Научная статья на тему 'Определение контактов фосфатных групп ДНК с нуклеофильными аминокислотами фермента репарации формамидопиримидин-ДНК гликозилазы E. сoli'

Определение контактов фосфатных групп ДНК с нуклеофильными аминокислотами фермента репарации формамидопиримидин-ДНК гликозилазы E. сoli Текст научной статьи по специальности «Биотехнологии в медицине»

CC BY
87
15
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Аннотация научной статьи по биотехнологиям в медицине, автор научной работы — Рыхлевская А.И., Сидоркина О.М., Романова Е.А., Орецкая Т.С., Лаваль Ж.

Для зондирования активного центра Fpg E. coli и определения контактов белка с фосфатными группами в ДНК использовали набор реакционноспособных аналогов субстратов, содержащих в своей структуре одновременно остаток 8-OG и тризамещенные пирофосфатные межнуклеотидные группировки в различных положениях по отношению к нему. Модифицированные ДНК-дуплексы были получены методом химического лигирования. Изучены свойства и реакционная способность синтезированных аналогов субстратов, исследовано их взаимодействие с Fpg E. coli, определены константы диссоциации ДНК-белковых комплексов. Изучено каталитическое расщепление модифицированных ДНК-дуплексов Fpg и найдены новые негидролизуемые аналоги субстратов этого фермента. Подобраны оптимальные условия для ковалентного связывания реакционноспособных ДНК-дуплексов с ферментом и получены специфические ковалентные ДНК-белковые комплексы, что позволило определить контакты нуклеофильных аминокислот Fpg E. coli с фосфатными группами ДНК.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по биотехнологиям в медицине , автор научной работы — Рыхлевская А.И., Сидоркина О.М., Романова Е.А., Орецкая Т.С., Лаваль Ж.

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Текст научной работы на тему «Определение контактов фосфатных групп ДНК с нуклеофильными аминокислотами фермента репарации формамидопиримидин-ДНК гликозилазы E. сoli»

УДК 547.693.32.057:542.95

ОПРЕДЕЛЕНИЕ КОНТАКТОВ ФОСФАТНЫХ ГРУПП ДНК С НУКЛЕОФИЛЬНЫМИ АМИНОКИСЛОТАМИ ФЕРМЕНТА РЕПАРАЦИИ ФОРМАМИДОПИРИМИДИН-ДНК ГЛИКОЗИЛАЗЫ

E. coli

А. И. Рыхлевская1, О. М. Сидоркина3, Е. А. Романова2, Т. С. Орецкая1*, Ж. Лаваль3, С. А. Кузнецова

(химический факультет, 2Институт физико-химической биологии им. А.Н. Белозерского Московского государственного университета им. М.В. Ломоносова, Воробьевы горы, Москва 119899, Россия; тел.: 939-31-48; e-mail: oretskaya@genebee.msu.su); 3Институт Гюстава Русси, Вильжуиф, Франция)

Для зондирования активного центра Fpg E. coli и определения контактов белка с фосфатными группами в ДНК использовали набор реакционноспособных аналогов субстратов, содержащих в своей структуре одновременно остаток 8-OG и тризамещенные пирофосфатные меж-нуклеотидные группировки в различных положениях по отношению к нему. Модифицированные ДНК-дуплексы были получены методом химического лигирования. Изучены свойства и реакционная способность синтезированных аналогов субстратов, исследовано их взаимодействие с Fpg E. coli, определены константы диссоциации ДНК-белковых комплексов. Изучено каталитическое расщепление модифицированных ДНК-дуплексов Fpg и найдены новые не-гидролизуемые аналоги субстратов этого фермента. Подобраны оптимальные условия для ковалентного связывания реакционноспособных ДНК-дуплексов с ферментом и получены специфические ковалентные ДНК-белковые комплексы, что позволило определить контакты нуклеофильных аминокислот Fpg E. coli с фосфатными группами ДНК.

