Научная статья на тему 'РЕЗУЛЬТАТЫ ВЫЯВЛЕНИЯ SARS-COV-2 И ДРУГИХ ВОЗБУДИТЕЛЕЙ ВНЕБОЛЬНИЧНЫХ ПНЕВМОНИЙ МЕТОДОМ ПЦР В ТЮМЕНСКОЙ ОБЛАСТИ'

РЕЗУЛЬТАТЫ ВЫЯВЛЕНИЯ SARS-COV-2 И ДРУГИХ ВОЗБУДИТЕЛЕЙ ВНЕБОЛЬНИЧНЫХ ПНЕВМОНИЙ МЕТОДОМ ПЦР В ТЮМЕНСКОЙ ОБЛАСТИ Текст научной статьи по специальности «Клиническая медицина»

CC BY
141
35
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
Ключевые слова
ПНЕВМОНИЯ / ПЦР / SARS-COV-2 / КОИНФЕКЦИИ / PNEUMONIA / PCR / CO-INFECTIONS

Аннотация научной статьи по клинической медицине, автор научной работы — Бакштановская И. В., Степанова Т. Ф., Шарухо Г. В., Летюшев А. Н., Степанова К. Б.

Целью настоящей работы являлось выявление возбудителей внебольничных пневмоний и ко-инфицирования с помощью исследования биоматериала от пациентов методом ПЦР .Материалы и методы. Проведено исследование 268 проб от 258 пациентов методом ПЦР для выявления РНК /ДНК возбудителей респираторных инфекций вирусной и бактериальной природы.Результаты и обсуждение. В 43,3 % проб выявлена РНК SARS-CoV-2, в 4,5 % - РНК /ДНК возбудителей ОРВИ , в одной пробе - ДНК Mycoplasma pneumoniae. Ко-инфекция обнаружена только у пациентов противотуберкулезного диспансера (SARS-CoV-2 с микобактериями туберкулеза). У обследованных больных пневмонией РНК SARS-CoV-2 существенно чаще выявлялась в биоматериале из нижних дыхательных путей (52 %), чем в респираторных мазках (8,5 %). В первую неделю от начала заболевания обнаружено 19,2 % положительных проб, во вторую - 56,5 %.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по клинической медицине , автор научной работы — Бакштановская И. В., Степанова Т. Ф., Шарухо Г. В., Летюшев А. Н., Степанова К. Б.

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

RESULTS OF DETECTING SARS-COV-2 AND OTHER PATHOGENS OF COMMUNITY-ACQUIRED PNEUMONIA BY PCR IN THE TYUMEN REGION

The aim of this work was to identify the causative agent of community-acquired pneumonia and coinfection using PCR study of biomaterial from patients.Materials and methods. PCR testing of 268 samples from 258 patients was carried out to identify RNA/DNA of viral and bacterial pathogens of respiratory infections.Results and discussion. In 43.3 % of samples SARS-CoV-2 RNA was detected, in 4.5 % - RNA/DNA of acute respiratory viral infections pathogens, in one sample - DNA of Mycoplasma pneumoniae. Co-infection was detected only in patients of the anti-tuberculosis dispensary (SARS-CoV-2 and Mycobacterium tuberculosis). In the examined patients with pneumonia, SARS-CoV-2 RNA was significantly more often detected in biomaterial from the lower respiratory tract (52 %) than in respiratory smears (8.5 %). In the first week from the onset of the disease, 19.2 % of positive samples were found, in the second - 56.5 %.

Текст научной работы на тему «РЕЗУЛЬТАТЫ ВЫЯВЛЕНИЯ SARS-COV-2 И ДРУГИХ ВОЗБУДИТЕЛЕЙ ВНЕБОЛЬНИЧНЫХ ПНЕВМОНИЙ МЕТОДОМ ПЦР В ТЮМЕНСКОЙ ОБЛАСТИ»

краткие сообщения

Brief communications

DOI: 10.21055/0370-1069-2020-3-146-149

УДК 616.98:578.2

и.В. Бакштановская1, Т.ф. Огепанова1, Г.В. Шарухо2, А.н. летюшеви, к.Б. степанова1, н.В. логинова3, ц.А. Панина1, Е.А. Зматракова1, А.н. косырева1, А.З. бартусевич1, с.А. леонтьева1,

