CC BY
16
Клиническая онкогематология. 2023;16(4):399-406
Clinical oncohematology. 2023;16(4):399-406
ТРАНСПЛАНТАЦИЯ КОСТНОГО МОЗГА
Оптимальное мультилокусное HLA-типирование у потенциальных доноров аллогенных гемопоэтических стволовых клеток
Е.Г. Хамаганова, С.П. Хижинский, Е.П. Кузьминова, А.Р. Абдрахимова, Е.А. Леонов, Т.В. Гапонова, Е.Н. Паровичникова
ФГБУ «НМИЦ гематологии» Минздрава России,
Новый Зыковский пр-д, д. 4, Москва, Российская Федерация, 125167
РЕФЕРАТ
Актуальность. HLA-типирование и выбор совместимого донора имеют решающее значение при трансплантации аллогенных гемопоэтических клеток (аллоТГСК), как и выявление донор-специфических анти-^А-антител. По рекомендациям Центра международных исследований в области трансплантации гемопоэтических стволовых клеток крови и костного мозга (CIBMTR) оптимальное HLA-типирование проводится по 11 HLA-генам (-A, -B, -C, -DRB1, -DRB3/4/5, -DQA1, -DQB1, -DPA1, -DPB1) с адекватным покрытием генов с целью получить результаты на уровне двухпольных значений.
Цель. Оценить результаты мультилокусного HLA-типиро-вания у доноров костного мозга/гемопоэтических стволовых клеток из базы данных ФГБУ «НМИЦ гематологии» Минздрава РФ на их соответствие рекомендациям CIBMTR при аллоТГСК с анализом частоты и распределения HLA-аллелей и мультилокусных HLA-гаплотипов. Материалы и методы. В исследование включено 3485 доноров с HLA-типированием методом секвениро-вания следующего поколения.
Результаты. У всех доноров аллели HLA-генов I класса установлены на уровне 4-го поля (нуклеотидной последовательности). При редукции результатов до уровня 2-го поля (аминокислотной последовательности) выявлен 61 аллель HLA-A, 92 — HLA-B, 49 — HLA-C. Аллели генов II класса установлены на уровне или двухпольных значений, или высокого разрешения. Среди генов локу-са HLA-DRB обнаружено 57 аллелей гена DRB1, 11 — гена DRB3, 6 — гена DRB4, 5 — гена DRB5. Выявлено 23 алле-ля HLA-DQA1, 30 — HLA-DQB1, 14 — HLA-DPA1, 33 — HLA-DPB1. Установлено 3289 различных HLA-гаплотипов генов A-B-C-DRB1-DQA1-DQB1-DPA1-DPB1. Заключение. В ФГБУ «НМИЦ гематологии» Минздрава РФ создана база данных потенциальных доноров костного мозга/гемопоэтических стволовых клеток, типированных по 11 классическим полиморфным генам HLA-A, -B, -C, -DRB1, -DRB3/4/5, -DQA1, -DQB1, -DPA1,
BONE MARROW TRANSPLANTATION
An Optimal Multi-Locus HLA-Typing in Potential Donors of Allogeneic Hematopoietic Stem Cells
EG Khamaganova, SP Khizhinskii, EP Kuzminova, AR Abdrakhimova, EA Leonov, TV Gaponova, EN Parovichnikova
National Research Center for Hematology, 4 Novyi Zykovskii pr-d, Moscow, Russian Federation, 125167
ABSTRACT
Background. HLA-typing and matched donor selection as well as the detection of donor-specific anti-HLA antibodies are essential for allogeneic hematopoietic cell transplantation (allo-HSCT). In accordance with the guidelines of the Center for International Blood and Marrow Transplant Research (CIBMTR) optimal HLA-typing is performed on 11 HLA genes (-A, -B, -C, -DRB1, -DRB3/4/5, -DQA1, -DQB1, -DPA1, and -DPB1) with an adequate coverage aiming to obtain the values at the two-field level.
Aim. To assess the results of multi-locus HLA-typing in bone marrow/hematopoietic cell donors from the database at the National Research Center for Hematology in terms of their conformance with the CIBMTR guidelines for allo-HSCT and to analyze the frequency and distribution of HLA alleles and multi-locus HLA haplotypes.
Materials & Methods. The study enrolled 3485 donors who were HLA-typed by next-generation sequencing. Results. In all donors, the alleles of HLA class I genes were identified at the fourth-field level (nucleotide sequence). When the results were reduced to the second-field level (amino acid sequence), 61 HLA-A, 92 HLA-B, and 49 HLA-C alleles were detected. The alleles of class II genes were discovered either at the two-field or high-reso I ution levels. Among the HLA-DRB locus genes, 57 DRB1, 11 DRB3, 6 DRB4, and 5 DRB5 alleles were identified. Also, 23 HLA-DQA1, 30 HLA-DQB1, 14 HLA-DPA1, and 33 HLA-DPB1 alleles were detected. There were reported 3289 different HLA haplotypes of A-B-C-DRB1-DQA1-DQB1-DPA1-DPB1 genes.
Conclusion. The database created at the National Research Center for Hematology includes potential bone marrow/ hematopoietic stem cell donors typed for 11 classical polymorphic genes HLA-A, -B, -C, -DRB1, -DRB3/4/5, -DQA1, -DQB1, -DPA1, and -DPB1, which is in line with the guidelines of CIBMTR. The frequency and distribution of HLA alleles and multi-locus HLA haplotypes in our donors correspond to those in populations of European origin. HLA-typing and
© 2023 практическая медицина
399
-йРВ1, что согласуется с рекомендациями CIBMTR. Частота и распределение НМ-аллелей и мультилокусных HLA-гаплотипов у доноров соответствуют таковым у популяций европейского происхождения. HLA-типирова-ние и выбор донора с учетом 11 НМ-генов будут способствовать улучшению результатов неродственных и гаплоидентичных ТГСК.
donor selection with regard to 11 HLA genes will contribute to improving the outcomes of both unrelated and haploiden-tical HSCTs.
Ключевые слова: аллоТГСК, HLA-типирование, HLA-аллели, HLA-гаплотипы, доноры костного мозга/гемопоэтических стволовых клеток.
Keywords: allo-HSCT, HLA-typing, HLA alleles, HLA haplotypes, bone marrow/hematopoietic stem cell donors.
Получено: 14 июня 2023 г. Принято в печать: 18 сентября 2023 г.
Received: June 14, 2023 Accepted: September 18, 2023
Для переписки: Екатерина Георгиевна Хамаганова, д-р биол. наук, Новый Зыковский пр-д, д. 4, Москва, Российская Федерация, 125167; тел.: +7(495)613-24-76; e-mail: ekhamag@mail.ru Для цитирования: Хамаганова Е.Г., Хижинский С.П., Кузьминова Е.П. и др. Оптимальное мультилокусное HLA-типирование у потенциальных доноров аллогенных гемопоэтических стволовых клеток. Клиническая онкогематология. 2023;16(4):399-406.
