Научная статья на тему 'ОПРЕДЕЛЕНИЕ МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКОГО ПРОФИЛЯ У ВЗРОСЛЫХ БОЛЬНЫХ ОСТРЫМИ МИЕЛОИДНЫМИ ЛЕЙКОЗАМИ МЕТОДОМ СЕКВЕНИРОВАНИЯ НОВОГО ПОКОЛЕНИЯ'

ОПРЕДЕЛЕНИЕ МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКОГО ПРОФИЛЯ У ВЗРОСЛЫХ БОЛЬНЫХ ОСТРЫМИ МИЕЛОИДНЫМИ ЛЕЙКОЗАМИ МЕТОДОМ СЕКВЕНИРОВАНИЯ НОВОГО ПОКОЛЕНИЯ Текст научной статьи по специальности «Клиническая медицина»

CC BY
137
28
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
Журнал
Гематология и трансфузиология
WOS
Scopus
ВАК
CAS
RSCI
PubMed
Область наук
Ключевые слова
ОСТРЫЙ МИЕЛОИДНЫЙ ЛЕЙКОЗ / СЕКВЕНИРОВАНИЕ НОВОГО ПОКОЛЕНИЯ / МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИЙ ПРОФИЛЬ / ACUTE MYELOID LEUKAEMIA / NEXT-GENERATION SEQUENCING / MOLECULAR GENETIC PROFILING

Аннотация научной статьи по клинической медицине, автор научной работы — Кашлакова А.И., Паровичникова Е.Н., Бидерман Б.В., Сидорова Ю.В., Чабаева Ю.А.

Введение. У больных острыми миелоидными лейкозами (ОМЛ) выявляются множественные драйверные мутации. Прогностическая значимость выявляемых мутаций в настоящее время до конца не изучена.Цель: оценить частоту мутаций различных генов и их влияние на прогноз заболевания у взрослых больных ОМЛ.Материалы и методы. В исследование включены 90 взрослых больных с впервые установленным диагнозом ОМЛ, из них 76 больных моложе 60 лет и 14 больных в возрасте от 60 лет и старше. В качестве индукции ремиссии у больных моложе 60 лет использовали программу химиотерапии (ХТ) «7+3», у больных старшей возрастной группы различные программы низкодозной ХТ с гипометилирующими агентами. Определение молекулярно-генетического статуса больных проводилось с использованием метода секвенирования нового поколения; авторская панель содержала гены ASXL1, BCOR, DNMT3, FLT3, IDH1, IDH2, PIGA, RUNX1, SETBP1, SF3B1, SRSF2, TET2, TP53 и U2AF2.Результаты. Нуклеотидные замены были обнаружены в генах DNMT3, TET2, TP53, SETBP1, BCOR, RUNX1, IDH2, IDH1, FLT3, U2AF2, SF3B1 у 57,8 % больных (n = 52), при этом у 17,8 % больных (n = 16) были выявлены сочетанные мутации в двух или трех генах. Эффективность лечения и долгосрочные результаты терапии оценивали в зависимости от возраста, группы риска по ELN 2017 и наличия мутаций в генах TP53, RUNX1, IDH1, IDH2 и DNMT3. При оценке долгосрочных результатов терапии были выявлены достоверные различия в общей выживаемости (ОВ) в зависимости от наличия мутаций генов TP53 и RUNX1: у больных с мутациями TP53 ОВ составила 30 %, у больных без мутаций 53,4 % (p = 0,0037). Схожие результаты были получены для мутаций гена RUNX1 - у больных с мутациями ОВ составила 20 %, в то время как у больных без - 54 % (p = 0,0466).Заключение. При диагностике ОМЛ определяют мутации в генах FLT3-ITD, NPM1 и CEBPA, однако генетическая гетерогенность группы больных ОМЛ диктует необходимость детального изучения их молекулярно-генетического статуса, что необходимо для уточнения прогноза заболевания и выбора оптимальной тактики терапии.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по клинической медицине , автор научной работы — Кашлакова А.И., Паровичникова Е.Н., Бидерман Б.В., Сидорова Ю.В., Чабаева Ю.А.

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

NEXT-GENERATION SEQUENCING-BASED MOLECULAR GENETIC PROFILING IN ADULTS WITH ACUTE MYELOID LEUKAEMIA

Introduction. Acute myeloid leukaemia (AML) is associated with multiple driver mutations, which prognostic value remains understudied.Aim. Assessment of the frequency of mutations in various genes and their impact on acute myeloid leukaemia outcome in adults.Materials and methods. The study included 90 adult patients with newly diagnosed AML; 76 were aged under 60, 14 were 60 and more years old. Patients under 60 had chemotherapy (CT) “7+3” as induction, the elder cohort had variant low-dose CT with hypomethylating agents. The molecular genetic status of patients was determined using next-generation sequencing; the in-house gene panel included ASXL1, BCOR, DNMT3, FLT3, IDH1, IDH2, PIGA, RUNX1, SETBP1, SF3B1, SRSF2, TET2, TP53 and U2AF2.Results. Nucleotide substitutions were identified in genes DNMT3, TET2, TP53, SETBP1, BCOR, RUNX1, IDH2, IDH1, FLT3, U2AF2, SF3B1 in 57.8 % of the patients (n = 52), with 17.8 % (n = 16) having compound mutations in two or three genes. Treatment efficacy and long-term outcomes were assessed against age, ELN-2017 risk groups and mutations in genes TP53, RUNX1, IDH1, IDH2 and DNMT3. In the long term, a reliable variation was revealed in the overall survival (OS) rate with respect to mutations in genes TP53 and RUNX1. Patients with mutant TP53 had 30 % OS, those with the intact gene - 53.4 % (p = 0.0037). Similar results were obtained with RUNX1: mutations marked 20 % OS, intact patients had 54% OS (p = 0.0466).Conclusion. Mutations in genes FLT3-ITD, NPM1 and CEBPA are proxy to AML. However, a more accurate prognosis and optimal choice of therapy require detailed molecular profiling due to genetic heterogeneity of AML patients.

Текст научной работы на тему «ОПРЕДЕЛЕНИЕ МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКОГО ПРОФИЛЯ У ВЗРОСЛЫХ БОЛЬНЫХ ОСТРЫМИ МИЕЛОИДНЫМИ ЛЕЙКОЗАМИ МЕТОДОМ СЕКВЕНИРОВАНИЯ НОВОГО ПОКОЛЕНИЯ»

https://doi.org/10.35754/0234-5730-2020-65-4-444-459 ГЙ]

ОПРЕДЕЛЕНИЕ МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКОГО ПРОФИЛЯ У ВЗРОСЛЫХ БОЛЬНЫХ ОСТРЫМИ МИЕЛОИДНЫМИ ЛЕЙКОЗАМИ МЕТОДОМ СЕКВЕНИРОВАНИЯ НОВОГО ПОКОЛЕНИЯ

Кашлакова А. И*, Паровичникова Е. Н., Бидерман Б. В., Сидорова Ю. В., Чабаева Ю. А., Троицкая В. В., Лукьянова И. А., Кохно А. В., Соколов А. Н., Судариков А. Б., Обухова Т. Н., Савченко В. Г.

ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр гематологии» Министерства здравоохранения Российской Федерации, 125167 Москва, Россия

BY 4.0

Введение. У больных острыми миелоидными лейкозами (ОМЛ) выявляются множественные драйверные мутации. Прогностическая значимость выявляемых мутаций в настоящее время до конца не изучена.

Цель: оценить частоту мутаций различных генов и их влияние на прогноз заболевания у взрослых больных ОМЛ. Материалы и методы. В исследование включены 90 взрослых больных с впервые установленным диагнозом ОМЛ, из них 76 больных моложе 60 лет и 14 больных в возрасте от 60 лет и старше. В качестве индукции ремиссии у больных моложе 60 лет использовали программу химиотерапии (ХТ) «7+3», у больных старшей возрастной группы — различные программы низкодозной ХТ с гипометилирующими агентами. Определение молекулярно-генетического статуса больных проводилось с использованием метода секвенирования нового поколения; авторская панель содержала гены ASXL1, BCOR, DNMT3, FLT3, ЮН1, ЮН2, PIGA, RUNX1, SETBP1, SF3B1, SRSF2, TET2, TP53 и U2AF2. Результаты. Нуклеотидные замены были обнаружены в генах DNMT3, ТЕТ2, ТР53, 5ЕТВР1, BCOR, RUNX1, ЮН2, ЮН1, FLT3, U2AF2, 5F3B1 у 57,8 % больных (п = 52), при этом у 17,8 % больных (п = 16) были выявлены сочетанные мутации в двух или трех генах. Эффективность лечения и долгосрочные результаты терапии оценивали в зависимости от возраста, группы риска по ELN 2017 и наличия мутаций в генах ТР53, RUNX1, ЮН1, ЮН2 и DNMT3. При оценке долгосрочных результатов терапии были выявлены достоверные различия в общей выживаемости (ОВ) в зависимости от наличия мутаций генов ТР53 и RUNX1: у больных с мутациями ТР53 ОВ составила 30 %, у больных без мутаций — 53,4 % (р = 0,0037). Схожие результаты были получены для мутаций гена RUNX1 — у больных с мутациями ОВ составила 20 %, в то время как у больных без — 54 % (р = 0,0466).

Заключение. При диагностике ОМЛ определяют мутации в генах FLT3-ITD, NPM1 и СЕВРА, однако генетическая гетерогенность группы больных ОМЛ диктует необходимость детального изучения их молекулярно-генетического статуса, что необходимо для уточнения прогноза заболевания и выбора оптимальной тактики терапии.

Ключевые слова: острый миелоидный лейкоз, секвенирование нового поколения, молекулярно-генетический профиль Конфликт интересов: авторы заявляют об отсутствии конфликта интересов.

Финансирование: исследование мутаций генов ЮН1/ЮН2 проводилось при финансовой поддержке Селджен Интернэшнл Холдингз Корпорэйшн. Для цитирования: Кашлакова А.И., Паровичникова Е.Н., Бидерман Б.В., Сидорова Ю.В., Чабаева Ю.А., Троицкая В.В., Лукьянова И.А., Кохно А.В., Соколов А.Н., Судариков А.Б., Обухова Т.Н., Савченко В.Г. Определение молекулярно-генетического профиля у взрослых больных острыми миелоидными лейкозами методом секвенирования нового поколения. Гематология и трансфузиология. 2020; 65(4): 444-459. ЬАрз:/Уо1 огд/10.35754/0234-5730-2020-65-4-444-459

Introduction. Acute myeloid leukaemia (AML) is associated with multiple driver mutations, which prognostic value remains understudied.

