Научная статья на тему 'Редкие варианты митохондриальной ДНК у ребенка с энцефаломиопатией'

Редкие варианты митохондриальной ДНК у ребенка с энцефаломиопатией Текст научной статьи по специальности «Клиническая медицина»

CC BY
491
60
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
Ключевые слова
ДЕТИ / ЭНЦЕФАЛОМИОПАТИЯ / МИТОХОНДРИИ / МИТОХОНДРИАЛЬНАЯ ДНК / СЕКВЕНИРОВАНИЕ / M.T8477C / CHILDREN / ENCEPHALOMYOPATHY / MITOCHONDRIA / MITOCHONDRIAL DNA / SEQUENCING / M.C12562G

Аннотация научной статьи по клинической медицине, автор научной работы — Воронкова Анастасия Сергеевна, Литвинова Наталия Александровна, Николаева Екатерина Александровна, Сухоруков Владимир Сергеевич

Проводится клиническое наблюдение ребенка с подозрением на митохондриальную энцефаломиопатию: циклическая рвота, выраженная утомляемость, мышечная слабость, головная боль, трудности усвоения школьного материала. Сходная симптоматика отмечена у старшего сибса, мать страдает сахарным диабетом 1-го типа. Проведено секвенирование полного митохондриального генома пробанда. Несмотря на то что достоверно патогенных вариантов не выявлено, был обнаружен ряд индивидуальных особенностей митохондриальной ДНК, которые могут иметь клиническую значимость. Особый интерес представляют два варианта: m.T8477C и m.C12562G, обладающие достаточно высоким патогенным потенциалом. Для установления их роли требуются дальнейшие исследования митохондриальной ДНК матери и сибса.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по клинической медицине , автор научной работы — Воронкова Анастасия Сергеевна, Литвинова Наталия Александровна, Николаева Екатерина Александровна, Сухоруков Владимир Сергеевич

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Rare variants of mitochondrial DNA in a child with encephalomyopathy

The paper considers a clinical case of a child with suspected mitochondrial encephalomyopathy: cyclic vomiting, evident fatigue, muscle weakness, headache, and difficulties in learning school material. The similar symptoms are noted in an older sibling; the mother suffers from type 1 diabetes mellitus. The entire mitochondrial genome was sequenced in the proband. Despite the fact that significantly pathogenetic variants have not been identified, there are a number of individual mitochondrial DNA characteristics that may be of clinical significance. Of particular interest are two variants: m.T8477C and C12562G, which have a sufficiently high pathogenic potential. To establish their role requires further investigations of mitochondrial DNA in the mother and sibling.

Текст научной работы на тему «Редкие варианты митохондриальной ДНК у ребенка с энцефаломиопатией»

Редкие варианты митохондриальной ДНК у ребенка с энцефаломиопатией

А. С. Воронкова, Н.А. Литвинова, Е.А. Николаева, В. С. Сухоруков

ОСП «Научно-исследовательский клинический институт педиатрии имени академика Ю.Е. Вельтищева» ГБОУ ВПО РНИМУ им. Н.И. Пирогова Минздрава РФ, Москва, Россия

Rare variants of mitochondrial DNA in a child with encephalomyopathy

A.S. Voronkova, N.A. Litvinova, E.A. Nikolaeva, V.S. Sukhorukov

Academician Yu.E. Veltishchev Research Clinical Institute of Pediatrics, N.I. Pirogov Russian National Research Medical University, Ministry of Health of the Russian Federation, Moscow, Russia

Проводится клиническое наблюдение ребенка с подозрением на митохондриальную энцефаломиопатию: циклическая рвота, выраженная утомляемость, мышечная слабость, головная боль, трудности усвоения школьного материала. Сходная симптоматика отмечена у старшего сибса, мать страдает сахарным диабетом 1-го типа. Проведено секвенирование полного митохондриального генома пробанда. Несмотря на то что достоверно патогенных вариантов не выявлено, был обнаружен ряд индивидуальных особенностей митохондриальной ДНК, которые могут иметь клиническую значимость. Особый интерес представляют два варианта: m.T8477C и m.C12562G, обладающие достаточно высоким патогенным потенциалом. Для установления их роли требуются дальнейшие исследования митохондриальной ДНК матери и сибса. Ключевые слова: дети, энцефаломиопатия, митохондрии, митохондриальная ДНК, секвенирование, m.T8477C, m.C12562G. Для цитирования: Воронкова А.С., Литвинова Н.А., Николаева Е.А., Сухоруков В.С. Редкие варианты митохондриальной ДНК у ребенка с энцефаломиопатией. Рос вестн перинатол и педиатр 2016; 61:5:42-46. DOI: 10.21508/1027-4065-2016-61-5-42-46

