Научная статья на тему 'ВЛИЯНИЕ ПОЛИМОРФНЫХ МАРКЕРОВ ГЕНОВ БЕЛКОВ - УЧАСТНИКОВ ФОЛАТНОГО МЕТАБОЛИЗМА НА ТЕЧЕНИЕ И ИСХОДЫ ВИРУСНОГО ПОРАЖЕНИЯ ЛЕГКИХ, СВЯЗАННОГО С ИНФИЦИРОВАНИЕМ КОРОНАВИРУСОМ SARS-COV-2'

ВЛИЯНИЕ ПОЛИМОРФНЫХ МАРКЕРОВ ГЕНОВ БЕЛКОВ - УЧАСТНИКОВ ФОЛАТНОГО МЕТАБОЛИЗМА НА ТЕЧЕНИЕ И ИСХОДЫ ВИРУСНОГО ПОРАЖЕНИЯ ЛЕГКИХ, СВЯЗАННОГО С ИНФИЦИРОВАНИЕМ КОРОНАВИРУСОМ SARS-COV-2 Текст научной статьи по специальности «Клиническая медицина»

CC BY
80
14
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
Журнал
Journal of Siberian Medical Sciences
ВАК
Область наук
Ключевые слова
ОДНОНУКЛЕОТИДНЫЕ ПОЛИМОРФИЗМЫ ГЕНОВ / MTRR 66AG / MTHFR 677CT / MTHFR 677ТT / ФОЛИЕВАЯ КИСЛОТА / КОРОНАВИРУС SARS-COV-2 / ВИРУСНОЕ ПОРАЖЕНИЕ ЛЕГКИХ

Аннотация научной статьи по клинической медицине, автор научной работы — Цеймах Ирина Яковлевна, Костюченко Геннадий Иванович, Богачев Дмитрий Евгеньевич, Зубова Ольга Александровна, Корнилова Татьяна Александровна

Введение. Инфицирование человека ассоциированным с тяжелым острым респираторным синдромом коронавирусом 2 (SARS-CoV-2) формирует полиморфную картину инфекционного заболевания (COVID-19) в диапазоне от легких форм острой респираторной инфекции до тяжелых и угрожающих жизни вариантов течения системной инфекции с вовлечением дыхательных путей. Среди значимых предикторов тяжелого течения и летального исхода у больных с поражением легких, ассоциированным с инфекционным заболеванием COVID-19, выделяют увеличение плазменного содержания D-димеров, гомоцистеина, некоторые однонуклеотидные полиморфизмы (single nucleotide polymorphisms - SNP) генов белков - участников фолатного цикла. Цель. Оценить роль генетических маркеров нарушений метаболизма фолиевой кислоты в развитии симптомов и исходов ассоциированного с коронавирусом SARS-CoV-2 поражения легких у госпитализированных пациентов. Материалы и методы. В открытом проспективном сравнительном исследовании 117 больных с поражением легких, ассоциированным с инфицированием коронавирусом SARS-CoV-2, проведен анализ исходов в зависимости от полиморфных маркеров генов белков фолатного цикла и применения в комплексной терапии фиксированной комбинации фолиевой кислоты с витаминами В6, В12. Результаты. У пациентов наблюдался повышенный относительный риск гетерозиготного носительства минорного аллеля G однонуклеотидного полиморфизма гена метионинсинтазыредуктазы ( MTRR ) 66AG. Гомозиготный генотип MTRR 66GG ассоциировался с показателями анемии и тромбоцитопении. Установлено статистически значимое снижение отношения шансов (ОШ) достижения к 14-му дню терапии отрицательного результата определения РНК SARS-CoV-2 у пациентов с гетерозиготным генотипом 677CT и гомозиготным генотипом 677ТT гена метилентетрагидрофолатредуктазы ( MTHFR ) . Заключение. Поражение легких, вызванное коронавирусом SARS-CoV-2, ассоциируется с повышенным риском генетически обусловленного нарушения метаболизма фолата и витамина В12.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по клинической медицине , автор научной работы — Цеймах Ирина Яковлевна, Костюченко Геннадий Иванович, Богачев Дмитрий Евгеньевич, Зубова Ольга Александровна, Корнилова Татьяна Александровна

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

THE EFFECT OF POLYMORPHIC MARKERS OF GENES OF PROTEINS INVOLVED IN THE FOLATE METABOLISM ON THE COURSE AND OUTCOMES OF THE VIRAL LUNG DAMAGE ASSOCIATED WITH SARS-COV-2 INFECTION

Introduction. Infection with human coronavirus 2 (SARS-CoV-2) associated with severe acute respiratory syndrome, forms polymorphous pattern of the infectious disease (COVID-19) in the range from mild acute respiratory infection to severe and life-threatening variations of systemic infection with respiratory tract involvement. Among significant predictors of the severe course and lethal outcome in the individuals with lung affection associated with COVID-19 infection, the increase of plasma levels of D-dimer, homocysteine, and some single-nucleotide polymorphisms (SNPs) of genes of the folate cycle proteins are singled out. Aim. To assess the role of genetic markers of folic acid metabolic disorders in the development of symptoms and the outcomes of viral lung damage associated with SARS-CoV-2 infection in the hospitalized patients. Materials and methods. In an open prospective comparative study the assessment of outcomes depending on polymorphic markers of protein genes of the folate cycle and the use of fixed combination of folic acid and vitamins В6, В12 in comprehensive therapy was performed in 117 patients with lung damage associated with SARS-CoV-2 infection. Results. Patients showed an increased relative risk of the heterozygous minor G-allele carriage of 66AG SNP of the methionine synthase reductase gene ( MTRR ). The homozygous MTRR G66G genotype was associated with indicators of anemia and thrombocytopenia. A statistically significant decrease in the odds ratio in achieving negative results for SARS-CoV-2 RNA detection by the 14th day of therapy in patients with the heterozygous 677CT genotype and the homozygous 677TT genotype of the MTHFR (methylenetetrahydrofalate reductase) gene was established. Conclusion. Lung damage caused by SARS-CoV-2 infection is associated with an increased risk of genetic metabolic disorder of folate and vitamin B12.

Текст научной работы на тему «ВЛИЯНИЕ ПОЛИМОРФНЫХ МАРКЕРОВ ГЕНОВ БЕЛКОВ - УЧАСТНИКОВ ФОЛАТНОГО МЕТАБОЛИЗМА НА ТЕЧЕНИЕ И ИСХОДЫ ВИРУСНОГО ПОРАЖЕНИЯ ЛЕГКИХ, СВЯЗАННОГО С ИНФИЦИРОВАНИЕМ КОРОНАВИРУСОМ SARS-COV-2»

УДК 6i6.24-031.72:[6i6.98:578.834.i]:575.174.015.3 doi: 10.31549/2542-1174-2021-4-67-79

Влияние полиморфных маркеров генов белков — участников фолатного метаболизма на течение и исходы вирусного поражения легких, связанного с инфицированием коронавирусом SARS-CoV-2

И.Я. Цеймах1, Г.И. Костюченко2, Д.Е. Богачев1, О.А. Зубова3, Т.А. Корнилова4, А.Г. Харлова3, И.П. Крамарь4, А.Е. Цеймах1, Я.Н. Шойхет1

ФГБОУВО «Алтайский государственный медицинский университет» Минздрава России 2КГБУЗ «Краевая клиническая больница» (Барнаул)

3КГБУЗ «Алтайский краевой госпиталь для ветеранов войн» (Барнаул) 4КГБУЗ «Городская больница № 5, г. Барнаул»

АННОТАЦИЯ

Введение . Инфицирование человека ассоциированным с тяжелым острым респираторным синдромом коронавирусом 2 (SARS-CoV-2) формирует полиморфную картину инфекционного заболевания (COVID-19) в диапазоне от легких форм острой респираторной инфекции до тяжелых и угрожающих жизни вариантов течения системной инфекции с вовлечением дыхательных путей. Среди значимых предикторов тяжелого течения и летального исхода у больных с поражением легких, ассоциированным с инфекционным заболеванием COVID-19, выделяют увеличение плазменного содержания D-димеров, гомоцистеина, некоторые однонуклеотидные полиморфизмы (single nucleotide polymorphisms — SNP) генов белков — участников фолатного цикла.

