Научная статья на тему 'Сезонные изменения дегидринов почек Betula platyphylla Sukacz. , связанные с формированием устойчивости к экстремальному климату Якутии'

Сезонные изменения дегидринов почек Betula platyphylla Sukacz. , связанные с формированием устойчивости к экстремальному климату Якутии Текст научной статьи по специальности «Биологические науки»

CC BY
144
51
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
Журнал
Biological Communications
WOS
Scopus
ВАК
RSCI
Область наук
Ключевые слова
ЯКУТИЯ / СУММАРНЫЕ БЕЛКИ / ДЕГИДРИНЫ / СЕЗОННЫЕ ИЗМЕНЕНИЯ / УСТОЙЧИВОСТЬ К ЭКСТРЕМАЛЬНОМУ КЛИМАТУ / BETULA PLATYPHYLLA / YAKUTIA / TOTAL PROTEINS / DEHYDRINS / SEASONAL CHANGES / TOLERANCE TO THE EXTREME CLIMATE

Аннотация научной статьи по биологическим наукам, автор научной работы — Татаринова Татьяна Дмитриевна, Пономарев Анатолий Гаврильевич, Перк Александр Александрович, Васильева Ирина Вениаминовна, Бубякина Виктория Витальевна

Впервые в почках берез якутской популяции Betula platyphylla выявлены сезонные изменения суммарных белков и дегидринов. С помощью иммунодетекции обнаружены две группы мажорных низкомолекулярных (15, 17, 18 и 21 кДа) и среднемолекулярных (59, 64, 66, 69 и 73 кДа) дегидринов, стабильно высокое содержание которых в период покоя коррелирует с наибольшей морозоустойчивостью деревьев. Установлен их полиморфизм внутри популяции. Обнаруженные особенности сезонных изменений дегидринов предполагают их участие в формировании морозоустойчивости березы к экстремально низким зимним температурам в условиях резко континентального климата Якутии.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по биологическим наукам , автор научной работы — Татаринова Татьяна Дмитриевна, Пономарев Анатолий Гаврильевич, Перк Александр Александрович, Васильева Ирина Вениаминовна, Бубякина Виктория Витальевна

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Seasonal changes of bud dehydrins of Betula platyphylla Sukacz., associated with development of resistance to extreme climate of Yakutia

For the first time seasonal fluctuations of spectra of total proteins and dehydrins were detected in buds of Betula platyphylla of Yakutia. By the means of immunodetection there identifi ed two groups of major dehydrins with low (15, 17, 18 and 21 kDa) and medium (59, 64, 66, 69 and 73 kDa) molecular masses, constantly high content of which coincides with the largest frost resistance of trees during the dormancy period, the polymorphism within the population being revealed. The characteristics of seasonal changes of dehydrins suggest their participation in the development of frost resistance of birch to extremely low temperatures in winter with severe continental climate of Yakutia.

Текст научной работы на тему «Сезонные изменения дегидринов почек Betula platyphylla Sukacz. , связанные с формированием устойчивости к экстремальному климату Якутии»

Т.Д. Татаринова, А. Г.Пономарев, А. А. Перк, И.В.Васильева, В.В.Бубякина СЕЗОННЫЕ ИЗМЕНЕНИЯ

ДЕГИДРИНОВ ПОЧЕК BETULA PLATYPHYLLA SUKACZ.,

СВЯЗАННЫЕ С ФОРМИРОВАНИЕМ УСТОЙЧИВОСТИ К ЭКСТРЕМАЛЬНОМУ КЛИМАТУ ЯКУТИИ

Введение

На территории Якутии, находящейся в пределах криолитозоны (многолетняя мерзлота), отмечаются максимальные годовые перепады температур (более 100 °С), не встречающиеся ни в одной другой точке мира. Резко континентальный климат региона характеризуется малой продолжительностью вегетационного периода, экстремально низкими зимними (до -55...-60 °С) и высокими летними (до +38 °С) температурами, приводящими к дефициту влаги в воздухе и почве. Местные древесные виды растений обладают ранними сроками вхождения в состояние глубокого покоя при относительной его краткости, а также очень продолжительным периодом вынужденного покоя при экстремально жестком низкотемпературном стрессе. Последний выступает как главный фактор отбора при адаптации растений на Севере.

