Научная статья на тему 'Эволюция опухолевых клонов при остром лимфобластном лейкозе взрослых'

Эволюция опухолевых клонов при остром лимфобластном лейкозе взрослых Текст научной статьи по специальности «Фундаментальная медицина»

CC BY
426
130
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
Журнал
Acta Naturae (русскоязычная версия)
WOS
Scopus
ВАК
RSCI
PubMed
Ключевые слова
ОСТРЫЙ ЛИМФОБЛАСТНЫЙ ЛЕЙКОЗ / РЕЦИДИВ / ПЦР / РЕАРАНЖИРОВКИ ГЕНОВ IG / РЕАРАНЖИРОВКИ ГЕНОВ TCR

Аннотация научной статьи по фундаментальной медицине, автор научной работы — Смирнова С.Ю., Сидорова Ю.В., Рыжикова Н.В., Сычевская К.А., Паровичникова Е.Н.

Нестабильность клонального состава популяции опухолевых клеток при острых лимфобластных лейкозах (ОЛЛ) усложняет процесс контроля минимальной остаточной болезни (МОБ) и эффективности терапии по установленным в дебюте заболевания мишеням, специфичным для данного пациента. Основные работы, в которых изучали эволюцию опухолевых клеток со сменой клональных реаранжировок генов TCR и IG в рецидиве заболевания, выполнены на детских ОЛЛ. Данные для взрослых больных ОЛЛ ограничены,тогда как ОЛЛ у взрослых и детей имеют различия в особенностях биологии и прогноза заболевания. Цель нашей работы состояла в изучении клональных реаранжировок генов IG и TCR и их стабильности у взрослых больных с ОЛЛ. Реаранжировки выявляли методом ПЦР по протоколу BIOMED-2 с последующим анализом фрагментов. У 83% пациентов выявили несоответствие клональных реаранжировок в дебюте и рецидиве заболевания. Клональная эволюция может быть одним из механизмов опухолевой прогрессии. Не исключена изначальная неоднородность состава опухолевых клеток, и в то время как одни клоны исчезают под воздействием терапии, другие, не распознанные из-за недостаточной чувствительности метода, приобретают способность к пролиферации. Кроме того, в течение заболевания реаранжировки могут меняться благодаря сохраняющейся активности рекомбиназного комплекса, что приводит к появлению опухолевых клонов de novo. Изучение механизмов клональной эволюции, способности терапии влиять на процессы клональной эволюции позволит выделить новые прогностические факторы, разработать тактику диагностики МОБ, расширит современные представления о механизмах онкогенеза.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по фундаментальной медицине , автор научной работы — Смирнова С.Ю., Сидорова Ю.В., Рыжикова Н.В., Сычевская К.А., Паровичникова Е.Н.

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Текст научной работы на тему «Эволюция опухолевых клонов при остром лимфобластном лейкозе взрослых»

УДК 616.155.392.2; 616-006.446

Эволюция опухолевых клонов

при остром лимфобластном лейкозе

взрослых

С. Ю. Смирнова1, Ю. В. Сидорова1, Н. В. Рыжикова1, К. А. Сычевская2, Е. Н. Паровичникова1, А. Б. Судариков1*

Тематологический научный центр Министерства здравоохранения РФ, 125167, Москва, Новый Зыковский пр-д, 4

2Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова, факультет фундаментальной медицины, 119192, Москва, Ломоносовский просп., 31, корп. 5 *E-mail: dusha@blood.ru Поступила в редакцию 10.02.2016 Принята к печати 01.04.2016

РЕФЕРАТ Нестабильность клонального состава популяции опухолевых клеток при острых лимфобластных лейкозах (ОЛЛ) усложняет процесс контроля минимальной остаточной болезни (МОБ) и эффективности терапии по установленным в дебюте заболевания мишеням, специфичным для данного пациента. Основные работы, в которых изучали эволюцию опухолевых клеток со сменой клональных реаранжировок генов TCR и IG в рецидиве заболевания, выполнены на детских ОЛЛ. Данные для взрослых больных ОЛЛ ограничены, тогда как ОЛЛ у взрослых и детей имеют различия в особенностях биологии и прогноза заболевания. Цель нашей работы состояла в изучении клональных реаранжировок генов IG и TCR и их стабильности у взрослых больных с ОЛЛ. Реаранжировки выявляли методом ПЦР по протоколу BIOMED-2 с последующим анализом фрагментов. У 83% пациентов выявили несоответствие клональных реаранжировок в дебюте и рецидиве заболевания. Клональная эволюция может быть одним из механизмов опухолевой прогрессии. Не исключена изначальная неоднородность состава опухолевых клеток, и в то время как одни клоны исчезают под воздействием терапии, другие, не распознанные из-за недостаточной чувствительности метода, приобретают способность к пролиферации. Кроме того, в течение заболевания реаранжировки могут меняться благодаря сохраняющейся активности рекомбиназного комплекса, что приводит к появлению опухолевых клонов de novo. Изучение механизмов клональной эволюции, способности терапии влиять на процессы клональной эволюции позволит выделить новые прогностические факторы, разработать тактику диагностики МОБ, расширит современные представления о механизмах онкогенеза. КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА острый лимфобластный лейкоз, рецидив, ПЦР, реаранжировки генов IG, реаранжировки генов TCR.

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ МОБ - минимальная остаточная болезнь; ОЛЛ - острый лимфобластный лейкоз; ПЦР-РВ - ПЦР в реальном времени; TCR - Т-клеточный рецептор; TCRG, TCRB, TCRD - Т-клеточные рецепторы у, в и 6 соответственно; IG - иммуноглобулин; IGH - тяжелая цепь иммуноглобулина; IGK - легкая цепь иммуноглобулина.

