Научная статья на тему 'Сравнение эффективности работы програм “ImageJ” и “морфология 5. 2” на примере анализа конфокальных изображений эндометрия пациенток с наружным гинетальным эндометриозом'

Сравнение эффективности работы програм “ImageJ” и “морфология 5. 2” на примере анализа конфокальных изображений эндометрия пациенток с наружным гинетальным эндометриозом Текст научной статьи по специальности «Фундаментальная медицина»

CC BY
182
33
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
Журнал
FORCIPE
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по фундаментальной медицине , автор научной работы — Шестакова А.В.

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Текст научной работы на тему «Сравнение эффективности работы програм “ImageJ” и “морфология 5. 2” на примере анализа конфокальных изображений эндометрия пациенток с наружным гинетальным эндометриозом»

Материалы всероссийского научного форума студентов с международным участием «СТУДЕНЧЕСКАЯ НАУКА - 2019» 573

А.Ф. Баталин, занимавший ее вплоть до 1893 г. Эти 9 лет являются периодом рассвета деятельности кафедры. Александр Федорович Баталин — видный ботаник, автор свыше 100 научных работ. Кафедра ботаники в 1930 году слилась с кафедрой биологии. С 1943 по 1952 г. этот предмет читался на кафедре фармакологии, фармации и фармакогнозии. [2]

Выводы: медико-хирургическая академия с момента своего открытия стала центром по изучению лекарственных растений. Хотя конец XIX и начало XX века ознаменовались значительными успехами в области синтеза новых химических препаратов, растительные лекарственные препараты не утратили своего значения. Тем не менее, конец XIX начало ХХ столетия знаменуется некоторым упадком интереса к лекарственным растениям. В 2013 году в Военно-медицинской академии возобновлена подготовка курсантов по специальности «Фармация». В системе подготовки провизоров ботаника является общетеоретической, базисной дисциплиной и необходима для овладения фармакогнозией [1, 3]. Литература

1. Бородин, И.П. Исторический очерк кафедры ботаники в Императорской Военно-медицинской академии (1798-1898) / И.П. Бородин. СПб.: Тип. М-ва внутр. дел, 1898. 40 с.

2. Столетие военного министерства 1802-1902 гг. Императорская Военно-медицинская (медико-хирургическая) академия: исторический очерк. Ч. 1. До царствования Императора Александра II. Ч. 2. До 1902 г. включительно / Г.Г. Скориченко. СПб.: Синод. тип., 1902. 506 с.

3. Мирошниченко, Ю.В. Вклад Военно-медицинской (Медико-хирургической академии) в развитие фармации и системы медицинского снабжения (к 215-й годовщине образования Военно-медицинской академии им. С.М. Кирова) / Ю.В. Мирошниченко [и др.] // Вестн. Росс. воен-мед. Акад. 2013. № 4. С. 247-251.

СРАВНЕНИЕ ЭФФЕКТИВНОСТИ РАБОТЫ ПРОГРАМ "IMAGEJ" И "МОРФОЛОГИЯ 5.2" НА ПРИМЕРЕ АНАЛИЗА КОНФОКАЛЬНЫХ ИЗОБРАЖЕНИЙ ЭНДОМЕТРИЯ ПАЦИЕНТОК С НАРУЖНЫМ ГИНЕТАЛЬНЫМ ЭНДОМЕТРИОЗОМ

Шестакова А.В.

Научный руководитель: Андреев А.Е. Кафедра медицинской биологии

Санкт-Петербургский государственный педиатрический медицинский университет

Актуальность исследования: при разнообразии методов получения микроскопических изображений их анализ является затруднительным и долгим. Решить эту проблему можно, с помощью методов компьютерного анализа. Наиболее распространенными в лабораторной практике являются программные пакеты "ВидеоТест-Морфология 5.2" и "ImageJ".

Цель исследования: провести анализ эффективности современного подхода к анализу микрофотографий, на оценке конфокальных изображений при помощи аналитических программных пакетов "ВидеоТест-Морфология 5.2" и "ImageJ". [1]

Материалы и методы: в качестве образцов для исследования была использована база фотографий эндометрия в котором экспрессировался рецептор к антимюллеровому гормону (n=100). На изображениях оценивались относительная площадь экспрессии и средняя яркость.