The paper considers a clinical case of a child with suspected mitochondrial encephalomyopathy: cyclic vomiting, evident fatigue, muscle weakness, headache, and difficulties in learning school material. The similar symptoms are noted in an older sibling; the mother suffers from type 1 diabetes mellitus. The entire mitochondrial genome was sequenced in the proband. Despite the fact that significantly pathogenetic variants have not been identified, there are a number of individual mitochondrial DNA characteristics that may be of clinical significance. Of particular interest are two variants: m.T8477C and C12562G, which have a sufficiently high pathogenic potential. To establish their role requires further investigations of mitochondrial DNA in the mother and sibling. Keywords: children, encephalomyopathy, mitochondria, mitochondrial DNA, sequencing, m.T8477C, m.C12562G. For citation: Voronkova A.S., Litvinova N.A., Nikolaeva E.A., Sukhorukov V.S. Rare variants of mitochondrial DNA in a child with encephalomyopathy. Ros Vestn Perinatol i Pediatr 2016; 61: 5:42-46 (in Russ). DOI: 10.21508/1027-4065-2016-61-5-42-46

Митохондриальные болезни — группа генетических заболеваний, которые характеризуются первичным нарушением митохондриального окислительного фосфорилирования — важнейшего этапа клеточного дыхания. Этот процесс, жизненно необходимый для работы практически всех клеток организма, локализован на внутренней мембране митохондрий [1].

Белки окислительного фосфорилирования находятся под двойным генетическим контролем митохондриального и ядерного геномов. Кольцевой митохон-дриальный геном (мтДНК) состоит всего из 16 569 пар оснований, но присутствует во множестве копий почти во всех клетках организма. мтДНК кодирует только 37 генных продуктов, из которых 13 — полипептидные структурные субъединицы дыхательных комплексов, 22 — транспортные РНК (тРНК) и 2 — рибосомальные РНК (рРНК), необходимые для их синтеза. Остальная часть митохондриального протеома, включая

© Коллектив авторов, 2016

Адрес для корреспонденции: Воронкова Анастасия Сергеевна — н. сотр. научно-исследовательской лаборатории общей патологии НИКИ педиатрии имени академика Ю.Е. Вельтищева

Литвинова Наталия Александровна — н.сотр. лаборатории Сухоруков Владимир Сергеевич — д.м.н., проф., зав. лабораторией Николаева Екатерина Александровна — д.м.н., и.о. рук. отдела психоневрологии и наследственных заболеваний с нарушением психики 125412 Москва, ул. Талдомская, д. 2.

большую часть респираторных комплексов, их сборочных и вспомогательных факторов, а также белки, необходимые для поддержания и экспрессии мтДНК, белкового синтеза и митохондриальной динамики, кодируется ядерной ДНК, синтезируется в цитозоле и затем импортируется внутрь митохондрии [1].

Митохондриальные энцефаломиопатии — распространенная форма митохондриальных заболеваний. Причиной являются нарушения генов, отвечающих за важнейшие функции митохондрий. Вызывать нарушения могут варианты как митохондриальной ДНК, так и ядерно-кодируемых митохондриальных генов. Более 50% синдромных и несиндромных форм энце-фаломиопатий при этом связаны с вариантами именно мтДНК [2]. Ниже (табл. 1) приведены ключевые мито-хондриально-кодируемые синдромы, а также гены, дефекты которых обусловливают указанные синдромы.

