Научная статья на тему 'ПОЛИМОРФИЗМ ГЕНА МИОСТАТИНА (MSTN) У ОВЕЦ ПОРОДЫ СОВЕТСКИЙ МЕРИНОС'

ПОЛИМОРФИЗМ ГЕНА МИОСТАТИНА (MSTN) У ОВЕЦ ПОРОДЫ СОВЕТСКИЙ МЕРИНОС Текст научной статьи по специальности «Агробиотехнологии»

CC BY
35
14
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
Ключевые слова
МИОСТАТИН / ОВЦА / СОВЕТСКИЙ МЕРИНОС

Аннотация научной статьи по агробиотехнологии, автор научной работы — Трухачев Владимир Иванович, Криворучко Александр Юрьевич, Скрипкин Валентин Сергеевич, Яцык Олеся Андреевна

В настоящее время основной доход овцеводческим хозяйствам приносит продажа мяса. Однако, на Северном Кавказе большинство разводимых пород овец относится к шерстному или мясошерстному направлению продуктивности, в связи с чем необходимо повысить мясную продуктивность, без ущерба для качества шерсти. Помочь в этом могут методы геномной селекции. Одним из наиболее перспективных генов кандидатов, влияющих на показатели мясной продуктивности, является ген миостатина (MSTN, GDF-8). Белок, кодируемый этим геном, ингибирует развитие мышечных тканей у высших позвоночных.Советский меринос одна из самых распространенных и достаточно продуктивных тонкорунной пород в России. Целью данной работы явилось исследование структуры гена MSTNу овец породы советский меринос. Исследование было проведено на базе ФГБОУ ВО «Ставропольский государственный аграрный университет». Объектом исследования служили баранчики в возрасте одного года породы советский меринос (n=20). С целью выявления мутаций в генах проводили целевое обогащение и последующее секвенирование исследуемых фрагментов ДНК. Для обогащения целевых регионов использовали технологию NimbleGen. Секвенирование осуществляли с использованием геномногосеквенатора GS Junior. Полученные в результате секвенирования фрагменты картировали на референсный геном Ovisaries сборка oviAri3. В ходе работы выявлено 28 однонуклеотидных замен. 2 SNP обнаружены впервые: c.940G>T, расположенная в экзоне 3 и с.*16C>A, расположенная в 3’фланкирующей области гена. Нонсенс-мутация c.940G>T превращает 314 кодон,кодирующий глутаминовую кислоту в стоп-кодон (GAA>TAA), что приводит к укорачиванию белкового продукта на 62 аминокислоты. Необходимо проводить дальнейшие исследования, направленные на изучение влияния обнаруженных SNPна показатели мясной продуктивности.At present, the main income of sheep farms brings the sale of meat. However, in the North Caucasus, most bred sheep breeds refers to wool or meat and wool productive direction, and therefore the need to increase meat productivity, without compromising the quality of the wool. To help in this are methods of genomic selection. One of the most promising candidate genes that affect the performance of meat productivity is myostatin (MSTN, GDF-8). The protein encoded by this gene, inhibits the development of muscle tissue in higher vertebrates. Soviet Merino, one of the most common and sufficiently productive fine-fleeced breeds in Russia. The aim of this work was to study the structure MSTN gene in sheep breeds Soviet Merino. The study was conducted on the basis of Stavropol State Agrarian UniversityWe have investigated 20 rams (n=20) at the age of one year of Soviet Merino breed, from livestock breeding farm of Stavropol Krai, Russian Federation. In order to detect mutations in the target genes were performed enrichment and subsequent sequencing of the DNA fragments studied. For enrichment of target regions using NimbleGen technology. Sequencing was performed using a genome sequencer GS Junior. The resulting sequencing fragments mapped to the reference genome assembly Ovisaries oviAri3. The work identified 28 single nucleotide substitutions. 2 SNP detected for the first time: c.940G>T in exon 3 and с.*16C>A in 3’flanking. Nonsense mutation c.940G>T314 converts the codon encoding glutamic acid at a stop codon (GAA> TAA), which leads to shortening of the protein product by 62 amino acids. Further studies should be conducted, aimed at studying the effect of SNP detected on meat productivity indicators.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по агробиотехнологии , автор научной работы — Трухачев Владимир Иванович, Криворучко Александр Юрьевич, Скрипкин Валентин Сергеевич, Яцык Олеся Андреевна

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Текст научной работы на тему «ПОЛИМОРФИЗМ ГЕНА МИОСТАТИНА (MSTN) У ОВЕЦ ПОРОДЫ СОВЕТСКИЙ МЕРИНОС»

58

Ежеквартальный

научно-практический

журнал

В

естник АПК

Ставрополья

УДК: 575.224.22:636.32/.38.082.2

Трухачев В. И., Криворучко А. Ю., Скрипкин В. С., Яцык О. А.

Trukhachev V. I., Krivoruchko A. Y., Skripkin V. S., Yatsyk O. A.