ВВЕДЕНИЕ

Острые лейкозы представляют собой гетерогенную группу опухолевых заболеваний кроветворной ткани, характеризующихся поражением костного мозга морфологически незрелыми (бластными) кроветворными клетками. В зависимости от принадлежности опухолевых клеток к той или иной линии гемопоэ-за, острые лейкозы принято разделять на острые лимфобластные и острые миелобластные лейкозы. Без терапии течение заболевания быстропрогресси-рующее и всегда заканчивается смертью больного.

Наиболее часто причиной смерти являются тяжелые инфекционные и геморрагические осложнения, обусловленные замещением нормальной кроветворной ткани бластными клетками.

Основная цель терапии любых форм лейкозов -эрадикация опухолевого клона, восстановление нормального кроветворения и достижение длительной безрецидивной выживаемости больных. Введение в клиническую практику цитостатических препаратов в конце 60-х годов позволило достичь полной ремиссии у 85-95% детей с ОЛЛ [1]. При этом важным

прогностическим фактором является возраст, бессобытийная выживаемость детей варьирует в разных возрастных группах от 83-97% (1-5 лет) до 49-66% (10-15 лет). На сегодняшний день Российской исследовательской группой по лечению острых лимфо-бластных лейкозов (RALL) показано, что в группах взрослых больных моложе 30 лет 5-летняя безрецидивная выживаемость составила 71.5%, в то время как у больных 30-55 лет этот показатель был ниже - 61.8% [2]. Показано, что взрослые и дети, больные ОЛЛ, отличаются не только выживаемостью, но также биологическими свойствами и прогнозом заболевания [3, 4]. В частности, к группе благоприятного прогноза у взрослых относят Т-клеточный вариант заболевания, в то время как у детей этот вариант считается прогностически неблагоприятным. Кроме того, у взрослых чаще выявляют прогностически неблагоприятные хромосомные аберрации (1(9;22), 1(4;11)), миелоидные антигены на мембране опухолевых клеток, в дебюте заболевания чаще определяют гиперлейкоцитоз, чаще диагностируют Т-клеточный иммунофенотип [3, 4].

Другой важный прогностический фактор при ОЛЛ - остаточное количество опухолевых клеток в костном мозге, или минимальная остаточная болезнь (МОБ). Оценка МОБ рассматривается не только как независимый фактор прогноза, но и как критерий разделения пациентов на группы риска развития рецидива [5-7]. Для оценки МОБ наиболее пригодны количественные методики с максимальным уровнем чувствительности (10-4-10-5), такие, как ПЦР в реальном времени (ПЦР-РВ) с использованием праймеров, специфичных для данного пациента, и многоцветная проточная цитофлуориме-трия. Оценка МОБ у пациентов с ОЛЛ методом ПЦР основана на определении клональных реаранжиро-вок генов Т-клеточных рецепторов (TCR) и иммуноглобулинов (Ю) в опухолевых клетках и подборе пациент-специфичных праймеров к CDR3-области этих генов [8].

Клональные реаранжировки генов Ю и TCR находят у 98% пациентов с В-ОЛЛ и у 95% больных с Т-ОЛЛ [9]. Поскольку в опухолевых клетках, полученных от разных больных, обнаруживают различные хромосомные аберрации, только перестроенные гены Ю и TCR считаются универсальными маркерами, позволяющими отслеживать опухолевые клоны практически у всех больных в течение болезни/терапии. Само по себе выявление клональ-ности не является критерием для постановки диагноза ОЛЛ. Клональные реаранжировки иногда обнаруживают и при реактивных (неопухолевых) процессах воспалительного, инфекционного или аутоиммунного генеза. Как правило, в этих случаях

клональный продукт определяется на поликлональ-ном фоне. Дифференциальная диагностика опухолевой и неопухолевой лимфопролиферации представляет определенную сложность при некоторых лимфомах, грибовидном микозе, синдроме Сезари, однако, исследование клональности при ОЛЛ, когда в периферической крови большинство лимфоцитов (> 20%) представлены опухолевыми клетками, таких затруднений не вызывает.

ПЦР-РВ с пациент-специфичными праймерами, подобранными к уникальной по нуклеотидной последовательности V-D-J-области клонально перестроенных генов Ю или TCR, позволяет с высокой чувствительностью (10-4-10-5) оценить остаточное количество опухолевых клеток у пациентов с ОЛЛ [10]. Однако данные, полученные при изучении клональ-ных перестроек в дебюте и рецидиве ОЛЛ у детей, свидетельствуют о том, что реаранжировки генов Ю и TCR могут изменяться в течение заболевания, т.е. в рецидиве заболевания часть выявленных клональ-ных реаранжировок исчезает и/или появляются новые реаранжировки. Необходимо отметить, что речь идет именно о частичной смене клональных реаран-жировок, так как полная смена генных реаранжи-ровок Ю и TCR в рецидиве указывает на возникновение вторичного ОЛЛ [11, 12]. Частичные различия клональных реаранжировок в дебюте и рецидиве наблюдаются у 67-70% детей с В-ОЛЛ и 45-50% детей с Т-ОЛЛ [13-15]. Данные об эволюции опухолевых клонов у взрослых с ОЛЛ весьма ограничены [11]. У Szczepanski и соавт. приведены результаты оценки генов TCR у 9 взрослых с Т-ОЛЛ [11]. Показано, что в целом стабильность генов TCR при взрослом Т-ОЛЛ выше (97%), чем при детском Т-ОЛЛ (86%) [11]. При этом реаранжировки генов Ю в дебюте и рецидиве заболевания не изучали.

Смена клональных реаранжировок, т.е. клональ-ная эволюция опухоли, может приводить к потере мишени для исследования МОБ и ложноотрицатель-ным результатам. Таким образом, приемлемость той или иной реаранжировки для изучения МОБ при ОЛЛ определяется не только частотой ее выявления, но и стабильностью. Основные данные изучения стабильности и частоты различных реаранжи-ровок при В-ОЛЛ и Т-ОЛЛ суммированы в табл. 1 [5-11, 15-19].

