Научная статья на тему 'Электронный атлас в эпидемиологическом надзоре за ВИЧ-инфекцией'

Электронный атлас в эпидемиологическом надзоре за ВИЧ-инфекцией Текст научной статьи по специальности «Компьютерные и информационные науки»

CC BY
300
191
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
Ключевые слова
ВИЧ-ИНФЕКЦИЯ / ЭЛЕКТРОННЫЙ ЭПИДЕМИОЛОГИЧЕСКИЙ АТЛАС / ПРИВОЛЖСКИЙ ФЕДЕРАЛЬНЫЙ ОКРУГ / ИНФОРМАЦИОННЫЕ ТЕХНОЛОГИИ / HIV INFECTION / E-EPIDEMIOLOGICAL ATLAS / VOLGA FEDERAL DISTRICT / INFORMATION TECHNOLOGY

Аннотация научной статьи по компьютерным и информационным наукам, автор научной работы — Зайцева Наталья Николаевна, Ефимов Евгений Игоревич, Солнцев Леонид Аркадьевич, Ершов Виктор Иванович

В статье содержится информация о применении геоинформационного проекта «Электронный эпидемиологический атлас Приволжского федерального округа», разработанного в Нижегородском научно-исследовательском институте имени академика И.Н. Блохиной Роспотребнадзора как нового современного элемента информационного обеспечения для проведения анализа и оценки эпидемической ситуации ВИЧ-инфекции на административных территориях ПФО. Статистическая информация, получаемая от территориальных центров СПИД округа, в сочетании с пространственной привязкой, как элемента геостатистики электронного атласа, дает возможность изучения каждого явления в пространственно-временной динамике и представления результата в наглядной компактной форме в виде картосхем. Применение атласа ведет к совершенствованию и оптимизации системы эпидемиологического надзора за ВИЧ-инфекций, позволяет повысить уровень эпидемиологической диагностики, оценивать особенности и тенденции развития эпидемического процесса ВИЧ-инфекции в округе для своевременного планирования профилактических и противоэпидемических мероприятий.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по компьютерным и информационным наукам , автор научной работы — Зайцева Наталья Николаевна, Ефимов Евгений Игоревич, Солнцев Леонид Аркадьевич, Ершов Виктор Иванович

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Electronic atlas in epidemiological surveiilanve over HIV-infection

This article contains information about the application of GIS project "Electronic epidemiological Atlas of the Volga Federal district", developed in Nizhny Novgorod scientific-research Institute named after academician S.N. Blokhina of the CPS as a new modern item of information support for analysis and evaluation of the epidemiological situation of HIV infection on the administrative territory of the Volga Federal district. Statistical information obtained from the regional AIDS centres in the district, in conjunction with spatial reference, as part of geostatistics electronic Atlas, allows for examination of each phenomenon in the spatio-temporal dynamics and presentation of results in a visual compact form in the form of a schematic map. The use of Atlas leads to improvement and optimization of the system of epidemiological surveillance of HIV infections, can increase the level of epidemiological diagnosis, to assess the characteristics and trends of the epidemic process of HIV infection in the district for the timely planning of preventive and antiepidemic measures.

Текст научной работы на тему «Электронный атлас в эпидемиологическом надзоре за ВИЧ-инфекцией»

ЭПИДЕМИОЛОГИЧЕСКИЙ НАДЗОР И КОНТРОЛЬ АКТУАЛЬНЫХ ИНФЕКЦИОННЫХ БОЛЕЗНЕЙ

УДК 616.98-036.22(084.4)

ЭЛЕКТРОННЫЙ АТЛАС В ЭПИДЕМИОЛОГИЧЕСКОМ НАДЗОРЕ ЗА ВИЧ-ИНФЕКЦИЕЙ

Н.Н. Зайцева, Е.И. Ефимов, Л.А. Солнцев, В.И. Ершов,

ФБУН «Нижегородский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии им. академика И.Н. Блохиной»

Зайцева Наталья Николаевна - e-mail: [email protected]

В статье содержится информация о применении геоинформационного проекта «Электронный эпидемиологический атлас Приволжского федерального округа», разработанного в Нижегородском научно-исследовательском институте имени академика И.Н. Блохиной Роспотребнадзора как нового современного элемента информационного обеспечения для проведения анализа и оценки эпидемической ситуации ВИЧ-инфекции на административных территориях ПФО. Статистическая информация, получаемая от территориальных центров СПИД округа, в сочетании с пространственной привязкой, как элемента геостатистики электронного атласа, дает возможность изучения каждого явления в пространственно-временной динамике и представления результата в наглядной компактной форме в виде картосхем. Применение атласа ведет к совершенствованию и оптимизации системы эпидемиологического надзора за ВИЧ-инфекций, позволяет повысить уровень эпидемиологической диагностики, оценивать особенности и тенденции развития эпидемического процесса ВИЧ-инфекции в округе для своевременного планирования профилактических и противоэпидемических мероприятий.

