CC BY
25
2012, Т. 2, № 1-2
Современное лабораторное обеспечение.
из семей с двумя и более детьми, в которых второй (третий) ребенок посещает детский сад или школу; именно они и составили 75,8% носителей.
Полученные данные свидетельствуют о необходимости вакцинации не только детей, находящихся в организованных коллективах, но и неорганизованным детям из семей с двумя и более детьми.
ГЕНОТИПИРОВАНИЕ РОТАВИРУСОВ ГРУППЫ А МЕТОДОМ ПЦР С ДЕТЕКЦИЕЙ В РЕЖИМЕ РЕАЛЬНОГО ВРЕМЕНИ
Г.Н. Бахтояров, А.А. Марова, С.А. Лободанов, В.В. Зверев, Е.Б. Файзулоев
ФГБУ«НИИ вакцин и сывороток им. И.И. Мечникова» РАМН, лаборатория молекулярной вирусологии, Москва
В странах с развитым здравоохранением рота-вирусная инфекция не несет серьезной опасности для жизни людей, но представляет значительные проблемы в педиатрии. Рекомендуемые ВОЗ протоколы генотипирования ротавирусов основаны на ПЦР с электрофоретической детекцией результатов, что обусловливает высокую трудоемкость теста, сложность в интерпретации результатов и проблемы, связанные с риском кросс-контаминации исследуемых образцов ампликонами, а также не позволяют типировать значительную часть выявляемых штаммов. Поэтому задача разработки более эффективных тест-систем остается актуальной. Целью настоящей работы являлась отработка условий генотипирования ротавирусов группы А методом ПЦР с детекцией в режиме реального времени (ПЦР-РВ).
В работе были использованы 40 биопроб от больных с клиническими проявлениями острой кишечной инфекции, охарактеризованные методами ИФА и ПЦР (ПЦР-РВ) на наличие антигенов и РНК ротавирусов группы А. В качестве системы классификации генотипов были приняты рекомендации ВОЗ (WHO/IVB/08.17, October 2009) и группы исследователей (Jelle Matthijnssens et al., 2008). Для исследований методом мультиплексной ПЦР-РВ использованы праймеры и ДНК-зонды собственной разработки, направленные на дифференциальное выявление РНК ротавирусов группы А генотипов G1, G2, G3, G4, G9, P4, P6, P8, I1, I2. В результате ротавирусы генотипа G1 выявлены в 17,5%, G2 — 2,5%, G3 — 17,5%, G4 — 55%, P4 — 2,5%, P8 — 92,5%, I1 — 77,5% случаев. Доля проб c неопределенным генотипом составила для генотипов G — 7,5%, P — 5%, I — 22,5%. В 2 биопробах выявлена коинфекция 2 типов ротавирусов, что свидетельствует о вероятном вторичном инфицировании госпитальным штаммом. Результаты ПЦР-РВ и генотипирования подтверждали электрофоре-тическим анализом продуктов ПЦР, выборочным секвенированием с последующим филогенетическим анализом. Таким образом, в работе показана перспективность тест-систем на основе ПЦР-РВ для генотипирования (в том числе по маркерным локусам полногеномного, посегментного) ротавирусов группы А. Дальнейшая валидация и совершенствование разработанного подхода позволит предложить альтернативную, менее трудоемкую, более точную и удобную в сравнении с традиционными методами тест-систему для определения генотипа ротавирусов.
ОСОБЕННОСТИ ВАГИНАЛЬНОГО МИКРОБИОЦЕНОЗА ЖЕНЩИН РЕПРОДУКТИВНОГО ВОЗРАСТА С НЕВЫНАШИВАНИЕМ БЕРЕМЕННОСТИ
Л.Т. Баязитова, О.Ф. Тюпкина, В.И. Шайхразиева
ФБУН «Казанский НИИ эпидемиологии и микробиологии Роспотребнадзора», г. Казань
В патогенезе инфекционно-воспалительных заболеваний органов малого таза большую роль играют дисбиотические изменения в вагинальной микрофлоре.
Цель. Изучение характера микро биоценоза влагалища женщин репродуктивного возраста с невынашиванием беременности.
Материалы и методы. Исследовано 40 женщин в возрасте от 18 до 42 лет. Биоматериал с заднего свода влагалища засевали на питательные среды: 5% кровяной агар, желточно-солевой агар, Эндо, MRS агар, Шедлера и тиогликолевую среду по методу Ю.М. Фельдман и соавторов. Идентификацию микроорганизмов проводили по комплексу культу-ральных и морфологических свойств согласно действующим нормативным документам.
