Научная статья на тему 'Анализ ассоциаций полиморфных маркеров гена TCF7L2 c сахарным диабетом 2-го типа у жителей Республики Татарстан'

Анализ ассоциаций полиморфных маркеров гена TCF7L2 c сахарным диабетом 2-го типа у жителей Республики Татарстан Текст научной статьи по специальности «Фундаментальная медицина»

CC BY
513
81
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
Ключевые слова
ПОЛИМОРФИЗМ / ГЕНTCF7L2 / RS7903146 / RS12255372 / САХАРНЫЙ ДИАБЕТ 2-ГО ТИПА / POLYMORPHISM / TCF7L2 GENE / TYPE 2 DIABETES MELLITUS

Аннотация научной статьи по фундаментальной медицине, автор научной работы — Валеева Фарида Вадутовна, Киселева Татьяна Александровна, Хасанова Камиля Булатовна, Ахметов Ильдус Ильясович, Валеева Елена Валерьевна

Целью исследования явился анализ ассоциации полиморфизмов гена TCF7L2 (rs7903146 C/T и rs12255372 G/Т) c сахарным диабетом 2 типа (СД2) у жителей Республики Татарстан. Материалы и методы. В исследовании приняли участие 76 пациентов (30% мужчин и 70% женщин) в возрасте от 38 до 76 лет с верифицированным диагнозом СД2 и избыточной массой тела или ожирением. Распределение генотипов и аллелей пациентов по полиморфизму rs7903146 сравнивали с данными литературы, по полиморфизму rs12255372 гена TCF7L2 использовалась собственная выборка (лица без клинических и лабораторных признаков диабета). Всем пациентам было проведено клиническое и лабораторное обследование. Результаты. При анализе распределения частот аллелей и генотипов по двум полиморфизмам в исследуемой и контрольной группах статистически значимых различий найдено не было. Обнаружена связь между носительством генотипа ТТ и аллеля T маркера rs7903146 и уровнем триглицеридов (р=0,04), а также показателем окружности талии к окружности бедер (ОТ/ОБ) (р=0,005). Среди пациентов с СД2 в группе носителей аллеля rs12255372 Т наблюдалось значимое увеличение среднего соотношения показателя ОТ/ОБ в сравнении с GG генотипом (р=0,04). Связи между носительством генотипа ТТ и аллеля T по обоим полиморфизмам с такими показателями, как ИМТ, общей холестерин, липопротеиды высокой и низкой плотности выявлено не было. Выводы. Выявлена положительная взаимосвязь аллелей риска гена TCF7L2 с признаками ожирения (по соотношению ОТ/ОБ) и метаболическими нарушениями. При анализе распределения частот аллелей и генотипов двух полиморфных маркеров гена TCF7L2 в исследуемой и контрольной группах не были обнаружены статистически значимые различия. Для объективизации картины распределения аллелей риска необходимы дальнейшие исследования с расширением объема выборок среди больных и здоровых лиц.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по фундаментальной медицине , автор научной работы — Валеева Фарида Вадутовна, Киселева Татьяна Александровна, Хасанова Камиля Булатовна, Ахметов Ильдус Ильясович, Валеева Елена Валерьевна

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Analysis of associations of polymorphous markers ofTCF7L2 gene with diabetes mellitus of the 2nd type in the case of residents of the Republic of Tatarstan

