CC BY
14
DOI: 10.17650/1726-9776-2021-17-4-19-26
(«DI
Сходство и различие процессов метастазирования и дифференцировки рака почки по экспрессии генов
Н.В. Апанович1, А.В. Матвеев2, П.В. Апанович1, А.А. Коротаева1, Ф.М. Кипкеева1, Т.А. Музаффарова1, О.А. Халмурзаев2, В.Б. Матвеев2, А.В. Карпухин1
ФГБНУ«Медико-генетический научный центр им. акад. Н.П. Бочкова»; Россия, 115522 Москва, ул. Москворечье, 1; 2ФГБУ«Национальный медицинский исследовательский центр онкологии им. Н.Н. Блохина» Минздрава России; Россия, 115478 Москва, Каширское шоссе, 24
Контакты: Александр Васильевич Карпухин [email protected]
Введение. Метастазирование и степень дифференцировки относятся к основным клиническим характеристикам злокачественных опухолей. Оба рассматриваемых признака нуждаются в углубленном исследовании, способном приводить к пониманию механизмов возникновения того или иного состояния раковых клеток. Цель исследования - изучение процессов метастазирования и дифференцировки светлоклеточного почечно-кле-точного рака (скПКР) по экспрессии генов.
Материалы и методы. Изучены уровни экспрессии 10 генов в 65 парных образцах (опухолевая ткань скПКР и нормальная ткань той же почки) методом полимеразной цепной реакции в реальном времени. Результаты. Показано, что экспрессия генов CA9, NDUFA4L2, VWF,IGFBP3, BHLHE41, ANGPTL4 и EGLN3 ассоциирована как со степенью дифференцировки скПКР, так и с метастазированием этой опухоли. Экспрессия C1QA связана только с метастазированием, но не участвует в процессах дифференцировки клеток опухоли. Неоднозначная ситуация с генами FN1 и CSF1R, экспрессия которых несущественна для процессов метастазирования скПКР, но может иметь некоторое значение для дифференцировки клеток этой опухоли. Низкодифференцированные опухоли имеют примерно в 5 раз повышенную частоту метастазирования в течение года по отношению к высокодифференцированным опухолям (отношение шансов 4,94). Выявлена низкая корреляция экспрессии генов в опухолях с низкой степенью дифференцировки, в противовес их высокой коэкспрессии при прогрессии опухоли по TNM-классификации. Заключение. Значительная часть существенных для развития скПКР генов связана как с метастазированием, так и со степенью дифференцировки опухоли, что обусловлено сходством функциональных изменений, стимулирующих оба этих процесса. В низкодифференцированных опухолях выявлена дезорганизация экспрессии генов, выражающаяся в слабой ее корреляции.
Ключевые слова: светлоклеточный почечно-клеточный рак, метастазирование, степень дифференцировки, экспрессия генов
Для цитирования: Апанович Н.В., Матвеев А.В., Апанович П.В. и др. Сходство и различие процессов метастазирования и дифференцировки рака почки по экспрессии генов. Онкоурология 2021;17(4):19-26. DOI: 10.17650/17269776-2021-17-4-19-26.
CV а CV
CS
U
е*
U
N а N it
Similarities and differences in the process of metastasis and differentiation of renal cancer on gene expression
N.V. Apanovich1, A.V. Matveev2, P.V. Apanovich1, A.A. Korotaeva1, F.M. Kipkeeva1, T.A. Muzaffarova1, O.A. Khalmurzaev2, V.B. Matveev2, A.V. Karpukhin1
1Research Centre for Medical Genetics; 1 Moskvorechye St., Moscow 115522, Russia;
2N.N. Blokhin National Medical Research Center of Oncology, Ministry of Health of Russia; 24 Kashirskoe Shosse, Moscow 115478, Russia
Contacts: Aleksandr Vasilyevich Karpukhin [email protected]
Background. Metastasing and degree of differentiation refer to the main clinical characteristics of malignant tumors. Both listed features need an in-depth study that can lead to an understanding of the mechanisms for the occurrence of certain state of cancer cells.