DOI: 10.21320/2500-2139-2023-16-4-399-406
For correspondence: Ekaterina Georgievna Khamaganova, PhD in Biology,
4 Novyi Zykovskii pr-d, Moscow, Russian Federation, 125167;
Tel.: +7(495)613-24-76; e-mail: ekhamag@mail.ru
For citation: Khamaganova EG, Khizhinskii SP, Kuzminova EP, et al.
An Optimal Multi-Locus HLA-Typing in Potential Donors of Allogeneic
Hematopoietic Stem Cells. Clinical oncohematology. 2023;16(4):399-406.
(In Russ).
DOI: 10.21320/2500-2139-2023-16-4-399-406
ВВЕДЕНИЕ
Трансплантация аллогенных гемопоэтических стволовых клеток (аллоТГСК) в настоящее время является неотъемлемой частью программной терапии для пациентов со многими угрожающими жизни заболеваниями системы крови [1]. По стандартам Европейской федерации иммуногенетики (EFI) наиболее строгие требования к HLA-типированию предъявляются при аллоТГСК от неродственного донора. Они требуют типирования реципиента и донора методами ДНК-ти-пирования с высоким разрешением минимально по генам HLA-A, -B, -C и -DRB1 [2]. В соответствии с приказом Министерства здравоохранения Российской Федерации 519-н от 29 июля 2022 г. типирование у доноров для неродственной аллоТГСК должно проводиться по пяти генам (HLA-A, -В, -С, -DRB1, -DQB1) в высоком разрешении [3]. В то же время по методическим рекомендациями ФМБА России (отвечает за создание и ведение Федерального регистра доноров костного мозга (КМ) и гемопоэтических стволовых клеток (ГСК) в России) типирование по тем же пяти генам выполняется в высоком разрешении по технологии секвенирования следующего поколения (NGS) и/или HLA-типирования методом секвенирования по Сэнгеру (Sequence Based Typing, SBT) [4].
Результаты HLA-типирования и выбор совместимого донора имеют решающее значение при аллоТГСК, как и выявление донор-специфических анти-HLA-антител (при частично совместимых и гаплоидентичных ТГСК) [5, 6]. Минимальные требования для аллоТГСК по рекомендациям Центра международных исследований в области трансплантации гемопоэтических стволовых клеток крови и костного мозга (Center for International Blood and
Marrow Transplant Research, CIBMTR) [5] заключаются в типировании по HLA-генам (-A, -B, -C, -DRB1, -DPB1) с адекватным покрытием генов для получения результатов на уровне P- или G-групп, исключая нулевые аллели, что соответствует критерию типирования с высоким разрешением. Высокое разрешение при HLA-типировании представляет собой идентификацию HLA-аллелей, которые кодируют одинаковую аминокислотную последовательность внутри антигенсвязывающего сайта, а также исключение аллелей, которые не экспрессируются на клеточной поверхности — нулевых аллелей [2, 7]. Включение гена HLA-DPB1 в обязательное минимальное HLA-ти-пирование и выбор донора при аллоТГСК обусловлены тем, что недопустимое несоответствие по гену HLA-DPB1 между реципиентом и донором оказывает влияние на результаты неродственных аллоТГСК [8-10] и гаплоидентичных трансплантаций от родственного донора [11]. Идентификация анти-HLA-ан-тител и использование виртуального перекрестного анализа необходимы для минимизации риска, связанного с донор-специфическими антителами, а именно развития несостоятельности трансплантата. Анти-HLA-антитела могут образовываться к любой полиморфной HLA-специфичности [12]. Известно 11 классических полиморфных HLA-генов: -A, -B, -C, -DRB1, -DRB3/4/5, -DQA1, -DQB1, -DPA1, -DPB1. Оптимальным по рекомендации CIBMTR считается типирование по всем 11 HLA-генам с адекватным покрытием генов для получения результатов на уровне двухпольных значений [5]. В соответствии с современной номенклатурой HLA-аллелей (http://hla. alleles.org/nomenclature/naming.html [13]) HLA-ти-пирование на уровне 2-го поля позволяет выявить HLA-аллели, кодирующие одинаковую специфичную аминокислотную последовательность, что превос-
ходит высокое разрешение, т. к. не ограничивается антигенсвязывающим сайтом.
Цель настоящей работы — оценить результаты мультилокусного HLA-типирования у доноров КМ/ ГСК из базы данных ФГБУ «НМИЦ гематологии» Минздрава России на их соответствие рекомендациям CIBMTR для аллоТГСК с анализом частоты и распределения ИЬЛ-аллелей и мультилокусных HLA-гапло-типов.
МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
В исследование включено 3485 доноров КМ/ГСК из базы данных ФГБУ «НМИЦ гематологии» Минздрава России. 3345 (95,7 %) доноров идентифицировали себя как русских, 134 (3,8 %) — указали иную этническую принадлежность, 16 (0,5 %) доноров не указали своей этнической принадлежности. От всех участников исследования получено информированное согласие.
Геномную ДНК выделяли из крови, заготовленной в пробирках с ЭДТА с помощью наборов QIAamp DNA Blood Mini Kit (Qiagen, ФРГ) [14] и автоматизированной системы выделения ДНК QIAcube (Qiagen, ФРГ) в соответствии с рекомендациями производителя. HLA-типирование проводили методом NGS с использованием набора AllType FASTplex NGS Assay (One Lambda, США). Библиотеки готовили согласно рекомендациям производителя. Коротко: в ходе таргетного обогащения HLA-гены амплифицировали методом мультиплексной полимеразной цепной реакции с использованием специфической смеси праймеров. Все анализируемые гены нарабатывали в одной пробирке. Гены I класса (HLA-A, -B, -C) амплифицировали полностью, гены II класса (HLA-DRB1, -DRB3/4/5, -DQA1, -DQB1, -DPA1, -DPB1) — от 2-го экзона до 3'UTR (UTR — нетранслируемая область). По завершении амплификации осуществляли очистку ампликонов, измерение их концентрации. Далее проводили фрагментацию ампликонов, бар-кодирование образцов, остановку реакции, пулирование образцов и очистку. Затем следовал этап амплификации полученной библиотеки. Амплифицированную библиотеку подвергали очистке, после которой измеряли ее финальную концентрацию и денатурировали с помощью гидроксида натрия. С использованием набора реагентов для секвенирования MiSeq Reagent Kit v2 (150 + 150 циклов) (Illumina, США) проводили секвенирование на платформе MiSeq (Illumina, США). Анализ полученных в результате секвенирования последовательностей HLA-генов выполняли с помощью компьютерной программы TypeStream Visual Software (TSV) (One Lambda, США), версия V2.0.0.68 и базы данных IPD-IMGT/HLA.
Статистический анализ
При статистической обработке результатов определяли частоту аллелей HLA-генов и HLA-гаплотипов с помощью компьютерной программы Arlequin 3.5 методом максимального правдоподобия с использованием алгоритма максимизации ожидания результатов [15].
