Научная статья на тему 'СРАВНИТЕЛЬНАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА МЕТОДОВ КУЛЬТИВИРОВАНИЯ ШТАММОВ CLOSTRIDIOIDES DIFFICILE И ДРУГОЙ АНАЭРОБНОЙ ФЛОРЫ ИЗ ОБРАЗЦОВ КАЛА В РУТИННОЙ ПРАКТИКЕ БАКТЕРИОЛОГИЧЕСКОЙ ЛАБОРАТОРИИ'

СРАВНИТЕЛЬНАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА МЕТОДОВ КУЛЬТИВИРОВАНИЯ ШТАММОВ CLOSTRIDIOIDES DIFFICILE И ДРУГОЙ АНАЭРОБНОЙ ФЛОРЫ ИЗ ОБРАЗЦОВ КАЛА В РУТИННОЙ ПРАКТИКЕ БАКТЕРИОЛОГИЧЕСКОЙ ЛАБОРАТОРИИ Текст научной статьи по специальности «Клиническая медицина»

CC BY
142
19
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
Ключевые слова
КУЛЬТИВИРОВАНИЕ / ЖИДКАЯ СРЕДА / ОБРАЗЦЫ КАЛА / CLOSTRIDIOIDES DIFFICILE / АНАЭРОБЫ

Аннотация научной статьи по клинической медицине, автор научной работы — Швыдкая Мария Геннадьевна, Затевалов А. М., Митрохин С. Д., Джандарова Д. Т.

Цель. Усовершенствовать методику посева кала при бактериологическом анализе по выделению чистых культур анаэробной флоры, в том числе Clostridioides difficile, в рутинной практике микробиологической лаборатории детского онкологического стационара. Материалы и методы. Всего было исследовано 517 образцов кала, взятого однократно у пациентов ФНКЦ ДГОИ им. Дмитрия Рогачева с 2013 по 2015 г. Все образцы были исследованы методом иммуноферментного анализа (ИФА) на наличие токсинов C. difficile и бактериологическим методом по 5 специально разработанным схемам для выделения анаэробных мироорганизмов, включая C. difficile. Статистическую значимость различий в частоте высеваемости штаммов в исследуемых группах (схемах посева) оценивали по критерию χ2. Результаты. Высеваемость токсигенных штаммов C. difficile при использовании схемы посева в печеночный бульон с наслоением технического агара с последующим посевом на анаэробный агар составила 100%. Данная схема также подходит для выделения сопутствующей анаэробной кишечной флоры: нетоксигенных штаммов C. difficile, Clostridium perfringens, других клостридий, Bacteroides fragilis и других бактероидов. Выводы. Использование жидкой среды накопления и наслоение технического агара позволяет выделить анаэробную флору из кала, а также увеличивает высеваемость токсигенных штаммов C. difficile до 100% от положительных результатов ИФА на клостридиальный токсин.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по клинической медицине , автор научной работы — Швыдкая Мария Геннадьевна, Затевалов А. М., Митрохин С. Д., Джандарова Д. Т.

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

COMPARISON OF CULTURE AND ISOLATION METHODS FOR CLOSTRIDIOIDES DIFFICILE AND OTHER ANAEROBES FROM STOOL SAMPLES IN A ROUTINE MICROBIOLOGICAL LABORATORY PRACTICE

Objective. To improve stool sample culture and isolation of anaerobic flora, including Clostridioides difficile in the routine microbiological laboratory practice at the children’s oncology hospital. Materials and methods. A total of 517 stool samples collected from patients in children’s oncology hospital from 2013 to 2015 were studied. All samples were analyzed by ELISA for C. difficile toxins and by culture according to dedicated 5 schemes for isolation of anaerobic bacteria, including C. difficile. Statistical significance of differences in isolation rates between the studied groups (culture schemes) was assessed by Pearson test. Results. Culture in liver broth and covering with technical agar followed by culture on anaerobic agar yielded 100% isolation rate of toxigenic C. difficile strains. This culture scheme is also suitable for isolating concomitant anaerobic flora: non-toxigenic C. difficile strains, Clostridium perfringens, other Clostridia spp. and Bacteroides spp. Conclusions. Use of the liquid accumulation medium and covering with technical agar make it possible to isolate anaerobic flora from stool samples and increase an isolation rate of toxigenic C. difficile strains to 100% of ELISA-positive samples.