Objective. Studying the processes of metastasis and differentiation of the clear cell renal cell carcinoma (ccRCC) on gene expression.
cv а
JN «t
CS
U
е*
U
N а N it
Materials and methods. The levels of expression of ten genes in 65 paired samples were studied (ccRCC tumor tissue and the normal kidney tissue) by the real-time polymerase chain reaction.
Results. It is shown that the expression of CA9, NDUFA4L2, VWF, IGFBP3, BHLHE41, ANGPTL4 and EGLN3 genes is associated both with the degree of differentiation of the ccRCC and with the metastasis of this tumor. C1QA expression is connected only with metastasis, but does not participate in the process of differentiation of tumor cells. An ambiguous situation with FN1 and CSF1R gene expression is not essential for ccRCC metastasis processes, but may have a certain value for differentiation of cells of this tumor. Low-differentiated tumors have about five times an increased metastasis frequency during the year relative to highly differentiated tumors (odds ratio 4.94). A low correlation of gene expression in tumors with a low degree of differentiation is revealed, as opposed to their high co-expression during tumor progression by TNM classifications.
Conclusion. A significant part of genes substantial for the development of ccRCC is associated with both metastasis and the degree of differentiation of the ccRCC, which is due to the similarity of functional changes that stimulate both of these processes. For low-differentiated tumors the number of genes with correlated expression is less than in high-differentiated tumors. This may be due to disorganization of gene expression.
Key words: clear cell renal cell carcinoma, metastasis, degree of differentiation, gene expression
For citation: Apanovich N.V., Matveev A.V., Apanovich P.V. et al. Similarities and differences in the process of metastasis and differentiation of renal cancer on gene expression. Onkourologiya = Cancer Urology 2021;17(4):19-26. (In Russ.). DOI: 10.17650/1726-9776-2021-17-4-19-26.
Введение
Метастазирование и степень дифференцировки относятся к основным клиническим характеристикам злокачественных опухолей, включая светлоклеточный почечно-клеточный рак (скПКР). Метастазирование является основной причиной смертности при скПКР. Степень дифференцировки клеток опухоли рассматривается как показатель ее злокачественности. В последнее время исследование дифференцировки раковых клеток приобретает особое значение в связи с зарождением дифференцировочной терапии (differentiation therapy). Ее суть состоит в воздействии на клетки опухоли, стимулирующем их дифференцировку. При успешности такого воздействия раковые клетки (стволовые, недодифференцированные и дедифференцированные) теряют свою злокачественность и становятся чувствительными к химио- и другим типам терапии [1—3].
Следовательно, оба рассматриваемых признака — метастазирование и степень дифференцировки — нуждаются в углубленном исследовании, способном приводить к пониманию механизмов возникновения того или иного состояния раковых клеток и на этой основе к разработке новых генов-мишеней терапии, а также биомаркеров. Несмотря на то что метастази-рование и дифференцировка опухолей активно изучаются [4—6], их взаимоотношение и гены, функционирование которых существенно для обоих состояний, пока мало известны.
Цель исследования — изучение процессов метаста-зирования и дифференцировки скПКР по экспрессии генов.
Для получения новой информации по этим вопросам нами изучена экспрессия генов, отобранных на основании ранее полученных данных, как имеющих
существенное значение для развития скПКР. Определены уровни экспрессии генов CA9, NDUFA4L2, VWF, IGFBP3, BHLHE41, EGLN3, ANGPTL4, CSF1R, C1QA и FN1, а также взаимосвязи их функционирования по корреляции экспрессии.
Материалы и методы
Образцы были получены в НМИЦ онкологии им. Н.Н. Блохина. Все пациенты дали добровольное информированное согласие на включение в исследование. Исследование проводилось в соответствии с Хельсинкской декларацией. Протокол исследования был утвержден комитетом по этике Медико-генетического научного центра им. акад. Н.П. Бочкова (№ 2017-4/2). Все образцы были гистологически исследованы в отделении патологической анатомии опухолей человека НМИЦ онкологии им. Н.Н. Блохина и клинически охарактеризованы. Изучены 65 парных образцов (опухолевая ткань скПКР и морфологически нормальная ткань той же почки), которые были подразделены на 2 группы: Low Grade (43 образца) и High Grade (22 образца).