Результаты: при проведении анализа эффективности обоих программ данные о относительной площади экспрессии статистически не различались [1]. [3] Однако, в обоих случаях прослеживалась зависимость точности измерений от опыта исследователя. Таким образом, можно утверждать о наличии погрешности, возникающей в следствии фактора субъективности. Показатели средней яркости были различны в следствии разных алгоритмов оценки в "ВидеоТест-Морфология 5.2" и "ImageJ". В "ImageJ" отсутствует показатель средней яркости изображения. Вместо этого имеется его аналог — интенсивность уровня серого, который,

FORCIPE

ТОМ 2 СПЕЦВЫПУСК 2019

elSSN 2658-4182

Abstracts Nationwide scientific forum of students with international participation «STUDENT SCIENCE - 2019»

подобно средней яркости, отражает интенсивность флюоресценции на препарате, но делает это с большей чувствительностью.

Выводы: «ВидеоТест-Морфология 5.2» — дорогостоящая программа, однако она изначально калибруется опытным патоморфологом, что позволяет получить максимально приближенные к истинным результатам. «ImageJ» бесплатная программа, имеющая достаточно возможностей для исследования, и ее можно откалибровать, но это

затруднительно, поскольку необходимо хорошее владение английским языком и достаточный опыт, поэтому точность исследования снижается. [2]

Таким образом, образом инструментарий обеих программ хоть и позволяет выполнить получение необходимых данных, однако этого недостаточно для эффективного выполнения задач в области науки и диагностики, которые требуют повышение точности и скорости проводимых измерений. Литература

1. А.Е. Андреев, С.Л. Ценевска, Д.И. Сергеев, Н. Кукавица, А.О. Дробинцева, П.Д. Дробин-цев. Компьютерный анализ микрофотографий на примере выявления клеточных ядер.Био-техносфера. No1 (55). 2018 г. C. 8-14

2. ВидеоТест-Морфология 5.0: Руководство пользователя. — СПб.: ООО «ВидеоТест», 2017.

3. Schindelin J, Rueden CT, Hiner MC1, Eliceiri KW. The ImageJ ecosystem: An open platform for biomedical image analysis. Mol Reprod Dev. 2015 Jul-Aug;82(7-8):518-29.

ЭТИЧЕСКИЕ ВОПРОСЫ РЕДАКТИРОВАНИЯ ГЕНОМА ЧЕЛОВЕКА С ПОМОЩЬЮ СИСТЕМЫ CRISPR/CAS

Ширяев Д.Л.

Научный руководитель: старший преподаватель Старунова З.И. Кафедра медицинской биологии

Санкт-Петербургский государственный педиатрический медицинский университет

Актуальность исследования: система CRISPR/Cas — иммунная система прокариот, представляющая из себя особые локусы, состоящие из повторяющихся последовательностей, и ассоциированных белков Cas [1]. Эта система используется для направленного редактирования генома и является перспективным направлением современной генной инженерии [2].

Цель исследования: анализ реакции широкой общественности и научного сообщества на результаты редактирования генома человека с помощью системы CRISPR/Cas китайскими учеными.

Материалы и методы: было проанализировано более 40 источников в интернете. Из них статьи в прессе (Associated Press, Риа новости, полит.ру и пр.), научно-популярные ресурсы (N+1, Биомолекула, Постнаука, Наука и жизнь), более сотни научных публикаций по базе PubMed.

Результаты: в 2018 году китайский ученый Цзянькуй Хэ, заявил о рождении первых генетически модифицированных детей, которые, вследствие редактирования генома обладают устойчивостью к ВИЧ [3]. Многие ученые и научные журналисты, например, П. Тебас (Пенсильванский университет) или Л. Шнайдер (научный журналист) считают странным выбор в качестве цели эксперимента именно устойчивость к ВИЧ, а не какое-либо генетическое заболевание. Другие ученые, например, Д. Дейли (Гарвардская медицинская школа) считают, что этот эксперимент позволит выработать приемлемые формы применения этого нового метода, обеспечив достаточную прозрачность и внешний контроль. Многие, например, Ф. Чжан (Институт Брода), считают необходимым запретить редактирование генома у эмбрионов человека. Российские ученые, например, О. Серов и С. Бушев (Институт молекулярной генетики РАН) считают, что нельзя окончательно судить о возможности генной модификации людей, до тех пор, пока не известны все подробности и последствия.

Выводы: редактирование генома человека — допустимо, потому что это позволит лечить многие заболевания, сейчас считающиеся неизлечимыми или получить устойчивость к ВИЧ

forcipe

том 2 СПЕЦВЫПУСК 2019

ISSN 2658-4174

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.