1 2 3 4 ©
Кузовникова Е.Ж. , Вольдшмидт Н.Б. , Сергевнин В.И. , Шнуренко Н.А.
1Врач-эпидемиолог, заведующая отделением антропонозных инфекций ФБУЗ «Центр гигиены и эпидемиологии в Пермском крае»; 2к.м.н., заместитель начальника отдела эпидемиологического надзора Управления Роспотребнадзора по Пермскому краю; 3д.м.н., профессор кафедры эпидемиологии с курсом гигиены и эпидемиологии факультета дополнительного профессионального образования ГБОУ ВПО «Пермский государственный медицинский университет им. акад. Е. А. Вагнера» Минздрава РФ; 4врач-бактериолог лаборатории природно-очаговых, особо опасных и вирусных инфекций ФБУЗ «Центр гигиены и эпидемиологии в Пермском крае»
ЭТИОЛОГИЯ ВНЕБОЛЬНИЧНЫХ ПНЕВМОНИЙ ПО ДАННЫМ ОТЧЕТОВ МЕДИЦИНСКИХ ОРГАНИЗАЦИЙ И РЕЗУЛЬТАТАМ ВЫБОРОЧНЫХ МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИХ ИССЛЕДОВАНИЙ
Аннотация
Проведена оценка этиологии внебольничной пневмонии (ВП) по данным отчетов медицинских организаций (МО) и результатам собственных молекулярно-генетических исследований. Установлено, что исследования, проводимые в МО, не раскрывают в полном объеме этиологию ВП. Молекулярно-генетический метод с использованием ПЦР расширяет возможности этиологической диагностики ВП и подтверждает данные о доминирующей роли Streptococcus pneumonia в качестве этиологического агента этой патологии.
Ключевые слова: внебольничная пневмония, этиология, отчеты медицинских организаций, молекулярно-генетические исследования.
Keywords: community-acquired pneumonia, etiology, reports of medical organizations, molecular genetic researches.
Внебольничные пневмонии (ВП) остаются одним из наиболее распространенных инфекционных заболеваний населения [2, 18]. В связи с этим с 2011 г. в РФ введен персонифицированный учет заболевших по установленной форме в территориальных органах, осуществляющих государственный санитарно-эпидемиологический надзор [1, 6]. Одновременно дополнены отчетные формы федерального государственного статистического наблюдения № 1 и № 2 «Сведения об инфекционных и паразитарных заболеваниях» (приказ Федеральной службы государственной статистики № 482 от 31.12.2010 г.). Вместе с тем система регистрации ВП пока что находится в стадии становления. Проблемным остается и вопрос этиологической расшифровки ВП, поскольку не все пациенты с подозрением на это заболевание подвергаются специфическому лабораторному обследованию, а методы лабораторной диагностики, применяемые в разных медицинских организациях (МО), не идентичны и не ориентированы на обнаружение максимального количества возбудителей.
Цель работы - оценка этиологии ВП по данным отчетов МО и результатам выборочных молекулярно-генетических исследований.
Материалы и методы.
Этиологию ВП оценивали по сведениям МО Пермского края на основе отчетов по форме № 2 за 2011-2014 гг., а также по результатам обследования 549 пациентов, поступивших с диагнозом ВП в одну из крупных детских больниц г. Перми в 2014 г. В последнем случае у больных было проведено бактериологическое исследование мокроты или мазков из зева и носа, а также серологические исследования сыворотки крови с применением иммуноферментного анализа (ИФА) и реакции непрямой гемагглютинации (РНГА). Серологическому обследованию подвергались только дети с полисегментарными
© Кузовникова Е.Ж., Вольдшмидт Н.Б., Сергевнин В.И., Шнуренко Н.А., 2015 г.
(обширными) пневмониями и длительно лихорадящие. Для выявления иммуноглобулинов методом ИФА к антигенам Chlamydophila pneumoniae применялись тест-системы производства ООО «ИмДи-тест» (Новосибирская обл. п. Кольцово), к антигенам Mycoplasma pneumoniae - тест-системы ЗАО «Вектор-Бест» (Новосибирская обл. п. Кольцово. Для обнаружения антигена к аденовирусу применялся диагностикум «Аденотест» производства НИИ ООО «Темп 2» (г. Ростов-на-Дону).
Этиологию ВП по результатам молекулярно-генетических исследований изучали по данным обследования 196 больных ВП, проведенного нами в лаборатории ФБУЗ «Центр гигиены и эпидемиологии в Пермском крае». Клинический материал (мазки из зева и носа) в лабораторию ФБУЗ поступал из трех МО г. Перми. С учетом выраженной полиэтиологичности ВП, возможности смешанной бактериально-вирусной инфекции, материал от больных исследовали методом полимеразной цепной реакции (ПЦР) с использованием четырех наборов реагентов, позволяющих выявить ДНК и/или РНК основных возбудителей ВП: ДНК Streptococcus pneumonia; ДНК Hemophilus influenza; ДНК Neisseria meningitidis; ДНК Chlamydophila pneumonia; ДНК Mycoplasma pneumonia; ДНК Chlamydophila psittaci; РНК Грипп А; РНК Грипп В; РНК Грипп H1N1 pdm 2009; РНК РС-вирус. Использовались наборы производства «Интерлабсервис» "ЦНИИЭ"
Роспотребнадзора.