Таблица 1. Частота (> 0,1 %) наиболее распространенных аллелей HLA-генов I класса (HLA-A, -B, -C)
Аллель гена HLA-A Частота, % Аллель гена HLA-B Частота, % Аллель гена HLA-C Частота, %
A*02:01 27,3 B*07:02 12,4 C*07:02 13,9
A*03:01 14,7 B*18:01 7,3 C*04:01 13,0
A*01:01 11,9 B*08:01 7,0 C*07:01 11,8
A*24:02 11,0 B*35:01 6,4 C*06:02 11,7
A*11:01 5,8 B*13:02 6,2 C*12:03 9,2
A*26:01 4,6 B*15:01 5,4 C*02:02 6,0
A*25:01 4,4 B*44:02 4,8 C*03:04 5,9
A*68:01 3,2 B*27:05 4,2 C*01:02 4,3
A*32:01 3,1 B*51:01 4,2 C*03:03 4,1
A*23:01 2,2 B*40:01 3,6 C*05:01 3,8
A*30:01 2,2 B*38:01 3,2 C*07:04 2,4
A*31:01 2,0 B*44:03 3,0 C*08:02 2,3
A*33:01 1,2 B*57:01 2,8 C*17:03 2,2
A*33:03 0,9 B*35:03 2,4 C*12:02 2,0
A*66:01 0,8 B*41:02 2,2 C*15:02 1,1
A*29:02 0,7 B*14:02 2,1 C*14:02 1,0
A*02:05 0,5 B*40:02 2,1 C*03:02 0,8
A*02:06 0,3 B*52:01 2,1 C*16:01 0,6
A*68:02 0,3 B*39:01 1,8 C*17:01 0,4
A*29:01 0,2 B*35:02 1,3 C*16:02 0,4
A*03:02 0,2 B*49:01 1,2 C*08:03 0,3
A*02:07 0,1 B*56:01 1,1 C*15:05 0,3
A*02:17 0,1 B*44:27 1,0 C*15:13 0,2
A*30:02 0,1 B*50:01 1,0 C*07:06 0,1
A*30:04 0,1 B*58:01 1,0 C*07:18 0,1
B*27:02 1,0 C*16:04 0,1
B*55:01 0,9
B*37:01 0,8
B*44:05 0,6
B*48:01 0,6
B*41:01 0,5
B*35:08 0,4
B*15:17 0,3
B*39:06 0,2
B*07:04 0,2
B*53:01 0,2
B*07:05 0,1
B*14:01 0,1
B*15:08 0,1
B*15:18 0,1
B*18:03 0,1
B*40:06 0,1
B*45:01 0,1
B*46:01 0,1
B*51:08 0,1
B*54:01 0,1
B*73:01 0,1
РЕЗУЛЬТАТЫ
У 3485 доноров (п) выявлено 6970 копий гаплотипов (2п). Варианты ИЬЛ-генов I класса были установлены на уровне уникальной нуклеотидной последователь-
Таблица 2. Частота (> 0,1 %) наиболее распространенных ; генов локуса ¡ЛА-ОЙБ
Аллели гена HLA-DRB1 Частота, % Аллели генов HLA-DRB3/4/5 Частота, %
ййВ1*07:01 14,4 йЯВ3 отсутствует 62,3
й1?ВГ15:01 12,1 й!1В3*02:02Р 19,1
й/гВГ01:01 11,2 йЙВ3*01:01Р 15,3
йЯВ1*03:01 8,3 йЙВ3*03:01 2,6
йЙВГ13:01 6,9 йЙВ3*02:24 0,3
йЙВ1*11:01 6,0
йЙВ1*11:04 5,0 йЯВ4 отсутствует 73,6
йЙВ1*04:01 4,1 йЙВ4*01:03 19,1
й!1В1*1в:01 4,1 йЙВ4*01:03:01:02М 3,7
йЙВ1*08:01Р 3,6 йЙВ4*01:01Р 3,2
йЙВ1*13:03 3,2 йЙВ4*01:02 0,1
й!1В1*04:04 2,8
й!?ВГ13:02 2,5 йЯВ5 отсутствует 81,8
йЙВ1*12:01/12:10 (= 12-.0V.01G или 12:01Р) 2,3 йЙВ5*01:01Р 12,2
йЙВ1*15:02/15:140/15:149 (= 15:02:0Ю или 15:02Р) 1,6 йЙВ5*02:02 4,2
йЙВ1*09:01 1,5 йР!В5*01:02 1,5
йЙВ1*01:02 1,3
йЙВ1*14:54 1,2
йЙВ1*04:02 1,0
й/гВ1*10:01 0,9
йЙВ1*11:03 0,9
йЙВ1*04:08 0,7
йЙВ1*04:03 0,6
й!1В1*04:05 0,4
й!1В1*04:07 0,4
йЙВ1*08:03 0,3
йЯВ1*01:03 0,1
йЙВ1*08:04 0,1
йЙВ1*12:02 0,1
йЙВ1*13:05 0,1
йЯВ1*1в:02Р 0,1
ности — с разрешением уровня 4-го поля (например, А*01:01:01:01). Для выявления аллелей на уровне уникальных аминокислотных последовательностей была проведена редукция результатов типирования до 2-го поля. На уровне 2-го поля среди ИЬА-генов I класса выявлен 61 различный аллель гена ИЬА-А, 92 — гена ИЬА-Б, 49 — гена ИЬА-С. Частота наиболее распространенных аллелей ИЬА-генов I класса представлена в табл. 1.
Наиболее распространенные аллели (с частотой > 10 %) гена ИЬА-А — А*02:01 (27,3 %), А*03:01 (14,7 %), А*01:01 (11,9 %), А*24:02 (11,0 %). Только один аллель гена ИЬА-Б имел частоту более 10 % — Б*07:02 (12,4 %). Частота 4 аллелей гена ИЬА-С превышала 10 %: С*07:02 (14,0 %), С*04:01 (13,1 %), С*07:01 (11,8 %), С*06:02 (11,7 %).
Нулевые аллели (с отсутствием экспрессии) среди ИЬА-генов I класса были установлены дважды. Один раз выявлен нулевой аллель гена ИЬА-А — A*01:16N, его характеризует инсерция в экзоне 3, приводящая к сдвигу рамки считывания и образованию стоп-ко-дона [16]. Этот аллель имеет статус WD ^еП^оси-
mented) — хорошо документированного аллеля в последнем каталоге распространенных и хорошо документированных ИЬА-аллелей [17], т. е. он был выявлен не менее 5 раз в разных популяциях. Один раз был определен нулевой аллель гена ИЬА-Б — ИЬA-Б*57:79N, который характеризуется делецией в экзоне 4, сдвигом рамки считывания и образованием стоп-кодона. Этот аллель относится к редким, т. е. отмечается в единичных наблюдениях.
