах
ВАК
Область наук
Ключевые слова
ГЕПАТИТ С-ИНФЕКЦИЯ / ВИРУС ГЕПАТИТА С / ПОЛИМЕРАЗНАЯ ЦЕПНАЯ РЕАКЦИЯ / ГЕНОТИПИЧЕСКАЯ СТРУКТУРА ВИРУСА / HEPATITIS CINFECTION / VIRUS OF HEPATITIS C / POLYMERASE CHAIN REACTION / GENOTYPICAL STRUCTURE OF VIRUS

Аннотация научной статьи по клинической медицине, автор научной работы — Быстрова Татьяна Николаевна, Корочкина Ольга Владимировна, Михайлова Юлия Владимировна, Карувваккат Ольга Сергеевна

В настоящей работе рассмотрена генотипическая структура вируса гепатита С среди пациентов инфекционных стационаров Нижегородской области с использованием метода ПЦР с электрофоретической и с гибридизационно-флуоресцентной детекцией в режиме «Real-Time». Показаны значительное разнообразие циркулирующих генотипов, доминирующие субтипы и их неравномерное распределение на исследуемой территории

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по клинической медицине , автор научной работы — Быстрова Татьяна Николаевна, Корочкина Ольга Владимировна, Михайлова Юлия Владимировна, Карувваккат Ольга Сергеевна

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Genotypical diversity of the virus of hepatitis C which circulates among the population of Nizhny Novgorod region

The genotypical structure of the virus of hepatitis C among the patients of infectious hospitals of Nizhny Novgorod region with the use of the method of polymerase chain reaction with electrophoretic and hybridization-fluorescent detection in the regimen «Real-Time» is given in the article. There are shown the considerable diversity of circulating genotypes, dominating subtypes and their uneven distribution on the examined territory.

Текст научной работы на тему «Генотипическое разнообразие вируса гепатита с, циркулирующего среди населения Нижегородской области»

ЭПИДЕМИОЛОГИЯ

Эпидемиология

IVh

МЕДИЦИНСКИЙ

АЛЬМАНАХ

УДК 616.36-002:616.988(470.341)

ГЕНОТИПИЧЕСКОЕ РАЗНООБРАЗИЕ ВИРУСА ГЕПАТИТА С, ЦИРКУЛИРУЮЩЕГО СРЕДИ НАСЕЛЕНИЯ НИЖЕГОРОДСКОЙ ОБЛАСТИ

Т.Н. Быстрова1, О.В. Корочкина2, Ю.В. Михайлова1, О.С. Карувваккат1,

1 ФГУН «Нижегородский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии им. акад. И.Н. Блохиной»,

2ГОУ ВПО «Нижегородская государственная медицинская академия»

Михайлова Юлия Владимировна - e-mail: gepatit-bystrova@yandex.ru

В настоящей работе рассмотрена генотипическая структура вируса гепатита С среди пациентов инфекционных стационаров Нижегородской области с использованием метода ПЦР с электрофоретической и с гибридизационно-флуоресцентной детекцией в режиме «Real-Time». Показаны значительное разнообразие циркулирующих генотипов, доминирующие субтипы и их неравномерное распределение на исследуемой территории.

Ключевые слова: гепатит С-инфекция, вирус гепатита С, полимеразная цепная реакция, генотипическая структура вируса.

The genotypical structure of the virus of hepatitis C among the patients of infectious hospitals of Nizhny

Novgorod region with the use of the method of polymerase chain reaction with electrophoretic and hybridization-fluorescent detection in the regimen «Real-Time» is given in the article. There are shown the considerable diversity of circulating genotypes, dominating subtypes and their uneven distribution on the examined territory.

Key words: hepatitis C- infection, virus of hepatitis C, polymerase chain reaction,

genotypical structure of virus

Введение сравнении с данными по РФ за период с 1997 по 2009 г.

Повсеместное распространение, исключительно высокая хронизация делают проблему гепатита С (ГС) особенно актуальной. Наиболее детально изучены закономерности течения и развития острых форм ГС, в то время, как именно хронические и скрытые варианты инфекции определяют основную часть эпидемического процесса, социальную значимость и прогноз данной инфекции [1, 2]. Большое влияние на течение инфекционного процесса ГС оказывает значи-^ тельная генетическая гетерогенность вируса, по-разному влияя на особенности течения болезни, эффективность противовирусной терапии, а возможно, и на частоту хрониза-ции инфекции [2-5].