Наиболее тяжелые формы митохондриальных эн-цефаломиопатий вызываются, как правило, мутациями в генах ATP6 и РНК. Нарушения тРНК приводят к существенному снижению синтетической активности органеллы: падает уровень белковой продукции [2]. Белок же, кодируемый геном ATP6, является необходимой частью комплекса V дыхательной цепи ^^0-АТФ-синтазы), которая функционирует как ионный канал, используя межмебранный протонный градиент

Воронкоеа А.С. и соает. Редкие варианты митохондриальной ДНК у ребенка с энцефаломиопатией Таблица 1. Типичные митохондриальные синдромы и связанные с ними гены, согласно сведениям литературы [2]

Синдром Гены

MELAS MTTL1, MTTQ, MTTH, MTTK, MTTC, MTND1, MTND4, MTND5, MTND6, MTTS1, MTTS2

MERRF MTTK, MTTL1, MTTH, MTTF, MTTS1, MTTS2

NARP MTATP6

LS MTND2, MTND3, MTND5, MTND6

LHON MTCOI, MTCO3, MTCYB, MTATP6, MTND1, MTND2, MTND4, MTND5, MTND6

MIDD MTTL1, MTTE, MTTK

KSS Крупные делеции, MT-TL, MT-TK

Примечание. MELAS — митохондриальная энцефаломиопатия, лактат-ацидоз, инсультоподобные эпизоды; MERRF — миоклониче-ская эпилепсия с рваными мышечными волокнами; NARP — невропатия, атаксия, пигментная дегенерация сетчатки; LS — синдром Ли; LHON — наследственная оптическая нейропатия Лебера; MIDD — наследуемый по материнской линии синдром диабета и глухоты; KSS — синдром Кернса—Сейра.

для синтеза АТФ, универсального источника энергии клетки [2].

Основной диагностической загадкой остается возможность формирования клинических картин таких разных заболеваний, как MERRF и MELAS за счет однотипных мутаций в определенных точках генов тРНК (например, точечная замена A3243G). Следует отметить, что мутации генов тРНК в других точках не имеют таких существенных подтвержденных последствий для организма. В то же время описано как минимум девять различных мутаций гена ATP6, которые приводят к синдромам NARP, MILS и др. [3].

Превалирует на сегодняшний день теория о накоплении соответствующей мутации в тканях и органах, поражение которых характерно для синдрома. Эта теория косвенно подтверждена иммуногистохимически-ми исследованиями [3]. Однако широко распространена и теория о влиянии так называемых вторичных (т.е. являющихся звеном формирования патогенеза) нарушений мтДНК. Вторичные изменения имеют менее явный характер поражения: они могут способствовать увеличению восприимчивости к различным заболеваниям или действовать синергично с патогенными вариантами. Вторичные варианты мало описаны в литературе и редко ассоциируются с заболеваниями. Выявление и исследование патогенетического потенциала таких вариантов представляет особую значимость.

В среднем каждый человек несет около 30 вариантов мтДНК, отличающихся от принятой референсной последовательности. В зависимости от этнической принадлежности число отклонений от референса может достигать 100 и более вариантов [4]. Большинство из них имеет высокую встречаемость в субпопуляциях и поэтому признано непатогенными. В то же время практически любой человек является носителем в среднем пяти редких или новых вариантов, которые могут быть ассоциированы с заболеваниями или не описаны в литературе. Каждый из таких вариантов может являться определяющим фактором при развитии заболевания. В связи с этим корректная интерпретация потенциальной патогенности редких и новых вариантов крайне важна для выяснения

их клинической значимости. Вариант может быть классифицирован как вредоносный в том случае, если несущая его митохондрия имеет дефекты в функционировании дыхательной цепи. Это должно быть подтверждено функциональными исследованиями, транс-митохондриальными гибридами и т.д. Однако такие исследования требуют больших временных и финансовых затрат. Зачастую нет возможности и необходимости проводить подобные исследования для каждого обнаруженного редкого или нового варианта. Поэтому необходим предварительный анализ полученных результатов с помощью коммерческих и открытых баз данных, алгоритмов исследования белковой структуры и предсказания патогенности вариантов. Такой анализ будет представлен в настоящей статье.

