Научная статья на тему 'Пространственное строение тетрапептида NAc-Ser-Phe-Val-Gly-OMe, определенное путем анализа констант остаточного диполь-дипольного взаимодействия'

Пространственное строение тетрапептида NAc-Ser-Phe-Val-Gly-OMe, определенное путем анализа констант остаточного диполь-дипольного взаимодействия Текст научной статьи по специальности «Химические науки»

CC BY
100
25
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Аннотация научной статьи по химическим наукам, автор научной работы — Клочков Владимир Васильевич, Скирда Владимир Дмитриевич, Клочков Антон Владимирович, Бергер Стефан

Подход, основанный на анализе величин констант остаточного диполь-дипольного взаимодействия между магнитными ядрами 13С и 1Н, разделенных одной химической связью (1D), в молекулах, частично ориентированных в лиотропных жидкокристаллических средах, использован при ЯМР-исследовании строения тетрапептида NAc-Ser-Phe-Val-Gly-OMe в лиотропной среде [n-алкил-поли(этилен)гликоль (С12Е5) / n-гексанол в воде]; на основании анализа экспериментальных величин наблюдаемых констант остаточного диполь-дипольного взаимодействия определено пространственное строение тетрапептида

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по химическим наукам , автор научной работы — Клочков Владимир Васильевич, Скирда Владимир Дмитриевич, Клочков Антон Владимирович, Бергер Стефан

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Текст научной работы на тему «Пространственное строение тетрапептида NAc-Ser-Phe-Val-Gly-OMe, определенное путем анализа констант остаточного диполь-дипольного взаимодействия»

УЧЕНЫЕ ЗАПИСКИ КАЗАНСКОГО ГОСУДАРСТВЕННОГО УНИВЕРСИТЕТА Том 149, кн. 1 Естественные науки 2007

УДК 541.12.038.2:536.75:536.728

ПРОСТРАНСТВЕННОЕ СТРОЕНИЕ ТЕТРАПЕПТИДА ^с-8ег-РИе-Уа1-С1у-Оше, ОПРЕДЕЛЕННОЕ ПУТЕМ АНАЛИЗА КОНСТАНТ ОСТАТОЧНОГО ДИПОЛЬ-ДИПОЛЬНОГО ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ

В.В. Клочков, В.Д. Скирда, А.В. Клочков, С. Бергер Аннотация

Подход, основанный на анализе величин констант остаточного диполь-дипольного взаимодействия между магнитными ядрами 13С и 1Н, разделенных одной химической связью (1В), в молекулах, частично ориентированных в лиотропных жидкокристаллических средах, использован при ЯМР-исследовании строения тетрапептида МЛс-8ег-РИе-УаЮ1у-0Ме в лиотропной среде [и-алкил-поли(этилен)гликоль (С12Е5) / и-гекса-нол в воде]; на основании анализа экспериментальных величин наблюдаемых констант остаточного диполь-дипольного взаимодействия определено пространственное строение тетрапептида.

Введение

Традиционно исследования строения относительно небольших органических соединений в растворах основаны как на данных одномерной ЯМР-спект-роскопии, так и на использовании современных подходов в ЯМР-спектроско-пии, таких как динамическая ЯМР [1-3] и двумерная ЯМР (COSY и NOESY модификации) спектроскопия [4, 5]. Отметим, что использование NOESY ЯМР-спектроскопии позволяет определять расстояния между магнитными ядрами, отстоящими друг от друга на расстоянии до 5 А, и тем самым устанавливать пространственную структуру органических соединений в растворе [4, 5].

В данной публикации демонстрируется приложение подхода к определению пространственного строения тетрапептида NAc-Ser-Phe-Val-Gly-OMe, относительно небольшой молекулы, частично ориентированной в лиотропной жидкокристаллической среде, основанного на анализе величин констант остаточного диполь-дипольного взаимодействия между магнитными ядрами 13С и 1Н, разделенных одной химической связью (1D). В настоящее время этот подход активно используется при исследованиях методом ЯМР биохимических объектов, попадающих под условие медленного движения ( О)0Тс » 1, тс - время корреляции, О0 - угловая скорость прецессии магнитных ядер) [6, 7], что позволяет независимым образом судить о структуре этих соединений в растворах.