ПОЛИМОРФИЗМ ГЕНА МИОСТАТИНА (MSTN) У ОВЕЦ ПОРОДЫ СОВЕТСКИЙ МЕРИНОС

THE MYOSTATIN GENE (MSTN) POLYMORPHISM IN SOVIET MERINO SHEEP BREED

В настоящее время основной доход овцеводческим хозяйствам приносит продажа мяса. Однако, на Северном Кавказе большинство разводимых пород овец относится к шерстному или мясошерстному направлению продуктивности, в связи с чем необходимо повысить мясную продуктивность, без ущерба для качества шерсти. Помочь в этом могут методы геномной селекции.

Одним из наиболее перспективных генов кандидатов, влияющих на показатели мясной продуктивности, является ген миостатина (MSTN, GDF-8). Белок, кодируемый этим геном, ингибирует развитие мышечных тканей у высших позвоночных.Советский меринос одна из самых распространенных и достаточно продуктивных тонкорунной пород в России.

Целью данной работы явилось исследование структуры гена MST^ овец породы советский меринос.

Исследование было проведено на базе ФГБОУ ВО «Ставропольский государственный аграрный университет». Объектом исследования служили баранчики в возрасте одного года породы советский меринос (n=20).

С целью выявления мутаций в генах проводили целевое обогащение и последующее секвенирование исследуемых фрагментов ДНК. Для обогащения целевых регионов использовали технологию NimbleGen. Секвенирование осуществляли с использованием геномногосеквенатора GS Junior. Полученные в результате секвенирования фрагменты картировали на референсный геном Ovisaries сборка oviAri3.

В ходе работы выявлено 28 однонуклеотидных замен. 2 SNP обнаружены впервые: c.940G>T, расположенная в эк-зоне 3 и a*16C>A, расположенная в 3'фланкирующей области гена. Нонсенс-мутация c.940G>T превращает 314 кодон,кодирующий глутаминовую кислоту в стоп-кодон (GAA>TAA), что приводит к укорачиванию белкового продукта на 62 аминокислоты. Необходимо проводить дальнейшие исследования, направленные на изучение влияния обнаруженных SNPна показатели мясной продуктивности.

At present, the main income of sheep farms brings the sale of meat. However, in the North Caucasus, most bred sheep breeds refers to wool or meat and wool productive direction, and therefore the need to increase meat productivity, without compromising the quality of the wool. To help in this are methods of genomic selection.

One of the most promising candidate genes that affect the performance of meat productivity is myostatin (MSTN, GDF-8). The protein encoded by this gene, inhibits the development of muscle tissue in higher vertebrates. Soviet Merino, one of the most common and sufficiently productive fine-fleeced breeds in Russia.

The aim of this work was to study the structure MSTN gene in sheep breeds Soviet Merino.

The study was conducted on the basis of Stavropol State Agrarian UniversityWe have investigated 20 rams (n=20) at the age of one year of Soviet Merino breed, from livestock breeding farm of Stavropol Krai, Russian Federation.

In order to detect mutations in the target genes were performed enrichment and subsequent sequencing of the DNA fragments studied. For enrichment of target regions using NimbleGen technology. Sequencing was performed using a genome sequencer GS Junior. The resulting sequencing fragments mapped to the reference genome assembly Ovisaries oviAri3.

The work identified 28 single nucleotide substitutions. 2 SNP detected for the first time: c.940G>T in exon 3 and a*16C>A in 3'flanking. Nonsense mutation c.940G>T314 converts the codon encoding glutamic acid at a stop codon (GAA> TAA), which leads to shortening of the protein product by 62 amino acids. Further studies should be conducted, aimed at studying the effect of SNP detected on meat productivity indicators.

Ключевые слова: MSTN; миостатин; GDF8; SNP; сек-венирование, овца, советский меринос.

Keywords: MSTN; Myostatin; GDF8; SNP; Sequence; Sheep; Soviet Merino.

Трухачев Владимир Иванович -

член корреспондент РАН, доктор сельскохозяйственных наук, доктор экономических наук, профессор кафедрыкормления животных и общей биологии Ставропольский государственный аграрный университет г. Ставрополь Тел.: 8(8652) 35-22-82 E-mail: rector@stgau.ru

Криворучко Александр Юрьевич -

доктор биологических наук, профессор кафедры

физиологии, хирургии и акушерства

Ставропольский государственный аграрный университет

г. Ставрополь

Тел.: 8(8652) 28-67-38

E-mail: rcvm@yandex.ru

Скрипкин Валентин Сергеевич -

кандидат ветеринарных наук, доцент кафедры физиологии, хирургии и акушерства Ставропольский государственный аграрный университет г. Ставрополь

Trukhachev Vladimir Ivanovich -

Corresponding Member of RAS, doctor of Agricultural Sciences, doctor of Economic Sciences, professor of department of animal nutrition and general biology Stavropol state agricultural University Stavropol

Tel.: 8(8652) 35-22-82 E-mail: rector@stgau.ru

Krivoruchko Alexander Yurievich -

doctor of biology sciences, professor of department of physiology, surgery and obstetrics Stavropol state agricultural University Stavropol