Цель . Оценить роль генетических маркеров нарушений метаболизма фолиевой кислоты в развитии симптомов и исходов ассоциированного с коронавирусом SARS-CoV-2 поражения легких у госпитализированных пациентов. Материалы и методы . В открытом проспективном сравнительном исследовании 117 больных с поражением легких, ассоциированным с инфицированием коронавирусом SARS-CoV-2, проведен анализ исходов в зависимости от полиморфных маркеров генов белков фолатного цикла и применения в комплексной терапии фиксированной комбинации фолиевой кислоты с витаминами В6, В12.

Результаты. У пациентов наблюдался повышенный относительный риск гетерозиготного носительства минорного аллеля G однонуклеотидного полиморфизма гена метионинсинтазыредуктазы (MTRR) 66AG. Гомозиготный генотип MTRR 66GG ассоциировался с показателями анемии и тромбоцитопении. Установлено статистически значимое снижение отношения шансов (ОШ) достижения к 14-му дню терапии отрицательного результата определения РНК SARS-CoV-2 у пациентов с гетерозиготным генотипом 677CT и гомозиготным генотипом 677ТТ гена метилентетрагидрофолатредуктазы (MTHFR).

Заключение. Поражение легких, вызванное коронавирусом SARS-CoV-2, ассоциируется с повышенным риском генетически обусловленного нарушения метаболизма фолата и витамина В12.

Ключевые слова: однонуклеотидные полиморфизмы генов, MTRR 66AG, MTHFR 677CT, MTHFR 677ТТ, фолие-вая кислота, коронавирус SARS-CoV-2, вирусное поражение легких.

Образец цитирования: Цеймах И.Я., Костюченко Г.И., Богачев Д.Е., Зубова О А., Корнилова Т.А., Харлова А.Г., Крамарь И.П., Цеймах А.Е., Шойхет Я.Н. Влияние полиморфных маркеров генов белков — участников фолатного метаболизма на течение и исходы вирусного поражения легких, связанного с инфицированием коронавирусом SARS-CoV-2 // Journal of Siberian Medical Sciences. 2021. № 4. С. 67-79. doi: 10.31549/2542-11742021-4-67-79

Поступила в редакцию 30.07.2021 Прошла рецензирование 06.09.2021 Принята к публикации 26.09.2021

Автор, ответственный за переписку

Цеймах Ирина Яковлевна: ФГБОУ ВО «Алтайский государственный медицинский университет» Минздрава России. 656038, г. Барнаул, пр. Ленина, 40. E-mail: irintsei@mail.ru

Received 30.07.2021 Revised 06.09.2021 Accepted 26.09.2021

Corresponding author

Irina Ya. Tseimakh: Altai State Medical University, 40, Lenina Prospect, Barnaul, 656038, Russia. E-mail: irintsei@mail.ru

Цеймах И.Я. и др. / Journal of Siberian Medical Sciences 4 (2021) 67-79

The effect of polymorphic markers of genes of proteins involved in the folate metabolism on the course and outcomes of the viral lung damage associated with SARS-CoV-2 infection

I.Ya. Tseimakh1, G.I. Kostuchenko2, D.E. Bogachev1, O.A. Zubova3, T.A. Kornilova4, A.G. Harlova3, I.P. Kramar4, A.E. Tseimakh1, Ya.N. Shoyhet1

'Altai State Medical University (Barnaul) 2Regional Clinical Hospital (Barnaul) 3Altai Regional Hospital for War Veterans (Barnaul) 4City Hospital No. 5 (Barnaul)

ABSTRACT

Introduction. Infection with human coronavirus 2 (SARS-CoV-2) associated with severe acute respiratory syndrome, forms polymorphous pattern of the infectious disease (COVID-19) in the range from mild acute respiratory infection to severe and life-threatening variations of systemic infection with respiratory tract involvement. Among significant predictors of the severe course and lethal outcome in the individuals with lung affection associated with COVID-19 infection, the increase of plasma levels of D-dimer, homocysteine, and some single-nucleotide polymorphisms (SNPs) of genes of the folate cycle proteins are singled out.

Aim. To assess the role of genetic markers of folic acid metabolic disorders in the development of symptoms and the outcomes of viral lung damage associated with SARS-CoV-2 infection in the hospitalized patients.

Materials and methods. In an open prospective comparative study the assessment of outcomes depending on polymorphic markers of protein genes of the folate cycle and the use of fixed combination of folic acid and vitamins В6, В in comprehensive therapy was performed in 117 patients with lung damage associated with SARS-CoV-2 infection. Results. Patients showed an increased relative risk of the heterozygous minor G-allele carriage of 66AG SNP of the methionine synthase reductase gene (MTRR). The homozygous MTRR G66G genotype was associated with indicators of anemia and thrombocytopenia. A statistically significant decrease in the odds ratio in achieving negative results for SARS-CoV-2 RNA detection by the 14th day of therapy in patients with the heterozygous 677CT genotype and the homozygous 677TT genotype of the MTHFR (methylenetetrahydrofalate reductase) gene was established.

Conclusion. Lung damage caused by SARS-CoV-2 infection is associated with an increased risk of genetic metabolic disorder of folate and vitamin B12.

Keywords: single-nucleotide polymorphisms of genes, MTRR 66AG, MTHFR 677CT, MTHFR 677TT, folic acid, SARS-CoV-2, viral lung damage.

C itation example: Tseimakh I.Ya., Kostuchenko G.I., Bogachev D.E., Zubova O.A., Kornilova T.A., Harlova A.G., Kramar I.P., Tseimakh A.E., Shoyhet Ya.N. (2021). The effect of polymorphic markers of genes of proteins involved in the folate metabolism on the course and outcomes of the viral lung damage associated with SARS-CoV-2 infection. Journal of Siberian Medical Sciences, 4, 67-79. doi: 10.31549/2542-1174-2021-4-67-79

ВВЕДЕНИЕ

Инфицирование человека ассоциированным с тяжелым острым респираторным синдромом коронавирусом 2 (8ЛК8-СоУ-2) формирует полиморфную картину инфекционного заболевания (СОУГО-19) в диапазоне от легких форм острой респираторной инфекции до тяжелых и угрожающих жизни вариантов течения системной инфекции с вовлечением дыхательных путей [1, 2]. Среди значимых предикторов тяжелого течения и летального исхода у больных с поражением легких, ассоциированным с инфекционным заболеванием ООУГО-19, выделяют увеличение плазменного содержания Б-димеров, гомоцистеина,

INTRODUCTION

Infection with human coronavirus 2 (SARS-C0V-2) associated with severe acute respiratory syndrome, forms polymorphous pattern of the infectious disease (COVID-19) in the range from mild acute respiratory infection to severe and life-threatening variations of systemic infection with respiratory tract involvement [1, 2]. Among significant predictors of the severe course and lethal outcome in the individuals with lung affection associated with COVID-19 infection the increase of plasma levels of D-dimer, homocysteine, and some single-nucleotide polymorphisms (SNP) of protein genes — participants of the folate cycle are singled out [3, 4].

Tseimakh I.Ya. et al. / Journal of Siberian Medical Sciences 4 (2021) 67-79

некоторые однонуклеотидные полиморфизмы (single nucleotide polymorphisms — SNP) генов белков — участников фолатного цикла [3, 4].

Гипергомоцистеинемия возникает вследствие нарушения метаболизма одноуглеродного фолата при участии ряда ферментов и витаминов группы В [5, 6]. Увеличение содержания в крови гомоцистеина может быть обусловлено дефицитом кофакторного метаболизма фолиевой кислоты и витамина В12. Генетический полиморфизм ряда белков фолатного цикла связан с повышенным риском гипергомоцистеинемии, прогрессирования атеросклероза, венозных тромбоэмболических осложнений, дефицитом активной формы витамина B и анемией [7, 8]. Потенциальная роль гипергомоцистеинемии, генетических и экзогенных факторов риска дефицита фолиевой кислоты и витамина В12 у пациентов с инфекционным заболеванием COVID-19 привлекает внимание исследователей.

В доступной нам литературе мы не встретили исследований клинической эффективности применения фолиевой кислоты во взаимосвязи с генетическими полиморфизмами генов белков — участников фолатного метаболизма.