Перестройки генов 6-цепи TCR (TCRD) - самая ранняя из генных перестроек в Т-лимфоцитах. Клональные перестройки генов TCRD встречаются примерно в 55% случаев Т-ОЛЛ [20], генов у-цепи TCR (TCRG) - у 95% пациентов [21], генов Р-цепи TCR (TCRB) - у 92% пациентов. Стабильность ре-аранжировок TCRB при рецидивах Т-ОЛЛ у детей была ниже стабильности у- и 6-цепей - 80 vs 86

Таблица 1. Стабильность и частота выявления клональных реаранжировок при В-ОЛЛ и Т-ОЛЛ [7]

Ген Реаранжировка В-ОЛЛ Т-ОЛЛ

Частота, % Стабильность, % Частота, % Стабильность, %

моно олиго моно олиго

ЮН VH-JH (полные) 93 30-40 88 47 5 НТ

БН^Н (неполные) 20 50-60 57 38 23 НТ

Все ЮН 98 40 85 44 23 НТ

ЮК Vx-K.de 45 5-10 95 40 0 НП

Интрон RSS-Kde 25 5-10 86 0 0 НП

Все Ме 50 5-10 95 40 0 НП

ТСЯБ VB-JB (полные) 21 10-15 89 60 77 79

БВ^В (неполные) 14 10-15 67 0 55 80

Все TСRB 33 10-15 81 43 92 80

ТСЯЮ VG-JG 55 15 75 95 86

TСRD VD-JD или ББ^Б1 < 1 НП НП НП 50 100

VD2-DD3 или ББ2-ББ3 40 20-25 86 26 55 100

Все TСRD 40 20-25 86 26 55 100

Примечание. НТ - не тестировали, НП - неприменимо.

и 100% соответственно (см. табл. 1) [11]. Несмотря на высокую частоту обнаружения и высокую стабильность, моноклональные перестройки генов у-цепи являются не самой удачной мишенью для контроля МОБ, поскольку имеют короткий фрагмент нуклеотидной вставки [22]. Согласно опубликованным данным, Т-ОЛЛ чаще, чем В-ОЛЛ, оказывается устойчивым к терапии и положительным по МОБ [23]. Выявлена высокая стабильность реаранжировок генов 1ЮК (95%) при В-ОЛЛ у детей, завершенных V-D-J-реаранжировок генов ЮН (88%), TCRB (89%) и TCRD (86%), относительно высокая стабильность реаранжировок генов TCRG (75%) и низкая стабильность неполных перестроек генов ЮН (57%) и неполных перестроек генов TCRB (67%) (табл. 1). Кроме того, в значительной части случаев детского В-ОЛЛ (26-30%) изначально определяется олигокло-нальный характер реаранжировок [13-15]. При ОЛЛ возможно присутствие клональных продуктов с незавершенной реаранжировкой генов и производных от них клональных продуктов с завершенными ре-аранжировками, что объясняется действием V(D) J-рекомбиназ и «текущим» продолжающимся процессом реаранжировок генов иммуноглобулинов и TCR в ранних клетках-предшественниках [11, 15,

24]. Чаще других олигоклональность (наличие двух и более клонов) выявляют в генах ЮН: полные реа-ранжировки - в 30-40% случаев, неполные - в 5060%, гены 6-цепи TCR - в 20-25% случаев (табл. 1). Олигоклональные реаранжировки не рекомендовано использовать в качестве мишени для оценки МОБ: они нестабильны и часто дают ложноотрицательные результаты.

Эволюцию опухолевых клеток (смену клональных реаранжировок генов TCR и ЮН) в рецидиве заболевания изучали в основном на детском ОЛЛ. Данные для взрослых больных ОЛЛ весьма ограничены. Учитывая то, что ОЛЛ у взрослых и детей имеют разные биологические свойства и прогноз заболевания, цель нашего исследования состояла в изучении характера клональных реаранжировок генов иммуноглобулинов и Т-клеточных рецепторов и их стабильности у взрослых с В-ОЛЛ и Т-ОЛЛ, проходивших лечение в Гематологическом научном центре МЗ РФ.

ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ

Пациенты и образцы

В исследование включено 63 больных ОЛЛ: 34 -с В-клеточным вариантом ОЛЛ, в том числе два

Таблица 2. Краткая характеристика пациентов с ОЛЛ

с Ph+ ОЛЛ; 28 - с Т-клеточным вариантом ОЛЛ и один с бифенотипическим вариантом ОЛЛ (табл. 2). Всем больным проводили стандартное цитогенети-ческое исследование, FISH-исследование клеток костного мозга с флуоресцентными зондами t(9;22) и t(4;11) (табл. 3). Нормальный кариотип имели 20 из 63 пациентов, у 17 из 63 не было митозов, у шести выявлены различные изменения хромосомы 9 и/или 22. Транслокация t(9;22) обнаружена методом FISH, а химерный транскрипт BCR/ABL (p190) идентифицирован молекулярно-генетическим методом (Ph+ B-ОЛЛ). У пяти больных методом FISH выявлена транслокация t(4;11), а с помощью ПЦР химерный транскрипт MLL-EPS15. У семи больных найдены множественные хромосомные аномалии: у четверых - трисомия 21. Исследовали ДНК, полученную из всех 63 образцов костного мозга в дебюте заболевания. Возраст пациентов 19-59 лет (медиана - 28). У шести из 63 пациентов изучали клональ-ные реаранжировки в дебюте и рецидиве заболевания. Время до рецидива составило от 5.4 до 11.6 месяцев. Больных наблюдали в отделении химиотерапии гемобластозов и депрессий кроветворения Гематологического научного центра (далее ГНЦ). Диагнозы устанавливали в соответствии с классификацией ВОЗ. Согласие на обработку данных получено от всех пациентов, включенных в исследование. Кровь здоровых доноров получена на станции переливания крови ГНЦ.