Исследовали экспрессию генов CA9, NDUFA4L2, VWF, IGFBP3, BHLHE41, EGLN3, ANGPTL4, CSF1R, C1QA и FN1 с помощью полимеразной цепной реакции в реальном времени (ПЦР-РВ). Выбор генов описан в работах [4, 7]. С помощью биоинформационного анализа выделены 200 генов с повышенной экспрессией в опухолях скПКР, экспрессия которых затем была изучена экспериментально. В результате для более детального изучения были выбраны 20 генов. Из их числа 10 оказались наиболее информативны для настоящего исследования [4].
Для выделения матричной РНК (мРНК) использовали наборы RNeasy Mini Kit (QIAGEN, США).
Наличие и интенсивность полос 2SS/1SS мРНК определяли электрофорезом в 1,8 % агарозном геле. Использовали систему гель-документирования Gel Doc XR+ (Bio-Rad, США). Концентрацию раствора мРНК и ее чистоту определяли на спектрофотометре NanoDrop 1000 (Thermo Fisher Scientific, США). Реакцию обратной транскрипции проводили набором ImProm-II™ Reverse Transcription System (США). Для ПЦР-РВ применили наборы TaqMan® Gene Expression Assays (Thermo Fisher Scientific, США). ПЦР-РВ проводили в 3 повторах для каждого гена с отрицательным контролем. В качестве эндогенного контроля использовали ген GAPDH [8].
Статистический анализ данных проводили с помощью программного обеспечения Statistica 10.0. Онлайн-каль-кулятор MedCalc (https://www.medcalc.org/calc/diagnostic_ test.php) использовали для расчета чувствительности и специфичности, а также для ROC-анализа. Уровень значимости принимали равным <0,05.
Результаты и обсуждение
С помощью ПЦР-РВ была исследована экспрессия 10 генов, основная часть которых ассоциирована с про-грессированием и метастазированием скПКР: CA9, NDUFA4L2, VWF, IGFBP3, BHLHE41, EGLN3, ANGPTL4, CSF1R, C1QA и FN1. С учетом полученных значений была оценена связь экспрессии указанных генов со степенью дифференцировки клеток скПКР. Использовали 2 степени дифференцировки — Low Grade (высокодифференцированные, низкая степень злокачественности) и High Grade (низкодифференцирован-ные, высокая степень злокачественности). При применении ROC-анализа ассоциацию со степенью дифференцировки продемонстрировало большинство генов, за исключением CSF1R, C1QA и FN1 (табл. 1).
Полученные при ROC-анализе пороговые значения экспрессии (которые оптимально разделяют соответствующие распределения) позволили оценить ассоциацию экспрессии генов и степени дифференцировки с помощью точного критерия Фишера. По этому критерию значимую ассоциацию, в том числе при учете поправки FDR (false discovery rate, ожидаемая доля ложных отклонений), показали почти все гены, за исключением C1QA.
Дедифференцировка клеток скПКР сопровождается статистически значимым снижением экспрессии генов CA9, NDUFA4L2, VWF, IGFBP3, BHLHE41, EGLN3, ANGPTL4, ассоциированных с этим процессом. Снижение экспрессии FN1 находится на грани статистической значимости, а экспрессия CSF1R хоть и снижается на треть по значению медианы, однако незначимо (табл. 2).
Ранее нами было показано снижение экспрессии генов CA9, NDUFA4L2, VWF, IGFBP3, BHLHE41, EGLN3 и C1QA при метастазировании скПКР [4]. Экспрессия гена ANGPTL4 не была проанализирована нами ранее на связь с метастазированием, но показана ее ассоциация с выживаемостью больных скПКР [7]. В настоящей работе была изучена и ее связь с метастазированием скПКР (табл. 3).
По всем использованным статистическим критериям, метастазирование скПКР связано с экспрессией ANGPTL4: при метастазировании опухоли происходит снижение экспрессии этого гена.