The aim of the study was to investigate the possible association of the IVS3 С>Т (rs7903146) and IVS4 G>Т (rs12255372) polymorphisms of the transcription factor 7-like 2 (TCF7L2) gene with type 2 diabetes mellitus (T2DM) in the Republic of Tatarstan (RT). Materials and Methods. The study involved 76 adult patients (30% men and 70% women; 38-77 years old) with type 2 diabetes mellitus and overweight or obesity. The distribution of genotypes and alleles of the rs7903146 TCF7L2 gene polymorphism was compared with the literature data, for the rs12255372 TCF7L2 gene polymorphism was used our own sample (people without T2DM). All patients underwent clinical and laboratory examination. Results. In the analysis of the frequency distribution of alleles and genotypes of polymorphic markers rs7903146 and rs12255372 of the TCF7L2 gene in the study and control groups statistically significant differences were not found. Correlation was found between carriers of genotype TT and allele T of polymorphic marker rs7903146 of the TCF7L2 gene and the level of triglycerides (p=0.04), increased average waist-hip ratio(p=0.005). Among patients with T2DM in the group withcarriers of allele T of the rs 12255372 TCF7L2 gene was observed a significant increase average waist-hip ratio compared with GG genotype (p=0.04). The connection between the carriers of genotype TT and allele T with such parameters as BMI, total cholesterol, HDL and low density have not been identified.Conclusions. There was a positive correlation of the risk alleles of the TCF7L2 gene with signs of obesity (the waist-hip ratio) and metabolic disorders. In the analysis of the frequency distribution of alleles and genotypes of two polymorphic markers TCF7L2 gene in the study and control groups was not found statistically significant differences. To obtain more objective picture of distribution of risk alleles, further studies are needed with the expansion of the volume of sample among patients and healthy individuals.

Текст научной работы на тему «Анализ ассоциаций полиморфных маркеров гена TCF7L2 c сахарным диабетом 2-го типа у жителей Республики Татарстан»

▲1

Введение

XXI век - это век «пандемии» сахарного диабета 2-го типа (СД2), который представляет собой серьезную не только медицинскую, но и социально-экономическую проблему для всего мира. Динамика роста распространенности СД2 в Республике Татарстан (РТ) остается высокой, что согласуется с данными по России в целом. В Республике Татарстан по данным регистра в 2001 году было зарегистрировано 39 795 пациентов с СД2, в 2010 году - 80 775 пациентов. Таким образом, за 10 лет официальный прирост составил 40 980 человек. По данным на 2015 год их число составило уже 107 112 человек. Большие затраты, связанные прежде всего с инвалидизацией и смертностью, ведут к организации системы учета и мониторинга клинико-эпидемиологических сведений о данном заболевании [1]. Накопленные на сегодняшний день научные данные позволяют с уверенностью говорить о том, что генетический компонент играет важную роль в формировании ожирения и сахарного диабета и составляет от 40 до 70% и более 50% в человеческой популяции соответственно. Сахарный диабет 2-го типа развивается в результате сложного взаимодействия неблагоприятных компонентов окружающей среды и определенных генетических факторов. Некоторые факторы риска, включая общие легко-измеряемые фенотипические признаки (такие как ожирение, артериальная гипертензия, низкий уровень липидов высокой плотности, повышенный уровень триглицери-дов, нарушенная гликемия натощак), так же, как наследственность по СД2, уже эффективно используются как предикторы развития СД2.

В настоящее время известно несколько сотен генов-кандидатов, которые ассоциированы с развитием различных нарушений углеводного обмена, таких как СД2, нарушенная толерантность к глюкозе, нарушенная гликемия натощак. В связи с тем, что вариантов генетических полиморфизмов, создающих основу предрасположенности к СД2, много, это обуславливает полигенный характер развития данного заболевания [2, 3]. На сегодняшний день активно изучаются гены, которые отвечают за важнейшие звенья патогенеза СД2 - инсулинорезистентность (ИР) и генетические дефекты р-клеток поджелудочной железы. Различают две основные наследственные причины в формировании нарушений углеводного обмена - это генетические дефекты р-клеточной функции и генетические дефекты действия инсулина.

Выявленные полиморфизмы находятся в генах, экспрессия которых определяет [4] синтез инсулина, снижение количества и дисфункцию р-клеток, ожирение, инсулинорезистентность, изменение концентрации глюкозы в крови и плазме.

Среди всех генов, которые были обнаружены благодаря методу полногеномных ассоциативных исследований (GWAS), несомненно, значимым в развитии СД2 является ген TСF7L2. Известно, что генетический полиморфизм гена TCF7L2 влияет на пролиферацию, функциональную активность и дифференцировку р-клеток поджелудочной железы.

Ген TCF7L2, который расположен на хромосоме ^25.3, является важным компонентом Wnt-зависимого сигнального пути, одного из важнейших в области развития и роста регуляторных механизмов клеток [5]. Механизм влияния гена TCF7L2 на развитие СД2 до сих пор до конца не изучен.