Анализ клональности по реаранжировкам генов

IG/TCR

Лейкоциты и ДНК из периферической крови выделяли как описано ранее [25]. Концентрацию ДНК определяли спектрофотометрически. Образцы ДНК хранили при -20°С. B- и T-клеточную клональность определяли с использованием мультиплексных систем праймеров BIOMED-2 для фрагментного анализа [26]. B-клеточную клональность оценивали по перестройкам генов тяжелых цепей IGH (VH-JH-

FR1/FR2/FR3/ DH-JH), легкой цепи к IGK (Vk-Jk/ Vk-KDE/IntronRSS-KDE). T-клеточную клональность оценивали по перестройкам генов T-клеточных рецепторов TCRG (VG-JG), TCRB (VB-JB/DB-JB), TCRD (VD-JD/DD2-JD/VD-DD3/DD2-DD3). Все локусы генов IG и TCR анализировали при помощи мультиплексных реакций с большим количеством праймеров, разделенных на несколько пробирок в соответствии с рекомендациями протокола BIOMED-2 (см. краткое описание в табл. 4). Для амплификации генов TCRB использовали коммерческий набор TCRB Gene Clonality Assay ABI Fluorescence Detection (Invivoscribe Technologies, США) в соответствии с рекомендациями производителя. Смесь (25 мкл) для ПЦР генов IGH, IGK и TCRG, TCRD содержала 5 пмоль каждого праймера («Синтол», Россия), 100200 нг ДНК и 12.5 мкл 2 xpCRMasterMix (Promega, США). Амплификацию проводили на автоматическом термоциклере DNAEngine (BioRad, США). Условия ПЦР: 95°C (7 мин), затем 35 циклов - 95°С (45 с), 60°С (45 с), 72°С (45 с) и 72°С (10 мин). В качестве положительного (клонального) контроля использовали клеточные линии Jurkat и Daudi, в качестве поликлонального контроля - мононуклеары периферической крови здоровых доноров. Для фрагментно-го анализа ПЦР-продуктов использовали автоматический анализатор нуклеиновых кислот ABIPRISM 3130 Genetic Analyzer (Applied Biosystems, США). С этой целью 2 мкл разведенного в 20 раз ПЦР-продукта смешивали с 10 мкл Hi-Di формамида (Applied Biosystems, США) и 0.04 мкл GeneScan 500-LIS Size Standard (Applied Biosystems, США). После денатурации при 95°C в течение 3 мин и последующего охлаждения 10 мкл смеси вносили в лунку 96-луночной плашки и проводили капиллярный электрофорез высокого разрешения на полимере POP-4 (Applied Biosystems, США). Флуоресценцию амплификатов и их профиль оценивали при помощи компьютерной программы GeneMapper v.4.0 (Applied Biosystems, США).

РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ

Клональные реаранжировки изучены у 34 пациентов с В-клеточным вариантом ОЛЛ, 28 пациентов с Т-клеточным вариантом, одного с бифенотипическим вариантом заболевания. Частоты клональных реаранжировок генов y-, ß- и б-цепей TCR и генов тяжелой и легкой цепей IG при B-и Т-вариантах ОЛЛ представлены в табл. 5. У пациента с бифенотипическим вариантом выявлена биаллельная реаранжировка (два пика) генов TCRG и олигоклональная (четыре пика) генов TCRD. У пациентов с В-клеточным вариантом ОЛЛ наиболее часто встречались реаранжировки генов тяжелой

Возраст 19-59(М 28)

Пол, м/ж 32/31

В-ОЛЛ/Т-ОЛЛ/бифенотипический вариант 34/28/1

Число рецидивов (В-ОЛЛ/Т-ОЛЛ) 6 (4/2)

Время до рецидива, мес. 5.4-11.6 (М 6.2)

Примечание. М - медиана возраста.

Таблица 3. Результаты стандартного цитогенетического исследования (СЦИ) и FISH-анализа транслокаций t(4;11) и t(9;22) у пациентов с ОЛЛ

Пациент Вариант ОЛЛ СЦИ, FISH, ПЦР

1 B-II Нет митозов

2 B-I Нормальный кариотип

3 B-I der(7)add(p22),-8?,der(9),i(q10),der(14),add(q32?),+mar der(9)?(17)cp/46, ХХ [3]

4 B-I Добавочный материал на коротком плече хромосомы 10, трисомия хромосом Х, 12 и 22, FISH t(4;11), выявлен MLL-EPS15 методом ПЦР

5 B-I 55XX, производное хромосом 3 и 11, делеция короткого плеча хромосомы 12 и длинного плеча хромосомы 13

6 B-I Нормальный кариотип

7 B-I Нормальный кариотип

8 B-I Нет митозов, FISH t(4;11), выявлен MLL-EPS15 методом ПЦР

9 B-II В 80% ядер выявлен дополнительный сигнал от локуса гена IGH (14q32) (трисомия хромосомы 14? другая транслокация с вовлечением локуса гена IGH)