Степень морозоустойчивости многолетних растений изменяется сезонно в зависимости от колебаний температуры. Этот процесс называется сезонным холодовым закаливанием и раззакаливанием [1]. Различные ткани и органы растений обладают разной степенью устойчивости к действию отрицательных температур. Известно, что наиболее криотолерантны почки и кора растений [2]. Вместе с тем даже в пределах одного вида встречаются особи с различной степенью устойчивости к тем или иным стресс-факторам. Каждая особь в популяции, как и сама популяция в целом, обладают разным набором генетических, морфологических и биохимических признаков, обусловливающих их гетерогенность (полиморфизм). Гетерогенность играет важную роль, обеспечивая значительное расширение адаптивного потенциала популяции. Одним из маркеров полиморфизма могут служить особенности как спектров суммарных белков, так и отдельных полипептидов индивидуальных растений, отличающихся высокой устойчивостью к холодовому стрессу.

В ходе холодового закаливания в результате низкотемпературного воздействия и уменьшения фотопериода индуцируется накопление АБК и других ингибиторов, происходит постепенная дегидратация, сопровождаемая экспрессией генов, кодирующих Cor-полипептиды (регулируемые холодом). К последним относятся, например, ферменты, ответственные за синтез совместимых осмолитов, десатуразы, а также белки теплового шока [1, 3]. Среди участвующих в процессах холодового закаливания полипептидов особый интерес вызывает ряд белков со структурным сходством с белками позднего эмбриогенеза (Late Embryogenesis Abundant, LEA). К группе II суперсемейства LEA-белков относятся водорастворимые белки-дегидрины, индуцируемые обезвоживанием [3, 4]. Они отличаются наличием высококонсервативных Y, S и K-сегментов,

© Т. Д. Татаринова, А. Г. Пономарев, А. А. Перк, И. В. Васильева, В. В. Бубякина, 2011

а также последовательностей богатых глицином. Обязательным для всех дегидринов является присутствие K-сегмента. Дегидрины выявляются при многих стрессовых воздействиях (низкие температуры, засуха, засоленность), сопровождающихся изменением водного статуса растений. Они задействованы в стабилизации макромолекул и мембран.

Вероятно, что спектр белков, связанный с формированием уникальной морозоустойчивости растений Якутии, а также характер их годовых изменений имеет особенности, отличные от таковых в многолетних растениях более умеренных зон. Подобного рода исследования биохимических особенностей деревьев криолитозоны ранее не проводились.

Цель настоящей работы — изучение сезонных изменений состава и содержания суммарных белков и дегидринов почек березы плосколистной (Betula platyphylla Sukacz.) при формировании морозоустойчивости в условиях экстремального климата Центральной Якутии.

Материалы и методы исследования

Исследования проводили в течение 2009 г. в лесопарковой зоне на территории Ботанического сада Института биологических проблем криолитозоны СО РАН, расположенного на второй надпойменной террасе долины р. Лены в 7 км к западу от г. Якутска (62 °15' с.ш., 129 °37' в.д.). Объектом исследования являлась береза плосколистная (Betula platyphylla Sukacz.) — наиболее распространенная лесообразующая лиственная порода Якутии. Сбор полевых материалов осуществляли ежемесячно на постоянных пробных площадях с шести деревьев (Ya1-Ya6). Возраст берез — 40-50 лет. Использовали почки текущего прироста березы, расположенные в средней, хорошо освещаемой естественным светом части кроны и собранные в первую половину дня (9:00-10:00). В период отсутствия почек в июне для анализа собирались листья. Средняя температура воздуха за май-сентябрь 2009 г. составляла 14,2 °С, сумма осадков во время вегетации достигала 142 мм, минимальная зимняя температура воздуха -44 °С (начало февраля). Эти показатели климата близки к средним многолетним значениям, наблюдаемым в Центральной Якутии. Для выделения суммарных белков почки и листья березы (1-2 г) измельчали в ступке в жидком азоте в присутствии нерастворимого по-ливинилпирролидона (ПВП, “Serva”, Германия, 2,5 % по отношению к объему буфера для экстракции) и буфера (20 мл), содержавшего 0,1 М Трис-HCl, рН 7,5, 12 мМ 2-мер-каптоэтанола, 1%-ного ДДС, 10 мМ ЭДТА, 3 мМ ФМСФ (фенилметилсульфонилфто-рид) [5]. Гомогенат центрифугировали 20 мин при 50 000 g. К супернатанту добавляли ПВП (2,5% по отношению к объему супернатанта) и центрифугировали 20 мин при 50 000 g. Все процедуры проводили при 4 °С. Белки осаждали пятью объемами ацетона при -20 °С. Содержание белка определяли с помощью набора (“Bio-Rad”, США). Электрофорез проводили в 12,5%-ной SDS-PAGE [6] с использованием маркеров молекулярной массы (мол. м.) (“Fermentas”, Литва) и последующим окрашиванием белков Ку-масси R-250. На треки наносили равное количество белка (15 мкг). Иммуноблоттинг проводили в соответствии с методикой из работы [7]. Белки из ПААГ переносили на ПВДФ (поливинилиденфторид) мембрану (“Bio-Rad”, США).