Репарация ДНК является одним из основных процессов, обеспечивающих стабильность и целостность генетической информации. Нарушения в системе репарации могут приводить к преждевременному старению, заболеваниям аутоиммунной системы, кардиологическим, онкологическим и ряду других [1-4]. Изучение основ механизма репарации, и в частности исследование субстратной специфичности и механизма действия ферментов, принимающих участие в этом процессе, является одной из приоритетных задач современной биоорганической химии, молекулярной биологии и медицины. Ключевую роль в репарации повреждений ДНК, вызванных воздействием активного кислорода, играет фермент эксцизионной репарации ДНК - формамидопиримидин-ДНК гликозилаза E. coli (Fpg) [5, 6]. Этот фермент узнает и выщепляет из ДНК остатки 7,8-дигидро-8-оксогуанина (8-OG) - наиболее распространенные повреждения ДНК, образующиеся под действием окислительных агентов, и является удобной моделью для исследования механизма действия репарирую-щих ферментов данного типа [7-10].

Целью настоящей работы явилось определение контактов Fpg E. coli с углеводофосфатным остовом ДНК. Для этого проводили зондирование активного центра фермента с помощью набора аналогов субстратов, содержащих в своей структуре одновременно остаток 8-OG и тризаме-щенные пирофосфатные межнуклеотидные группы в раз-

*Адресат для переписки.

личных положениях по отношению к нему. Модифицированные ДНК-дуплексы, содержащие реакционноспособ-ные тризамещенные пирофосфатные группы, предложенные нами ранее, успешно используются в настоящее время в качестве эффективных аффинных реагентов для кросслинкинга с ДНК-узнающими белками, поскольку ре-акционноспособные межнуклеотидные группы в этих соединениях способны образовывать специфические кова-лентные комплексы с нуклеофильными аминокислотами белков, сближенными с ними в составе фермент-субстратного комплекса [11-14].

В работе синтезированы модифицированные ДНК-дуплексы, содержащие остаток 8-OG и тризамещенные пиро-фосфатные межнуклеотидные группы, исследовано их взаимодействие с Fpg E. coli и определены константы диссоциации ДНК-белковых комплексов.

Исследовано каталитическое расщепление этих соединений Fpg и найдены новые негидролизуемые аналоги субстратов этого фермента.

Подобраны оптимальные условия для ковалентного связывания реакционноспособных ДНК-дуплексов с белком, получены специфические ковалентные ДНК-белковые комплексы.

Определены специфические контакты нуклеофильных аминокислот Fpg E. coli с фосфатными группами ДНК в составе фермент-субстратного комплекса.

С х е м а

I I Ш IY Y YI

5' AgC TTg CAT gCp*Cp*Tp*(8-OxoG)p*Ap*gp*gT CgA CTC TAg Ag 3' 3' g AAC gTA Cg—g—A--------C--------T----C--CA gCT gAg 5'

o O

p*^O-P-"O-P-O- (дуплексы (I)-(VI)), OAlk O-

Alk=Et ((I) - (III), (V)-(VI), Me (IV). OO

p*^O-P—O-P-O— (дуплекс (IVa)),

r I I

OH O-O

p*—O-P-O— (дуплекс (IVn)). OH

Синтез реакционноспособных аналогов субстратов - Fpg E. coli

Для синтеза серии модифицированных ДНК-дуплексов (I)-(VI), содержащих одновременно остаток 8-OG и тризамещенные пирофосфатные группировки (их структура представлена на схеме), использовали метод химического лигирования, разработанный нами ранее для введения тризамещенных пирофосфатных групп в угле-водофосфатный остов ДНК [14]. Модифицированные межнуклеотидные группы вводили в пентануклеотидный участок с центральным нуклеотидом 8-OG, поскольку этот участок вовлечен в специфическое взаимодействие с белком. ДНК-дуплексы (I)-(VI) получали в результате конденсации 5'-фосфатной группы одного олигонуклео-тида с 3'-0-алкилфосфатной группой смежного олиго-нуклеотида, сближенных на комплементарной 22-звенной матрице.