Aim. Assessment of the frequency of mutations in various genes and their impact on acute myeloid leukaemia outcome in adults.

Materials and methods. The study included 90 adult patients with newly diagnosed AML; 76 were aged under 60, 14 were 60 and more years old. Patients under 60 had chemotherapy (CT) "7+3" as induction, the elder cohort had variant low-dose CT with hypomethylating agents. The molecular genetic status of patients was determined using next-generation sequencing; the in-house gene panel included ASXL1, BCOR, DNMT3, FLT3, IDH1, IDH2, PIGA, RUNX1, SETBP1, SF3B1, SRSF2, TET2, TP53 and U2AF2.

Results. Nucleotide substitutions were identified in genes DNMT3, TET2, TP53, SETBP1, BCOR, RUNX1, IDH2, IDH1, FLT3, U2AF2, SF3B1 in 57.8 % of the patients (n = 52), with 17.8 % (n = 16) having compound mutations in two or three genes. Treatment efficacy and long-term outcomes were assessed against age, ELN-2017 risk groups and mutations in genes TP53, RUNX1, IDH1, IDH2 and DNMT3. In the long term, a reliable variation was revealed in the overall survival (OS) rate with respect to mutations in genes TP53 and RUNX1. Patients with mutant TP53 had 30 % OS, those with the intact gene — 53.4 % (p = 0.0037). Similar results were obtained with RUNX1: mutations marked 20 % OS, intact patients had 54% OS (p = 0.0466). Conclusion. Mutations in genes FLT3-ITD, NPM1 and CEBPA are proxy to AML. However, a more accurate prognosis and optimal choice of therapy require detailed molecular profiling due to genetic heterogeneity of AML patients.

Keywords: acute myeloid leukaemia, next-generation sequencing, molecular genetic profiling Conflict of interest: the authors declare no conflict of interest.

Financial disclosure: IDH1/IDH2 gene mutations were studied with support from the Celgene International Holdings Corporation.

For citation: Kashlakova A.I., Parovichnikova E.N., Biderman B.V., Sidorova Y.V., Chabaeva Y.A., Troitskaya V.V., Lukianova I.A., Kokhno A.V., Sokolov A.N., Sudarikov A.B., Obukhova T.N., Savchenko V.G. Next-generation sequencing-based molecular genetic profiling in adults with acute myeloid leukaemia. Russian Journal of Hematology and Transfusiology (Gematologiya i transfuziologiya). 2020; 65(4): 444-459 (in Russian). https://doi.org/10.35754/0234-5730-2020-65-4-444-459

■ NEXT-GENERATION SEQUENCING-BASED MOLECULAR GENETIC PROFILING IN ADULTS WITH ACUTE MYELOID LEUKAEMIA

Kashlakova A. I.*, Parovichnikova E. N., Biderman B. V., Sidorova Y. V., Chabaeva Y. A., Troitskaya V. V., Lukianova I. A., Kokhno A. V., Sokolov A. N., Sudarikov A. B., Obukhova T. N., Savchenko V. G.

National Research Center for Hematology, 125167 Moscow, Russian Federation ^m ABSTRACT

Введение

В последние годы в клинической практике у больных острыми миелоидными лейкозами (ОМЛ) выполняются молекулярно-генетические исследования. В определении групп риска у больных ОМЛ основополагающими методами являются стандартное цито-генетическое исследование и метод флуоресцентной гибридизации in situ (Fluorescence In Situ Hybridization,

FISH). Изучено влияние на прогноз заболевания таких устойчивых хромосомных аномалий, как t(15;17) (q22;q12); PML-RARA, t(8;21)(q22;q22)/RUNX1-RUNX1T1 и inv(16)(p13q22)/t(16;16)(p13;q22)/CfiFB -MYH11, выделенных в группу благоприятного прогноза, а также -5/(del)5q, -7, -17/abn(17p), inv(3)(q21.3q26.2)/t(3;3) (q21.3;q26.2) и комплексного кариотипа, являющихся,

напротив, факторами неблагоприятного прогноза [1—4]. Однако у 50 % больных при цитогенетическом исследовании определяется нормальный кариотип, и в этом случае они стратифицируются в группу промежуточного риска [1]. Отсутствие у таких больных каких-либо цитогенетических аномалий затрудняет прогнозирование течения заболевания и не позволяет выбрать оптимальную тактику лечения. С появлением новых методов молекулярно-генетического анализа стало возможным рассматривать ОМЛ не только как цитогенетически гетерогенную группу заболеваний, но и как сложную, динамическую систему, характеризующуюся множественными соматическими драйверными мутациями и постоянной эволюцией сосуществующих опухолевых клонов [5]. За последние 20 лет было идентифицировано множество мутаций, ассоциированных с миелоидными новообразованиями, в частности с ОМЛ, и предпринято немало попыток создания классификации ОМЛ, учитывающей как биологическую природу опухоли, так и влияние выявляемых генетических поломок на дальнейший прогноз заболевания. В классификацию ВОЗ 2016 г. была добавлена категория «ОМЛ с генетическими мутациями» (AML with gene mutations), включающая такие варианты заболевания, как ОМЛ с мутацией NPM1, ОМЛ с биаллельной мутацией CEBPA и ОМЛ с мутацией RUNX1 (предварительная категория) [6]. Включение данных мутаций в классификацию ВОЗ обусловлено их частым выявлением у больных ОМЛ (20-45 % для NPM1, 5-10 % для CEBPA, 5-15 %

для RUNX1), доказанной прогностической значимостью (мутации NPM1 и биаллельная мутация CEBPA являются факторами благоприятного прогноза, в то время как мутации RUNX1 — неблагоприятного), а также их специфической ролью в патогенезе опухоли [7-16]. Таким образом, классификация ВОЗ учитывает как биологические, так и клинические особенности ОМЛ с вышеуказанными мутациями.

В клинической практике наибольшим значением обладает молекулярно-генетическая стратификация ОМЛ по группам риска, предложенная в клинических рекомендациях European Leukemia Net (ELN) в 2017 г. В данной классификации учитываются мутации в генах NPM1, CEBPA (биаллельная мутация), а также в генах FLT3-ITD, RUNX1, ASXL1 и TP53 [5]. Мутации в генах RUNX1, ASXL1 и TP53, согласно данным многочисленных исследований, являются факторами неблагоприятного прогноза [17-25], мутации в генах NPM1 и CEBPA-biallelic ассоциированы с благоприятным прогнозом. Что касается мутаций в гене FLT3-ITD, значение имеет не только их наличие, но и уровень аллельного соотношения мутантного типа к «дикому» типу, а также отсутствие или наличие при этом мутации в гене NPM1. Мутации гена FLT3-ITD являются одними из наиболее часто выявляемых мутаций

при ОМЛ, обнаруживаются у 25—30 % больных и ассоциированы с высоким риском развития рецидива [26— 32]. Выявление мутаций FLT3-ITD в настоящее время является одним из важных прогностических маркеров при ОМЛ, так как позволяет не только прогнозировать течение заболевания, но и выбирать терапевтическую тактику с учетом появления нескольких таргетных препаратов.

Однако принятые классификации разработаны с учетом весьма ограниченного количества мутаций. Эти генетические аномалии являются наиболее изученными при ОМЛ и обладают вполне однозначной прогностической значимостью. Тем не менее существуют исследования, свидетельствующие о важности и других мутаций. Поиск новых терапевтических возможностей и прогностических критериев делает актуальным в настоящее время применение полногеномного секвенирования у больных ОМЛ.

В программе TCGA (The Cancer Genome Atlas) исследовательской группой ОМЛ были проведены полногеномное (n = 50) и полноэкзомное (n = 150) секвени-рования 200 случаев de novo ОМЛ и выявлены мутации суммарно в 260 генах; из них 23 гена были мутированы повсеместно, и в 237 генах мутации выявлялись лишь в двух или более случаях. Обнаруженные мутации были разбиты на 9 функциональных классов: мутации в генах, кодирующих нуклеофосмин (NPM1), мутации в генах опухолевой супрессии (TP53), мутации в генах эпигенетической регуляции, или генах, связанных с метилированием ДНК (DNMT3A, TET2, IDH1, IDH2), в генах сигнальных путей (FLT3, SETBP1), в генах, кодирующих факторы транскрипции (RUNX1, CEBPA), в генах-модификаторах хроматина (ASXL1, BCOR), в генах-факторах сплайсинга (SRSF2, SF3B1, U2AF1, U2AF2) и в генах двух других классов (гены, кодирующие белки когезина, и химерные гены) [7]. Роль перечисленных мутаций в лейкемогенезе и их влияние на прогноз заболевания в настоящий момент изучаются. Несмотря на неоднозначность и противоречивость имеющихся данных, некоторые исследователи предлагают выделить дополнительные категории ОМЛ, помимо описанных в классификации ВОЗ 2016 г. E. Papaemmanuil и соавт. [33], проанализировав клинические, цитогенетические и молекулярно-генети-ческие данные 1540 больных ОМЛ, разделили ОМЛ на 11 непересекающихся классов, каждый со своими клиническими характеристиками и прогнозом. Среди новых предложенных категорий — ОМЛ с мутациями в генах-модификаторах хроматина и генах-факторах сплайсинга, ОМЛ с мутациями гена TP53 и/или анеу-плоидией, ОМЛ с мутациями гена IDH2 в кодоне R172. Таким образом, несмотря на прогресс в изучении молекулярной биологии ОМЛ, неясны все патогенетические механизмы и закономерности течения данного заболевания.

Цель настоящего исследования — оценить частоту мутаций различных генов и их влияние на прогноз заболевания у взрослых больных ОМЛ.

Материалы и методы

В биобанке лаборатории молекулярной гематологии ФГБУ «НМИЦ гематологии» Минздрава России накоплен первичный материал (аспират костного мозга, взятый в дебюте заболевания) от взрослых больных с впервые установленным диагнозом ОМЛ, поступивших в Центр в период с 2012 г. по 2019 г. Для решения поставленной задачи были отобраны образцы ДНК от 100 больных, выделенные в период с 2016 г. по 2018 г. Впоследствии 10 больных были исключены из дальнейшего анализа в связи с недостаточным количеством материала для проведения исследования. Таким образом, в исследование были включены 90 больных ОМЛ.