Следовательно, экспрессия генов CA9, NDUFA4L2, VWF, IGFBP3, BHLHE41, ANGPTL4 и EGLN3 ассоциирована как со степенью дифференцировки скПКР, так и с метастазированием этой опухоли. Экспрессия C1QA связана только с метастазированием, но не участвует в процессах дифференцировки клеток опухоли. Неоднозначная ситуация с генами FN1 и CSF1R,
CV а
JN «t
CS
U
et
U
N а N it
Таблица 1. Характеристики связи экспрессии исследуемых генов со степенью дифференцировки клеток светлоклеточного почечно-клеточного рака Table 1. Relationships between the studied genes and cell differentiation grade of clear cell renal cell carcinoma
ROC-анализ, Пороговое значение Частота выше/ниже порогового значения при высокой Точный критерий Фишера,
■9 Area under Чувствительность/специфичность и низкой степени дифферен- 1 111 1Л 1 1111' 11
Gene / \ 1 vil Ullllvl the ROC-curve, р экспрессии Cut-off values Sensitivity/specificity Frequency above/below the cut-off value with high and low degree of differentiation D Fisher's exact test, р
CA9 0,0021* <9,2 81,82/58,14 18/25 18/4 0,0033*
NDUFA4L2 0,0078* <2,8 72,73/65,12 15/28 16/6 0,0079*
EGLN3 0,0001* <2,5 77,27/62,79 16/27 17/5 0,0036*
BHLHE41 0,006* <1,7 72,73/62,79 16/27 16/6 0,0090*
C1QA 0,5059 <0,5 38,1/85 6/34 8/13 0,0571
Окончание табл. 1 End of table 1
cv a <N it
CS
U
ex и
N a N it
ROC-анализ, P Я Пороговое значение Чувствительность/специфичность Частота выше/ниже порогового значения при высокой и низкой степени дифферен- Точный критерий Фишера,
Gene the ROC-curve, P экспрессии Cut-off values Sensitivity/specificity Frequency above/below the cut-off value with high and low degree of differentiation П2Г
CSF1R 0,2164 <0,4 42,86/85,71 6/36 9/12 0,0253*
FN1 0,042 <0,6 47,62/83,33 7/35 10/11 0,0152*
VWF 0,0006* <3,3 90,91/41,86 25/18 20/2 0,0096*
IGFBP3 <0,0001* <1,7 81,82/58,14 18/25 18/4 0,0033*
ANGPTL4 0,0098* <3,4 77,27/58,54 17/24 17/5 0,0084*
*Значимые с поправкой FDR (ожидаемая доля ложных отклонений). *Significant with the FDR (false discovery rate) correction.
Таблица 2. Значения медиан уровней экспрессии при разных степенях дифференцировки светлоклеточного почечно-клеточного рака и значимость их различий
Table 2. Median expression levels under various differentiation grades of clear cell renal cell carcinoma and the significance of their differences
Ген Gene Медиана уровня экспрессии Median expression level U-критерий, р
Low Grade High Grade
CA9 15,1 2,15 0,008
NDUFA4L2 16,5 1,3 0,015
EGLN3 3,8 1 0,001
BHLHE41 2,2 1,2 0,014
C1QA 1,55 1,4 0,461
CSF1R 0,95 0,7 0,179
FN1 1,45 0,8 0,051
VWF 2 0,65 0,003
IGFBP3 2 1 0,0006
ANGPTL4 7,1 1,3 0,016
Таблица 3. Характеристики связи экспрессии гена ANGPTL4 с метастазированием светлоклеточного почечно-клеточного рака (скПКР) Table 3. Relationships between ANGPTL4gene expression and clear cell renal cell carcinoma (ccRCC) metastasis
Медиана экспрессии гена в опухоли не метастазирующего скПКР Медиана экспрессии гена в опухоли метастазирующего скПКР ROC-анализ, р Log-rank, n Точный критерий Фишера, р
Median gene expression in non-metastatic ccRCC tumor Median gene expression in metastatic ccRCC tumor the ROC-curve, р 1 1 Fisher's exact test, р
ANGPTL4
12,00
1,15
<0,0001
0,00018
<0,0001
экспрессия которых не существенна для процессов метастазирования скПКР [4], но может иметь определенное значение для дифференцировки клеток данной опухоли. Это следует из наличия ассоциации рассматриваемых характеристик, выявленной с помощью точного критерия Фишера. Отсутствие или пограничные значения аналогичной связи по ROC-анализу указывают на как минимум низкое значение этих генов в качестве маркеров для подразделения опухолей разной степени злокачественности по уровню их экспрессии.