10 B-II Нормальный кариотип

11 B-II Нет митозов

12 B-II 53XY? +X,+4,+ 6,+14,+21,+21,+mar [10]

13 B-II Нормальный кариотип

14 B-II Нет митозов

15 B-II Нет митозов

16 B-II В 15% по два дополнительных сигнала от локусов генов ABL(9q34) и BCR(22q11), тетрасомия хромосом 9 и 22?

17 B-II Трисомия 21

18 B-II Нормальный кариотип

19 B-II Трисомия 21

20 B-II Трисомия 21, моносомия 13

21 B-II Нормальный кариотип

22 B-II Нет митозов

23 B-II Нормальный кариотип

24 B-II Нормальный кариотип

25 B-II Нормальный кариотип

26 B-III Две клетки с del (11), FISH t(4;11), выявлен MLL-EPS15 методом ПЦР

27 B-III Нормальный кариотип

28 B-III 47ХХ +5 (5q31)

29 B-III 54X,?+X,Y,+4,+5,+ 6,?-7,+14,+21,+22,+ ?mar или r i(7)(q10) или i(8)(q10),+mar [19],46XY

30 B-III +8+11+21

31 B-Ph+ Нет митозов, FISH t(9;22), выявлен BCR-ABL методом ПЦР

32 B-Ph+ Нормальный кариотип, FISH t(9;22), выявлен BCR-ABL методом ПЦР

33 B-II Нет митозов

34 B-II Нет митозов

35 T-I 46XY[2]/90-92,XXYY,=mar [10]

36 T-I Нет митозов

37 T-I 11q23 перестроен, FISH t(4;11), выявлен MLL-EPS15 методом ПЦР

38 T-I Нормальный кариотип

39 T-I del9(p13)

40 T-I Нет митозов

41 T-I Нормальный кариотип

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

42 T-I 15.5% трисомия, в 45% тетрасомия в локусе гена PMLL\11q23, FISH t(4;11), выявлен MLL-EPS15 методом ПЦР

43 T-I Нормальный кариотип

44 T-II Нормальный кариотип

45 T-II Нормальный кариотип

46 T-II Нормальный кариотип

47 T-II Нет митозов

48 T-II Делеция длинного плеча хромосомы 5? или транслокация t(5;?), производные хромосом 2, 4, 5, 7, 22 и 17 (с вовлечением гена р53)

49 T-II Трисомия хромосомы 8

50 T-II (47, XY,+8 (20))

51 T-II Нормальный кариотип

52 T-II Нет митозов

53 T-III Нормальный кариотип

54 T-III 47, XY+mar [20]

55 T-III der (1)add(p36)?dup(p31p36)?{20}; моносомия 9 или делеция локуса 9q34

56 T-III Нет митозов

57 T-III Производное хромосомы 11, делеция длинного плеча хромосомы 6

58 T-III Нет митозов

59 T-III Нет митозов

60 T-III Нет митозов

61 T-IV t(6;17) +20

62 T-I del 11q23

Бифено-

63 типическии вариант заболевания 47, XY, der(2)add(p24-25),+5, del(7)(q22),del(13)(q11-q34),+14[6]/46, XY [4]

Примечание: жирным шрифтом выделены пациенты, у которых констатирован рецидив заболевания, выявляли реаранжировки генов Т-клеточных рецепторов и иммуноглобулинов в дебюте и рецидиве заболевания.

Таблица 5. Частота (%) выявления клональных реаранжировок генов у-, в- и б-цепей TCR и генов тяжелой и легкой цепей Ю при В- и Т-вариантах ОЛЛ

Таблица 4. Описание мультиплексных реакций и ПЦР-праймеров по протоколу BЮMED-2

Ген Набор праймеров Прямые праймеры Обратные праймеры (меченые) Длина продуктов, п.н.

ЮН А VH1-7 (ЕИ1) JHcons ЕАМ 310-360

В VH1-7 (ЕИ2) JHcons ЕАМ 250-295

С VH1-7 (ЕИ3) JHcons ЕАМ 100-170

Е БН1-6 JHcons ТАМИА 110-290 и 390-420

Б БН7 JHcons ТАМИА 100-130

ЮК А V* 1/6-7 Jк1-4, Jк5 FAM 120-300

В V* 1/6-7, Г№ГО КБЕ-ЕАМ 210-390

TCRD Б1 Dб2,Vб1-Vб6 Jб1FAM, Jб2R6G, Jб3TAMRA, Jб4ROX 120-280

Б2 Dб2,Vб1-Vб6 Dб3FAM 130-280

TCRG GA VYlf, VY10 JY1/2FAM, Jp1/2 R6G 145-255

GB VY9, VY11 JY1/2FAM, Jp1/2 R6G 80-220

TCRB А VP2-VP24 ТР1.1, JP1.6HEX, JP2.2, JP2.6, JP2.7FAM 240-285

В VP2-VP24 JP2.1, Jp2.3, JP2.4, JP2.5 FAM 240-285

С DP1, DP2 JP1.1, JP1.6HEX, Jp2.1, JP2.7FAM 170-210 285-325

Реаранжировки В-ОЛЛ (п = 34) Т-ОЛЛ (п = 28)

TCRG VG-JG 76.5 (п = 26) 89.3 (п = 25)

TCRB VB-JB (полные) 26.5 (п = 9) 50 (п = 14)

БВ^В (неполные) 23.5 (п = 8) 46.4 (п = 13)

Все ТСИВ 38.2 (п = 13) 60.7 (п = 17)

TCRD VБ-JБ/ББ2-JБ 17.6 (п = 6) 53.6 (п = 15)

VБ-ББ3/ББ2-ББ3 47.1 (п = 16) 32.1 (п = 9)

Все ТСИБ 55.9 (п = 19) 64.3 (п = 18)

ЮН VH-JHFR1/FR2/FR3 (полные) 73.5 (п = 25) 7.1 (п = 2)

БН^Н (неполные) 26.5 (п = 9) 25 (п = 7)

Все IGH 82.4 (п = 28) 28.6 (п =8)

ЮК Vk-Jk 26.5 (п = 9) 0 (п = 0)

Vk-KБE/IntronRSS-KБE 26.5 (п = 9) 3.6 (п = 1)

Все IGK 38.2 (п = 13) 3.6 (п = 1)

цепи Ю (82.4%) и у-цепи TCR (76.5%), реаранжиров-ки генов в-цепи TCR и генов к-цепи IG обнаружены в 38.2% случаев, генов б-цепи TCR - в 55.9%. У 89.3% пациентов с Т-клеточным вариантом ОЛЛ выявлены перестройки генов у-цепи TCR. Перестройки генов б-цепи выявлены в 64.3% случаев, генов в-цепи -в 60.7% случаев. Реже остальных при Т-ОЛЛ встречались перестройки ЮН - 28.6%. Перестройка генов легкой к-цепи иммуноглобулина Vk/KDE найдена в одном случае Т-ОЛЛ. Наши данные по частоте клональных генных реаранжировок Ю и TCR несколько отличаются от данных международных исследований, что мы связываем с небольшим размером вы-

борки. Олигоклональные реаранжировки (три и более клональных пика) наблюдались как при В-ОЛЛ (ЮН у 12% (4 из 34) пациентов, TCRD у 18% (6 из 34) пациентов), так и при Т-ОЛЛ (TCRD у 32% (9 из 28) пациентов).