ЦЕЛЬ ИССЛЕДОВАНИЯ

Оценить роль генетических маркеров нарушений метаболизма фолиевой кислоты в развитии симптомов и исходов ассоциированного с коро-навирусом SARS-CoV-2 поражения легких у госпитализированных пациентов, получающих дополнительно к стандартной терапии фолиевую кислоту в фиксированной комбинации с витаминами В6, В12.

МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ

В открытое проспективное сравнительное исследование было включено 117 больных с поражением легких, ассоциированным с инфицированием коронавирусом SARS-CoV-2. Проведение исследования было одобрено комитетом по этике при Алтайском государственном медицинском университете (протокол № 7 от 03.07.2020). Критериями включения явилось соблюдение следующих условий: предоставление пациентом письменного информированного согласия на участие в исследовании; возраст > 18 лет; подтвержденный выделением РНК SARS-CoV-2 диагноз новой короновирусной инфекции, установленный в соответствии с действующими стандартами [9]; уточненное по результатам проведенной до начала лечения компьютерной томографии (КТ) вирусное поражение легких. Критерии исключе-

Hyperhomocysteinemia occurs due to one-carbon folate metabolism disorder involving a series of enzymes and B vitamins [5, 6]. Hyperhomocystein-emia may be caused by the folic acid and vitamin В12 cofactor metabolism deficiency. Genetic polymorphism of a number of proteins of the folate cycle is related to the increased risk of hyperhomocystein-emia, atherosclerosis progression, venous thrombo-embolic complications, vitamin B12 active form deficiency and anemia [7, 8]. The potential role of hyperhomocysteinemia, genetic and exogenic risk factors of folic acid and vitamin B12 deficiency in patients with COVID-19 infection draws attention of the researchers.

We have not found any studies on the clinical efficacy of folic acid use in relation to genetic polymorphisms of genes, encoding proteins involved in the folate metabolism, in the available literature.

AIM OF THE RESEARCH

To assess the role of genetic markers of metabolic disorders of folic acid in the development of symptoms and outcomes of the viral lung damage associated with SARS-CoV-2 infection in the hospitalized patients receiving folic acid in the fixed combination with В , В vitamins in addition to the conventional

6' 12

therapy.

MATERIALS AND METHODS

In an open prospective comparative study 117 individuals with lung damage associated with SARS-CoV-2 infection were included. The study was approved by the Ethics Committee of Altai State Medical University (Protocol No. 7 by June 3, 2020). Inclusion criteria specified as follows: the patient's written informed consent for study participation; age > 18 years; the diagnosis of a novel coronavirus infection confirmed by SARS-CoV-2 RNA isolation, made according to current standards [9]; the viral lung involvement specified by results of computer tomography (CT) prior to therapy initiation. Exclusion criteria were specified as follows: impaired con-siousness; unstable hemodynamics (systolic blood pressure less than 90 mm Hg, or diastolic blood pressure less than 60 mm Hg, diuresis less than 20 ml/h); the volume of viral lung lesion > 50% according to CT; the need for mechanical ventilation of the lungs.

The study group included 78 patients who provided additional consent to receive the folic acid at a daily dose of 15 mg as a part of combined preparation, containing 5 mg of folic acid, 4 mg of pyridoxine hydrochloride, 6 ^g of cyanocobalamin. The control

Цеймах И.Я. и др. / Journal of Siberian Medical Sciences 4 (2021) 67-79

ния: нарушение сознания, нестабильная гемодинамика (систолическое АД менее 90 мм рт. ст. или диастолическое АД менее 60 мм рт. ст., диурез менее 20 мл/ч), объем вирусного поражения легких > 50 % по данным КТ, необходимость механической вентиляции легких.

В основную группу были включены 78 пациентов, предоставивших дополнительное согласие на прием в рамках комплексного лечения фолиевой кислоты в суточной дозе 15 мг в составе комбинированного препарата, содержащего в одной таблетке 5 мг фолиевой кислоты, 4 мг пиридок-сина гидрохлорида, 6 мкг цианокобаламина. В группу сравнения вошли 39 пациентов, получавших комплексное лечение без фолиевой кислоты в комбинации с витаминами В6, В12.

Возраст больных основной группы и группы сравнения не имел различий, составив соответственно 57.8 ± 13.5 (59.5 (50.0-67.0)) года и 57.2 ± 12.0 (57.0 (51.0-63.0)) года (p = 0.833). В обеих группах больных сопоставимо преобладали женщины — 46 (59.0 %) в основной группе и 26 (66.7 %; p = 0.545) в группе сравнения. Оценка степени тяжести инфекционного заболевания COVID-19 проводилась по шкале NEWS (National Early Warning Score — Национальная система раннего предупреждения) [10]. Тяжесть заболевания по шкале NEWS варьировала в диапазоне от 1 до 6 баллов, преобладала оценка 1-4 балла — у 65 чел. (83.3 %) в основной группе и 35 чел. (89.7 %; p = 0.518) в группе сравнения. При анализе объема поражения легких по данным КТ с использованием «эмпирической» визуальной шкалы вовлечения паренхимы легких в патологический процесс [9] в основной группе и группе сравнения в сопоставимых соотношениях определялись малые (<25 %, КТ-1) и умеренные (2549 %, КТ-2) объемы вирусного поражения легких. В основной группе и группе сравнения отмечалась гипоксемическая дыхательная недостаточность — 33 (42.3 %) и 17 (43.6 %; p = 0.949) пациентов соответственно. Сопутствующие заболевания имели 57 пациентов (73.1 %) в основной группе и 29 больных (74.4 %; p = 0.943) в группе сравнения. В группах пациентов отсутствовали вакцинированные от гриппа и пневмококковой инфекции.

Все пациенты получали лечение инфекционного заболевания COVID-19 и сопутствующих заболеваний в соответствии с актуальными клиническими рекомендациями [9]. Сопоставимое количество пациентов основной группы и группы сравнения получало противовирусные, анти-тромботические, противовоспалительные препа-

group included 39 patients receiving the comprehensive therapy without folic acid in the combination with B,, B vitamins.

6' 12

Patients' age in the main group and the control one had no differences being respectively 57.8 ± 13.5 (59.5 (50.0-67.0)) and 57.2 ± 12.0 (57.0 (51.063.0)) (p = 0.833) years of age. Females consistently prevailed in both groups — 46 (59.0%) in the main group and 26 (66.7%; p = 0.545) in the control one. The COVID-19 infection severity was assessed according to NEWS (National Early Warning Score) [10]. The severity of disease according to NEWS varied in the range of 1-6 scores, the score of 1-4 prevailed in 65 patients (83.3%) in the main group and 35 patients (89.7%; p = 0.518) in the control group. When analyzing the volume of lung damage according to CT scan data with the application of "empiric" visual scale of the pulmonary parenchyma involvement in the pathologic process [9], in the main group and the control one the low (<25%, CT-1) and moderate (25-49%, CT-2) volumes of lung damage were defined in comparable proportions. In the main group and the control one hypoxemic respiratory failure was noted in 33 (42.3%) and 17 (43.6%; p = 0.949) patients respectively. 57 patients (73.1%) in the main group and 29 patients (74.4%; p = 0.943) in the control group had concomitant diseases. There were no patients vaccinated against influenza and pneumococcus in the groups.

All the patients received the therapy for COVID-19 infection and concomitant disease according to current clinical guidelines [9]. The comparable number of patients from the main group and the control one received antiviral, antithrombotic, and anti-inflammatory drugs, systemic glucocorticoste-roids, and oxygen insufflation.

Standard methods of clinical laboratory and instrumental diagnostics were applied for patients' examination. BC-5800, BC-5300 hemoanalyzers (Shenzhen Mindray Bio-Medical Electronics Co., Ltd., China) were used. Highly sensitive C-reactive protein was determined by latex immunoturbidimet-ric assay using Roche Diagnostics test-kits (Germany). Solid-phase immunoturbidimetric assay using Siemens Healthcare Diagnostics test-kits (Germany) was used to detect the plasma D-dimer level. The fibrinogen concentration in plasma was determined with the application of Sysmex CS-2000i (Siemens Healthcare Diagnostics, Japan) and AK-37 (Astra Lab, Russia) automatic coagulation analyzers.

The study of allelic polymorphism of genes of the folate cycle proteins was carried out using the real-time polymerase chain reaction (RT-PCR).