Ключевые слова: ВИЧ-инфекция, электронный эпидемиологический атлас, Приволжский федеральный округ, информационные технологии.

This article contains information about the application of GIS project «Electronic epidemiological Atlas of the Volga Federal district», developed in Nizhny Novgorod scientific-research Institute named after academician S.N. Blokhina of the CPS as a new modern item of information support for analysis and evaluation of the epidemiological situation of HIV infection on the administrative territory of the Volga Federal district Statistical information obtained from the regional AIDS centres in the district, in conjunction with spatial reference, as part of geostatistics electronic Atlas, allows for examination of each phenomenon in the spatio-temporal dynamics and presentation of results in a visual compact form in the form of a schematic map. The use of Atlas leads to improvement and optimization of the system of epidemiological surveillance of HIV infections, can increase the level of epidemiological diagnosis, to assess the characteristics and trends of the epidemic process of HIV infection in the district for the timely planning of preventive and antiepidemic measures.

Key words: HIV infection, e-epidemiological Atlas, the Volga Federal district, information technology.

Введение

ВИЧ-инфекция продолжает оставаться одним из актуальнейших инфекционных заболеваний современности и наиболее важной и сложной проблемой здравоохранения в силу своей социальной, медицинской и демографической значимости [1, 2].

Эффективная система мониторинга развития эпидемического процесса инфекционных заболеваний, и в том числе ВИЧ-инфекции, является одним из актуальных направлений в развитии эпидемиологической науки на современном этапе. Внедрение компьютерных информационных систем предлагает совершенно новый путь использования статистических, картографических и других баз данных в эпидемиологии, что позволяет любому специалисту получить о заболевании все его эпидемиологические характеристики как на уровне отдельно взятой территории, так и округа в целом, используя всего лишь

возможности персонального компьютера (ПК) на своем рабочем месте.

Одним из примеров такого решения являются электронные атласы, основной задачей которых являются систематизация и динамическое формирование из набора исходных данных некоторой единой системы хранения и представления информации в виде графиков и справок (карты, таблицы, диаграммы и т. п.). Использование алгоритма и процедуры статистической обработки в сочетании с богатым функционалом геостатистики в плане пространственного представления явления дает пользователю возможность изучения пространственно-временной динамики эпидемического процесса актуальных инфекций. Последнее интересно с научных и крайне важно с практических позиций в плане своевременного и, как следствие, эффективного проведения соответствующих профилактических и противоэпидемических мероприятий.

Именно в динамическом формировании электронного атласа заложено его важное отличие от бумажного аналога, который устаревает ещё до момента выхода в печать. Кроме того, варианты представления имеющихся данных в бумажном атласе, как правило, фиксированы и ограничены рядом факторов (таких, как объём получаемого издания).

Цель работы: включение современных информационных технологий в систему эпидемиологического надзора и мониторинга ВИЧ-инфекции в Приволжском федеральном округе.

Материал и методы

Для работы используются данные статистической отчетности территориальных центров по профилактике и борьбе со СПИД на уровне субъектов Приволжского федерального округа. Атлас реализован в виде веб-сервиса, динамически формирующего результирующую информацию в ответ на запрос пользователя. Основу атласа составляет база данных SQL (от англ. Structured Query Language - «структурированный язык запросов»), в которой хранится вся информация в виде связанных таблиц. С помощью языка PHP (от англ. Hypertext Preprocessor - «PHP: препроцессор гипертекста») данные извлекаются и формируются сводные таблицы, графики временной динамики и картосхемы.