Мы выявили ИЬА-аллели, которые имели несинонимичные замены (приводящие к замене аминокислоты) по сравнению с консенсусными последовательностями из базы данных ИЬА-аллелей IMGT/HLA [18], что приводило к образованию новых ИЬА-аллелей. Это новый аллель гена ИЬА-А*03, отличающийся от ИЬА-А*03:01:01:01 заменой в экзоне 2 (Е2-261), ССС^С, Рго>Аг& которому 31.03.2022 г. комитетом Всемирной организации здравоохранения (ВОЗ) по номенклатуре факторов HLA-системы было присвоено имя ИЬА-А*03:152. Новый аллель гена ИЬА-А*24 отличается от ИЬА-А*24:02:01:01 заменой в экзоне 4 (Е4-1576), ССС->СТС, Рго-^еи. Этому аллелю 29.01.2021 г. комитетом ВОЗ по номенклатуре присвоено имя ИЬА-А*24:521. Новому аллелю гена ИЬА-Б*13, отличающемуся от ИЬА-Б*13:02:01:01 заменой в экзоне 1 (Е1-29), СТС-^С, Leu->Arg, 29.01.2021 г. присвоено имя ИЬА-Б*13:152. Новый аллель гена ИЬА-С отличается от ИЬА-С*07:04:01:01 заменой в эк-зоне 3 (Е3-755), CTG->GTG, Leu->Val, ему 31.02.2022 г. присвоено имя ИЬА-С*07:1012.
Таким образом, у всех доноров были установлены специфичные нуклеотидные последовательности ИЬА-генов I класса и кодируемые ими аминокислотные последовательности. Выявлены доноры, являющиеся носителями нулевых аллелей, и доноры с новыми ИЬА-аллелями.
Среди генов локуса ИЬА-йЯБ выявлено 57 различных аллелей гена ИЬА-йЯБ1, 11 — гена ИЬА-ОИБ3 (+ вариант отсутствия гена в HLA-гаплотипе), 6 — гена ИЬА-йЯБ4 (+ вариант отсутствия гена в HLA-гапло-типе), 5 — гена ИЬА-йЯБ4 (+ вариант отсутствия гена в HLA-гаплотипе). Наиболее распространенные аллели этого локуса представлены в табл. 2.
Варианты гена ИЬА-йЯБ1 были установлены на уровне 2-го поля, т. е. аллелей с уникальной аминокислотной последовательностью, за исключением БЯБ1*12:01/12:10 и БЯБ1*15:02/15:140/15:149. йЯБ1*12:01/12:10 включает 2 аллеля, различающихся по последовательностям вне антигенсвязывающего сайта. Поскольку эти аллели имеют одинаковую нуклеотидную последовательность антигенсвя-зывающего сайта, это соответствует типированию с высоким уровнем разрешения, а его результат может быть представлен как 12:01:0Ю (аллели с одинаковой нуклеотидной последовательностью антигенсвязывающего сайта) или 12:01Р (аллели, кодирующие одинаковую аминокислотную последовательность антигенсвязывающего сайта). Кроме того, на уровне высокого разрешения был выявлен вариант йЯБ1*15:02/15:140/15:149, включающий три экспрессирующихся аллеля с одинаковой нуклео-тидной последовательностью антигенсвязывающего сайта. Частота 3 аллелей гена ИЬА-йЯБ1 превышала
Таблица 3. Наиболее распространенные аллели генов локусов НИА-йО и ША-йР (> 0,1 %)
Аллели гена Аллели гена Аллели гена Аллели гена
Н1.А-йОА1 Частота, % Н.А-йОВ1 Частота, % Н1.А-йРА1 Частота, % Н1.А-йРВ1 Частота, %
DQA1*01:02 19,2 DQB1*03:01P 20,1 DPA1*01:03P 85,3 DPB1*04:01P 41,4
DQA1*05:05 17,3 DQB1*05:01P 13,6 DPA1*02:01P 11,2 DPB1*04:02P 15,5
DQA1*02:01P 14,4 DQB1*06:02 11,3 DPA1*02:02 1,0 DPB1*02:01P 14,4
DQA1*01:01 12,5 DQB1*02:02 10,7 DPA1*01:04 0,9 DPB1*03:01P 10,9
DQA1*01:03P 8,5 DQB1*02:01:01G 8,3 DPA1*02:07 0,6 DPB1*01:01P 3,0
DQA1*05:01P 8,3 DQB1*03:02P 7,6 DPA1*02:06 0,4 DPB1*13:01P 2,0
DQA1*03:01P 7,3 DQB1*06:03 7,1 DPB1*17:01P 1,9
DQA1*04:01 3,1 DQB1*03:03 5,5 DPB1*06:01P 1,5
DQA1*03:03 3,1 DQB1*05:02P 4,8 DPB1*05:01P 1,4
DQA1*01:04 1,7 DQB1*04:02 3,6 DPB1*23:01P 1,3
DQA1*03:02 1,6 DQB1*06:04 1,9 DPB1*14:01P 1,1
DQA1*05:03 1,6 DQB1*06:01P 1,6 DPB1*10:01P 1,1
DQA1*01:05 0,9 DQB1*05:03 1,6 DPB1*15:01P 1,0
DQA1*06:01 0,4 DQB1*03:04 0,6 DPB1*09:01P 0,8
DQA1*04:02 0,3 DQB1*06:09 0,5 DPB1*11:01P 0,7
DQA1*05:09 0,3 DQB1*05:04 0,2 DPB1*19:01P 0,3
DQB1*03:05 0,1 DPB1*02:02 0,2
DPB1*16:01P 0,2
DPB1*36:01 0,1
10 %: DRB1 *07:01 — 14,4 %, DRB1*15:01 — 12,2 %, DRB1*01:01 —11,26 %.
Аллели генов HLA-DRB3/4/5 установлены на уровне или двухпольных значений, или высокого разрешения. Гены DRB3/4/5 чаще отсутствовали в HLA-гаплотипах, чем присутствовали. Наиболее распространенными с частотой более 10 % были аллели DRB3*02:02P (19,2 %), DRB3*01:01P (15,4 %), DRB4*01:03 (19,1 %) и DRB5*01:01P (12,2 %).
Следует отметить высокую распространенность нулевого аллеля DRB4*01:03:01:02N, который присутствовал в 3,8 % HLA-гаплотипов. Его появление связано с мутацией в месте сплайсинга перед эк-зоном 2, приводящей к делеции 17 пар нуклеотидов, сдвигу рамки считывания и образованию стоп-кодона [16]. Этот аллель относится к C (common) — распространенным [19]. Три раза (0,04 %) был установлен нулевой аллель DRB5*01:10N. Он характеризуется делецией в экзоне 2, приводящей к сдвигу рамки считывания и образованию стоп-кодона [16]. Этот аллель относится к WD [17].