Все больные были разделены на две возрастные группы: моложе 60 лет и от 60 лет и старше. Группу больных моложе 60 лет составили 76 человек (соотношение мужчин и женщин — 23 : 53), группу больных от 60 лет и старше — 14 человек (соотношение мужчин и женщин — 8 : 6). Медиана наблюдения составила 20,9 месяца (0,07—78,3 месяца).

Диагноз ОМЛ у всех больных был установлен на основании исследования общего анализа крови, а также цитологического, цитохимического, иммунофеноти-пического, цитогенетического и молекулярно-гене-тического исследований аспиратов костного мозга. Клинико-лабораторная характеристика больных ОМЛ в зависимости от возраста представлена в таблице 1.

В качестве индукции ремиссии использовали различные программы химиотерапии (ХТ). В группе больных моложе 60 лет у большинства больных применяли программу ХТ по схеме «7+3», предусматривающую непрерывную инфузию цитарабина в дозе 200 мг/м2/сут. в течение 7 дней и введение в течение 3 дней антрациклинового антибиотика (даунорубици-на либо идарубицина). Впоследствии 48,7 % больных (n = 37) из данной возрастной группы была выполнена трансплантация аллогенных гемопоэтических стволовых клеток (алло-ТГСК). В старшей возрастной группе у большинства больных применяли курсы низкодозной химиотерапии с гипометилирующими агентами. Алло-ТГСК этим больным не выполняли. Характеристика применявшихся программ лечения представлена в таблице 2.

Для проведения секвенирования нового поколения использовали технологию таргетного обогащения библиотек фрагментов ДНК HEAT-SEO (Roche Diagnostics, Швейцария). Эта система основана на амплификации таргетных генов с использованием инвертированных молекулярных зондов для детекции различных вариантов исследуемых мишеней. Авторская панель Myelo_set_HEAT была подобрана на основа-

нии литературных данных и содержала гены ASXL1 (экзон 12), BCOR (экзоны 1-14), DNMT3 (экзоны 7-23), FLT3 (экзоны 13-16, 20), IDH1 (экзон 4), IDH2 (экзон 4), NPM1 (экзоны 10-11), PIGA (экзоны 1-5), RUNX1 (экзоны 4-9), SETBP1 (экзон 4), SF3B1 (экзоны 14-16), SRSF2 (экзон 1), TET2 (экзоны 3-11), TP53 (экзоны 4-10), U2AF2 (экзоны 2, 6) [34]. Анализ нуклеотидных последовательностей производили на полногеномном секвенаторе MySeq (Illumina, США) с использованием наборов MiSeq Reagents Kit v2 — 300 cycles (Illumina, США). Фильтрование данных, удаление служебных последовательностей, картирование прочтений, поиск вариантов и удаление повторов осуществляли при помощи утилит FastOC, SAMtools, trimmomatic, hsqutils и bwa. Полученные результаты анализировали с помощью свободного программного обеспечения wANNOVAR [35]. Информация о патогенности мутаций была получена из открытых баз данных COSMIC [36] и DB SNP.

Для определения мутаций генов NPM1, FLT3-ITD и CEBPA были использованы последовательности праймеров, описанные ранее [37, 38]. Чтобы избежать аденилирования (присоединения лишнего аденина) при работе Taq-полимеразы и возникновения эффекта «двойных» пиков при капиллярном электрофорезе, на 5' конце обратных праймеров была помещена нуклеотидная последовательность gtttctt, в соответствии с рекомендациями [39]. Для полимеразной цепной реакции (ПЦР) использовали реактивы ЗАО Синтол, Москва. 20 мкл реакционной смеси содержало: 100-200 нг ДНК, 5 пмоль прямого и обратного праймеров, dNTP (0,25 мМ), 10 х ПЦР-буфер, MgCl2 (2 мМ), DMSO 1,5 мкл, Taq-полимеразу (1,25 ед.). Условия ПЦР: 95° 7 мин, затем 30 циклов — 95° 45 сек, 60° 45 сек, 72° 60 сек, затем окончательная элонгация 72° 5 мин. ПЦР проводили на амплификаторе T100 (Bio-Rad Laboratories, США). Для капиллярного электрофореза и фрагментного анализа ПЦР-продуктов использовали автоматический анализатор нуклеиновых кислот ABI PRISM 3130 Genetic Analyzer (Applied Biosystems, США). Для этого 2 мкл разведенного в 50-250 раз ПЦР-продукта смешивали с 10 мкл Hi-Di формамида (Applied Biosystems, США) и 0,04 мкл GeneScan 500-LIS Size Standard (Applied Biosystems, США). После денатурации при 95 °C в течение 3 минут и последующего охлаждения 10 мкл смеси наносили в лунку 96-луночной плашки и проводили капиллярный электрофорез высокого разрешения на полимере POP-4 (Applied Biosystems, США). Флуоресценция и распределение амплификатов по длине оценивались при помощи компьютерной программы GeneMapper v. 4.0 (Applied Biosystems, США).

Для исследования точечных соматических мутаций генов IDH1 (p.R132H, p.R132C/G/S) и IDH2 (p.R140Q; p.R172K) использовали аллель-специфичную ПЦР

Таблица 1. Клинико-лабораторная характеристика больных в зависимости от возраста Table 1. Clinical and laboratory profile of age cohorts

Возраст, лет Age, years < 60 (n = 76) > 60 (n = 14)

Пол Gender, n (%) • Мужчины / Male • Женщины / Female 23 (30,3) 53 (69,7) 8 (57,1) 6 (42,9)

Группы риска по ELN 2017, n (%) ELN-2017 risk cohorts, n (%)

• Благоприятный • Favourable 18 (23,7) 1 (7,1)

• Промежуточный • Intermediate 37 (48,7) 6 (42,9)

• Неблагоприятный • Unfavourable 21 (276) 7 (50)

Цитогенетические аберрации и данные молекулярного исследования, n (%) Cytogenetic aberrations and molecular evidence, n (%)

> Группа благоприятного риска: ^ Favourable risk cohort

• t(8;21)(q22;q22.1); RUNX1-RUNX1T1 6 (7,9) -

• inv(16)(p13.1q22); CBFB-MYH11 3 (4) -

• Нормальный кариотип + мутация в гене NPM1 • Normal karyotype + NPM1 mutation 9 (11,8) 1 (7,1)

> Группа промежуточного риска: ^ Intermediate risk cohort

• (9;11)(p21.3;q23.3); MLLT3-KMT2A 1 (1,3) -

• Неклассифицируемые численные аномалии • Unclassified numerical abnormalities 6 (7,9) 2 (14,3)

• Неклассифицируемые структурные аномалии • Unclassified structural abnormalities 2 (2,6) 1 (7,1)

• Нормальный кариотип + мутации в генах NMP1 и FLT3-ITD • Normal karyotype + NPM1 or FLT3-ITD mutations 5 (6,6) 1 (7,1)

• Нормальный кариотип без мутаций NPM1, FLT3-ITD • Normal karyotype, no NPM1 or FLT3-ITD mutations 23 (30,2) 2 (14,3)

> Группа неблагоприятного риска: ^ Unfavourable risk cohort

• -7/del(7q) 5 (6,6) -

• Комплексный или моносомный кариотип • Complex or monosomal karyotype 9 (11,8) 5 (35,8)

• Нормальный кариотип + мутация в гене FLT3-ITD • Normal karyotype + FLT3-ITD mutation 4 (5,3) -

• Другое, в т. ч. сочетанные аномалии • Other, including combined abnormalities 3 (4) 2 (14,3)

• Концентрация гемоглобина крови в дебюте, медиана (диапазон), г/л • Haemoglobin concentration at debut, median (range), g/L 84 (50-142) 85 (49-135)

• Количество тромбоцитов крови в дебюте, медиана (диапазон), * 109/л • Platelet count at debut, median (range), x 109/L 57 (3-417) 56,5 (17-189)

• Количество бластных клеток в костном мозге дебюте, медиана (диапазон), % • Blast cell count in bone marrow at debut, median (range), % 65,8 (10,8-96,8) 65,2 (23,2-92,8)

Таблица 2. Характеристика программ лечения в зависимости от возраста Table 2. Therapy structure in age cohorts

Программы индукционной ХТ Induction chemotherapy Больные < 60 лет Patients < 60 years (n = 76) Больные > 60 лет Patients > 60 years (n = 14)

Программы стандартной ХТ Standard chemotherapy

«7+3» — n (%) 61 (80,3) 4 (28,6)

«7+3» с предфазой Aza — n (%) "7+3" + pre-phase with Aza, n (%) 8 (10,5) -

Курсы низкодозной ХТ Low-dose chemotherapy

Aza-Ida-Ara-C, n (%) 6 (79) 4 (28,6)

Dac-Ida-Ara-C, n (%) 1 (1,3) 1 (71)

Aza + Венетоклакс, n (%) Aza + Venetoclax, n (%) - 3 (21,4)

Без лечения, n(%) Intact, n (%) - 2 (14,3)

Алло-ТГСК — n (%) Allo-HSCT, n (%) 37 (48,7) 0

• в первой ремиссии, n • first complete remission, n 31

• во второй ремиссии, n • second complete remission, n 2 -

• вне ремиссии, n • no remission, n 4

Примечание. Aza — Азацитидин, Aza-Ida-Ara-C — Азацитидин + Идарубицин + Цитарабин, Dac-Ida-Ara-C — Децитабин + Идарубицин + Цитара-бин.

Note. Aza — azacitidine, Aza-Ida-Ara-C — azacitidine + idarubicin + cytarabine, Dac-Ida-Ara-C — decitabine + idarubicin + cytarabine.

в реальном времени. 200 нг ДНК вносили в 25 мкл реакционной смеси (ЗАО Синтол, Москва), содержащей 10 пмоль прямого и обратного праймеров и 7,5 пмоль пробы. ПЦР проводили в дупликатах на приборе Step One Real-Time PCR (Applied Biosystems, США). Условия ПЦР: 95° 5 мин, затем 50 циклов — 95° 30 сек, 62° 20 сек, 72° 20 сек. В качестве отрицательных контролей использовали смесь ДНК здоровых доноров. В качестве положительных контролей — образцы с подтвержденными секвенированием по Сенгеру мутациями.