А.о. Вишнякова1

результаты выявления sars-cov-2 и других возбудителей внебольничных пневмоний методом пцр в тюменской области

'ФБУН «Тюменский научно-исследовательский институт краевой инфекционной патологии», Тюмень, Российская Федерация;

2Управление Роспотребнадзора по Тюменской области, Тюмень, Российская Федерация;

3Департамент здравоохранения Тюменской области, Тюмень, Российская Федерация

целью настоящей работы являлось выявление возбудителей внебольничных пневмоний и ко-инфицирования с помощью исследования биоматериала от пациентов методом ПЦР. материалы и методы. Проведено исследование 268 проб от 258 пациентов методом ПЦР для выявления РНК/ДНК возбудителей респираторных инфекций вирусной и бактериальной природы. результаты и обсуждение. В 43,3 % проб выявлена РНК SARS-CoV-2, в 4,5 % - РНК/ДНК возбудителей ОРВИ, в одной пробе - ДНК Mycoplasma pneumoniae. Ко-инфекция обнаружена только у пациентов противотуберкулезного диспансера (SARS-CoV-2 с микобактериями туберкулеза). У обследованных больных пневмонией РНК SARS-CoV-2 существенно чаще выявлялась в биоматериале из нижних дыхательных путей (52 %), чем в респираторных мазках (8,5 %). В первую неделю от начала заболевания обнаружено 19,2 % положительных проб, во вторую - 56,5 %.

Ключевые слова: пневмония, ПЦР, SARS-CoV-2, ко-инфекции.

Корреспондирующий автор: Бакштановская Ирина Владимировна, e-mail: [email protected].

Для цитирования: Бакштановская И.В., Степанова Т.Ф., Шарухо Г В., Летюшев А.Н., Степанова К.Б., Логинова Н.В., Панина Ц.А., Зматракова Е.А., Косырева А.Н., Бартусевич А.З., Леонтьева С.А., Вишнякова А.О. Результаты выявления SARS-CoV-2 и других возбудителей внебольничных пневмоний методом ПЦР в Тюменской области. Проблемы особо опасных инфекций. 2020; 3:146-149. DOI: 10.21055/0370-1069-2020-3-146-149 Поступила 14.09.20. Принята к публ. 16.09.20.

I.V. Bakshtanovskaya1, T.F. Stepanova1, G.V. Sharukho2, A.N. Letyushev12, K.B. Stepanova1,

N.V. Loginova3, Ts.A. Panina1, E.A. Zmatrakova1, A.N. Kosyreva1, A.Z. Bartusevich1, S.A.Leont'eva1,

A.O. Vishnyakova1

Results of Detecting SARS-CoV-2 and Other Pathogens of Community-Acquired Pneumonia by PCR in the Tyumen Region

'Tyumen Research Institute of the Regional Infection Pathology, Tyumen, Russian Federation; 2Rospotrebnadzor Administration in the Tyumen Region, Tyumen, Russian Federation; 3Department of Health of the Tyumen Region, Tyumen, Russian Federation

Abstract. The aim of this work was to identify the causative agent of community-acquired pneumonia and co-infection using PCR study of biomaterial from patients. Materials and methods. PCR testing of 268 samples from 258 patients was carried out to identify RNA/DNA of viral and bacterial pathogens of respiratory infections. Results and discussion. In 43.3 % of samples SARS-CoV-2 RNA was detected, in 4.5 % - RNA/DNA of acute respiratory viral infections pathogens, in one sample - DNA of Mycoplasma pneumoniae. Co-infection was detected only in patients of the anti-tuberculosis dispensary (SARS-CoV-2 and Mycobacterium tuberculosis). In the examined patients with pneumonia, SARS-CoV-2 RNA was significantly more often detected in biomaterial from the lower respiratory tract (52 %) than in respiratory smears (8.5 %). In the first week from the onset of the disease, 19.2 % of positive samples were found, in the second - 56.5 %.

Key words: pneumonia, PCR, SARS-CoV-2, co-infections.

Conflict of interest: The authors declare no conflict of interest.

Corresponding author: Irina V. Bakshtanovskaya, e-mail: [email protected].

