Научная статья на тему 'АНАЛИЗ ГЕНЕТИЧЕСКИХ АБЕРРАЦИЙ В ГЛИОМАХ ВЫСОКОЙ СТЕПЕНИ ЗЛОКАЧЕСТВЕННОСТИ У ДЕТЕЙ'

АНАЛИЗ ГЕНЕТИЧЕСКИХ АБЕРРАЦИЙ В ГЛИОМАХ ВЫСОКОЙ СТЕПЕНИ ЗЛОКАЧЕСТВЕННОСТИ У ДЕТЕЙ Текст научной статьи по специальности «Клиническая медицина»

CC BY
317
59
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
Ключевые слова
ГЛИОБЛАСТОМА / АНАПЛАСТИЧЕСКАЯ АСТРОЦИТОМА / АНАПЛАСТИЧЕСКАЯ ПЛЕОМОРФНАЯ КСАНТОАСТРОЦИТОМА / ДИФФУЗНАЯ СРЕДИННАЯ ГЛИОМА / H3 K28M / BRAF V600E / CDKN2A / 2B / ETV6-NTRK3 / LIOBLASTOMA / ANAPLASTIC ASTROCYTOMA / ANAPLASTIC PLEOMORPHIC XANTHOASTROCYTOMA / DIFFUSE MIDLINE GLIOMA

Аннотация научной статьи по клинической медицине, автор научной работы — Зайцева М. А., Шехтман А. П., Папуша Л. И., Валиахметова Э. Ф., Ясько Л. А.

Введение. Высокозлокачественные глиомы характеризуются широким спектром генетических аномалий. Различия в молекулярно-генетическом профиле позволяют выделить несколько основных подгрупп глиом высокой степени злокачественности у детей и подростков, которые различаются как по клиническому течению заболевания, его прогнозу, так и по ответу на стандартные схемы терапии.Цель исследования - оценить профиль молекулярно-генетических маркеров глиом высокой степени злокачественности у детей.Материалы и методы. В исследование были включены 53 образца глиом высокой степени злокачественности у детей. Были проанализированы мутации в генах H3F3A, Hist1H3B, BRAF, IDH1/2, а также аномалии числа копий генов CDKN2A/2B и экспрессия химерного гена ETV6-NTRK3.Результаты. В 24 (45 %) из 53 проанализированных случаев выявлена драйверная мутация в ткани опухоли, в 15 (28 %) - потеря копии CDKN2A / 2B, которая может выступать как второе мутационное событие. В общей сложности обнаружена 41 генетическая аберрация, из них 24 (58,5 %) составляют соматические миссенс-мутации, 1 (2,4 %) - вариант с неясным клиническим значением, 1 (2,4 %) - химерный онкоген и 15 (36,6 %) - делеции генов-онкосупрессоров.Заключение. Полученные данные свидетельствуют о важности углубленного изучения генетического профиля опухоли для определения тактики ведения пациентов, а также подбора персонализированной терапии для больных злокачественными глиомами.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по клинической медицине , автор научной работы — Зайцева М. А., Шехтман А. П., Папуша Л. И., Валиахметова Э. Ф., Ясько Л. А.

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

ANALYSIS OF GENETIC ABERRATIONS IN PEDIATRIC HIGH-GRADE GLIOMAS

Background. High-grade gliomas are characterized by a wide range of genetic abnormalities. The heterogeneous genomic landscape of pediatric high-grade gliomas allows identifying distinct subgroups of the disease in children and young adults. Most importantly, these subgroups differ by clinical course and prognosis, as well as treatment response to standard therapy.Objective: to assess the profile of molecular genetic markers of high-grade gliomas in children.Materials and methods. In the current study, we examine the frequency of H3F3A, Hist1H3B, BRAF, IDH1 / 2 mutations, the copy number alterations of CDKN2A / 2B genes and the expression of ETV6-NTRK3 fusion gene in a cohort of 53 pediatric high-grade gliomas.Results. Driver mutations and CDKN2A / 2B deletions were observed in 24 (45 %) and 15 (28 %) of 53 tumors, respectively. Overall, the studied high-grade gliomas harbored 41 genetic aberrations including 24 (58.5 %) somatic missense mutations, 1 (2.4 %) genetic variant of unknown clinical significance, 1 (2.4 %) oncogenic fusion gene and 15 (36.6 %) deletions of the tumor suppressor genes.Conclusion. These findings point to the importance of molecular profiling of tumors for the optimal clinical care and development of new approaches to treatment aimed at molecular targets for personalized anticancer therapies.

Текст научной работы на тему «АНАЛИЗ ГЕНЕТИЧЕСКИХ АБЕРРАЦИЙ В ГЛИОМАХ ВЫСОКОЙ СТЕПЕНИ ЗЛОКАЧЕСТВЕННОСТИ У ДЕТЕЙ»

Анализ генетических аберраций в глиомах «

высокой степени злокачественности у детей Г

со

М.А. Зайцева1, А.П. Шехтман1, Л.И. Папуша1, Э.Ф. Валиахметова1, 2, Л.А. Ясько1, А.Е. Друй1, 3 §

1ФГБУ«Национальный медицинский исследовательский центр детской гематологии, онкологии и иммунологии о

им. Дмитрия Рогачева» Минздрава России; Россия, 117997Москва, ГСП-7, ул. Саморы Машела, 1; 2

2ФГАУ«Национальный медицинский исследовательский центр нейрохирургии им. акад. Н.Н. Бурденко» Минздрава России; 0=

Россия, 125047Москва, ул. 4-я Тверская-Ямская, 16; 2

3ГАУЗ СО «Институт медицинских клеточных технологий»; Россия, 620026 Екатеринбург, ул. Карла Маркса, 22а ^а

ш

Контакты: Маргарита Алексеевна Зайцева [email protected] ^

Введение. Высокозлокачественные глиомы характеризуются широким спектром генетических аномалий. Различия в молекуляр-но-генетическом профиле позволяют выделить несколько основных подгрупп глиом высокой степени злокачественности у детей и подростков, которые различаются как по клиническому течению заболевания, его прогнозу, так и по ответу на стандартные схемы терапии.

Цель исследования — оценить профиль молекулярно-генетических маркеров глиом высокой степени злокачественности у детей. Материалы и методы. В исследование были включены 53 образца глиом высокой степени злокачественности у детей. Были проанализированы мутации в генах H3F3A, НШ1Н3В, ВВАВ, ШН1/2, а также аномалии числа копий генов CDKN2A/2B и экспрессия химерного гена ETV6-NTRK3.

Результаты. В 24 (45 %) из 53 проанализированных случаев выявлена драйверная мутация в ткани опухоли, в 15 (28 %) — потеря копии CDKN2A/2B, которая может выступать как второе мутационное событие. В общей сложности обнаружена 41 генетическая аберрация, из них 24 (58,5 %) составляют соматические миссенс-мутации, 1 (2,4 %) — вариант с неясным клиническим значением, 1 (2,4 %) — химерный онкоген и 15 (36,6 %) — делеции генов-онкосупрессоров.