Tseimakh I.Ya. et al. / Journal of Siberian Medical Sciences 4 (2021) 67-79

раты, системные глюкокортикостероиды, инсуф-фляцию кислорода.

Для обследования пациентов применялись стандартные методы клинической лабораторной и инструментальной диагностики. Использовались гемоанализаторы BC-5800, BC-5300 (Shenzhen Mindray Bio-Medical Electronics Co., Ltd., Китай). Определение высокочувствительного С-реактивного белка (СРБ) выполнялось с применением латексного иммунотурбидиметри-ческого метода с использованием тест-систем фирмы Roche Diagnostics (Германия). Для оценки плазменного содержания D-димеров использовался твердофазный иммунотурбидиметриче-ский метод с применением тест-систем фирмы Siemens Healthcare Diagnostics (Германия). Определение концентрации фибриногена в плазме выполнялось на автоматических коагулометрах Sysmex CS-2000i (Siemens Healthcare Diagnostics, Япония) и АК-37 («Астра Лаб», Россия).

Исследование аллельного полиморфизма генов белков — участников фолатного цикла проводилось с применением метода полимеразной цепной реакции в режиме реального времени. Выделение нуклеиновых кислот выполнялось с помощью наборов «Проба-Рапид-Генетика» («ДНК-Технология», Россия). Амплификация с последующим анализом кривых плавления осуществлялась на амплификаторе DTprime («ДНК-Технология», Россия) с применением реагентов «Кардио-Генетика Тромбофилия» и «Генетика Метаболизма Фолатов» производства «ДНК-Технология» (Россия). В качестве референсных пределов частот однонуклеотидных аллельных полиморфизмов генов белков — участников фолатного метаболизма использовались, с согласия автора, результаты исследования здоровых лиц, проведенного Л.А. Строзенко [11].

Статистический анализ и графическое представление данных выполнены с помощью пакета статистических программ SigmaPlot 11.0 (Systat Software, США), пакета Microsoft Excel (Microsoft Corporation, США). Характер распределения изучаемых показателей оценивали с помощью критерия Шапиро — Уилка. Для характеристики выборочных данных использовались методы описательной статистики: рассчитывались медиана (Me), нижний (Q1) и верхний (Q3) квартили; определялись среднее арифметическое выборки (M) и стандартное отклонение (SD). Данные представлены в виде M ± SD и Me (Q1-Q3). При сравнении двух групп с нормальными распределениями данных использовался t-критерий Стьюдента для связанных выборок. В случае,

Nucleic acids were extracted with the use of PREP-RAPID GENETICS kit (DNA-Technology, Russia). Amplification with the subsequent analysis of melting curves using DTprime amplifier (DNA-Technol-ogy, Russia) with the use of Cardio Genetics Trom-bophilia and Genetics of Folate Metabolism kits (DNA-Technology, Russia). As reference limits of frequency of single-nucleotide allelic polymorphisms of genes of proteins participating in the folate metabolism were used, with author's consent, the results of healthy individuals' study carried out by L.A. Strozenko [11].

Statistical analysis and graphic imaging of the data were made with the use of SigmaPlot 11.0 statistical software package (Systat Software, USA), Microsoft Excel software package (Microsoft Corporation, USA). The distribution pattern was estimated using the Shapiro-Wilk test. To characterize the sample data the methods of descriptive statistics were used: median (Me), lower quartile (Q1) and upper quartile (Q3) were calculated; the arithmetic mean of the sample (M) and standard deviation (SD) were determined. Data are presented as M ± SD and Me (Q1-Q3). When comparing two groups with normal data distributions, the Student's t-test for related samples was used. In the case when at least in one of the two compared groups the data did not obey the law of normal distribution, nonparametric methods were applied. The Mann-Whitney U-test was used as a nonparametric test to compare two unrelated groups. To assess the degree of probability of conjugation of qualitative phenotypic or geno-typic signs with the probability of the disease development, methods of relative risk analysis using four-field tables were applied. Data were represented as relative risk (RR) and 95% confidence interval (95% CI).

To predict the probability of a causal relationship of quantitative and qualitative independent variables with binary trait or binary disease outcome, logistic regression models were constructed using the procedure for including and excluding predictors by evaluating Wald statistic. The likelihood ratio test was used to assess the quality of the model: the higher likelihood ratio, the better is the consistency of the model with the sampled data.

When testing null statistical hypotheses, the critical value of the statistical significance level was assumed to be 0.05.

RESULTS AND DISCUSSION

A duration of the novel coronavirus infection from the onset of the disease to the moment of hospi-talization was similar both in the main group and

Цеймах И.Я. и др. / Journal of Siberian Medical Sciences 4 (2021) 67-79

когда хотя бы в одной из двух сравниваемых групп данные не подчинялись закону нормального распределения, применялись непараметрические методы. В качестве непараметрических тестов использовали критерий Манна — Уитни для сравнения двух несвязанных групп. Для оценки степени вероятности сопряжения качественных фенотипических или генотипических признаков с вероятностью развития заболевания использовались методы анализа относительного риска по четырехпольным таблицам. Данные представлялись в виде относительного риска (ОР) и 95% доверительного интервала (95% ДИ). Для прогнозирования вероятности причинно-следственной связи количественных и качественных независимых переменных с бинарным признаком или бинарным исходом заболевания проводилось построение моделей логистической регрессии с использованием процедуры включения и исключения предикторов посредством оценки статистики Вальда. Метод отношения правдоподобия использовался для оценки качества модели, при большем отношении правдоподобия определялась лучшая согласованность модели с выборочными данными.

При проверке нулевых статистических гипотез критическое значение уровня статистической значимости принималось равным 0.05.

РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ

Продолжительность новой коронавирусной инфекции от начала заболевания до момента госпитализации была одинаковой в основной группе и группе сравнения, составив соответственно 6.6 ± 4.8 (5.0 (3.0-9.0)) и 6.5 ± 4.0 (4.0 (3.0-9.8)) дня (р = 0.979). Длительность стационарного лечения вирусного поражения легких, ассоциированного с СОУГО-19, составила 17.2 ± 6.1 (15.5 (13.0-20.0)) дня в основной группе и 15.8 ± 5.0 (16.0 (12.0-18.8)) дня в группе сравнения (р = 0.417).

Между пациентами основной группы и группы сравнения до начала терапии не было выявлено различий по показателям красной крови, количеству лейкоцитов и их субпопуляций, количеству тромбоцитов, индикаторам воспаления — С-реактивному белку, фибриногену (табл. 1). В основной группе было в большей степени повышено плазменное содержание Б-димеров.

Для изучения механизмов синтропии ассоциированного с коронавирусом 8АЯ8-СоУ-2 поражения легких и повышенного риска тромботиче-ских осложнений, микроангиопатии изучена

control one, having constituted 6.6 ± 4.8 (5.0 (3.09.0)) and 6.5 ± 4.0 (4.0 (3.0-9.8)) days (p = 0.979) respectively. A duration of in-patient treatment of viral lung disease associated with COVID-19 was 17.2 ± 6.1 (15.5 (13.0-20.0)) days in the main group and 15.8 ± 5.0 (16.0 (12.0-18.8)) days in the control group (p = 0.417).

Before the start of therapy, there were no differences between the patients of the main group and comparison group in terms of red blood counts, number of leucocytes and their subpopulations, number of platelets, inflammatory parameters — C-reactive protein, fibrinogen (Table 1). In the main group the plasma content of D-dimer was increased to a greater extent.

To study the syntrophic mechanisms of lung damage associated with SARS-CoV-2, the increased risk of thrombotic complications and microangiopa-thy, the prevalence of minor allele of single-nucleo-tide polymorphisms of genes of proteins involved in the folate metabolism in patients with coronavirus infection was studied (Fig. 1).

In patients with lung disease caused by SARS-CoV-2 infection the odds ratio (OR) of heterozygous minor G-allele carriage of methionine synthase reductase gene (MTRR) 66AG (p < 0.001) SNP is significantly increased, as compared to its incidence in the group of healthy individuals. A tendency to an increase of the OR heterozygous minor G-allele carriage of methionine synthase gene (MTR) 2756AG SNP (p = 0.059) was noted.

To assess the effect of RBC and PLT indices on the probability of minor G-allele carriage of MTRR 66GG SNP in patients with lung damage caused by SARS-CoV-2 infection the logistic regression analysis was used (Table 2).