Citation: Bakshtanovskaya I.V., Stepanova T.F., Sharukho G.V., Letyushev A.N., Stepanova K.B., Loginova N.V., Panina Ts.A., Zmatrakova E.A., Kosyreva A.N., Bartusevich A.Z., Leont'eva S.A., Vishnyakova A.O. Results of Detecting SARS-CoV-2 and Other Pathogens of Community-Acquired Pneumonia by PCR in the Tyumen Region. Problemy Osobo Opasnykh Infektsii [Problems of Particularly Dangerous Infections]. 2020; 3:146-149. (In Russian). DOI: 10.21055/0370-1069-2020-3-146-149 Received 14.09.20. Revised Accepted 16.09.20.

Bakshtanovskaya I.V. ORCID: https://orcid.org/0000-0003-1365-7741 Zmatrakova E.A., ORCID: https://orcid.org/0000-0002-8917-1900

Stepanova T.F., ORCID: https://orcid.org/0000-0002-6289-6274 Kosyreva A.N., ORCID: https://orcid.org/0000-0002-9332-5829

Sharukho G.V., ORCID: https://orcid.org/0000-0003-0772-8224 Bartusevich A.Z., ORCID: https://orcid.org/0000-0002-5728-2382

Letyushev A.N., ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4185-9829 Leont'eva S.A., ORCID: https://orcid.org/0000-0002-9426-5135

Stepanova K.B., ORCID: https://orcid.org/0000-0002-5420-0919 Vishnyakova A.O., ORCID: https://orcid.org/ 0000-0002-0008-3788

Panina Ts.A., ORCID: https://orcid.org/0000-0003-2490-4592

Для заболевания, вызываемого новым коронави-русом (SARS-CoV-2), характерно преимущественное поражение нижних дыхательных путей. Входными воротами возбудителя являются эпителий верхних дыхательных путей и эпителиоциты желудка и кишечника. Начальным этапом заражения является проникновение SARS-CoV-2 в клетки-мишени, имеющие рецепторы ангиотензинпревращающего фермента II типа, при этом основной и быстро достижимой мишенью являются альвеолярные клетки II типа легких, что определяет развитие пневмонии [1].

В условиях распространения COVID-19 к приоритетам первого уровня при организации исследований и противоэпидемических мероприятий относится проведение лабораторных исследований у лиц с диагнозом «внебольничная пневмония» (СП 3.1.3597-20 «Профилактика новой коронавирус-ной инфекции (COVГО-19)»).

Вариативность и динамическое изменение рентгенологической картины пневмонии, вызванной SARS-CoV-2, может затруднять дифференциальную диагностику с пневмониями, вызванными другими возбудителями, поэтому у пациентов с тяжелым течением вирусной пневмонии, вызванной SARS-Со^2, актуально изучение различных вариантов ко-инфицирования (бактериальными, грибковыми патогенами, другими вирусами) [1]. Показано, что ко-инфицирование несколькими вирусами выявлялось у 3 % заболевших, наиболее часто у них изолировали респираторно-синцитиальный вирус (16,9 %) и грипп типа А (15,5 %) [2]. Авторы одного из исследований, проведенных в США (Калифорния), в пятой части SARS-CoV-2-положительных образцов обнаруживали прочие возбудители респираторных инфекций, наиболее часто выявляли риновирусы (7 %), респираторно-синцитиальный вирус (5 %) и отличные от SARS-CoV-2 коронавирусы (4 %) [3]. Поскольку инфекционные агенты вирусной природы играют ведущую роль в структуре инфекционных заболеваний неясной этиологии, мониторинг известных вирусных патогенов - важный аспект эпидемиологического надзора, необходимый для своевременного реагирования на возникающие угрозы [4]. Ко-инфекции способны приводить к увеличению летальности, в связи с чем дифференциальная диагностика пневмоний, вызванных SARS-CoV-2, с выявлением других патогенов, представляется актуальной задачей.

На территории Тюменской области за 28 недель 2020 г. зарегистрировано 8235 случаев внебольнич-ных пневмоний, что на 33,9 % выше, чем в аналогичном периоде 2019 г. (6147 сл.). Уровень кумулятивной заболеваемости на 28-ю неделю составил 542,2 на 100 тыс. населения и превысил в 1,9 раза среднемно-голетний показатель (СМП 2017-2019 - 287,8). Всего на 14.07.2020 г. с диагнозом «внебольничная пневмония» госпитализировано 4950 человек (60,1 %), из них у 3564 человек проведены исследования для уточнения возбудителя, охват обследованием составил 83,6 %. Выявлено 1068 возбудителей, частота

выявления патогенного агента составила 25,8 %. В структуре выявленных возбудителей первое место занимали вирусы негриппозной этиологии - 556 (52,1 %). Далее по мере убывания другие бактериальные патогенные агенты - 406 (38,0 %), пневмококки -73 (6,8 %), вирусы гриппа - 19 (1,8 %), микоплазмы -11 (1,1 %). Доля расшифрованных случаев ВП от числа госпитализированных составила 21,6 %.