Результаты. Установлено, что у 10,5% женщин выявлено состояние вагинального нормобиоценоза. Дисбиотические изменения во влагалищном секрете выявлены
у 89,5% пациенток: выраженный дефицит лак-тобактерий, бифидобактерий и избыточный рост условно-патогенной микрофлоры. Часто высевались бактерии рода Staphylococcus — S. epidermidis (22,4%), S. aureus (24,2%); в 9,5% случаев стафилококковые штаммы оказались метициллинрези-стентными. Дисбиоз влагалища, обусловленный энтеробактериями (E coli, Klebsiella spp, Proteus spp и Enterobacter spp), отмечался у 15,1% обследованных. Вагинальный дисбиоз, выражающийся ростом условно-патогенных бактерий в ассоциации с грибами рода Candida, наблюдался у 15, 9% пациенток.
Таким образом, установлены дисбиотические сдвиги в вагинальном микробиоценозе у 89,5% женщин репродуктивного возраста с невынашиванием беременности. Своевременное выявление и коррекция вагинального дисбиоза позволит оптимизировать тактику ведения данной категории пациентов
ВИДОВОЙ СОСТАВ
И АНТИБИОТИКОЧУВСТВИТЕЛЬНОСТЬ МИКРОФЛОРЫ ГНОЙНОЙ РАНЫ У БОЛЬНЫХ С СИНДРОМОМ ДИАБЕТИЧЕСКОЙ СТОПЫ
Ю.П. Белозерцева1, П.П. Курлаев1, В.А. Гриценко2
1Оренбургская государственная медицинская академия Минздрава РФ, г. Оренбург; 2Институт клеточного и внутри клеточного симбиоза УрО РАН, г. Оренбург
Сахарным диабетом (СД) страдает около 4% населения, а в России число таких больных приближается к 8 млн (Аникин А.И. с соавт., 2009). Синдром диабетической стопы (СДС) осложняет течение СД более чем у 25% пациентов, являясь причиной ампутаций нижних конечностей в 50—70% случаев (Светухин А.М., Прокудина М.В, 2010). Антибактериальная терапия — один из основных подходов к лечению инфицированных поражений стоп у больных СД (Пащина С.Н., Крайнова Л.Е., 2008).
Материалы X съезда ВНПОЭМП, Москва, 12-13 апреля 2012 г.
Инфекция и иммунитет
Цель работы — определение наиболее эффективных антибиотиков для стартовой терапии больных с гнойно-некротическими осложнениями СДС с учетом антибиотикочувствительности микроорганизмов, выделенных из раневого отделяемого у 92 больных СД II типа с гнойными формами СДС, госпитализированных для лечения в НУЗ ОКБ на ст. Оренбург в 2010-2011 гг.
В работе установлено, что в первичных посевах раневого отделяемого наблюдалось преобладание грамположительной кокковой микрофлоры, которую в 57,6% случаев составляли S. aureus, а также коагулазоотрицательные стафилококки и S. pyogenes (по 5,4%). Не несколько реже из раны выделялась грамотрицательная флора, в частности P. aeruginosa и K. pneumonia (по 8,7%), E. coli (5,4% случаев). Представители других видов микроорганизмов можно отнести к минорным патогенам (с частотой выделения < 5%). Большинство выделенных из раневого отделяемого у больных с СДС бактерий, как грампо-ложительных, так и грамотрицательных, проявляли чувствительность к современным карбапенемам — меропенему и имипенему (82,6 и 89,1% штаммов соответственно). Грамотрицательные бактерии и стафилококки относительно часто были чувствительны к ципрофлоксацину (соответственно 82,6 и 77,2%). Цефалоспорины III поколения (цефотаксим, цеф-триаксон) оказались активны в отношении стафилококков и грамотрицательных бактерий (исключая P. aeruginosa). Вместе с тем более 50% выделенных культур микроорганизмов обладали устойчивостью к азитромицину, эритромицину и оксациллину (соответственно 52,2, 56,5 и 76,1% изолятов).
Таким образом, в качестве стартовых (эмпирически выбранных) препаратов для санации ран при СДС следует использовать карбапенемы (можно в монотерапии), ципрофлоксацин и цефалоспорины III поколения (желательно в комбинации). Однако для успешной эрадикации возбудителя требуется проведение терапии, основанной на результатах анализа у конкретного больного с СДС чувствительности раневой микрофлоры к антибактериальным препаратам.