Tel.: 8(8652) 28-67-38 E-mail: rcvm@yandex.ru

Skripkin Valentin Sergeevich -

candidate of veterinary sciences, associate professor of physiology, surgery and obstetrics Stavropol state agricultural University Stavropol

в

естник АПК

Ставрополья

Тел.: 8(8652) 28-67-38 E-mail: skripkinvs@mail.ru

:№ 2(22), 2016

Ветеринария

59

Яцык Олеся Андреевна -

аспирант кафедры физиологии, хирургии и акушерства

Ставропольский государственный аграрный университет

г. Ставрополь

Тел.: 8(918) 757-14-58

Е-т^1:та^е1е@таИ.ги

Работа выполнена в соответствии с планом НИР Министерства сельского хозяйства Российской Федерации (решение конкурсной комиссии о выдаче целевой субсидии №3119/13 от 30.12.2013).-

В современных экономических условиях чрезвычайно высока значимость мясной продуктивности овец, доход от которой достигает 80% и более от общей выручки [1]. В связи с этим, необходимо обратить особое внимание на повышение мясной продуктивности мериносовых овец, как наиболее многочисленной категории поголовья Российской Федерации [2].

Советский меринос одна из самых распространенных и достаточно продуктивных тонкорунных пород. Достоинства породы - высокие шерстные качества, выживаемость в условиях засушливых зон Ставропольского края, устойчивость к экстремальным климатическим факторам. Овец породы советский меринос разводят в хозяйствах Ставропольского края, Ростовской и Омской областей, Республиках Калмыкия и Башкортостан. Продуктивность в среднем по живой массе у баранов-производителей 108,0 кг, у маток - 53,0 кг, настриг чистой шерсти соответственно 7,3 и 3,4 кг [3].

Повысить мясную продуктивность, без ущерба для качества шерсти могут помочь методы маркер-ассоциированной селекции. Одним из перспективных генов кандидатов, влияющих на показатели мясной продуктивности, является ген миостатина (МЭТЫ, вОР-8). Белок, кодируемый этим геном, ингибирует развитие мышечных тканей у высших позвоночных [4]. Доказана связь полиморфизмов МЭТЫ с изменением мышечной массы у КРС [5; 6], свиней [7] и овец [8-10].

Кроме того, ген МЭТЫ и прилегающие области входят в локусы количественных признаков связанные не только с интенсивностью мышечного роста [11; 12] и с содержанием в мясе ряда жирных кислот, таких как арахидоновая, эйко-запентаеновая, линоленовая, докозапентаено-вая [13]; но так же с молочной продуктивностью [14], с устойчивостью к паразитарным заболеваниям [15; 16].

Ген МЭТЫ у овец расположен на второй хромосоме, имеет 3 экзона. Кодирует пептид, состоящий из 395 аминокислот. Кодирующие области гена высоко консервативны. Известно только о 3 ЭЫР в области экзона, при этом только одна замена приводит к изменению кодируемой аминокислоты. В интронах обнаружено 33 замены.

Tel.: 8(8652) 28-67-38 E-mail: skripkinvs@mail.ru

Yatsyk Olesya Andreevna -

post-graduate student of department of physiology, surgery and obstetrics Stavropol state agricultural University Stavropol

Tel.: 8(918) 757-14-58 E-mail: malteze@mail.ru

Замену c.*1232G>A в 3'фланкирующем регионе MSTN овец зарубежными учеными было предложено использовать в качестве маркера для геномной селекции [17-19]. По их данным животные, несущие 2 копии аллеля A имеют более развитую мускулатуру и превосходят сородичей по показателям мясной продуктивности.

Целью данной работы явилось исследование структуры гена MSTN у овец породы советский меринос.

Материалы и методы

Исследование было проведено на базе ФГБОУ ВО «Ставропольский государственный аграрный университет». Объектом исследования служили баранчикив возрасте одного года породы советский меринос (n=20) из СПК колхоз-племзавод им. Ленина Арзгирского района Ставропольского края.

Геномная ДНК выделялась из образцов крови, полученных из яремной вены в асептических условиях. Пробы крови отбирали в пробирки Vacutainer® со стабилизатором ЭДТА (Becton Dickinsonand Company, Franklin Lakes, NJ, USA). ДНК выделяли из 0,2 мл крови c использованием набора PureLinkGenomic DNA MiniKit (Invitrogen Life Technologies, Grand Island, NY, USA).C целью выявления мутаций в генах проводили целевое обогащение и последующее секвенирование исследуемых фрагментов ДНК. Для обогащения целевых регионов использовали технологию NimbleGen (Roche NimbleGen, Inc., Madison, WI, USA). Зонды для целевых регионов были разработаны в сотрудничестве с фирмой Roche NimbleGen (USA). Библиотеки фрагментов ДНК исследуемых животных, подготовленные в соответствие с протоколом Rapid Library Preparation Method Manual подвергали процедуре обогащения с использованием зондов NimbleGen SeqCap EZ Developer Libraries в соответствии с протоколом производителя (RocheNimbleGen, Inc., Madison, WI, USA).