Исследование S.F. Grant et. al. впервые показало связь аллеля Т полиморфного маркера rs7903146 гена TCF7L2 с повышенным риском развития СД2 (OR=2,41), при этом популяционный риск у носителей предрасполагающего аллеля составил 21% [5]. Дальнейшие репликационные исследования подтвердили участие полиморфизмов гена TCF7L2 в развитии заболевания [6, 7, 8]. Мутантная аллель Т повышает постпрандиальную гликемию и уменьшает периферические концентрации инсулина в ответ на перо-ральную нагрузку углеводами [9]. Аналогичные данные также были получены в исследованиях на американской [10], финской [11] и британской [12] популяциях.

В работах отечественных авторов сообщается о том, что полиморфные маркеры rs12255372 и rs7903146 гена TCF7L2 ассоциированы с развитием СД2 у русских жителей Новосибирской области и г. Москвы [13, 14]. В исследовании полиморфного маркера IVS3 С>Т (rs7903146) гена TCF7L2 у лиц с СД2 в Новосибирской области установлено, что носительство аллеля Т повышает риск развития СД2, а больные СД с генотипом ТТ имеют более высокие значения индекса массы тела (ИМТ). Другие исследования, проведенные на русской популяции [15] и на татарской этнической группе Башкортостана [16], также подтвердили эти данные.

Цель исследования: провести анализ ассоциации полиморфизма IVS3 С>Т (rs7903146) и IVS4 GM" (rs12255372) гена TCF7L2 c СД2 у жителей РТ.

Материал и методы

В исследовании приняли участие 76 пациентов (30% мужчин и 70% женщин) в возрасте от 38 до 76 лет с верифицированным диагнозом СД2 и избыточной массой тела (ИМТ от 25,0 до 29,9 кг/м2) или ожирением (ИМТ>30 кг/м2). Критерии включения в исследование: лица с подтвержденным диагнозом «сахарный диабет 2-го типа» (согласно критериям ВОЗ, 1999-2013). Критериями исключения из исследования были сахарный диабет 1-го типа, беременность, алкоголизм, психиатрические заболевания, возраст испытуемого до 18 лет, отказ пациента от участия в исследовании.

Распределение генотипов и аллелей пациентов по полиморфизму rs7903146 сравнивали с данными литературы (286 лиц без клинических и лабораторных признаков сахарного диабета 2-го типа; татары) [16]. По полиморфизму rs12255372 гена TCF7L2 использовалась собственная выборка (жители РФ, 110 человек без клинических и лабораторных признаков сахарного диабета 2-го типа).

Проводилась оценка клинических и биохимических параметров. Исследованы показатели липидного обмена. Определение содержания общего холестерина, три-глицеридов, липопротеидов высокой плотности, липо-протеидов низкой плотности проводили на биохимическом анализаторе Architect c4000. Биоматериалом для генетического анализа являлись клетки цельной крови. ДНК выделяли с помощью сорбентного метода («Ампли-Прайм ДНК-сорб-В», Москва). Генотипирование проводили с помощью полимеразной цепной реакции в реальном времени с использованием коммерческих наборов реагентов («Синтол», Москва). Все исследования проводились в Центральной научно-исследовательской лаборатории Казанского ГМУ.

NK

МЕДИЦИНСКИЙ

АЛЬМАНАХ

Статистическая обработка данных включала в себя методы описательной и сравнительной статистики с использованием программ GraphPadlnStat, Microsoft Excel 2007. Проведена оценка соответствия распределения частоты аллелей и генотипов равновесию Харди-Вайнберга (по критерию х2), также оценивался показатель отношения шансов (ОШ). Статистически значимыми считались результаты при p<0,05.

Результаты и их обсуждение

Была проанализирована частота встречаемости всех генотипов и аллелей в группе пациентов с СД2 и проведено сравнение их с данными литературы [16]. При анализе распределения частот аллелей и генотипов полиморфного маркера rs7903146 гена TCF7L2 в исследуемой и контрольной группах статистически значимых различий найдено не было (таблица 1).

Распределение генотипов полиморфизма IVS3 С>Т гена TCF7L2 (СС - 59,2%, СТ - 28,9%, ТТ - 11,8%) и аллелей (С - 73,7%, Т - 26,3%) в исследуемой группе не отличалось от данных контрольной группы. Распределение частоты аллелей и генотипов полиморфизма IVS3 С>Т гена TCF7L2 не соответствовало распределению Харди-Вайнберга, что может быть связано с резким отбором пациентов из общей популяции РТ.