Текст научной работы на тему «СРАВНИТЕЛЬНАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА МЕТОДОВ КУЛЬТИВИРОВАНИЯ ШТАММОВ CLOSTRIDIOIDES DIFFICILE И ДРУГОЙ АНАЭРОБНОЙ ФЛОРЫ ИЗ ОБРАЗЦОВ КАЛА В РУТИННОЙ ПРАКТИКЕ БАКТЕРИОЛОГИЧЕСКОЙ ЛАБОРАТОРИИ»

K'M'AiX

https://cmac-journal.ru

КЛИНИЧЕСКАЯ МИКРОБИОЛОГИЯ И АНТИМИКРОБНАЯ ХИМИОТЕРАПИЯ

Теп 23 N°2

2021

DOI: 10.36488/cmac.2021.2.212-216

Оригинальная статья

Сравнительная характеристика методов культивирования штаммов Clostridioides difficile и другой анаэробной флоры из образцов кала в рутинной практике бактериологической лаборатории

Швыдкая М.Г.1, Затевалов А.М.1, Митрохин С.Д.2, Джандарова Д.Т.3

1 ФБУН «Московский НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Г.Н. Габричевского» Роспотребнадзора, Москва, Россия

2 Городская клиническая больница № 67 им. Л.А. Ворохобова, Москва, Россия

3 Диагностический клинический центр № 1, Москва, Россия

Контактный адрес:

Мария Геннадьевна Швыдкая

Эл. почта: [email protected]

Ключевые слова: культивирование, жидкая среда, образцы кала, Clostridioides difficile, анаэробы.

Конфликт интересов: авторы заявляют об отсутствии конфликтов интересов.

Внешнее финансирование: исследование проведено без внешнего финансирования.

Цель. Усовершенствовать методику посева кала при бактериологическом анализе по выделению чистых культур анаэробной флоры, в том числе Clostridioides difficile, в рутинной практике микробиологической лаборатории детского онкологического стационара.

Материалы и методы. Всего было исследовано 517 образцов кала, взятого однократно у пациентов ФНКЦ ДГОИ им. Дмитрия Рогачева с 2013 по 2015 г. Все образцы были исследованы методом иммуноферментного анализа (ИФА) на наличие токсинов C. difficile и бактериологическим методом по 5 специально разработанным схемам для выделения анаэробных мироорганизмов, включая C. difficile. Статистическую значимость различий в частоте высеваемости штаммов в исследуемых группах (схемах посева) оценивали по критерию х2.

Результаты. Высеваемость токсигенных штаммов C. difficile при использовании схемы посева в печеночный бульон с наслоением технического агара с последующим посевом на анаэробный агар составила 100%. Данная схема также подходит для выделения сопутствующей анаэробной кишечной флоры: нетоксигенных штаммов C. difficile, Clostridium perfringens, других клостридий, Bacteroides fragilis и других бактероидов.

Выводы. Использование жидкой среды накопления и наслоение технического агара позволяет выделить анаэробную флору из кала, а также увеличивает высеваемость токсигенных штаммов C. difficile до 100% от положительных результатов ИФА на клостридиальный токсин.

