Научная статья на тему 'Особенности генетической структуры генотипов 4 и 5 вируса клещевого энцефалита'

Особенности генетической структуры генотипов 4 и 5 вируса клещевого энцефалита Текст научной статьи по специальности «Ветеринарные науки»

CC BY
52
18
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
Журнал
Инфекция и иммунитет
Scopus
ВАК
RSCI
ESCI
Область наук
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по ветеринарным наукам , автор научной работы — Т.В. Демина, Ю.П. Джиоев, И.В. Козлова, М.М. Верхозина, С.Е. Ткачев

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Текст научной работы на тему «Особенности генетической структуры генотипов 4 и 5 вируса клещевого энцефалита»

Материалы X съезда ВНПОЭМП, Москва, 12-13 апреля 2012 г.

Инфекция и иммунитет

логической диагностики чумы, которые могут быть использованы при проведении эпизоотологическо-го обследования в природных очагах. В РосНИПЧИ «Микроб» сконструирована экспериментальная иммуноферментная тест-система для выявления антител (АТ) к чумному микробу («ИФА-Ат-Ф1 Yersinia pestis»), предназначенная для обнаружения АТ к капсульному Ф1 антигену в сыворотках, суспензиях крови и смывах с органов грудной полости грызунов. Данная тест-система обладала высокой диагностической ценностью и специфичностью при исследовании материала, взятого непосредственно перед проведением анализа (Девдариани с соавт., 2011). Однако при работе в полевых условиях нередко отсутствует возможность немедленного исследования антителосодержащего биологического материала серологическими методами, в связи с чем их либо предварительно замораживают, либо наносят на фильтровальную бумагу, пропитанную мертиолатом натрия (ФБ-М) (СП 1.3.1285-03). Целью настоящей работы стало изучение эффективности обнаружения анти-Ф1 антител с помощью вышеназванной тест-системы в образцах антитело-содержащих жидкостей до и после замораживания, а также нанесенных на ФБ-М. Были исследованы образцы крови лабораторных мышей, вакцинированных живой чумной вакциной (г. Ставрополь), взятые на 21-й день эксперимента, когда у животных наблюдался максимальный антительный ответ. Параллельно тестировали предварительно замороженные при минус 20°С и не подвергавшиеся замораживанию пробы крови, обработанные натрия цитратом, суспензии крови в фосфатно-солевом буфере, смывы с органов грудной полости и образцы крови, нанесенные на ФБ-М. Жидкие пробы обрабатывали метриолатом натрия (СП 1.3.1285-03). Оказалось, что значения титров специфических АТ в образцах биологических жидкостей до и после замораживания были сходными и значительно превышали диагностический титр, достигая значений 1:10 240. Не менее эффективным было исследование образцов крови на ФБ-М — титры антител практически полностью коррелировали с таковыми при исследовании не подвергавшихся замораживанию проб крови. Таким образом, применение тест-системы «ИФА-Ат-Ф1 Yersinia pestis» является информативным при исследовании антителосодержащего биоматериала, обработанного различными способами.

ОСОБЕННОСТИ ГЕНЕТИЧЕСКОЙ СТРУКТУРЫ ГЕНОТИПОВ 4 И 5 ВИРУСА КЛЕЩЕВОГО ЭНЦЕФАЛИТА

Т.В. Демина1, Ю.П. Джиоев2, И.В. Козлова12, М.М. Верхозина3, С.Е. Ткачев4, Е.К. Дорощенко2, О.В. Лисак2, А.И. Парамонов2, В.И. Злобин1

1Иркутский государственный медицинский университет Росздрава, г. Иркутск; 2НЦпроблем здоровья семьи и репродукции человека СО РАМН, г. Иркутск; 3ФБУЗ «Центр эпидемиологии и гигиены в Иркутской области», г. Иркутск; 4Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН, г. Новосибирск

На основе сравнения полногеномных структур 54 штаммов, фрагментов гена Е (160 н.о.) 643 штаммов и изолятов РНК вируса клещевого энцефалита (ВКЭ) подтверждено ранее высказанное нами по-

ложение (Злобин В.И. и др., 2001) о существовании, наряду с тремя основными генотипами, генотипов 4 (штамм 178-79) и 5 (штамм 886-84). В настоящее время нами обнаружено 13 и другими авторами — 4 штамма (или изолята РНК), гомологичных последнему и сформировавших «группу 886».

Структуры каждого из пяти генотипов ВКЭ представляют собой последовательности нуклео-тидов, состоящие из чередований участков, одни из которых являются специфичными для каждого из них, другие — общими. Частота их чередований у штамма 178-79 и «группы 886» выражена сильнее, чем у представителей трех основных генотипов. При сопоставлении полипротеинов 54 штаммов выявлено три аминокислотных остатка, характерных только для генотипов 4 и 5: изо-лейцин (I) в позиции 109 (на конце белка С), лизин (^ в позиции 2074 (белок NS3) и аспарагиновая кислота в позиции 2515 (начало белка NS5). Установлено, что надежным генотипспецифиче-ским признаком является определенное сочетание аминокислот в 22 позициях, в 12 из которых обнаружены аминокислотные остатки строго консервативные для каждого из трех основных генотипов: ^3, E-206, Ш1-54, Ш1-285, NS2A-127, NS2A-175, NS2A-225, Ш3-376, NS4B-28, NS4B-96, NS5-18, NS5-671. В указанных выше 22 позициях у генотипа 4 чередуются аминокислоты, характерные для генотипов 1 и 3, у генотипа 5 — наряду с аминокислотами, присущими трем основным генотипам, отмечается чередование уникальных замен (С-108А, NS2A-127S и NS3-258G).

Возможно, приведенные факты косвенно указывают на такое явление, как множественная рекомбинация и демонстрируют ее значительную роль в процессе видообразования у флавивирусов млекопитающих, передающихся клещами.

ИЗУЧЕНИЕ ВОЗДЕЙСТВИЯ ТРЕТИЧНЫХ АЛКИЛАМИНОВ НА СТРУКТУРНУЮ ОРГАНИЗАЦИЮ БИОПЛЕНОК ФОРМИРУЕМЫХ ПАТОГЕННЫМИ ГРАМОТРИЦАТЕЛЬНЫМИ И ГРАМПОЛОЖИТЕЛЬНЫМИ БАКТЕРИЯМИ Л.В. Диденко1, Г.Г. Кардаш2, Э.Р. Толордава1, Д.А. Куршин2, О.В. Емшанов2

ФГБУ НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Н.Ф. Гамалеи Минздравсоцразвития РФ; 2Научно-производственная компания ООО «ИНТЕРСЭН-плюс»

В настоящее время дезинфицирующие средства на основе третичных алкиламинов получают широкое распространение, поскольку обладают бактерицидной активностью в отношении грамполо-жительных и грамотрицательных бактерий, грибов и вирусов и низкими показателями токсичности.

Оценка антимикробной активности дезинфицирующих средств проводится по традиционным микробиологическим методикам, в результате которых регистрируется способность микроорганизмов к росту на питательных средах после воздействия микробиоцидами.

Применение традиционных микробиологических методов оценки микробиоцидной активности в отношении образуемых бактериями в неблагоприятных для них условиях биопленок неэффективно, поскольку ростовые свойства бактерий в составе биопленок изменены. Отсутствие роста бактерий

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.