Олигонуклеотиды, входящие в состав исходных ДНК-дуплексов, получали стандартным амидофосфитным методом на ген-синтезаторе «Applied Biosystems 380B» (США) [15]. Эффективность химического лигирования за-

1 2 3 4 5 6

висела от структуры реакционного узла и варьировала от 12 до 60% (табл. 1).

При введении стабильной дизамещенной пирофосфат-ной группировки, не содержащей ненуклеотидного заместителя (IVa), образующейся в результате конденсации 3'- и 5'-концевых фосфатных групп смежных олигонуклеотидов, эффективность лигирования была значительно выше и достигала 90%. Это связано с различием в нуклеофильности дианионфосфата и моноанионфосфата моноэфирной природы, участвующих в реакции.

Реакционную способность синтезированных ДНК-дуплексов (I)-(VI) подтверждали, выдерживая их в 0,4 М водном растворе N-метилимидазола (pH 8,0) и 0,5 М водном растворе этилендиамина (pH 8,0) в условиях, разработанных нами ранее для специфического расщепления модифицированной группы [14, 16]. Как и ожидалось, все синтезированные ДНК-дуплексы, содержащие тризамещен-ные пирофосфатные группировки, количественно расщеплялись под действием нуклеофильных агентов по модифицированной межнуклеотидной группе.

Связывание модифицированных ДНК-дуплексов с Fpg E. coli

Для определения условий получения ковалентных комплексов Fpg с модифицированными ДНК-дуплексами, а также для изучения влияния тризамещенной пирофосфат-ной группы на эффективность их взаимодействия с ферментом было изучено связывание ДНК-дуплексов (I)-(VI) с Fpg. Поскольку в связывании и катализе участвуют

Т а б л и ц а 1

Эффективность химического лигирования дуплексов (I) - (VI)

Рис. 1. Связывание Fpg E. coli c ДНК-дуплексом (II): 1 - ДНК-дуплекс (II). Реакционные смеси, образующиеся при добавлении к дуплексу (II) 0,2; 0,4; 0,6; 1,0 и 1,5 нМ Fpg E. coli (дорожки 2, 3, 4, 5 и 6 соответственно)

(I) (II) (III) (IV) (IVa) (V) (VI)

12% 43% 60% 54% 90% 44% 30%

Катализ

100 90 80 70 60 50 40 30 20 10 0

д dup IV n

* dup VI

25 30

t, мин

Рис. 2. Зависимость степени расщепления аналогов субстратов Fpg E. coli от времени инкубации с ферментом

только активные молекулы белка, то нами предварительно была определена концентрация активных молекул Fpg E. coli. Для этого мы использовали метод Скэтчарда [17].

Связывание Fpg E. coli с модифицированными ДНК-дуплексами (I)-(VI) проводили буфере Д при температуре 0° в течение 5 мин. В качестве примера на рис. 1 представлен радиоавтограф нативного гель-электрофореза, полученный при связывании ДНК-дуплекса (II) с ферментом. Как видно из этого рисунка, с увеличением концентрации белка эффективность связывания увеличивается, а при концентрации 1 ,5 нМ происходит полное связывание модифицированного субстрата.

Оказалось, что все синтезированные ДНК-дуплексы (I)-(VI), содержащие тризамещенные пирофосфатные группы, а также дуплекс (IVa), содержащий стабильную дизамещенную пирофосфатную группу, эффективно связываются с ферментом. Известно, что введение пирофос-фатных группировок в структуру природных субстратов может изменять эффективность их связывания с ферментами. Так, эффективность связывания урацил-ДНК глико-зилазы с ДНК-дуплексом, содержащим дизамещенную пирофосфатную группу с З'-конца по отношению к остатку дезоксиуридина, была на 4 порядка ниже, чем с аналогичными субстратами природного строения [18]. В то же время введение этой модифицированной группы в структуру аналога субстрата Fpg (ДНК-дуплекс (IVa)) непосредственно с З'-конца от 8-OG хотя и приводило к уменьшению эффективности связывания, но значительно