При анализе распределения частот аллелей и генотипов полиморфного маркера rs12255372 гена TCF7L2 в исследуемой и контрольной группах также не были обнаружены статистически значимые различия (таблица 2).

ТАБЛИЦА 1.

Сравнительный анализ распределения частот аллелей и генотипов полиморфного маркера IVS3 С>Т (rs7903146) гена TCF7L2 в исследуемой и контрольной группах

Был проведен анализ ассоциаций полиморфизма ^3 С>Т (^7903146) гена TCF7L2 с клинико-биохимическими показателями пациентов с СД2, данные которого представлены в таблице 3. Наблюдается увеличение среднего соотношения окружности талии к окружности бедер (ОТ/ОБ) от группы пациентов с СС генотипом к пациентам с СТ генотипом и максимальное значение выявлено среди пациентов с ТТ генотипом (0,94±0,05, 0,97±0,06, 0,99±0,07, соответственно; р=0,025). Среди пациентов с ТТ и СТ генотипами наблюдалась тенденция к увеличению уровня общего холестерина, ЛПНП в сравнении с группой пациентов с СС генотипом (р>0,05).

Был проведен анализ ассоциаций полиморфизма ^4 G>Т (^12255372) гена TCF7L2 с клинико-биохимическими показателями пациентов с СД2, данные которого представлены в таблице 4. В связи с небольшим количеством пациентов с генотипом ТТ анализ клинических и биохимических параметров в зависимости от полиморфных вариантов ^4 G>Т гена TCF7L2 был произведен путем сравнения группы пациентов с генотипом GG и носителей аллеля риска Т. Среди пациентов с СД2 в группе носителей аллеля Т наблюдалось значимое увеличение среднего соотношения показателя окружности талии к окружности бедер в сравнении с GG генотипом (0,98±0,07 против 0,94±0,06 соответственно; р=0,04). Прослеживалась тенденция к увеличению ИМТ, ЛПНП и триглицеридов у носителей аллеля Т в сравнении с группой пациентов с GG генотипом (р>0,05).

ТАБЛИЦА 2.

Сравнительный анализ распределения частот аллелей и генотипов полиморфного маркера V4 G>Т (к12255372) гена TCF7L2 в исследуемой и контрольной группах

Аллели и генотипы 1-я подгруппа, n=85 Значение х2 р

исследуемая группа (СД2) n (%) контрольная группа n (%)

Аллель С 112 (73,7) 396 (69,2) 1,14 0,29

Аллель Т 40 (26,3) 176 (30,8)

Генотип СС 45 (59,2) 146 (51,0) 1,73 0,42

Генотип СТ 22 (28,9) 104 (36,4)

Генотип ТТ 9 (11,8) 36 (12,6)

Аллели и генотипы 1-я подгруппа, n=85 Значение х2 р

исследуемая группа (СД2) n (%) контрольная группа n (%)

Аллель С 124 (81,6) 170 (77,3) 1,01 0,32

Аллель Т 28 (18,4) 50 (22,7)

Генотип СС 51 (67,1) 65 (59,1) 1,24 0,54

Генотип СТ 22 (28,9) 40 (36,4)

Генотип ТТ 3 (3,9) 5 (4,5)

ТАБЛИЦА 3.

Анализ клинических и биохимических параметров в зависимости от полиморфных вариантов V3 С>Тгена TCF7L2

Параметры Генотипы p

СС СТ ТТ

ИМТ, кг/м2 32,95±3,9 34,2±4,61 32,62±4,2 р=0,25

ОТ/ОБ 0,94±0,05 0,97±0,06 0,99±0,07 р=0,25*

Общий холестерин, ммоль/л 5,86±1,16 6,2±1,49 6,32±1,38 р=0,48

ЛПВП, ммоль/л 2,04±0,89 2,16±0,79 2,29±1,11 р=0,62

ЛПНП, ммоль/л 3,15±0,87 3,5±1,05 3,62±1,14 р=0,15

Триглицериды, ммоль/л 1,81±0,69 2,08±0,59 2,64±1,00 р=0,15

Примечание: * - жирным шрифтом выделены статистически значимые различия.