Приложения данного подхода к определению пространственного строения небольших органических соединений в растворе в литературе лишь начали появляться [8-12]. Значимость самого подхода возрастает, если учесть, что применение вышеназванного метода двумерной NOESY ЯМР-спектроскопии к

относительно малым молекулам не всегда эффективно [4, 5]. Это обусловлено малыми временами корреляции тс таких молекул в растворе, что приводит к слабым по интенсивности кросс-пикам в спектрах NOESY и затрудняет получение количественной информации о межпротонных расстояниях в таких молекулярных системах.

Экспериментальная часть

Регистрация ЯМР 1Н (700 МГц) и 13С (176 МГц) спектров тетрапептида NAc-Ser-Phe-Val-Gly-OMe в изотропном растворителе и лиотропной жидкокристаллической смеси проводилась на ЯМР-спектрометре AVANCE-700 фирмы “Bruker”. Спектрометр работает в режиме внутренней стабилизации по линии резонанса 1Н. При записи спектров ЯМР 1Н использовались 90° импульсы и задержки между импульсами равнялись 2 с; ширина спектра была 15 м.д.; число накоплений - от 10. При записи спектров ЯМР 13С применялись 45° импульсы и использовалась (или не использовалась) широкополосная развязка от протонов; задержки между импульсами равнялись 2 с; ширина спектра была равной 200 м.д., число накоплений - от 4000 до 8000, применялась цифровая экспоненциальная фильтрация с константой, равной 2-4 Гц. Двумерные спектры 2D HSQC и HMBC [13] использовались для отнесения сигналов в спектрах ЯМР 13С тетрапептида NAc-Ser-Phe-Val-Gly-OMe. Образцы представляли собой растворы соединения в соответствующих средах, концентрации веществ

0.5% (весовых) при записи ЯМР :Н и 13С спектров. Отсчет химических сдвигов производили от линий резонанса эталонных жидкостей. Ошибка в определении констант диполь-дипольного взаимодействия не превышала 1 Гц.

При проведении двумерных ЯМР-экспериментов (NOESY - модификация) в молекулярной системе время задержки между последовательностями импульсов было в три раза большим, чем усредненное время продольной релаксации Т для протонов тетрапептида NAc-Ser-Phe-Val-Gly-OMe. Спектры записывались с использованием фазочувствительной методики для 1024 точек F2 координаты и 256 точек Fi координаты; использовалась экспоненциальная фильтрация вдоль обеих координат. Параметр времени смешивания тт выбирался равным 0.2, 0.4, 0.6 и 0.8 с.

Остаточные величины констант диполь-дипольного взаимодействия между магнитными ядрами в тетрапептиде NAc-Ser-Phe-Val-Gly-OMe, определялись в смеси и-алкил-поли(этилен)гликоль [С12Е5, где 12 - число атомов углерода в n-алкильной группе, а 5 - число гликольных групп в поли(этилен)гликоле] / n-гек-санол в воде [5.5% (w/w)], молярное отношение (r) п-алкил-поли(этилен)гли-коль к n-гексанолу было равно 0.97. Существование ламеллярной La -фазы подтверждалось наблюдением квадрупольного расщепления 2H ЯМР-сигнала дейтерированной воды (D2O) [7], входящей в состав жидкокристаллической системы. Жидкокристаллическая система на основе п-алкил-поли(этилен)гли-коля и n-гексанола готовилась, как описано в работе [14, 15].

Обсуждение результатов

Известно, что в растворах диполь-дипольное взаимодействие между магнитными ядрами внутри молекулы полностью усредняется как следствие хаотичного движения молекул. Если же молекулярная система растворена в лиотропной жидкокристаллической системе [6], то вследствие соударения о магнитно-ориентированные молекулярные образования поступательное и вращательное движение молекул перестает быть изотропным. Эта анизотропия в движении молекул приводит к появлению слабого диполь-дипольного взаимодействия между магнитными ядрами, что проявляется в спектрах ЯМР как остаточные константы диполь-дипольного взаимодействия, при этом уширение сигналов ЯМР не наблюдается [6, 7].