Аллели локусов HLA-DQ и HLA-DP были раскрыты на уровне или двухпольных значений, или высокого разрешения. Аллели гена HLA-DPB1 представлены на уровне Р-группы. Установлено 23 аллеля гена HLA-DQA1, 30 — гена HLA-DQB1, 14 — гена HLA-DPA1 и 33 — гена HLA-DPB1. Наиболее распространенные аллели представлены в табл. 3. Частота 4 аллелей HLA-DQA1 (DQA1*01:02, DQA1*05:05, DQA1*02:01P, DQA1*01:01), 4 аллелей HLA-DQB1 (DQB1*03:01P, DQB1*05:01P, DQB1*06:02, DQB1*02:02), 2 аллелей HLA-DPA1 (DPA1*01:03P, DPA1*02:01P) и 4 аллелей HLA-DPB1 (DPB1*04:01P, DPB1*04:02P, DPB1*02:01P, DPB1*03:01P) превышала 10 %.
Выявлен новый аллель гена HLA-DQA1, отличающийся от HLA-DQA1*05:05:01:18 заменой в экзоне 2 (E2-3941), GAG->AAG, приводящей к замене аминокис-
лоты Glu->Lys, которому 31.03.2022 г. присвоено имя DQA1*05:51.
Таким образом, уровень разрешения при типи-ровании HLA-генов II класса у исследованных нами доноров варьировал от высокого (специфичной аминокислотной последовательности антигенсвязы-вающего сайта) до двухпольного (специфичной аминокислотной последовательности соответствующей полипептидной цепи HLA-молекул). Были установлены нулевые аллели HLA-генов II класса, у 1 донора определен новый аллель гена HLA-DQA1.
HLA-гаплотипы A-B-C-DRB1-DQA1-DQB1-DPA1-DPB1 были определены с помощью программы Arlequin 3.5 методом максимального правдоподобия с использованием алгоритма максимизации ожидания результатов при неизвестной гаметной фазе, что не позволило включить в исследование непостоянно присутствующие в HLA-гаплотипах гены DRB3/4/5. Установлено 3289 различных HLA-гаплотипов A-B-C-DRB1-DQA1-DQB1-DPA1-DPB1. Первые по распространенности 20 HLA-гаплотипов представлены в табл. 4. Частота 6 HLA-гаплотипов превышала 1 %. Наиболее распространенным HLA-гаплотипом был A*03:01-B*07:02-C*07:02-DRB1*15:01-DQA1*01:02-DQB1*06:02P-DPA1*01:03P-DPB1*04:01P (2,3 %). Однако совокупная частота HLA-гаплотипов A*01:01-B*08:01-C*07:01-DRB1*03:01-DQA1*05:01P-DQB1*02:01-DPA1*01:03P-DP-B1*04:01P и A*01:01-B*08:01-C*07:01-DRB1*03:01-DQA-1*05:01P-DQB1*02:01-DPA1*02:01P-DPB1*01:01P была выше (3,5 %), т. к. шестигенный HLA-гаплотип A*01:01-B*08:01-C*0 7:01 -DRB1 *03:01-D QA1 *05:01P-D QB1 *02:01 встречался с двумя распространенными вариантами локуса генов HLA-DP: DPA1*01:03P-DPB1*04:01P и DPA1*02:01P-DPB1*01:01P.
Наиболее распространенный DPB1-аллель входит в состав большинства установленных гаплотипов DPB1*04:01P. К HLA-гаплотипам, имеющим иной
Таблица 4. Наиболее распространенные Н1_А-гаплотипы генов А-В-С-йРВ1-йОА1-йОВ1-йРА1-йРВ1
A*24:02-B*13:02-C*06:02-DRB1*07:01-DQA1*02:01P- 0,3
DQB1*02:02-DPA1*02:01-DPB1*17:01P
аллель гена БРВ1, нежели БРВ1*04:01Р, помимо вышеупомянутого А*01:01-В*08:01-С*07:01^В1*03:01-DQA1*05:01P-DQB1*02:01-DPA1*02:01P-DPB1*01:01P относилось еще 6 гаплотипов из перечисленных в табл. 4. Среди них HLA-гаплотип А*03:01-В*35:01-C*04:01-DRB1*01:01-DQA1*01:01-DQB1*05:01P-0РА1*01:03Р-йРВ1*04:02Р — пятый по распространенности у исследованных нами доноров. HLA-гаплотип A*11:01-B*35:01-C*04:01-DRB1*01:01-DQA1*01:01-DQB1*05:01P-DPA1*01:03P-DPB1*04:02P (шестнадцатый по распространенности) отличался от предыдущего иным аллелем гена ИЬА-А. В состав этого HLA-гаплотипа также входит аллель БРВ1*04:02Р, что свидетельствует о возможном неравновесном сцеплении блока В*35:01-С*04:01 (0-блок генов HLA-гаплотипов) с аллелем БРВ1*04:02Р (е-блок генов HLA-гаплотипов) [19]. Для локуса ИЬА-йР характерно отсутствие или слабое сцепление с другими ИЬА-генами из-за горячей точки рекомбинации между ним и остальным комплексом ИЬА-генов [20].
ОБСУЖДЕНИЕ
Итак, впервые в России в ФГБУ «НМИЦ гематологии» Минздрава России создана база данных потенциальных доноров КМ/ГСК, типированных по 11 классическим полиморфным ИЬА-генам, что соответствует рекомендациям CIBMTR по оптимальному HLA-типи-рованию при аллоТГСК [5]. Рекомендуемая CIBMTR степень разрешения для оптимального HLA-типи-рования — на уровне двухпольных значений, т. е. выявления специфичной аминокислотной последовательности соответствующей полипептидной цепи HLA-молекулы. В настоящем исследовании уровень разрешения типирования ИЬА-генов I класса превышал эти требования и соответствовал 4-му полю. По номенклатуре ИЬА-аллелей типирование на уровне 3-го поля свидетельствует о присутствии синонимичных замен (не приводящих к замене аминокислоты в синтезируемом белке), а типирование на уровне 4-го поля — о нуклеотидной замене в некодирующей области (ин-троне или UTR) [13]. Следовательно, функциональное значение имеет именно типирование на уровне 2-го поля. При этом результаты типирования на уровне 3-го и 4-го полей могут быть легко редуцированы до 2-го поля. Для аллелей ИЬА-генов II класса степень разрешения варьировала от Р- и G-групп до 4-го поля. Однако даже типирование на уровне Р- и G-групп соответствует критерию типирования с высоким уровнем разрешения (идентификация ИЬА-аллелей, которые кодируют одинаковую аминокислотную последовательность внутри антигенсвязывающего сайта, а также исключение аллелей, которые не экспрессиру-ются на клеточной поверхности — нулевых аллелей). Результат на уровне Р- или G-групп с исключением нулевых аллелей по ИЬА-генам -А, -В, -С, -йЯВ1, -БРВ1 соответствует минимальным требованиям при аллоТГСК по рекомендациям CIBMTR [5].