В связи с поручением Руководителя Роспо-требнадзора (письмо Роспотребнадзора № 02/70452020-26 от 15.04.2020), в соответствии с пунктом 2 перечня поручений Правительства Российской Федерации от 8 апреля 2020 г. № ММ-П13-3019кв по итогам заседания президиума Координационного совета при Правительстве Российской Федерации по борьбе с распространением новой коронавирус-ной инфекции на территории Российской Федерации 8 апреля 2020 г. с целью установления причины заболевания (возбудителя) при госпитализации в медицинскую организацию граждан с подозрением на пневмонию или с подтвержденной пневмонией ФБУН ТНИИКИП Роспотребнадзора с 16.04.2020 г. организовал получение от медицинских организаций проб биоматериала и проводит их лабораторное исследование методом ПЦР и бактериологическими методами с применением масс-спектрометрии.

Издан совместный приказ Управления Роспотребнадзора по Тюменской области, ФБУН ТНИИКИП Роспотребнадзора и Департамента здравоохранения Тюменской области № 73/41/о/309 от 13.05.2020 г. «Об этиологической расшифровке случаев заболевания внебольничными пневмониями в Тюменской области», в соответствии с которым руководители медицинских организаций, оказывающих медицинскую помощь (стационарную и амбулаторную) больным с диагнозом «внебольничная пневмония», обеспечивают забор и доставку биологического материала, а институт - лабораторные исследования поступившего материала по установлению возбудителя.

В институт поступают образцы биоматериала из моногоспиталей, организованных на базе медицинских организаций области, медицинских учреждений и поликлиник г. Тюмени.

Целью настоящей работы являлось выявление возбудителей внебольничных пневмоний и ко-инфицирования с помощью исследования методом ПцР биоматериала от пациентов с подозрением на COVID-19.

Материалы и методы

Проведено исследование 268 проб от 258 пациентов: 214 проб мокроты и бронхоальвеолярного ла-важа, 47 проб респираторных мазков, 7 проб мочи.

В соответствии с Временными методическими рекомендация МЗ РФ по профилактике, диагностике и лечению новой коронавирусной инфекции, для проведения дифференциальной диагностики у всех

Проблемы особо опасных инфекций. 2020; 3

краткие сообщения

заболевших проводили исследования методом ПЦР на возбудители респираторных инфекций: вирусы гриппа типа А и В, респираторно-синцитиальный вирус, вирусы парагриппа, риновирусы, аденовирусы, человеческие метапневмовирусы, MERS-CoV [5], а также микробиологическую диагностику и/или ПЦР диагностику на Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae type B, Legionella pneumophila, а также иные возбудители бактериальных респираторных инфекций нижних дыхательных путей.

поступившие пробы исследовали методом пцр для выявления РНК/ДНК следующих возбудителей:

1. коронавирус SARC-Cov-2 - тест-системами Вектор-ПцРрв-2019-nCoV-RG (ГНЦ «Вектор», р.п. Кольцово), Вектор-OneStepпЦр-CoV-RG (ГНЦ «Вектор», р.п. Кольцово) и SARS-CoV-2/SARS-CoV (ДНК-технология);

2. коронавирусы, вызывающие тяжелую респираторную инфекцию, MERS-CoV и SARS-CoV;

3. микобактерии туберкулеза;

4. возбудители ОРВИ: респираторно-синцитиальный вирус (human Respiratory Syncytial virus -hRSv), метапневмовирус (human Metapneumovirus -hMpv), вирусы парагриппа 1, 2, 3 и 4 типов (human Parainfluenza virus-1-4 - hPiv), коронавирусы (human Coronavirus - hCov), риновирусы (human Rhinovirus -hRv), аденовирусы групп B, C и E (human Adenovirus B, C, E - hAdv), бокавирус (human Bocavirus -hBov);

5. вирусы гриппа А и вирусы гриппа В;

6. вирус гриппа А субтип A/H1N1(sw2009);

7. вирус гриппа А субтип H5N1;

8. вирус гриппа А субтипы H1N1 и H3N2;

9. возбудители коклюша (Bordetella pertussis), паракоклюша (Bordetellaparapertussis) и бронхисеп-тикоза (Bordetella bronchiseptica);

10. Legionella pneumophila;

11. Listeria monocytogenes;

12. Brucella spp.;

13. Mycoplasma pneumoniae и Chlamydophila pneumoniae (№ 2-13 - тест-системами производства «АмплиСенс»).

проводилось также микробиологическое исследование, результаты которого представлены в отдельной публикации [6].