Заключение. Полученные данные свидетельствуют о важности углубленного изучения генетического профиля опухоли для определения тактики ведения пациентов, а также подбора персонализированной терапии для больных злокачественными глиомами. Ключевые слова: глиобластома, анапластическая астроцитома, анапластическая плеоморфная ксантоастроцитома, диффузная срединная глиома, Н3 К28М, ВРАВ V600E, CDKN2A/2B, ЕТУ6-ШВК3

Для цитирования: Зайцева М.А.., Шехтман А.П., Папуша Л.И. и др. Анализ генетических аберраций в глиомах высокой степени злокачественности у детей. Успехи молекулярной онкологии 2020;7(3):37—47.

и ш u

DOI: 10.17650/2313-805X-2020-7-3-37-47 (ф

Analysis of genetic aberrations in pediatric high-grade gliomas

M.A. Zaytseva1, A.P. Shekhtman1, L.I. Papusha1, E.F. Valiakhmetova1,2, L.A. Yasko1, A.E. Druy1,3

'Dmitry Rogachev National Medical Research Center of Pediatric Hematology, Oncology and Immunology, Ministry of Health of Russia;

1 Samory Mashela St., GSP-7, Moscow ''7997, Russia; 2N.N. Burdenko National Medical Research Center for Neurosurgery, Ministry of Health of Russia; 16, 4th Tverskaya-Yamskaya St., Moscow 125047, Russia; 3Research Institute of Medical Cell Technologies; 22a Karla Marksa St., Yekaterinburg 620026, Russia

Background. High-grade gliomas are characterized by a wide range of genetic abnormalities. The heterogeneous genomic landscape of pediatric high-grade gliomas allows identifying distinct subgroups of the disease in children and young adults. Most importantly, these subgroups differ by clinical course and prognosis, as well as treatment response to standard therapy. Objective: to assess the profile of molecular genetic markers of high-grade gliomas in children.

Materials and methods. In the current study, we examine the frequency of H3F3A, Hist1H3B, BRAF, IDH1/2 mutations, the copy number alterations of CDKN2A/2B genes and the expression of ETV6-NTRK3 fusion gene in a cohort of 53pediatric high-grade gliomas. Results. Driver mutations and CDKN2A/2B deletions were observed in 24 (45 %) and 15 (28 %) of 53 tumors, respectively. Overall, the studied high-grade gliomas harbored 41 genetic aberrations including 24 (58.5 %) somatic missense mutations, 1 (2.4 %) genetic variant of unknown clinical significance, 1 (2.4 %) oncogenic fusion gene and 15 (36.6 %) deletions of the tumor suppressor genes. Conclusion. These findings point to the importance of molecular profiling of tumors for the optimal clinical care and development of new approaches to treatment aimed at molecular targets for personalized anticancer therapies.

Key words: glioblastoma, anaplastic astrocytoma, anaplastic pleomorphic xanthoastrocytoma, diffuse midline glioma, H3 K28M, BRAF V600E, CDKN2A/2B, ETV6-NTRK3

For citation: Zaytseva M.A., Shekhtman A.P., Papusha L.I. et al. Analysis of genetic aberrations in pediatric high-grade gliomas. Uspekhi molekulyarnoy onkologii = Advances in Molecular Oncology 2020;7(3):37—47. (In Russ.).

CV а CV

со

us

и ш u

ж ш

и

Введение

Глиомы — самые распространенные новообразования центральной нервной системы (ЦНС). Традиционно, основываясь на данных гистологического исследования с применением рутинной окраски гематоксилином и эозином и методов им-муногистохимии, глиомы подразделяют на 4 степени злокачественности (grade). В основе определения степени злокачественности лежат следующие гистологические критерии: клеточный и ядерный полиморфизм, фигуры митозов, эндотелиальная пролиферация и области некрозов опухолевой ткани. При наличии 2 и более критериев глиальные опухоли оцениваются как высокозлокачественные (ВЗГ). К ним относятся анапластическая астроцитома (АА), анапла-стическая плеоморфная ксантоастроцитома (АПКА), анапластическая олигодендроглиома, анапластиче-ская ганглиоглиома — степень злокачественности III по классификации Всемирной организации здравоохранения (ВОЗ) grade III. Некроз и/или пролиферация микрососудов (ангиогенез) являются характерными особенностями глиобластом (ГБ) — опухолей IV степени злокачественности (WHO grade IV) [1].

За последние 5 лет в диагностике опухолей ЦНС произошли кардинальные изменения благодаря совершенствованию методов молекулярной биологии. В обновленной классификации опухолей ЦНС ВОЗ 2016 г. (издание 4-е, пересмотренное) впервые был реализован междисциплинарный подход в диагностике, основанный на определении не только гистологических, но и в обязательном порядке молекулярно-гене-тических особенностей опухоли. Определение мутационного статуса генов IDH1, IDH2, а также коделеции 1p/19q стало необходимым для окончательной верификации гистологических вариантов глиом у взрослых пациентов, а определение мутации K28M в гене H3F3A стало обязательным для исключения диффузной срединной глиомы у детей, характеризующейся крайне агрессивным клиническим течением и неблагоприятным прогнозом [1]. Более того, после публикации классификации опухолей ЦНС ВОЗ 2016 г. была продемонстрирована диагностическая и прогностическая ценность многих других молекулярно-генетических аномалий, выявление которых в настоящее время активно применяется в рутинной практике и является неотъемлемым этапом окончательной постановки диагноза, а также определения тактики лечения пациентов с учетом генетического профиля опухоли [2—5].

Принимая во внимание, что глиальные опухоли характеризуются высокой гетерогенностью по своему клеточному составу, не вызывает сомнений, что выявление молекулярно-генетических маркеров позволит существенно улучшить качество дифференциальной диагностики фенотипически схожих гистологических вариантов глиом, а также позволит использовать идентифицированные генетические варианты в качестве прогностических биомаркеров и терапевтических мишеней.

Цель исследования — оценить профиль молекуляр-но-генетических маркеров ВЗГ у детей.

Материалы и методы

В ретроспективно-проспективное исследование были включены 53 пациента в возрасте от 4 мес до 21 года (медиана возраста 10 лет) с глиальными опухолями grade Ш—IV Клинический диагноз у всех пациентов был подтвержден результатами гистологического исследования в патологоанатомическом отделении Национального медицинского исследовательского центра детской гематологии, онкологии и иммунологии им. Дмитрия Рогачева в период с 2013 по 2020 г. Законные представители пациентов предоставили информированное согласие на использование результатов исследований в научных целях.

В общей структуре исследованного материала ВЗГ большую часть наблюдений составили гистологически верифицированные ГБ (n = 35; 66 %), среди них 8 (15 %) случаев — гигантоклеточные ГБ. Меньшее количество наблюдений составили АА (n = 9; 17 %) и АПКА (n = 7; 13 %). В 2 (4 %) случаях ввиду малого количества диагностически значимого материала гистологический вариант злокачественной глиомы не был дифференцирован.

В серии наших наблюдений ВЗГ имели преимущественно полушарное расположение (n = 27; 51 %), 1 из них с вовлечением подкорковых структур. Опухоли срединной локализации составили 22 (42 %) наблюдения, среди них 12 (23 %) — опухоли таламуса, 4 (7 %) — опухоли ствола головного мозга, 3 (6 %) — опухоли мозжечка и 3 (6 %) — опухоли спинного мозга. У 4 (7 %) пациентов данные о локализации опухоли неизвестны. Соотношение девочек и мальчиков составило 1:1,5 (21 и 32 пациента соответственно).