Original Article

Comparison of culture and isolation methods for Clostridioides difficile and other anaerobes from stool samples in a routine microbiological laboratory practice

Shvydkaya M.G.1, Zatevalov A.M.1, Mitrokhin S.D.2, Dzhandarova D.T.3

1 G.N. Gabrichevsky Research Institute for Epidemiology and Microbiology, Moscow, Russia

2 City Clinical Hospital #67 named after L.A. Vorokhobov, Moscow, Russia

3 Diagnostic Clinical Center #1, Moscow, Russia

Objective. To improve stool sample culture and isolation of anaerobic flora, including Clostridioides difficile in the routine microbiological laboratory practice at the children's oncology hospital. Materials and methods. A total of 517 stool samples collected from patients in children's oncology hospital from 2013 to 2015 were studied. All samples were analyzed by ELISA for C. difficile toxins and by culture according to dedicated 5 schemes for isolation of anaerobic bacteria, including C. difficile. Statistical significance of differences in isolation rates between the studied groups (culture schemes) was assessed by Pearson test.

Results. Culture in liver broth and covering with technical agar followed by culture on anaerobic agar yielded 100% isolation rate of toxigenic C. difficile strains. This culture scheme is also suitable for isolating concomitant anaerobic flora: non-toxigenic C. difficile strains, Clostridium perfringens, other Clostridia spp. and Bacteroides spp.

Conclusions. Use of the liquid accumulation medium and covering with technical agar make it possible to isolate anaerobic flora from stool samples and increase an isolation rate of toxigenic C. difficile strains to 100% of ELISA-positive samples.

Contacts:

Maria G. Shvydkaya E-mail: [email protected]

Key words: culture, liquid medium, stool samples, Clostridium difficile, anaerobes.

Conflicts of interest: all authors report no conflicts of interest relevant to this article.

External funding source: no external funding received.

Швыдкая М.Г. и соавт.

Введение

При лечении основного заболевания у пациентов детского онкологического стационара развивается иммуносуппресия, которая провоцирует осложения в виде колитов. В большинстве случаев колит вызывает токсигенный штамм Clostridioides difficile, который можно выявить с помощью иммуноферментного анализа (ИФА) по наличию клостридиального токсина A/B в кале [1]. ИФА у пациентов с иммуносупрессией и лейкопенией обладает низкой чувствительностью, не дает информации об интенсивности бактериальной колонизации, чувствительности микроорганизма к антибиотикам и не учитывает нетоксигенные штаммы C. difficile, которые также могут быть возбудителем колита [2, 3]. Кроме ИФА на токсины C. difficile используются поли-меразная цепная реакция (ПЦР), глутаматдегидрогена-зный тест и ряд других тестов, указывающих на присутствие C. difficile в кале. Для обеспечения метода ПЦР необходимо иметь специально оборудованные помещения, дорогостоящее оборудование и подготовленных специалистов. Известны случаи гипердиагностики, что связано с высокой чувствительностью метода ПЦР [5]. Методика определения глутаматдегидрогеназы в кале имеет преимущество в скорости выдачи ответа, но получаемый результат имеет сложную интерприта-цию [4]. Однако большинство вышеперечисленных тестов только косвенно указывают на присутствие возбудителя и дают неполную информацию, необходимую для выбора терапии. Поэтому эталонным стандартом является бактериологический анализ кала, позволяющий культуральным методом выделить токсигенные штаммы C. difficile.

Культуральный метод имеет ряд ограничений, среди которых длительный срок выдачи ответа, необходимость использования дорогостоящих сред и оборудования для анаэробного культивирования [3-5]. Тем не менее, согласно российским [6, 7] и зарубежным рекомендациям [8], культуральный метод утвержден для диагностики клостридиальной инфекции. В вышеперечисленных методических рекомендациях не указывается алгоритм посева и среда для культивирования, что позволяет каждой лаборатории самостоятельно определять эти параметры.