The statistically significant relationship between the MCH decrease and prognostic probability of homozygous carriage of minor G-allele SNP of the MTRR 66GG gene. The RBC count decrease in the peripheral blood was associated with OR increase of homozygous carriage of minor G-allele of the MTRR 66GG gene SNP being nearly statistically significant (p = 0.052). When the indices of hemoglobin, hematocrit, MCV, RDW-CV, PLT count being included additionally, the high quality of the model consistency with the sampled data was obtained. The established causal relationship allows considering the indices of anemia and thrombocytopenia, primarily the mean corpuscular hemoglobin (MCH), as indicators of probability of the MTRR 66GG gene SNP.

To make a prognosis of the effect of genetic polymorphisms of genes of the folate cycle proteins and

Tseimakh I.Ya. et al. / Journal of Siberian Medical Sciences 4 (2021) 67-79

Таблица 1. Гематологические показатели, индикаторы воспаления и тромбогенного риска у больных новой коронавирусной инфекцией (COVID-19) до лечения

Table 1. Blood values, inflammatory parameters and thrombogenic risk in patients with the novel Coronavirus infection (COVID-19) before treatment

Показатель Index Основная группа Main group (n = 78) Группа сравнения Control group (n = 39) P

Me (Q1-Q3) M ± SD Me (Q1-Q3) M ± SD

СЭ (xio12 кл./л) RBC (xio12 c/l) 4.59 (4.27-4.86) 4.56 ± o.57 4.72 (4.32-5.o7) 4.7o ± o.5o o.173

Hb (г/л) | (g/l) i35.5 (i27.o-i45.o) 135.8 ± 16.1 14o.o (128.3-146.5) 138.6 ± 16.4 o.276

Ht (%) 4o.6 (37.4-42.7) 4o.2 ± 5.1 42.o (38.1-43.o) 41.1 ± 5.1 o.296

MCH, пг / MCH, pg 29.4 (28.o-3o.8) 3o.8 ± 9.7 29.3 (27.9-3o.i) 28.9 ± 1.7 o.512

MCV, фл / fl 87.6 (84.7-9i.5) 86.9 ± 9.6 88.1 (85.9-89.4) 87.7 ± 4.6 o.839

RDW-CV, % i3.2 (12.5-14.I) 13.6 ± 1.7 12.7 (12.2-13.9) 13.1 ± 1.2 o.4o9

СЛ (xio9 кл./л) WBC (xio9 c/l) 6.72 (4.7o-8.5o) 6.91 ± 2.97 6.35 (4.53-7.42) 6.23 ± 2.61 o.247

СТ (xio9 кл./л) PLT (xio9 c/l) 198.5o (171.oo-241.oo) 215.62 ± 79.o2 196.oo (17o.75-263.oo) 22o.92 ± 88.39 o.849

СРБ (мг/л) CRP (mg/l) 41.2 (14.6-73.8) 52.7 ± 5o.1 25.6 (13.8-57.5) 5o.3 ± 56.o o.451

D-димер (мг/л) D-dimer (mg/l) o.84 (o.4o-i.o8) o.92 ± o.74 o.4o (o.24-o.78) o.76 ± 1.14 o.o28

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

Фибриноген (г/ л) Fibrinogen (g/l) 5.4 (4.4-6.3) 5.4 ± 1.6 4.3 (3.7-5.6) 4.9 ± 1.9 o.111

Примечание . Здесь и в табл. 2: СЭ — содержание эритроцитов в крови, Hb — гемоглобин, Ht — гематокрит, MCH — среднее содержание гемоглобина в эритроцитах, MCV — средний объем эритроцитов, RDW-CV — ширина распределения эритроцитов, СЛ — содержание лейкоцитов в крови, СТ — содержание тромбоцитов в крови, СРБ — С-реактивный белок.

Note. Here and in Table 2: RBC — red blood cell count; Hb — hemoglobin; Ht — hematocrit; MCH — mean corpuscular hemoglobin; MCV — mean corpuscular volume; RDW-CV — red cell distribution width; WBC — white blood cell count; PLT — platelet count; CRP — С-reactive protein.

распространенность минорных аллелей однону-клеотидных полиморфизмов генов белков — участников метаболизма фолата у пациентов с коронавирусной инфекцией (рис. 1).

У пациентов с поражением легких, вызванным коронавирусом SARS-CoV-2, определено значимо повышенное отношение шансов (ОШ) гетерозиготного носительства минорного аллеля G SNP гена метионинсинтазыредуктазы (MTRR) 66AG (p < 0.001) по сравнению с распространенностью в группе здоровых людей. Отмечена тенденция к увеличению ОШ гетерозиготного носительства минорного аллеля G SNP гена метионинсинтазы (MTR) 2756AG (p = 0.059).

Для определения влияния показателей красной крови и содержания тромбоцитов в крови на вероятность носительства минорного аллеля G SNP гена MTRR 66GG у больных с поражением легких, вызванным коронавирусом SARS-CoV-2, был использован метод построения модели логистического регрессионного анализа (табл. 2).

folic acid administration on the outcomes of viral lung disease associated with SARS-CoV-2 infection, modeling was performed with the use of logistic regression analysis of the probability of achieving negative results of twofold studies of biological material for the SARS-CoV-2 RNA detection during the first 14 days of hospitalization (Table 3). A statistically significant OR reduction in the probability of achieving the first of two negative results of SARS-CoV-2 RNA detection in the biomaterial from the respiratory tract of patients with homozygous carriage of the minor T-allele of MTHFR 677CT gene SNP was found. There was a tendency to a significant OR decrease of obtaining the first negative result of SARS-CoV-2 RNA detection by 14th day of in-patient treatment in patients with the homozygous MTHFR 1298CC genotype. In the created regression model, the relationship between the folic acid administration and the timing of a negative result of SARS-CoV-2 RNA detection was not statistically significant; however, the inclusion of this parameter

Цеймах И.Я. и др. / Journal of Siberian Medical Sciences 4 (2021) 67-79

Выше частота носительства Выше частота носительства

Ген, гетеро-/гомозиготы, редкий аллель; ОР (95% ДИ; р) генов у здоровых людей генов у больных COVID-19

Gene, hetero-/homozygotes, minor allele, OR (95% CI; p) Higher the carriage rate of genes Higher the carriage rate of genes

in healthy individuals in the patients with COVID-19

MTHFR, гетерозиготы, 677СТ; 0.878 (0.673-1.147; 0.377) heterozygotes

MTHFR, гомозиготы, 677ТТ; 1.916 (1.217-3.016; 0.10) homozygotes

MTHFR, гетерозиготы, 1298АС; 1.056 (0.814-1.370; 0.769) heterozygotes

MTHFR, гомозиготы, 1298СС; 0.882 (0.464-1.680; 0.882) homozygotes

MTR, гетерозиготы, 2756AG; 1.425 (1.021-1.988; 0.059) heterozygotes

MTR, гомозиготы, 2756GG; 0.406 (0.149-1.109; 0.097) homozygotes

MTRR, гетерозиготы, 66AG; 1.605 (1.257-2.049; 0.001) heterozygotes

MTRR, гомозиготы, 66GG; 0.794 (0.590-1.068; 0.137) homozygotes

0.25

0.50

1.00

2.00

ОР (95% ДИ), логарифмическая шкала OR (95% CI), logarithmic scale

4.00

Рис. 1. Распределение редких аллелей генов белков — участников метаболизма метионина у пациентов с инфекционным заболеванием COVID-19 в сравнении со здоровыми людьми (ОР — относительный риск; ДИ — доверительный интервал) Fig. 1. Distribution of minor alleles of genes of protein involved in methionine metabolism in the patients with COVID-19 infection compared to healthy individuals (OR — odds ratio; CI — confidence interval)

Таблица 2. Параметры и характеристика модели регрессии для оценки связи показателей красной крови с вероятностью однонуклеотидного полиморфизма гена MTRR 66GG у больных с поражением легких, ассоциированным с COVID-19

Table 2. Parameters and characteristics of a regression model for assessing the relationship of red blood indices with the probability of MTRR 66GG gene SNP in the patients with lung disease, associated with COVID-19