Идентификацию дегидринов выполняли с помощью поликлональных антител против их консервативного К-сегмента (EKKGIME/DKIKEKLPG) [4] в разведении

1:500 (“Agrisera”, Швеция). Дегидрины визуализировали при помощи кроличьих антител, конъюгированных с щелочной фосфатазой в разведении 1 : 2500 (“Sigma”, США). В качестве хромогенных субстратов использовали 5-бромо-4-хлоро-3-индолил фосфат и нитросиний тетразолий (“AppliChem”, Германия). На рисунках приведены результаты электрофореза и иммуноблоттинга суммарных белков почек и листьев (июнь) трех характерных экземпляров берез (Ya3, Ya4, Ya6) после трех аналитических определений. Температуру воздуха в районе г. Якутска отслеживали по данным (URL: http:// www.wunderground.com) с параллельной ее регистрацией на опытном участке с помощью термографа DS1922L iBitton (“Dallas Semiconductor”, США). Данные сканирования гелей и блотов (“Canon”, Япония) обрабатывали с помощью программы ImageJ 1.41 o / Java 1.50_09 (США). Молекулярную массу белков рассчитывали в среде электронной таблицы Microsoft Excel 2002 из пакета Microsoft Office.

Результаты исследования и их обсуждение

Одним из подходов для выявления специфики адаптационного процесса растений служит исследование сезонных изменений белковых спектров [8]. По мере снижения минимальной температуры воздуха с 12,5 до 1,5 °С с июля по август происходит уменьшение на 30% содержания влаги в побегах березы, что запускает механизмы холодового закаливания деревьев [9].

В общем спектре суммарных белков почек B.platyphylla из Центральной Якутии было идентифицировано около 60 полос полипептидов с разной мол. м. (рис. 1). Эти белки берез условно могут быть разделены на три группы в зависимости от сезонного поведения. К первой группе относятся полипептиды, обнаруживающиеся круглогодично и мало подверженные сезонным количественным изменениям, например, мажорные белки с мол. м. 51, 83, 116 кДа. Во вторую группу можно объединить полипептиды с выраженной сезонной динамикой, наиболее представленные в летний период. К таковым можно отнести белки с мол. м. 15, 39, 60, 68 и 79 кДа. Видно, что с наступлением весны (май), после значительного повышения среднесуточных температур и в летний период во время вегетации растений в спектре суммарных белков почек берез количественно преобладают более высокомолекулярные полипептиды. Одновременно снижается содержание белков в низкомолекулярной области. Вместе с тем в июне, когда почки только формируются, в спектре белков листьев выявляются несколько мажорных полипептидов с мол. м. 15, 49 и 51 кДа, в то время как другие белки представлены в менее значительных количествах. К третьей группе белков, накопление которых наблюдается при подготовке растений к покою (август, сентябрь) и, вероятно, связанных с формированием устойчивости к экстремальным условиям перезимовки, относятся полипептиды с мол. м. 14, 17, 26, 27, 42, 49 кДа. Их уровень остается стабильно высоким в течение длительной зимы. Хотя функции этих мажорных белков в период покоя неизвестны, особенности их сезонной динамики позволяют предположить, что среди них могут быть запасающие и иные полипептиды, ассоциированные с перезимовкой. В целом выявленная динамика сезонных изменений суммарных белков является однотипной в годовом цикле якутской популяции берез.