Согласно результатам сравнительных исследований, наибольшую чувствительность и специфичность при культивировании C. difficile показывает циклосерин-цефок-ситиновый хромогенный агар [6]. Использование этой среды в рутинной практике детского онкологического стационара ограничено его высокой стоимостью. Кроме токсигенных штаммов C. difficile, возбудителями колита также могут быть нетоксигенные штаммы C. difficile, Clostridium innocuum, Clostridium perfringens, Bacteroides fragilis и Bacteroides vultagus [9-12]. Стоит отметить, что все вышеперечисленные анаэробные микроорганизмы могут иметь внекишечную локализацию и способны вызывать заболевания различных органов и систем [13-21], поэтому в практической работе микробиологической ла-

боратории детского онкологического стационара принята своя методика исследования и определенный набор сред для культивирования анаэробной флоры. Данная методика обеспечивает оптимальное соотношение цены и качества исследования, но может быть усовершенствована без увеличения стоимости и трудозатрат.

Цель исследования - усовершенствовать методику посева кала при бактериологическом анализе по выделению чистых культур анаэробной флоры, в том числе C. difficile, в рутинной практике микробиологической лаборатории детского онкологического стационара.

Материалы и методы

В работе было исследовано 517 образцов кала, взятого однократно у пациентов ФНКЦ ДГОИ им. Дмитрия Рогачева в период с 2013 по 2015 г. Были выделены 5 групп в зависимости от схемы посева и типа применяемых сред.

1 группа - посев проводился на агар Шедлер, бульон не использовался;

2 группа - посев проводился на агар Шедлер, использовался печеночный бульон;

3 группа - посев проводился на агар Шедлер, использовался печеночный бульон с наслоением технического агара;

4 группа - посев проводился на анаэробный агар, использовался анаэробный бульон с наслоением технического агара;

5 группа - посев проводился на анаэробный агар, использовался печеночный бульон с наслоением технического агара.

Наличие в кале клостридиального токсина А/В определяли методом ИФА (R-Biopharm, Германия). Для выделения и идентификации штаммов анаэробной флоры использовали культуральный метод, который выполнялся по следующей схеме: посев на жидкую питательную среду - наслаивание технического агара для 3-5 группы (инкубация 24 ч. в анаэростате) - посев на твердую питательную среду (инкубация 24-48 ч. в анаэро-стате) - идентификация колоний.

Посев был выполнен следующим образом: кал вносился в анаэробный бульон (Oxoid, Великобритания) и печеночный бульон (Oxoid, Великобритания) микробиологической петлей (10 мкл). Поверх бульона наслаивали 2 мл технического агара (Oxoid, Великобритания), нагретого до 37°C. Далее материал инкубировался в анаэростате с использованием газпакетов (Oxoid, Великобритания). Затем 0,5 мл осадка петлей наносили на зону сброса в чашке Петри с анаэробным агаром (Oxoid, Великобритания) с добавкой нитроцефина (Oxoid, Великобритания) или с агаром Шедлер (Oxoid, Великобритания) с добавкой нитроцефина и рассевали петлей 1 мкл. Инкубация осуществлялась в анаэростате указанным выше способом. Последующая идентификация колоний до вида проводилась с помощью MALDI-

Швыдкая М.Г. и соавт.

TOF масс-спектрометрии по протоколу компании-производителя (Bruker Daltonic, Германия).

Сбор и обработку данных проводили с использованием лабораторно-информационной системы (SGM Analytix, Швеция) и программы QlikView Personal Edition (SGM Analytix Explorer, Швеция).

Статистическую значимость различий в частоте вы-севаемости штаммов в исследуемых группах оценивали по критерию х2.

Результаты

Результаты исследования нативных фекалий методом ИФА на наличие клостридиального токсина A/B и частота высеваемости штаммов в зависимости от схемы посева представлены в Таблице 1.

Из 517 образцов наибольшее количество посевов было выполнено по схемам 3, 4 и 5. Наличие токсина А/В C. difficile с помощью ИФА было выявлено в 61 (11,8%) образце.

Анаэробные представители микрофлоры кишечника при использовании схемы 1 не были выделены, несмотря на то что 1 образец был положительным в ИФА на клостридиальный токсин. Использование схемы 2 статистически значимо увеличило высеваемость токсигенных штаммов C. difficile, но результат остается на очень низком уровне - 25%. Более высокую высеваемость штаммов показало применение схем 3 и 4 - 61,5% и 68,2% соответственно. Наиболее высокий результат наблюдается при применении схемы 5 - 100%. Таким образом, можно утверждать, что использование жидкой накопительной среды и «пробки» из технического агара значительно повышает высеваемость анаэробной флоры.