Рис. 3. Радиоавтограф 12% SDS-ПААГ, иллюстрирующий связывание ДНК-дуплексов (III) и (IV) с ферментом в оптимальных условиях

в меньшей степени (табл. 2). Специфичность связывания Fpg с модифицированными ДНК-дуплексами была подтверждена методом конкурентного вытеснения избытком холодного субстрата. Константы диссоциации комплексов аналогов субстратов (I)-(VI) с белком приведены в табл. 2. Они были рассчитаны как описано в работе [19]. Как видно из табл. 2, эффективность связывания зависела от положения модифицированной межнуклеотидной группы и ее природы. Так, введение тризамещенной пирофос-фатной группы с З'-конца от остатка 8-OG и через одно звено от него (дуплексы (IV) и (V)) значительно уменьшало эффективность связывания с ферментом по сравнению с эффективностью связывания природного субстрата (IVn). Введение модификации с 5'-конца от 8-OG (дуплексы (II) и (III)) также приводило к уменьшению эффективности связывания, однако в меньшей степени, чем для дуплексов (IV) и (V). Эти данные свидетельствуют о том, что межнуклеотидные фосфаты с З'-конца от остатка 8-OG играют особую роль в узнавании и связывании Fpg с ДНК. В случае ДНК-дуплекса (IVa), когда с З'-конца от 8-OG находилась дизамещенная пирофосфатная группа, т.е. при введении дополнительного отрицательного заряда, значение константы увеличивалось (от З.1 нМ для дуплекса (IV) до 4,1 нМ для дуплекса (IVa)), что свидетельствует о том, что такие субстраты хуже узнаются белком и связываются с ним. По мере удаления модифицированных межнуклеотидных групп от остатка 8-OG значение константы диссоциации уменьшалось.

Каталитическое расщепление модифицированных ДНК-дуплексов Fpg E. coli.

Каталитическое расщепление модифицированных ДНК-дуплексов ферментом Fpg E. coli проводили, как описано

Т а б л и ц а 2

Константы диссоциации аналогов субстратов Fpg E. coli

Номер дуплекса (I) (II) (III) (IV) (™а) (IVn) (V) (VI)

Kd, nM 0,19±0,04 0,72±0,14 1,0±0,2 3,1±0,6 4,1±0,8 0,35±0,07 1,1±0,2 0,38±0,08

в [20]. На рис. 2 представлены кривые зависимости доли расщепленных ДНК-дуплексов (I)-(VI), (IVa) и (IVn) от времени инкубации с белком. Оказалось, что все дуплексы, за исключением дуплексов (IV) и (IVa), расщепляются ферментом. Эффективность расщепления зависела от положения модифицированной группы и была выше, когда тризамещенная группировка находилась с 5'-конца от остатка 8-OG. Так, дуплексы (I)-(III) расщеплялись ферментом даже более эффективно, чем природный субстрат (IVn). Это может быть связано с тонкими конформацион-ными изменениями в структуре этих субстратов, способствующими ускорению каталитического процесса.

В то же самое время дуплекс (IVa), содержащий стабильную дизамещенную пирофосфатную группу с 3'-кон-ца от остатка 8-OG (как и дуплекс IV, содержащий реакци-онноспособную тризамещенную пирофосфатную группу с 3'-конца от остатка 8-OG), не расщеплялся ферментом. Известно, что механизм каталитического выщепления остатков 8-OG ферментом Fpg E. coli включает расщепление фосфодиэфирных связей с 3'- и 5'-концов от остатка 2'-дезоксирибозы, образующейся в результате дегликози-лирования, по механизму последовательного ß-5-элимини-рования [21]. На основании полученных данных можно предположить, что Fpg E. coli не расщепляет ДНК-дуплексы (IV) и (IVa), поскольку модифицированная межнук-леотидная группа, расположенная с 3'-конца от 8-OG, препятствует ß-элиминированию. Таким образом, мы обнаружили, что дуплексы (IV) и (IVa) - негидролизуемые аналоги субстратов Fpg E. coli. Эти соединения являются наиболее близкими к физиологическим субстратам структурными аналогами Fpg и могут быть использованы для рентгеноструктурного анализа ДНК-белкового комплекса.