Статистический анализ. Для статистической обработки данных использовали стандартные методы описательного, частотного и событийного анализа. Расчеты проводили с помощью процедур пакета SAS 9.4. Анализ общей выживаемости и безрецидивной выживаемости проводили с использованием оценок Каплана — Мейера и логрангового критерия для сравнения групп. При проведении многофакторного анализа и оценки отношения рисков использовали модель пропорциональных рисков (модель Кокса). Для сравнения категориальных переменных использовали критерий X2. При анализе общей выживаемости временной интервал отсчитывали от даты диагностики заболевания до даты смерти (событие)/даты последнего контакта (цензурирование). При анализе безрецидивной выживаемости временной интервал отсчитывали от даты ремиссии до даты смерти или рецидива (событие)/даты последнего контакта

(цензурирование). Поскольку в работе оценивали эффективность всего протокола терапии, в котором алло-ТГСК является его частью, цензурирование на момент трансплантации не выполняли.

Результаты

Все больные были распределены по группам риска, согласно клиническим рекомендациям ЕЕМ 2017 [5]: среди больных моложе 60 лет группа благоприятного риска составила 23,7 % (п = 18), группа промежуточного риска — 48,7 % (п = 37), группа неблагоприятного риска — 27,6 % (п = 21). Среди больных от 60 лет и старше к указанным группам риска было отнесено 7,1 % (п = 1), 42,9 % (п = 6) и 50 % (п = 7) больных соответственно.

В группе моложе 60 лет у 41 (54 %) больного определили нормальный кариотип. Из цитогенетических аберраций в группе благоприятного риска у 6 (7,9 %) больных была выявлена 1(8;21)(422;422.1); КиЫХ1-КиШ1Т1, у 3 (4 %) — 1^(16) (р13.^22); СВЕВ-МУН11. В группе промежуточного риска у одного больного была выявлена 1(9;11)(р21.3;423.3); МЬЬТ3-КМТ2Л. У 8 (10,5 %) больных в этой прогностической группе выявлялись численные, либо структурные цитогенетические перестройки, не классифицируемые как благоприятные или неблагоприятные, среди которых наиболее часто выявлялась трисомия 8-й хромосомы (п = 4). В группе неблагоприятного риска у 9 больных (11,8 %) был

выявлен комплексный или моносомный кариотип, у 7 (9,2 %) больных определили моносомию 7-й хромосомы или del(7q), при этом у 2 — в сочетании c del(5q) или перестройкой гена EVI.

В группе больных от 60 лет и старше у 4 (28,6 %) больных был определен нормальный кариотип. Цитогенетических перестроек в группе благоприятного риска выявлено не было. В группе промежуточного прогноза были выявлены трисомия 8-й хромосомы, а также другие численные и структурные перестройки, не классифицируемые как благоприятные или неблагоприятные. В группе неблагоприятного прогноза у 5 (35,8 %) больных был выявлен комплексный кариотип.

Распределение по группам риска проводили согласно данным цитогенетического и молекулярно-генети-ческого исследований на этапе установки диагноза. При проведении молекулярного исследования устанавливали наличие мутаций в генах CEBPA, NPM1 и FLT3-ITD, оценка аллельного соотношения мутант-ного типа к «дикому» при наличии мутации в гене FLT3-ITD не проводилась. Таким образом, больные с нормальным кариотипом и изолированной мутацией в гене FLT3-ITD были определены в группу неблагоприятного прогноза; в случае наличия у больных с нормальным кариотипом сочетанных мутаций NPM1 и FLT3-ITD их определяли в группу промежуточного прогноза.

В ходе проведенного исследования нуклеотидные замены были обнаружены в генах DNMT3, TET2, TP53, SETBP1, BCOR, RUNX1, IDH2, IDH1, FLT3, U2AF2, SF3B1 у 52 (57,8 %) из 90 больных. При этом у 16 (17,8 %) больных выявлены сочетанные мутации в двух или трех генах. Спектр выявленных мутаций представлен на рисунке 1.

В гене TET2 выявлены 5 нонсенс-мутаций в 3-м, 10-м и 11-м экзонах (p.342X, p.454X, p.550X, p.R1465X и p.Q1942X) и 2 миссенс-мутации в 7-м (p.G1275R)

и 9-м экзонах (р.К1359С). У 8 больных выявлены нук-леотидные замены в гене TP53. Из них 7 относятся к патогенным — в 5, 6, 7 и 8-м экзонах (рУ126М, р.У1571, р.Ш75С, р.Ш960, р.У220С, Я248^ р.С275У, р.Я273И). В гене SETBP1 у одного больного выявлена миссенс-мутация р.У1200Е неизвестного значения. Патогенная миссенс-мутация в 12-м экзоне гена BCOR (р.К1513Х) выявлена у одного больного. Также выявлена нонсенс-мутация р.К1295Х в 9-м экзоне данного гена, отсутствующая в известных базах данных. В 6-м экзоне гена RUNX1 у 2 больных обнаружены мутации в позиции Я204 — миссенс-мутация р.К2040 и нонсенс-мутация р.Я204Х. Также выявлены 4 патогенные миссенс-мута-ции в 5-м экзоне — р.Р1581, р.Б160Е, р.Ш628, р.Ш660, и одна — в 6-м экзоне (р.81720) с неизвестным клиническим значением. Патогенные мутации в генах ЮН1 и ШН2 выявлены суммарно у 19 (21,1 %) из 90 больных. В 4-м экзоне гена ЮН2 у 7 больных выявлена мутация р.Я1400, у 4 больных — р.Ш72К. В 4-м экзоне гена ШН1 у 5 больных обнаружена мутация р.К132С и еще у 2 — р.Я132И. При выполнении аллель-специфичной ПЦР были подтверждены все выявленные мутации генов ШН1 и ШН2, а также выявлен еще один больной с мутацией гена ЮН1 р.К132Ы. У 5 (5,6 %) больных выявлена мутация FLT3-TKО в 20-м экзоне (р.О835У). Еще у 2 больных выявлена патогенная нуклеотидная замена в 14-м экзоне (р.У579Е) и 16-м экзоне (р.К663К) гена ¥ЬГ3. Мутации FLT3-ITD не исследовались в связи с особенностями методики. Патогенные мутации в 15-м экзоне гена SF3B1 выявлены у 4 больных и представлены заменой р.К700Е. В 6-м экзоне гена U2AF2 обнаружена миссенс-мутация р.Е175Р неизвестного значения. В исследуемых экзонах генов SRSF2, ASXL1 и РЮА клинически значимых мутаций обнаружено не было. Характеристика выявленных мутаций в зависимости от возраста представлена в таблице 3.

Эффективность лечения оценивали по достижению полной ремиссии (ПР) после двух курсов

Номер падзентаА1олекулярно-геаетаческве нарушения Patient's number/Molecular aberrations ■Ö с s с- a rf t- rf it 1 - 7 f t- x •c •c ■TT t- t- c< -a g CT 3 "Я" S •с £ Г- ■X 7 ■X S 43 r- t- ; - - s ï ■c t-X o- - X - О r- - r - -n t- с ï CT r- r- •c r- — fT s s I s CT, g I о 3 s 3 I ■ g 0\ МЭ r- •o r- 0\ r- Tt 00 00

DNMT3

TET2

TPS3

SSSF2

SEJBP1

ASXL1

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

BCOR

RUNX1

ЮН2

ЮН1

FLT3

U2AF2

P1GA

SF3B1

Рисунок 1. Спектр выявленных молекулярно-генетических нарушений в общей группе больных

Figure 1. Molecular aberration profile of general cohort Патогенные мутации в гене DNMT3 в 11 из 19 выявленных случаев мутаций гена были представлены нуклеотид-ной заменой в 23-м экзоне, приводящей к аминокислотной замене R882 (три разных варианта), еще у 3 больных были выявлены нуклеотидные замены в 14-м экзоне (p.G543C), у 2 больных — в 18-м и 19-м экзонах (p.I705T p.R771X, p.R720C). У 2 больных были обнаружены мутации в 16-м и 17-м экзонах, данные о патогенности которых отсутствуют.

Таблица 3. Молекулярно-генетический профиль больных в зависимости от возраста Table 3. Molecular genetic profile of age cohorts

Ген, число больных (n) Gene, number of patients (n) Нуклеотидные замены Nucleotide substitutions Возраст, лет Age, years

< 60 (n = 76) > 60 (n = 14)

exon14:c.G1627T:p.G543C n = 3 -

exon16:c.A1922G:p.D641 G n = 1 -

exon17:c.T1964C:p.I655T n = 1 -

exon18:c.T2114C:p.I705T n = 1 -

DNMT3 (n = 18) exon18:c.C2158T:p.R720C exon19:c.C2311T:p.R771X exon23:c.G2645A:p.R882H exon23:c.C2644T:p.R882C exon23:c.C2644A:p.R882S n = 1 n = Z n = 2 n = 1 n = 1 n = 1

Суммарно в группе, число больных (%) Cohort total, number of patients (%) 16 (21) 2 (14,3)

exon3:c.A1360T:p.K454X - n = 1

exon3:c.G1024T:p.G342X - n = 1

exon3:c.C1648T:p.R550X n = 1 -

TET2 (n = 6) exon7:c.G3823C:p.G1275R exon9:c.C4075T:p.R1359C exon10:c.C4393T:p.R1465X exon11 :c.C5824T:p.Q1942X = = = = nnnn -

Суммарно в группе, число больных (%) Cohort total, number of patients (%) 4 (5,3) 2 (14,3)

exon5:c.G469A:p.V157I n = 1 -

exon5:c.T376A:p.Y126N n = 1 -

exon5:c.C523G:p.R175G - n = 1

exon6:c.G587A:p.R196Q - n = 1

TP53 (n = 8) exon6:c.A659G:p.Y220C exon7:c.C742T:p.R248W exon7:c.C697A:p.H233N exon8:c.G818A:p.R273H exon8:c.G824A:p.C275Y n = 1 = = - = = n n nn

Суммарно в группе, число больных (%) Cohort total, number of patients (%) 3 (4) 5 (35,7)

SETBPl (n = 1) exon4:c.T3599A:p.V1200E n = 1 -

Суммарно в группе, число больных (%) Cohort total, number of patients (%) 1 (1,3) 0

BCOR (n = 2) exon9:c.A3883T:p.K1295X exon12:c.C4537T:p.R1513X n = 1 n = 1 -

Суммарно в группе, число больных (%) Cohort total, number of patients (%) 2 (2,6) 0

exon5:c.C480A:p.D160E n = 1 -

exon5:c.G486T:p.R162S n = 1 -

exon5:c.T472A:p.F158I n = 1 -

RUNXl (n = 7) exon5:c.G497A:p.R166Q exon6:c.C610T:p.R204X exon6:c.G611A:p.R204Q exon6:c.A514G:p.S172G = = = = nnnn -