Характеристика пациента и методы исследования

Ребенок П., 4 лет, впервые был обследован в отделении психоневрологии и наследственных заболеваний ОСП НИКИ педиатрии им. Ю.Е. Вельтищева. Поступил с жалобами на периодические приступы бледности, тошноты, рвоты, вялости, головной боли. В родословной случай повторный — у старшей сестры 8 лет имеются аналогичные жалобы. У матери через 6 мес после рождения мальчика манифестировал сахарный диабет 1-го типа.

Ребенок от второй физиологически протекавшей беременности. Роды вторые на 38-й неделе плановым кесаревым сечением. При рождении масса тела 2450 г, длина 49 см, оценка по шкале Апгар 7/8 баллов. Раннее развитие протекало по возрасту. С 1,5 лет появились приступы боли в животе с тошнотой, рвотой, вялостью, сопровождались появлением запаха ацетона. Позднее присоединились приступы головной боли. При обследовании однократно была выявлена гипогликемия 2,4 ммоль/л. Наблюдался педиатром и неврологом по месту жительства. При обследовании в нашей клинике в возрасте 4 лет обращала внимание задержка физического развития: рост — 94 см (10-й перцентиль), масса тела — 12 кг (<3-го перцентиля). Отмечена задержка темпов психоречевого развития,

моторная неловкость, нечеткость выполнения коор-динаторных проб, умеренная диффузная мышечная гипотония, гипотрофия, симптом Бабинского справа. Кожные покровы чистые. В легких дыхание везикулярное. Сердечные тоны ясные, ритмичные. Живот мягкий, безболезненный. Печень и селезенка не пальпируются. Стул, диурез в норме. Слух и зрение не нарушены.

Изменений в клинических анализах крови и мочи, биохимическом анализе крови не обнаружено. Ацидоза, гиперлактатацидемии нет. На электроэнцефалограмме (ЭЭГ) патологических изменений не выявлено. По данным ультразвукового исследования (УЗИ) нарушений внутренних органов не обнаружено. При повторных исследованиях мочи методом газожидкостной хроматографии — хроматомасс-спектрометрии выявлена дикарбоновая и монокарбоновая ацидурия, повышенная экскреция гидроксимасляной и янтарной кислот. В спектре аминокислот и ацилкарнитинов крови изменений не обнаружено (метод тандемной масс-спектрометрии). Таким образом, были исключены болезни группы органических ацидурий и дефектов окисления жирных кислот. Установлен диагноз: циклические ацетонемические состояния (рвота), задержка физического и темпов психоречевого развития.

В дальнейшем на фоне соблюдения диетических рекомендаций (снижение квоты липидов в рационе, частое дробное питание) и курсов левокарнитина произошло улучшение состояния: исчезли приступы боли в животе, тошноты и рвоты. Однако сохранялись жалобы на выраженную утомляемость, мышечную слабость, головную боль, трудности усвоения школьного материала. В связи с подозрением на митохондриаль-ный генез патологии (в том числе учитывая данные родословной — аналогичное заболевание у сибса, наличие сахарного диабета у матери) было произведено секвенирование по Сэнгеру полной последовательности мтДНК ребенка.

ДНК выделялась из сухих капель крови. Далее проводилась амплификация мтДНК с использованием 50 пар праймеров, полученные фрагменты секвенирова-лись с помощью BigDye Terminator (Applied Biosystems Inc, США) на генетическом анализаторе ABI 3500.

Базы данных и инструменты анализа митохондриальных вариантов

Полученные данные сравнивались с пересмотренной Кембриджской референсной последовательностью (rCRS): GenBank NC_012920 gi:251831106.40,4. Применяли программное обеспечение Applied Biosystems: Sequencing Analysis 6, Seqscape Software 3.

Для анализа выявленных отличий от референсной последовательности использовали международные базы данных: PhyloTree, MITOMAP, The Human Mitochondrial Genome Database, The Mamit-tRNA database.

PhyloTree (http://www.phylotree.org/) [5] содержит наиболее полную информацию о митохондриальном

филогенетическом древе человека [6]. Частота встречаемости вариантов в разных гаплогруппах неодинакова. Если редкие варианты обычно встречаются в определенной гаплогруппе, то низкие аллельные частоты могут быть связаны с недостаточной этнической представленностью в базе данных. Зачастую у одного человека может обнаруживаться несколько гапло-групповых мотивов. Гаплогруппу принято определять по доминирующему мотиву, при этом варианты, ассоциированные с другими гаплогруппами, считаются непатогенными [5].

