Научная статья на тему 'Частоты генов HLA-A, b, dr в популяции татар Челябинской области в сравнении с другими этносами региона'

Частоты генов HLA-A, b, dr в популяции татар Челябинской области в сравнении с другими этносами региона Текст научной статьи по специальности «Химические науки»

CC BY
339
93
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
Ключевые слова
ПОПУЛЯЦИОННАЯ ИММУНОГЕНЕТИКА / ТАТАРЫ / БАШКИРЫ / РУССКИЕ / MHC / HLA / POPULATIONAL IMMUNOGENETICS / TATARS / BASHKIRS / RUSSIAN

Аннотация научной статьи по химическим наукам, автор научной работы — Суслова Татьяна Александровна, Бурмистрова Александра Леонидовна, Хромова Елена Борисовна, Вавилов Михаил Николаевич, Беляева Светлана Валерьевна

Представлены частоты генов и гаплотипов HLA у татар Челябинской области в сравнении с русскими и башкирами, населяющими регион.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по химическим наукам , автор научной работы — Суслова Татьяна Александровна, Бурмистрова Александра Леонидовна, Хромова Елена Борисовна, Вавилов Михаил Николаевич, Беляева Светлана Валерьевна

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

The most frequent HLA alleles and haplotypes in the Tatars of Chelybinsk region are presented in this study. A comparison of immunogenetics parameters Tatars with those of the Russian and Bashkirs living in the region was carried out. Immunogenetic similarities and differences of ethnic groups living in the is shown.

Текст научной работы на тему «Частоты генов HLA-A, b, dr в популяции татар Челябинской области в сравнении с другими этносами региона»

Вестник Челябинского государственного университета. 2013. № 7 (298). Биология. Вып. 2. С. 14-17.

Т. А. Суслова, А. Л. Бурмистрова, Е. Б. Хромова, М. Н. Вавилов, С. В. Беляева, М. С. Чернова, А. К. Горелова

ЧАСТОТЫ ГЕНОВ ИЬЛ-Л, В, БЯ В ПОПУЛЯЦИИ ТАТАР ЧЕЛЯБИНСКОЙ ОБЛАСТИ В СРАВНЕНИИ С ДРУГИМИ ЭТНОСАМИ РЕГИОНА

Представлены частоты генов и гаплотипов HLA у татар Челябинской области в сравнении с русскими и башкирами, населяющими регион.

Ключевые слова: популяционная иммуногенетика, МНС, ША, татары, башкиры, русские.

Введение. Татары — тюркская по происхождению этническая группа, второй по численности этнос России. По данным переписи 2010 г., татары составляют 3,72 % населения страны, что соответствует 5 310,6 тыс. чел. Татары делятся на три основные этнотерриториальные группы: волгоуральские, сибирские и астраханские, проживают во всех регионах России, больше всего — в её европейской части. Численность татар, проживающих в Челябинской области, находится на 3-м месте после республик Татарстан (2 012 тыс. чел.) и Башкортостан (1 009 тыс. чел.). В Челябинской области проживают 180 913 татар (перепись 2002 г.) [6]. Татары живут преимущественно в северных и северо-западных районах области. Первые исторические указания о поселении татар в регионе относятся к началу XVII в.: описаны первые поселения татар-мишар (д. Усть-Багаряк и Караболка). Их количество увеличилось с развитием экспедиции царского правительства под руководством И. К. Кириллова. Служилые мишари (их до ХХ в. называли мещеряки) и ясачные татары, являясь военным сословием, с середины XVIII в. были переселены в район деревень Муслюмово, Курманово, Кунашак, где они проживают до сих пор [3].

Этногенез волго-уральских татар точно не установлен. В настоящее время имеется три теории, объясняющие происхождение татар: бул-гаро-татарская, татаро-монгольская и тюркско-татарская. Булгаро-татарская подразумевает, что предками современных татар были жители Великой Булгарии — булгары (IX в. н. э.). Татаро-монгольская теория утверждает, что предками современных татар были монгольские завоеватели, которые, смешавшись с кипчаками в период Золотой Орды, и дали начало татарскому этносу. Согласно третьей теории — тюрко-татарской — татары образовались и с участием волжских булгар и других тюркских

племён, проживавших веками на этой территории. Особая группа волго-уральских татар России — татары-мишари. Мишари — субэтнос татар, имеющий свой субдиалект татарского языка. Он складывался на территории центра России (междуречье Цны и Мокши), в их этногенезе большую роль играли буртасы, булгары, племена мещеры, относившиеся к финно-уграм и потомки Золотой Орды [1], впоследствии мигрировали в район Поволжья и Приуралья. Татары говорят на татарском языке, представляющем кыпчакскую подгруппу тюркской группы алтайской языковой семьи, представлены четырьмя основными антропологическими типами: понтийским, светлым европеоидным, субла-поноидным, монголоидным [1; 3].

Цель работы: установить распределение генов, гаплотипов ^А-А*, В*, DRB1* в этнической группе татар, проживающих в Челябинской области.

