CC BY
38
УДК 575.17
АНАЛИЗ ВКЛАДА СОЧЕТАНИЙ ГЕНОВ ФАКТОРОВ НЕКРОЗА ОПУХОЛИ И ИХ РЕЦЕПТОРОВ В ГЕНЕТИЧЕСКУЮ ПРЕДРАСПОЛОЖЕННОСТЬ К ХРОНИЧЕСКОМУ ЛИМФОЛЕЙКОЗУ
Белгородский
государственный
национальный
исследовательский
университет
Т.С. ТИКУНОВА
В статье изложены результаты изучения вклада комбинаций полиморфных вариантов генов фактора некроза опухоли а (-3080/А ТОТа), лимфотоксина а (+250Л/0 и а), рецептора фактора некроза опухоли 1-го типа (+36А/0 ТОТК!) и рецептора фактора некроза опухоли 2-го типа (+1663А/0 ТОТ^) в генетическую предрасположенность к хроническому лимфолейкозу.
e-mail: [email protected]
Ключевые слова: гены факторов некроза опухоли, хронический лимфолейкоз, генетическая предрасположенность к хроническому лимфолейкозу.
Хронический лимфолейкоз (ХЛЛ) представляет собой доброкачественную опухоль, ее субстрат составляют преимущественно морфологически зрелые лимфоциты [1]. Болезнь проявляется лимфатическим лейкоцитозом, диффузной лимфоцитарной пролиферацией в костном мозге, увеличением лимфатических узлов, селезенки и печени. Хронический лимфолейкоз является самым частым видом лейкоза у взрослых. Наиболее распространен в странах Европы и Северной Америки. В этих странах на его долю приходится около 30% от всех лейкозов, а ежегодная заболеваемость ХЛЛ составляет 3-3,5 на 100 000 населения, увеличиваясь до 20 на 100 000 для лиц старше 65 лет и до 50 на 100 000 после 70 лет [2, 3]. В настоящее время важное этиопатогене-тическое значение при хроническом лимфолейкозе придается нарушениям в системе апоптоза и пролиферации [4, 5]. Одно из центральных звеньев в этих процессах занимают полифункциональные цитокины- факторы некроза опухолей и их рецепторы [6, 7]. Обладая множеством медико-биологических эффектов (цитотоксическое, индукция апоптоза, стимуляция пролиферации лимфоцитов, влияние на гемопоэз, про-воспалительное действие и др., эти цитокины влияют на развитие и прогрессирование хронического лимфолейкоза [8, 9].
Цель работы - установить роль комбинаций генетических вариантов полиморфных маркеров фактора некроза опухоли a (-308G/A TNFa), лимфотоксина a (+250A/G Lt a), рецептора фактора некроза опухоли 1-го типа (+36A/G TNFR1), рецептора фактора некроза опухоли 2-го типа (+1663A/G TNFR2) в формировании подверженности к хроническому лимфолейкозу.
Анализ полиморфизмов генов факторов некроза опухоли проводили на материале двух выборок: 206 больных хроническим лимфолейкозом (114 мужчин и 92 женщины) и 307 человек популяционного контроля (162 мужчины и 145 женщин) в возрасте от 35 до 79 лет (p<0,05). Для исследования использовали ДНК, выделенную из венозной крови, взятой из локтевой вены пробанда. Анализ локусов осуществлялся методом детекции TaqMan зондов с помощью real-time ПЦР. Анализ ассоциаций сочетаний генетических вариантов с ХЛЛ проведен с помощью программного обеспечения APSampler (http://sources.redhat.com/cygwin/), использующего метод Монте-Карло марковскими цепями и байесовскую непараметрическую статистику [10].
В результате проведенного комплексного анализа носительства сочетаний аллелей и генотипов исследуемых локусов факторов некроза опухолей и их рецепторов (-308G/A TNFa, +250A/G Lt a, +36A/G TNFR1, +1663A/G TNFR2) выявлен целый ряд достоверных различий между больными и контролем (табл. 1).