Результаты и обсуждение.
Анализ этиологической структуры ВП по сведениям ф. № 2 за 2011 - 2014 гг. по Пермскому краю показал (табл. 1), что в основном регистрировалась патология
бактериальной природы. При этом доля ВП бактериальной, но не пневмококковой этиологии составила 65,7±0,2%. В то же время доля ВП пневмококковой оказалась минимальной -0,8±0,04 %. Столь же невысоким оказался удельный вес вирусных ВП - 0,6±0,03 %. Количество ВП, вызванной другими возбудителями и не уточненной, согласно отчетам, составило 32,8±0,2 %.
Таблица 1
Этиологическая структура ВП по данным отчетов МО
Этиология ВП Кол-во случаев
абс. % ± m
Бактериальная не пневмококковая 30385 65,8±0,2
Пневмококковая 371 0,8±0,04
Вирусная 272 0,6±0,03
Вызванная другими возбудителями и не уточненная 15208 32,8±0,2
Итого 46236 100
По результатам лабораторных исследований пациентов детской больницы г. Перми были выявлены микроорганизмы в 55 случаях (табл. 2). Наибольшую долю составил Streptococcus pneumonia - 23,7±0,04%. Реже выделялись Staphylococcus spp., Pseudomonas spp. и др.
Таблица 2
Этиологическая структура ВП по данным детской больницы
Выделенные микроорганизмы и их маркеры Кол-во микроорганизмов и их маркеров %±m
Streptococcus pneumonia 13 23,7±5,7
Klebsiella pneumoniae 4 7,3±3,4
Pseudomonas spp. 9 16,3±4,9
Staphylococcus spp. 10 18,3±5,1
Mycoplasma pneumoniae 3 5,4±3,0
Стрептококки группы В 2 3,6±2,5
Escherichia coli 4 7,3±3,4
Другие аэробные грамотрицательные бактерии (Аcinetobacter и др.) 9 16,3±4,9
Аdenovims 1 1,8±1,8
Итого 55 100
Анализ этиологической структуры ВП по данным собственных молекулярногенетических исследований показал (табл. 3), что из 196 больных у 55,6 % были выделены маркеры возбудителей ВП. При этом ДНК и/или РНК возбудителей были обнаружены в 141 случае. Преобладала ДНК Streptococcus pneumonia, на долю которой пришлось 64,5±4,0 %. Доля РНК РС-вируса и РНК гриппа А составила 12,7±2,8 и 11,3±2,6 % соответственно, ДНК Hemophilus influenzae - 7,0±2,1 %, ДНК Mycoplasma pneumonia - 3,5±1,5 %, ДНК Chlamydophila pneumoniae - 0,7±0,7 %.
Таблица 3
Этиологическая структура ВП по данным ПЦР исследований
Маркеры микроорганизмов Количество маркеров микроорганизмов
абс. %±m
ДНК Streptococcus pneumonia 91 64,5±4,0
ДНК Haemophilus influenzae 10 7,0±2,1
ДНК Mycoplasma pneumoniae 5 3,5±1,5
ДНК Chlamydophila pneumoniae 1 0,7±0,7
РНК вируса гриппа А 16 11,3±2,6
РНК RS-вируса 18 12,7±2,8
Всего 141 100
Обращает внимание тот факт, что в исследуемом материале у 31 больного ВП из 109 (28,4%) были обнаружены сочетания нескольких ДНК/РНК возбудителей: ДНК Streptococcus pneumonia и РНК гриппа А - в 35,5±8,6 % случаев, ДНК Streptococcus pneumonia и ДНК Hemophilus, ДНК Streptococcus pneumonia и РНК РС-вируса - по 22,6±7,5 % соответственно, ДНК Streptococcus pneumonia и ДНК Mycoplasma pneumonia - в 12,9±6,0 %. Другие сочетания отмечались в 2-х случаях - по 3,2±3,1 %.
Таким образом, рутинные бактериологические и выборочные серологические исследования, проводимые в МО, не раскрывают в полном объеме этиологию ВП. Молекулярно-генетический метод с использованием ПЦР расширяет возможности этиологической диагностики ВП и подтверждает данные о доминирующей роли Streptococcus pneumonia в качестве этиологического агента этой патологии.
Литература
1. Эпидемиологический надзор за внебольничными пневмониями. МУ 3.1.2.3047-13.
2. Чучалин А.Г. Внебольничная пневмония у взрослых. Практические рекомендации по диагностике, лечению и профилактике /А.Г. Чучалин, А.И. Синопальников, Р.С. Козлов, И.Е. Тюрин, С.А. Рачина. - М. 2010. - 60 с.