CC BY
23
УДК 541.49:541.64
Т. Н. Гришаева, А. Н. Маслий, А. М. Кузнецов
СОЕДИНЕНИЕ ВКЛЮЧЕНИЯ В КУКУРБИТ[8]УРИЛ КОМПЛЕКСА КОБАЛЬТА(Ш) С ЦИКЛЕНОМ:
КВАНТОВО-ХИМИЧЕСКИЙ ПРОГНОЗ СТРУКТУРЫ
И ТЕРМОДИНАМИЧЕСКИХ ПАРАМЕТРОВ ОБРАЗОВАНИЯ
Ключевые слова: теория функционала плотности, РСМ, функционал PBE, комплекс «гость-хозяин», цикленовый комплекс
кобальта(Ш), кукурбит[8]урил.
В рамках теории функционала плотности исследована структура соединения включения {макроциклический кавитанд СВ[8]/цикленовый комплекс Co(III)}, а также оценены термодинамические параметры его образования. Результаты сопоставляются с имеющимися экспериментальными данными.
Keywords: density functional theory, PCM, functional PBE, "host-guest" complex, cyclen cobalt(III) complex, cucurbit[8]uril.
The structure of the inclusion compound {the macrocyclic CB[8] cavitand/ cobalt(III) cyclen complex} has been investigated within the density functional theory. Thermodynamic parameters of its formation were estimated as well. The obtained results are compared with available experimental data.
Введение
Важным направлением супрамолекулярной химии является изучение соединений включения типа «гость-хозяин», в которых в качестве «хозяина» выступают макроциклические молекулы. В качестве гостевой молекулы помимо распространенных ка-ликсаренов, краун-эфиров и циклодекстринов широко используются и гомологи семейства кукур-бит[п]урилов (С6пН6пМ4п02п, СВ[п], п = 5-10). Структура гомолога СВ[8] показана на рисунке 1.
* а а • • т
9.1 А
Рис. 1 - Пространственная структура макроцик-лического кавитанда СВ[8] (вид сбоку и вид сверху) и его основные размеры
Интерес к подобному роду соединений связан
с рядом их полезных свойств. В частности, при включении в СВ[п] комплексов платины, палладия и золота, обладающих противораковым действием, значительно уменьшается токсичность этих препаратов для человеческого организма [1-3], что позволило запатентовать новые эффективные лекарственные препараты, ранее запрещенные к применению из-за их высокой токсичности [4,5]. Для катализа многообещающим является получение металлической фазы в полости или на порталах СВ[п] путем восстановления водородом включенных в кавитанд метал-локомплексов [6]. При этом особый интерес представляет образование цепочечных полимеров из СВ[п] с металлической фазой внутри с целью создания нанопроводников. Разработка методики синтеза, установление структуры и изучение свойств получаемого соединения являются трудоемкими процессами. В связи с этим экспериментаторы возлагают большие надежды на методы квантовой химии, которые хорошо зарекомендовали себя как мощный инструмент для прогнозирования структуры и возможности синтеза новых сложных соединений.
Данная работа является продолжением работ, связанных с изучением и прогнозированием геометрии и принципиальной возможности формирования соединений включения на основе металлокомплексов и СВ[8] [7-15]. Изучение проводилось для уже синтезированного соединения включения на базе комплекса кобальта(Ш) [16] с целью установления факторов, влияющих на закрепление гостевой молекулы в полости СВ[8], а также для отработки методики кван-тово-химических расчетов для изучения подобных систем.
Методы исследования
Квантово-химические расчеты проводились с помощью программного пакета PR.IR.ODА [17] на уровне теории функционала плотности с функционалом РВЕ [18]. Для всех атомов использовался атомный базисный набор Т2 [19]. Системы с открытой электронной оболочкой рассчитывались в рамках неограниченной версии метода РВЕ. Полная газофазная оптимизация всех систем проводилась без
каких-либо ограничений по симметрии. После оптимизации геометрии проводился расчет частот нормальных колебаний макромолекулы. Отсутствие мнимых значений частот в колебательном спектре свидетельствовало о том, что оптимизированные структуры соответствуют минимумам на многомерной поверхности потенциальной энергии. На основе проведенного термохимического анализа были получены термодинамические параметры реакций.