Таблица 1
Распространенность сочетаний некоторых аллелей/генотипов генов TNFa, Ь1а, TNFR1 и TNFR2 у больных с хроническим лимфолейкозом
и в контрольной группе
Полиморфизмы Сочетание (аллели/гено типы) Обозначение сочетания Больные ХЛЛ Контроль Pcor (с учетом поправки Бонферрони) OR (95% CI)
n % n %
-308 G/A TNFa, +250 A/G Lta, +1663 A/G TNFR2 -308 00 ЮТа совместно с + 250 А иа и +1663 А ЮТК2 А 66 32,04 159 52,13 0,002 0,45 (0,31-0,65)
-308 G/A TNFa, +1663 A/G TNFR2 -308 00 ЮТа совместно с +1663 А ЮТК2 В 71 34,47 162 53,11 0,007 0,47 (0,330,69)
+250 A/G Lta, + 1663 A/G TNFR2, + 36 A/G TNFR1 + 250 А иа совместно с +1663 А ЮТК2 и +36 А ЮТК1 С 67 32,52 151 49,51 0,02 0,50 (0,35-0,72)
-308 G/A TNFa, + 250 A/G Lta, + 1663 A/G TNFR2 -308 0 ТОТа совместно с + 250 А иа и +1663 А ЮТК2 D 93 45,15 189 61,97 0,05 0,52 (0,36-0,75)
+1663 A/G TNFR2, + 36 a/G TNFR1 +1663 А ЮТК2 совместно с +36 А ЮТШ Е 74 35,92 158 51,80 0,05 0,53 (0,37-0,76)
+250 A/G Lta, + 1663 A/G TNFR2 + 250 А иа совместно с+1663 А ЮТК2 F 99 48,06 195 63,93 0,05 0,53 (0,37-0,76)
Следует отметить, что все представленные в таблице статистически значимые данные получены с использованием поправки Бонферрони, т.е. поправки, минимизирующей вероятность получения ложноположительных результатов. Обращает на себя внимание и тот факт, что все четыре рассмотренных генетических полиморфизма (-3080/А ТОТа, +250А/0 Ц а, +36А/0 ЮТЫ!, +1663А/0 ЮТК^) участвуют в формировании значимых комбинаций генетических вариантов, отличающих больных ХЛЛ от контрольной группы.
В первую очередь обращает на себя внимание высокодостоверная (рТОг=0,002) ассоциация сочетания генотипа -30800 ЮТа с аллелями +250А а и +1663А ЮТК2 (сочетание А) с формированием хронического лимфолейкоза. У больных ХЛЛ 32,04% имеют это сочетание генетических маркеров, тогда как в контрольной группе оно выявлено у 52,13%.
Данная комбинация полиморфных вариантов генов факторов некроза опухолей и их рецепторов является протективным фактором развития хронического лимфолейкоза, о чем свидетельствует величина ОЫ, равная 0,45 при 95% доверительном интервале 0,31-0,65. Сочетание В, которое наблюдается у 34,47% больных и 53,11% популяционного контроля, включает комбинацию двух генетических факторов: -30800 ЮТа и +1663А ЮТК2. Уровень статистической значимости различий в частотах комбинаций данных генетических маркеров между больными и контролем также достаточно высок (рЮг=0,007). Отношение шансов для сочетания В составляет 0,47 (95% С1 0,33-0,69).
Наряду с сочетаниями А и В протективную направленность имеет и сочетание С - отношение шансов для этой комбинации полиморфных вариантов равно 0,50 при 95% доверительном интервале 0,35-0,72 (р=0,02). Сочетание С встречается у 49,51% индивидуумов контрольной группы и лишь у 32,52% больных ХЛЛ.
На уровне статистической значимости рсоГ=о,05 (с учетом поправки Бонферро-ни) зарегистрированы различия в концентрациях сочетаний генетических факторов Б, Е и Б. Сочетание Б представленное комбинацией аллелей -3080 ТОТа, +250А Lt а и +1663А ТОТК^. Это сочетание встречается в популяционном контроле (61,97%) - в 1,37 раза чаще, чем среди больных ХЛЛ (45,15%). О протективном характере сочетания позволяет говорить отношение шансов, равное 0,52 (при 95% С1 0,36-0,75).
Также в контрольной группе значительно чаще (в 1,44 и 1,33 раза, соответственно) встречаются сочетания Е и Б по сравнению с больными ХЛЛ. Концентрации этих комбинаций генетических вариантов в популяционном контроле составляют 51,80% и 63,93% соответственно, тогда как среди больных данные показатели равны 35,92% и 48,06%, соответственно. Отношения шансов для этих сочетаний равно 0,53.