Регистрируемая константа диполь-дипольного взаимодействия DD(e,p) между двумя магнитными ядрами I и J в этом случае может быть выражена следующим образом [7]:

Dd(в, р) = Da |^(3cos2 в-1) + 3/2Rsin2 вcos2p], (1)

где

Da =-(М0 h/16П) SyyK3] Aa. (2)

Здесь Aa = Azz - (Axx + Ayy)/2 - аксиальная компонента молекулярного тензора

А, характеризующего преимущественное пространственное расположение молекулы относительно внешнего магнитного поля; R = (Axx - A ) / Azz - ромбическая компонента; Axx, Aи Azz - проекции молекулярного тензора А на x, y

и z направления ортогональной системы координат, связанной с молекулой; в и р - полярные координаты межядерного вектора (I и J ядра), связывающие главные оси молекулярного тензора и направление внешнего магнитного поля; S - параметр порядка, описывающий внутреннюю динамическую подвижность меж ядерного вектора; yI и YJ - гиромагнитные отношения ядер I и J; rD -расстояние между магнитными ядрами.

Различные жидкокристаллические среды используются для необходимого частичного ориентирования биохимических объектов в магнитном поле. В качестве примера можно привести фосфорлипидные бицеллы [6], бактерии [16] или фрагменты мембран [17]. Нематические фазы могут быть созданы на основе смесей бромид n-цетил-n,n,n-триметиламмониума, хлорид или бромид це-тилпиридина и n-гексанола [18, 19]; n-алкил-поли(этилен)гликолей и нормальных спиртов в воде [14, 15]. При некоторых условиях перечисленные системы формируют ламеллярные жидкокристаллические фазы, обозначаемые как La, в которых плоскости молекулярных образований ориентируются в магнитном поле вдоль его направления [7].

Описанный выше подход был использован при определении структуры тетрапептиде NAc-Ser-Phe-Val-Gly-OMe (1) в растворе, интерес к исследованию которого (и его производных) методом ЯМР достаточно высок [20]:

OH

O

\

H3C CH3

O

CH3

O CH2

O

CH3

O

O

1

Изучение конформаций олигопептидов важно во многих отношениях. Прежде всего, олигопептиды можно рассматривать в качестве структурных блоков и знание их строения может быть использовано для предсказания конфигурации цепей полипептидов и дизайна протеинов de novo [21]. Сами по себе некоторые олигопептиды выполняют медиаторные функции, при этом их взаимодействия с рецепторами конформационно-зависимы.

Табл. 1

Химические сдвиги ЯМР 13С атомов углерода (8С, м.д., относительно ТМС) и значения прямых констант спин-спинового взаимодействия (11СН + 1ВСН, Гц, нижняя строка) для тетрапептида NAc-Ser-Phe-Val-Gly-OMe, растворенного в изотропном растворителе и лиотропной жидкокристаллической среде

Среда a CH Ser И e CS оа a CH Phe в CH2 Phe 2,6-CH Phe 3,5-CH Phe 4-CH Phe a CH Val Hl О £ a CH2 Gly

Э2О 54.25 146.7 59.95 147.2 55.10 144.7 36.92 130.0 128.60 161.5 129.05 159.0 127.05 161.5 59.12 141.4 30.10 131.0 40.95 141.4

(C12E5)/ я-гекса- нол 54.6 146.6 60.1 131.0; 165.0 55.1 124.4 37.1 60.6 59.8 128.8 133.3 129.2 126.4 127.1 234.0 58.8 78.0 29.9 72.1 41.0 105.6 125.0

ЯМР 'Н спектр тетрапептида КЛс^ег-РЬе-Уа1-01у-0Ме описан ранее [20], здесь мы использовали лишь информацию о химических сдвигах протонов. ЯМР 13С спектр тетрапептида КЛс^ег-РЬе-Уа1-01у-0Ме (растворенного в Б2О и в лиотропной среде - С12Е5 / и-гексанол и вода) состоит из десяти синглетных сигналов (нами рассматривались лишь метиновые и метиленовые атомы угле-родов), химические сдвиги которых сведены в табл. 1. Отнесение сигналов в спектре ЯМР С сделано в соответствии с литературными данными [22, 23] и на основании двумерных экспериментов 2Б HSQC.