Хотя гены ИЬА-йЯВ3/4/5 характеризуются низкой экспрессией [21], они определяются серологическими методами как соответственно антигены HLA-DR52, -DR53 и -DR51 [13]. Продукты этих генов могут служить мишенями для донор-специфических анти-HLA-антител [22]. Несоответствие по генам ИЬА-йЯВ3/4/5 встречается у 12,5-17,8 % пар донор-реципиент при неродственной аллоТГСК [23]. Несовместимость по ИЬА-йЯВ3/4/5 коррелирует с увеличением риска развития острой реакции «трансплантат против хозяина» при совместимой по генам ИЬА-А, -В, -С, ^В1, ^В1 аллоТГСК от неродственного донора [24] и ухудшением общей выживаемости реципиентов [21, 24]. Отрицательное влияние на результаты аллоТГСК при неродственных аллоТГСК недопустимого несоответствия по гену ИЬА-БРВ1 между реципиентом и донором отмечается во многих исследованиях [8-10]. Напротив, при гаплоидентичных ТГСК недопустимое несоответствие по ИЬА-БРВ1 по направлению «трансплантат против хозяина» сопровождается улучшением показателей общей выживаемости [11]. Следовательно, оптимальное типирование при аллоТГСК должно проводиться по всем 11 классическим полиморфным генам ИЬА.
В проведенном нами исследовании были выявлены нулевые ИЬА-аллели. Некоторые из них были опреде-
ИЬД-гаплотип Частота, %
A*03:01-B*07:02-C*07:02-DRB1*15:01-DQA1*01:02-DQB1*06:02P-DPA1*01:03P-DPB1*04:01P 2,3
A*01:01-B*08:01-C*07:01-DRB1*03:01-DQA1*05:01P-DQB1*02:01-DPA1*01:03P-DPB1*04:01P 2,1
A*02:01-B*13:02-C*06:02-DRB1*07:01-DQA1*02:01P-DQB1*02:02-DPA1*01:03P-DPB1*04:01P 1,4
A*01:01-B*08:01-C*07:01-DRB1*03:01-DQA1*05:01P- 1,3
DQB1*02:01-DPA1*02:01P-DPB1*01:01P
A*03:01-B*35:01-C*04:01-DRB1*01:01-DQA1*01:01-DQB1*05:01P-DPA1*01:03P-DPB1*04:02P 1,3
A*02:01-B*07:02-C*07:02-DRB1*15:01-DQA1*01:02-DQB1*06:02P-DPA1*01:03P-DPB1*04:01P 1,2
A*01:01-B*57:01-C*06:02-DRB1*07:01-DQA1*02:01P-DQB1*03:03-DPA1*01:03P-DPB1*04:01P 0,7
A*33:01-B*14:02-C*08:02-DRB1*01:02-DQA1*01:01- 0,7
DQB1*05:01P-DPA1*01:03P-DPB1*04:01P
A*02:01-B*15:01-C*03:04-DRB1*04:01-DQA1*03:01P-DQB1*03:02P-DPA1*01:03P-DPB1*04:01P 0,6
A*24:02-B*07:02-C*07:02-DRB1*15:01-DQA1*01:02-DQB1*06:02P-DPA1*01:03P-DPB1*04:01P 0,6
A*30:01-B*13:02-C*06:02-DRB1*07:01-DQA1*02:01P-DQB1*02:02-DPA1*01:03P-DPB1*04:01P 0,5
A*03:01-B*35:01-C*04:01-DRB1*01:01-DQA1*01:01- 0,5
DQB1*05:01P-DPA1*01:03P-DPB1*04:01P
A*25:01-B*18:01-C*12:03-DRB1*15:01-DQA1*01:02-DQB1*06:02P-DPA1*01:03P-DPB1*23:01P 0,5
A*02:01-B*44:27-C*07:04-DRB1*16:01-DQA1*01:02-DQB1*05:02P-DPA1*01:03P-DPB1*04:01P 0,4
A*25:01-B*18:01-C*12:03-DRB1*15:01-DQA1*01:02-DQB1*06:02P-DPA1*01:03P-DPB1*04:01P 0,4
A*11:01-B*35:01-C*04:01-DRB1*01:01-DQA1*01:01- 0,4
DQB1*05:01P-DPA1*01:03P-DPB1*04:02P
A*02:01-B*18:01-C*07:01-DRB1*11:04-DQA1*05:05-DQB1*03:01P-DPA1*01:03P-DPB1*04:02P 0,4
A*02:01-B*57:01-C*06:02-DRB1*07:01-DQA1*02:01P-DQB1*03:03-DPA1*01:03-DPB1*04:01P 0,4
A*02:01-B*07:02-C*07:02-DRB1*15:01-DQA1*01:02-DQB1*06:02P-DPA1*01:03P-DPB1*02:01P 0,3
лены несколько раз и относились к распространенным и хорошо документированным аллелям. Это свидетельствует о том, что присутствие в популяции нулевых HLA-аллелей — явление нередкое. Невыявление нулевых аллелей при аллоТГСК чревато развитием алло-иммунных реакций и угрожающих жизни осложнений, поэтому их определение является обязательным.
Анализ распределения аллелей HLA-генов показал, что частота и распределение аллелей HLA-A, -Б,', -С, -ОЯВ1, ^Б3/4/5, -DQA1, -DQB1 соответствовали полученным ранее данным у популяций с преобладанием этнических русских [25, 26], а также европейского происхождения в целом [27]. Частота и распределение аллелей локуса HLA-DP, ранее не исследованные у российских популяций, соответствуют таковым у североевропейских популяций [28] и американцев европейского происхождения [27, 29].
Среди мультилокусных HLA-гаплотипов А-Б-С-DRB1-DQA1-DQB1-DPA1-DPB1 у исследованных нами доноров наиболее распространенным был А*03:01-B*07:02-C*07:02-DRB1*15:01-DQA1*01:02-DQB1*06:02P-DPA1*01:03P-DPБ1*04:01P. В этот НЬА-гаплотип, как и большинство других, входит аллель DPБ1*04:01P. Однако были выявлены распространенные мультилокусные HLA-гаплотипы, для которых характерны иные аллели локуса НЬА^. Это A*01:01-B*08:01-C*07:01-DRB1*03:01-DQA1*05:01P-DQB1*02:01-DPA1*02:01P-DPB1*01:01P; его распространенность отмечена и в других европейских популяциях [30, 31]. В отсутствие аллелей локуса НЬА^ гаплотип A*01:01-B*08:01-C*07:01-DRB1*03:01-DQA1*05:01P-DQB1*02:01 был наиболее распространенным у исследованных доноров, как и у большинства популяций европейского происхождения [27]. Пятый по распространенности у наших доноров HLA-гаплотип A*03:01-B*35:01-C*04:01-DRB1*01:01-DQA1*01:01-DQB1*05:01P-DPA1*01:03P-DPB1*04:02P является первым по распространенности у финнов [32]. Для этого гаплотипа характерно присутствие HLA-DPБ1*04:02P. Аллели HLA-DPA1*01:03P-DPБ1*23:01P присущи гапло-типу A*25:01-B*18:01-C*12:03-DRB1*15:01-DQA1*01:02-DQB1*06:02P-DPA1*01:03P-DPB1*23:01P, их связь с DRБ1*15:01 выявлена у американцев европейского происхождения [31]. В целом частота и распределение мультилокусных HLA-гаплотипов у доноров из базы данных ФГБУ «НМИЦ гематологии» Минздрава России соответствуют популяциям европейского происхождения [27, 33].