В настоящее время определение генотипов вируса ГС (ВГС) имеет не только клиническое, но и значительное эпидемиологическое значение. Помимо знаний о частоте выявления отдельных генотипов в различных регионах РФ, не менее важным являются исследования динамики генотипического разнообразия ВГС в пределах одной территории, с учетом полного спектра маркеров инфекции, с целью прогнозирования изменений эпидемиологической ситуации, предотвращения дальнейшего распространения инфекции. В частности, доминирование и возможный дальнейший рост доли субтипа 1Ь, который значительно снижает эффективность интерферонотерапии, ведет к увеличению длительно существующих источников ГС-инфекции. В случае создания кандидатной вакцины возможность ее применения и эффективность также будут определяться степенью изученности популяционной структуры ВГС, а именно, знанием превалирующих генотипов.

Цель исследования: изучение структуры генетических вариантов вируса гепатита С, циркулирующих среди населения Нижегородской области.

Материалы и методы

С целью изучения особенностей распространения ГС на основе данных официальной статистики проведен сравнительный анализ динамики заболеваемости манифестным острым (ОГС) и хроническим ГС (ХГС), включая латентную форму инфекции, на территории Нижегородской области в

В сыворотках крови 637 лиц, госпитализированных с предварительным диагнозом: «вирусный гепатит» в стационары различных городов Нижегородской области, определены анти-ВГС методом ИФА. Анти-ВГС-позитивные образцы проверены на наличие РНК ВГС, генотипированы методом ПЦР с различными методами детекции полученных результатов. Использование электрофоретической детекции в агарозном геле, окрашенном бромистым этидием, позволяет дифференцировать 1а, 1в, 2, 3а генотипы ВГС, в то время как гибридизационно-флуоресцентная детекция в режиме «Real-Time» дает возможность дополнительно определять четвертый генотип вируса [3,4]. При изучении 132 историй болезни лиц с заключительным диагнозом: «ХГС» проанализирована структура генотипов вируса в зависимости от давности инфицирования. Пациенты с известным возрастом разделены на 4 группы с интервалом в 10 лет. Полученные данные обработаны в программе Biostat.

Результаты и их обсуждение

Анализ официально регистрируемых данных в период с 1997 по 2009 г. отражает снижение заболеваемости ОГС; а также стабилизацию ХГС в последние годы как по РФ в целом, так и в Н. Новгороде на уровне 37-41%000 и 63-790/0000 соответственно. На протяжении всего периода наблюдения отмечен рост соотношения между показателями ОГС и ХГС (для Н. Новгорода: с 1:0,7 в 1997 г. до 1:52 в 2009 г.). Кроме того, в отличие от некоторых территорий РФ, когда пики заболеваемости острым и хроническим ГС разделены пятью годами, в Н. Новгороде выраженный подъем ОГС сопровождался пиком регистрации ХГС уже через 3 года. Полученные данные свидетельствуют об интенсивности эпи -демического процесса ГС на исследуемой территории, о значительном росте темпов накопления источников инфекции, отражая широкий потенциал нозоформы.

Анти-ВГС среди пациентов обнаружены в 32,0±1,8%, что свидетельствует о наличии у них инфекции, вызванной ВГС. В подавляющем большинстве у этих пациентов установлен диагноз ХГС (96,0±1,6%). Как известно, ГС редко диагностируется в фазе острого заболевания, являясь, в основном,

Э п и де м и о ло ги я

хронической инфекцией, что связано с ярко выраженной хрониогенной способностью возбудителя. В отличие от ОГС, когда РНК ВГС обнаружена во всех исследованных случаях, репликативная активность вируса при ХГС составила 76,0±3,5%, свидетельствуя о стадии реактивации инфекционного процесса.