Обсуждение

В большинстве лабораторий, в которых занимаются выделением, идентификацией и исследованием штаммов C. difficile, применяют анаэробный агар или агар Шедлер с использованием добавок, заявленных производителем, при этом частота высеваемости C. difficile составляет 68-94% [23]. Использование хромогенных сред ограничено их высокой стоимостью и узким спектром определяемых штаммов. Одним из важных условий культивирования C. difficile является своевременное прекращение доступа кислорода, которое обеспечивается наслоением технического агара. В Таблице 1 показано, что применение данного технического приема в нашем исследовании позволило повысить высевае-мость токсигенных штаммов C. difficile до 100%, тогда как другие схемы продемонстриовали существенно худшие результаты. Увеличилось количество штаммов анаэробной флоры, а именно нетоксигенных клостридий и бактероидов. Сравнение с результатами, полученными в других исследованиях на хромогенной среде, показало, что затраты по времени для хромогенной среды -24 ч., при использовании схемы 5 - 72 ч. По сравнению с хромогенным агаром увеличена высеваемость токсигенных штаммов до 100% (в то время как хро-могенный агар - 94%) и спектр высеваемых культур. Последний факт имеет важное значение, так как, по данным Bauer M. и соавт., нетоксигенные штаммы не вызывают заболевания, а колонизация кишечника неток-сигенными штаммами C. difficile может защитить от колонизации токсигенными штаммами [24]. Также имеются сообщения о том, что нетоксигенные штаммы C. difficile могут быть связаны с некоторыми случаями внутриболь-

Таблица 1. Сравнение схем посева кала на микробиологические среды и частоты высеваемости анаэробной микрофлоры из кала у пациентов детского онкологического стационара

Схемы посева кала на микробиологические среды

1 2 3 4 5

Бульон - Печеночный Печеночный Анаэробный Печеночный

Твердая среда Агар Шедлер Агар Шедлер Агар Шедлер Анаэробный агар Анаэробный агар

Технический агар - - + + +

Всего образцов, n 10 18 179 180 130

Токсин(+) ИФА 1 4 13 22 21

C. difficile tox(+) из токсин(+) ИФА 0% 25,0%1 61,5%12 68,2%12 100%12-3-4

C. difficile tox(+) 0 (0%) 1 (5,6%) 8 (4,5%) 15 (8,3%) 21 (16,2%)

C. difficile tox(-) 0 (0%) 0 (0%) 16 (8,9%) 50 (27,8%) 69 (53,1%)

C. perfringens 0 (0%) 1 (5,6%) 23 (12,8%) 46 (25,6%) 30 (23,1%)

Другие клостридии 0 (0%) 5 (27,8%) 38 (21,2%) 90 (50,0%) 101 (77,7%)

B. fragilis 0 (0%) 0 (0%) 7 (3,9%) 12 (6,7%) 15 (11,5%)

Другие бактероиды 0 (0%) 1 (5,6%) 11 (6,1%) 21 (11,7%) 25 (19,2%)

Значение в верхнем индексе в строке «C. difficile tox(+) из токсин(+) ИФА» указывает на номер схемы посева, с которой имеются статистически значимые различия (p < 0,05).

tox(+) - токсигенные штаммы C. difficile; tox(-) - нетоксигенные штаммы C. difficile.

Швыдкая М.Г. и соавт.