Суммарно в группе, число больных (%) Cohort total, number of patients (%) Z (9,2) 0

IDHl (n = 8) exon4:c.C394T:p.R132C exon4:c.G395A:p.R132H n = 4 n = 2 n = 1 n = 1

Суммарно в группе, число больных (%) Cohort total, number of patients (%) 6 (79) 2 (14,3)

IDH2 (n = 11) exon4:c.G515A:p.R172K exon4:c.G419A:p.R140Q n = 4 n = 7 -

Суммарно в группе, число больных (%) Cohort total, number of patients (%) 11 (14,5) 0

Продолжение табл. 3 Table 3 (continued)

Ген, число больных (n) Gene, number of patients (n) Нуклеотидные замены Nucleotide substitutions Возраст, лет Age, years

< 60 (n = 76) > 60 (n = 14)

FLT3 (n = 7) exon14:c.T1736A:p.V579E exon16:c.A1988G:p.K663R exon20:c.G2503T:p.D835Y n = 1 n = 5 n = 1

Суммарно в группе, число больных (%) Cohort total, number of patients (%) 6 (779) 1 (771)

U2AF2 (n = 1) exon6:c.T524C:p.L175P - n = 1

Суммарно в группе, число больных (%) Cohort total, number of patients (%) 0 1 (71

SF3B1 (n = 4) exon15:c.A2098G:p.K700E n = 4 -

Суммарно в группе, число больных (%) Cohort total, number of patients (%) 4 (5,3) 0

индукционной ХТ. В группе больных моложе 60 лет ПР была достигнута у 64 (84,2 %) больных, у 6 (7,9 %) больных была констатирована первичная рефрак-терность; ранняя летальность составила 6,6 % (п = 5). Данные о результатах лечения одной больной отсутствуют в связи с выпиской из стационара по собственному желанию. В группе больных от 60 лет и старше двое больных умерли до начала лечения. ПР была достигнута у 10 (83,3 %) больных, у 1 (8,3 %) констатирована первичная рефрактерность. Ранняя летальность в старшей возрастной группе составила 8,3 % (п = 1).

В группе благоприятного риска у всех 19 (100 %) больных была достигнута ПР. В группе промежуточного риска ПР была достигнута у 38 (88,4 %) больных, у одной больной констатирована первичная рефрак-терность, данные об эффективности лечения у одной больной отсутствуют. Ранняя летальность составила 7 % (п = 3). В группе неблагоприятного риска у 17

(65,4 %) больных была достигнута ПР, у 6 (23,1 %) констатирована первичная рефрактерность; ранняя летальность составила 11,5 % (п = 3). Двое больных умерли до начала лечения.

При анализе долгосрочных результатов терапии оценивали 3-летнюю общую выживаемость (ОВ) и безрецидивную выживаемость (БРВ) в разных возрастных группах (< 60 и > 60 лет), в группах риска по ЕВМ 2017 [5] и в зависимости от наличия у больных мутаций генов ТР53, ШШ!, ШИ1, ЮИ2 и ОКМТЗ. ОВ в общей группе составила 51,6 %; в группе больных моложе 60 лет — 57,2 %, в группе больных от 60 лет и старше медиана наблюдения 36 месяцев достигнута не была, в связи с чем оценить 3-летнюю ОВ не удалось (р = 0,0006) (рис. 2). В зависимости от группы риска (благоприятный, промежуточный, неблагоприятный) ОВ составила 63,2, 69,5 и 18,6 % (р = 0,0001) (рис. 3). Статистически

Общая выживаемость (возраст), % Overall survival (age), %

? и

I

S

■и л

H

Рисунок 2. Общая выживаемость в зависимости от возрастной группы Figure 2. Overall survival in age cohorts

Рисунок 3. Общая выживаемость в зависимости от группы риска по ELN 2017 Figure 3. Overall survival in ELN-2017 risk groups

значимые различия в ОВ в зависимости от наличия тех или иных мутаций были выявлены для больных с мутацией генов ТР53 и RUNX1: у больных с мутацией ТР53 ОВ была ниже, чем у больных без нее (30 % против 53,4 %, р = 0,0037) (рис. 4). Наличие мутации в гене RUNX1 явилось фактором, неблагоприятно влияющим на ОВ: у больных с мутацией ОВ составила 20 %, в то время как у больных без нее — 54 % (р = 0,0466) (рис. 5).

БРВ в общей группе составила 43,4 %, в группе больных моложе 60 лет — 46 % (р = 0,0661). В группе больных от 60 лет и старше не удалось оценить 3-летнюю

ОВ в связи с меньшим сроком наблюдения за выжившими больными (рис. 6). В зависимости от группы риска БРВ составила 34,5, 62 и 14,5 % соответственно (р = 0,0630) (рис. 7). Достоверных различий в зависимости от наличия тех или иных мутаций при оценке БРВ выявлено не было.

При проведении многофакторного анализа влияния различных факторов на ОВ и БРВ с пошаговой селекцией в качестве факторов-кандидатов на вхождение в модель были включены мутация в гене ГР53, мутация в гене RUNX1, а также группа риска по ЕЬМ 2017 в двух градациях (благоприятного/промежуточного либо

Рисунок 4. Общая выживаемость в зависимости от наличия мутации гена TP53 Figure 4. Overall survival depending onTP53 gene aberration

Рисунок 5. Общая выживаемость в зависимости от наличия мутации гена RUNX1 Figure 5. Overall survival depending on RUNX1 gene aberration

Рисунок 6. Безрецидивная выживаемость в зависимости от возрастной группы Figure 6. Relapse-free survival in age cohorts

Рисунок

2017 Figure 7.

Месяцы Motiibs

7. Безрецидивная выживаемость в зависимости от группы риска по ELN Relapse-free survival in ELN-2017 risk groups

неблагоприятного риска) и возраст (< 60 и > 60 лет). Прогностическую значимость установили для следующих факторов: при оценке ОВ — группа риска по ELN 2017 и возраст, при оценке БРВ — только группа риска ELN 2017 [5].

Обсуждение

При проведении настоящего исследования у 88 % больных были выявлены молекулярные либо цитоге-нетические перестройки, что сопоставимо с данными крупных исследований, согласно которым более 90 % больных ОМЛ имеют, как минимум, одну драйверную мутацию [33, 34]. Для решения поставленных задач была выбрана молекулярная панель из 14 генов, мутации в которых имеют прогностическую значимость при ОМЛ. В целом частота большей части выявленных мутаций оказалась сопоставима с частотой, описываемой в литературе. Мутации гена DNMT3 были выявлены у 20 % больных, мутации гена TP53 — у 9 % больных, RUNX1 — у 8 %, IDH1/IDH2 — у 21 % [33, 40, 41]. Некоторые из исследовавшихся мутаций, такие как ASXL1, SRSF2, SF3B1, U2AF2 и BCOR, характерны для вторичного ОМЛ и для ОМЛ, обусловленного предшествовавшей химиотерапией, более чем для де novo ОМЛ [42]. Возможно, этим объясняется отсутствие (ASXL1~) либо низкая частота мутаций выбранных генов у больных в нашем исследовании.

Сравнение долгосрочных результатов терапии больных в зависимости от молекулярно-генетического профиля подтвердило неблагоприятное прогностическое значение мутаций таких генов, как TP53 и RUNX1. Показано, что в группе больных без мутаций TP53 ОВ была достоверно выше, чем в группе с мутациями (54 % против 30 %). При оценке эффективности терапии в группе больных без мутаций TP53 частота достижения ПР составила 85,4 %, первично-рефрактерное течение заболевания констатировано у 8,5 % больных, а ранняя летальность составила 4,9 %. Данные об эффективности лечения одной больной отсутствуют. В группе больных с мутацией гена TP53 лишь у 50 % больных была достигнута ПР. Смертность составила так же 50 %: двое больных умерли до начала лечения, двое — на этапах индукции ремиссии. Таким образом, мутации гена TP53 являются независимым прогностическим фактором, оказывающим неблагоприятное влияние как на эффективность терапии, так и на ее долгосрочные результаты. Подавляющее боль-

шинство больных (75 %) с выявленными мутациями ТР53 были отнесены к группе неблагоприятного риска по ЕЕМ 2017 [5]: у 5 больных выявили комплексный кариотип, у 1 — моносомный. Наблюдалась ассоциация между наличием указанных мутаций и возрастом: 62,5 % больных с мутациями принадлежали к старшей возрастной группе (> 60 лет). Полученные результаты соответствуют данным литературы, согласно которым мутации гена ТР53 ассоциированы с пожилым возрастом, сложными цитогенетическими поломками, в частности, с комплексным либо моносомным кари-отипом, и плохим прогнозом [23]. Схожие результаты при оценке долгосрочных результатов терапии были получены для больных с мутациями гена Ки^Х! (ОВ для больных с мутациями составила 20 % по сравнению с 54 % у больных без мутаций). Однозначность получаемых результатов в отношении мутаций ТР53 и Ки^Х! лишний раз доказывает необходимость их исследования еще на этапе установки диагноза ОМЛ. В то же время при оценке БРВ не было выявлено достоверных различий в зависимости от наличия тех или иных мутаций.

Особенность настоящего исследования заключается в расширении диапазона исследуемых мутаций при ОМЛ с использованием новейших молекулярно-генетических технологий, в том числе секвенирования нового поколения. Данный метод позволяет значительно повысить производительность и чувствительность исследования по сравнению с методом секвенирования по Сэнгеру. Проведение высокопроизводительного секвенирования с использованием соответствующих генетических панелей является критически важным для онкогематологических заболеваний, в частности ОМЛ, с учетом высокой частоты мутаций у данных больных и появлением все большего количества тар-гетных препаратов.

Таким образом, проанализирован материал от 90 больных с впервые установленным диагнозом ОМЛ с помощью секвенирования нового поколения. Данный метод позволяет в короткие сроки проанализировать массивный объем информации и получить развернутую характеристику молекулярно-генети-ческого статуса для каждого больного. Полученные результаты свидетельствуют о необходимости дальнейшего изучения мутационного профиля ОМЛ с большим объемом выборки и проведением развернутого статистического анализа.

Литература

1. Grimwade D., Hills R.K., Moorman A.V. et al. Refinement of cytogenetic classification in AML Younger adult patients treated in UKMRC. Blood. 2010; 116(3): 354-66. DOI: 10.1182/blood-2009-11-254441.