Региоспецифическое ковалентное связывание реакционноспособных аналогов субстратов с Fpg E. coli

Региоспецифическое ковалентное связывание Fpg E. coli с ДНК-дуплексами (I)-(VI) изучали в условиях, подобранных нами в экспериментах по нековалентному связыванию. Реакционноспособные аналоги субстратов выдерживали с ферментом в буфере Д, варьируя температуру и время инкубации. В работе [11] было показано, что в присутствии N-метилимидазола эффективность кова-лентного связывания может возрастать за счет N-метили-мидазольного катализа, поэтому реакцию проводили в присутствии N-метилимидазола.

Оказалось, что специфический кросслинкинг наблюдается только в случае ДНК-дуплексов (III) и (IV), содержащих тризамещенные пирофосфатные группы с 5'- и 3'-концов от остатка 8-OG соответственно. Максимальная эффективность связывания (30%) наблюдалась в случае дуплекса (IV) при температуре 20° в присутствии 0,05 М N-метилимидазола (рис. 3). С меньшей эффективностью ковалентно связывался с ферментом дуплекс (III) (10%). Образование ковалентных комплексов аналогов субстратов (III) и (IV) с Fpg E. coli является прямым экспери-

ментальным доказательством сближенности нуклеофиль-ных групп аминокислот белка, формирующих активный центр Fpg, с межнуклеотидными фосфатами с 3'- и 5'-концов от 8-OG в ДНК.

Таким образом, в настоящей работе впервые было проведено зондирование активного центра Fpg E. coli с помощью набора синтетических ДНК-дуплексов, содержащих реакционноспособные тризамещенные пирофос-фатные группировки в различных положениях от остатка 8-OG.

В ходе работы было установлено наличие контактов фосфатных групп субстрата, расположенных с 3'- и с 5'-конца от остатка 8-OG, с нуклеофильными группами аминокислот фермента Fpg E. coli, в составе фермент-субстратного комплекса. В продолжение этих исследований планируется идентифицировать природу аминокислот, вовлеченных в специфические взаимодействия с фосфатными группами ДНК. Результаты исследования могут быть использованы при изучении про- и эукариотических гомологов Fpg, а также других репарирующих ферментов. В совокупности с результатами других исследований они позволят пополнить знания о механизмах репарации ДНК.

Экспериментальная часть

В работе использовали КДИ, МЭС, ЭДА («Merck»), EDTA, LiClO4 («Fluka»); акриламид, N,N'-метиленбисак-риламид, KCl («Serva»); HEPES, MgCl2 («Sigma»); поли-

32

нуклеотидкиназу Т4 (МБИ « Ферментас »); [у- P] ATP (1000 Ки/ммоль; «Изотоп»). Вода очищена на системе лабораторной очистки «Millipore».

5'-32Р-метку вводили фосфорилированием олигонукле-отидов (2, 4, 6, 8, 10 и 12) с помощью Т4-полинуклео-тидкиназы.

Олигодезоксирибонуклеотиды природного строения, использованные в работе, были синтезированы на автоматическом ДНК-синтезаторе «Applied Biosystems 380B» (США) по стандартной амидофосфитной схеме [15]. Синтез модифицированных олигонуклеотидов с включением остатков 7,8-дигидро-8-оксогуанина был осуществлен с использованием коммерческого З'-амидофосфитного производного модифицированного 2'-дезоксигуанозина («Glen Research»). Деблокирование функциональных групп олигомеров проводили концентрированным аммиаком в присутствии 0,25 М 2-меркаптоэтанола (36 ч, 20°). Синтез олигонуклеотидов с 3'-алкилфосфатной группой проводили с использованием предварительно синтезированного модифицированного твердофазного носителя для автоматического олигонуклеотидного синтеза, как описано нами ранее [23].