Результаты и их обсуждение

В Приволжском федеральном округе более 65% территорий имеют высокий и очень высокий уровни поражен-ности населения ВИЧ-инфекцией. В целом, начиная с 2000 г.,

показатели заболеваемости и распространенности превышают среднероссийские значения [3]. На 01.07.2014 г. более 60 000 ВИЧ-позитивных граждан получают антире-тровирусную терапию, значительная часть из которых (35,5%) ее прерывала, что предусматривает необходимость проведения систематического мониторинга за лекарственно-устойчивыми штаммами ВИЧ. Общее количество ВИЧ-инфицированных лиц, умерших от всех причин, в округе составило 44 616 человек, в том числе вследствие ВИЧ-инфекции - 8546. Кроме того, наблюдается ежегодный рост числа детей, рожденных от ВИЧ-инфицированных матерей, в том числе инфицированных при перинатальном контакте.

Таким образом, эпидемический процесс ВИЧ-инфекции продолжает свое развитие, что определяет необходимость включения в систему эпидемиологического надзора новых современных элементов информационного обеспечения для проведения всестороннего анализа и оценки эпидемической ситуации данной инфекционной патологии.

Эта задача успешно решена созданием и внедрением в практику работы геоинформационного проекта «Электронный эпидемиологический атлас Приволжского федерального округа», разработанного в Нижегородском научно-исследовательском институте имени акад. И.Н. Блохиной в соответствии с отраслевой научно-исследовательской программой «Научные аспекты обеспечения санитарно-эпидемиологического благополучия в Российской Федерации на 2006-2010 годы», утвержденной

РИС. 1.

Раздел «ВИЧ-инфекция» электронного эпидемиологического атласа ПФО.

Руководителем Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека от 23 сентября 2006 года и являющегося частью опытно-экспериментальной работы «Разработка геоинформационной системы органов государственной власти ПФО». Атлас размещен на сайте института (www.nniiem.ru), что дает возможность свободного использования специалистами данных многолетнего эпидемиологического мониторинга за целым спектром нозологий инфекционного генеза, и в том числе за ВИЧ-инфекцией.

Атлас состоит из 2 частей:

Часть 1: «Заболеваемость актуальными инфекциями в ПФО».

Часть 2: «Информация о силах и средствах противоэпидемической защиты населения» (в стадии разработки).

Собственно раздел «ВИЧ-инфекция» атласа представлен несколькими подразделами (рис. 1).

В подразделах собраны данные о качественных и количественных характеристиках эпидемического процесса ВИЧ-инфекции на 14 административных территориях ПФО за многолетний период наблюдения, данные молекулярно-эпидемиологического мониторинга за резистентными штаммами ВИЧ и субтиповой структуры вируса иммунодефицита человека в ПФО.

Подраздел атласа «Общие данные по ПФО» представляет информацию по заболеваемости как в каждом

Выберите источник данных:

Данные инф. сборников

Временная динамика

Аналитические данные

Пространственная динамика за:

1997

Нарисовать карто-схему

Конструктор сводных таблиц

Открыть

о

2000

Заболевание:Данные инф. сборников Территория: ПФО Период: 2000 по 2012 года

■ Мордовия ■ Нижегородская обл.

/ Уровень заболеваемости в 2002 с 59.10 чел/100 тыс. населения иставил Рмский "Ра*

^Башкирия

Кировская обл. ^Марий Эл ^Мордовия ^Нижегородская обл. ^Оренбургская обл. I-Пензенская обл. ^Пермский край I Самарская обл. I Саратовская обл. ^Татарстан ^Удмуртия ^Ульяновская обл. ^Чувашия

РИС. 2.

Многолетние показатели заболеваемости ВИЧ-инфекцией на территориях ПФО (подраздел атласа «Общие данные по ПФО»).

РИС. 3.

Показатели смертности и число умерших от ВИЧ-инфекции в ПФО в 2013 г. (подраздел атласа «Смертность среди ВИЧ-инфицированных в ПФО»).

конкретном году, так и отражает многолетние показатели инцидентности, показатели пораженности и распространенности ВИЧ-инфекции среди населения территорий округа (рис. 2). Также здесь имеются данные по возрастной, половой, социальной структурам и факторам риска инфицирования вирусом ВИЧ-позитивных лиц Приволжья.

Подраздел атласа «Смертность среди ВИЧ-инфицированных в ПФО» (рис. 3) позволяет объективно охарактеризовать интенсивность эпидемического процесса ВИЧ-инфекции, сравнивая и оценивая показатели смертности и летальности на территориях округа в разные годы наблюдения.