Процедуру моноклональной амплификации готовых обогащенных целевых регионов ДНК проводили по стандартному протоколу emPCR Amplification Method Manual, Lib-L (Roche NimbleGen, Inc., Madison, WI, USA).

Секвенирование осуществляли с использованием геномного секвенатора GS Junior (Roche NimbleGen, Inc., Madison, WI, USA) Полученные в результате секвенирования фрагменты картировали на референсный геном Ovis aries

60

,,„ „„„„, Jj Ставрополья

научно-практическии журнал

сборка oviAri3 (National Center for Biotechnology Information. Genome. (2012) Ovis aries (sheep), 2015) с помощью программного обеспечения GS Reference Mapper v2.9 (Roche NimbleGen, Inc., Madison, WI, USA).

Для описания обнаруженных однонуклеотид-ных замен (SNP) использовалась номенклатура HGVS (Human Genome Variation Society).

Результаты

В ходе работы нами было обнаружено 28 од-нонуклеотидных замен (табл. 1). 26 из них были описаны для зарубежных пород овец и включены в базу NCBl. Так же нами выявлены 2 новые, ранее неописанные мутации: c.940G>T и с.*16С>А.

По нашим результатам преобладающий процент точечных мутаций приходится на транзи-ции- 68%, причем чаще меняются пуриновые основания.

Большинство из обнаруженных SNP расположены в некодирующих участках:14 SNP в интро-нах, 12 в регуляторных фланкирующих областях. Две из обнаруженных замен расположены в эк-зонах и ведут к изменению структуры кодируемого пептида. Так миссенс-мутация a101A>G в первом экзоне приводит к замене глутамино-вой кислоты на глицин. Новая нонсенс-мутация в третьем экзоне c.940G>T превращает 314 ко-дон, кодирующий глутаминовую кислоту в стоп-кодон (GAA>TAA). В результате белковый продукт укорачивается на 62 аминокислоты, что несомненно должно сказываться на ингибиру-ющей способности миостатина.

По 28 обнаруженным SNP исследуемые животные разделены нами на 7 основных генотипов и подгруппы (табл.2). В группу «A» вошло 25% животных, у которых никаких полиморфизмов обнаружить не удалось. Структура их гена идентична австралийскому референсу (Oar_ v3.1).B группу G напротив вошли животные с максимальным количеством замен в гене: 1819 SNP.

Обсуждение

Ген MSTN имеет множество вариаций. Генотипы резко различаются даже в пределах одной породы овец, не говоря уже о популяции в целом. В данном исследовании впервые изучена структура гена MSTN у овец породы советский меринос, одной из самых старых отечественных тонкорунных пород. Эта порода идеально подходит для выращивания в климатических условиях Ставрополья, имеет высокую шерстную и неплохую мясную продуктивность.

В ходе работы нами было выявлено 28 одно-нуклеотидных замен. О 26 из них ранее сообщалось зарубежными учеными. Так же обнаружены 2 новые, ранее не описанные замены: c.940G>T в экзоне 3 и a'^OA в 3'фланкирующей области гена.

Перспективными для дальнейшего исследования являются, прежде всего, замены расположенные в экзонах и изменяющие структуру пептида: a101A>G и c.940G>T, поскольку можно предположить, что эти полиморфизмы

сказываются на ингибирующей способности миостатина, и в дальнейшем на мясных качествах. c.940G>T выявлена впервые, а мутация c.101A>G ранее была обнаружена у овец породы австралийский меринос, ромни, корридейл, новозеландских гибридов [20] и отечественной породы джалгинский меринос [10].

Так же на показатели мясной продуктивности могут влиять замены, расположенные в промоторе гена, и изменяющие его транскрипционную активность. Так замена c.-1128T>C расположена между связывающим сайтом E-Box8 (EnhancerBox-CAAT) и сайтом связывания с рецептором прогестерона. SNP с.-958Т>С расположен в 12 нуклеотидах от сайта взаимодействия с белком MEF2 (Myocyte enhancer factor 2) [21]. Замена a-40C>A расположена на расстоянии всего в 40 нуклеотидов от старта транскрипции, и обнаружена у черных и белых суффолков, поллдорсетов, ромни [18]. У джалгинского мериноса данные полиморфизмы связаны с негативным влиянием на показатели мясной продуктивности [10].

Замена c.373+18 G>T располагается в 1 ин-троне, вблизи донор- сайта сплайсинга. Она обнаружена у латвийских темноголовых овец [22], ряда новозеландских пород овец [20], джалгинского мериноса [10] а так же среди представителей породы суффолк и тексель [18]. Аналогичная замена (с.373+5 G>A) обнаружена у людей с фенотипом дабл-маскл [23]. Генетический изменения расположенные в приграничных регионах интронов могут повлиять на сплайсинг мРНК, а затем на аминокислоту, соответсвенно на мясные качества [22].