ЯМР-спектроскопия позволяет описать пространственное строение триг-лицина в терминах расположения глициновых фрагментов относительно связей -С(0)-КН-, поскольку вращение вокруг этих связей сопряжено с преодолением высокого барьера (75-80 кДж/моль [1-3]), что позволяет в шкале ЯМР наблюдать «вымороженные» спектры транс- и цис- (ориентация С(0) и КН свя-

зей) конформеров, как это наблюдается для бензол замещенных триглицинов [24]. Поскольку для исследуемого соединения наблюдается лишь индивидуальные ЯМР Н и С спектры в воде, можно лишь сделать вывод, что тетрапептид NAc-Ser-Phe-Val-Gly-OMe, по данным ЯМР-спектроскопии, существует в растворе в виде одного из возможных конформеров.

Для определения межпротонных расстояний, напрямую характеризующих пространственную геометрию тетрапептида NAc-Ser-Phe-Val-Gly-OMe в растворе, были записаны спектры 2D NOESY с вариацией времени смешивания тт . Наблюдать кросс-пики между протонами, относящимися к различным аминокислотным фрагментам, в спектрах 2D NOESY исследуемого соединения, растворенного в D2О, не удалось. Это объяснимо, на наш взгляд, тремя причинами:

а) удаленностью друг от друга aCH или aCH2 протонов, принадлежащих различным аминокислотным остаткам;

б) обсуждаемой выше неэффективностью метода двумерной NOESY ЯМР-спектроскопии к исследованию строения относительно малых молекул;

в) участием амидных протонов в межмолекулярном обмене.

С целью определения одного из возможных конформеров тетрапептида NAc-Ser-Phe-Val-Gly-OMe были проведены полуэмперические расчеты теплоты образования молекулы по программе MOPAC 93 (метод РМ 3), которые позволили однозначно определить некий конформер как наиболее выгодную структуру для тетрапептида.

Для выяснения пространственного строения тетрапептида NAc-Ser-Phe-Val-Gly-OMe использовался описанный выше подход, основанный на анализе величин констант диполь-дипольного взаимодействия между магнитными ядрами. Для этого были рассмотрены взаимодействия между ядрами 13С и 'Н, разделенные одной химической связью, в молекуле, растворенной в изотропном растворителе и лиотропной среде (смесь я-алкил-поли(этилен)гликоль С12Е5 / я-гексанола и вода). В табл. 1 приведены данные о химических сдвигах атомов углерода (8С) и прямых констант спин-спинового взаимодействия (Jqh) для тетрапептида, полученных методом ЯМР 13С спектроскопии в условиях отсутствия радиочастотной развязки от протонов. Константы диполь-дипольного взаимодействия (^СН) определенные из разницы наблюдаемой КССВ (:1СН + ^СН) для магнитных ядер молекул, растворенных в лиотропной жидкокристаллической среде и изотропном растворителе [7], оказались следующими: 0.1 Гц для aCH Ser; -16.2 и 17.8 Гц для PCH2 Ser; -20.3 Гц для aCH Phe; -69.4 и -70.2 Гц для PCH2 Phe; -28.2 Гц для 2,6-CH Phe; -32.6 Гц для 3,5-CH Phe; 72.5 Гц для 4-CH Phe; -63.4 Гц для aCH Val, -58.9 Гц для PCH Val; -35.8 и -16.4 Гц для aCH2 Gly.