Коэффициент регрессии ± Отношение шансов

Показатель станд. ошибка (95% ДИ) X2 Вальда р Вальда

Index Regression coefficient ± Odds ratio Wald x2 Wald р

standard error (95% CI)

СЭ (х1012 кл./л) RBC (xio12 c/l) -5.317 ± 2.742 0.00491 (0.0000227; 1.058) 3.761 0.052

Hb (г/л) / (g/l) 0.247 ± 0.176 1.280 (0.906; 1.807) 1.61 0.161

MCV, фл / fl 0.300 ± 0.256 1.349 (0.818; 2.227) 1.374 0.241

MCH, пг / pg -1.853 ± 0.932 0.157 (0.0252; 0.974) 3.951 0.047

Ht, % -0.367 ± 0.502 0.693 (0.259; 1.853) 0.534 0.465

RDW-CV, % -0.0613 ± 0.271 0.941 (0.553; 1.600) 0.0511 0.821

СТ (xio9 кл./л) PLT (xio« c/l) 0.00149 ± 0.00440 1.001 (0.993; 1.010) 0.115 0.735

Const 33.738 ± 16.885 4.49 (1.059; 1.904) 3.992 0.046

Модель полностью: Logit P = 33.738 - (5.317 x СЭ) + (0.247 x Hb) + (0.300 x MCV) - (1.853 x MCH) - (0.367 x Ht) -

- (0.0613 x RDW-CV) + (0.00149 x СТ).

Тест отношения правдоподобия: 13.383 (р = 0.063).

-2 x Log (Likelihood) = 57.522 Complete model: Logit P = 33.738 - (5.317 x RBC) + (0.247 x Hb) + (0.300 x MCV) - (1.853 x MCH) - (0.367 x Ht) -

- (0.0613 x RDW-CV) + (0.00149 x PLT). Likelihood ratio test: 13.383 (р = 0.063).

-2 x Log (Likelihood) = 57.522

Tseimakh I.Ya. et al. / Journal of Siberian Medical Sciences 4 (2021) 67-79

Выявлена статистически значимая связь между снижением MCH и прогностической вероятностью гомозиготного носительства минорного аллеля G SNP гена MTRR 66GG. Уменьшение количества эритроцитов в периферической крови ассоциировалось с близким к статистически значимому увеличению ОШ гомозиготного носительства минорного аллеля G SNP гена MTRR 66GG (p = 0.052). При дополнительном включении показателей гемоглобина, гемато-крита, MCV, RDW-CV, количества тромбоцитов крови получено высокое качество согласованности модели с выборочными данными. Установленная причинно-следственная связь позволяет рассматривать показатели анемии и тромбоцито-пении, прежде всего среднее содержание гемоглобина в эритроците, как индикаторы высокой вероятности SNP гена MTRR 66GG.

Для прогнозирования влияния генетических полиморфизмов генов белков — участников фолатного цикла и приема фолиевой кислоты на исходы вирусного поражения легких, связанного с инфицированием вирусом SARS-CoV-2, было выполнено моделирование с помощью метода логистического регрессионного анализа вероятности достижения в течение первых 14 дней госпитализации отрицательного результата двукратных исследований биологического материала на выявление РНК SARS-CoV-2 (табл. 3). Установлено статистически значимое снижение ОШ достижения первого из двух отрицательных результатов определения РНК SARS-CoV-2 в биологическом материале из дыхательных путей пациентов с гетерозиготным носительством минорного аллеля T SNP MTHFR 677CT. Наблюдалась тенденция к достижению значимого снижения ОШ получения первого отрицательного результата выявления РНК SARS-CoV-2 к 14-му дню стационарного лечения у пациентов с гомозиготным генотипом MTHFR 1298CC. В созданной регрессионной модели связь между приемом фолиевой кислоты и сроками достижения отрицательного результата выявления РНК SARS-CoV-2 не была статистически значимой, однако включение этого параметра позволило достигнуть высокого отношения правдоподобия для уравнения логистической регрессии.

Распространенность дефицита фолиевой кислоты у больных с инфекционным заболеванием COVID-19 достигает 11 %, не имеет значительного отличия от популяционных показателей у здоровых людей [12, 13]. Рядом авторов обращено внимание на связь нарушений метаболизма фолие-вой кислоты, витамина В12 с микроангиопатиями,

allowed us to achieve the high likelihood ratio for the logistic regression equation.

The prevalence of folic acid deficiency in patient with COVID-19 infection reaches as high as 11% and does not differ significantly from population rates in healthy individuals [12, 13]. A number of authors take note of the association between the folic acid and vitamin B metabolism disorders, and microan-

12 '

giopathy, symptoms of anemia and thrombocytopenia [14, 15]. Genetically determined disorders of the methionine synthase functioning, including the MTR 2756AG, MTRR 66AG genotypes, are related to methylcobalamin deficiency (one of vitamin B12 forms), leading to disturbances in the synthesis of methionine from homocysteine, as well as associated with the increased risk of anemia [5]. In a number of clinical studies [5-7], the homozygous carriage of minor MTHFR alleles (677TT, 1298CC genotypes) is associated with a high risk of angiopathy, venous thrombosis and pulmonary thrombo-embolism.

Our study demonstrated the increased OR of genetically determined disorders of vitamin B12 metabolism and homocysteine transformation. The significance of a number of anemia indices as indicators of genetically determined folate cycle disorders has been established. The significant reduction of the OR of achieving a negative result of SARS-CoV-2 RNA detection in biological material in patients with heterozygous and homozygous carriage of minor allele T SNP of MTHFR gene (genotypes 677CT, 677TT) by the 14th day of hospitalization was shown, which allows to suggest a relationship between longer SARS-CoV-2 virus persistence and an increased risk of thrombosis and angiopathy. Insufficient statistical significance of the effect on the studied outcome of the disease of the homozygous MTHFR 1298CC genotype may be associated with the limited number of sample observations of patients in our study, and low frequency of these single-nucleotide polymorphisms of genes.

CONCLUSION

The obtained results allow us to draw the following conclusions:

1. The increased relative risk of heterozygous carriage of the minor G-allele of the single-nucleotide polymorphism of the folate cycle enzyme gene MTRR 66AG is observed in patients with the lung disease associated with COVID-19, which may be responsible for the methylcobalamin deficiency.

There is an increase in the odds ratio of homo-zygous carriage of the G-allele of the MTRR 66GG single-nucleotide polymorphism in patients with

Цеймах И.Я. и др. / Journal of Siberian Medical Sciences 4 (2021) 67-79

Таблица 3. Параметры и характеристика модели логистической регрессии для прогнозирования влияния фолатного статуса на достижение к 14-му дню госпитализации отрицательного результата выявления РНК SARS-CoV-2 у больных с вирусным поражением легких, связанным с коронавирусом SARS-CoV-2 Table 3. Parameters and characteristics of a logistic regression model for predicting the effect of folate status on achieving a negative result of SARS-CoV-2 RNA detection by the 14th day of hospitalization in patients with viral lung damage associated with SARS-CoV-2 infection

Показатель Index Коэффициент регрессии ± станд. ошибка Regression coefficient ± standard error Отношение шансов (95% ДИ) Odds ratio (95% CI) X2 Вальда Wald x2 p Вальда Wald р

Прием фолиевой кислоты Folic acid administration -0.455 ± 0.539 o.634 (o.22o; 1.826) o.712 o.399

MTHFR 677CT гетерозиготы heterozygotes -1.508 ± 0.612 o.22i (o.o667; o.734) 6.o73 o.o14

MTHFR 677TT гомозиготы homozygotes -1.572 ± 0.593 o.2o8 (o.o439; o.983) 3.926 o.o48

MTHFR 1298AC гетерозиготы heterozygotes -0.317 ± 0.586 o.728 (o.23i; 2.295) o.294 o.588

MTHFR 1298CC гомозиготы homozygotes -1.668 ± 0.927 o.i89 (o.o3o7; 1.161) 3.236 o.o72

MTRR 66AG гетерозиготы heterozygotes 0.565 ± 0.606 1.759 (o.536; 5.773) o.868 o.351

MTRR 66GG гомозиготы homozygotes 0.205 ± 0.640 1.227 (o.35o; 4.3o5) o.1o2 o.749

Const 2.493 ± 0.734 i2.o99 (2.872; 5o.964) 11.547 <o.ooi

Модель полностью: Logit P = 2.493 - (0.455 x Прием фолиевой кислоты) - (1.508 x MTHFR 677CT) -- (1.572 x MTHFR 677TT) - (0.317 x MTHFR 1298AC) - (1.668 x MTHFR 1298CC) + (0.565 x MTRR 66AG) + + (0.205 x MTRR 66GG).