Замена с.*1232G>A предложена в качестве селекционного маркера [19; 20; 24]. Данная мутация широко распространена среди текселей, носителями так же являются овцы породы линкольны, поллдорсет, уайтсуффолк [3]. В своем исследовании мы использовали референс Oar_ v3.1. Исходя из него, аденин в позиции с.*1232 является референсным основанием, а гуанин-мутантным. Соответственно мутация имеет вид с.*1232A>G. Таким образом, 90% исследованных нами животных несут рекомендуемый генотип AA.

Так же интересным является то, что 3 замены в промоторной области с.-1128Т>С, с.-958Т>С и a-40C>A образуют группу и встречаются только совместно друг с другом, что позволяет предположить их сцепленное наследование.

Заключение

В ходе работы выявлено 28 однонуклео-тидных замен. 2 SNP - c.940G>T в экзоне 3 и с.^бС^ в 3'фланкирующей области гена обнаружены впервые. Нонсенс-мутацияc.940G>T превращает 314 кодон, кодирующий глутаминовую кислоту в стоп-кодон (GAA>TAA), что приводит к укорачиваниюбелкового продукта на 62 аминокислоты. Необходимо проводить дальнейшие исследования, направленные на изучение влияния обнаруженных SNP на показатели мясной продуктивности.

Вестник АПК

Ветеринария -! № 2(22), 2016 " "

Таблица 1 - Частотность полиморфных аллелей и генотипов у овец породы советский меринос

Наименование БЫР по номенклатуре ИОУв Идентификатор в базе ЫОВ! Позиция на хромосоме Аллель Генотип

1 с.-1866С>Т гб418742295 118142577 С Т СС СТ ТТ

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

0,875 0,125 0,75 0,25 0,00

2 с.-1499в>Д гб401553933 118142944 в Д вв вД ДД

0,950 0,050 0,90 0,10 0,00

3 с.-1404А>Т гб412722044 118143039 Д Т ДД ДТ ТТ

0,825 0,175 0,65 0.35 0.00

4 с.-1401в>Д гб424217443 118143042 в Д вв вД ДД

0,850 0,150 0,70 0,30 0,00

5 с.-1213С>Т гб398560354 118143230 С Т СС СТ ТТ

0,850 0,150 0,70 0,30 0,00

6 с.-1128Т>С гб414042681 118143315 Т С ТТ ТС СС

0.600 0,400 0,35 0,50 0,15

7 с.-958Т>С гб425338021 118143485 Т С ТТ ТС СС

0.600 0,400 0,35 0,50 0,15

8 с.-783в>Д гб403972675 118143660 в Д вв вД ДД

0,850 0,150 0.70 0,30 0,00

9 с.-40С>Д Г8411139795 118144403 С Д СС СД ДД

0.600 0,400 0,35 0,50 0,15

10 с.101Д>в гб417816017 118144543 Д в ДД Дв вв

0.950 0,050 0.90 0.10 0,00

11 с.373 + 18в>Т Г8119102825 118144833 в Т вв вТ ТТ

0.750 0.250 0,50 0,50 0,00

12 с.373 + 241Т>С ^119102826 118145056 Т С ТТ ТС СС

0,900 0.100 0,80 0,20 0.00

13 с.373+243в>Д ^427811339 118145058 в Д вв вД ДД

0,825 0.175 0,65 0,35 0.00

14 с.373 + 249Т>С ^417602601 118145064 Т С ТТ ТС СС

0,925 0,075 0,85 0,15 0.00

15 с.373+259в>Т ^119102828 118145074 в Т вв вТ ТТ

0,725 0,275 0,50 0.45 0.05

16 :с.373+323С>Т ^407388367 118145138 С Т СС СТ ТТ

0,925 0,075 0.85 0.15 0.00

17 с.373+563в>Д ^408710650 118145378 в Д вв вД ДД

0,900 0.100 0,80 0.20 0.00

18 с.374-645Д>в ^420853334 118146004 Д в ДД Дв вв

0,925 0,075 0,85 0,15 0.00

19 с.747+164Д>в ^426500486 118147186 Д в ДД Дв вв

0,750 0,250 0,50 0,50 0,00

20 с.747+309Т>Д ^404916326 118147331 Т Д ТТ ТД ДД

0,850 0,150 0.70 0.30 0.00

21 с.748-810С>Т ГБ423466211 118148243 С Т СС СТ ТТ

0,800 0,200 0,60 0,40 0.00

22 с.748-475Д>С ^406265773 118148578 Д С ДД ДС СС

0,900 0.100 0,80 0.20 0,00

23 с.748-468С>Т ^417558185 118148585 С Т СС СТ ТТ

0,900 0.100 0,80 0.20 0,00

24 с.748-54С>Т гб428638621 118148999 С Т СС СТ ТТ

0,925 0.075 0,85 0,15 0.00

25 с.940в>Т в базе отсутствует 118149245 в Т вв вТ ТТ

0,975 0.025 0.95 0,05 0,00

26 с.*16С>Д в базе отсутствует 118149449 С Д СС СД ДД

0,975 0.025 0.95 0,05 0,00

27 с.*709Д>С ^414527527 118150142 Д С ДД ДС СС

0,975 0.025 0.95 0,05 0,00

28 с.*1232Д>в ^408469734 118150665 Д в ДД Дв вв

0,900 0.100 0,90 0,00 0,10

Ежеквартальный

научно-практический

журнал

Вестник АПК

Ставрополья

Таблица 2 - Генотипы, выявленные у овец породы советский меринос.