Анализ полученных констант диполь-дипольного взаимодействия (^СН) проводили по программе MODULE [25]. Программа позволяет, исходя из соотношения (1), связывать значения наблюдаемых констант и расположение меж-ядерного вектора (химическая связь С-Н) относительно внешнего магнитного поля в рамках определенной конформации исследуемой молекулы. Критерием соответствия рассчитанной структуры реальной является линейная корреляция

Рис. 1. Зависимость между наблюдаемыми константами диполь-дипольного взаимодействия (^СН, Гц) для тетрапептида NAc-Ser-Phe-Val-Gly-OMe, растворенного в лиотропной жидкокристаллической среде и рассчитанными значениями соответствующих констант в наиболее выгодной конформации, определенной с помощью программы MOPAC 93 (метод РМ 3)

Рис. 2. Конформация тетрапептида NAc-Ser-Phe-Val-Gly-OMe, для которой наблюдалось лучшее соответствие между наблюдаемыми и рассчитанными значениями констант диполь-дипольного взаимодействия

Рис. 3. Зависимость между наблюдаемыми константами диполь-дипольного взаимодействия (^СН, Гц) для тетрапептида NAc-Ser-Phe-Val-Gly-OMe, растворенного в лиотропной жидкокристаллической среде и рассчитанными значениями соответствующих констант в конформации, представленной на рис. 2

между наблюдаемыми и рассчитанными, исходя из заданного пространственного строения исследуемого соединения, значениями констант диполь-диполь-ного взаимодействия. Программа позволяет в случае несоответствия наблюдаемых и рассчитанных констант изменять исходную конформацию путем поворота отдельных фрагментов относительно других вокруг химических связей, их связывающих.

Использование в качестве исходных данных для программы MODULE координат атомов тетрапептида NAc-Ser-Phe-Val-Gly-OMe в наиболее выгодной конформации, определенной с помощью программы MOPAC 93 (метод РМ 3), и экспериментальных значений диполь-дипольных констант показало отсутствие корреляции между наблюдаемыми и рассчитанными значениями констант (рис. 1). Изменение исходной конформации путем поворота отдельных фрагментов относительно других позволило выбрать единственную структуру (рис. 2), для которой наблюдалось полное соответствие между константами диполь-дипольного взаимодействия (рис. 3). В табл. 2 приведены координаты атомов пространственной структуры тетрапептида NAc-Ser-Phe-Val-Gly-OMe, отвечающих этому соответствию между наблюдаемыми и рассчитанными константами.

Работа выполнена при финансовой поддержке Российского фонда фундаментальных исследований (проект № 06-03-32101а) и совместной программы CRDF и Министерства образования РФ (проект № 007-03).