В целом использование данных, изложенных в этих двух подразделах атласа, позволяет пользователю оценивать динамику и развитие эпидемического процесса ВИЧ-инфекции как на любой из 14 территорий ПФО, так и в округе в целом, во временном и пространственном измерении, используя данные, заложенные в функционал атласа, в любое удобное для себя время на своем рабочем месте.

Результаты проведенного молекулярно-генетического мониторинга за резистентными штаммами ВИЧ к антире-тровирусным препаратам (АРВП) и мониторинга субтиповой структуры вируса иммунодефицита человека в Приволжском федеральном округе нашли свое отражение

РИС. 4.

Структура мутаций, определяющих резистентность ВИЧ-1 к различным группам АРВП в 2012 г. в ПФО

(подраздел атласа «Характеристика мутаций высокой степени устойчивости ВИЧ к антиретровирусным препаратам»).

РИС. 5.

Субтиповая структура ВИЧ-1 в ПФО (подраздел атласа «Субтипы ВИЧ-1 в ПФО»).

в следующих подразделах атласа: «Характеристика мутаций высокой степени устойчивости ВИЧ к антиретровирус-ным препаратам» и «Субтипы ВИЧ-1 в ПФО». В данных вкладках пользователь может ознакомиться со структурой мутаций, определяющих лекарственную устойчивость ВИЧ к различным группам применяемых препаратов (рис. 4), оценить распространенность каждой отдельно взятой мутации резистентности вируса к АРВП в различные годы наблюдения на административных территориях округа.

Характеристика субтиповой структуры ВИЧ-1 в ПФО представлена во вкладке, где на картограмме показан спектр различных субтипов, циркулирующих в регионах ПФО (рис. 5).

Вкладка «Аналитические данные» позволяет пользователю ознакомиться с анализом эпидемической ситуации по ВИЧ-инфекции в ПФО, изложенной в годовых информационных бюллетенях Приволжского окружного центра по профилактике и борьбе со СПИД.

Вкладка «Конструктор сводных таблиц» позволяет получить доступ к исходной табличной информации, что не ограничивает пользователя только теми видами анализа и представления данных, которые заложены в функционал атласа разработчиками, а дает возможность использовать запрашиваемые сведения в самых различных вариантах на свое усмотрение.

Заключение

Таким образом, статистическая информация, получаемая от территориальных центров СПИД округа, в сочетании с пространственной привязкой, как элемента геостатистики электронного атласа, дает возможность изучения

каждого явления в пространственно-временной динамике и представления результата в наглядной компактной форме в виде картосхем.

В целом применение атласа как информационной составляющей эпидемиологического надзора за ВИЧ-инфекцией позволяет пользователю «на местах» иметь своевременную, актуальную, полную и наглядную (с максимальной визуализацией данных статистического анализа) информацию, которая характеризует эпидемический процесс ВИЧ-инфекции как на каждой из 14 территорий ПФО, так и в округе в целом. Все это позволяет оперативно оценивать особенности, тенденции и интенсивность развития эпидемического процесса данной инфекционной нозологии для своевременного планирования профилактических и противоэпидемических мероприятий.

ЛИТЕРАТУРА

1. Покровский В.В. Эпидемиология и профилактика ВИЧ-инфекции/СПИД. М. 1996. 248 с.

2. Вирус иммунодефицита человека - медицина. Руководство для врачей / под редакцией Н.А. Белякова и А.Г. Рахмановой. 3-е изд. СПб.: Балтийский медицинский образовательный центр, 2012. 656 с.

Virus immunodeficita cheloveka - medicina. Rukovodstvo dlja vrachej/pod redakciej N.A. Beljakova i A.G. Rahmanovoj. 3-e izd. SPb.: Baltijskij medicinskij obrazovatel'nyj centr, 2012. 656 s.

3. Зайцева Н.Н., Парфенова О.В., Ефимов Е.И. Анализ распространенности резистентных штаммов ВИЧ к антиретровирусным препаратам в ПФО. Вопросы вирусологии. 2013. № 6. С. 39-41.

Zajceva N.N., Parfenova O.V., Efimov E.I. Analiz rasprostranennosti rezistentnyh shtammov VICH k antiretrovirusnym preparatam v PFO. Voprosy virusologii. 2013. № 6. S. 39-41.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.