Одновременно при сравнении электрофоретических спектров белков между отдельными экземплярами берез установлено наличие вариабельных участков, расположенных в двух областях. Прежде всего, это относится к белкам с мол. м. 23-26 кДа.

-116 ■ 83 ' 79 68 60 - 51 ' 49 ' 42 ' 39

. 27 26

17

15

14

Янв. Фев. Март Апр. Май Июнь Июль Авг. Сент. Окт. Нояб. Дек. Месяцы

б

кДа

Янв. Фев. Март Апр. Май Июнь Июль Авг. Сент. Окт. Нояб. Дек. Месяцы в

Янв. Фев. Март Апр. Май Июнь Июль Авг. Сент. Окт. Нояб. Дек. Месяцы

Рис. 1. Результаты электрофореза суммарных белков почек (в июне — листьев) B. pla-typhylla Ya3 (а), Ya4 (б), Ya6 (в) в течение 2009 г.

Слева — мол. м. маркеров; справа — полипептидов с сезонной динамикой.

кДа

.69

‘ 66

кДа 116—►

66,2—►

45—►

35—►

25-»-

-21

. 18 -17 -15

Янв. Фев. Март Апр. Май Июнь Июль Авг. Сент. Окт. Нояб. Дек. Месяцы

б

кДа

69

:бб

'59

18,4-

14,4-

-17

Янв. Фев. Март Апр. Май Июнь Июль Авг. Сент. Окт. Нояб. Дек. Месяцы

Рис. 2. Результаты иммуноблоттинга суммарных белков почек (в июне — листьев) B. pla-typhylla Ya3 (а), Ya4 (б), Ya6 (в) с антителами на дегидрины в течение 2009 г.

Слева — мол. м. маркеров; справа — дегидри-нов.

кДа

73 69 : 66 64 59

Янв. Фев. Март Апр. Май Июнь Июль Авг. Сент. Окт. Нояб. Дек.

В данной области выявляются от 1 до 4 минорных белковых полос, которые занимают различные позиции у разных образцов растений. Другой полиморфный участок представлен в области мол. м. 16-18 кДа, где наблюдается от 1 до 3 минорных белковых полос. Таким образом, выявленные полиморфные участки в спектрах суммарных белков почек могут служить маркерами отдельных экземпляров берез.

Сравнение спектров дегидринов, выявленных с помощью иммуноблоттинга, показало, что у изученных берез наблюдаются две области распределения мажорных дегидринов: низкомолекулярная — в интервале от 15 до 21 кДа и среднемолекулярная — в интервале от 59 до 73 кДа (рис. 2). Мажорные полипептиды с мол. м. 17, 66 и 69 кДа встречаются у всех экземпляров растений, в то время как другие обнаруживаются только у отдельных берез. Например, 18 и 21 кДа-белки характерны для березы Ya3 (рис. 2, а), но отсутствуют у берез Ya4 (рис. 2, б) и Ya6 (рис. 2, в). Дегидрины с мол. м. 66 и 69 кДа наблюдаются у всех экземпляров берез, в то время как полипептид с мол. м. 73 кДа характерен только для Ya6. Дегидрин с мол. м. 59 кДа свойственен березам Ya4 и Ya6. Наличие дегидрина с мол. м. 64 кДа также характерно для березы Ya6. В целом березы Ya4 и Ya6 имеют меньше различий по спектру дегидринов почек между собой по сравнению с таковым березы Ya3. Остальные экземпляры берез (Ya1, Ya2, Ya5) обладали сходными характеристиками, более близкими к березам Ya4 и Ya6 (данные не приведены).