Молекулярно-генетическое исследование ткани опухоли включало определение наиболее характерных генетических аберраций для ВЗГ у детей: мутаций в генах H3F3A (COSM327928, COSM327929), Hist1H3B (C0SM829202), BRAF (COSM476), IDH1 (COSM28746, COSM28747), IDH2 (COSM33733) аномалий числа копий (делеций) генов CDKN2A/2B и экспрессии химерного гена ETV6-NTRK3 (COSF571) [6].

Материалом для молекулярно-генетического исследования послужили образцы опухолевой ткани, фиксированные в формалине и залитые в парафиновые блоки. Для выделения РНК и ДНК использовали коммерческий набор FFPE RNA/DNA Purification Plus (Norgen Biotek, Канада) в соответствии с инструкцией фирмы-производителя. Концентрацию выделенных РНК и ДНК оценивали с помощью спектрофотометра Nanodrop 2000 (Thermo Fisher Scientific, США).

Анализ мутаций в генах H3F3A и Hist1H3B проводили методом полимеразной цепной реакции (ПЦР) с последующим двусторонним секвенированием продуктов амплификации на генетическом анализаторе ABI 3500xl Genetic Analyzer (Applied Biosystems, США).

Полученные данные интерпретировали с использованием программного обеспечения Variant Reporter v2.0 (Applied Biosystems, США) и Sequencing Analysis v6.0 (Applied Biosystems, США). Для количественной оценки частоты мутантного аллеля H3 K28M проводили цифровую капельную ПЦР с применением системы QX200 Droplet Digital PCR (Bio-Rad, США). Анализ и интерпретацию результатов осуществляли с помощью программного обеспечения QuantaSoft Version 1.6.6.0320 (Bio-Rad, США).

Определение соматических мутаций в экзоне 4 IDH1 (R132C и R132H), экзоне 4 IDH2 (R172M и R172K), экзоне 15 BRAF (V600E), а также анализ числа копий генов CDKN2A/2B выполняли методом множественной лигазно-зависимой амплификации зондов (MLPA). Для пробоподготовки использовали набор реагентов SALSA MLPA probemix Р370-А1 BRAF-IDH1-IDH2 (MRC-Holland, Нидерланды). Количественный анализ результатов проводили с применением программного обеспечения Coffalyser.Net (MRC-Holland, Нидерланды). Все выявленные нуклео-тидные замены были подтверждены референтным методом — секвенированием по Сэнгеру.

Определение экспрессии химерного гена ETV6 (экзон 5) — NTRK3 (экзон 15) выполняли методом ПЦР с обратной транскрипцией с последующей верификацией ПЦР-продуктов секвенированием по Сэн-

геру. Для исключения ложноотрицательных результатов одновременно с выявлением химерного транскрипта проводилось определение экспрессии референсного гена ABL, что служило контролем сохранности выделенной РНК.

Статистическую обработку результатов исследований осуществляли с использованием программы XLStat. Различия качественных параметров между исследуемыми группами пациентов были проанализированы с помощью непараметрического критерия х2, количественных параметров — Манна—Уитни.

Результаты

Определение мутационного статуса гена H3F3A было выполнено всем 53 пациентам. При секвени-ровании по Сэнгеру экзона 2 гена H3F3A выявлены 2 патогенных генетических варианта: c.83A>T, p.(K28M) — у 15 (28 %) пациентов и c.103G>A, p.(G35R) - у 4 (8 %), а также вариант c.95C>A, p.(S32Y) с неясным клиническим значением — у 1 (2 %) пациента. В качестве ре-ференса использовали транскрипт ENST00000366815.9, версия генома GRCh38.p13. Количественную оценку частоты мутантного аллеля H3 K28M выполняли 14 пациентам, результаты представлены на рис. 1 и в таблице.

Пациентам с «диким» типом гена H3F3A и срединной локализацией опухоли (таламус, ствол головного

CV а CV

CS

и ш u

б

¡S.-8

У-ё

.о ^

А02

F02

C03

E02

6000 5000 4000 3000 2000 1000

0

и

уз £

I- а

и

о

ш 1 s с х § £ б X \

3000 2500 2000 1500 1000 500 0

^ и с х

го ф

10 000 20 000 30 000 40 000 50 000 Количество событий / Event number

ßl% 65% 34% 4%

А02

F02

C03

E02

." "• V.' ' " мяидд ЙРУСЙК

* ■ nt

1 Г—1 1

10 000 20 000 30 000 40 000 50 000 Количество событий / Event number

X ш

и

Рис. 1. Результаты оценки частоты мутантного аллеля H3 K28M: а — определение частоты мутантного аллеля H3 K28Mметодом цифровой капельной полимеразной цепной реакции. Канал 1 (FAM) — детекция мутантного аллеля, канал 2 (HEX) — детекция аллеля «дикого» типа. Розовой линией обозначен пороговый уровень интенсивности флуоресценции, выше которого капли расценивались как позитивные (HEX: 1500, FAM: 2000); б — секвенирование по Сэнгеру образцов с высокой (81 %) и низкой (4 %) частотой мутантного аллеля H3 K28M, стрелкой обозначена исследуемая нуклеотидная замена H3F3A:c.83A>T

Fig. 1. The results of assessing allele frequency of H3 K28M: а — the variant allele frequency of H3 K28M detection using digital droplet polymerase chain reaction assays. Channel 1 (FAM) - H3F3A K28M, channel 2 (HEX) - wild-type H3F3A. The pink line shows the threshold (HEX: 1500, FAM: 2000); б - Sanger sequencing in the cases with high (81 %) and low (4%) H3 K28Mvariant allele frequency, the arrow indicates the location of the nucleotide substitution H3F3A:c.83A>T

а

0

CV а CV

со

us

Клинико-морфологические особенности злокачественных глиом с мутацией H3 K28M Clinicopathologic features of high-grade gliomas with histone H3 K28M mutation

Возраст Номер пациента,

лет Пол Локализация опухоли

■вши!