ТАБЛИЦА 4.

Анализ клинических и биохимических параметров в зависимости от полиморфных вариантов V4 G>Тгена TCF7L2

Параметры Генотипы p

GG GТ+ТТ

ИМТ кг/м2 33,4±4,6 34,6±4,2 р=0,3

ОТ/ОБ 0,94±0,06 0,98±0,07 р=0,04*

Общий холестерин, ммоль/л 6,12±1,18 6,09±1,49 р=0,9

ЛПВП, ммоль/л 2,13±0,85 2,14±0,89 р=0,9

ЛПНП, ммоль/л 3,19±0,93 3,46±1,03 р=0,3

Триглицериды, ммоль/л 1,90±0,63 2,15±0,83 р=0,21

Примечание: * - жирным шрифтом выделены статистически значимые различия.

▲1

SSM

ТАБЛИЦА 5.

Анализ клинических и биохимических параметров в зависимости от полиморфных вариантов V3 С>Тгена TCF7L2

Параметры Генотипы p

СС СТ+ТТ

ОТ/ОБ 0,94±0,05 0,97±0,06 р=0,005*

Триглицериды, ммоль/л 1,81±0,69 2,20±0,71 р=0,04*

Примечание: * - жирным шрифтом выделены статистически значимые различия.

В связи с небольшим количеством пациентов с генотипом ТТ анализ клинических и биохимических параметров в зависимости от полиморфных вариантов IVS3 С>Т гена TCF7L2 был также произведен путем сравнения группы пациентов с генотипом СС и носителей аллеля риска Т. Среди пациентов с СД2 носителей аллеля Т наблюдалось значимое увеличение среднего соотношения показателя окружности талии к окружности бедер в сравнении с СС генотипом (0,94±0,05 против 0,97±0,06 соответственно; р=0,0052). Среди пациентов с СД2 носителей аллеля Т наблюдалось значимое увеличение уровня триглицеридов в сравнении с СС генотипом (1,81 ±0,69 против 2,21±0,71 ммоль/л соответственно; р=0,04) (таблица 5).

Выводы

Выявлена положительная взаимосвязь аллелей риска гена TCF7L2 с признаками ожирения (по соотношению ОТ/ОБ) и метаболическими нарушениями. При анализе распределения частот аллелей и генотипов двух полиморфных маркеров гена TCF7L2 в исследуемой и контрольной группах не были обнаружены статистически значимые различия. Для объективизации картины распределения аллелей риска необходимы дальнейшие исследования с расширением объема выборок среди больных и здоровых лиц.

ЛИТЕРАТУРА

1. Дедов И.И., Шестакова М.В., Викулова О.К. Государственный регистр сахарного диабета в Российской Федерации: статус 2014 г. и перспективы развития. Сахарный диабет. 2015. № 3. С. 5-22.

DedovI.I., Shestakova M.V., Vikulova O.K. Gosudarstvennyjregistrsaxarnogo diabeta v Rossijskoj Federacii: status 2014 g. iperspektivy razvitiya. Saharnyj dia-bet. 2015. № 3. S. 5-22.

2. Grant R.W., Moore A.F., Florez J.C. Genetic Architecture of Type 2 Diabetes: Recent Progress and Clinical Implications. DiabetesCare. 2009. № 32 (6). Р. 1107-1114.

3. Parikh H., Lyssenko V., Groop Leif C. Prioritizing genes for follow up from genome wide association studies using information on gene expression in tissues relevant for type 2 diabetes mellitus. BMC Med Genomics. 2009. № 2. 72 р.

4. McCarthy M.I. Genomics, type 2 diabetes, and obesity. N. Engl. J. Med. 2010. № 363. Р. 2339-2350.

5. Grant S.F., Thorleifsson G., Reynisdottir I. et al. Variant of transcription factor 7-like 2 (TCF7L2) gene confers risk of type 2 diabetes. Nat. Genet. 2006. № 38. Р. 320-323.

6. Goodarzi M.O., Rotter J.I. Testing the gene or testing a variant? The case of TCF7L2. Diabetes. 2007. № 56. Р. 2417-2419.

