Научная статья на тему 'НОВЫЕ МУТАЦИИ В ГЕНЕ SPIKE КОРОНАВИРУСА SARS-COV-2 У ПАЦИЕНТОВ С COVID-19'

НОВЫЕ МУТАЦИИ В ГЕНЕ SPIKE КОРОНАВИРУСА SARS-COV-2 У ПАЦИЕНТОВ С COVID-19 Текст научной статьи по специальности «Биотехнологии в медицине»

CC BY
1
0
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
Журнал
Гематология и трансфузиология
WOS
Scopus
ВАК
CAS
RSCI
PubMed
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по биотехнологиям в медицине , автор научной работы — Абдуллаев А.О., Тихомиров Д.С., Адышаа Ч.М., Туполева Т.А., Гаврилина О.А.

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Текст научной работы на тему «НОВЫЕ МУТАЦИИ В ГЕНЕ SPIKE КОРОНАВИРУСА SARS-COV-2 У ПАЦИЕНТОВ С COVID-19»

| ГЕМАТОЛОГИЯ И ТРАНСФУЗИОЛОГИЯ | RUSSIAN JOURNAL OF HEMATOLOGY AND TRANSFUSIOLOGY (GEMATOLOGIYA I TRANSFUSIOLOGIYA) | 2022; ТОМ 67; №2 |

ТЕЗИСЫ VI КОНГРЕССА ГЕМАТОЛОГОВ И III КОНГРЕССА ТРАНСФУЗИОЛОГОВ РОССИИ

Абдуллаев А. О., Тихомиров Д. С., Адышаа Ч. М., Туполева Т. А., Гаврилина О. А., Судариков А. Б.

НОВЫЕ МУТАЦИИ В ГЕНЕ SPIKE КОРОНАВИРУСА SARS-COV-2 У ПАЦИЕНТОВ С COVID-19

ФГБУ «НМИЦ гематологии» Минздрава России

Введение. Рецепторный белок Spike коронавируса SARS-CoV-2, взаимодействуя с рецептором АСЕ2, обеспечивает вхождение вируса в клетку. Многие вакцины, включая Спутник V, в качестве антигена содержат полноразмерный ген Spike SARS-CoV-2. Мутации в гене Spike приводят к изменению биологии SARS-CoV-2, делая его более вирулентным и устойчивым к вируснейтра-лизующему эффекту антител, выработанных после вакцинаций. Сравнительный анализ спектра мутаций гена Spike SARS-CoV-2 в начале и конце пика второй волны пандемии COVID-19, позволит выявить появление новых изолятов с характерными им мутациями в гене Spike SARS-CoV-2.

Цель работы. Изучить спектр мутаций гена Spike SARS-CoV-2, выявленных в период второй волны пандемии COVID-19 в РФ.

Материалы и методы. В качестве материала использованы РНК SARS-CoV-2 от 51 пациента с COVID-19, диагностированной в периоды подъема (11—17 ноября 2020 г.) и угасания (с 19 февраля по 17 марта 2021 г.) второй волны распространения COVID-19 в РФ. Для секвенирования всего гена Spike были синтезированы олигонуклеотиды со следующей последовательностью:

5-CAACAGAGTTGTTATTTCTAGTGATGT-3' и 5'-TCTGAACTCACTTTCCATCCA-3';

5-TGATCCATTTTTGGGTGTTT-3' и 5-CAGTGAAGGATTTCAACGTACA-3';

5'-TGTGCACTTGACCCTCTCTC-3' и 5-TCAAAAGGTTTGAG ATTAGACTTCC-3';

5'-TCTTGATTCTAAGGTTGGTGGT-3' и 5'-AACAGGGACTTCTGTGCAGTT-3';

5'-TCTTTTGGTGGTGTCAGTGTT-3' и 5'-CTGCCATATTGCAACAAAAGA-3';

5'-GTACATTTGTGGTGATTCAACTG-3' и 5'-CATTAAACCTATAAGCCATTTGC-3';

5'-GCAGGTGCTGCATTACAAAT-3' и 5'-ACCATGAGGTGCTGACTGAG-3';

5'-CAAAAAGAGTTGATTTTTGTGGA-3' и 5'-ATTGAGGCGGTCAATTTCTT-3';

5'-ATGATCCTTTGCAACCTGAA-3' h5'-TGAAGATTCTCATAAACAAATCCA-3'.

