Частоты генов hla-micb в популяции татар в сравнении с другими популяциями, проживающими на территории Челябинской области

Вавилов Михаил Николаевич; Бурмистрова Александра Леонидовна; Целищев Григорий Владимирович; Суслова Татьяна Александровна

Вестник Челябинского государственного университета. 2013. № 7 (298). Биология. Вып. 2. С. 34-35.

М. Н. Вавилов, А. Л. Бурмистрова, Г. В. Целищев, Т. А. Суслова

ЧАСТОТЫ ГЕНОВ ИЬА-М1СБ В ПОПУЛЯЦИИ ТАТАР В СРАВНЕНИИ С ДРУГИМИ ПОПУЛЯЦИЯМИ ПРОЖИВАЮЩИМИ НА ТЕРРИТОРИИ ЧЕЛЯБИНСКОЙ ОБЛАСТИ

Производится сравнение частот распределения генов MICB в популяции татар, проживающей на территории Челябинской области, с другими наиболее численными популяциями Южного Урала, с популяцией русских и башкир.

Ключевые слова: популяционная иммуногенетика, МНС, ША, М1С, татары, башкиры, русские.

Введение. MIC — группа неклассических генов HLA, расположенных на коротком плече 6-й хромосомы в области HLA-I [1]. Из 7 известных локусов генов MIC лишь MICB и соседний с ним локус MICA кодируют полипептиды, которые являются лигандами для рецептора NKG2D на естественных киллерах (ЕК) и Т-лимфоцитах, тем самым участвуя в активации реакции клеточной цитотоксичности, что имеет значение во врождённом и адаптивном иммунном ответе [2]. Локус MICB, как и классические локусы HLA, высокополиморфны. Обнаружено около 30 вариантов аллелей MICB.

Распределение аллелей MICB в различных этносах мира имеет свои особенности. Сравнивая частоты аллелей MICB, условно можно выделить монголоидные и европеоидные черты, характерные также и для основных этнических групп Южного Урала. В предыдущих исследованиях были установлены статистически достоверные отличия в распределении аллелей MICB в популяциях русских и башкир Челябинской области. У русских по сравнению с башкирами достоверно выше частота MICB*004 и MICB*005:03, что характерно для европеоидных популяций, у башкир достоверно выше MICB*009N и MICB*014, что сближает их с монголоидными популяциями [3].

В данном исследовании было рассмотрено распределение частот MICB в популяции татар. Современные татары — это тюркоязычный народ, является вторым по численности народом в Российской Федерации после русских. По итогам переписи населения 2002 г., в Челябинской области проживает более 200 тыс. человек татарской национальности — это третий регион России по численности татарского населения [4]. Вопрос о происхождении и этногенезе татар остаётся открытым.

Цель. Определить частоты аллелей HLA-I класса MICB в популяции татар, проживающих

в Челябинской области, и сравнить полученные данные с данными по частотам М1СВ в основных популяциях, проживающих в данном регионе.

Материалы и методы. Было обследовано 108 татар, 100 русских и 50 башкир, проживающих на территории Челябинской области. Этническая принадлежность лиц определялась по официальным документам и данным генеалогического анамнеза в трёх поколениях. Генотипирование по MICB осуществлялось полимеразной цепной реакцией с использованием аллельспецифиче-ских праймеров (SSP-PCR). Математическая обработка результатов проводилась с использованием специализированных программ для генетических исследований — Аг^шп (V. 3.11) [5] и DoctorStat [6].

Как видно из таблицы, у татар обнаружено 9 из 10 наиболее распространённых вариантов М1СВ, которые встречаются в описанных мировых популяциях. Также можно заметить, что значения частот генов М1СВ*003, М1СВ*004, М1СВ*005:01, М1СВ*005:02 и М1СВ*013 у татар занимают промежуточное положение между частотами данных генов в русской и башкирской популяции с незначительным отклонением в ту или иную сторону. Носительство аллельных вариантов М1СВ*002 и М1СВ*008 незначительно выше, чем в остальных рассмотренных популяциях.