Проведенное генотипирование выявило в Нижегородской области следующие генотипы ВГС: 1b - 42,6±4,0%; 1а -4,1±1,6%; 2 - 4,7±1,7%; 3а - 32,4±3,8%, которые, согласно данным литературы, являются типичными для территории РФ [3-6]. При этом были получены сравнимые результаты генотипирования как при использовании ПЦР с электрофо-резной детекцией, так и в режиме «реального времени». Следует отметить, что применение метода ПЦР с гибридизационно-флуоресцентной детекцией позволяет увеличить аналитическую чувствительность тест-систем (согласно заявленным характеристикам: 100 МЕ/мл для «Real-Time» в сравнении с 103 МЕ/мл при гель-электрофорезе) [3, 7]. Это особенно важно для идентификации образцов, нетипируемых с помощью электрофоретической детекции. Это может быть связано с низкой вирусной нагрузкой (согласно литературным данным - менее 104 МЕ/ мл) и наличием редких микст вариантов генотипов [7, 8]. Применение «Real-Time» позволило сократить число нетипируемых вариантов с 26,5±1,7 до 9,5±2,4%. Образцы, в которых генотип повторно не определялся, требуют дальнейшего анализа методом секвенирования. Кроме того, в 7,0±2,0% установлено наличие микст-генотипов - 1Ь/3а, которые выявлены только с использованием гибридизационно-флуоресцентной детекции. Обнаружение микст вариантов генотипов, возможно, связано с повторным инфицированием другим штаммом вируса.

В отличии от большинства территорий РФ, где наблюдается выраженное преобладание генотипа 1b ВГС, в Нижегородской области субтипы 1b и 3а превалировали в равной мере [9, 10]. Аналогичные данные получены Пахалковой Е.В. (2004), Цыганко Е.В. (2007), Маркиным Н.В. (2004) по Омской, Свердловской и Ростовской области [4-6]. Вместе с тем, выраженная неравномерность эпидемического процесса ГС на исследуемой территории проявилась и в неоднородности генотипической структуры вируса. Так, в отличии от Н. Новгорода и Балахны, где не выявлено различий в частоте обнаружения доминирующих субтипов 1b и 3а, в Дзержинске 1b достоверно преобладал над 3а (p<0,05). Остальные субтипы вируса выявлялись значительно реже и также неравномерно на исследуемой территории. Наибольшая доля микст-генотипов приходилась на лиц, госпитализированных в стационары Н. Новгорода, что составило 70,0±1,5% от общего количества образцов с ^/3а. В Н. Новгороде и Балахне отмечены единичные находки генотипов 1а и 2, которые не циркулируют в Дзержинске. В то же время, именно на больных ГС в г. Дзержинске приходилась наибольшая доля нетипируемых образцов (17,6±3,1%). Все вышесказанное обуславливает необходимость исследования региональных особенностей генотипической структуры ВГС, особенно превалирующих генотипов, для изучения эволюционных проявлений эпидемического процесса ГС в современных условиях на конкретной территории.

Частота обнаружения субтипов 1b и 3а не зависела от формы инфекции и давности заболевания, они одинаково

преобладали как при остром, так и хроническом ГС. Так, при ОГС в 50,0±15,8% выявлен генотип 1Ь и в 40,0±13,4% - 3а.

Частота обнаружения доминирующих генотипов при ХГС составила 43,2±5,2% и 31,8±4,9% соответственно. При этом ХГС отличался значительным разнообразием выявляемых генотипов, включая субтипы 1а (3,4%) и 2 (6,8%), а также микст-генотипов 1Ь/3 (8,0%), ни один из которых не был выявлен в фазе острой инфекции. Обращает на себя внимание, что субтип 1а у больных ХГС начинает выявляться лишь в период 2006-2010 гг.

Среди обследованных лиц 67,0±3,3% составляли мужчины и 33,0±3,3% - женщины. При этом, у женщин 1Ь достоверно преобладал над 3а (р<0,01),а у мужчин данные субтипы превалировали в равной доли. Другие генотипы выявлялись значительно реже и примерно одинаково в обеих группах.

Различия в частоте обнаружения доминирующих генотипов выявлены только у лиц 50 лет и старше, где 1Ь достоверно преобладал над 3а (62,9±8,2% и 8,6±3,7% соответственно). В остальных возрастных группах 1Ь и 3а превалировали в равной мере. Следует отметить, что у лиц старше 30 лет наблюдалась тенденция к равномерному увеличению доли 1Ь с возрастом (с 22,5±6,6% в 30 лет до 63,0±8,2% у лиц старше 50 лет (р<0,01)) и снижению удельного веса 3-го генотипа (с 50,0±7,9% до 9,0±4,7% соответственно (р<0,01)). Аналогичные данные по возрастному распределению доминирующих генотипов получены Шустовым А.В (2003) среди населения Новосибирской области [11].