У всех берез наблюдаются общие черты в сезонных изменениях дегидринов. Во-первых, низкомолекулярные дегидрины имеют более выраженную сезонную динамику, чем среднемолекулярные. Они полностью исчезают во время вегетации, начиная с апреля-мая, и вновь появляются в августе-сентябре при подготовке растений к покою. Интересно, что дегидрин с мол. м. 17 кДа у березы Ya6 исчезает ранней весной и появляется также рано осенью в августе, в то время как у берез Ya3 и Ya4 он исчезает в мае и вновь синтезируется в сентябре. С другой стороны, среднемолекулярные дегидрины имеют менее выраженную динамику в годовом цикле. Их содержание несколько падает в летний период. Изученные экземпляры берез также отличались по количеству мажорных дегидринов. В целом количество изоформ дегидринов колебалось от 4 (Ya4) до 6 (Ya3 и Ya6), причем низкомолекулярных от 1 (Ya4 и Ya6) до 4 (Ya3), а среднемолекулярных — от 2 (Ya3) до 5 (Ya6). Осенью в период листопада березы, вероятно, полностью формируется необходимый набор дегидринов. Можно предположить, что главным для поддержания низкотемпературной устойчивости берез является наличие двух групп дегидринов — низко- (17, 18 и 21 кДа) и среднемолекулярных (59, 64, 66, 69 и 73 кДа). Их индивидуальный полиморфизм, возможно, обусловлен посттрансляцион-ной модификацией отдельных дегидринов, что может являться одной из адаптивных реакций организма. Существование подобных изменений было описано для белка Picg5 белой ели (Picea glauca), предполагаемая функция которого связана с приобретением устойчивости к холодовому стрессу [10].

В период подготовки к зиме наблюдается значительный синтез дегидринов, связанный со снижением содержания воды, одновременно сопровождаемый появлением ингибиторов роста и повышением содержания ненасыщенных жирных кислот в органах и тканях B.platyphylla и возрастанием морозоустойчивости [11, 12]. Нами было показано, что уровень дегидринов в побегах B. platyphylla якутской популяции является самым высоким в период покоя, когда морозоустойчивость достигает максимума [9]. В период возобновления роста побегов весной происходит деакклимация, которая

сопровождается резким снижением уровня дегидринов, особенно низкомолекулярных, и морозоустойчивости в целом. Таким образом, самый низкий уровень дегидринов приходится на период вегетации. Аналогичная зависимость для дегидринов почек выявлена в настоящей работе. Другие исследователи также отмечали связь между накоплением дегидринов у древесных растений умеренных зон и уровнем их устойчивости к холоду [3]. Содержание обнаруженных нами низкомолекулярных дегидринов почек берез в области мол. м. 15-21 кДа и среднемолекулярных дегидринов в области мол. м. 56-73 кДа в период с октября по апрель оставалось без заметных колебаний на высоком уровне. Данный факт отличается от выводов, сделанных при изучении дегидринов, выявляемых с помощью антител против дегидрина dsp 16 из Craterostigma plantagineum, в почках другого вида березы (B. pubescens) в условиях Скандинавии [13]. Авторы указанной работы отмечали максимум содержания найденного ими дегидрина 24 кДа в течение всего осенне-зимнего периода, а дегидрина 30 кДа — только в самые холодные месяцы зимы. Возможно, это связано с тем, что в условиях относительно мягкого климата Финляндии часто наблюдаются возвратные потепления, в отличие от резко континентального климата Центральной Якутии, где температура воздуха стабильно держится в пределах низких отрицательных значений, подавляя возможность изменения состава дегидринов во время покоя.

При сравнении молекулярных масс наиболее близким к дегидрину с мол. м. 21 кДа почек якутской березы B. platyphylla является дегидрин с мол. м. 24 кДа почек финской березы B.pubescens. Наблюдаемые различия в молекулярных массах могут быть связаны с видовой спецификой растений и климатическими особенностями региона. Сходные по молекулярным массам дегидрины, индицируемые холодом, также найдены у Vaccinium corymbosum (14 и 65 кДа) [14] и Citrus unshiu (19 кДа) [15]. Насколько нам известно, идентифицированные в данной работе низко- и среднемолекулярные дегидрины ранее у берез не описывались.

Заключение

Впервые в почках берез якутской популяции Betula platyphylla выявлены сезонные изменения суммарных белков и дегидринов. С помощью иммунодетекции обнаружены две группы мажорных низкомолекулярных (15, 17, 18 и 21 кДа) и среднемолекулярных (59, 64, 66, 69 и 73 кДа) дегидринов, стабильно высокое содержание которых в период покоя коррелирует с наибольшей морозоустойчивостью деревьев. Установлен их полиморфизм внутри популяции. Обнаруженные особенности сезонных изменений дегидринов предполагают их участие в формировании морозоустойчивости березы к экстремально низким зимним температурам в условиях резко континентального климата Якутии.

