Научная статья на тему 'Моделирование в исследовании биологических систем 1. Методы статистического (имитационного) моделирования'

Моделирование в исследовании биологических систем 1. Методы статистического (имитационного) моделирования Текст научной статьи по специальности «Компьютерные и информационные науки»

CC BY
325
61
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Аннотация научной статьи по компьютерным и информационным наукам, автор научной работы — Шишкин В.А.

Статья посвящена рассмотрению метода статистического (имитационного) моделирования в исследовании биологических систем и, в частности. биосистем растительного происхождения. Это первая статья в серии, посвященной рассмотрению данной проблемы.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Simulation in investigation of biological systems. 1. Method of statistical simulation

The method of statistical simulation in investigation of biological systems and specifically in biosystems of vegetation origin has been regarded in this article. This is the first article in series devoted to the given problem.

Текст научной работы на тему «Моделирование в исследовании биологических систем 1. Методы статистического (имитационного) моделирования»

Список литературы

1. Витрук С.К. Пособие по функциональным методам исследования сердечно-сосудистой системы. - Киев: Здоровье, 1990. - 224 с.

2. Дашина Т.А., Крикорова С.А.. Современные представления о фитоароматерапии // Вопросы курортологии, физиотерапии и лечебной физической культуры. - 1999. - № 2. - С. 47-53.

3. Ковалёв В.М., Павлий О.И., Исакова Т.И. Фармакогнозия с основами биохимии растений. -Харьков: Прапор, 2000. - 703 с.

4. Короленко Е.С., Николаевский В.В., Солдатченко С.С. Растительные ароматические биорегуляторы и их использование в практическом эдравоохранении // Научно - практическая конференция «Актуальные вопросы производства и использования природных биорегуляторов»: Тез. докл. - Ялта, 1994. - С.11.

5. Лакин Г.Ф. Биометрия: Учеб. пособие для биол. спец. вузов - 4-е изд. перераб. и доп. - Москва: Высш.шк., 1990. - 352 с.

6. Нагрузочное тестирование в оценке реабилитационного потенциала: Методические рекомендации /Сост. В.И. Малыгина - Симферополь, 2003. - 54 с.

7. Уилмор Дж.Х., Костил Д.Л., Физиология спорта / Пер. с англ. А. Ященко. - Киев: Олимпийская литература, 2001. - 502 с.

Рекомендовано к печати д.б.н., проф. Работяговым В.Д,

МЕТОДИКА ИССЛЕДОВАНИЙ

МОДЕЛИРОВАНИЕ В ИССЛЕДОВАНИИ БИОЛОГИЧЕСКИХ СИСТЕМ 1. МЕТОДЫ СТАТИСТИЧЕСКОГО (ИМИТАЦИОННОГО) МОДЕЛИРОВАНИЯ

В.А.ШИШКИН, кандидат технических наук Никитский ботанический сад - Национальный научный центр

Введение

Системный подход при исследовании сложных систем предусматривает использование различных методов моделирования. Это обуславливается разнообразными требованиями, предъявляемыми к результатам исследований. К таким можно отнести растянутые во времени процессы, сложные с точки зрения постановки эксперимента, многоуровневые эксперименты со смешанными временными факторами и наконец, очень дорогостоящие эксперименты. В таких случаях различные методы моделирования исследовательского процесса позволяют устранить подобные недостатки.

Объект и методы исследования

В исследовании биологических систем доминирующим недостатком является длительность периода исследований. Кроме того, динамика процесса во многих случаях меняется достаточно плавно, без особо резких скачков. В таких случаях наиболее приемлемым является метод статистического (имитационного) моделирования [1].

Сущность метода статистического моделирования сводится к построению моделирующего алгоритма, имитирующего поведение и взаимодействие элементов системы с учетом случайных входных воздействий и воздействий внешней среды Е и реализации этого алгоритма с использованием программно-технических средств [2].

Различают две области применения метода статистического моделирования:

- для изучения стохастических систем;

- для решения детерминированных задач.

Основной идеей, которая используется для решения детерминированных задач методом статистического моделирования, является замена детерминированной задачи эквивалентной схемой некоторой стохастической системы, выходные характеристики последней совпадают с результатом решения детерминированной задачи. При такой замене погрешность уменьшается с увеличением числа испытаний (реализации моделирующего алгоритма) N.

Результаты и обсуждение

В результате статистического моделирования системы получается серия частных значений искомых величин или функций, статистическая обработка которых позволяет получить сведения о поведении реального объекта или процесса в произвольные моменты времени. Если количество реализации N достаточно велико, то полученные результаты моделирования системы приобретают статистическую устойчивость и с достаточной точностью могут быть приняты в качестве оценок искомых характеристик процесса функционирования системы 5 [4].