2. Grimwade D., Walker H., Oliver F. et al. The importance of diagnostic cytogenetics on outcome in AML: Analysis of 1,612 patients entered into the MRC AML 10 trial. Blood. 1998; 92(7): 2322-33. DOI: 10.1182/blood.v92.7.2322.

References

1. Grimwade D., Hills R.K., Moorman A.V. et al. Refinement of cytogenetic classification in AML Younger adult patients treated in UKMRC. Blood. 2010; 116(3): 354-66. DOI: 10.1182/blood-2009-11-254441.

2. Grimwade D., Walker H., Oliver F. et al. The importance of diagnostic cytogenetics on outcome in AML: Analysis of 1,612 patients entered into the MRC AML 10 trial. Blood. 1998; 92(7): 2322-33. DOI: 10.1182/blood.v92.72322.

3. Grimwade D., Walker H., Harrison G. et al. The predictive value of hierarchical cytogenetic classification in older adults with acute myeloid leukemia (AML): Analysis of 1065 patients entered into the United Kingdom Medical Research Council AML11 trial. Blood. 2001; 98(5): 1312-20. DOI: 10.1182/blood.V98.5.1312.

4. Schoch C., Haferlach T., Haase D. et al. Patients with de novo acute myeloid leukaemia and complex karyotype aberrations show a poor prognosis despite intensive treatment: A study of 90 patients. Br J Haematol. 2001; 112(1): 118-26. DOI: 10.1046/j.1365-2141.2001.02511 .x.

5. Döhner H., Estey E., Grimwade D. et al. Diagnosis and management of AML in adults: 2017 ELN recommendations from an international expert panel. Blood. 2017; 129: 424-47 DOI: 10.1182/blood-2016-08-733196.

6. Arber D.A., Orazi A., Hasserjian R. et al. The 2016 revision to the World Health Organization classification of myeloid neoplasms and acute leukemia. Blood. 2016; 127(20): 2391-405. DOI: 10.1182/blood-2016-03-643544.

7 Ley T.J., Miller C., Ding L. et al. Genomic and epigenomic landscapes of adult de novo acute myeloid leukemia. N Engl J Med. 2013; 368(22): 2059-74. DOI: 10.1056/NEJMoa1301689.

8. Röllig C., Bornhäuser M., Thiede C. et al. Long-term prognosis of acute myeloid leukemia according to the new genetic risk classification of the European Leu-kemiaNet recommendations: Evaluation of the proposed reporting system. J Clin Oncol. 2011; 29(20): 2758-65. DOI: 10.1200/JCO.2010.32.8500.

9. Preudhomme C., Sagot C., Boissel N. et al. Favorable prognostic significance of CEBPA mutations in patients with de novo acute myeloid leukemia: A study from the Acute Leukemia French Association (ALFA). Blood. 2002; 100(8): 2717-23. DOI: 10.1182/blood-2002-03-0990.

10. Fröhling S., Schlenk R.F., Stolze I. et al. CEBPA mutations in younger adults with acute myeloid leukemia and normal cytogenetics: Prognostic relevance and analysis of cooperating mutations. J Clin Oncol. 2004; 22(4): 624-33. DOI: 10.1200/JCO. 2004.06.060.

11. Tang J.L., Hou H.A., Chen C.Y. et al. AML1/RUNX1 mutations in 470 adult patients with de novo acute myeloid leukemia: Prognostic implication and interaction with other gene alterations. Blood. 2009; 114(26): 5352-61. DOI: 10.1182/ blood-2009-05-223784.

12. Gaidzik V.I., Bullinger L., Schlenk R.F. et al. RUNX1 mutations in acute my-eloid leukemia: Results from a comprehensive genetic and clinical analysis from the AML study group. J Clin Oncol. 2011; 29(10): 1364-72. DOI: 10.1200/ JCO.2010.30.7926.

13. Mendler J.H., Maharry K., Radmacher M.D. et al. RUNX1 mutations are associated with poor outcome in younger and older patients with cytogenetically normal acute myeloid leukemia and with distinct gene and microRNA expression signatures. J Clin Oncol. 2012; 30(25): 3109-18. DOI: 10.1200/JCO.2011 .40.6652.

14. Gaidzik V.I., Teleanu V., Papaemmanuil E. et al. RUNX1 mutations in acute myeloid leukemia are associated with distinct clinico-pathologic and genetic features. Leukemia. 2016; 30: 2160-8. DOI: 10.1038/leu.2016.126.

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

15. Haferlach T., Stengel A., Eckstein S. et al. The new provisional WHO entity "RUNX1 mutated AML" shows specific genetics but no prognostic influence of dysplasia. Leukemia. 2016; 30(10): 2109-12. DOI: 10.1038/leu.2016.150.

16. Wouters B.J., Löwenberg B., Erpelinck-Verschueren C.A.J. et al. Double CEBPA mutations, but not single CEBPA mutations, define a subgroup of acute myeloid leukemia with a distinctive gene expression profile that is uniquely associated with a favorable outcome. Blood. 2009; 113(13): 3088-91. DOI: 10.1182/ blood-2008-09-179895.

17. Metzeler K.H., Becker H., Maharry K. et al. ASXL1 mutations identify a high-risk subgroup of older patients with primary cytogenetically normal AML within the ELN Favorable genetic category. Blood. 2011; 118(26): 6920-9. DOI: 10.1182/ blood-2011-08-368225.

3. Grimwade D., Walker H., Harrison G. et al. The predictive value of hierarchical cytogenetic classification in older adults with acute myeloid leukemia (AML): Analysis of 1065 patients entered into the United Kingdom Medical Research Council AML11 trial. Blood. 2001; 98(5): 1312-20. DOI: 10.1182/blood.V98.5.1312.

4. Schoch C., Haferlach T., Haase D. et al. Patients with de novo acute myeloid leukaemia and complex karyotype aberrations show a poor prognosis despite intensive treatment: A study of 90 patients. Br J Haematol. 2001; 112(1): 118-26. DOI: 10.1046/j.1365-2141.2001.02511 .x.

5. Döhner H., Estey E., Grimwade D. et al. Diagnosis and management of AML in adults: 2017 ELN recommendations from an international expert panel. Blood. 2017; 129: 424-47. DOI: 10.1182/blood-2016-08-733196.

6. Arber D.A., Orazi A., Hasserjian R. et al. The 2016 revision to the World Health Organization classification of myeloid neoplasms and acute leukemia. Blood. 2016; 127(20): 2391-405. DOI: 10.1182/blood-2016-03-643544.

7. Ley T.J., Miller C., Ding L. et al. Genomic and epigenomic landscapes of adult de novo acute myeloid leukemia. N Engl J Med. 2013; 368(22): 2059-74. DOI: 10.1056/NEJMoa1301689.

8. Röllig C., Bornhäuser M., Thiede C. et al. Long-term prognosis of acute myeloid leukemia according to the new genetic risk classification of the European Leu-kemiaNet recommendations: Evaluation of the proposed reporting system. J Clin Oncol. 2011; 29(20): 2758-65. DOI: 10.1200/JCO.2010.32.8500.

9. Preudhomme C., Sagot C., Boissel N. et al. Favorable prognostic significance of CEBPA mutations in patients with de novo acute myeloid leukemia: A study from the Acute Leukemia French Association (ALFA). Blood. 2002; 100(8): 2717-23. DOI: 10.1182/blood-2002-03-0990.

10. Fröhling S., Schlenk R.F., Stolze I. et al. CEBPA mutations in younger adults with acute myeloid leukemia and normal cytogenetics: Prognostic relevance and analysis of cooperating mutations. J Clin Oncol. 2004; 22(4): 624-33. DOI: 10.1200/jœ.2004.06.060.

11. Tang J.L., Hou H.A., Chen C.Y. et al. AML1/RUNX1 mutations in 470 adult patients with de novo acute myeloid leukemia: Prognostic implication and interaction with other gene alterations. Blood. 2009; 114(26): 5352-61. DOI: 10.1182/ blood-2009-05-223784.

12. Gaidzik V.I., Bullinger L., Schlenk R.F. et al. RUNX1 mutations in acute my-eloid leukemia: Results from a comprehensive genetic and clinical analysis from the AML study group. J Clin Oncol. 2011; 29(10): 1364-72. DOI: 10.1200/ JCO.2010.30.7926.

13. Mendler J.H., Maharry K., Radmacher M.D. et al. RUNX1 mutations are associated with poor outcome in younger and older patients with cytogenetically normal acute myeloid leukemia and with distinct gene and microRNA expression signatures. J Clin Oncol. 2012; 30(25): 3109-18. DOI: 10.1200/JCO.2011.40.6652.

14. Gaidzik V.I., Teleanu V., Papaemmanuil E. et al. RUNX1 mutations in acute myeloid leukemia are associated with distinct clinico-pathologic and genetic features. Leukemia. 2016; 30: 2160-8. DOI: 10.1038/leu.2016.126.

15. Haferlach T., Stengel A., Eckstein S. et al. The new provisional WHO entity "RUNX1 mutated AML" shows specific genetics but no prognostic influence of dysplasia. Leukemia. 2016; 30(10): 2109-12. DOI: 10.1038/leu.2016.150.

16. Wouters B.J., Löwenberg B., Erpelinck-Verschueren C.A.J. et al. Double CEBPA mutations, but not single CEBPA mutations, define a subgroup of acute myeloid leukemia with a distinctive gene expression profile that is uniquely associated with a favorable outcome. Blood. 2009; 113(13): 3088-91. DOI: 10.1182/ blood-2008-09-179895.

17 Metzeler K.H., Becker H., Maharry K. et al. ASXL1 mutations identify a high-risk subgroup of older patients with primary cytogenetically normal AML within the ELN Favorable genetic category. Blood. 2011; 118(26): 6920-9. DOI: 10.1182/ blood-2011-08-368225.

18. Pratcorona M., Abbas S., Sanders M.A. et al. Acquired mutations in ASXL1 in acute myeloid leukemia: Prevalence and prognostic value. Haematologica. 2012; 97(3): 388-92. DOI: 10.3324/haematol.2011.051532.

19. Schnittger S., Eder C., Jeromin S. et al. ASXL1 exon 12 mutations are frequent in AML with intermediate risk karyotype and are independently associated with an adverse outcome. Leukemia. 2013; 27(1): 82-91. DOI: 10.1038/leu.2012.262.