Тест отношения правдоподобия: 9.127 (р = 0.244).

-2 x Log (Likelihood) = 109.612 Complete model: Logit P = 2.493 - (0.455 x Folic acid administration) - (1.508 x MTHFR 677CT) - (1.572 x MTHFR 677TT) - (0.317 x MTHFR 1298AC) - (1.668 x MTHFR 1298CC) + (0.565 x MTRR 66AG) + (0.205 x MTRR 66GG). Likelihood ratio test: 9.127 (р = 0.244).

-2 x Log (Likelihood) = 109.612

симптомами анемии и тромбоцитопении [14, 15]. Генетически обусловленные нарушения функционирования энзима метионинсинтазы, включая генотипы MTR 2756AG, MTRR 66AG, связаны с дефицитом метилкобаламина (одной из форм витамина В12), ведущим к нарушению образования метионина из гомоцистеина, часто ассоциирующимся с повышенным риском анемии [5]. Гомозиготное носительство минорных аллелей MTHFR (генотипы 677ТТ, 1298CC) ассоциируется в ряде клинических исследований с повышенным риском ангиопатии, венозных тромбозов и легочной тромбоэмболии [5-7].

В нашем исследовании продемонстрировано повышенное ОШ генетически обусловленных нарушений метаболизма витамина В12 и трансформации гомоцистеина. Установлено значение ряда показателей анемии как индикаторов генетически детерминированных нарушений фолат-ного метаболизма. Показано значимое уменьше-

the detected anemia and thrombocytopenia markers.

2. The heterozygous 677CT single-nucleotide polymorphism and the homozygous 677TT polymorphism of the MTHFR gene are associated with the OR decrease of achieving by the 14th day of hospitalization the first of two negative results of SARS-CoV-2 RNA detection in biological material from the respiratory tract in the hospitalized patients with lung damage associated with the COVID-19 infection.

3. The use of prediction and correction methods of folic acid and vitamin B12 metabolism disorders in patients with lung damage associated with SARS-CoV-2 infection, has a potential to develop a strategy of personalized therapy and early rehabilitation of this category of patients.

Conflict of interest. The authors declare no conflict of interest.

Tseimakh I.Ya. et al. / Journal of Siberian Medical Sciences 4 (2021) 67-79

ние ОШ достижения отрицательного результата выявления РНК вируса 8ЛЯ8-СоУ-2 в биологическом материале к 14-му дню госпитализации у пациентов с гетерозиготным и гомозиготным носительством минорного аллеля Т 8МР гена МТИЕЯ (генотипы 677СТ, 677ТТ) что позволяет предположить связь более длительного перси-стирования вируса 8ЛЯ8-СоУ-2 с повышенным риском тромбозов и ангиопатий. Недостаточная статистическая значимость влияния на изучаемый исход заболевания генотипа гомозигот МТИЕЯ 1298СС может быть связана с ограниченным количеством выборочных наблюдений пациентов с СОУГО-19 и низкими частотами этих однонуклеотидных полиморфизмов генов.

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

Полученные результаты позволяют сделать следующие выводы:

1. У пациентов с поражением легких, ассоциированным с СОУГО-19, наблюдается повышенный относительный риск гетерозиготного носи-тельства минорного аллеля О однонуклеотид-ного полиморфизма гена фермента фолатного цикла МТЯЯ 66ЛО, что может обусловливать дефицит метилкобаламина.

Наблюдается увеличение отношения шансов гомозиготного носительства аллеля О однону-клеотидного полиморфизма МТЯЯ 66ОО у пациентов при выявлении маркеров анемии и тром-боцитопении.

2. Однонуклеотидный гетерозиготный полиморфизм 677СТ и гомозиготный полиморфизм 677ТТ гена МТИГЯ ассоциируются с уменьшением отношения шансов достижения к 14-му дню госпитализации первого из двукратно полученных отрицательных результатов определения в биологическом материале из дыхательных путей РНК коро-навируса 8ЛЯ8-СоУ-2 у госпитализированных пациентов с поражением легких, ассоциированным с инфекционным заболеванием СОУГО-19.

3. Применение методов прогнозирования и коррекции нарушений метаболизма фолиевой кислоты и витамина В12 у пациентов с поражением легких, связанным с инфицированием коронавирусом 8ЛЯ8-СоУ-2, имеет потенциал для разработки стратегии персонифицированной терапии и ранней реабилитации этой категории пациентов.

Конфликт интересов. Авторы заявляют об отсутствии конфликта интересов.

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

1. Woolf S.H., Chapman D.A., Lee J.H. COVID-19 as the leading cause of death in the United States / / JAMA. 2021. Vol. 325 (2). P. 123-124. doi: 10.1001/ jama.2020.24865.

2. Piroth L., Cottenet J., Mariet A.S. et al. Comparison of the characteristics, morbidity, and mortality of COVID-19 and seasonal influenza: a nationwide, population-based retrospective cohort study // Lancet. Respirat. Med. 2021. Vol. 9 (3). P. 251-259. doi: 10.1016/ S2213-2600(20)30527-0.

3. Tang N., Li D., Wang X., Sun Z. Abnormal coagulation parameters are associated with poor prognosis in patients with novel coronavirus pneumonia // J. Thromb. Haemost. 2020. Vol. 18 (4). P. 844-847. doi: 10.1111/jth.14768.

4. Yang Z., Shi J., He Z. et al. Predictors for imaging progression on chest CT from coronavirus disease 2019 (COVID-19) patients // Aging. 2020. Vol. 12 (7). P. 6037-6048. doi: 10.18632/aging.102999.

5. Carr D.F., Whiteley G., Alfirevic A., Pirmohamed M. Investigation of inter-individual variability of the one-carbon folate pathway: a bioinformatic and genetic review // Pharmacogenomics J. 2009. Vol. 9. P. 291305. doi: 10.1038/tpj.2009.29.

6. Lupi-Herrera E., Soto-Lopez M.E., Lugo-Dimas A.J. et al. Polymorphisms C677T and A1298C of MTHFR gene: homocysteine levels and prothrombotic bio-markers in coronary and pulmonary thromboembolic disease // Clin. Appl. Thromb. Hemost. 2019. Vol. 25: 1076029618780344. doi: 10.1177/1076029618780344.

REFERENCES

1. Woolf S.H., Chapman D.A., Lee J.H. (2021). COVID-19 as the leading cause of death in the United States. JAMA, 325 (2), 123-124. doi: 10.1001/jama.2020.24865.

2. Piroth L., Cottenet J., Mariet A.S. et al. (2021). Comparison of the characteristics, morbidity, and mortality of COVID-19 and seasonal influenza: a nationwide, population-based retrospective cohort study. Lancet. Respirat. Med., 9 (3), 251-259. doi: 10.1016/S2213-2600(20)30527-0.

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

3. Tang N., Li D., Wang X., Sun Z. (2020). Abnormal coagulation parameters are associated with poor prognosis in patients with novel coronavirus pneumonia. J. Thromb. Haemost., 18 (4), 844-847. doi: 10.1111/ jth.14768.

4. Yang Z., Shi J., He Z. et al. (2020). Predictors for imaging progression on chest CT from coronavirus disease 2019 (COVID-19) patients. Aging, 12 (7), 6037-6048. doi: 10.18632/aging.102999.

5. Carr D.F., Whiteley G., Alfirevic A., Pirmohamed M. (2009). Investigation of inter-individual variability of the one-carbon folate pathway: a bioinformatic and genetic review. Pharmacogenomics J., 9, 291-305. doi: 10.1038/tpj.2009.29.

6. Lupi-Herrera E., Soto-Lopez M.E., Lugo-Dimas A.J. et al. (2019). Polymorphisms C677T and A1298C of MTHFR gene: homocysteine levels and prothrom-botic biomarkers in coronary and pulmonary throm-boembolic disease. Clin. Appl. Thromb. Hemost., 25, 1076029618780344. doi: 10.1177/1076029618780344.