Учет влияния растворителя проводился следующим образом. При фиксированной геометрии систем, предварительно оптимизированных с помощью программы PRIRODA, проводился расчет свободной энергии их гидратации с помощью пакета GAUSSIAN 03 [20] в рамках модели поляризуемого континуума PCM [21-23] со статической диэлектрической проницаемостью £=78,4 для водного раствора. Эти расчеты проводились на уровне теории функционала плотности в версии B3LYP [24,25] с использованием стандартного валентно-
расщепленного базисного набора атомных орбиталей 6-31G(d,p).
Результаты и обсуждение
Исследование структуры соединения включения комплекса [Co(Cyclen)(H20)Clf+ в СВ[8].
На первом этапе была проведена оптимизация геометрии соединения включения цикленового комплекса кобальта(Ш) (cyclen - 1,4,7,10-тетраазациклододекан), полученной на основе данных РСА. В результате оптимизации цикленовый комплекс кобальта частично покинул полость макроцикла. Был сделан вывод, что фактором, влияющим на закрепление комплекса в полости, могут быть молекулы воды. Учитывая тот факт, что молекулы воды, образующиеся в процессе синтеза кукур-бит[п]урилов, остаются в полости кавитанда, в том числе и после его кристаллизации, любой процесс включения гостевых молекул в полость макроциклов необходимо рассматривать как конкурентный процесс частичного или полного замещения молекул воды, находящихся внутри полости СВ[п]. Энергетический эффект процесса включения зависит от относительной энергии взаимодействия гостевой молекулы и вытесняемых молекул воды с внутренней поверхностью полости кавитанда. Кроме того, присутствие молекул воды в области порталов макроцикла свидетельствует о значительной роли молекул воды в процессе закрепления металлокомплексов внутри макроцикла. На основании вышесказанного, было проведено дополнительное моделирование, в котором в расчетную схему системы [Co(Cyclen)(H20)Cl]2+@CB[8] включалось несколько молекул воды, так, чтобы в итоге получилось стабильное соединение включения. В результате установлено, что комплекс стабильно закрепляется в полости при включении дополнительно пяти молекул воды.
На рисунке 2 показана оптимизированная структура, обладающая наименьшей энергией, в которой помимо металлокомплекса в полости располагаются пять дополнительных молекул воды.
Рис. 2 - Оптимизированная структура соединения
{[Со(Сус!еп)(Н2О)С!]2+(Н2О)5}@СБ[8]
Для упрощения на рисунке отсутствует большая часть атомов СВ[8], показаны только шестнадцать портальных атомов кислорода. Из рисунка видно, что атом кобальта(Ш) находится в октаэдрическом окружении, образованном четырьмя атомами азота циклена и цис-расположенными хлорид-ионом и молекулой воды. Комплекс гостевой молекулы ориентирован внутри полости СВ[8] таким образом, что атом металла находится практически на главной оси симметрии кавитанда, при этом металлокомплекс сдвинут от экваториальной плоскости макроцикла в сторону портала. Координированные хлорид-ион и молекула воды располагаются на уровне портала. В структуре, полученной в результате расчета, длины связи Оо-Ы находятся в диапазоне 1.94-1.98 А (экспериментально получены значения 1.77-1.99 А), длины связей Оо-О1 и Оо-О составляют соответственно 2.29 и 1.99 А против экспериментальных данных 2.21 и 1.92 А.
Пять дополнительных молекул воды, закрепляющих металлокомплекс, расположены следующим образом. На одном портале СВ[8] две молекулы воды образуют водородные связи с портальными атомами кислорода, а также с молекулой воды и ЫН-группами цикленового лиганда комплекса. На противоположном портале кавитанда три молекулы воды в виде линейного тримера образуют водородные связи с карбонильными атомами кислорода портала и ЫН-группами цикленового лиганда. Таким образом, ме-таллокомплекс должен прочно удерживаться в полости кукурбит[8]урила «крышками», состоящими из молекулы воды самого комплекса и пяти дополнительных молекул воды.