Результаты и обсуждение

В 116 из 268 проб (43,3 %) от пациентов выявлена РНК SARS-CoV-2.

В трех случаях у пациентов обнаружено одновременно наличие РНК SARS-CoV-2 и SARS-CoV. В двух образцах выявлена только РНК SARS-CoV.

В 9 из 14 проб от пациентов противотуберкулезного диспансера обнаружена РНК SARS-CoV-2, в одной - аденовирус. Во всех пробах этих пациентов обнаружена ДНК микобактерий туберкулеза.

РНК возбудителей гриппа в исследованных пробах не обнаружены.

РНК/ДНК возбудителей оРВи обнаружены в 12 пробах мокроты и мазков (4,5 %):

- респираторно-синцитиальный вирус (human Respiratory Syncytial virus - hRSv) - 1 проба;

- метапневмовирус (human Metapneumovirus -hMpv) - 1 проба;

- вирусы парагриппа 2 типа (human Parainfluenza virus-1 - hPiv) - 5 проб;

- вирусы парагриппа 4 типа (human Parainfluenza virus-4 - hPiv) - 1 проба;

- коронавирусы NL-63, 229E (human Corona-virus - hCoV) - 4 пробы;

- аденовирусы групп B, C и E (human Adenovirus B, C, E - hAdv) - 2 проба.

В двух пробах мокроты обнаружены одновременно РНК вируса парагриппа 2 типа и коронавиру-сов NL-63, 229E.

В одной пробе выявлено наличие ДНК Mycoplasma pneumoniae.

В пробах, где обнаружены возбудители оРВи и микоплазмы, РНК SARS-CoV-2 не выявлена.

В двух случаях в пробах мокроты обнаружено сочетание ДНК микобактерий туберкулеза с ДНК аденовирусов (в одном случае) и Brucella spp. (во втором).

ДНК возбудителей коклюша, паракоклюша, бронхосептикоза, Legionella pneumophila, Listeria monocytogenes, Mycoplasma pneumoniae и Chlamydophila pneumoniae не обнаружены.

В весенний период (апрель-май 2020 г.) в 28 из поступивших 98 проб (28 %) выявлено наличие РНК SARS-CoV-2, именно в этот период в пробах без нового коронавируса обнаружены РНК/ДНК возбудителей оРВи. В следующие два летних месяца (июнь-июль 2020 г.) среди поступивших 160 проб в 86 (53,8 %) обнаружена РНК SARS-CoV-2, возбудители оРВи и гриппа не выявлялись, однократно обнаружена ДНК Mycoplasma pneumoniae.

У обследованных нами больных пневмонией РНК SARS-CoV-2 существенно чаще выявлялась в биоматериале из нижних дыхательных путей (мокрота, бронхоальвеолярный лаваж, аспираты из трахеи и бронхов) (52 %, 112 проб из 214), чем в респираторных мазках (8,5 %, 4 из 47 проб). Эти результаты согласуются с литературными данными, свидетельствующими, что SARS-CoV-2 обнаруживается чаще и с более высокими вирусными нагрузками в образцах из нижних дыхательных путей, чем в образцах из верхних дыхательных путей, особенно на поздних этапах инфекции, по-видимому, в связи с активной репликацией SARS-CoV-2 в легких [7]. Во многих работах показано, что оптимальным биологическим материалом для своевременного выявления новой коронавирусной инфекции у пациентов с пневмониями является мокрота [1].

по-видимому, существует и определенная динамика выявления РНК нового коронавируса в мокроте в зависимости от длительности заболевания к моменту забора проб: в первую неделю от начала за-

болевания нами обнаружено 19,2 % положительных проб, во вторую - 56,5 %; при отсчете срока от момента госпитализации РНК SARS-CoV-2 обнаруживалась примерно в половине проб (46,3 % в первую неделю, 58,3 % - во вторую).