Табл. 2

Координаты атомов конформации тетрапептида NAc-Ser-Phe-Val-Gly-OMe в pdb-формате

№ атома Атом Фрагмент тетрапептида х-Координата _у-Координата z-Координата

1 N 1SER 3.184 -4.161 2.964

2 CA 1SER 2.942 -2.752 2.582

3 C 1SER 1.590 -2.602 1.868

4 O 1SER 0.663 -3.393 1.995

5 1HB 1SER 2.178 -2.226 4.576

6 2HB 1SER 2.766 -0.816 3.647

7 CB 1SER 2.955 -1.881 3.866

8 OG 1SER 4.209 -1.859 4.490

9 HG 1SER 4.407 -2.744 4.776

10 HA 1SER 3.772 -2.419 1.900

11 H 1SER 2.399 -4.654 3.332

12 N 2PHE 1.462 -1.507 0.996

13 CA 2PHE 0.185 -1.140 0.335

14 C 2PHE 0.544 -0.576 -1.052

15 O 2PHE 0.455 -1.222 -2.081

16 1HB 2PHE -0.205 0.873 1.123

17 CB 2PHE -0.639 -0.151 1.179

18 2HB 2PHE -0.587 -0.435 2.251

19 CG 2PHE -2.073 -0.138 0.761

20 HD1 2PHE -1.823 1.457 -0.686

21 CD1 2PHE -2.527 0.761 -0.203

22 HD2 2PHE -2.620 -1.739 2.109

23 CD2 2PHE -2.974 -1.026 1.354

24 HE1 2PHE -4.220 1.485 -1.325

25 CE1 2PHE -3.869 0.777 -0.567

26 CE2 2PHE -4.313 -1.009 0.986

27 HE2 2PHE -5.016 -1.708 1.451

28 CZ 2PHE -4.763 -0.106 0.027

29 HZ 2PHE -5.819 -0.093 -0.261

30 HA 2PHE -0.417 -2.077 0.193

31 H 2PHE 2.160 -0.795 1.049

32 N 3VAL 1.116 0.724 -1.078

33 CA 3VAL 1.494 1.429 -2.328

34 C 3VAL 3.026 1.311 -2.464

35 O 3VAL 3.567 0.816 -3.437

36 CB 3VAL 1.028 2.902 -2.333

37 HB 3VAL 1.450 3.429 -1.440

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

38 CG1 3VAL -0.489 2.996 -2.277

39 2HG1 3VAL -0.905 2.570 -1.348

40 3HG1 3VAL -0.959 2.468 -3.118

41 1HG1 3VAL -0.817 4.043 -2.324

42 CG2 3VAL 1.526 3.607 -3.587

43 1HG2 3VAL 1.197 4.654 -3.606

44 2HG2 3VAL 1.147 3.125 -4.500

45 3HG2 3VAL 2.623 3.607 -3.647

46 HA 3VAL 1.026 0.905 -3.204

47 H 3VAL 0.924 1.293 -0.274

48 N 4GLY 3.837 1.825 -1.411

49 CA 4GLY 5.240 1.416 -1.247

50 C 4GLY 5.410 0.338 -0.185

51 O 4GLY 4.662 0.109 0.752

52 1HA 4GLY 5.819 2.309 -0.933

53 2HA 4GLY 5.663 1.086 -2.219

54 H 4GLY 3.364 2.048 -0.562

Summary

V.V. Klochkov, V.D. Skirda, A.V. Klochkov, S. Berger. A spatial structure of tetrapeptide (NAc-Ser-Phe-Val-Gly-OMe) determined by residual dipolar couplings analysis.

The possibility of determination of relatively small organic compound conformations by the approach based on analysis of the residual dipolar couplings 13C - 1H in the molecules

partially aligned in lyotropic liquid crystalline media has been considered. This approach has been used at NMR investigation of tetrapeptide (NAc-Ser-Phe-Val-Gly-OMe) structure in lyotropic medium (pentaethylene glycol monododecyl ether (С12Е5) / n-hexanol); the conformation of tetrapeptide in solution has been established on the basis of the experimental data of observed dipolar couplings.

Литература

1. Dynamic nuclear magnetic resonance spectroscopy / Eds. L.M. Jackman, F.A. Cotton. -N. Y.; San Francisco; London: Acad. Press, 1975. - 660 p.

2. Sandstrom J. Dynamic NMR spectroscopy. - London: Acad. Press, 1982. - 226 p.

3. Oki M. Application of dynamic NMR spectroscopy to organic chemistry. - N. Y.: VCH Publishers, Inc., 1985. - 423 p.

4. Ernst R.R., Bodenhausen B., Wokaun A. Principles of nuclear magnetic resonance in one and two dimensions. - Oxford: Oxford University Press, 1987. - 610 p.

5. Van der Ven, Frank J.M. Multidimensional NMR in liquids: basic principles and experimental methods. - N. Y.; Toronto: Wiley-VCH, 1995. - 399 p.

6. Tjandra N., Bax A. Direct measurement of distances and angles in biomolecules by NMR in a dilute liquid crystalline medium // Science. - 1997. - V. 278. - P. 1111-1114.

7. Alba E., Tjandra N. NMR dipolar couplings for the structure determination of biopolymers in solution // Progress in NMR Spectroscopy. - 2002. - V. 40. - P. 175-197.

8. Thiele C.M., Berger S. Probing the diastereotopicity of methylene protons in strychnine using residual dipolar couplings // Organic Lett. - 2003. - V. 5. - P. 705-708.

9. Klochkov V.V., Khairutdinov B.I,. Klochkov A.V., Shtyrlin V.G., Shaykhutdinov R.A. A spatial structure of triglycine determined by the residual dipolar couplings analysis // Appl. Magn. Resonance. - 2003. - V. 25. - P. 113-119.