Фермент формамидопиримидин-ДНК гликозилаза E. coli предоставлен для работы доктором Ж. Лавалем (Институт Густава Русси, Париж, Франция).

Буферные растворы: А - 0,05 М МЭС (pH 6,0), 0,02 M MgCl2; Б - 0,5 M МЭС (pH 4,5), 1M MgCl2; В - 0,05 M Трис-борат (pH 8,5), 0,001 M EDTA; Г - 0,4 M N-MeIm (pH 8,0), 0,2 M NaCl, 0,12 M MgCl2; Д - 0,025 M HEPES

(pH 7,6), 0,1 M KCl, 0,005 M ß-меркаптоэтанол. 0,002 M Na2EDTA, 0,1% (w/v) BSA, 6% (v/v) глицерин; E - 0,089 М Трис-борат (pH 8,5) (Ж), 0,025М Трис (pH 8,3), 0,2 М глицин, 0,1% SDS.

Получение модифицированных ДНК-дуплексов методом химического лигирования. К 0,15 о.е. исходных дуплексов (I)-(VI) в 14 мкл буфера А (общенуклеотидная концентрация С0 составила 10-3М) добавляли 1 мкл 3 М КДИ (конечная концентрация КДИ составила 0,2 М). Реакцию проводили в течение 3-4 сут при 20° в темноте, затем анализировали реакционные смеси с помощью электрофореза в пластинах 20%-го ПААГ, содержащего 7 М мочевину, в буфере В при постоянном напряжении 1200 В с последующей радиоавтографией. Выходы продуктов химического лигирования в дуплексах I-VI варьировали от 12 до 90%.

Аминолиз и гидролиз ДНК-дуплексов (I)-(VI). 0,10,5 нмоль дуплексов выдерживали в 0,5 М водном растворе ЭДА (pH 8,0) или в буфере Г при 20° в течение 20 ч. Реакционные смеси анализировали гель-электрофорезом, как описано выше.

Определение активности Fpg E. coli методом Скэт-чарда. Для определения концентрации активных молекул Fpg методом Скэтчарда изучали связывание 5-20 фмоль ДНК-дуплекса (IVn) с 4 нМ фермента в 20 мкл буфера Д при температуре 0° в течение 5 мин. Метод расчета активности фермента из полученных данных описан в [17].

Связывание модифицированных ДНК-дуплексов с Fpg E. coli. К 10-100 фмолям ДНК добавляли 1-100 нМ белка в 20 мкл буфера Д. Смесь инкубировали в течение 5 мин. при температуре 0°, затем анализировали с помощью электрофореза в пластинах 10%-го нативного ПААГ в буфере Е при постоянном напряжении 120 В, с последующей радиоавтографией.

Каталитическое расщепление ДНК-дуплексов (I)-(VI) ферментом Fpg E. coli. 1 0-100 фмоль модифицированных ДНК-дуплексов (I)-(VI) инкубировали с З0 нг фермента в 12 мкл буфера Д при температуре З7°. Из реакционной смеси через 2, 5, 10, 20, З0 и 60 мин отбирали по 2 мкл раствора, добавляли З мкл смеси bpb и xc в 80%-м водном растворе формамида и анализировали с помощью электрофореза в пластинах 20%-го ПААГ в буфере В в присутствии 7 М мочевины при постоянном напряжении 1200 В.

Ковалентное связывание реакционноспособных аналогов субстратов с Fpg E. coli. К 10-100 фмолям ДНК-дуплексов (I)-(VI) добавляли 10-100 нМ белка в 20 мкл буфера Д, а также в некоторых случаях 1,6 мкл 0,64 М N-MeIm (конечная концентрация составила 0,05 М). Смесь инкубировали в течение 24 ч при температуре 0 и 20°. Реакционные смеси анализировали с помощью электрофореза по Лэммли в пластинах 12%-го денатурирующего ПААГ, содержащего 0,1% SDS в буфере Ж при постоянном напряжении 200 В, с последующей радиоавтографией.