и ш u

X ш

и

9

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

10 11 12

13

14

15

Age at onset, years

10

15

17

13

2

16

18

4 14

5 11 16 11

Мужской Male

Мужской Male

Мужской Male

Женский Female

Женский Female

Мужской Male

Мужской Male

Мужской Male

Женский Female

Мужской Male

Мужской Male

Мужской Male

Женский Female

Мужской Male

Женский Female

Ствол головного мозга и IV желудочек Brainstem and IV ventricle

Левый таламус Left thalamus

Теменно-затылочная область левого

полушария Parieto-occipital region of the left cerebral hemisphere

Правый боковой желудочек с распространением на область правого таламуса, правую ножку мозга и четверохолмие Right lateral ventricle with the extension to the right thalamus, right cerebral peduncle and corpora quadrigemina

Левое полушарие мозжечка Left cerebellar hemisphere

Левый таламус и ножки мозга слева Left thalamus and left cerebral peduncles

Правый таламус с распространением в ствол головного мозга Right thalamus with the extension to the brainstem

Правое полушарие с распространением в боковой и III желудочки, правый таламус и средний мозг Right hemisphere with the extension to the lateral and III ventricles, right thalamus and midbrain

Правый зрительный бугор и средний мозг Right thalamus and midbrain

Спинной мозг на уровне C4—C7 Spinal cord at C4-C7 level

Спинной мозг на уровне C4—Th3 Spinal cord at C4—Th3 level

Ствол головного мозга Brainstem

Левый таламус и ножки мозга слева Left thalamus and left cerebral peduncles

Правый таламус и ножки мозга справа Right thalamus and right cerebral peduncles

Левый таламус и средний мозг Left thalamus and midbrain

Частота мутант-ного аллеля H3 K28M, %

Variant allele frequency (VAF) of H3 K28M, %

Нет данных No data

53,2 4,0

56.2

55,6 33,9

80,9

64,4

50.3 64,6 35,3

45.0

56.1

44.2 44,8

Пролиферативная активность по Ki-67, %

Нет данных No data

60

15-20

20

20-30

10-15, фокально до 20 10-15, focally up to 20

15-20, фокально до 25-30 15-20, focally up to 25-30

30

30 15 20 30 20 40 15

1

2

3

4

7

9

8

7

мозга, спинной мозг) был проведен анализ мутаций в гене т*ПН3В (п = 9). Мутация т*ПН3В К28М не обнаружена ни в одном из исследуемых образцов ВЗГ.

Далее образцы были проанализированы на предмет более редких генетических аберраций. При исследовании методом MLPA у 1 пациента обнаружена

замена c.394C>T, p.(R132C) в гене IDH1, у 4 - мутация BRAF c.1799T>A, p.(V600E). Мутаций в гене IDH2 (R172M и R172K) в исследуемой когорте пациентов не выявлено. Делеция локуса 9р21.3, затрагивающая CDKN2A/2B, обнаружена в 15 (43 %) из 35 образцов: в 4 случаях - гомозиготная и в 11 случаях -

гетерозиготная. В 6 (40 %) из 15 образцов ген MIR31, расположенный в регионе 9p13, также был вовлечен в делецию.

Определение химерного транскрипта ETV6-NTRK3 было выполнено пациентам в возрасте 0—7 лет (n = 14). Экспрессия химерного гена в ткани опухоли обнаружена только у 1 пациентки. На рис. 2 представлена электрофореграмма продуктов амплификации детектируемого химерного транскрипта ETV6-NTRK3 и фрагмента гена ABL, а также результат верификации выявленного транскрипта путем секвенирования по Сэнгеру.

На рис. 3 показаны обнаруженные генетические аберрации в когорте пациентов с ВЗГ.

Обсуждение

При интерпретации результатов секвенирования гена H3F3A могут возникать трудности, поскольку в зависимости от используемой номенклатуры можно встретить разные обозначения мутаций: H3 K27M и H3 G34R/V или H3 K28M и H3 G35R/V. Данные

разногласия связаны с устоявшейся номенклатурой сайтов модификации гистонов в контексте эпигенетической регуляции экспрессии генов. Однако при уточнении первичной структуры гистонов было обнаружено, что после трансляции полипептидная цепь H3, как и многие другие полипептиды, подвергается посттрансляционной модификации (процессингу) для приобретения функциональной активности — отщеплению N-концевого остатка метионина. Поскольку в составляющих нуклеосомную глобулу молекулах гистонов отсутствует метионин, то в общеизвестной номенклатуре гистонов при нумерации аминокислот не учитывается удаленный аминокислотный остаток метионина. Несмотря на то что в научной литературе чаще встречаются обозначения генетических вариантов H3F3A по общепринятой номенклатуре гистонов, в данном исследовании все варианты нуклеотидной последовательности H3F3A названы в соответствии с номенклатурой, принятой HGVS (Human Genome Variation Society; http//www.hgvs.org), во избежание ошибочной интерпретации сообщаемых данных

cv a cv

CS

и ш u

X ш

и

а

б

ETV6 (экзон 5) / ETV6 (exon 5) Я NTRK3 (exon 15)

III ill 1 0 С 0 ■ J L I . I 1 t 1 1 1 ( 1 l l 111 с <3 С С С Г. Id 1 1 dl. 1 J

VYYAA a шАДАД ■ a A- /

Рис. 2. Результат определения химерного транскрипта ETV6-NTRK3: а — электрофореграмма продуктов амплификаци (М — маркер молекулярной массы; 1, 2 — фрагмент химерного транскрипта ETV6-NTRK3 (188 пар оснований); 3, 4 — фрагмент референсного гена ABL; 5, 6 — отрицательный контроль реакции); б — фрагмент хроматограммы ETV6 (экзон 5) — NTRK3 (экзон 15) с указанием точки разрыва. В качестве рефе-ренсных транскриптов для генов ETV6и NTRK3 использованы ENST00000396373.9 и ENST00000360948.6соответственно, версия генома GRCh38.p13 Fig. 2. Results of the fusion transcript ETV6-NTRK3 detection: а — gel electropherogram of RT-PCR products (M — DNA Ladder; 1, 2 —fragment of ETV6-NTRK3 fusion transcript (188 base pairs); 3, 4 — fragment of ABL housekeeping gene transcript; 5, 6 — negative amplification control); б — sequence chromatogram of ETV6 (exon 5) — NTRK3 (exon 15) fusion transcript, with the arrow indicating the fusion breakpoint. ENST00000396373.9 and ENST00000360948.6transcripts were used as reference sequences for ETV6 and NTRK3 genes respectively, genome build GRCh38.p13

CV а CV

со

us

и ш u

X ш

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

и

ETV6-NTRK3 CDKN2A/2B IDH1 R132C BRAF V600E Hist1H3B K28M H3F3A G35R H3F3A K28M Локализация / Location Диагноз / Diagnosis Пол / Gender

Пол / Gender

Женский / Female Мужской / Male

Гистологический диагноз / Histological diagnosis

Глиобластома / Glioblastoma Гигантоклеточная глиобластома / Giant cell glioblastoma Анапластическая плеоморфная ксантоастроцитома / Anaplastic pleomorphic xanthoastrocytoma Анапластическая астроцитома / Anaplastic astrocytoma Астроцитома высокой степени злокачественности, неуточненный вариант / High grade astrocytoma, unspecified

Локализация опухоли / Tumor location Полушарная / Hemispheric Срединная / Median Нет данных / No data available

H3F3A K28M

Не обнаружено / Negative Обнаружено / Positive

H3F3A G35R

Не обнаружено / Negative Обнаружено / Positive

Hist1H3B K28M

Не обнаружено / Negative Нет данных / No data available

BRAF V600E

Не обнаружено / Negative Обнаружено / Positive

IDH1 R132C

Не обнаружено / Negative Обнаружено / Positive

Аномалии числа копий CDKN2A/2B /

CDKN2A/2B copy number variation Не обнаружено / Negative Гетерозиготная делеция CDKN2A/2B/MIR31 / Hetero del CDKN2A/2B/MIR31 Гомозиготная делеция CDKN2A/2B / Homo del CDKN2A/2B Гетерозиготная делеция CDKN2A/2B / Hetero del CDKN2A/2B

Гомозиготная делеция CDKN2A/2B/MIR31 / Homo del CDKN2A/2B/MIR31 Нет данных / No data available

ETV6-NTRK3

Не обнаружено / Negative Обнаружено / Positive Нет данных / No data available

Рис. 3. Графическое представление клинических данных и генетических аберраций в исследуемой когорте пациентов с высокозлокачественными глиомами

Fig. 3. Graphical representation of the clinical data and of the genetic alterations observed in the cohort ofpediatric high-grade gliomas

и диагностических неточностей. Тем не менее стоит иметь в виду, что обозначения H3F3A: с.83А>Т, р.(К28М) и H3F3A: c.103G>A, p.(G35R) эквивалентны общеизвестным Н3 К27М и Н3 G34R [7].