Материалы и методы. Проведено HLA-типи-рование неродственных лиц, относящих себя к татарский национальности, проживающих на территории Челябинской области как минимум в трёх поколениях и понимающих татарский язык; всего 170 человек. НЬА-типирование проводилось полимеразной цепной реакцией (ПЦР) с использованием аллельспецифических праймеров (SSP-PCR), предложенных в [4].

Статистические методы: расчёт генных частот (GF), частот гаплотипов (ЭТ) и определение гаметной фазы проводилось методом максимизации ожидания в компьютерных программах Аг^шп 3.1 и DoctorStat [7; 8]. Определение соответствия наблюдаемого распределения аллелей равновесию Харди — Вайнберга проверялось для каждого локуса в программе Аг^шп 3.1. Достоверность различий в частоте встречаемости генов и гаплотипов в популяциях определяли согласно критерию Пирсона. При абсолют-

ных значениях меньше 5 использовали точный двусторонний критерий Фишера. Для сравнения были использованы данные НЬА-типирования башкир и русских, проживающих в Челябинской области [2; 5].

Результаты и обсуждение. Результаты им-муногенетических расчётов частот генов НЬА у татар представлены в таблице. Данные таблицы иллюстрируют, что у татар Челябинской области наиболее частыми генами локусов НЬА-1

Сравнение частот генов HLA в основных этносах Челябинской области

Аллели НЬА Частота гена, % Точный двусторонний критерий Фишера

Русские Ж = 207 Татары N = 170 Башкиры N = 146 Татары и русские Татары и башкиры Русские и башкиры Русские и татары

А*01 18,12 12,89 8,90 - - Р < 0,01

А*02 29,71 27,24 33,56 - Р = 0,055 -

А*03 15,94 14,94 8,56 - Р < 0,05 Р < 0,01

А*11 4,59 8,28 5,82 Р < 0,05 - -

А*24 8,94 11,22 14,38 - - Р < 0,05

А*25 4,35 2,99 1,03 - - Р < 0,05

А*26 3,87 5,75 4,80 - - -

А*33 0,48 2,08 3,08 - - -

А*68 3,38 5,13 8,56 - - Р < 0,05

В*07 14,73 10,23 8,22 - - -

В*08 7,73 5,13 3,43 - - Р < 0,05

В*13 5,31 10,23 16,10 Р < 0,05 Р < 0,01 Р << 0,01

В*15 8,21 3,59 2,74 Р < 0,05 - Р < 0,01

В*18 5,56 7,01 3,43 - - -

В*35 9,66 12,22 7,53 - - -

В*40 1,21 1,48 0,69 - - -

В*44 3,87 4,21 2,06 Р < 0,01 - Р < 0,01

В*48 0,48 1,78 7,53 - Р < 0,01 Р << 0,01

В*49 0,24 3,29 2,40 Р < 0,01 - Р < 0,01

В*50 1,21 3,90 3,77 Р < 0,05 - Р < 0,05

В*51 4,35 5,44 10,62 - Р < 0,05 Р < 0,01

В*58 0,73 2,68 2,40 Р < 0,05 - -

DRB1*01 15,70 10,23 7,53 Р = 0,053 - Р < 0,01

DRB1*03 9,42 7,33 5,14 - - Р < 0,05

DRB1*04 10,87 10,23 11,64 - - -

DRB1*07 13,53 19,56 21,58 - - Р < 0,01

DRB1*08 4,35 3,29 2,74 - - -

DRB1*09 1,45 2,99 4,80 - - Р < 0,01

DRB1*10 1,69 2,08 0,69 - - -

DRB1*11 9,66 9,90 6,16 - - -

DRB1*12 0,97 2,38 8,22 - Р < 0,01 Р << 0,01

DRB1*13 12,56 13,91 15,41 - - -

DRB1*14 1,69 3,90 4,45 - - Р < 0,05

DRB1*15 14,73 10,89 9,25 - - Р < 0,05

DRB1*16 3,38 5,13 2,40 - - -

и 2 класса представлены аллели: А*1, 2, 3, 24, 11, В*35, 7, 13, 18, 44, 40, 27, DR*07, 13, 01, 03, 11, 08. Высокие частоты данных аллелей типичны для любой европеоидной популяции. Аллельные варианты, определяющиеся по данным литературы как характерные монголоидные (азиатские популяции), а именно: А*33, 31, В*52, 54, 46, 48, DR*09, 10, 12 — встречаются у татар с минимальной частотой. Эти признаки позволяют нам утверждать, что татары России являются принципиально европеоидной популяцией.

О том же говорит и частота гаплотипов НЬА: наиболее распространены А*03-В*35-DRB1*01 (Н = 4,4 %), А*02-В*44-0ЯВ1*07 (Н = 2,6), А* 02-В* 07-DRB1* 15 (Н = 2,2 %) и сходные с ними А*03-В*07ЧЖВ1*13 (Hf = 1,9 %), A*03-B*07-DRB1*15 (Н = 1,3 %). Частота ан-цестрального А1.Н8 составляет (Hf = 1,5 %), что несколько ниже, чем в европейских популяциях. Из гаплотипов, встречающихся чаще в азиатских популяциях, у татар Челябинской области наиболее распространён A*02-B*50-DRB1*07. Он занимает 5-е место в числе наиболее распространённых гаплотипов в данной популяции с частотой 1,9 %. Один из наиболее частых азиатских В13-DR*7 на 6-м месте с частотой 1,8 %.