Выводы

1. Несмотря на снижение официальных показателей заболеваемости, полученные данные свидетельствуют о высокой ^

интенсивности латентного компонента эпидемического процесса ГС на территории Нижегородской области, о значительном росте темпов накопления источников инфекции, отражая широкий потенциал нозоформы.

2. Использование ОТ-ПЦР с детекцией в режиме «реального времени» не только позволяет увеличить чувствительность методики, но и дифференцировать большее число генотипов вируса.

3. Генотипическое разнообразие изолятов ВГС на территории Нижегородской области ограничено четырьмя генотипами: 1а, 1Ь, 2 и 3а.

4. Показано превалирование в равной доле субтипов 1Ь и 3а независимо от формы инфекции и давности заболевания.

5. Частота обнаружения микст-генотипов 1Ь/3 составила 7,0±2,0% случаев.

6. Наблюдение за динамикой генотипической структуры ВГС должно являться необходимой составляющей эпидемиологического надзора за гепатит С- инфекцией на каждой ^ конкретной территории.

ЛИТЕРАТУРА

1. Шляхтенко Л.И., Мукомолов С.Л., Сулягина Л.Г. и др. Пути совершенствования эпидемиологической диагностики вирусных гепатитов В и С. Мир вирусных гепатитов. 2006. № 1. С. 2-10.

2. Иванова Т.Г., Яковчук Е.М., Высоцкий В.С. и др. Проблемы вирусных гепатитов в современный период. Сборник трудов всерос. НПК «Современные проблемы эпидемиологии. Перспективные средства и методы лабораторной диагностики и профилактики актуальных инфекций». СПб. 2010. С. 215.

3. Гущин А.Е., Носкова О.М., Шипулин Г.А. Разработка набора реагентов «АмплиСенс ИСУ-генотип» для определения субтипов 1а, 1Ь, 2а, 3а вируса гепатита С. Вопросы вирусологии. 2003. № 3. С. 45-48.

ЭПИДЕМИОЛОГИЯ

ЭПИДЕМИОЛОГИЯ

Эпидемиология

МЕДИЦИНСКИЙ

АЛЬМАНАХ

4. Пахалкова Е.В., Утянская И.Г. Распространение субтипов ВГС на территории Омска и Омской области. Сборник трудов V Всерос. НПК «Генодиагностика инфекционных болезней». М. 2004. Т. 1. С. 261-265.

5.Цыганко Е.В., Ковалев С.Ю. Распределение генотипов вируса гепатита С в г.Екатеринбурге: динамика эпидемиологического процесса. Сборник трудов 6-й Всерос. НПК с межд. участием «Молекулярная диагностика-2007». М. 2007. Т. 1. С. 279-283.

6. Маркин Н.В., Цема Н.И. и др. Распределение субтипов вируса гепатита С в Ростовской области. Сборник трудов V Всерос. НПК «Генодиагностика инфекционных болезней». М. 2004. Т. 1. С. 249-250.

7.Орлов С.Т., Неверов А.Д., Михайловская Г.В. и др. Разработка и апробация тест-системы «АмплиСенс ИСУ-генотип-РРТ» на клиническом материале

и контрольных панелях ОСМР. Сборник трудов 6-й Всерос. НПК с межд. участием «Молекулярная диагностика-2007». М. 2007. Т. 1. С. 320-323.

8. ПЦР в режиме реального времени. Под. ред. Ребрикова Д.В. М.: БИНОМ, 2009. 215 с.

9. Мукомолов С.Л., Калинина О.В. Молекулярная эпидемиология вирусных гепатитов. Мир вирусных гепатитов. 2003. № 12. С. 5-13.

10. Калинина О.В. Молекулярно-генетическая характеристика вариантов вируса гепатита С, циркулирующих в Санкт-Петербурге. Автореф.дис....кан. биол. наук. СПб. 2000. 23 с.

11. Шустов А.В. Генотипическое разнообразие изолятов и молекулярная вариабельность вируса гепатита С у Населения Новосибирской области. Автореф.дис....кан. биол.наук. Кольцово. 2003. 22 с.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.