ничной диареи [9, 24, 25]. Данные о роли нетоксиген-ных штаммов Clostridium spp. довольно противоречивы. Так, Chia J. и соавт. указывают на то, что C. innocuum могут вызывать антибиотикоассоциированный колит, а, по данным Kiu R. и соавт., C. perfringens играет важную роль в патогенезе ряда важных кишечных заболеваний человека, включая некротический энтероколит [10, 11]. Имеются сведения о роли бактероидов в патогенезе развития колита. По данным Yu L., B. fragilis вырабатывает энтеротоксин, а B. vultagus способствует развитию колита [12]. Использование отдельных селективных сред для идентификации этих микроорганизмов значительно увеличивает трудозатраты и стоимость анализа [26-29]. Доступные тест-системы в рутинной практике для микробиологической лаборатории неудобны и имеют высокую стоимость [30, 31]. Данные, полученные в нашем исследовании, показывают, что все вышеперечисленные микроорганизмы можно выделять и идентифицировать, не используя отдельные селективные среды, а применяя только стандартные, доступные в рутинной практике среды для культивирования анаэробной флоры.

Заключение

Использование усовершенствованного метода посева при бактериологическом анализе по выделению анаэробной флоры из кала увеличивает высеваемость токсигенных штаммов C. difficile до 100% от положительных результатов ИФА на клостридиальный токсин, что позволяет значительно улучшить диагностику, лечение и профилактику инфекций, вызванных C. difficile. Использование усовершенствованного метода посева также позволяет существенно снизить трудозатраты и стоимость анализа по сравнению с методом, предполагающим использование селективных хромогенных сред для каждого микроорганизма, который может быть причиной колита у пациентов детского онкологического стационара при лечении основного заболевания.

Благодарность

Авторы выражают благодарность Тутельяну А.В. за помощь в организации исследования.

Литература

1. Jain T., Croswell C., Urday-Cornejo V., Awali R., Cutright J., Salimnia H., et al. Clostridium difficile colonization in hematopoietic stem cell transplant recipients: a prospective study of the epidemiology and outcomes involving toxigenic and nontoxigenic strains. Biol Blood Marrow Transplant. 2016;22(1):157-163. DOI: 10.1016/j. bbmt.2015.07.020

2. Al-Rawahi G.N., Al-Najjar A., McDonald R., Deyell R.J., Golding G.R., Brant R., et al. Pediatric oncology and stem cell transplant patients with healthcare-associated Clostridium difficile infection were already colonized on admission. Pediatr Blood Cancer. 2019;66(5):e27604. DOI: 10.1002/pbc.27604

3. Erb S., Frei R., Stranden A.M., Dangel M., Schudin-Sutter S.T., Widmer A.F. Low sensitivity of fecal toxin A/B enzyme immunoassay for diagnosis of Clostridium difficile infection in immunocompromised patients. Clin Microbiol Infect. 2015;21(11):998.e9-998.e15. DOI: 10.1016/j. cmi.2015.07.016

4. Stahlmann J., Schönberg M., Herrmann M., von Müller L. Detection of nosocomial Clostridium difficile infections with toxigenic strains despite negative toxin A and B testing on stool samples. Research Note Epidemiology. 2014;20(9):0590-0592. DOI: 10.1111/14690691.12558

5. Origüen J., Corbella L., Orellana M.A., Villa J., Delgado R., August A. Comparison of the clinical course of Clostridium difficile infection in glutamate dehydrogenase-positive toxin-negative patients diagnosed by PCR to those with a positive toxin test. Clin Microbiol Infect. 2018;24(4):414-421 DOI: 10.1016/j.cmi.2017.07.033

6. Clostridium difficile-associated diarrhea. National

Швыдкая М.Г. и соавт.

Association of Specialists in the Control of Infections Associated with the Provision of Medical Care (NP "NASCI"). Federal clinical guidelines, 2017. Russian. (Clostridium difficile-ассоциированная диарея. Национальная ассоциация специалистов по контролю инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи (НП «НАСКИ»). Федеральные клинические рекомендации, 2017.)