Таким образом, дедифференцировка и метастази-рование скПКР характеризуются в значительной мере одними и теми же генами со сходными характеристиками экспрессии. Это может указывать на взаимосвязь рассматриваемых процессов. Поэтому мы оценили наличие их ассоциации (табл. 4).
Из данных табл. 4 следует высокозначимая ассоциация степени дифференцировки и синхронного метаста-зирования скПКР. Низкодифференцированные опухоли имеют примерно в 5 раз повышенную вероятность
метастазирования в течение года по отношению к вы-сокодифференцированным опухолям (отношение шансов 4,94). В то же время метахронное метастази-рование не связано со степенью дифференцировки скПКР. Интересно, что отсутствие метастазов менее вероятно в плохо дифференцированных опухолях (отношение шансов 0,29), хотя этот результат не является статистически значимым (р = 0,085).
На специфичность рассматриваемой ассоциации указывает отсутствие связи степени дифференцировки со стадиями опухоли по TNM-классификации (р = 0,128).
Помимо различий в генах, изменяющих экспрессию при дифференцировке опухоли или при ее мета-стазировании, может быть различной и коэкспрессия генов, что отражает изменения в экспрессионной картине и относится к взаимодействию генов. В связи с этим были изучены особенности корреляций экспрессии при разных степенях дифференцировки опухоли, при наличии или отсутствии метастазирования (табл. 5).
CV а CV «t
CS
и
ex и
N а N it
Таблица 4. Ассоциация метастазирования и степени дифференцировки Table 4. Correlation between metastasis and cell differentiation grades
Степень дифференцировки
Общее число образцов
Differentiation grade , г., , , , , .
" I Total number of samples
Low Grade High Grade
43 22
Образцы с синхронным тазами
Образцы с метахронны-ми метастазами
Samples with simultaneous I Samples with metachronous metastases I metastases
Образцы без метастазирования
Samples without metastases
%
30,2 68,2
Ассоциация с Grade, p
Association with Grade, p
0,007
%
20,9 13,6
Ассоциация с Grade, p
Association with Grade, p
%
0,74
34,9 13,6
Ассоциация с Grade, p
Association with Grade, p
0,085
Таблица 5. Корреляции экспрессии генов при разной степени дифференцировки светлоклеточного почечно-клеточного рака и при наличии/отсутствии метастазирования
Table 5. Correlations of gene expression under various clear cell renal cell carcinoma differentiation grades with and without metastasis
Гены
Высокая степень дифференцировки Hish Grade
Низкая степень дифференцировки
Low Grade
Коэффициент корреляции
Correlation coefficient
CA9/IGFBP3 -0,472 0,048 0,558 0,017 - - - -
CA9/ANGPTL4 -0,550 0,018 - - - - - -
ANGPTL4/EGLN3 -0,566 0,014 - - - - - -
NDUFA4L2/FN1 -0,562 0,015 0,602 0,008 - - - -
Окончание табл. 5 End of table 5
cv а
<N «t
CS
U
ex и
N а N it
Высокая степень дифференцировки Низкая степень д Low ифференцировки Grade
без метастазирования с синхронными без метастазирования с синхронными
метастазами метастазами
Гены Genes without metastasis with simultaneous metastases without metastasis with simultan metastase eous
Коэффициент корреляции Р Коэффициент корреляции Р ^о^рф^ицгиен" Р Коэффициент корреляции Р
coefficient coefficient if* coefficient
ANGPTL4/FN1 -0,618 0,006 - - - - - -
ANGPTL4/NDUFA4L2 - - 0,482 0,043 - - - -
NDUFA4L2/VWF - - 0,473 0,048 - - -
EGLN3/VWF - - 0,531 0,023 0,499 0,034 - -
EGLN3/IGFBP3 - - 0,505 0,033 - - - -
EGLN3/BHLHE41 - - - - 0,475 0,045 - -
EGLN3/CSF1R - - - - -0,507 0,037 - -