Таким образом, в условиях пандемии при установлении этиологии внебольничных пневмоний необходима «ковидная настороженность», особенно в летний период (при низкой вероятности вирусных пневмоний, связанных с ОРВИ). Полученные результаты свидетельствуют, что ко-инфекции выявляются в небольшом проценте случаев, однако для установления этиологического агента необходимо проводить исследования наиболее показательного биоматериала (при пневмониях - из нижних дыхательных путей) и в соответствующие сроки от начала заболевания.

конфликт интересов. Авторы подтверждают отсутствие конфликта финансовых/нефинансовых интересов, связанных с написанием статьи.

список литературы

1. Базыкина Е.А., Троценко O.E., Корита Т.В., Балахонцева Л.А., Котова B.O. 2020. Особенности пневмоний, вызванных новым коронавирусом SARS-CoV-2 (Обзор литературы). COVID19-PREPRINTS.MICROBE.ru. 23.07.202(1 [Электронный ресурс]. DOI: 10.21055/preprints-3111730.

2. Lansbury L., Lim B., Baskaran V., Lim W.S. Co-infections in people with COVID-19: a systematic review and meta-analysis. J. Infect. 2020; 81(2):266-75. DOI: 10.1016/i.jinf.2020.05.046.

3. Kim D., Quinn J., Pinsky B., Shah NH., Brown I. Rates of co-infection betWeen SARS-CoV-2 and other respiratory pathogens. JAMA. 2020; 323(20):2085-86. DOI: 10.1001/jama.2020.6266.

4. Хафизов К.Ф., Сперанская A.C., Мацвай А.Д., Шипулин Г.А., Дедков В.Г. Передовые технологии в диагностике вирусных заболеваний неясной этиологии. Инфекция и иммунитет. 2020; 10(1):9-25.

5. Александрович Ю.С., Байбарина E.H., Баранов A.A., Вишнева Е.А., Зверева H.H., Иванов Д.О., Крючко Д.С., Коновалов И.В., Куличенко Т.В., Лобзин Ю.В., Мазанкова Л.Н., Намазова-Баранова Л.С., Петренко Ю.В., Прометной Д.В., Пшениснов К.В., Ртищев А.Ю., Сайфуллин М.А., Селимзянова Л.Р., Усков А.Н., Федосеенко М.В., Харькин А.В., Чумакова О.В., Эфендиева К.Е., Яковлев А.В. Ведение детей с заболеванием, вызванным новой коронавирусной инфекцией (SARS-CoV-2). Педиатрическая фармакология. 2020; 17(2):103-18. DOI: 10.15690/pf/v17i2.2096.

6. Катаева Л.В., Степанова Т.Ф., Степанова К.Б., Бакштановская И.В., Посоюзных О.В., Ташланова В.В., Карпухина Н.Ф., Колотова О.Н., Калашникова Ю.Н., Вакарина А.А. Микробиоценоз нижних дыхательных путей при пневмонии, ассоциированной с SARS-CoV-2. COVID19-PREPRINTS. MICROBE.rU. 29.07.2020. [Электронный ресурс]. DOI: 10.21055/preprints-3111755.

7. Lu X., Wang L., Sakthivel S.K., Whitaker B., Murray J., Kamili S., Lynch B., Malapati L., Burke S.A., Harcourt J., Tamin A., Thornburg N.J., Villanueva J.M., Lindstrom S. US CDC Real-Time Reverse Transcription PCR Panel for Detection of Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2. Emerg. Infect. Dis. 2020; 26(8):1654-65. DOI: 10.3201/eid2608.201246.

References

1. Bazykina E.A., Trotsenko O.E., Korita T.V., Balakhontseva L.A., Kotova V.O. 2020. [Features of pneumonia caused by the new Coronavirus SARS-CoV-2 (Literature review)]. COVID19-PREPRINTS.MICROBE.RU. 27 Jul 2020. [Internet]. DOI: 10.21055/preprints-3111730.

2. Lansbury L., Lim B., Baskaran V., Lim W.S. Co-infections in people with COVID-19: a systematic review and meta-analysis. J. Infect. 2020; 81(2):266-75. DOI: 10.1016/j.jinf.2020.05.046.