Итак, HLA-типирование и выбор донора с учетом всех 11 классических полиморфных ЩА-генов будут способствовать улучшению результатов неродственных и гаплоидентичных аллоТГСК. Полученные в результате проведенного исследования знания о частоте и распределении аллелей 11 классических ЩА-генов и мультилокусных HLA-гаплотипов имеют важное значение для прогнозирования соответствия реципиента и донора при аллоТГСК и облегчают выбор подходящих доноров [34, 35].
ВЫВОДЫ
1. Впервые в России в ФГБУ «НМИЦ гематологии» Минздрава РФ создана база данных потенци-
альных доноров КМ/ГСК, типированных по 11 классическим полиморфным генам ^А-А, -Б, -С, -DRB1, -DRB3/4/5, ^А1, -DQB1, ^РА1, -DPB1 с уровнем разрешения, превышающим или соответствующим высокому разрешению. Это отвечает рекомендациям CIBMTR по HLA-типированию при трансплантации аллогенного КМ/ГСК.
2. Частота и распределение аллелей ЖА-генов -А, -B, -С, -DRB1, -DRB3/4/5, ^А1, -DQB1 у доноров из базы данных ФГБУ «НМИЦ гематологии» Минздрава России соответствуют таковым в популяциях с преобладанием этнических русских, а также в популяциях европейского происхождения в целом. Частота и распределение аллелей ранее не исследованных в России генов HLA-DPA1, -DPБ1 и мультилокусных HLA-гаплотипов A-Б-C-DRБ1-DQA1-DQB1-DPA1-DPB1 соответствуют таковым у европейцев и американцев европейского происхождения.
3. HLA-типирование и выбор донора с учетом всех 11 классических полиморфных ЩА-генов (-А, -Б, -С, -DRB1, -DRB3/4/5, ^А1, -DQB1, ^РА1, ^Б1) будут способствовать улучшению результатов неродственных и гаплоидентичных аллоТГСК.
КОНФЛИКТЫ ИНТЕРЕСОВ
Авторы заявляют об отсутствии конфликтов интересов.
ИСТОЧНИКИ ФИНАНСИРОВАНИЯ
Исследование не имело спонсорской поддержки.
ВКЛАД АВТОРОВ
Концепция и дизайн: Е.Г. Хамаганова.
Сбор и обработка данных: С.П. Хижинский, А.Р. Абдра-
химова, Е.П. Кузьминова, Е.А. Леонов.
Предоставление материалов исследования: Т.В. Га-
понова.
Анализ и интерпретация данных: Е.Г. Хамаганова. Подготовка рукописи: Е.Г. Хамаганова. Окончательное одобрение рукописи: все авторы.
БЛАГОДАРНОСТИ
Авторы выражают благодарность сотрудникам группы рекрутинга доноров Управления развития донорства крови и гемопоэтических стволовых клеток ФГБУ «НМИЦ гематологии» Минздрава России.
ЛИТЕРАТУРА/REFERENCES
1. Протоколы трансплантации аллогенных гемопоэтических стволовых клеток. Под ред. В.Г. Савченко. М.: Практика, 2020. 320 с.
[Savchenko VG, ed. Protokoly transplantatsii allogennykh gemopoeticheskikh stvolovykh kletok. (Allogeneic hematopoietic stem cell transplantation protocols.) Moscow: Praktika Publ.; 2020. 320 p. (In Russ)]
2. Standards for Histocompatibility and Immunogenetics Testing. Version B.C. [Internet] Available from: https://efi-web.org/committees/standards-committee (accessed CB.C6.2C23).
3. Приказ Министерства здравоохранения Российской Федерации № 519-н от 29.C7.2C22 г. «Об утверждении Порядка проведения медицинского обследования донора, давшего письменное информированное добровольное согласие на изъятие своих органов и (или) тканей для трансплантации». М., 2C22.
[Decree No. 519-n of the Ministry of Health of the Russian Federation dated July 29, 2C22, On the approval of the Procedure of conducting a medical examination of a donor who has given written informed voluntary consent to the removal of his organs and/or tissues for transplantation. Moscow; 2C22. (In Russ)]
4. Организация работы «типирующей лаборатории» в Федеральном регистре доноров костного мозга и гемопоэтических стволовых клеток, донорского костного мозга и гемопоэтических стволовых клеток, реципиентов костного мозга и гемопоэтических стволовых клеток: методические рекомендации ФМБА России. M., 2C22. 6 с.
["Typing laboratory" management in the Federal Registry of Bone Marrow and Hematopoietic Stem Cell Donors, Donor Bone Marrow and Hematopoietic Stem Cells, Bone Marrow and Hematopoietic Stem Cell Recipients: methodological guidelines of the FMBA of Russia. Moscow; 2C22. 6 p. (In Russ)]
Б. Yu N, Askar M, Wadsworth K, et al. Current donor selection strategies for al-logeneic hematopoietic cell transplantation. Hum Immunol. 2C22;B3(1C):665-73. doi: 1C.1C16/j.humimm.2C22.C4.CCB.
6. Timofeeva OA, Philogene MC, Zhang QJ. Current donor selection strategies for allogeneic hematopoietic cell transplantation. Hum Immunol. 2C22;B3(1C):674-B6. doi: 1C.1C16/j.humimm.2C22.CB.CC7.
7. Хамаганова Е.Г., Дроков М.Ю., Хижинский С.П. и др. Антитела к антигенам лейкоцитов (HLA) у больных с запланированной трансплантацией аллогенных гемопоэтических стволовых клеток. Трансфузиология. 2C22;23(2):156-69.
[Khamaganova EG, Drokov MYu, Khizhinskii SP, et al. Antibodies to human leukocyte antigens (HLA) in patients with planned transplantation of allogeneic hematopoietic stem cells. Transfuziologiya. 2C22;23(2):156-69. (In Russ)]
5. Fleischhauer K, Shaw BE, Gooley T, et al. International Histocompatibility Working Group in Hematopoietic Cell Transplantation. Effect of T-cell-epitope matching at HLA-DPB1 in recipients of unrelated-donor haemopoietic-cell transplantation: a retrospective study. Lancet Oncol. 2C12;13(4):366-74. doi: 1C.1C16/ S147C-2C45(12)7CCC4-9.
9. Pidala J, Lee SJ, Ahn KW, et al. Nonpermissive HLA-DPB1 mismatch increases mortality after myeloablative unrelated allogeneic hematopoietic cell transplantation. Blood. 2C14;124(16):2596-6C6. doi: 1C.11B2/blood-2C14-C5-576C41.
1G. Fleischhauer K, Shaw BE. HLA-DP in unrelated hematopoietic cell transplantation revisited: challenges and opportunities. Blood. 2C17;13C(9):1CB9-96. doi: 1C.11B2/blood-2C17-C3-742346.