Таким образом, резюмируя полученные в работе данные, можно сделать вывод о значимом вкладе комбинаций полиморфных вариантов генов фактора некроза опухоли а (-3080/А ТОГа), лимфотоксина а (+250А/0 Lt а), рецептора фактора некроза опухоли 1-го типа (+36А/0 ТОТЕ!) и рецептора фактора некроза опухоли 2-го типа (+1663А/0 ЮТ^) в генетическую предрасположенность к хроническому лимфолейкозу. Различные сочетания низкопродуктивных генетических вариантов исследуемых полиморфизмов генов факторов некроза опухолей и их рецепторов встречаются в популяционном контроле в 1,3-1,6 раза чаще по сравнению с больными ХЛЛ и могут являться протективны-ми факторами развития хронического лимфолейкоза (ОЯ=0,45-0,53).
1. Федоров, А.Б. В-клеточный хронический лимфолейкоз / А.Б. Федоров // Клиническая онкогематология. Фундаментальные исследования и клиническая практика. - 2008. - Т. 1, № 3. - С. 275-277.
2. Никитин, Е.А. Хронический лимфолейкоз / Никитин Е.А. // Клиническая онкогемато-логия. Фундаментальные исследования и клиническая практика. - 2009. - Т. 2, № 1. - С. 87-91.
3. Волкова, М.А. Хронический лимфолейкоз - от рентгенотерапии до кэмпаса / М.А. Волкова // Клиническая онкогематология. Фундаментальные исследования и клиническая практика. - 2010. - Т. 3, № 2. - С. 209-210.
4. Hallek, M. Хронический лимфолейкоз / M. Hallek // Клиническая онкогематология. -2010. - Т. 3, № 1. - С. 101-102.
5. Damle, R.N. Chronic lymphocytic leukaemia: a disease of activated monoclonal B cells. / R.N. Damle, C. Calissano, N. Chiorazzi // Best Pract. Res. Clin. Haematol. - 2010. - Mar (№23). - Р. 33-45.
6. B-chronic lymphocytic leukemia cells exert an in vitro cytotoxicity mediated by tumor necrosis factor alpha / E. Rosati [et al.] // Leuk. Res. - 2005. -№ 29. - Р. 829-839.
7. Tumor necrosis factor alpha promoter polymorphism and the risk of chronic lymphocytic leukemia and myeloma in the Chinese population / W.Y. Au[et al.] // Leuk Lymphoma. - 2006. -Vol. 47. - P. 2189-2193.
8. Treatment with lenalidomide modulates T-cell immunophenotype and cytokine production in patients with chronic lymphocytic leukemia. / B.N. Lee [et al.] // Cancer. - 2011. - Sep (№17). -Р. 3999-4008.
9. TNF family molecules in the serum of patients with B-cell chronic lymphocytic leukemia (B-CLL) / E. Jablonska [et al.] // Leuk Lymphoma. - 2005. - № 46. - Р. 1307-1312.
10.A Gibbs sampler for identification of symmetrically structured, spaced DNA motifs with improved estimation of the signal length / Favorov, A.V. [et al.] // Bioinformatics. - 2005. - № 21. -P. 2240-2245.
Литература
ANALYSIS OF DEPOSIT COMBINATION OF GENES TUMOR NECROSIS FACTOR AND THEIR RECEPTORSIN GENETICALLY PREDISPOSED TO CHRONIC
LYMPHOCYTIC LEUKEMIA
Belgorod National Research University
T.S. TIKUNOVA
The article presents the results of the study the contribution of combinations of polymorphic variants of genes of tumor necrosis factor a (-308G / A TNFa), lymphotoxin a (+250 A / G Lt a), tumor necrosis factor receptor type 1 (+36 A / G TNFRl) and receptortumor necrosis factor type-2 (+1663 A / G TNFR2) in the genetic predisposition to chronic lymphocytic leukemia.
e-mail:
Key words: tumor necrosis factor genes, chronic lymphocytic leukemia, genetic predisposition to chronic lymphocytic leukemia.