20. Paschka P., Schlenk R.F., Gaidzik V.I. et al. ASXL1 mutations in younger adult patients with acute myeloid leukemia: A study by the German-Austrian acute myeloid leukemia study group. Haematologica. 2015; 100(3): 324-30. DOI: 10.3324/haematol.2014.114157.

21. Haferlach C., Dicker F., Herholz H. et al. Mutations of the TP53 gene in acute myeloid leukemia are strongly associated with a complex aberrant karyotype. Leukemia. 2008; 22(8): 1539-41. DOI: 10.1038/leu.2008.143.

22. Bowen D., Groves M.J., Burnett A.K. et al. TP53 gene mutation is frequent in patients with acute myeloid leukemia and complex karyotype, and is associated with very poor prognosis. Leukemia. 2009; 23(1): 203-6. DOI: 10.1038/ leu.2008.173.

23. Rücker F.G., Schlenk R.F., Bullinger L. et al. TP53 alterations in acute myeloid leukemia with complex karyotype correlate with specific copy number alterations, monosomal karyotype, and dismal outcome. Blood. 2012; 119(9): 2114-21. DOI: 10.1182/blood-2011 -08-375758.

24. Devillier R., Mansat-De Mas V., Gelsi-Boyer V. et al. Role of ASXL1 and TP53 mutations in the molecular classification and prognosis of acute myeloid leukemias with myelodysplasiarelated changes. Oncotarget. 2015; 6(10): 8388-96. DOI: 10.1 8632/oncotarget.3460.

25. Tsai C.H., Hou H.A., Tang J.L. et al. Genetic alterations and their clinical implications in older patients with acute myeloid leukemia. Leukemia. 2016; 30(7): 1485-92. DOI: 10.1038/leu.2016.65.

26. Kottaridis P.D., Gale R.E., Frew M.E. et al. The presence of a FLT3 internal tandem duplication in patients with acute myeloid leukemia (AML) adds important prognostic information to cytogenetic risk group and response to the first cycle of chemotherapy: Analysis of 854 patients from the United King. Blood. 2001; 98(6): 1752-9. DOI: 10.1182/blood.V98.6.1752.

27 Thiede C., Steudel C., Mohr B. et al. Analysis of FLT3-activating mutations in 979 patients with acute myelogenous leukemia: Association with FAB subtypes and identification of subgroups with poor prognosis. Blood. 2002; 99(12): 432635. DOI: 10.1182/blood.V99.12.4326.

28. Schlenk R.F., Breitruck J., Benner A. et al. Prognostic significance of activating FLT3 mutations in younger adults (16 to 60 years) with acute myeloid leukemia and normal cytogenetics: a study of the AML Study Group Ulm. Blood. 2002; 100(13): 4372-80. DOI: 10.1182/blood-2002-05-1440.

29. Gale R.E., Green C., Allen C. et al. The impact of FLT3 internal tandem duplication mutant level, number, size, and interaction with NPM1 mutations in a large cohort of young adult patients with acute myeloid leukemia. Blood. 2008; 111 (5): 2776 - 84. DOI: 10.1182/blood-2007-08-109090.

30. Pratcorona M., Brunet S., Nomdedéu J. et al. Favorable outcome of patients with AML harboring a low-allelic burden FLT3-ITD and concomitant NPM1 mutation: relevance to post-remission. Blood. 2013; 121(14): 2734-8. DOI: 10.1182/ blood-2012-06-431122.The.

31. Schlenk R.F., Kayser S., Bullinger L. et al. Differential impact of allelic ratio and insertion site in FLT3-ITD-positive AML with respect to allogeneic transplantation. Blood. 2014; 124(23): 3441-9. DOI: 10.1182/blood-2014-05-578070.

32. Linch D.C., Hills R.K., Burnett A.K. et al. Impact of FLT3ITD mutant allele level on relapse risk in intermediate-risk acute myeloid leukemia. Blood. 2014; 124(2): 273-6. DOI: 10.1182/blood-2014-02-554667

18. Pratcorona M., Abbas S., Sanders M.A. et al. Acquired mutations in ASXL1 in acute myeloid leukemia: Prevalence and prognostic value. Haematologica. 2012; 97(3): 388-92. DOI: 10.3324/haematol.2011.051532.

19. Schnittger S., Eder C., Jeromin S. et al. ASXL1 exon 12 mutations are frequent in AML with intermediate risk karyotype and are independently associated with an adverse outcome. Leukemia. 2013; 27(1): 82-91. DOI: 10.1038/leu.2012.262.

20. Paschka P., Schlenk R.F., Gaidzik V.I. et al. ASXL1 mutations in younger adult patients with acute myeloid leukemia: A study by the German-Austrian acute myeloid leukemia study group. Haematologica. 2015; 100(3): 324-30. DOI: 10.3324/haematol.2014.114157

21. Haferlach C., Dicker F., Herholz H. et al. Mutations of the TP53 gene in acute myeloid leukemia are strongly associated with a complex aberrant karyotype. Leukemia. 2008; 22(8): 1539-41. DOI: 10.1038/leu.2008.143.

22. Bowen D., Groves M.J., Burnett A.K. et al. TP53 gene mutation is frequent in patients with acute myeloid leukemia and complex karyotype, and is associated with very poor prognosis. Leukemia. 2009; 23(1): 203-6. DOI: 10.1038/ leu.2008.173.

23. Rücker F.G., Schlenk R.F., Bullinger L. et al. TP53 alterations in acute myeloid leukemia with complex karyotype correlate with specific copy number alterations, monosomal karyotype, and dismal outcome. Blood. 2012; 119(9): 2114-21. DOI: 10.1182/blood-2011 -08-375758.

24. Devillier R., Mansat-De Mas V., Gelsi-Boyer V. et al. Role of ASXL1 and TP53 mutations in the molecular classification and prognosis of acute myeloid leukemias with myelodysplasiarelated changes. Oncotarget. 2015; 6(10): 8388-96. DOI: 10.18632/oncotarget.3460.

25. Tsai C.H., Hou H.A., Tang J.L. et al. Genetic alterations and their clinical implications in older patients with acute myeloid leukemia. Leukemia. 2016; 30(7): 1485-92. DOI: 10.1038/leu.2016.65.

26. Kottaridis P.D., Gale R.E., Frew M.E. et al. The presence of a FLT3 internal tandem duplication in patients with acute myeloid leukemia (AML) adds important prognostic information to cytogenetic risk group and response to the first cycle of chemotherapy: Analysis of 854 patients from the United King. Blood. 2001; 98(6): 1752-9. DOI: 10.1182/blood.V98.6.1752.

27. Thiede C., Steudel C., Mohr B. et al. Analysis of FLT3-activating mutations in 979 patients with acute myelogenous leukemia: Association with FAB subtypes and identification of subgroups with poor prognosis. Blood. 2002; 99(12): 432635. DOI: 10.1182/blood.V99.12.4326.

28. Schlenk R.F., Breitruck J., Benner A. et al. Prognostic significance of activating FLT3 mutations in younger adults (16 to 60 years) with acute myeloid leukemia and normal cytogenetics: a study of the AML Study Group Ulm. Blood. 2002; 100(13): 4372-80. DOI: 10.1182/blood-2002-05-1440.

29. Gale R.E., Green C., Allen C. et al. The impact of FLT3 internal tandem duplication mutant level, number, size, and interaction with NPM1 mutations in a large cohort of young adult patients with acute myeloid leukemia. Blood. 2008; 111 (5): 2776 - 84. DOI: 10.1182/blood-2007-08-109090.

30. Pratcorona M., Brunet S., Nomdedéu J. et al. Favorable outcome of patients with AML harboring a low-allelic burden FLT3-ITD and concomitant NPM1 mutation: relevance to post-remission. Blood. 2013; 121(14): 2734-8. DOI: 10.1182/ blood-2012-06-431122.The.

31. Schlenk R.F., Kayser S., Bullinger L. et al. Differential impact of allelic ratio and insertion site in FLT3-ITD-positive AML with respect to allogeneic transplantation. Blood. 2014; 124(23): 3441-9. DOI: 10.1182/blood-2014-05-578070.

32. Linch D.C., Hills R.K., Burnett A.K. et al. Impact of FLT3ITD mutant allele level on relapse risk in intermediate-risk acute myeloid leukemia. Blood. 2014; 124(2): 273-6. DOI: 10.1182/blood-2014-02-554667.

33. Papaemmanuil E., Gerstung M., Bullinger L. et al. Genomic classification and prognosis in acute myeloid leukemia. N Engl J Med. 2016; 374(23): 2209-21. DOI: 10.1056/NEJMoa1516192.

34. Metzeler K.H., Herold T., Rothenberg-Thurley M. et al. Spectrum and prognostic relevance of driver gene mutations in acute myeloid leukemia. Blood. 2016; 128(5): 686-98. DOI: 10.1182/blood-2016-01-693879.

35. Wang K., Li M., Hakonarson H. ANNOVAR: Functional annotation of genetic variants from high-throughput sequencing data. Nucleic Acids Res. 2010; 38(16): 1-7 DOI: 10.1093/nar/gkq603.

36. Tate J.G., Bamford S., Jubb H.C. et al. COSMIC: the Catalogue Of Somatic Mutations In Cancer. Nucleic Acids Res. 2018; 47(D1): D941-7 DOI: 10.1093/ nar/gky1015.

37 Scholl S., Mugge L.-O., Landt O. et al. Rapid screening and sensitive detection of NPM1 (nucleophosmin) exon 12 mutations in acute myeloid leukaemia. Leuk Res. 2007; 31(9): 1205-11. DOI: 10.1016/j.leukres.2006.12.011.

38. Lin L.I., Lin T.C., Chou W.C. et al. A novel fluorescence-based multiplex PCR assay for rapid simultaneous detection of CEBPA mutations and NPM mutations in patients with acute myeloid leukemias. Leukemia. 2006; 20(10): 1899-903. DOI: 10.1038/sj.leu.2404331.

39. Brownstein M.J., Carpten J.D., Smith J.R. Modulation of non-templated nucleotide addition by Taq DNA polymerase: Primer modifications that facilitate geno-typing. Biotechniques. 1996; 20(6): 1004-10. DOI: 10.2144/96206st01.

40. Ley T.J., Ding L., Walter M.J. et al. DNMT3A mutations in acute myeloid leukemia. N Engl J Med. 2010; 363(25): 2424-33. DOI: 10.1056/NEJMoa1005143.