Поскольку речь идет о исследовании стохастических систем, то закономерно воспользоваться «методом Монте-Карло», как основополагающим в решении задач статистического моделирования [3,5]. Метод Монте-Карло предполагает генерирование последовательности выборочных значений случайной величины с заданным распределением [7,8].

Случайные величины обычно моделируют с помощью преобразований одного или нескольких независимых значений случайной величины а, равномерно распределенной в интервале (0,1). Независимые случайные величины, равномерно распределенные в интервале (0,1).

Выделяются следующие этапы моделирования случайных величин:

- генерирование N реализаций случайной величины с заданным нормальным распределением;

- преобразование полученной величины, определяемой моделью;

- статистическая обработка полученной реализации.

На этапе статистической обработки действуют методы, определенные статистическим анализом.

Общую схему процесса можно представить в следующей последовательности:

- подготовка исходных данных;

- генерирование случайных чисел с равномерным распределением;

- преобразование выборки в вид с заданным законом распределения;

- статистическая обработка данных.

Имитационные системы имеют следующие функциональные блоки:

- имитации входных процессов;

- имитации правил переработки входной информации исследуемой системы;

- накопления информации в результате моделирования;

- анализа накопленной информации;

- управления имитирующей системы.

Рис. 1 Блок-схема процесса имитационного моделирования

В представленной блок-схеме

ИД - исходные данные

ГСЧ - генератор случайных чисел

ГВП - генератор входных процессов

ИС - имитационная система

СО - статистическая обработка данных

На первом этапе находят наиболее подходящие методы и алгоритмы для описания аналитических функций распределения и проводят вычисления (блок ИД) для определения исходных данных.

В блоках (ГСЧ и ГВП) производится генерирование случайных чисел с равномерным распределением Е, и входных процессов.

Блок (ИС) имитирует работу исследуемой системы, результаты его работы накапливаются для последующей статистической обработки. В последнем блоке осуществляется статистическая обработка [6,9].

При моделировании систем на ЭВМ программная имитация случайных воздействий любой сложности сводится к генерированию некоторых стандартных (базовых) процессов и к их последующему функциональному преобразованию. В качестве базового может быть принят любой

удобный в случае моделирования конкретной системы процесс. Однако при дискретном моделировании базовым процессом является последовательность чисел {х = х0,х1,...,х1чГ^ представляющих собой реализации независимых, равномерно распределенных на интервале (0,1) случайных величин = или в статистических терминах повторную выборку из

равномерно распределенной на (0,1) генеральной совокупности значений величины £,.

Непрерывная случайная величина с имеет равномерное распределение в интервале (а,Ь), если ее функция плотности (рис. 2,а) и распределение (рис. 2,Ь) соответственно примут вид:

Рис.2. Равномерное распределение случайной величины

f (x) =

F(x) =

1/(a-b), a<x<b

0 , x < a,x > b

0

,x < a

(x-a)/(b-a), a<x<b 1 , x >b

Выводы

Таким образом, в результате проведенного анализа метода статистического моделирования была выявлена реальная возможность исследования биологических систем при различных заданных условиях. Одним из наиболее важных достоинств приведенного метода является его универсальность в вопросе «добычи» данных в условиях сложности проведения множественного эксперимента.

Список литературы

1. Ермаков С.М., Михайлов Г.А. Статистическое моделирование. - Изд. 2. - М.: Наука, 1982. -

296 с.

2. Ермаков С.М., Михайлов Г.А. Курс статистического моделирования. - М.: Наука, 1976. - С. 79.

3. Соболь И.М. Метод Монте-Карло. - 4-е изд. - М.: Наука, 1985. - С. 25-27.

4. Прикладная математика: Курс лекций / Под ред. А.А. Колесникова. - Л.: ВАС, 1987. - С. 6-41, 123-180.

5. Ермаков С.М. Метод Монте - Карло и смежные вопросы.-Изд 2. - М.: Наука, 1975. - 440 с.

6.Статистические методы в инженерных исследованиях: Учебное пособие/ Под ред. Г.К. Круга. -М.: Высш. шк., 1983. - 216 с.

7. Соболь И.М. Численные методы Монте-Карло. - 4-е изд. - М.: Наука, 1973 - 311 с.

8. Михайлов Г.А. Некоторые вопросы теории методов Монте - Карло. - Новосибирск: Наука, 1974. - 141 с.

9. Математическая теория планирования эксперимента / Под ред. С.М. Ермакова. - М.: Наука, 1983. - 392 с.

Рекомендовано к печати д.м.н. Ярош А.М.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.