MITOMAP (http://www.MITOMAP.org/MITOMAP) [7] содержит данные как публичных, так и коммерческих ресурсов; является основным источником информации по митохондриальным вариантам. Все варианты в нем разделены на две категории: полиморфизмы и мутации. К полиморфизмам относятся непатогенные, соматические и неопубликованные варианты. К мутациям относятся подтвержденные патогенные или ассоциированные с каким-либо заболеванием варианты.

The Human Mitochondrial Genome Database (mtDB) (http://www.mtdb.igp.uu.se/) [8] содержит около 3000 митохондриальных геномов здоровых людей и является важным инструментом для определения частоты встречаемости. Для определения варианта мтДНК как редкого используется пороговая аллельная частота <0,2%. Следует отметить, что представленность разных этнических групп (и соответственно, гаплогрупп) на данном ресурсе сильно разнится. Некоторые варианты могут оказаться редкими только в связи с недостаточной представленностью российской популяции.

The Mamit-tRNA database (http://mamit-trna.u-stras-bg.fr/human.asp) [9] содержит информацию о тРНК млекопитающих и используется для оценки значения варианта в генах тРНК митохондрий.

Классификация вариантов мтДНК в нашем исследовании

При интерпретации полученных вариантов мтДНК основным документом является рекомендация по классификации митохондриальных вариантов, выпущенная в 2012 г. исследовательской группой Американского колледжа генетики и геномики [10]. В ней предлагается рассматривать варианты в рамках трех групп:

1. Непатогенный вариант — вариант обозначен на MITOMAP как «полиморфизм»; нет сведений о его ассоциированности с заболеваниями в популяцион-ных или семейных исследованиях; его аллельная частота в mtDB > 0,2%.

2. Неклассифицированный вариант — любой вариант, соответствующий по крайней мере одному из следующих критериев:

а) новый вариант;

б) редкий вариант, который обозначен

на MITOMAP как «полиморфизм», но его нет

в базе mtDB или частота его встречаемости < 0,2%;

Воронкова А.С. и соавт. Редкие варианты митохондриальной ДНК у ребенка с энцефаломиопатией

в) редкий вариант, обозначенный в литературе или на MITOMAP как «мутация» на основании исследования одной семьи или одной статьи без функциональных исследований его патогенности. Неклассифицированные варианты в этой категории должны быть дополнительно оценены in silico инструментами по предсказанию структуры белка или с помощью других баз данных:

1) для миссенс-вариантов, эволюционной консервативности и компьютерных алгоритмов используют in silico предсказания патогенности;

2) если вариант мтДНК встречается в одном из митохондриальных тРНК генов, используется база данных Mamit-tRNA.

3. Патогенный вариант — вариант, который обозначен как «подтвержденная мутация» на MITOMAP; был описан в нескольких клинических исследованиях отдельных пациентов или семей; содержит функциональные исследования.

Результаты

Полученные отличия от референсной последовательности представлены в табл. 2. Всего найдено: 32 варианта. Гаплогруппа: U5b (U5b1e1).

К гаплогрупповым мотивам относятся 27 (84%) вариантов. Эти варианты считаются непатогенными. Согласно данным литературы, подобная картина наблюдается практически всегда: в среднем 70—95% найденных вариантов являются маркерами гаплогрупп [11, 12]. Причина заключается в том, что референсная последовательность rCRS относится к гаплогруппе H2a2a. Если исследуемый образец относится к другой гаплогруппе, число точечных отклонений от референ-са может колебаться от 20 до 100.

Также были исключены из рассмотрения крайне полиморфные варианты, прежде описанные в литературе в гипервариабельных сегментах контрольного региона митохондриального генома 303—315 и 522—523 [11]. Таким образом, в фокус нашего исследования попали варианты, представленные в табл. 3.