41. Di Nardo C.D., Cortes J.E. Mutations in AML: Prognostic and therapeutic implications. Hematology. 2016; 2016(1): 348-55. DOI: 10.1182/asheduca-tion-2016.1.348.

42. Lindsley R.C., Mar B.G., Mazzola E. et al. Acute myeloid leukemia ontogeny is defined by distinct somatic mutations. Blood. 2015; 125(9): 1367-76. DOI: 10.1182/blood-2014-11-610543.

Информация об авторах

Кашлакова Анастасия Игоревна*, клинический ординатор отделения интенсивной высокодозной химиотерапии гемобластозов и депрессий кроветворения с круглосуточным стационаром, ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр гематологии» Министерства здравоохранения Российской Федерации, e-mail: kashlakova.a.i@gmail.com, тел.: +7 (495) 612-45-92 ORCID: https://orcid.org/0000-0002-3548-8929

Паровичникова Елена Николаевна, доктор медицинских наук, руководитель отдела химиотерапии гемобластозов, депрессий кроветворения и трансплантации костного мозга, ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр гематологии» Министерства здравоохранения Российской Федерации, e-mail: elenap@blood.ru

ORCID: https://orcid.org/0000-0001-6177-3566

Бидерман Белла Вениаминовна, кандидат биологических наук, старший научный сотрудник лаборатории молекулярной гематологии, ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр гематологии» Министерства здравоохранения Российской Федерации, e-mail: bella_biderman@mail.ru ORCID: https://orcid.org/0000-0002-6253-3334

33. Papaemmanuil E., Gerstung M., Bullinger L. et al. Genomic classification and prognosis in acute myeloid leukemia. N Engl J Med. 2016; 374(23): 2209-21. DOI: 10.1056/NEJMoa1516192.

34. Metzeler K.H., Herold T., Rothenberg-Thurley M. et al. Spectrum and prognostic relevance of driver gene mutations in acute myeloid leukemia. Blood. 2016; 128(5): 686-98. DOI: 10.1182/blood-2016-01-693879.

35. Wang K., Li M., Hakonarson H. ANNOVAR: Functional annotation of genetic variants from high-throughput sequencing data. Nucleic Acids Res. 2010; 38(16): 1-7. DOI: 10.1093/nar/gkq603.

36. Tate J.G., Bamford S., Jubb H.C. et al. COSMIC: the Catalogue Of Somatic Mutations In Cancer. Nucleic Acids Res. 2018; 47(D1): D941-7. DOI: 10.1093/ nar/gky1015.

37. Scholl S., Mügge L.-O., Landt O. et al. Rapid screening and sensitive detection of NPM1 (nucleophosmin) exon 12 mutations in acute myeloid leukaemia. Leuk Res. 2007; 31(9): 1205-11. DOI: 10.1016/j .leukres.2006.12.011.

38. Lin L.I., Lin T.C., Chou W.C. et al. A novel fluorescence-based multiplex PCR assay for rapid simultaneous detection of CEBPA mutations and NPM mutations in patients with acute myeloid leukemias. Leukemia. 2006; 20(10): 1899-903. DOI: 10.1038/sj.leu.2404331.

39. Brownstein M.J., Carpten J.D., Smith J.R. Modulation of non-templated nucleotide addition by Taq DNA polymerase: Primer modifications that facilitate geno-typing. Biotechniques. 1996; 20(6): 1004-10. DOI: 10.2144/96206st01.

40. Ley T.J., Ding L., Walter M.J. et al. DNMT3A mutations in acute myeloid leukemia. N Engl J Med. 2010; 363(25): 2424-33. DOI: 10.1056/NEJMoa1005143.

41. Di Nardo C.D., Cortes J.E. Mutations in AML: Prognostic and therapeutic implications. Hematology. 2016; 2016(1): 348-55. DOI: 10.1182/asheduca-tion-2016.1.348.

42. Lindsley R.C., Mar B.G., Mazzola E. et al. Acute myeloid leukemia ontogeny is defined by distinct somatic mutations. Blood. 2015; 125(9): 1367-76. DOI: 10.1182/blood-2014-11-610543.

Information about the authors

Anastasia I. Kashlakova*, Clinical Resident, Department of Intensive HighDose Chemotherapy for Hemoblastoses and Hematopoietic Depressions, National Research Center for Hematology, e-mail: kashlakova.a.i@gmail.com, tel.: +7 (495) 612-45-92 ORCID: https://orcid.org/0000-0002-3548-8929

Elena N. Parovichnikova, Dr. Sci. (Med.), Head of the Department of Chemotherapy for Hemoblastoses, Hematopoietic Depressions and BMT, National Research Center for Hematology, e-mail: elenap@blood.ru

ORCID: https://orcid.org/0000-0001-6177-3566

Bella V. Biderman, Cand. Sci. (Biol.), Senior Researcher, Laboratory of Molecular Hematology, National Research Center for Hematology, e-mail: bella_biderman@mail.ru ORCID: https://orcid.org/0000-0002-6253-3334

Сидорова Юлия Владимировна, кандидат медицинских наук, старший научный сотрудник лаборатории молекулярной гематологии, ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр гематологии» Министерства здравоохранения Российской Федерации, e-mail: iouliavl@gmail.com ORCID: https://orcid.org/0000-0003-1936-0084

Чабаева Юлия Александровна, кандидат технических наук, заместитель заведующего информационно-аналитическим отделом, ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр гематологии» Министерства здравоохранения Российской Федерации, e-mail: uchabaeva@gmail.com ORCID: https://orcid.org/0000-0001-8044-598X

Троицкая Вера Витальевна, кандидат медицинских наук, заместитель генерального директора по лечебной работе, заведующая отделением интенсивной высокодозной химиотерапии гемобластозов и депрессий кроветворения с круглосуточным стационаром, ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр гематологии» Министерства здравоохранения Российской Федерации, e-mail: verat@blood.ru

ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4827-8947

Лукьянова Ирина Анатольевна, кандидат медицинских наук, врач отделения интенсивной отделения интенсивной высокодозной химиотерапии гемобластозов и депрессий кроветворения с дневным стационаром, ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр гематологии» Министерства здравоохранения Российской Федерации, e-mail: irina.donskova99@mail.ru ORCID: https://orcid.org/0000-0002-8337-2242

Кохно Алина Владимировна, кандидат медицинских наук, ведущий научный сотрудник отделения интенсивной высокодозной химиотерапии гемобластозов и депрессий кроветворения с круглосуточным стационаром, ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр гематологии» Министерства здравоохранения Российской Федерации, e-mail: anilako@rambler.ru ORCID: https://orcid.org/0000-0003-0261 -5941

Соколов Андрей Николаевич, кандидат медицинских наук, старший научный сотрудник отделения интенсивной высокодозной химиотерапии ге-мобластозов и депрессий кроветворения с круглосуточным стационаром, ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр гематологии» Министерства здравоохранения Российской Федерации, e-mail: sokolov.a@blood.ru ORCID: http://orcid.org/0000-0003-1494-7978

Судариков Андрей Борисович, доктор биологических наук, заведующий лабораторией молекулярной гематологии, ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр гематологии» Министерства здравоохранения Российской Федерации, e-mail: sudarikov.a@blood.ru ORCID: https://orcid.org/0000-0001-9463-9187

Yulia V. Sidorova, Cand. Sci. (Med.), Senior Researcher, Laboratory of Molecular Hematology, National Research Center for Hematology, e-mail: iouliavl@gmail.com ORCID: https://orcid.org/0000-0003-1936-0084

Yulia A. Chabaeva, Cand. Sci. (Tech.), Deputy Head of the Information and Analysis Department, National Research Center for Hematology, e-mail: uchabaeva@gmail.com ORCID: https://orcid.org/0000-0001-8044-598X

Vera V. Troitskaya, Cand. Sci. (Med.), Deputy Director for Therapy, Head of the Department of Intensive High-Dose Chemotherapy for Hemoblastoses and Hematopoietic Depressions, Deputy Director for Medical Affairs, National Research Center for Hematology, e-mail: verat@blood.ru

ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4827-8947

Irina A. Lukianova, Cand. Sci. (Med.), Physician, Department of Intensive HighDose Chemotherapy for Hemoblastoses and Hematopoietic Depressions, National Research Center for Hematology, e-mail: irina.donskova99@mail.ru ORCID: https://orcid.org/0000-0002-8337-2242

Alina V. Kokhno, Cand. Sci. (Med.), Leading Researcher, Department of Intensive High-Dose Chemotherapy for Hemoblastoses and Hematopoietic Depressions, National Research Center for Hematology, e-mail: anilako@rambler.ru ORCID: https://orcid.org/0000-0003-0261-5941

Andrey N. Sokolov, Cand. Sci. (Med.), Senior Researcher, Department of Intensive High-Dose Chemotherapy for Hemoblastoses and Hematopoietic Depressions, National Research Center for Hematology, e-mail: sokolov.a@blood.ru ORCID: http://orcid.org/0000-0003-1494-7978

Andrey B. Sudarikov, Dr. Sci. (Biol.), Head of the Laboratory of Molecular Hematology, National Research Center for Hematology, e-mail: sudarikov.a@blood.ru ORCID: https://orcid.org/0000-0001-9463-9187

Обухова Татьяна Никифоровна, кандидат медицинских наук, заведующая лабораторией кариологии, ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр гематологии» Министерства здравоохранения Российской Федерации, e-mail: obukhova.t@blood.ru ORCID: https://orcid.org/0000-0003-1613-652X

Савченко Валерий Григорьевич, доктор медицинских наук, профессор, академик РАН, главный внештатный специалист-гематолог МЗ РФ, генеральный директор ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр гематологии» Министерства здравоохранения Российской Федерации,

e-mail: svg@blood.ru

ORCID: https://orcid.org/0000-0001-8188-5557

* Автор, ответственный за переписку

Поступила: 23.07.2020 Принята в печать: 27.10.2020

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

Tatyana N. Obukhova, Cand. Sci. (Med.), Head of the Laboratory of Karyol-ogy, National Research Center for Hematology, e-mail: obukhova.t@blood.ru ORCID: https://orcid.org/0000-0003-1613-652X

Valery G. Savchenko, Dr. Sci. (Med.), Professor, Full Member of the Russian Academy of Sciences, Director, National Research Center for Hematology; Chief Non-staff Hematologist, Ministry of Health of the Russian Federation, e-mail: svg@blood.ru

ORCID: https://orcid.org/0000-0001-8188-5557

* Corresponding author

Received 23 July 2020 Accepted 27 Oct 2020

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.