В данном исследовании было проанализировано 53 образца ВЗГ у детей. В 24 (45 %) из них выявлена драйверная мутация в ткани опухоли. Все выявленные мутации были взаимоисключающими — сочетаний мутаций в генах H3F3A, ЮН1/2, ВВАТне обнаружено. В соответствии с наличием или отсутствием драйвер-ных мутаций в выбранных генах-кандидатах и экспрессии химерного гена Е7У6^7ВК3 все глиомы у детей и подростков можно разделить на 6 основных подгрупп: Н3 К28-мутантный тип, Н3 G35-мутантный тип, ЮН1/2-мутантный тип, ВВАТ-мутантный тип, с наличием перестроек N7RK и Н3/ВВАТ/ШН-«дикий» тип. Наиболее распространенными соматическими мутациями в ВЗГ у детей оказались мутации в гене Н3Т3А.

В серии наших наблюдений мутации Н3Т3А были обнаружены в 19 (36 %) из 53 образцов: вариант К28М выявлен в 15 (28 %) случаях, вариант G35R — в 4 (8 %), вариант G35V не обнаружен. Из 15 глиом с Н3 К28М в 8 (53 %) случаях был выставлен гистологический диагноз ГБ, в 1 (7 %) — гигантоклеточная ГБ, в 4 (27 %) — АА, в 2 (13 %) случаях гистологический вариант ВЗГ не был дифференциально диагностирован. Мутация Н3 К28М обнаружена в глиомах средней линии

в 13 (59 %) из 22 образцов: 8 (67 %) из 12 глиом тала-муса, 2 (50 %) из 4 глиом ствола головного мозга, 2 (67 %) из 3 глиом спинного мозга, а также 1 (33 %) из 3 глиом мозжечка. В 1 случае опухоль имела диффузное распространение из правого полушария головного мозга в боковой и III желудочек, правый таламус, средний мозг. В классификации опухолей ЦНС ВОЗ 2016 г. для обозначения подобных опухолей введена новая нозологическая единица «диффузная срединная глиома с мутацией Н3 К28М, WHO grade IV» [1].

Однако у 1 пациента с полушарной гигантоклеточ-ной ГБ также выявлена мутация H3F3A K28M. Стоит отметить, что в данном случае частота мутантного ал-леля составила 4 %, т. е. соответствовала субклональ-ной. Данный факт указывает на внутриопухолевую гетерогенность и ставит под сомнение драйверный характер замены H3 K28M и ее прогностическое значение. На момент сбора катамнестических данных пациент закончил локальную лучевую терапию с параллельной химиотерапией темозоломидом и вальпро-евой кислотой по протоколу HIT HGG 2007 и жив без признаков прогрессирования заболевания спустя 20 мес от постановки диагноза.

У пациента 4 лет с АА спинного мозга в гене H3F3A были обнаружены 2 генетических варианта: 1) патогенный вариант c.83A>T, p.(K28M) с частотой мутантного аллеля 64,6 %; 2) гетерозиготная однонуклеотидная замена c.95C>A в экзоне 2 с частотой альтернативного

аллеля ~65 %, приводящая к замене аминокислоты p.(S32Y). Вариант H3 S32Y не зарегистрирован в базе данных аллельных вариантов человека The Genome Aggregation Database (gnomAD) и базе данных Catalogue of Somatic Mutations in Cancer (COSMIC). Для оценки возможного влияния замены аминокислоты на структуру и функцию белка были применены компьютерные (in silico) программы предсказаний пато-генности. По данным предсказательных ресурсов MutationTaster, Mutation assessor, SIFT и PROVEAN, замена считается патогенной. Более того, найденный генетический вариант располагается в высококонсервативном участке ДНК, а аминокислота в позиции 32 является уникальным сайтом фосфорилирования ги-стона H3.3, отличающим его от других вариантов ги-стона H3, что также свидетельствует в пользу его па-тогенности. В исследовании F. N. Grigore и соавт. показано, что замены K28M, S32E, G35R/V инициируют онкогенез через хромосомную нестабильность, обусловленную нарушением регуляции клеточного цикла и приводящую к анеуплоидии. На клеточной линии диффузной срединной глиомы авторы продемонстрировали, что аномальная сегрегация хромосом обусловлена снижением метилирования лизина H3K28 и влечет за собой нарушение фосфорилирования серина H3S32. В то же время клеточные линии с сочетанными мутациями (K28M/S32E или G35R/ S32E) проходят контрольные точки клеточного цикла и завершают цикл деления без каких-либо нарушений. Таким образом, нуклеотидная замена в сайте фосфорилирования может нивелировать потерю метилирования H3K28 и восстанавливать эпигенетическую регуляцию активности генов, ответственных за прохождение клетки по тому или иному периоду клеточного цикла [8]. Спустя год от постановки диагноза описываемый пациент жив и продолжает терапию.

По последним данным, срединные глиомы с ал-лельной нагрузкой H3 K28M, превышающей 50 %, характеризуются наиболее агрессивным фенотипом [9]. Наличие соматического генетического варианта с частотой мутантного аллеля >50 % обусловлено ал-лельным дисбалансом области расположения гена H3F3A (локус 1q42.12). В исследовании S. Maeda и со-авт. в 27 % диффузных срединных глиом аллельная нагрузка H3 K28M превышала 50 %, что было связано с увеличением числа копий мутантного аллеля, потерей интактного аллеля и потерей гетерозиготности 1q. Наличие аллельного дисбаланса локуса 1q42.12 было ассоциировано с высоким индексом пролиферации Ki-67, а также с низкими показателями выживаемости пациентов (p <0,05) [9]. Таким образом, принципиально важно определять не только наличие мутации H3 K28M, но и оценивать частоту альтернативного аллеля.

Мы провели количественную оценку частоты мутантного аллеля H3 K28M в опухолевой ДНК, в 8 (57 %) из 14 случаев она превышала 50 % (см. таблицу). При сравнении пролиферативной активности опухолевых

клеток в группах пациентов с частотой мутантного аллеля H3 K28M >50 и <50 % статистически значимых различий не получено (p >0,05).

Мутация G35R в гене H3F3A выявлена в 4 (15 %) из 26 полушарных ВЗГ, а именно в ГБ лобной доли, ГБ височной доли и в 2 ГБ с сочетанным поражением долей (лобно-теменной и теменно-височно-затылочной).