3. Kim D., Quinn J., Pinsky B., Shah N.H., Brown I. Rates of co-infection between SARS-CoV-2 and other respiratory pathogens. JAMA. 2020; 323(20)2085-86. DOI: 10.1001/jama.2020.6266.

4. Khafizov K.F., Speranskaya A.S., Matsvai A.D., Shipulin G.A., Dedkov V.G. [Advanced technologies in the diagnosis of viral diseases of unknown etiology]. Infektsiya i Immunitet [Russian Journal of Infection and Immunity]. 2020; 10(1):9-25.

5. Aleksandrovich Yu.S., Baibarina E.N., Baranov A.A., Vishneva E.A., Zvereva N.N., Ivanov D.O., Kryuchko D.S., Konovalov I.V., Kulichenko T.V., Lobzin Yu.V., Mazankova L.N., Namazova-Baranova L.S., Petrenko Yu.V., Prometnoy D.V., Pshenisnov K.V., Rtischev A.Yu., Sayfullin M.A., Selimzyanova L.R., Uskov A.N., Fedoseenko M.V., Kharkin A.V., Chumakova O.V., Efendieva K.E., Yakovlev A.V. [Management of children with illness caused by a new coronavirus infection (SARS-CoV-2)]. Pediatricheskaya Farmokologiya

17(2):103-18. DOI: 10.15690/pf.v17i2.2096.

6. Kataeva L.V., Stepanova T.F., Stepanova K.B., Bakshtanovskaya I.V., Posoyuznykh O.V., Tashlanova V.V., Karpukhina N.F., Kolotova O.N., Kalashnikova Yu.N., Vakarina A.A. [Microbiocenosis of the lower respiratory tract in pneumonia associated with SARS-CoV-2]. COVID19-PREPrINTS.MICROBE. RU. 29 Jul 2020. [Internet]. DOI: 10.21055/preprints-3111755.

7. Lu X., Wang L., Sakthivel S.K., Whitaker B., Murray J., Kamili S., Lynch B., Malapati L., Burke S.A., Harcourt J., Tamin A., Thornburg N.J., Villanueva J.M., Lindstrom S. US CDC Real-Time Reverse Transcription PCR Panel for Detection of Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2. Emerg. Infect. Dis. 2020; 26(8):1654-65. DOI: 10.3201/eid2608.201246.

Authors:

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

Bakshtanovskaya I.V., Stepanova T.F., Stepanova K.B., Panina Ts.A., Zmatrakova E.A., Kosyreva A.N., Bartusevich A.Z., Leont'eva S.A., Vishnyakova A.O. Tyumen Research Institute of the Regional Infection Pathology. 147, Resbubliki St., Tyumen, 625026, Russian Federation. E-mail: [email protected].

Sharukho G.V. Rospotrebnadzor Administration in the Tyumen Region. 45-A, Rizhskaya St., Tyumen, 625026, Russian Federation. E-mail: [email protected].

Letyushev A.N. Tyumen Research Institute of the Regional Infection Pathology; 147, Resbubliki St., Tyumen, 625026, Russian Federation; e-mail: [email protected]. Rospotrebnadzor Administration in the Tyumen Region; 45-A, Rizhskaya St., Tyumen, 625026, Russian Federation; e-mail: [email protected].

Loginova N.V. Department of Health of the Tyumen Region. Tyumen, Russian Federation.

об авторах:

Бакштановская И.В., Степанова Т.Ф., Степанова К.Б., Панина Ц.А., Зматракова Е.А., Косырева А.Н., Бартусевич А.З., Леонтьева С.А., Вишнякова А.О. ФБУН ТНИИКИП Роспотребнадзора. Российская Федерация, 625026, Тюмень, ул. Республики, 147. E-mail: [email protected].

Шарухо Г.В. Управление Роспотребнадзора по Тюменской области. Российская Федерация, 625026, Тюмень, ул. Рижская, 45-А. E-mail: [email protected].

Летюшев А.Н. Тюменский научно-исследовательский институт краевой инфекционной патологии; Российская Федерация, 625026, Тюмень, ул. Республики, 147; e-mail: [email protected]. Управление Роспотребнадзора по Тюменской области; Российская Федерация, 625026, Тюмень, ул. Рижская, 45-А; e-mail: [email protected].

Логинова Н.В. Департамент здравоохранения Тюменской области. Российская Федерация, Тюмень.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.