7. Shelygin Yu.A., Aleshkin V.A., Sukhina M.A., Mironov A.Yu., et al. Clinical recommendations of the National Association of Specialists in Control of Infections Associated with the Provision of Medical Assistance, and the All-Russian Public Non-Profit Organization Association of Coloproctologists of Russia for Diagnostics, treatment and prevention of Clostridium difficile-associated diarrhea (CDI). Koloproktologiya. 2018;3(65):7-23. Russian. (Шелыгин Ю.А., Алешкин В.А., Сухина М.А., Миронов А.Ю. и соавт. Клинические рекомендации национальной ассоциации специалистов по контролю инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи, и общероссийской общественной некоммерческой организации «Ассоциация колопроктологов России» по диагностике, лечению и профилактике Clostridium difficile-ас-социированной диареи (CDI). Колопроктология. 2018;3(65):7-23.) DOI: 10.33878/2073-7556-2018-03-7-23

8. Crobach M.J., Planche T., Eckert C., Barbut F., Terveer E.M., Dekkers O.M. European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases: update of the diagnostic guidance document for Clostridium difficile infection. Clin Microbiol Infect. 2016;22:S63-S81. DOI: 10.1016/j. cmi.2016.03.010

9. Camorlinga M., Sanchez-Rojas M., Torres J., Romo-Castillo M. Phenotypic Characterization of non-toxigenic

Clostridioides difficile strains isolated from patients in Mexico. Front Microbiol. 2019;10(84):1-10. DOI: 10.3389/fmicb.2019.00084

10. Chia J.-H., Wu T.-S., Wu T.-L.,Chen C.-L., Chuang C.-H., Su L.-H., et al. Clostridium innocuum is a vancomycin-resistant pathogen that may cause antibiotic-associated diarrhoea. Clin Microbiol Infect. 2018;24(11):1195-1199. DOI: 10.1016/j.cmi.2018.02.015

11. Kiu R., Hall L.J. An update on the human and animal enteric pathogen Clostridium perfringens. Emerg Microbes Infect. 2018;7:141. DOI: 10.1038/s41426-018-0144-8

12. Yu L.C. Microbiota dysbiosis and barrier dysfunction in inflammatory bowel disease and colorectal cancers: exploring a common ground hypothesis. J Biomedical Science. 2018;25(1):79. DOI: 10.1186/s12929-018-0483-8

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

13. Borisov O.O., Efremov E.M. Bacteremia due to Clostridium difficile: literature review. WORLD SCIENCE: PROBLEMS AND INNOVATIONS. Articles of the XXXI International Scientific and Practical Conference. Science and Education. 2019. Russian. (Борисов О.О., Ефремов Е.М. Бактеремия, вызванная Clostridium difficile: обзор литературы. WORLD SCIENCE: PROBLEMS AND INNOVATIONS. Сборник статей XXXI Международной научно-практической конференции. Наука и Просвещение. 2019.)

14. Yamamoto Y., Itoh N., Sugiyama T., Kurai H. Clinical features of Clostridium bacteremia in cancer patients: A case series review. J Infect Chemother. 2020;26(1):92-94. DOI: 10.1016/j.jiac.2019.07.019

15. Millard M.A., McManus K. A., Wispelwey B. Severe sepsis due to Clostridium perfringens bacteremia of urinary origin: a case report and systematic review. Case Rep Infect Dis. 2016;2016:2981729. DOI: 10.1155/2016/2981729

16. Madsen R.I., Justesen U.S. Bacteremia with Bacteroides pyogenes after a cat bite. J Clin Microbiol. 2011;49(8): 3092-3093. DOI: 10.1128/JCM.00250-11

17. Hsu G., Chen C., Lai M., Luh S. Chest wall abscess due to Prevotella bivia. J Zhejiang Univ Sci B. 2009;10(3):233-236. DOI: 10.1631/jzus.B0820289

18. Di Marco Berardino A., Inchingolo R., Smargiassi A., Re A., Torelli R., Fiori B., et al. Empyema caused by Prevotella bivia complicating an unusual case of spontaneous chylothorax. J Clin Microbiol. 2014;52(4):1284-1286. DOI: 10.1128/ JCM.03282-13