Небольшая деформация, вызванная сопоставимыми ван-дер-ваальсовыми размерами гостевой молекулы и полости хозяина, наблюдаются и у СВ[8]. Макроцикл, имеющий в исходном состоянии круглое сечение, под влиянием включенного комплекса приобретает овальную форму. Растяжение окружности макроцикла составляет приблизительно 0.35 А, а сужение - около 0.25 А.
Расчет термодинамических параметров формирования соединений включения
Процесс образования соединения включения {[Со(Сус!еп)(Н2О)С!]2+-(Н2О)5}@СБ[8] сопровождается полным или частичным вытеснением молекул воды, которые присутствуют в полости кавитанда СБ[8] при его синтезе в водном растворе. Не останавливаясь на деталях расчетов, отметим, что наиболее вероятное число молекул воды в полости СБ[8] оказывается равным 10. Эти молекулы образуют водный кластер (Н20)ю, который напоминает своей формой правильную пятиугольную призму, в вершинах которой располагаются молекулы воды (рис. 3). Кластер фиксируется в полости СБ[8] с помощью водородных связей, образованных между молекулами воды верхнего и нижнего пятичленных циклов с портальными атомами кислорода СБ[8].
Рис. 3 - Оптимизированная на уровне PBE/3Z структура соединения включения (H2O)10@CB[8]
Таблица 1 - Газофазные полные свободные энергии Гиббса, энергии гидратации и газофазные энтропии частиц, входящих в уравнение (1): (а) - [(H2OЫ@CB [8], (б) - H2O,
(в)-[Co(Сyclen)(H2O)Cl]2+,
(г)- {[Co(Cyclen)(Н2О)Cl]2+•(Н2О)5}@CB [8]
G°(gb AhydG°, S°(gb
Хартри ккал/моль кал/К-моль
(а) -5573.286916 -73.77 475.87
(б) -76.375263 -6.04 46.52
(в) -2453.719668 -178.62 120.17
(г) -7645.271614 -142.93 497.61
Таким образом, формирование соединения включения на основе цикленового комплекса кобаль-та(Ш) и кукурбит[8]урила в водном растворе можно описать следующим уравнением: [Co(CyClen)(H20)Cl] (aq) + [(H2O)l0]@CB[8](aq) = {[Co(Cyclen)(H20)Cl]2+-(H20)5}@CB[8](aq) + (1)
Как видно, этот процесс сопровождается вытеснением пяти молекул воды и их выходом в объем раствора.
Свободную энергию Гиббса этой реакции можно рассчитать из соотношения AG0M = Е G0(aq) (pr°d) - S G° щ (read) + nRTln([H2O]) (2) Здесь первые две суммы представляют собой суммарные полные свободные энергии Гиббса продуктов и исходных реагентов реакции (1), которые
получаются из квантово-химической процедуры термохимического анализа при температуре 298.15 К и давлении 1 атм. Третье слагаемое в выражении (2) обусловлено тем, что при расчете AG° реакции в растворе концентрации всех реагентов и продуктов при стандартных условиях должны составлять 1 моль/л, в то время как концентрация воды в жидкой воде [H2O] при стандартной температуре и давлении равна 55.34 моль/л [26]. Коэффициент n - число молей H2O в правой части уравнения (1). Для (1) эта поправка составляет 11.89 ккал/моль соответственно.
Полную свободную энергию Гиббса частицы А в водном растворе можно представить как G°(A(aq)) = G°(A(gas)) + AhydG°(A) + AG°^* (3)
В выражении (3) первое слагаемое - энергия частицы в газовой фазе, второе слагаемое представляет собой стандартную свободную энергию гидратации частицы, а поправка AG°^* связана с различием стандартных состояний в газовой фазе и в растворе. В газовой фазе в качестве стандартного состояния идеального газа принято давление 1 атм. (24.46 л/моль), а в растворе стандартной является концентрация 1М (1 моль/л). Таким образом, изменение свободной энергии Гиббса одного моля идеального газа (24.46 л/моль) при переходе в 1М раствор (1 моль/л) можно рассчитать по следующей формуле: AG°^* = -TAS°^* =RTln(V°/V*) = RTln(24.46) =
= 1.89 ккал/моль (Т = 298.15 К) (4)
По аналогии с (3), учитывая, что AS°^* = -AG°^*/T, можно записать выражение для энтропии реакции в растворе:
AS°(aq) = S S°(aq) (pr°d) - S°S°(aq) (react) - nR°n([H2O]), °(5) a энтальпия реакции AH°(aq) связана с AG°(aq) и AS° (aq) формулой Гиббса-Гельмгольца AG° = AH° - TAS°.