№ Генот ип SNP

Upstream gene Exon I

С.-1866 c.-1499 C.-1404 C.-1401 C.-1213 C.-1128 C.-958 C.-783 C.-40 c.101

1 A

2 B 1

3 2

4 C 1

5 2

6 3

7 D

8 E 1

9 2

10 3

11 4

12 F 1

13 2

14 G 1

15 2

Генот ип Intron 1 Intron 2

c.373+ c.374- C.747+

+18 +241 +243 +249 +259 +323 +563 -645 +164 +309

A

B 1

2

C 1

2

3

D

E 1

2

3

4

F 1

2

G 1

2

Генот ип Intron 2 Exon 3 Downstream gene

C.748- c.940 c.*16 c.*709 c.*1232

-810 -475 -468 -54

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

A

B 1

2

C 1

2

3

D

E 1

2

3

4

F 1

2

G 1

2

Ячейки заштрихованные черным цветом обозначают гомозиготный вариант мутантного аллеля, серым-гетерозиготный, белым- гомозиготный вариант аллеля дикого типа.

Вестник АПК

Ставрополья

:№ 2(22), 2016

Ветеринария

63

Литература

1. Дунин И. М., Сердюков И. Г., Павлов М. Б. Новое селекционное достижение тонкорунная порода овец джалгинский меринос // FarmAnim. 2013. № 3-4.

2. Колосов Ю. А., Засемчук И. В., Маенко М. Е. Мясная продуктивность молодняка овец различного происхождения // Ветеринарная патология. 2014. № 3-4. С. 74-77.

3. Ефимова Н. И., Куприян А. Н., Любина Г. В. Генетический потенциал овец породы советский меринос // Сборник научных трудов / Ставропольский научно-исследовательский институт животноводства и кормопроизводства. 2006. Т. 1, № 1.

4. Шишкин С. С. Миостатин и некоторые другие биохимические факторы, регулирующие рост мышечных тканей у человека и ряда высших позвоночных // Успехи биологической химии. 2004. Т. 44. С. 209-262.

5. Haplotype diversity of the myostatin gene among beef cattle breeds / S. Dunner, M. E. Miranda, Y. Amigues, J. Cañón, M. Georges, R. Hanset, J. Williams, F. Ménissier // Genet. Sel. Evol. 2003. Vol. 35, no. 1. Pp. 103-118.

6. Molecular definition of an allelic series of mutations disrupting the myostatin function and causing double-muscling in cattle / L. Grobet, D. Poncelet, L. Royo, B. Brouwers, D. Pirottin, C. Michaux, F. Ménissier, M. Zanotti, S. Dunner, M. Georges // Mamm. Genome. 1998. Vol. 9, no. 3. Pp. 210213.

7. Characterization of the complete porcine MSTN gene and expression levels in pig breeds differing in muscularity / A. Stinckens, T. Luyten, J. Bijttebier, K. Van den Maagdenberg, D. Dieltiens, S. Janssens, S. De Smet, M. Georges, N. Buys // Anim. Genet. 2008. Vol. 39, no. 6. Pp. 586-96.

8. Polymorphisms in the ovine myostatin gene (MSTN) and their association with growth and carcass traits in New Zealand Romney sheep / J. G. H. Hickford, R.

H. Forrest, H. Zhou, Q. Fang, J. Han, C. M. Frampton, A. L. Horrell // Anim. Genet. 2010. Vol. 41, no. 1. Pp. 64-72.

9. A frameshift mutation in the coding region of the myostatin gene (MSTN) affects carcass conformation and fatness in Norwegian White Sheep (Ovis aries) /

I. A. Boman, G. Klemetsdal, T. Blichfeldt, O. Nafstad, D. I. Vage // Anim. Genet. 2009. Vol. 40, no. 4. Pp. 418-422.

10.Myostatin gene (MSTN) polymorphism with a negative effect on meat productivity in Dzhalginsky Merino sheep breed / V. Trukhachev, V. Belyaev, A. Kvochko, A Kulichenko, D. Kovalev, S. Pisarenko, A. Volynkina, M. Selionova, M. Aybazov, S. Shumaenko, A. Omarov, T. Mamontova, N. Golovanova, O. Yatsyk, A. Krivoruchko // J. Biosci. Biotechnol. 2015. Vol. 4, no. 2. Pp. 191-199.