19. Mehmood M., Jaffar N. A., Nazim M., Khasawneh F.A. Bacteremic skin and soft tissue infection caused by Prevotella loescheii. BMC Infect Dis. 2014;14:162. DOI: 10.1186/1471-2334-14-162

20. Mo S., Wei L., Chen H., Li R., Li S., Luo G. A chinese case of Prevotella intermedia and Streptococcus constellatus intracranial mixed infection. Metab Brain Dis. 2018;33(1):161 -166. DOI: 10.1007/s11011-017-0142-x

21. Litusov N.V. Genus Bacteroides. Illustrated tutorial. FGBOU VO USMU, Yekaterinburg, 20172017. 17 p. Russian. (Ли-тусов Н.В. Род Bacteroides. Иллюстрированное учебное пособие. ФГБОУ ВО УГМУ, Екатеринбург, 2017. 17 с.)

22. Mirzaei E.Z., Rajabnia M., Sadeghi F., Ferdosi-Shahandashti E., Sadeghi-Haddad-Zavareh M., Khafri S., et al. Diagnosis of Clostridium difficile infection by toxigenic culture and PCR assay. Iran J Microbiol 2018;10(5):287-293.

23. Shannon S., Gustafson D., Segner R., Ali A., Schieffer B., Boelman K., et al. Comparison of recovery rates of Clostridium difficile from stool using chromogenic agar versus a classic culture method. Available at: www.chromagar.com/ fichiers/1470066757Comparison_of_Recovery_Rates_of_ Clostridium_difficile_from.pdf. Accessed October 5, 2020.

24. Bauer M.P., Farid A., Bakker M., Hoek R.A.S., Kuijper E.J., van Dissel J.T. Patients with cystic fibrosis have a high carriage rate of non-toxigenic Clostridium difficile. Clin Microbiol Infect. 2014;20(7):0446-0449. DOI: 10.1111/1469-0691.12439

25. Gerding D. N., Meyer T., Lee C., Cohen S.H., Murfy U.K., Poirier A., et al. Administration of spores of nontoxigenic Clostridium difficile strain m3 for prevention of recurrent C. difficile infection. JAMA. 2015;313(17):1719-1727. DOI: 10.1001/jama.2015.3725

26. Kotsanas D. Novel use of tryptose sulfite cycloserine egg yolk agar for isolation of Clostridium perfringens during an outbreak of necrotizing enterocolitis in a neonatal unit. J. Clin. Microbiol. 2010;48:4263-4265. DOI: 10.1128/ JCM.01724-10

27. GOST R 53400-2009 (ISO 7937:2000). Microbiology of food and animal feed. Colony counting method for Clostridium perfringens. Russian. (ГОСТ Р 53400-2009 (ИСО 7937:2000). Микробиология пищевых продуктов и кормов для животных. Метод подсчета колоний Clostridium perfringens.

28. Zamani S., Shariati S.H., Zali M.R., Aghdaei H.A., Asiabar A.S., Bokaie S., et al. Detection of enterotoxigenic Bacteroides fragilis in patients with ulcerative colitis. Gut Pathog. 2017;9:53. DOI: 10.1186/s13099-017-0202-0

29. Ho P., Ho L., Yau C., Tong M., Chow K. A novel selective medium for isolation of Bacteroides fragilis from clinical specimens. J Clin Microbiol. 2017;55(2):384-390. DOI: 10.1128/JCM.01988-16

30. Ayyagari A., Khanna T., Devi S. Enzyme linked immunosorbent assay & indirect fluorescence assay for rapid diagnosis of Bacteroides fragilis infections. Indian J Med Res. 1992;95:34-40. DOI: 10.1016/s0140-6736(79)90768-2

31. Lalitha M.K., Mathai E., Elias L., Anandi V., Kalpana C.R. Detection of Bacteroides infection by counter immunoelectrophoresis test. Indian J Med Res. 1991;93:171-173. DOI: 10.1136/jcp.31.11.1078

Швыдкая М.Г. и соавт.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.