7. Hayashi T., Iwamoto Y., Kaku K. et al. Replication study for the association of TCF7L2 with susceptibility to type 2 diabetes in a Japanese population. Diabetologia. 2007. № 50. 980-984.

8. Jin T., Liu L. The Wnt signaling pathway effector TCF7L2 and type 2 diabetes mellitus. Mol. Endocrinol. 2008. № 22 (11). Р. 2383-2392.

9. Florez J.C., Jablonski K.A., Bayley N. et al. TCF7L2 Polymorphisms and Progression to Diabetes in the Diabetes Prevention Program. The New England journal of medicine. 2006. № 355 (3). Р. 241-250.

10. Zhang C., Qi L., Hunter D.J., Meigs J.B., Manson J.E., van Dam R.M., Hu F.B. Variant of transcription factor 7-like 2 (TCF7L2) gene and the risk of type 2 diabetes in large cohorts of U.S. women and men. Diabetes. 2006. № 55. Р. 2645-2648.

11. Scott L.J., Bonnycastle L.L., Willer C.J., Sprau A.G., Jackson A.U., Narisu N. et al. Association of transcription factor 7-like 2 (TCF7L2) variants with type 2 diabetes in a Finnish sample. Diabetes. 2006. № 55. Р. 2649-2653.

12. Groves C.J., Zeggini E., Minton J., Frayling T.M., Weedon M.N. et al. Association analysis of 6,736 U.K. subjects provides replication and confirms TCF7L2 as a type 2 diabetes susceptibility gene with a substantial effect on individual risk. Diabetes. 2006. № 55. Р. 2640-2644.

13. Бондарь И.А. и др. Ассоциация полиморфных маркеров rs7903146 гена TCF7L2 и rs1801282 гена PPARG (Pro12Ala) с сахарным диабетом 2-го типа в Новосибирской области. Сахарный диабет. 2013. № 4. С. 17-22.

Bondar' I.A i dr. Associacija polimorfnyh markerov rs7903146 gena TCF7L2 i rs1801282 gena PPARG (Pro12Ala) s saharnym diabetom 2 tipa v Novosibirskoj oblasti. Saharnyj diabet. 2013. № 4. S. 17-22.

14. Никитин А.Г., Потапов В.А., Бровкин А.Н. и др. Ассоциация полиморфных маркеров гена TCF7L2 с сахарным диабетом 2-го типа. Клиническая практика. 2014. № 1. С. 4-10.

Nikitin A.G., Potapov V.A., Brovkin A.N., i dr. Associacija polimorfnyh markerov gena TCF7L2 s saharnym diabetom 2 tipa. Klinicheskaja praktika. 2014. № 1. S. 4-10.

15. Потапов В.А., Шамхалова М.Н., Сметанина С.А., Бельчикова Л.Н., Суплотова Л.А. и др. Полиморфные маркеры rs12255372 и rs13266634 генов TCF7L2 и SLC30A8 связаны с развитием сахарного диабета типа 2 в русской популяции. Генетика. 2010. № 46 (8). С. 1123-1231.

Potapov V.A., Shamhalova M.N., Smetanina S.A., Bel'chikova L.N., Suplotova LA i dr. Poiimorfnye markery rs12255372 i rs13266634 genov TCF7L2 i SLC30A8 svjazany s razvitiem saharnogo diabeta tipa 2 v russkoj populjacii. Genetika. 2010. № 46 (8). S. 1123-1231.

16. Авзалетдинова Д.Ш., Шарипова Л.Ф., Кочетова О.В., Моругова Т.В., Эрдман В.В. и др. Анализ ассоциаций полиморфного маркера rs7903146 гена TCF7L2 с сахарным диабетом 2-го типа в татарской этнической группе, проживающей в Башкортостане. Сахарный диабет. 2016. № 2. С. 119-124.

Avzaletdinova D.Sh., Sharipova L.F., Kochetova O.V., Morugova T.V., Jerd-man V.V. i dr. Analiz associacij polimorfnogo markera rs7903146 gena TCF7L2 s saharnym diabetom 2 tipa v tatarskoj jetnicheskoj gruppe, prozhivajushhej v Bashkortostane. Saharnyj diabet. 2016. № 2. S. 119-124. |

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.