11.Mapping quantitative trait Loci underlying fitness-related traits in a free-living sheep population / D. Beraldi, A. F. McRae, J. Gratten, J. Slate, P. M. Visscher, J. M. Pemberton // Evolution. 2007. Vol. 61, no. 6. Pp. 1403-16.

References

1. Dunin I. M., Serdyukov, I. G., Pavlov M. B. New selection achieving fine-fleeced sheep breed Dzhalginsky Merino // Farm Anim. 2013. № 3-4.

2. Kolosov Y. A., Zasemchuk I. V., Maenko M. E. Meat efficiency of young growth of sheep of different origin // Veterinary pathology. 2014. № 3-4. P. 74-77.

3. Efimova N. I., Kupriyan A. N., Lubina G. V. The genetic potential of sheep breeds Soviet Merino // Collection of scientific works of the Stavropol Research Institute of Livestock and fodder production. 2006. T. 1, № 1.

4. Shishkin S. S.Myostatin and some other biological factors that regulate the growth of muscle tissue in humans and a number of higher vertebrates // Advances of Biological Chemistry. 2004. T. 44. P. 209-262.

5. Dunner S. et al. Haplotype diversity of the myostatin gene among beef cattle breeds // Genet. Sel. Evol. 2003. T. 35, № 1. P. 103-118.

6. Grobet L. et al. Molecular definition of an allelic series of mutations disrupting the myostatin function and causing double-muscling in cattle // Mamm. Genome. 1998. T. 9, № 3. P. 210-213.

7. Stinckens A. et al. Characterization of the complete porcine MSTN gene and expression levels in pig breeds differing in muscularity // Anim. Genet. 2008. T. 39, № 6. P. 586-96.

8. Hickford J. G. H. et al. Polymorphisms in the ovine myostatin gene (MSTN) and their association with growth and carcass traits in New Zealand Romney sheep // Anim. Genet. 2010. T. 41, № 1. P. 64-72.

9. Boman I. a. et al. A frameshift mutation in the coding region of the myostatin gene (MSTN) affects carcass conformation and fatness in Norwegian White Sheep (Ovis aries) // Anim. Genet. 2009. T. 40, № 4. P. 418-422.

10.Trukhachev V. et al. Myostatin gene (MSTN) polymorphism with a negative effect on meat productivity in Dzhalginsky Merino sheep breed // J. Biosci. Biotechnol. 2015. T. 4, № 2. P. 191199.

11.Beraldi D. et al. Mapping quantitative trait Loci underlying fitness-related traits in a free-living sheep population // Evolution. 2007. T. 61, № 6. P. 1403-16.

12.Cavanagh C. R. et al. Mapping Quantitative Trait Loci (QTL) in sheep. III. QTL for carcass composition traits derived from CT scans and aligned with a meta-assembly for sheep and cattle carcass QTL // Genet. Sel. Evol. 2010. T. 42. P. 36.

13.Johnson P. L. et al. Meat quality traits were unaffected by a quantitative trait locus affecting leg composition traits in Texel sheep // J. Anim. Sci. 2005. T. 83, № 12. P. 2729-35.

14. Gutiérrez-Gil B. et al. Quantitative trait loci underlying milk production traits in sheep // Anim. Genet. 2009. T. 40, № 4. P. 423-434.

15.Davies G. et al. Quantitative trait loci associated with parasitic infection in Scottish blackface

64

"" — — Jj Ставрооодья

научно-практический журнал

12.Mapping Quantitative Trait Loci (QTL) in sheep. III. QTL for carcass composition traits derived from CT scans and aligned with a meta-assembly for sheep and cattle carcass QTL / C. R. Cavanagh, E. Jonas, M. Hobbs, P. C. Thomson, I. Tammen, H. W. Raadsma // Genet. Sel. Evol. 2010. Vol. 42. Pp. 36.

13.Meat quality traits were unaffected by a quantitative trait locus affecting leg composition traits in Texel sheep / P. L. Johnson, J. C. McEwan, K. G. Dodds, R. W. Purchas, H. T. Blair // J. Anim. Sci. 2005. Vol. 83, no. 12. Pp. 2729-35.

14.Quantitative trait loci underlying milk production traits in sheep / B. Gutiérrez-Gil, M. F. El-Zarei, L. Alvarez, Y. Bayón, L. F. de la Fuente, F. San Primitivo, J.-J. Arranz // Anim. Genet. 2009. Vol. 40, no. 4. Pp. 423-434.

15.Quantitative trait loci associated with parasitic infection in Scottish blackface sheep / G. Davies, M. J. Stear, M. Benothman, O. Abuagob, A. Kerr, S. Mitchell, S. C. Bishop // Heredity (Edinb). 2006. Vol. 96, no. 3. Pp. 252-258.