VWF/C1QA - - - - - - 0,435 0,023
ANGPTL4/BHLHE41 - - - - - - 0,388 0,04
В результатах, приведенных в табл. 5, прежде всего обращает внимание различное число генов с коррелирующей экспрессией при разной степени дифференци-ровки опухоли — большее число в дифференцированных опухолях по отношению к низкодифференцированным. Это наблюдается как в метастазирующих, так и в неме-тастазирующих опухолях, т. е. гены, принимающие участие в прогрессировании и метастазировании скПКР [4, 7], имеют большую координацию экспрессии в дифференцированных опухолях скПКР по сравнению с низкодифференцированными. Кроме этого, следует отметить различие в характеристиках коэкспрессии в метастазирующих и неметастазирующих опухолях при одной и той же степени дифференцировки.
Таким образом, значительная часть исследованных генов изменяет экспрессию сходным образом при мета-стазировании и дедифференцировке скПКР. Это может свидетельствовать о сходстве функциональных процессов, приводящих к указанным результатам. На связь метастазирования и дедифференцировки скПКР прямо указывает также обнаруженная нами их ассоциация. Найденная взаимосвязь может быть обусловлена сходством ряда ключевых процессов при развитии раковой опухоли, протекающих с участием изученных в данной работе генов и характерных как для метастазирования, так и для дифференцировки/дедифференцировки клеток
опухоли. Экспрессия генов NDUFA4L2, EGLN3, ANGPTL4, CA9 и IGFBP3 связана с энергетическим метаболизмом — обеспечением определенных соотношений митохондриального метаболизма и гликолиза; BHLHE41 участвует в активации эпителиально-мезенхимального перехода (EMT), и все указанные гены регулируются HIF1 (индуцированный гипоксией фактор 1), обеспечивающим адаптацию опухоли к гипоксии [4, 7]. Наряду с геном VWF, влияющим на ангиогенез, их экспрессия обеспечивает важнейшие процессы, приводящие к дедифференцировке клеток опухоли, — ответ на гипоксию, активацию эпителиально-мезенхимального перехода и регуляцию соотношения гликолиза и окислительного фосфорилирования [5, 6, 9, 10].
Участие рассматриваемых генов в 2 процессах — метастазировании и контроле степени дифференци-ровки — связано с их существенной ролью в развитии рака, которое носит комплексный характер [7]. В то же время ген C1QA, связанный с метастазированием [4], не принимает участия в контроле дифференцировки, как следует из полученных в настоящей работе результатов. Наряду с этим экспрессия генов FN1 и CSF1R несущественна для процессов метастазирования скПКР [4], но может быть ассоциирована с дифферен-цировкой, однако это требует дополнительного исследования.
Интересным представляется обнаруженная низкая корреляция экспрессии исследуемых генов, особенно при низкой степени дифференцировки. Это контрастирует с высокой корреляцией этих же генов при про-грессировании скПКР по стадиям TNM-классифика-ции [4]. В связи с этим показанное нами отсутствие ассоциации степени дифференцировки с прогрессией опухоли по TNM-классификации указывает на различие процессов развития опухоли и ее дедифференци-ровки. С другой стороны, низкая коэкспрессия генов при низкой степени дифференцировки скПКР соответствует представлениям о дезорганизации экспрессии генов в дедифференцированных злокачественных клетках [11]. Как отмечает автор цитированной статьи, реалистичная дифференцировочная терапия должна быть направлена на устранение дезорганизации экспрессии связанных с дифференцировкой генов [11].