10. Klochkov A.V., Khairutdinov B.I., Tagirov M.S., Klochkov V.V. Determination of the spatial structure of glutathione by residual dipolar coupling analysis // Magn. Reson. in Chemistry. - 2005. - V. 43. - P. 948-951.

11. Ohnishi S., Shortle D. Observation of residual dipolar couplings in short peptides // Proteins. - 2003. - V. 50. - P. 546-551.

12. Bernado P., Blackledge M. Anisotropic small amplitude peptide plane dynamics in proteins from residual dipolar couplings // J. Am. Chem. Soc. - 2004. - V. 126. - P. 49074920.

13. Berger S., Braun S. 200 and more NMR experiments. - Weinheim: Wiley-VCH, 2004. -810 p.

14. RuckertM., Otting G. Alignment of biological macromolecules in novel nonionicliquid crystalline media for NMR experiments // J. Am. Chem. Soc. - 2000. - V. 122. -P. 7793-7797.

15. Klochkov V.V, Klochkov A. V., Thiele C.M., Berger S. A novel liquid crystalline system for partial alignment of polar organic molecules // J. Magn. Resonance. - 2006. - V. 179. -P. 58-63.

16. Clore G.M., Starich M.R., Gronenborn A.M. Measurement of residual dipolar couplings of macromolecules aligned in the nematic phase of a colloidal suspension of rod-shaped viruses // J. Am. Chem. Soc. - 1998. - V. 120. - P. 10571-10572.

17. Koenig B.W., Hu J., Ottiger M., Bose S., Hendler R.W.,. Bax A. NMR measurement of dipolar couplings in proteins aligned by transient binding to purple membrane fragment // J. Am. Chem. Soc. - 1999. - V. 121. - P. 1385-1386.

18. ProsserR.S., Losonczi J.A., ShiyanovskayaI.V. Use of a novel aqueous liquid crystalline medium for high-resolution NMR of macromolecules in solution // J. Am. Chem. Soc. -1998. - V. 120. - P. 11010-11011.

19. Barrientos L.G., Dolan C., Gronenborn A.M. Characterisation of surfactant liquid crystal phases suitable for molecular alignment and measurement of residual dipolar couplings // J. Biomol. NMR. - 2000. - V. 16. - P. 329-337.

20. Diaz M.D., Berger S. Preferential solvation of a tetrapeptide by trifluorethanol as studied by intermolecular NOE // Magn. Reson. in Chemistry. - 2001. - V. 39. - P. 369-373.

21. Bradley E.K., Kerr J.M., Richter L.S., Figliozzi G.M., Goff D.A., Zuckermann R.N., Spellmeyer D.C., Blaney J.M. NMR structural characterization of oligo-N-substituted glycine lead compounds from a combinatorial library // Molecular Diversity. - 1997. -V. 3. - P. 1-15.

22. Breitmaier E., Woelter W. 13C NMR spectroscopy. Methods and application in organic chemistry. - Weinheim; N. Y.: Verlag Chemie, 1978. - 322 p.

23. Wuthrich K. NMR of Proteins and Nucleic Acids. - N. Y.: Wiley-VCH, 1986. - 396 p.

24. Anishetty S., Pennathur G., Anishetty R. Tripeptide analysis of protein structures // BMC Structural Biology. - 2002. - V. 2. - P. 1472-1507.

25. DossetP., Hus J.-C., Blackledge M. A novel interactive tool for rigid-body modeling of multi-domain macromolecules using residual dipolar couplings // J. Biomol. NMR. -2001. - V. 20. - P. 223-233.

Поступила в редакцию 18.01.07

Клочков Владимир Васильевич - доктор химических наук, профессор кафедры общей физики Казанского государственного университета.

E-mail: Vladimir.Klochkov@ksu.ru

Скирда Владимир Дмитриевич - доктор физико-математических наук, профессор, заведующий кафедрой молекулярной физики Казанского государственного университета.

Клочков Антон Владимирович - аспирант кафедры молекулярной физики Казанского государственного университета.

Бергер Стефан - доктор философии, профессор, директор Института аналитической химии Университета Лейпцига, Федеративная Республика Германия, г. Лейпциг.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.