Цеймах И.Я. и др. / Journal of Siberian Medical Sciences 4 (2021) 67-79

7. Abu-Farha M., Al-Sabah S., Hammad M.M. et al. Prognostic genetic markers for thrombosis in COVID-19 patients: a focused analysis on D-dimer, homocysteine and thromboembolism // Front. Pharmacol. 2020. Vol. 11: 587451. doi: 10.3389/fphar.2020.587451.

8. Dehghani-Samani A., Kamali M., Hoseinzadeh-Chah-kandak F. The role of vitamins on the prevention and/ or treatment of COVID-19 infection; a systematic review // Mod. Care J. 2020. Vol. 17 (3): e104740. doi: 10.5812/modernc.104740.

9. Временные методические рекомендации. Профилактика, диагностика и лечение новой коронавирусной инфекции (COVID-19). Министерство здравоохранения Российской Федерации. Версия 7 (03.06.2020). URL: https://static-0.rosminzdrav. ru/system/attachments/attaches/000/050/584/ original/03062020_%D0%9CR_COVID-19_v7.pdf (дата обращения: 24.04.2021).

10. Астафьева М.Н., Багин В.А., Молдованов А.В. и др. Сравнение шкал qSOFA, NEWS и критериев SIRS в прогнозе исходов у пациентов приемного отделения в зависимости от наличия инфекции: результаты проспективного наблюдательного исследования // Клин. микробиология и антимикробная химиотерапия. 2019. Т. 21, № 1. С. 18-25.

11. Строзенко Л.А. Первичная тромбопрофилактика у подростков на основе выявления и модификации постоянных и временных факторов тромбогенного риска: дис. ... д-ра мед. наук: 14.01.08; 14.01.21. Барнаул, 2014. 269 с.

12. Meisel E., Efros O., Bleier J. et al. Folate levels in patients hospitalized with coronavirus disease 2019 // Nutrients. 2021. Vol. 13 (3): 812. doi: 10.3390/ nu13030812.

13. Im J.H., Je Y.S., Baek J. et al. Nutritional status of patients with COVID-19 // Int. J. Infect. Dis. 2020. Vol. 100. P. 390-393.

14. Lee K.T., Teoh C.S., Chew T.K., Goh A.S. Microangio-pathic haemolytic anaemia and thrombocytopenia due to combined vitamin B12 and folate deficiency masquerading as thrombotic thrombocytopenic purpura // J. R. Coll. Physic. Edinb. 2020. Vol. 50 (2). P. 144-147. doi: 10.4997/jrcpe.2020.213.

15. Zhang Q., Shan K.S., Ogunnaike B.A., Amewuame-Kpehor A., Nace T. An exceedingly rare presentation of severe folate deficiency-induced non-immune hemolytic anemia // Cureus. 2020. Vol. 12 (6): e8570. doi: 10.7759/cureus.8570.

СВЕДЕНИЯ ОБ АВТОРАХ

Цеймах Ирина Яковлевна — д-р мед. наук, профессор, доцент, заведующий кафедрой пульмонологии и фтизиатрии ФГБОУ ВО «Алтайский государственный медицинский университет» Минздрава России.

Костюченко Геннадий Иванович — д-р мед. наук, профессор, заведующий отделом лабораторной диагностики КГБУЗ «Краевая клиническая больница» (Барнаул).

Богачев Дмитрий Евгеньевич — клинический ординатор ФГБОУ ВО «Алтайский государственный медицинский университет» Минздрава России.

7. Abu-Farha M., Al-Sabah S., Hammad M.M. et al. (2020). Prognostic genetic markers for thrombosis in COVID-19 patients: a focused analysis on D-dimer, homocysteine and thromboembolism. Front. Pharmacol., 11: 587451. doi: 10.3389/fphar.2020.587451.

8. Dehghani-Samani A., Kamali M., Hoseinzadeh-Chah-kandak F. (2020). The role of vitamins on the prevention and/or treatment of COVID-19 infection; a systematic review. Mod. Care J., 17 (3), e104740. doi: 10.5812/modernc.104740.

9. Temporary methodological recommendations. Prevention, diagnostics and treatment of novel corona-virus infection (COVID-19). Ministry of Health of the Russian Federation. Version 7 (2020). Retrieved on April 24, 2021 from https://static0.rosminzdrav. ru/system/attachments/attaches/000/050/584/ original/03062020_%D0%9CR_COVID-19_v7.pdf. (In Russ.)

10. Astafyeva M.N., Bagin V.A., Moldovanov A.V. et al. (2019). Comparison of the qSOFA, NEWS scores and the SIRS criteria in predicting outcomes in emergency department patients with and without infection: results from a prospective observantional study. Clinical Microbiology and Antimicrobial Chemotherapy, 21,1, 18-25.

11. Strozenko L.A. (2014). Primary thromboprophylaxis in adolescents based on the reveal and modification of constant and temporary factors of thrombogenic risk. Dr. Sci. (Med.) Thesis. Barnaul, 269 p. (In Russ.)

12. Meisel E., Efros O., Bleier J. et al. (2021). Folate levels in patients hospitalized with coronavirus disease 2019. Nutrients, 13 (3), 812. doi: 10.3390/nu13030812.

13. Im J.H., Je Y.S., Baek J. et al. (2020). Nutritional status of patients with COVID-19. Int. J. Infect. Dis., 100, 390-393.

14. Lee K.T., Teoh C.S., Chew T.K., Goh A.S. (2020). Microangiopathic haemolytic anaemia and thrombocy-topenia due to combined vitamin B12 and folate deficiency masquerading as thrombotic thrombocytopenic purpura. J. R. Coll. Physic. Edinb., 50 (2), 144-147. doi: 10.4997/jrcpe.2020.213.

15. Zhang Q., Shan K.S., Ogunnaike B.A., Amewuame-Kpehor A., Nace T. (2020). An exceedingly rare presentation of severe folate deficiency-induced non-immune hemolytic anemia. Cureus, 12 (6), e8570. doi: 10.7759/ cureus.8570.

ABOUT THE AUTHORS

Irina Ya. Tseimakh — Dr. Sci. (Med.), Professor, Associate Professor, Head, Department of Pulmonology and Phthisiology, Altai State Medical University (Barnaul).

Gennady I. Kostuchenko — Dr. Sci. (Med.), Professor, Head, Department of Laboratory Diagnostics, Regional Clinical Hospital (Barnaul).

Dmitry E. Bogachev — Clinical Resident, Altai State Medical University (Barnaul).

Olga A. Zubova — Chief, Altai Regional Hospital for War Veterans (Barnaul).

Tatyana A. Kornilova — Head, Department of Pulmon-ology, City Hospital No. 5 (Barnaul).

Alena G. Harlova — Medical Deputy Chief, Altai Regional Hospital For War Veterans (Barnaul).

Tseimakh I.Ya. et al. / Journal of Siberian Medical Sciences 4 (2021) 67-79

Зубова Ольга Александровна — начальник КГБУЗ «Алтайский краевой госпиталь для ветеранов войн» (Барнаул).

Корнилова Татьяна Александровна — заведующий отделением пульмонологии КГБУЗ «Городская больница № 5, г. Барнаул».

Харлова Алена Геннадьевна — заместитель начальника госпиталя по медицинской части КГБУЗ «Алтайский краевой госпиталь для ветеранов войн» (Барнаул).

Крамарь Ирина Петровна — врач-пульмонолог КГБУЗ «Городская больница № 5, г. Барнаул».

Цеймах Александр Евгеньевич — канд. мед. наук, ассистент кафедры факультетской хирургии ФГБОУ ВО «Алтайский государственный медицинский университет» (Барнаул).

Шойхет Яков Нахманович — д-р мед. наук, профессор, член-корреспондент РАН, заведующий кафедрой факультетской хирургии ФГБОУ ВО «Алтайский государственный медицинский университет» (Барнаул).

Irina P. Kramar — Pulmonologist, City Hospital No. 5 (Barnaul).

Alexandr E. Tseimakh — Cand. Sci. (Med.), Assistant, Department of Surgery, Altai State Medical University (Barnaul).

Yakov N. Shoyhet — Dr. Sci. (Med.), Professor, Corresponding Member, Academy of Sciences of Russia, Head, Department of Surgery, Altai State Medical University (Barnaul).

•-•-•

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.