Результаты и обсуждение. Схематическая структура гена Spike и расположение найденных мутаций представлены на рис. Как представлено на рис., в зависимости от времени сбора образцов РНК SARS-CoV-2 все пациенты разделены на две группы. В первую группу вошли 36 пациентов с COVID-19, диагностированной в период подъема второй волны (11—17 ноября 2020 г.). Частота мутаций в гене Spike данной группы пациентов составила

11% (4/36), не считая известную мутацию p.D614G субъединицы S2. Почти все найденные мутации (p.C361S; р.А522С; S477N+ р.А522С) в основном располагались в рецептор-связывающем домене (Receptor Binding Domain, RBD) гена Spike. Вторую группу составили 15 пациентов с COVID-19, диагностированной в период угасания второй волны (с 19 февраля по 17 марта 2021 г.). Частота мутаций в гене Spike составила 53% (8/15). Мутации в RBD-домене гена Spike в этой группе были представлены p.S477N; р.Е484К; p. S477N+A522S; p.E484A+S494P; p.K417N+E484K+N501Y; p.F306L+E484K+S494P. В образце РНК с комбинацией мутаций RBD-домена гена Spike p.K417N+E484K+N501Y далее были выявлены все мутации, характерные для южноафриканского штамма В.1.351. Это был один из первых случаев выявления данного штамма в России еще до официального объявления Роспотребнадзором его появления в РФ.

Заключение. Молекулярно-генетический мониторинг мутационного статуса гена Spike у пациентов с COVID-19 позволяет своевременно выявить появление и эпидемиологическое доминирование новых штаммов SARS-CoV-2, возможно, устойчивых к воздействию поствакцинационных антител.

Александрова Т. Н.1, Терехова Л. Д.1, Соловьева И. Е.1, Мулина И. И.1, Парфенова С. Н.1, Прядезникова А. М.1, Ядрихинская В. Н.2

МНОГОЛЕТНИЙ ОПЫТ ТЕРАПИИ ХРОНИЧЕСКОГО МИЕЛОЛЕЙКОЗА В РЕСПУБЛИКЕ САХА (ЯКУТИЯ)

1ГАУ РС(Я) «Республиканская больница № 1 — Национальный центр медицины», Клинический центр, отделение гематологии, 2ФГАОУ ВО «Северо-Восточный федеральный университет имени М.К. Аммосова», Медицинский институт, кафедра «Госпитальная терапия, профессиональные болезни и клиническая фармакология»

Введение. Открытие химерного гена BCR/ABL и последующее активное внедрение в клиническую практику ингибиторов тирозинкиназ (НТК) кардинально изменило прогноз заболевания, сопоставив среднюю продолжительность жизни больных хроническим миелолейкозом (ХМЛ) с общепопуляционными показателями, а также значительно улучшило качество жизни пациентов. Однако, несмотря на достигнутый прогресс, у 5% пациентов наблюдается прогрессирование хронической фазы (ХФ) в фазу бластного криза (БК), при котором прогноз заболевания

остается крайне неблагоприятным, а у 37—50% больных, получающих терапию первой линии иматинибом, появляется необходимость смены препарата.

Цель работы. Проанализировать эффективность терапии ХМЛ в Республике Саха (Якутия).

Материалы и методы. Проведен ретроспективный анализ медицинских карт взрослых пациентов с ХМЛ, наблюдавшихсяу гематологов клинико-консультативного отдела клинико-диагностического центра ГАУ РС(Я) «РБ№ 1 — НЦМ» г. Якутска Республики

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.