В связи с тем, что в континуальном приближении, каковым является используемая нами модель PCM, растворитель рассматривается бесструктурно, энтропии частицы в газовой фазе и в растворе практически неразличимы. Поэтому при расчете AS°(aq) по соотношению (5) вместо S°(aq) нами использовались газофазные энтропии частиц S°(g) .
С учетом приведенных выше соотношений, а также данных таблицы 1 получаются следующие стандартные термодинамические параметры реакции (1): AG°(aq) = -1.88 ккал/моль, AH°(aq) = 49.97 ккал/моль, AS°(aq) = 173.98 кал/К-моль.
Как видно из этих результатов, образование супрамолекулы сопровождается положительным значением изменения энтропии. Это обусловлено дест-руктурированием водно-молекулярного кластера (Н2О)-|0 в полости кавитанда и выходом части молекул в объем раствора, что приводит к возрастанию степени беспорядка в системе. Положительное значение AH°(aq) свидетельствуют об эндотермическом характере реакции (1), а небольшие отрицательные значения AG°(aq) в совокупности с положительной величиной энтропии реакции AS°(aq) - об обратимом характере реакции. Иными словами, с ростом температуры возрастает по абсолютной величине отрицательное значение AG0(aq), что приводит к повышению термодинамической вероятности самопроизвольного
протекания реакций. И, наоборот, с понижением температуры значение AG0(aq) при T<AH0(aq)/AS0(aC|) приобретает положительное значение, что способствует самопроизвольному протеканию обратной реакции.
Полученные нами результаты можно рассматривать как квантово-химический прогноз возможности синтеза соединения включения состава {[Co(Cyclen)(H20)Cl]2+-(H20)5}@CB[8](aq) при температуре 25оС и выше. Полученные значения термохимических параметров реакции (1) позволяют сделать только качественные выводы о термодинамической возможности протекания этой реакции, поскольку рассмотрены для реакции, протекающей в идеальных условиях. Тем не менее, можно полагать, что использованные нами подходы могут быть успешно применены для прогнозирования и других реакций с образованием соединений включения, актуальных для супрамолеку-лярной химии.
Заключение
В результате проведенного квантово-химического исследования соединений включения в СВ[8] комплексов кобальта(Ш) с цикленом показано, что фиксация металлокомплекса в полости СВ[8] осуществляется соответственно за счет пяти молекул H2O, остающихся в полости после включения в нее комплекса. Проведенный термодинамический анализ с учетом влияния диэлектрической среды показал, что процессы включения комплексов имеют эндотермический характер с небольшим отрицательным значением свободной энергии Гиббса реакции. Положительное значение энтропии реакции позволяет сделать вывод о том, что повышение температуры должно способствовать повышению термодинамической вероятности рассматриваемых реакций. Таким образом, проведенные расчеты a priori предсказывают принципиальную возможность синтеза соединения включения на основе кобальта(Ш) с цикленом и кавитанда CB [8].
Литература
1. N.J. Wheate, A.I. Day, R.J. Blanch, A.P. Arnold, C. Cullinane, J.G. Collins, Chem. Commun, 1424-1425 (2004).
2. M.S. Bali, D.P. Buck, A.J. Coe, A.I. Day, J.G. Collins, J. Chem. Soc., Dalton Trans., 5337-5344 (2006).
3. N.J. Wheate, D.P. Buck, A.I. Day, G. Collins, J. Chem. Soc, Dalton Trans, 451-458 (2006).
4. S. Korea Pat. WO 0324978 A1 20030327 / K. Kim, Y. J.
Jeon. S.-Y. Kim, and Y. H. Ko; Postech Foundation, S. Korea, PCT Int. Appl. 2002. 42.