У шести пациентов клональные реаранжировки исследовали в дебюте и рецидиве заболевания. Всего в дебюте заболевания выявлено 17 клональных реаранжировок генов TCR и 5 клональных реаранжировок генов Ю. В рецидиве заболевания выявлено шесть клональных реаранжировок генов TCR и три клональные реаранжировки генов Ю, которые отличались от выявленных в дебюте (табл. 6).

Таблица 6. Клональные продукты, выявленные в дебюте и рецидиве у шести пациентов с диагнозом ОЛЛ

Пациент/ № 1 T-ОЛЛ № 2 T-ОЛЛ № 3 B-ОЛЛ № 4 B-ОЛЛ № 5 B-ОЛЛ № 6 B-ОЛЛ

диагноз Д Р Д Р Д Р Д Р Д Р Д Р

TCRG-GA + + + + - - + - - + + +

TCRG-GB + + - - - - + - - + - +

TCRB-A + + - - - - + - - - - +

TCRB-B - - - - - - - - - - + +

TCRB-C - - - - - - - - - - - -

TCRD-D1 + + + + 1 + + + + + + - -

TCRD-D2 + + - - - + + - + - - -

IGH-A/ IGH-B/ IGH-C - - - - - + - - + + 1 + +

VK-A - - - - - + + - - - + -

VK-B - - - - - - + + - - - -

Примечание. «+» - моноклональная реаранжировка, «-» - поликлональная реаранжировка, «+1» - изначальная клональная реаранжировка выявляется с дополнительной, отличной от выявленной в дебюте заболевания, Д -дебют заболевания, Р - рецидив заболевания.

У двух пациентов с В-клеточным вариантом заболевания отмечена потеря одной из клональных реаранжировок, выявленных в дебюте, при одновременном появлении новых реаранжировок (пациенты № 5 на рис. 1 и № 6 в табл. 6). У одной пациентки с диагнозом раннего Т-ОЛЛ клональные реаранжировки генов y-, ß- и ô-цепей TCR, выявленные в дебюте заболевания, полностью совпадали с клональными ре-аранжировками в рецидиве (№ 1). У одного пациента с диагнозом Т-ОЛЛ, при полном сохранении клональных перестроек, выявленных в дебюте, отмечено появление новых реаранжировок (№ 2). У одного пациента в рецидиве заболевания сохранились только две из семи реаранжировок, выявленных в дебюте (рис. 2, № 4). У одного пациента в дебюте В-ОЛЛ выявлена только одна клональная реаранжировка генов ô-цепи TCR, которая сохранилась в рецидиве, но появились несколько новых, в том числе клональные реаранжировки генов IGH и генов легкой к-цепи IG.

Нами показано, что у всех пациентов в рецидиве ОЛЛ сохранился хотя бы один клональный продукт из выявленных в дебюте (табл. 6). Это подтверждает данные, согласно которым даже при развитии позднего рецидива ОЛЛ у детей (более чем через 5 лет с момента констатации ремиссии) сохраняется хотя бы один исходный клональный продукт [27]. В нашей работе у пяти из шести (83%) пациентов отмечено несоответствие клональных реаранжировок в дебюте и рецидиве заболевания. Даже при столь

небольшой выборке мы наблюдали клональную эволюцию в рецидиве заболевания, что делает актуальным вопрос о первоначальном выборе мишени для количественного определения МОБ. Для минимизации риска ложноположительных результатов принято использовать как минимум две независимые мишени с высокой стабильностью. Однако на практике не ко всем мишеням удается подобрать пациент-специфичный праймер, который обладает нужной специфичностью и чувствительностью. Прежде всего, это касается незавершенных реаранжиро-вок или генных реаранжировок, где отсутствует D-сегмент, например TCRG (Vy-Jy). Нами обнаружена потеря пациент-специфичных мишеней, выявленных у трех пациентов в дебюте заболевания. Для того чтобы зафиксировать минорные субклоны в дебюте заболевания и оценить их поведение на фоне проводимой терапии, мы решили повысить первоначальную чувствительность метода. При помощи праймеров, специфичных к семействам V и J, мы повторно исследовали первоначальный материал на предмет наличия клонов, возникших в рецидиве. Использование таких праймеров увеличивает чувствительность определения опухолевых клеток с 10-1 до 10-2 —10-3. Однако даже при такой чувствительности субклоны не были обнаружены в дебюте, что свидетельствует о малом размере субклонов и подтверждает данные других исследований. Так, в 77% (35 из 45) случаев детского В-ОЛЛ клоны с но-

Пациент 5 Дебют

Рецидив

GA

D1

.142

/ /

) ■-___ . 1 .

207

зон

1МВ

поли

GA

• 164

• • -_ии I

GB

/

151

/

165

D1

.142 / /

207

D2 Л 64 / 1

1 . . . г к .

ЮН-А 347 /

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

150 210 270 330

ЮН-В * к. /27?

|1 , 144 / ЮН-С

Лы1

D2 к и п 11 оли

120 1в0 240 эоо эи

ЮН-А 330, .....1 347 / к

120 1В0 240 300 эво

ЮН-В . 1.1 263

120 1» 240 ЭСЮ ЭВД

/127 V1" ЮН-С

поли

Рис. 1. Данные фрагментного анализа продуктов амплификации генов TCRG, TCRD, ЮН пациента № 5 в дебюте и рецидиве заболевания. В дебюте выявлено два клональных продукта длиной 142 и 207 п.н. (указаны стрелками) реаранжировки генов TCRD, клональный продукт 347 п.н. реаранжировки генов ЮН. В рецидиве заболевания у данного пациента сохранились исходные клональные реаранжировки генов TCRD и тяжелой цепи ЮН, при этом появились новые клональные реаранжировки генов у-цепи TCR (TCRGA - 164 п.н., TCRGB - 151, 165 п.н.), тяжелой цепи Ю (ЮНА - 330 п.н., ЮНВ - 263 п.н., ЮНС - 127 п.н.)

