Научная статья на тему 'АНТИБАКТЕРИАЛЬНАЯ ТЕРАПИЯ И МИКРОБИОМ КИШЕЧНИКА У ПАЦИЕНТОВ ПОСЛЕ ТРАНСПЛАНТАЦИИ ГЕМОПОЭТИЧЕСКИХ СТВОЛОВЫХ КЛЕТОК КРОВИ'

АНТИБАКТЕРИАЛЬНАЯ ТЕРАПИЯ И МИКРОБИОМ КИШЕЧНИКА У ПАЦИЕНТОВ ПОСЛЕ ТРАНСПЛАНТАЦИИ ГЕМОПОЭТИЧЕСКИХ СТВОЛОВЫХ КЛЕТОК КРОВИ Текст научной статьи по специальности «Биотехнологии в медицине»

CC BY
37
7
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по биотехнологиям в медицине , автор научной работы — Усс М.А., Стома И.О., Губанова Т.Н., Ковалев А.А.

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Текст научной работы на тему «АНТИБАКТЕРИАЛЬНАЯ ТЕРАПИЯ И МИКРОБИОМ КИШЕЧНИКА У ПАЦИЕНТОВ ПОСЛЕ ТРАНСПЛАНТАЦИИ ГЕМОПОЭТИЧЕСКИХ СТВОЛОВЫХ КЛЕТОК КРОВИ»

ВЕСТНИК ГЕМАТОЛОГИИ, том XVIII, № 2, 2022

большинство побочных эффектов ОК на систему гемостаза, в основном, ответственны их эстрогенные компоненты.

Заключение. На основании представленных данных предлагается профилактическая гемореологическая терапия при

применении КОК у женщин с высоким тромбориском и иными относительными противопоказаниями к применению ОК, патогенетически обоснованная выявленными коагулологическими и гемореологическими сдвигами.

М.А. Усс1, И.О. Стома2, Т.Н. Губанова1, А.А. Ковалев2

АНТИБАКТЕРИАЛЬНАЯ ТЕРАПИЯ И МИКРОБИОМ КИШЕЧНИКА У ПАЦИЕНТОВ ПОСЛЕ ТРАНСПЛАНТАЦИИ ГЕМОПОЭТИЧЕСКИХ СТВОЛОВЫХ КЛЕТОК КРОВИ

1ГУ «Минский научно-практический центр хирургии, трансплантологии и гематологии», Республика Беларусь, Минск 2УО «Гомельский государственный медицинский университет», Республика Беларусь, Гомель

Введение. В желудочно-кишечном тракте (ЖКТ) человека проживают разнообразные микробные сообщества, состоящие в основном из бактерий, в значительной массе анаэробных представителей Firmicutes и Bacteroidetes, в меньшей степени Proteobacteria, Fusobacteria, Actinobacteria, а также грибов, ар-хеи и эукариоты с плотностью от 1013 до 1014 кл/г фекального материала, чей геном в сочетании с молекулами межклеточного взаимодействия и слизистыми оболочками, как локусом обитания, формирует кишечный микробиом человека. В процессе трансплантации костного мозга пациенты подвергаются воздействию мегадоз химиопрепаратов и/или ионизирующего излучения, а также других лекарственных средств, в том числе антибактериальных препаратов. Все это может вести к повреждению слизистого барьера кишечника и местного микробиома, что в свою очередь, может быть ассоциировано с неблагоприятными исходами у пациентов после трансплантации гемопо-этических стволовых клеток (ТГСК). Назначение антибактериальных препаратов считается наиболее значимым фактором повреждения микробиома кишечника, однако, по различным данным, степень влияния тех или иных групп антибактериальных препаратов различна.

Цель. Изучение влияния назначения различных групп антибактериальных препаратов на кишечный микробиом у пациентов после трансплантации ГСК.

Материалы и методы. В исследование включено 37 пациентов после выполнения трансплантации костного мозга, среди них 20 (54%) мужчин, 17 (46%) женщин. Средний возраст исследуемой группы составил 36 лет с медианой 36. Показанием к проведению ТГСК служили различные онкогематологические заболевания, основную массу 54% (n=20) составили пациенты с лейкозом. Аутологичная трансплантация была выполнена 32% (n=12) аллогенная ТГСК 68% (n=25). Коллекция образцов стула выполнялась трижды, обязательным условием было наличие образца, забранного перед трансплантацией, далее проводилась последовательная коллекция двух дополнительных образцов в посттрансплантационном периоде. В общей сложности было набрано 85 образцов биологического материала. Подготовка генных ампликонов рибосомальной РНК (рРНК) 16S для системы Illumina MiSeq» с использованием IDT for Illumina Nextera DNA UD Indexes и Ampliseq UD Indexes for Illumina со стратегией двойного индексирования. Секвенирование вариабельного гена 16S рРНК V3-V4 проводилось с использованием реагентов MiSeq Reagent Kit v3 (600 циклов). Обработка и анализ массива данных выполнялась с помощью программного кода, разработанного на языке программирования R. Анализ качества полученных файлов выполнялся в программе FASQC, удаление праймеров V3-V4 и обьединение прочтений в утилите

Preprocess 16. Обрезка некачественных прочтений осуществлялась при помощи инструмента Trimmomatic, назначение таксономии и формирование таблицы для дальнейшего анализа в программе Kraken 2. Тестирование различий значений доли таксонов выполнялось при помощи Т-критерия Вилкоксона с поправкой на множественные сравнения.

Результаты. Были изучены факторы, способствующие повреждению микробиома кишечника. Пол, возраст, характер основного заболевания не оказали значимого влияния на состав микробиома кишечника. Наиболее значимое влияние показало применение антибактериальных препаратов. Была проведена сравнительная оценка влияния цефалоспоринов, ванкомицина, линезолида и карбопенемов на состав микробиома кишечника у пациентов после ТГСК. Использование антибактериальных препаратов из групп цефалоспоринов и линезолида не вело к потере биоразнообразия микробиома кишечника либо развитию доминирования определенных таксонов. Назначение ванкоми-цина не вело к значительному снижению разнообразия микро-биома, однако способствует росту относительной плотности бактерий рода Enterococcus. (p<0.005). VRE бактеримия является значительной проблемой у иммунокомпрометированых пациентов в ряде европейских стран, однако, учитывая значительное доминирование грамотрицательных бактерий в спектре возбудителей центра (70%), доминирование Enterococcus не рассматривается как ключевая проблема и значимый фактор риска развития VRE в Республиканском центре гематологии и трансплантации костного мозга. Наиболее существенное влияние на состав микробиома кишечника оказывало использование антибиотиков из группы карбопенемов, а именно, наблюдалось значительное снижение плотности типа Bacteroidetes и класса Bacteroidia в образцах стула пациентов, получавших карбопенемы вплоть до практически полного замещения всех таксонов бактериями типа Firmicutes (p<0.005). Сниженная плотность Bacteroidetes на фоне применения карбопенемов наблюдалась как до, так и после отстройки кроветворения. Так же на фоне применения карбопенемов была зарегистрирована тенденция к росту плотности Enterococcus и Enterobacterales (p=0.055 и 0.04 соответственно).

Выводы. Влиянии различных антибактериальных препаратов на разнообразие и состав микробиома кишечника представляется неравноценным. Назначение карбопенемов оказывает наиболее выраженный негативный эффект на разнообразие и состав микробиома кишечника, в то же время, отрицательное воздействие от назначения группы цефалоспоринов и лине-золида был незначительным. В связи с этим, можно предположить, что применение линезолида у пациентов с нейтропенией при ТГСК является предпочтительнее ванкомицина.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.