16.Discovery of quantitative trait loci for resistance to parasitic nematode infection in sheep: I. Analysis of outcross pedigrees / A. M. Crawford, K. A. Paterson, K. G. Dodds, C. Diez Tascon, P. A. Williamson, M. Roberts Thomson, S. A. Bisset, A. E. Beattie, G. J. Greer, R. S. Green, R. Wheeler, R. J. Shaw, K. Knowler, J. C. McEwan // BMC Genomics. 2006. Vol. 7. Pp. 178.

17.Effect of Myostatin (MSTN) g+6223G>A on production and carcass traits in New Zealand Romney sheep / J. Han, H. Zhou, R. H. Forrest, J. R. Sedcole, C. M. Frampton, J. G. H. Hickford // Asian-Australasian J. Anim. Sci. 2010. Vol. 23, no. 7. Pp. 863-866.

18.Evidence for multiple alleles effecting muscling and fatness at the ovine GDF8 locus / J. W. Kijas, R. McCulloch, J. E. H. Edwards, V. H. Oddy, S. H. Lee, J. van der Werf // BMC Genet. 2007. Vol. 8. Pp. 80.

19.Evaluating the effects of the c.*1232G>A mutation and TM-QTL in TexelxWelsh Mountain lambs using ultrasound and video image analyses / A. Y. Masri, N. R. Lambe, J. M. Macfarlane, S. Brotherstone, W. Haresign, L. Bünger // Small Rumin. Res. 2011. Vol. 99, no. 2-3. Pp. 99-109.

20.Han J., Forrest R. H., Hickford J. G. H. Genetic variations in the myostatin gene (MSTN) in New Zealand sheep breeds // Mol. Biol. Rep. 2013. Vol. 40, no. 11. Pp. 6379-6384.

21.Some motifs were important for myostatin transcriptional regulation in sheep (Ovis aries) / R. Du, X. An, Y. Chen, J. Qin // J. Biochem. Mol. Biol. 2007. Vol. 40, no. 4. Pp. 547-553.

22.Analysis of the single-nucleotide polymorphism in the 5'UTR and part of intron I of the sheep MSTN gene / T. Sjakste, N. Paramonova, Z. Grislis, I. Trapina, D. Kairisa // DNA Cell Biol. 2011. Vol. 30, no. 7. Pp. 433-444.

23.Myostatin mutation associated with gross muscle hypertrophy in a child / M. Schuelke, K. R. Wagner, L. E. Stolz, C. Hübner, T. Riebel, W. Kömen, T. Braun, J. F. Tobin, S. J. Lee // N. Engl. J. Med. 2004. Vol. 350, no. 26. Pp. 2682-8.

sheep // Heredity (Edinb). 2006. T. 96. № 3. P. 252-258.

16.Crawford A. M. et al. Discovery of quantitative trait loci for resistance to parasitic nematode infection in sheep: I. Analysis of outcross pedigrees // BMC Genomics. 2006. T. 7. P. 178.

17.Han J. et al. Effect of Myostatin (MSTN) g+6223G>A on Production and Carcass Traits in New Zealand Romney Sheep // Asian-Australasian J. Anim. Sci. 2010. T. 23, № 7. P. 863-866.

18.Kijas J. W. et al. Evidence for multiple alleles effecting muscling and fatness at the ovine GDF8 locus // BMC Genet. 2007. T. 8. P. 80.

19.Masri A.Y. et al. Evaluating the effects of the c.*1232G>A mutation and TM-QTL in TexelxWelsh Mountain lambs using ultrasound and video image analyses // Small Rumin. Res. 2011. T. 99, № 2-3. P. 99-109.

20.Han J., Forrest R. H., Hickford J. G. H. Genetic variations in the myostatin gene (MSTN) in New Zealand sheep breeds // Mol. Biol. Rep. 2013. T. 40, № 11. P. 6379-6384.

21.Du R. et al. Some motifs were important for myostatin transcriptional regulation in sheep (Ovis aries) // J. Biochem. Mol. Biol. 2007. T. 40, № 4. P. 547-553.

22.Sjakste T. et al. Analysis of the single-nucleotide polymorphism in the 5'UTR and part of intron I of the sheep MSTN gene // DNA Cell Biol. 2011. T. 30, № 7. P. 433-444.

23.Schuelke M. et al. Myostatin mutation associated with gross muscle hypertrophy in a child // N. Engl. J. Med. 2004. T. 350, № 26. P. 2682-8.

24.Clop A. et al. A mutation creating a potential illegitimate microRNA target site in the myostatin gene affects muscularity in sheep// Nat. Genet. 2006. T. 38, № 7. P. 813-818.

в

естник АПК

Ветеринария -! № 2(22), 2016 " "

65

24.A mutation creating a potential illegitimate microRNA target site in the myostatin gene affects muscularity in sheep / A. Clop, F. Marcq, H. Takeda, D. Pirottin, X. Tordoir, B. Bibe, J. Bouix, F. Caiment, J. M. Elsen, F. Eychenne, C. Larzul, E. Laville, F. Meish, D. Milenkovic, J. Tobin, C. Charlier, M. Georges // Nat. Genet. 2006. Vol. 38, no. 7. Pp. 813-818.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.