11. Fuchs EJ, McCurdy SR, Solomon SR, et al. HLA informs risk predictions after haploidentical stem cell transplantation with posttransplantation cyclophospha-mide. Blood. 2C22;139(1C):1452-6B. doi: 1C.11B2/blood.2C21C13443.
12. Nunes E, Heslop H, Fernandez-Vina M, et al. Definitions of histocompatibility typing terms: Harmonization of Histocompatibility Typing Terms Working Group. Hum Immunol. 2C11;72(12):1C14-16. doi: 1C.1C16/j.humimm.2C11.C6.CC2.
13. Nomenclature for Factors of the HLA System. [Internet] Available from: http://hla.alleles.org/nomenclature/naming.html (accessed CB.C6.2C23).
14. QIAamp DNA Mini and Blood Mini Handbook. 5th edition. [Internet] Available from: https://www.qiagen.com/cn/resources/download.aspx?id=62a2CCd6-faf4-469b-b5Cf-2b59cf73B962&lang=en (accessed CB.C6.2C23).
1Б. Excoffier L, Lischer H. Arlequin suite ver 3.5: a new series of programs to perform population genetics analyses under Linux and Windows. Mol Ecol Resour. 2C1C;1C(3):564-7. doi: 1C.1111/j.1755-C99B.2C1C.C2B47.x.
16. Null and Alternatively Expressed Alleles. [Internet] Available from: https:// hla.alleles.org/alleles/nulls.html (accessed CB.C6.2C23).
17. Hurley CK, Kempenich J, Wadsworth K, et al. Common, intermediate and well-documented HLA alleles in world populations: CIWD version 3.C.C. HLA. 2C2C;95(6):1-16. doi: 1C.1111/tan.13B11.
18. IMGT/HLA. Release Documentation. [Internet] Available from: https://www. ebi.ac.uk/ipd/imgt/hla/release/ (accessed 08.06.2023).
19. Dawkins RL, Lloyd SS. MHC Genomics and Disease: Looking Back to Go Forward. Cells. 2019;8(9):1-10. doi: 10.3390/cells8090944.
20. Kauppi L, Stumpf MP, Jeffreys AJ. Localized breakdown in linkage disequilibrium does not always predict sperm crossover hot spots in the human MHC class II region. Genomics. 2005;86(1):13-24. doi: 10.1016/j.ygeno.2005.03.011.
21. Fernandez-Vina MA, Klein JP, Haagenson M, et al. Multiple mismatches at the low expression HLA loci DP, DQ, and DRB3/4/5 associate with adverse outcomes in hematopoietic stem cell transplantation. Blood. 2013;121(22):4603-10. doi: 10.1182/blood-2013-02-481945.
22. Yamamoto H, Uchida N, Naofumi MN, et al. Anti-HLA Antibodies Other than Against HLA-A, -B, -DRB1 Adversely Affect Engraftment and Nonrelapse Mortality in HLA-Mismatched Single Cord Blood Transplantation: Possible Implications of Unrecognized Donor-specific Antibodies. Biol Blood Marrow Transplant. 2014;20(10):1634-40. doi: 10.1016/j.bbmt.2014.06.024.
23. Tsamadou C, Engelhardt D, Platzbecker U, et al. HLA-DRB3/4/5 Matching Improves Outcome of Unrelated Hematopoietic Stem Cell Transplantation. Front Immunol. 2021;12:771449. doi: 10.3389/fimmu.2021.771449.
24. Ducreux S, Dubois V, Amokrane K, et al. HLA-DRB3/4/5 mismatches are associated with increased risk of acute GVHD in 10/10 matched unrelated donor hematopoietic cell transplantation. Am J Hematol. 2018;93(8):994-1001. doi: 10.1002/ajh.25133.
25. Хамаганова Е.Г., Леонов Е.А., Абдрахимова А.Р. и др. HLA-генетическое разнообразие русской популяции, выявленное методом секвенирования следующего поколения. Медицинская иммунология. 2021;23(3):509-22. doi: 10.15789/1563-0625-HDI-2182.
[Khamaganova EG, Leonov EA, Abdrakhimova AR, et al. HLA diversity in the Russian population assessed by next generation sequencing. Medical Immunology. 2021;23(3):509-22. doi: 10.15789/1563-0625-HDI-2182. (In Russ)]
26. Smirnova D, Loginova M, Druzhinina S, et al. Distributions of HLA-A, -B, -C, -DRB1 and -DQB1 alleles typed by next generation sequencing in Russian volunteer donors. HLA. 2023;101(6):623-33. doi: 10.1111/tan.15007.
27. Creary LE, Gangavarapu S, Mallempati KC, et al. Next-generation sequencing reveals new information about HLA allele and haplotype diversity in a large European American population. Hum Immunol. 2019;80(10):807-22. doi: 10.1016/j.humimm.2019.07.27.
28. Begovich AB, Moonsamy PV, Mack SJ, et al. Genetic variability and linkage disequilibrium within the HLA-DP region: analysis of 15 different populations. Tissue Antigens. 2001;57(5):424-39. doi: 10.1034/j.1399-0039.2001.057005424.x.
29. Hollenbach JA, Madbouly A, Gragert L, et al. A combined DPA1~DPB1 amino acid epitope is the primary unit of selection on the HLA-DP heterodimer. Immuno-genetics. 2012;64(8):559-69. doi: 10.1007/s00251-012-0615-3.
30. Grundschober C, Sanchez-Mazas A, Excoffier L, et al. HLA-DPB1 DNA polymorphism in the Swiss population: linkage disequilibrium with other HLA loci and population genetic affinities. Eur J Immunogenet. 1994;21(3):143-57. doi: 10.1111/j.1744-313x.1994.tb00186.x.
31. Scibola CF, Akers NK, Conde L, et al. Multi-locus HLA class I and II allele and haplotype associations with follicular lymphoma. Tissue Antigens. 2012;79(4):279-86. doi: 10.1111/j.1399-0039.2012.01845.
32. Linjama T, Rather C, Ritari J, et al. Extended HLA Haplotypes and Their Impact on DPB1 Matching of Unrelated Hematologic Stem Cell Transplant Donors. Biol Blood Marrow Transplant. 2019;25(10):1956-64. doi: 10.1016/j. bbmt.2019.07.008.
33. Allele Frequency Net Database. [Internet] Available from: http://www. allelefrequencies.net/. (accessed 08.06.2023).
34. Gragert L, Eapen M, Williams E, et al. HLA match likelihoods for hematopoietic stem-cell grafts in the U.S. registry. N Engl J Med. 2014;371(4):339-48. doi: 10.1056/NEJMsa1311707.
35. Dehn J, Setterholm M, Buck K, et al. HapLogic: A Predictive Human Leukocyte Antigen-Matching Algorithm to Enhance Rapid Identification of the Optimal Unrelated Hematopoietic Stem Cell Sources for Transplantation. Biol Blood Marrow Transplant. 2016;22(11):2038-46. doi: 10.1016/j.bbmt.2016.07.022.