5. N.J.Wheate, A.I. Day, R.J. Blanch, J.G. Collins UNISEARCH Limited, Australia, PCT Int. Appl. 2005. 63.
6. В.В. Баковец, В.А. Надолинный, С.Б. Эренбург, А.М. Кузнецов, И.П Долговесова, Журнал неорганической химии, 55, 12, 2011-2016 (2010).
7. А.Н. Маслий, Т.Н. Гришаева, А.М. Кузнецов, В.В. Баковец, Журнал структурной химии, 48, 3, 593-597 (2007).
8. V.V. Bakovets, A.N. Masliy, A.M. Kuznetsov, Journal of Physical Chemistry B: Biophysical Chemistry, Biomaterials, Liquids, and Soft Matter, 112, 38, 12010-12013 (2008).
9. А.Н. Маслий, Т.Н. Гришаева, А.М. Кузнецов, В.В. Баковец, Журнал структурной химии, 50, 3, 413-418 (2009).
10. Т.Н. Гришаева, А.Н. Маслий, В.В. Баковец, А.М. Кузнецов, Журнал неорганической химии, 55, 10, 1689-1694 (2010).
11. Т. Н. Гришаева, А. Н. Маслий, В. В. Баковец, А. М. Кузнецов, Вестник Казанского технологического университета, 9, 18-25 (2010).
12. Т.Н. Гришаева, А.Н. Маслий, В.В. Баковец, А.М. Кузнецов, Вестник Казанского технологического университета, 6, 7-15 (2011).
13. Т.Н. Гришаева, А.Н. Маслий, В.В. Баковец, А.М. Кузнецов, Вестник Казанского технологического университета, 15, 6, 23-29 (2012).
14. А.Н. Маслий, Т.Н. Гришаева, В.В. Баковец, А.М. Кузнецов, Вестник Казанского технологического университета, 16, 15, 7-12 (2013).
15. А.Н. Маслий, Т.Н. Гришаева, В.В. Баковец, А.М. Кузнецов, Вестник Казанского технологического университета, 16, 13, 28-32 (2013).
16. Е.А. Коваленко, Т.В. Митькина, О.А. Герасько, Д.Г.Самсоненко, Д.Ю. Наумов, В.П. Федин, Коорд. химия, 37, 3, 163-168 (2011).
17. D.N. Laikov, Chem. Phys. Lett. 281, 1-3, 151-156 (1997).
18. J.P. Perdew, K. Burke, M. Ernzerhof, Phys. Rev. Lett., 77, 18, 3865-3868 (1996).
19. D.N. Laikov, Chem. Phys. Lett., 416, 1-3, 116-120 (2005).
20. Gaussian 03, Revision C.01, Frisch M.J., Trucks G.W., et. al. Gaussian, Inc., Wallingford CT. (2004).
21. M.T. Cances, B. Mennucci, J. Tomasi, J. Chem. Phys., 107, 3032 (1997).
22. M. Cossi, V. Barone, B. Mennucci, J. Tomasi, Chem. Phys. Lett, 286, 253-260 (1998).
23. B. Mennucci, J. Tomasi, J. Chem. Phys, 106, 5151-5158 (1997).
24. A.D. Becke, J.Chem. Phys., 98, 7, 5648-5652 (1993).
25. C. Lee, W. Yang, R.G. Parr, Phys. Rev. B., 37, 2, 785-789 (1988).
26. Д. Эйзенберг, В. Кауцман Структура и свойства воды. Пер. с англ. Л.: Гидрометеоиздат, 1975. 208 с .
© Т. Н. Гришаева - к.х.н., асс. каф. неорганической химии КНИТУ, [email protected]; А. Н. Маслий - к.х.н., доц. каф. неорганической химии КНИТУ, [email protected]; А. М. Кузнецов - д.х.н., проф., зав. каф. неорганической химии КНИТУ, [email protected].
© T. N. Grishaeva - PhD (Chem.), Assistant Professor, Department of Inorganic Chemistry, KNRTU, [email protected]; A. N. Masliy - PhD (Chem.), Associate Professor, Department of Inorganic Chemistry, KNRTU, [email protected]; A. M. Kuznetsov - Dr.Sci. (Chem.), Professor, Head of Department of Inorganic Chemistry, KNRTU, [email protected].