Полученные нами данные о преобладании мутаций H3F3A в ВЗГ у детей соответствуют результатам ранее опубликованных исследований. D.A. Solomon и соавт., проведя иммуногистохимическое исследование, выявили наличие H3 K28M в 17 (94 %) из 18 диффузных глиом ствола, в 15 (65 %) из 23 глиом зрительного бугра и в 9 (53 %) из 17 глиом спинного мозга [10]. По данным A. Johnson и соавт., в серии из 90 ГБ аберрации H3F3A наблюдались в 43 (48 %) случаях, из них H3 K28M - в 35 (81 %), H3 G35R - в 8 (19 %) [2]. Кроме того, в исследованиях, посвященных изучению молекулярно-генетического профиля ВЗГ, подчеркивается, что для замен K28M и G35R/V характерна корреляция с локализацией опухоли [2, 3]. В глиомах срединных структур выявляется мутация H3 K28M, в глиомах полушарной локализации — H3 G35R/V. Данная особенность подтверждена и в серии наших наблюдений.

Аберрантная активация сигнального пути MAPK/ ERK является наиболее частым событием в патогенезе глиом низкой степени злокачественности. Тем не менее в 5—10 % ВЗГ, преимущественно АПКА и эпи-телиоидных ГБ, также встречается активирующая мутация BRAF V600E [2]. Среди исследуемых нами пациентов с ВЗГ данная мутация обнаружена только у пациентов с АПКА, а именно в 4 (57 %) из 7 проанализированных случаев.

Отличительная особенность генетического профиля АПКА — аберрантная активация генов семейства RAF (BRAF, RAF1) в сочетании с биаллельной инактивацией гена-супрессора опухолевого роста CDKN2A. По данным J.J. Phillips и соавт., с частотой до 90 % в АПКА наблюдаются мутации в гене BRAF, безусловно, наиболее распространенная из них BRAF V600E [11]. Описан случай АПКА с редким генетическим вариантом — BRAF p.(485_490del), также приводящим к конститутивной активации сигнального пути MAPK/ERK. Помимо точечных мутаций BRAF в геноме АПКА могут присутствовать структурные перестройки, приводящие к образованию химерных генов NRF1-BRAF и ATG7-RAF1 [11, 12]. Данные генетические аберрации являются идеальной мишенью для тар-гетной терапии пациентов с ВЗГ [5, 13].

По данным R.A. Vaubel и соавт., гомозиготная де-леция CDKN2A/2B наблюдается в 93 % случаев АПКА. Согласно приведенным данным потеря CDKN2A/2B выявлялась в сочетании с другими аберрациями хромосомы 9 — с утратой всей хромосомы, делециями короткого плеча, а также с потерей гетерозиготно-сти 9p, не сопровождающейся изменениями числа

CV а CV

CS

и ш u

ж ш

и

CV а CV

со

us

и ш u

X ш

U

копий [12]. Значительно реже в АПКА наблюдается гетерозиготная делеция CDKN2A, однако при проведении иммуногистохимического окрашивания с антителом к белковому продукту CDKN2A (p16INK4a) выявляется полная утрата экспрессии маркера, что указывает на биаллельную инактивацию гена альтернативным механизмом (например, за счет гиперметилирования промоторной области) [11]. В исследуемой нами когорте в 4 (57 %) из 7 АПКА наблюдалась гетерозиготная делеция CDKN2A, в 1 (14 %) из 7 — гомозиготная, в 3 образцах она сочеталась с мутацией BRAF V600E.

С высокой частотой делеция CDKN2A встречается и при других гистологических вариантах ВЗГ у детей. L. Frazäo и соавт. выявили делецию CDKN2A/2B в 6 (35,3 %) из 17 ВЗГ разных гистологических вариантов (ГБ, АА и других более редких нозологических форм): в 4 случаях — гомозиготную и в 2 — гетерозиготную. Наличие делеции было ассоциировано с худшей общей и бессобытийной выживаемостью пациентов [14]. A Johnson и соавт. выявили делеции CDKN2A и CDKN2B соответственно в 18 (20 %) и 14 (16 %) из 90 ГБ у детей [2]. В исследуемой нами группе пациентов делеция CDKN2A/2B обнаружена в 15 из 35 (43 %) образцов: в 4 случаях — гомозиготная и в 11 — гетерозиготная. При этом в 2 образцах ГБ она сочеталась с мутацией H3F3A G35R. В 6 (40 %) из 15 наблюдений ген MIR31, расположенный в регионе 9p13, также был вовлечен в делецию. По данным R. Rajbhandari и соавт., экспрессия miR-31 снижена в >70 % ГБ и ассоциирована с худшими показателями общей выживаемости независимо от количества копий CDKN2A/2B [15].

Наиболее изученными прогностическими маркерами глиом у взрослых являются мутации в генах IDH1 и IDH2. С частотой до 80 % в астроцитомах, олигоден-дроглиомах и вторичных ГБ обнаруживается мутация в кодоне 132 гена IDH1. Однако в ВЗГ у детей мутации IDH1 и IDH2 наблюдаются в редких случаях. В исследовании Детской онкологической группы США (Children's Oncology Group, COG) частота встречаемости мутаций IDH1 в ВЗГ у детей составила 16 %, при этом чаще наблюдалась замена R132H, реже — R132S и R132C. Согласно приведенным данным мутации IDH1 чаще встречались у детей с АА, чем с ГБ (26 и 8 % соответственно). Все мутации IDH1 были обнаружены у детей старше 14 лет, в то время как в младшей возрастной группе данных мутаций не выявлено. Наличие мутации IDH1 имело благоприятное влияние на 1-годичную безрецидивную выживаемость и общую годовую выживаемость [16]. A. М. Buccoliero и соавт., исследовав серию из 42 глиом различных гистологических типов и степеней злокачественности у детей, не обнаружили мутаций IDH1 [17]. В исследовании M. Antonelli и соавт. в когорте из 27 ВЗГ мутаций гена IDH1 также не выявлено [18]. Вероятно, полученные данные связаны с малым возрастом детей в исследуемых группах (медиана возраста 6 и 9 лет соответственно).

В исследуемой нами когорте пациентов замена c.394C>T, p.(R132C) в гене IDH1 обнаружена только у 1 пациента 17 лет с гистологически верифицированной АА лобной доли. Полученный результат подтверждает низкую частоту встречаемости мутаций IDH1 в глиомах у детей, а также данные о старшем подростковом возрасте пациентов c ВЗГ, имеющих мутацию IDH1 [16-18].

A.S. Guerreiro Stucklin и соавт. представили данные о парадоксальном клиническом поведении глиом у младенцев до 1 года в сравнении с детьми старшего возраста: наибольшая выживаемость была отмечена в группе пациентов с ВЗГ, в то время как пациенты с глиомами низкой степени злокачественности имели более высокий уровень смертности. Причины таких отличий в течении заболевания свидетельствуют об уникальной биологии глиом у младенцев. В 83 % полушарных ВЗГ были обнаружены транслокации ALK, ROS1, NTRK1/2/3, MET. В 2 из 7 NTRK-положи-тельных ВЗГ наблюдалось посттерапевтическое созревание опухоли в более дифференцированный вариант [19].