При сравнении популяций уральских татар с русскими, проживающими в Челябинской области, обращает на себя внимание тот факт, что несмотря на то, что обе сравниваемые популяции являются типично европеоидными, у них имеются некоторые отличия: в локусе А у татар чаще встречается ген А* 11 (этот ген более характерен для азиатских популяций евразийского континента). Несколько больше отличий отмечено в локусе В: у татар снижены В*15 и 44, но повышен В*13, 49, 50, 58. В локусе DR* у татар немного выше частота гена DR*07 и меньше DR*01 (Р < 05). Следует отметить также у татар некоторое снижение частот аллелей, входящих в ан-цестральные европейские гаплотипы АН 8.1, АН 7.3, однако это снижение не достигает статистически значимого уровня. Имеется также и некоторое различие в частотах наиболее распространённых гаплотипов. У татар наибольшие частоты у гаплотипов: А*03-В*35-DR*01 и А*02-В*44-DRB1*07, в то время как у русских А*01-В*08-DR*03 и A*03-В*07-DR*15.

Следующая популяция, сравниваемая с татарами Челябинской области и проживающая на этой территории,— башкиры Челябинской области. Башкиры являются более древней популя-

цией, происходящей и проживающей на территории Челябинской области с I тыс. до н. э. Татары и башкиры считаются тюркскими этническими группами, говорят на похожих языках на протяжении нескольких последних столетий, проживают на одних и тех же территориях. Сравнение иммуногенетического профиля татар и башкир, проживающих в Челябинской области, показывает более существенные отличия между этими двумя этническими группами, а именно: у татар достоверно выше частота А*03, существенно (однако недостоверно) повышение А*29, В*35, DR*11, 16 и достоверно снижены частоты А*02, 68, В*13, 48, 51 DR*12. Следует отметить, что частоты последних (А*02, 68, В*13, 48, 51 DR*12) являются характерными особенностями башкир и отличают их от многих европейских и даже азиатских популяций именно по этим признакам [2], придавая им иммуногенетическое своеобразие и отражая древнее происхождение и многовековую обособленность башкир от остальных народностей России. Частоты наиболее распространённых гаплотипов у татар и башкир также различны. У башкир это гаплотипы, включающие превалирующие в популяции В*13, 48, DR* 07, 12, в то время как у татар это гаплотип А*03-В*35-DR*01, характерный также для русских и для финно-угорских популяций и гаплотип А* 02-В*44-DR* 07.

В то же время у татар и башкир есть нечто общее, что позволило бы отличить эти тюркские этносы по иммуногенетическим показателям от славян и других европейских популяций: равные и относительно высокие частоты В*49, 50, 58 и достаточно высокие частоты генов В*13, DR*

07, также как и гаплотипа, из них состоящего.

Выводы и заключение. Итак, сравнение им-муногенетического профиля татар, проживающих в Челябинской области, с другими этническими группами региона показало их близость к русским, проживающим на той же территории, и большее отличие от другой неславянской популяции Челябинской области — башкир.

Список литературы

1. Орлов, А. М. Мещера, мещеряки, мишари. Казань : Татар. кн. изд-во, 1992. 112 с.

2. Суслова, Т. А. Распределение генов, гаплотипов НЬА в популяции башкир, проживающих в Челябинской области / Т. А. Суслова, А. Л. Бурмистрова, М. С. Чернова, М. Н. Вавилов, Е. Б. Хромова // Иммунология. 2011. № 2. С. 65.

3. Этнокультурная история населения Сафаку-левского района (с древнейших времён до начала ХХ века) : монография / под ред. Д. Н. Маслюжен-ко. Курган : Изд-во Курган. гос. ун-та, 2012. 102 с.

4. Downing, J. Five-Locus HLA Typing of Hematopoietic Stem Cell Donor Volunteers Using PCR Sequence Specific Primers / J. Downing, M. G. Gut-tridge, J. Thompson, C. Darke // Genetic Testing. 2004. Vol. 8, № 3. P. 301.

5. Suslova, T. A. HLA gene and haplotype frequencies in Bashkirs, Russians and Tatars, living in the Chelyabinsk region (Russian South Urals) / T. A. Suslova, A. L. Burmistrova, M. S. Chernova, E. B. Khromova, I. V. Devald, S. V. Timofeeva.

M. N. Vavilov, E. I. Lupar, C. Darke // Intern. J. of Immunogenetics. 2012. № 00. Р. 1-15

6. Всероссийская перепись населения 2002 года [Электронный ресурс] : итоги переписи. URL: http://www.perepis2002.ru

7. Arlequin ver 3.11 [Электронный ресурс] : An Integrated Software for Population Genetics Data Analysis. URL: http://cmpg.unibe.ch/software/ arlequin3

8. DoctorStat = Статистика для врачей [Электронный ресурс] : бесплат. компьютер. программа для проведения стат. расчётов в медицине. URL: http://doctorstat.narod.ru/index.html

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.