Дифференцировочная терапия направлена на стимуляцию дифференцировки раковых стволовых клеток либо на дедифференцированные злокачественные клетки опухоли, которые имеют многие свойства раковых стволовых клеток [12]. С этой целью применяются различные воздействия [1—3].
Как уже отмечалось ранее, характеристики диф-ференцировки тесно связаны с метаболическими
особенностями опухоли, в которых задействованы и изученные нами гены. Воздействие на связанные с ними пути также рассматривается в качестве стратегии дифференцировочной терапии [13, 14]. Поскольку в стимуляции и метастазирования, и дедифферен-цировки одна из ключевых ролей отводится ЕМТ, в котором также принимают участие изученные нами гены, то способом снижения злокачественности и метастазирования может служить реализация обратного процесса — мезенхимально-эпителиального перехода [6, 15].
Заключение
Показана связь метастазирования и степени диффе-ренцировки опухолей скПКР с экспрессией генов. Экспрессия значительной части генов, существенных для развития опухоли, связана как с метастазированием, так и со степенью дифференцировки, что объясняется сходством функциональных изменений, стимулирующих оба процесса. Выявлена низкая корреляция экспрессии генов в опухолях с низкой степенью дифферен-цировки, в противовес их высокой коэкспрессии при прогрессии опухоли по TNM-классификации. Это указывает на дезорганизацию экспрессии генов при де-дифференцировке.
CV а
JN «t
CS
U
et
U
N а N it
ЛИТЕРАТУРА / REFERENCES
1. Zhang X., Hu B., Sun Y.F. et al. Arsenic trioxide induces differentiation of cancer stem cells in hepatocellular carcinoma through inhibition of LIF/JAK1/STAT3 and NF-kB signaling pathways synergistically. Clin Transl Med 2021;11(2):e335. DOI: 10.1002/ctm2.335.
2. Zhao Z., Gao J., Li C. et al. Reactive oxygen species induce endothelial differentiation of liver cancer stem-like sphere cells through the activation of Akt/ IKK signaling pathway. Oxid Med Cell Longev 2020;2020:1621687.
DOI: 10.1155/2020/1621687.
3. Gonzalez-Guerrico A.M., Espinoza I., Schroeder B. et al. Suppression
of endogenous lipogenesis induces reversion of the malignant phenotype and normalized differentiation in breast cancer. Oncotarget 2016;7(44):71151-68. DOI: 10.18632/oncotarget.9463.
4. Apanovich N., Peters M., Apanovich P. et al. The genes-candidates for prognostic markers of metastasis by expression level in clear cell renal cell cancer. Diagnostics 2020;10(1):30.
DOI: 10.3390/diagnostics10010030.
5. Jögi A., Vaapil M., Johansson M., Pahlman S. Cancer cell differentiation heterogeneity
and aggressive behavior in solid tumors. Ups J Med Sci 2012;117(2):217-24. DOI: 10.3109/03009734.2012.659294.
6. Zheng X., Dai F., Feng L. et al. Communication between epithelialmesenchymal plasticity and cancer stem cells: new insights into cancer progression. Front Oncol 2021;11:617597.
DOI: 10.3389/fonc.2021.617597.
7. Apanovich N., Apanovich P., Mansorunov D. et al. The choice of candidates in survival markers based on coordinated gene expression in renal cancer. Front
Oncol 2021;11:615787. DOI: 10.3389/fonc.2021.615787.
8. Moein S., Javanmard S.H., Abedi M. et al. Identification of appropriate housekeeping genes for gene expression analysis
in long-term hypoxia-treated kidney cells. Adv Biomed Res 2017;6:15. DOI: 10.4103/2277-9175.200790.
9. Rodrigues A.S., Pereira S.L., Ramalho-Santos J. Stem metabolism: Insights from oncometabolism and vice versa. Biochim Biophys Acta Mol Basis Dis 2020;1866(7):165760.
DOI: 10.1016/j.bbadis.2020.165760. 10. Mimeault M., Batra S.K. Hypoxia-inducing factors as master regulators
of sternness properties and altered metabolism of cancer- and metastasis-initiating cells. J Cell Mol Med 2013;17(1):30-54. DOI: 10.1111/jcmm.12004.