Среди больных, включенных в исследуемую нами группу, была пациентка с полушарной ВЗГ в возрасте 4 мес на момент постановки диагноза. Ткань опухоли имела гистологическое строение ВЗГ и в большей степени соответствовала ГБ. Ввиду отсутствия специфической гистологической картины дифференциальная диагностика проводилась с АПКА и анапластическим вариантом пилоцитарной астроцитомы. После проведения 4 блоков химиотерапии в составе комбинации винкристина с циклофосфаном (блоки 1, 3) и этопо-зида с карбоплатином (блоки 2, 4) была выполнена повторная резекция опухоли. При гистологическом исследовании материала от повторной операции и его сопоставлении с инициальным материалом было подтверждено идентичное морфологическое строение опухоли (рис. 4).

При проведении молекулярно-генетического исследования был выявлен химерный транскрипт ETV6 (экзон 5) — NTRK3 (экзон 15). Данный вариант транскрипта обнаруживают у подавляющего большинства пациентов с инфантильной фибросаркомой и мезо-бластной нефромой клеточного типа, у пациентов с ВЗГ он встречается значительно реже. Стоит отметить, что в зависимости от локализации точки разрыва могут возникать различные типы химерного гена ETV6-NTRK3. Вариант химерного транскрипта ETV6 (экзон 4) — NTRK3 (экзон 14) у детей с ВЗГ встречается заметно чаще [3, 4, 19].

С учетом того, что опухоли в детском возрасте отличаются малым совокупным количеством мутаций, в том числе являющихся мишенями для таргетной терапии, обнаружение подгруппы ВЗГ с перестройками генов, кодирующих протеинкиназы, открывает перспективы для использования соответствующих ингибиторов. Управление по санитарному надзору за качеством

а

а Ш

:

. ■ штт

щ: .с

г .

-^тшттшшм Шшщш ■ штш

'-■ - ._ Я L ' J ■ V Г -1 . ' ■ " ■ Ч." -. ■ ' . J ■ ' 1 . ■ ■ 4

Рис. 4. Гистологическая картина инфантильной глиобластомы с наличием химерного гена ETV6-NTRK3: а — ткань опухоли с компактным расположением клеточных элементов. Клетки опухоли с умеренно выраженным клеточным полиморфизмом, местами формируют потоковые структуры (окраска гематоксилином и эозином, х 100); б — клетки опухоли с умеренно выраженным ядерным полиморфизмом. Определяются фигуры митоза и пролиферация эндотелия сосудов (окраска гематоксилином и эозином, х 400); в — клетки опухоли экспрессируют GFAP (GFAP, х 100); г — пролиферативная активность по уровню экспрессии Ki-67 — 10 % (Ki-67, х200)

Fig. 4. Histopathologic analysis of infant glioblastoma harboring ETV6-NTRK3fusion gene: а — tumor tissue with compact arrangement of cellular elements. Slightly polymorphic cells form stream-like structures (H&E, х 100); б — tumor cells demonstrate moderate nuclear pleomorphism. Mitotic figures and vascular endothelial proliferation are present (H&E, х400); в — immunohistochemical stains showing tumor cell immunoreactivity for glial fibrillary acidic protein (GFAP, х100); г — approximate cell proliferative index 10 % (Ki-67, х200)

cv a cv

CS

и ш u

ж ш

и

пищевых продуктов и медикаментов США (FDA) одобрило применение энтректиниба (entrectinib) — селективного ингибитора рецепторных тирозинкиназ Trk A/B/C, ROS1, ALK — для лечения взрослых и детей c неоперабельными или метастатическими солидными опухолями с перестройкой генов NTRK1/2/3, ROS1 и ALK вне зависимости от гистологического диагноза и локализации опухоли. Эффективность применения энтректиниба у детей была продемонстрирована в I/II фазе исследования STARTRK-NG (NCT02650401). Одним из преимуществ данного таргетного препарата является его способность проникать через гематоэнце-фалический барьер, благодаря чему были показаны исключительно высокие результаты противоопухолевой активности у пациентов с ВЗГ (n = 8) с транслокацией генов NTRK1/2/3 и ROS1: 4 полных ответа (ETV6-NTRK3, EML1-NTRK2, GOPC-ROS1, TPR-NTRK1) и 2 частичных ответа (KANK1-NTRK2, EEF1G-ROS1). У 2 пациентов наблюдался продолженный рост опухоли (EML4-ALKи PARP6-NTRK3) [20]. Обнаружение экспрессии химерного гена ETV6-NTRK3 в ткани

опухоли описываемой больной позволяет рассматривать ингибиторы NTRK как потенциально эффективную терапевтическую опцию.

Заключение

Представленные данные подчеркивают важность углубленного изучения молекулярной биологии ВЗГ. Идентификация патогенетически значимых молекулярных маркеров имеет важное практическое значение для определения тактики ведения пациентов и поиска новых терапевтических возможностей, в том числе мо-лекулярно-направленной (таргетной) терапии, в случаях опухолей, устойчивых к стандартным схемам лечения.

На основании полученных нами данных можно выработать диагностический алгоритм поиска генетических аберраций в ВЗГ у детей. На первом этапе целесообразно проводить поиск драйверных мутаций в «горячих точках» H3F3A: К28М — для опухолей срединной локализации и G35R/V — полушарной локализации. Далее, при отрицательном результате, необходим поиск более редких генетических аберраций.

CV а CV

со

us

Для пациентов с «диким» типом гена Н3Т3А и срединной локализацией опухоли рекомендовано исследование ткани опухоли на наличие мутации К28М в гене Hist1H3B, в случае полушарной локализации — ВВАТ

V600E. Пациентам с ВЗГ старше 14 лет целесообразно проводить поиск мутаций в генах IDH1/2, детям младше 1 года — химерных онкогенов с вовлечением NTRK1/2/3, MET, ROS1 и ALK.

ЛИТЕРАТУРА/REFERENCES

и ш u

X ш

и

1. Louis D.N., Perry A., Reifenberger G.

et al. The 2016 World Health Organization classification of tumors of the Central Nervous System: a summary. Acta Neuropathol 2016;131:803-20. DOI: 10.2176/nmc.ra.2017-0010.

2. Johnson A., Severson E., Gay L. et al. Comprehensive genomic profiling of 282 pediatric low- and high-grade gliomas reveals genomic drivers, tumor mutational burden, and hypermutation signatures. Oncologist 2017;22(12):1478—90.

DOI: 10.1634/theoncologist.2017-0242.

3. Зайцева М.А., Ясько ЛА., Папуша Л.И., Друй А.Е. Молекулярно-генетические характеристики глиом у детей. Вопросы гематологии/онкологии и иммунопатологии в педиатрии 2019;18(4):109—17. [Zaytseva M.A., Yasko L.A., Papusha L.I., Druy A.E. Molecular genetic features

of pediatric gliomas. Voprosy gematologii/ onkologii i immunopatologii v pediatrii = Pediatric Hematology/Oncology and Immunopathology 2019;18(4):109—17. (In Russ.)]. DOI: 10.24287/1726-17082019-18-4-109-117.