Однако есть и некоторые достоверные отличия. У татар по сравнению с русскими, как и у башкир, достоверно ниже частота М1СВ*005:03. По сравнению с башкирами у татар достоверно ниже частота М1СВ*009К и полностью отсутствует М1СВ*014, что сближает их с русскими. Таким образом, основываясь на наших предыдущих исследованиях по распределению частот генов HLA среди основных популяций Челябинского региона: русских [7] и башкир [7; 8], а также по результатам данного исследования, можно заключить, что татары Челябинской области несут в себе

Распределение частот аллелей MICB среди русских, татар и башкир, проживающих на территории Челябинской области

Аллель MICB Частота генов, % Точный двусторонний критерий Фишера

Русские N = 100 Татары N = 108 Башкиры N = 50 Татары и русские Татары и башкиры Русские и башкиры

MICB*002 14,0 18,2 17,5 - - -

MICB*003 4,6 1,8 1,0 - - -

MICB*004 24,5 18,2 12,8 - - P < 0,05

MICB*005:01 2,0 0,5 - - - -

MICB*005:02 37,6 48,4 49,0 - - -

MICB*005:03 6,2 0,5 - P < 0,01 - P < 0,01

MICB*008 6,2 8,1 5,1 - - -

MICB*009N 0,5 2,3 8,3 - P < 0,05 P < 0,01

MICB*013 3,6 0,9 - - - -

MICB*014 - - 4,1 - P < 0,01 P < 0,05

черты как монголоидных, так и европеоидных популяций.

Выводы и заключение. 1. У татар Челябинской области по сравнению с русскими данного региона достоверно понижена частота MICB*005:03.

2. У татар Челябинской области по сравнению с башкирами данного региона достоверно ниже частота MICB*009N и MICB*014.

Список литературы

1. Collins, R. W. M. Human MHC class I chain related (MIC) genes: their biological function and relevance to disease and transplantation // Europ. J. of Immunogenetics. 2004. Vol. 31. P. 105-114.

2. Stastny, P. Introduction: MICA/MICB in Innate Immunity, Adaptive Immunity, Autoimmunity, Cancer, and in the immune response to transplants // Human Immunology. 2006. Vol. 67. P. 141-144.

3. Vavilov, M. N. HLA and MICB alleles in ancestral haplotypes in Russian and Bashkir populations of the Chelyabinsk Region of Russian South Urals / M. N. Vavilov, T. A. Suslova, A. L. Burmistrova.

C. Darke [et al.] // Tissue Antigens. 2012. Vol. 79, № 6. P. 531.

4. Всероссийская перепись населения 2002 года [Электронный ресурс]. URL: http://www. perepis2002.ru

5. Arlequin ver 3.11. An Integrated Software for Population Genetics Data Analysis [Электронный ресурс]. URL: http://cmpg.unibe.ch/software/arle-quin3

6. Компьютерная программа DoctorStat [Электронный ресурс]. URL: http://doctorstat.narod.ru/ index.html

7. Suslova, T. A. HLA gene and haplotype frequencies in Bashkirs, Russians and Tatars, living in the Chelyabinsk region (Russian South Urals) / T. A. Su-slova, A. L. Burmistrova, C. Darke [et al.] // Intern. J. of Immunogenetics. 2012. Vol. 39. P. 394-408.

8. Суслова, Т. А. Распределение генов, гапло-типов HLA в популяции башкир, проживающих в Челябинской области / Т. А. Суслова, А. Л. Бурмистрова, М. С. Чернова [и др.] // Иммунология. 2011. № 2. С. 65.

Текст научной работы на тему «Частоты генов hla-micb в популяции татар в сравнении с другими популяциями, проживающими на территории Челябинской области»