выми реаранжировками в рецидиве присутствовали лишь в минимальных количествах при дебюте заболевания [28]. Размер таких резистентных субклонов варьировал от 10-2 до 10-5 клеток, и чем меньше было количество клеток, тем больше времени проходило до рецидива [29].

В последние годы показано, что острые лимфо-бластные лейкозы имеют сложный и генетически неоднородный состав опухолевых клеток в пределах одного заболевания [30, 31]. В большинстве случаев ОЛЛ клональная эволюция обусловлена реактива-

цией одного из минорных субклонов, резистентного к проводимой терапии [14, 29, 32]. Клональное разнообразие является механизмом опухолевой прогрессии. Часть клональных клеток, вероятно, имеет отличные от остальных клеток свойства (генетические мутации, скорость деления, иммунологическую зрелость), что придает им устойчивость к воздействию химиотерапии. Причины поздней реактивации первоначального опухолевого клона до сих пор неизвестны. Возможно, происходит ослабление иммунологического надзора и механизмов противоопухоле-

2000 О

Дебют

120 160 240 300

- GA 212

I • г

гни 1400 700 0

640 ; D2

эео-

180- 1 ..1

163

120

оооа- GB .180

4000 /

2000- /

I ■ Л 1

D1

124 /

1.1 / 1 . ...

3000 TCRB-A

2000 260 ^

юоо

Рецидив

120

600 400 200 О

390 260

130

о

1200 ООО 400 О

120 200 230

GB jll.lL.. поли

: D1 ■ 24 *

1 . ]

120 200 200

- D2 поли

.1. 1 . Ц J I _

Рис. 2. Данные фрагментного анализа продуктов амплификации генов TCRG, TCRD, ЮК, TCRB пациента № 4 в дебюте и рецидиве заболевания. В дебюте выявлено семь клональных продуктов (указаны стрелками). В рецидиве у данного пациента сохранились только два клональных продукта из семи исходных - реаранжировка генов TCRD (в реакции D1 - 124 п.н.) и легкой к-цепи Ю (в реакции VK-B - 283 п.н.)

вого иммунитета или появление новых генетических мутаций в опухолевых клетках с их последующей реактивацией. Применение количественных методов оценки МОБ является независимым фактором прогноза и критерием разделения пациентов на группы риска развития рецидива. В течение заболевания спектр клональных реаранжировок может изменяться. Такой процесс может происходить в течение раннего индукционного курса терапии, что дает ложноотрицательные результаты определения МОБ и препятствует стратификации больных на группы риска. Успешный контроль минимальной остаточной болезни можно обеспечить только при подборе пациент-специфичных праймеров для каждой клональ-ной мишени, выявленной в дебюте заболевания.

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

У пяти из шести (83%) пациентов отмечено несоответствие клональных реаранжировок в дебюте и рецидиве заболевания, что говорит о клональной нестабильности на фоне проводимой полихимиотерапии. Опухолевые клетки при ОЛЛ изначально имеют сложный генетически неоднородный состав,

и в то время как одни клоны исчезают под воздействием полихимиотерапии, другие, не распознанные из-за недостаточной чувствительности метода, приобретают способность к пролиферации. Клональная эволюция служит одним из механизмов опухолевой прогрессии и является серьезной помехой для количественной оценки МОБ методом ПЦР. Нами показано, что отсутствие амплификации с пациент-специфичными праймерами, подобранными к мишеням, секвенированным в дебюте заболевания, не может полностью гарантировать отсутствие остаточного заболевания, так как мы показываем, что в ряде случаев при остром лейкозе опухолевые клоны нестабильны. Таким образом, в сомнительных случаях при подозрении на рецидив и отсутствии амплификации с пациент-специфичными праймерами необходимо повторное исследование клональности. Изучение механизмов клональной эволюции, способности полихимиотерапии влиять на процессы кло-нальной эволюции, возможно, будет способствовать разработке новых прогностических факторов и терапевтических подходов. •

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

1. Felix C. Acute lymphoblastic leukemia in infants. Washington: Education Program Book of hematology, American society of hematology, 2015. P. 285-302.

2. Паровичникова Е.Н., Троицкая В.В., Соколов А.Н., Ахмер-заева З.Х., Кузьмина Л.А., Менделеева Л.П., Клясова Г.А., Кравченко С.К., Грибанова Е.О., Бондаренко С.Н. и др. // Онкогематология. 2014. № 3. С. 6-15.

3. Campana D., Pui C. // Blood. 1995. V. 85. № 6. P. 1416-1434.

4. Copelan E., McGuire E. // Blood. 1995. V. 85. № 5. P. 1151-1168.

5. Flohr T., Schrauder A., Cazzaniga G., Panzer-Grümayer R., van der Velden V., Fischer S., Stanulla M., Basso G., Niggli F.K., Schäfer B.W. // Leukemia. 2008. V. 22. № 4. P. 771-782.

6. Brüggemann M., Raff T., Flohr T., Gökbuget N., Nakao M., Droese J., Lüschen S., Pott C., Ritgen M., Scheuring U., et al. // Blood. 2006. V. 107. № 3. P. 1116-1123.

7. van Dongen J.J., van der Velden V.H., Brüggemann M., Orfao A. // Blood. 2015. V. 125. № 26. P. 3996-4009.

8. van der Velden V.H., Hochhaus A., Cazzaniga G., Szczepan-ski T., Gabert J., van Dongen J.J. // Leukemia. 2003. V. 17.