Работа выполнена в рамках гранта ЮТА8 (№ 97-1645) при поддержке РФФИ (№2 00-04-48253), а также гранта

Ведущие научные школы (№2 00-15-97944).

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

1. Zhang Q.-M., Ishicawa N., Nakahara T., Yonei S. // Nucleic Acids

Res. 1998. 26. P. 4669.

2. Lipinski L.J., Hoehr N., Mazur S.J., Dianov G.L., Senturker S.,

Dizdaroglu M., Bohr V.A. // Nucleic Acids Res. 1999. 27. P. 3153.

3. Tano K., Akasaka S., Hashimoto M., Asano M., Yamamoto K.,

Utsumi H, Takimoto K. // Mutat. Res. 1998. 420. P. 7.

4. Alhama J., Ruiz-Laguna J., Rodriguez-Ariza A., Toribio F., Lopez-

Barea J., Pueyo C. // Mutagenesis. 1998. 13. P. 589.

5. Boiteux S., O'Connor T.R., Laval J. // EMBO J. 1987. 6. P. 3177.

6. Bailly V., Verly W.G., O'Connor T.R., Laval J. // Biochem. J. 1989.

262. P. 581.

7. Menissier-de Murcia J., Molinete M., Gradwohl G., Simonin F.,

Murcia G.de // J. Mol. Biol. 1989. 210. P. 229.

8. Mazen A., Menissier-de Murcia J., Molinete M., Simonin F.,

Gradwohl G., Poirer G., Murcia G. de // Nucleic Acids Res. 1989. 17. P. 4689.

9. Angulo J.F., Rouer E., Mazin A., Tissier A., Horellou P., Benarous

R., Devoret R.// Nucleic Acids Res. 1991. 19. P. 5117.

10. Navaratham S., Myles G.M., Strange R.W., Sancar A. // J. Biol. Chem. 1989. 264. P. 16067.

11. Purmal A.A., Shabarova Z.A. // Nucl. Acids Res. 1992. 20. С. 3713.

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

12. Kuznetsova S.A., Catherine C., Edgardo U., Elias I., Vasseur M., Blumenfeld M., Shabarova Z.A. // Nucl. Acids Res. 1996. 24. P. 4783.

13. Ивановская М.Г., Козлов И.А., Кубарева Е.А., Таран Е.А., Са-разев Т.В., Шабарова З.А. //Мол. биол. 1997. 31. С. 435.

14. Кузнецова С.А., Ивановская М.Г., Шабарова З.А. // Биоорг. Химия. 1990. 16. С. 219.

15. MatteucciM.D., Caruthers M.H. // J. Am. Chem. Soc. 1981. 103. P. 3185.

16. Кузнецова С.А., Ивановская М.Г., Шабарова З.А. // Биоорг. химия. 1991. 17. С. 1633.

17. Shilov I., Tashlitsky V., Khodoun M., Vasil'ev S., Alekseev Y., Kuzubov A., Kubareva E., Karyagina A. // Nucl. Acids Res. 1998. 26. P. 2659.

18. Purmal A.A., Wallace S.S., Kow Y.W. // Biochemistry. 1996. 35. P. 16630.

19. Castaing B., Boiteux S., Zelwer C. // Nucleic Acids Res. 1992. 20. P. 389.

20. Castaing B., Geiger A., Seliger H., Nehls P., Laval J., Zelwer C., Boiteux S. // Nucleic Acids Res. 1993. 21. P. 2899.

21. BhagwatM, Gerlt J.A. // Biochemistry. 1996. 35. P. 659.

22. Долинная Н.Г., Громова Е.С., Михайлов С.Н., Шабарова З.А. // Биоорг. химия. 1978. 4. С. 535.

23. Нарышкин Н.А., Ивановская М.Г., Орецкая Т.С., Волков Е.М., Гейт М.Дж., Шабарова З.А. // Биоорг химия. 1996. 22. С. 691.

Поступила в редакцию 20.06.00

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.