***

Работа выполнена при финансовой поддержке РФФИ (грант №09-04-98556-р_ восток_а).

1. Functional role of winter-accumulating proteins from mulberry tree in adaptation to winter-induced stresses / Fujikawa S., Ukaji N., Nagao M. Yamane K., Takezawa D., Arakawa K. // Cold Hardiness in Plants: Molecular and Physiology. 2006. P. 181-202.

2. Туманов И. И. Физиология закаливания и морозостойкости растений. М.: Наука, 1979. 350 с.

3. Welling A., Palva E. T. Molecular control of cold acclimation in trees // Physiologia Plantarum. 2006. Vol. 127. P. 167-181.

4. Svensson J., Ismail A. M., Palva E. T., Close T. J. Dehydrins // Cell and molecular responses to stress. Amsterdam, NL: Elsevier Press, 2002. Vol. III. P. 155-171.

5. Variations in the content of stress proteins in the needles of common pine (Pinus sylvestris L.) within an annual cycle / Korotaeva N. E., Oskorbina M. V., Kopytova L. D., Suvorova G. G., Borovskii G. B., Voinikov V. K. // J. For. Research. 2011. DOI 10.1007/s10310-011-0260-y.

6. Laemmli U. K. Cleavage of structural proteins during the assembly of the head of bacteriophage T4 // Nature. 1970. Vol. 227. P. 680-685.

7. Timmons T. M., Dunbar B. S. Protein blotting and immunodetection // Methods Enzymol. 1990. Vol. 182. P. 679-701.

8. Пономарев А. Г., Татаринова Т. Д., Перк А. А., Бубякина В. В., Алексеев В. А. Физиологобиохимические характеристики Betula platyphylla в связи с условиями произрастания на многолетней мерзлоте // Вестн. Моск. гос. ун-та леса: Лесной вестник. 2009. № 2. С. 12-16.

9. Особенности сезонной динамики дегидринов Betula platyphylla Sukacz., ассоциированные с формированием морозоустойчивости в условиях криолитозоны / Бубякина В. В., Татаринова Т. Д., Пономарев А. Г., Перк А. А., Соломонов Н. Г. // Докл. АН. 2011. Т. 439. № 6. С. 844-877.

10. Characterization of Picg5 novel proteins associated with seasonal cold acclimation of white spruce (Picea glauca) / Liu J. J., Abul К. М., Ekramoddoullah D. T., Piggott N, Summer L., Hawkins B. // Trees. 2004. Vol. 18. P. 649-657.

11. Древесные растения Якутии и низкотемпературный стресс / Петров К. А., Софроно-ва В. Е., Бубякина В. В., Перк А. А., Татаринова Т. Д., Пономарев А. Г., Чепалов В. А., Охлопкова Ж. М., Васильева И. В., Максимов Т. Х. // Физиология растений. 2011. Т. 439. №6. С. 866-874.

12. Сезонная динамика тотальных белков и ингибиторов роста Betula platyphylla в условиях разных регионов криолитозоны Якутии / Бубякина В. В., Алексеев В. А., Петров К. А., Тата-ринова Т. Д., Перк А. А., Пономарев А. Г. // Первые Беккеровские чтения. Ч. I. Волгоград, 2010. С. 25-26.

13. Rinne P., Welling A., Kaikuranta P. Onset of Freezing Tolerance in Birch (Betula pubescens Ehrh.) Involves LEA Proteins and Osmoregulation and is Impaired in an ABA-deficient Genotype // Plant Cell Environ. 1998. Vol. 21. P. 601-611.

14. Muthalif M. M., Rowland L. J. Identification of Dehydrin-Like Proteins Responsive to Chilling in Floral Buds of Blueberry (Vaccinium, section Cyanococcus) // Plant Physiol. 1994. Vol. 104. P. 14391447.

15. Hara M., Terashima S., Kuboi T. Characterization and cryoprotective activity of cold-responsive dehydrin from Citrus unshiu // J. Plant Physiol. 2001. Vol. 158. P. 1333-1339.

Статья поступила в редакцию 9 июня 2011 г.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.