Согласно указанным ранее критериям (аллель-ная частота в mtDB < 0,2%, вариант обозначен на MITOMAP как полиморфизм), эти варианты относятся к неклассифицированным. A9644G приводит к синонимичной замене, в связи с чем вероятность его патогенности минимальна. T8477C является мис-сенс- (т.е. приводит к замене аминокислоты в белке) вариантом в гене субъединицы 8 АТФазы, C12562G является миссенс вариантом в сог-субъединице 5 НАДН-убихинон-оксидоредуктазы. В табл. 4 приведены показатели, позволяющие оценить потенциальную патогенность найденных вариантов.

Как упоминалось выше, in silico оценка носит предварительный характер и может быть использована только в качестве основания для дальнейших исследований. В данном случае оценки in silico различных алгоритмов расходятся. Вариант m.C12562G находится

Таблица 2. Результаты наложения полученного сиквенса пациента П. на референсную последовательность rCRS

в достаточно консервативном локусе белка, что указывает на его значимость. Кроме того, несинонимичные замены могут иметь вторичный характер; влиять на структуру белка не напрямую, а опосредованно — через ДНК-зависимые регуляторные факторы, взаимосвязи с ядерными генами и т.д. Как известно, индивидуальные точечные особенности мтДНК могут иметь латентные патогенные свойства, проявление которых зависит от внешних и наследственных факторов [6]. В связи с предположительно митохондриаль-ным генезом клинических проявлений у ребенка имеются основания считать, что обнаруженные варианты

Позиция нуклеотида Значение в rCRS Значение в образце

73 A G

150 C T

263 A G

314 T Инсерция TCC

523 CA Делеция

750 A G

1438 A G

2706 A G

2757 A G

3197 T C

4769 A G

5656 A G

7028 C T

7768 A G

8337 T C

8477 T C

8860 A G

9477 G A

9644 A G

10283 A G

11467 A G

11719 G A

12308 A G

12372 G A

12562 C G

12616 T C

13617 T C

14182 T C

14766 C T

15326 A G

16270 C T

16465 C T

Таблица 3. Варианты-кандидаты на патогенное влияние

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

Вapиaнт Лoкyc Тип a/к зямси^г Aллельнaя чacтoтa б mtDB, % Обoзнaчение Ha MITOMAP

m.T8477C MTATP8 Hеcинoнимичнaя S^P 0 Пoлимopфизм

m.A9644G MTCO3 Си^ними^я W^W 0,03 Пoлимopфизм

m.C12562G MTND5 Hеcинoнимичнaя L^V 0 Пoлимopфизм

Примечание. Здега и б тябл. 4: a/к — aминoкиcлoтнaя.

Таблица 4. Данные in silico инструментов предсказания значения аминокислотной замены

Вapиaнт A/к зaменa Пpедcкaзaннaя пaтoгеннocть Koнcеpвaтивнocть лoкyca

PolyPhen Provean Sift aмииcкиcлcты, MITOMAP

m.T8477C p.S38P HепaтGгенный (oncHKa 0,02) HепaтGгенный (G^HKa -1,841) HепaтGгенный (oHüHKa -0,31) 17%

m/C12562G p.L76V CKGpcc Bœro тютен-ный (ouaHKa 0,996) HепaтGгенный (oHüHKa -2,295) HепaтGгенный (oHüHKa 0,31) 80%

Примечание. PolyPhen — in silico инструмент для предсказания потенциальной вредоносности аминокислотной замены. Оценивает вариант от 0 (непатогенный) до 1 (патогенный); Provean — in silico инструмент для предсказания потенциальной вредоносности аминокислотной замены. Оценка проводится на основании порогового значения: оценки менее -2,5 свидетельствуют в пользу патогенности варианта; Sift — in silico инструмент для предсказания потенциальной вредоносности аминокислотной замены. Оценивает вероятность изменения функции белка при аминокислотной замене. Достоверной считает оценку (вероятность) <0,05; консервативность аминокислотного локуса оценивается на основании пептидных последовательностей 45 видов позвоночных животных. Приводится процентная доля видов, для которых характерно то же аминокислотное основание в данном локусе, что и для rCRS.

пoтенциaльнo мoгyт BHocmb бкляд в paзвитие пaтoлo-гаче^т ^o^ccoB.