11. Capp J.P. Cancer stem cells: from historical roots to a new perspective. J Oncol 2019;2019:5189232.
DOI: 10.1155/2019/5189232.
12. Jin X., Jin X., Kim H. Cancer stem cells and differentiation therapy. Tumor Biol 2017;39(10):1010428317729933. DOI: 10.1177/1010428317729933.
13. Riester M., Xu Q., Moreira A. et al. The Warburg effect: persistence of stem-cell metabolism in cancers as a failure of differentiation. Ann Oncol 2018;29(1):264-70.
DOI: 10.1093/annonc/mdx645.
14. Khan T., Cabral H. Abnormal glycosylation of cancer stem cells and targeting strategies.
Front Oncol 2021;11:649338. DOI: 10.3389/fonc.2021.649338.
15. Tanabe S., Quader S., Cabral H., Ono R. Interplay of EMT and CSC in cancer and the potential therapeutic strategies. Front Pharmacol 2020;11:904.
DOI: 10.3389/fphar.2020.00904.
cv а JN it
ев
u
СХ U
N а N it
Вклад авторов
Н.В. Апанович: получение данных, анализ результатов, написание статьи;
А.В. Матвеев: сбор и анализ клинических образцов;
П.В. Апанович: статистический анализ полученных данных;
A.А. Коротаева, Ф.М. Кипкеева, Т.А. Музаффарова: обзор публикаций по теме статьи; О.А. Халмурзаев: клинические характеристики образцов;
B.Б. Матвеев: обзор публикаций по теме статьи, анализ данных;
А.В. Карпухин: написание статьи, разработка дизайна исследования, анализ результатов, научное редактирование текста рукописи. Authors' contributions
N.V. Apanovich: obtaining data, analysis of results, article writing; A.V. Matveev: collection and analysis of clinical samples; P. V. Apanovich: statistical analysis of the obtained data;
A.A. Korotaeva, F.M. Kipkeeva, T.A. Muzaffarova: reviewing of publications of the article's theme;
O.A. Khalmurzaev: clinical characteristics of samples;
V.B. Matveev: reviewing of publications of the article's theme, data analysis;
A.V. Karpukhin: article writing, developing the research design, analysis of results, scientific editing of the article. ORCID авторов / ORCID of authors
Н.В. Апанович / N.V. Apanovich: https://orcid.org/0000-0002-9221-115X П.В. Апанович / P.V. Apanovich: https://orcid.org/0000-0001-6576-5512 Ф.М. Кипкеева / F.M. Kipkeeva: https://orcid.org/0000-0003-4778-9726 Т.А. Музаффарова / T.A. Muzaffarova: https://orcid.org/0000-0002-2345-2056
B.Б. Матвеев / V.B. Matveev: https://orcid.org/0000-0001-7748-9527 А.В. Карпухин / A.V. Karpukhin: https://orcid.org/0000-0002-7001-9116
Конфликт интересов. Авторы заявляют об отсутствии конфликта интересов. Conflict of interest. The authors declare no conflict of interest.
Финансирование. Исследование проведено в рамках государственного задания Министерства науки и высшего образования Российской Федерации на 2021 г.
Financing. The study was conducted under the state assignment of the Ministry of Science and Higher Education of the Russian Federation for 2021. Соблюдение прав пациентов и правил биоэтики
Протокол исследования одобрен комитетом по биомедицинской этике ФГБНУ «Медико-генетический научный центр им. акад. Н.П. Бочкова». Протокол № 2017-4/2.
Все пациенты подписали информированное согласие на участие в исследовании. Compliance with patient rights and principles of bioethics
The study protocol was approved by the biomedical ethics committee of Research Centre for Medical Genetics. Protocol No. 2017-4/2. All patients gave written informed consent to participate in the study
Статья поступила: 19.10.2021. Принята к публикации: 11.12.2021. Article submitted: 19.10.2021. Accepted for publication: 11.12.2021.