Работа выполнена по проекту совместных исследований учреждений УрО и ДВО РАН.
ОРГАНИЗАЦИЯ ЛАБОРАТОРНОЙ ДИАГНОСТИКИ «КЛЕЩЕВЫХ ИНФЕКЦИЙ» НА ТЕРРИТОРИИ КУРСКОЙ ОБЛАСТИ
М.М. Бернштейн1, О.В. Шеховцова2, А.В. Бунаков1, М.Л. Ковальчук2
Управление Роспотребнадзора по Курской области, г. Курск; 2ФБУЗ «Центр гигиены и эпидемиологии в Курской области», г. Курск
Природно-очаговые клещевые трансмиссивные инфекции, такие, как иксодовый клещевой борре-лиоз (ИКБ), гранулоцитарный анаплазмоз человека (ГАЧ), моноцитарный эрлихиоз человека (МЭЧ) и их сочетанные формы представляют серьезную проблему для здравоохранения. За последнее десятилетие отмечается увеличение удельного веса различных микст-инфекции. С целью их своевременного выявления в Курской области принят к использованию комплекс современных серологических и молекулярно-генетических методов, стандартные протоколы диагностики, которые значи-
тельно увеличивают возможности своевременной дифференциальной диагностики, в первую очередь «клещевых инфекций».
В 2010—2011 гг. в лаборатории особо опасных инфекций исследованы 211 клещей, снятых с людей и собранных методом «на флаг».
Для достоверной и ранней диагностики всех клещевых инфекций нами оптимизированы сроки доставки и исследования клещей с помощью набора реагентов серии «МультиПрайм», позволяющим одновременно детектировать четыре патогена, передаваемых одним и тем же переносчиком, что существенно сокращает время исследования, исключает ошибки при выборке клещей, подлежащих данным исследованиям и расширяет спектр нозологий.
Благодаря использованию в лаборатории ООИ ФБУЗ «Центр гигиены и эпидемиологии в Курской области» мультиплексной тест-системы для ПЦР стало возможным одновременное исследование клещей, снятых с людей и пойманных методом «на флаг», на наличие генетического материала патогенных боррелий, вируса КЭ, моноцитарного эр-лихиоза человека и гранулоцитарного анаплазмоза человека. Так, в 2010 году из 96 исследованных клещей в 6 был обнаружен генетический материал Anaplasma phagocytophilum и в 7 генетический материал патогенных боррелий. В 2011 году набором реагентов серии «МультиПрайм» было исследовано 115 клещей, из которых в 2 клещах были обнаружена анаплазма, в 10 клещах патогенные для человека боррелии и 1 клещ был сочетано инфицирован ана-плазмой и боррелиями. Результатами исследований сывороток крови методом ИФА, подтверждено, что сочетанное инфицирование клещей приводит к микст-инфицированию ИКБ и ГАЧ пострадавших от их укусов. В результате проведения скрининговых исследований клещей с использованием комплекса современных серологических и молекулярно-генетических методов, установлено, что удельный вес инфицированных клещей составляет порядка 10%. Имеет место сочетанное инфицирование клещей генетическим материалом ИКБ и ГАЧ.
МОНИТОРИНГ ЗАБОЛЕВАЕМОСТИ И ЭТИОЛОГИИ ШИГЕЛЛЕЗОВ НА ТЕРРИТОРИИ КАРАЧАЕВО-ЧЕРКЕССКОЙ РЕСПУБЛИКИ В 2002-2011 гг.
С.В. Бескакотов1, К.Х. Болатчиев1, Х.Х. Батчаев2, Т.Д. Пилипенко2, В.И. Арапова2
1Управление Роспотребнадзора по Карачаево-Черкесской Республике, г. Черкесск; ФБУЗ «Центр гигиены и эпидемиологии в Карачаево-Черкесской Республике», г. Черкесск
В структуре заболеваемости бактериальными диареями, имеющими этиологическую расшифровку, на территории Карачаево-Черкесской Республики (КЧР) традиционно лидирует дизентерия.
Изучение многолетних материалов заболеваемости дизентерией в регионе Карачаево-Черкесии по сравнению со среднероссийской позволяет выявить ряд особенностей. Если в 2002—2003 гг. кривые заболеваемости синхронно повторяют друг друга, то в последующие 2004—2005 гг. наблюдаются противоположные тенденции: на фоне стойкого снижения заболеваемости по Российской Федерации, в КЧР ее уровень резко возрастает, превышая интенсивные показатели по стране соответственно в 1,8—2,3 раза.