Заключение

Пpoведенo мoлекyляpнo-генетичеcкoе иccледo-бянис митoxoндpиaльнoй ДHK pебенкa c пoдoзpени-ем Ha митGXGHдpиaльный генез пaтoлoгии. Hеcмoтpя Ha TG чтo дocтoвеpнo пaтGгенныx вapиaнтGB y тциен-Ta не выявленG, некGTGpые из Gбнapyженныx gcg6ch-HGcтей мтДHK MGгyт иметь клиничеcкyю знaчимGcть.

БGЛьшинcтвG выявленныx oтличий GT pефеpенcнGй

пGcледGвaтельнGcти являютcя непaтGгенными. Дбя вapиaнтa: m.T8477C и m.C12562G пpивGДят к нест-HGHимичным зaменaм aминGKиcлGTныx GcHGвaний в cyбъединицax ^м^ек^в дыxaтельнGй цепи. Зня-чение дяннык вapиaнтGB Ha cегGДняшний день неяcнo, GДнaкG cyщеcтвyет веpGятнGcть иx влияния Ha фopми-pGвaние фенGTипa митoxoндpиaльнoй энцефaлGпaтии y pебенкa. Для ycтaнoвления иx pGЛи тpебyютcя дяль-нейшие иccледGвaния мтДHK мaтеpи и c^ca.

ЛИТЕРАТУРА (REFERENCES)

1. Chinnery P., Hudson G. Mitochondrial genetics. Br Med Bull 2013; 106: 1: 135-159.

2. Schon E, DiMauro S., Hirano M. Human mitochondrial DNA: roles of inherited and somatic mutation. Nat Rev Genet 2012; 13: 12: 878-890.

3. He Y, Jian Wu J., Iacobuzio-Donahue C. et al. Heteroplasmic mitochondrial DNA mutations in normal and tumor cells. Nature 2010; 464: 7288: 610-614.

4. Ingman M, Kaessmann H, Pääbo S. et al. Mitochondrial genome variation and the origin of modern humans. Nature 2000; 408: 708-713.

5. Oven M, Kayser M. Updated Comprehensive Phylogenetic Tree of Global Human Mitochondrial DNA. Var Hum Mut Mutation in Brief 2008; 30: E394.

6. Сухорукое В. С., Воронкова А. С., Литвинова Н.А. Клиническое значение индивидуальных особенностей митохон-дриальной ДНК. Рос вестн перинатол и педиатр 2015; 60: 2: 10-20. (Sukhorukov V.S., Voronkova A.S., Litvinova N.A. Clinical value of specific features of mitochondrial DNA Ros vestn perinatol i pediatr 2015; 60: 2: 10-20. (in Russ))

7. Ruiz-Pesini E, Lott M, Procaccio V. et al. An enhanced MITOMAP with a global mtDNA mutational phylogeny. Nucleic Acids Res 2007; 35: D823 — D828.

8. Ingman M, Gyllensten U. MtDB: Human Mitochondrial Genome Database, a resource for population genetics and medical sciences. Nucleic Acids Res 2006; 34: D749 — D751.

9. Pütz J., Dupuis B, Sissler M. et al. Mamit-tRNA, a database of mammalian mitochondrial tRNA primary and secondary structures. RNA 2007; 13: 1184-1190.

10. Wang J., Schmitt E, Megan L. et al. An integrated approach for classifying mitochondrial DNA variants: one clinical diagnostic laboratory's experience. Genetics in Medicine 2012; 14: 6: 620-626.

11. Zaragoza M, Brandon M, Diegoli M. et al. Mitochondrial cardiomyopathies: how to identify candidate pathogenic mutations by mitochondrial DNA sequencing, MITOMASTER and phylogeny. Eur J Hum Genet 2011; 19: 2: 200-207.

12. Yano T, Nishio S, Usami S. Frequency of mitochondrial mutations in non-syndromic hearing loss as well as possibly responsible variants found by whole mitochondrial genome screening. J Hum Genet 2014; 59: 2: 100-106.

Исследование выполнено при финансовой поддержке

РФФИ в рамках научного проекта № 15—04—08416.

Поступила 01.05.2016 Received on 2016.05.01

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.