4. Gambella A., Senetta R., Collemi G. et al. NTRK fusions in central nervous system tumors: a rare, but worthy target.

Int J Mol Sci 2020;21(3):753. DOI: 10.3390/ijms21030753.

5. Toll S.A., Tran H.N., Cotter J. et al. Sustained response of three pediatric BRAFV600E mutated high-grade gliomas to combined BRAF and MEK inhibitor therapy. Oncotarget 2019;10(4):551—7. DOI: 10.18632/oncotarget.26560.

6. Catalogue of somatic mutations in cancer. Available at: https://cancer.sanger.ac.uk/ cosmic.

7. Leske H., Rushing E., Budka H. et al. K27/G34 versus K28/G35 in histone

H3-mutant gliomas: a note of caution. Acta Neuropathology 2018;136(1):175—6. DOI: 10.1007/s00401-018-1867-2.

8. Grigore F.N., Day C., Yang H. et al. Histone H3.3 mutations drive tumori-genesis through chromosomal instability. Neurooncology 2019;21(Suppl_2):ii84. DOI: 10.1093/neuonc/noz036.086.

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

9. Maeda S., Ohka F., Okuno Y. et al. H3F3A mutant allele specific imbalance in an aggressive subtype of diffuse midline glioma, H3 K27M-mutant. Acta Neuropathol Commun 2020;8(1):8. D0I:10.1186/s40478-020-0882-4.

10. Solomon D.A., Wood M.D., Tihan T. et al. Diffuse midline gliomas with histone H3 K27M mutation: a series of 47 cases assessing the spectrum of morphologic variation and associated genetic alterations.

Brain Pathol 2016;26(5):569—80. DOI: 10.1111/bpa.12336.

11. Phillips J.J., Gong H., Chen K. et al. The genetic landscape of anaplastic pleomorphic xanthoastrocytoma. Brain Pathol 2019;29(1):85—96. DOI: 10.1111/bpa.12639.

12. Vaubel R.A., Caron A.A., Yamada S. et al. Recurrent copy number alterations in low-grade and anaplastic pleomorphic xanthoastrocytoma with and without BRAF V600E mutation. Brain Pathol 2018;28(2): 172-82. DOI: 10.1111/bpa.12495.

13. Touat M., Younan N., Euskirchen P. et al. Successful targeting of an ATG7-RAF1 gene fusion in anaplastic pleomorphic xanthoastrocytoma with leptomeningeal dissemination. JCO Precis Oncol 2019;3:1-7. DOI: 10.1200/PO.18.00298.

14. Frazâo L., do Carmo Martins M., Nunes V.M. et al. BRAFV600E mutation and 9p21: CDKN2A/B and MTAP co-deletions — markers in the clinical

stratification of pediatric gliomas. BMC

Cancer 2018;18(1):1259.

DOI: 10.1186/s12885-018-5120-0.

15. Rajbhandari R., McFarland B.C., Patel A. et al. Loss of tumor suppressive micro-RNA-31 enhances TRADD/NF-kB signaling in glioblastoma. Oncotarget 2015;6(19):17805-16.

DOI: 10.18632/oncotarget.4596.

16. Pollack I.F., Hamilton R.L., Sobol R.W. et al. IDH1 mutations are common

in malignant gliomas arising in adolescents: a report from the Children's Oncology Group. Child's Nervous System 2011;27(1):87-94. DOI: 10.1007/s00381-010-1264-1.

17. Buccoliero A.M., Castiglione F., Degl'Innocenti D.R. et al. IDH1 mutation in pediatric gliomas: has it a diagnostic and prognostic value? Fetal Pediatr Pathol 2012;31:278-82.

DOI: 10.3109/15513815.2012.659383.

18. Antonelli M., Buttarelli F.R., Arcella A. et al. Prognostic significance

of histological grading, p53 status, YKL-40 expression, and IDH1 mutations in pediatric high-grade gliomas. J Neurooncol 2010;99:209-15. DOI: 10.1007/s11060-010-0129-5.

19. Guerreiro Stucklin A.S., Ryall S., Fukuoka K. et al. Alterations in ALK/ ROS1/NTRK/MET drive a group

of infantile hemispheric gliomas. Nat Commun 2019;10(1):4343. DOI: 10.1038/s41467-019-12187-5.

20. Desai A.V., Robinson G.W., Basu E.M.

et al. Updated entrectinib data in children and adolescents with recurrent or refractory solid tumors, including primary CNS tumors. J Clin Oncol 2020;38(15_suppl):107. DOI: 10.1200/JCO.2020.38.15_suppl.107.

Вклад авторов

М.А. Зайцева: разработка дизайна исследования, проведение генетических исследований и анализ полученных данных, обзор публикаций по теме статьи, написание текста рукописи;

А.П. Шехтман: проведение гистологических исследований, редактирование текста рукописи; Л.И. Папуша, Э.Ф. Валиахметова: обзор публикаций по теме статьи, сбор клинических данных;

Л.А. Ясько, А.Е. Друй: разработка дизайна исследования, обзор публикаций по теме статьи, научное редактирование текста рукописи. Authors' contributions

M.A. Zaytseva: developing the research design, genetic testing and analysis of the obtained data, analysis of the literature, writing of the manuscript;

A.P. Shekhtman: histopathologic analysis, editing of the manuscript;

L.I. Papusha, E.F. Valiakhmetova: analysis of the literature, clinical data collection;

L.A. Yasko, A.E. Druy: developing the research design, analysis of the literature, scientific editing of the manuscript.

ORCID авторов / ORCID of authors в

М.А. Зайцева / M.A. Zaytseva: https://orcid.org/0000-0003-2015-5790 ^

А.П. Шехтман / A.P. Shekhtman: https://orcid.org/0000-0001-5461-7442 CV Л.И. Папуша / L.I. Papusha: https://orcid.org/0000-0001-7750-5216

Э.Ф. Валиахметова / E.F. Valiakhmetova: https://orcid.org/0000-0002-2977-665X m Л.А. Ясько / L.A. Yasko: https://orcid.org/0000-0003-3007-3772

А.Е. Друй / A.E. Druy: https://orcid.org/0000-0003-1308-8622 g

Конфликт интересов. Авторы заявляют об отсутствии конфликта интересов. О

Conflict of interest. The authors declare no conflict of interest. 2

Финансирование. Исследование было поддержано благотворительным фондом «Наука-детям».

Financing. The study was supported by charity foundation "Science for children" _j

U

Соблюдение прав пациентов и правил биоэтики ш

Протокол исследования одобрен комитетом по биомедицинской этике ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр О

детской гематологии, онкологии и иммунологии им. Дмитрия Рогачева» Минздрава России. ®

Все пациенты или законные представители пациентов подписали информированное согласие на участие в исследовании. 5

Compliance with patient rights and principles of bioethics c/9 The study protocol was approved by the biomedical ethics committee of Dmitry Rogachev National Medical Research Center of Pediatric Hematology, {Jj

Oncology and Immunology, Ministry of Health of Russia. Z

All patients or legal representatives of patients gave written informed consent to participate in the study. Ba

X ш

и

Статья поступила: 29.06.2020. Принята к публикации: 19.10.2020. Article submitted: 29.06.2020. Accepted for publication: 19.10.2020.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.