P. 1013-1034.

9. van Dongen J.J., Langerak A.W., Bruggemann M., Evans P.A.S., Hummel M., Lavender F.L., Delabesse E., Davi F., Schuuring E., García-Sanz R. // Leukemia. 2003. V. 17. № 12. P. 2257-2317.

10. Pongerse-Willemse M.J., Seriu T., Stolz F., d'Aniello E., Gameiro P., Pisa P., Gonzalez M., Bartram C.R., Panzer-Grümayer E.R., Biondi A. // Leukemia. 1999. V. 13. P. 110-118.

11. Szczepanski T., van der Velden V.H., Raff T., Jacobs D.C., van Wering E.R., Brüggemann M., Kneba M., van Dongen J.J. // Leukemia. 2003. V. 17. № 11. P. 2149-2156.

12. Szczepanski T., van der Velden V.H., Waanders E., Kuiper R.P., van Vlierberghe P., Gruhn B., Eckert C., Panzer-Grü-mayer R., Basso G., Cavé H., et al. // ClinOncol. 2011. V. 29. № 12. P. 1643-1649.

13. Beishuizen A., Verhoeven M.A., van Wering E.R., Hahlen K., Hooijkaas H., van Dongen J.J. // Blood. 1994. V. 83. № 8. P. 2238-2247.

14. Li A., Zhou J., Zuckerman D., Rue M., Dalton V., Lyons C., Silverman L.B., Sallan S.E., Gribben J.G. // Blood. 2003. V. 102. № 13. P. 4520-4526.

15. Szczepanski T., Willemse M.J., Brinkhof B., van Wering E.R., van der Burg M., van Dongen J.J. // Blood. 2002. V. 99. № 7.

P. 2315-2323.

16. van der Velden V.H., Szczepanski T., Wijkhuijs J.M., Wijkhui-js J.M., Hart P.G., Hoogeveen P.G., Hop W.C.J, van Wering E.R., van Dongen J.J.M. // Leukemia. 2003. V. 17. № 9. P. 1834-1844.

17. Beishuizen A., Hahlen K., Hagemeijer A., Verhoeven M.A., Hooijkaas H., Adriaansen H.J., Wolvers-Tettero I.L., van Wering E.R, van Dongen J.J. // Leukemia. 1991. V. 5. № 8.

P. 657-667.

18. Beishuizen A., de Bruijn M.A., Pongers-Willemse M.J., Verhoeven M.-A.J., van Wering E.R., Hahlen K., Breit T.M., de Bruin-Versteeg S., Hooijkaas H., van Dongen J.J.M. // Leukemia. 1997. V. 11. № 12. P. 2200-2207.

19. Bruggemann M., van der Velden V.H., Raff T., Droese J., Ritgen M., Pott C., Wijkhuijs A.J., Gökbuget N., Hoelzer D., van Wering E.R. // Leukemia. 2004. V. 18. № 4. P. 709-719.

20. Breit T.M., WolVers-Tettero I.L., Beishuizen A., Verhoeven M.A., van Wering E.R., van Dongen J.J. // Blood. 1993. V. 82. № 10. P. 3063-3074.

21. Szczepanski T., Langerak A.W., Willemse M.J., Wolvers-Tettero I.L., van Wering E.R., van Dongen J.J. // Leukemia. 2000. V. 14. № 7. P. 1208-1214.

22. van der Velden V.H., Wijkhuijs J.M., Jacobs D.C., van Wering E.R., van Dongen J.J. // Leukemia. 2002. V. 16. № 7. P. 1372-1380.

23. Willemse M.J., Seriu T., Hettinger K., d'Aniello E., Hop W.C., Panzer-Grümayer E.R., Biondi A., Schrappe M., Kamps W.A., Masera G., et al. // Blood. 2002. V. 99. № 12. P. 4386-4393.

24. Germano G., del Giudice L., Palatron S., Giarin E., Cazzaniga

G., Biondi A., Basso G.. // Leukemia. 2003. V. 17. № 8. P. 15731582.

25. Сидорова Ю.В., Сорокина Т.В., Бидерман Б.В., Никулина Е.Е., Кисиличина Д.Г., Наумова Е.В., Почтарь М.Е., Лугов-ская С.А., Иванова В.Л., Ковалева Л.Г. и др. // Клиническая лабораторная диагностика. 2011. № 12. С. 22-35.

26. Dongen J.J., Langerak A.W., Bruggemann M., Evans P.A., Hummel M., Lavender F.L., Delabesse E., Davi F., Schuur-ing E., García-Sanz R., et al. // Leukemia. 2003. V. 17. № 12. P. 2257-2317.

27. Lo Nigro L., Cazzaniga G., Di Cataldo A., Pannunzio A., D'Aniello E., Masera G., Schiliró G., Biondi A. // Leukemia. 1999. V. 13. P. 190-195.

28. Eckert C., Flohr T., Koehler R., Hagedorn N., Moericke A., Stanulla M., Kirschner-Schwabe R., Cario G., Stackelberg A.,

Bartram C.R., et al. // Leukemia. 2011. V. 25. № 8. P. 1305-1313.

29. Choi S., Henderson M.J., Kwan E., Beesley A.H., Sutton R., Bahar A.Y., Giles J., Venn N.C., Pozza L.D., Baker D.L., et al. // Blood. 2007. V. 110. № 2. P. 632-639.

30. Mullighan C.G., Zhang J., Kasper L.H., Lerach S., Payne-Turner D., Phillips L.A., Heatley S.L., Holmfeldt L., Collins-Underwood J.R., Ma J., et al. // Nature. 2011. V. 471. № 7337. P. 235-239.

31. Gawad C., Pepin F., Carlton V.E., Klinger M., Logan A.C., Miklos D.B., Faham M., Dahl G., Lacayo N. // Blood. 2012. V. 120. № 22. P. 4407-4417.

32. de Haas V., Verhagen O.J., von dem Borne A.E., Kroes W., van den Berg H., van der Schoot C.E. // Leukemia. 2001. V. 15. № 1. P. 134-140.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.