Научная статья на тему 'МИКРОБИОЛОГИЧЕСКИЕ ПОКАЗАТЕЛИ ПАЦИЕНТОВ С ПОДТВЕРЖДЕННОЙ ИНФЕКЦИЕЙ COVID-19'

МИКРОБИОЛОГИЧЕСКИЕ ПОКАЗАТЕЛИ ПАЦИЕНТОВ С ПОДТВЕРЖДЕННОЙ ИНФЕКЦИЕЙ COVID-19 Текст научной статьи по специальности «Клиническая медицина»

CC BY
320
60
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
Ключевые слова
БАКТЕРИАЛЬНЫЕ ИНФЕКЦИИ / РЕЗИСТЕНТНОСТЬ К АНТИБИОТИКАМ / МИКРОБИОЛОГИЧЕСКИЙ МОНИТОРИНГ / BACTERIAL INFECTION / ANTIBIOTIC RESISTANCE / MICROBIOLOGIC MONITORING / БАКТЕРИАЛДЫқ ИНФЕКЦИЯЛАР / БАКТЕРИЯЛАРДЫң ТұРАқТЫЛЫғЫ / МИКРОБИОЛОГИЯЛЫқ МОНИТОРИНГ

Аннотация научной статьи по клинической медицине, автор научной работы — Бисенова Н.М., Ергалиева А.С.

Цель настоящего исследования - определить микробный пейзаж и антибиоитикочувствительность основных патогенов, выделенных от пациентов с COVID-19. Материалы и методы: Проведено проспективное микробиологическое исследование микробного пейзажа и антибиотикочувствительность штаммов, выделенных от пациентов c подтвержденной COVID-19 инфекцией, госпитализированных в АО «Национальный научный медицинский центр», г.Нур-Султан. Идентификацию выделенных изолятов и их антибиотикочувствительность проводили на микробиологическом автоматическом анализаторе Vitek 2 - Compact. Результаты: При исследовании микробного пейзажа клинического материала от данной категории пациентов всего выделено 282 штамма микроорганизма. Наибольшее количество выделенных микроорганизмов 51,6% (145) относились к стрептококкам, далее по частоте высеваемости Candida 24,8% (70). Грамотрицательные микроорганизмы в большинстве случаев были представлены штаммами A.baumanii 6,4% (18) и K.pneumoniae 3,5% (10). Выделенные штаммы обладали высоким уровнем резистентности к антимикробным препаратам. Заключение: Результаты нашего проспективного микробиологического исследования показали высокий процент выделения грибов р. Candida . Бактериальные инфекции, вызванные грамотрицательной флорой, отличались множественной лекарственной устойчивостью. Все это побуждает проведение микробиологического мониторинга с целью внесения изменений в тактику введения и лечения данной категории пациентов в соответствии с принципами рационального использования противомикробных препаратов.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по клинической медицине , автор научной работы — Бисенова Н.М., Ергалиева А.С.

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

MICROBIOLOGICAL INDICATORS OF PATIENTS WITH CONFIRMED INFECTION COVID-19

Background. The aim of this study was to identify etiological microorganisms and antibiotic resistance rates of bacterial infection in patients with COVID-19 infection. Materials and methods. A prospective microbiological study of the microbial landscape and antibiotic resistance of strains isolated from patients with confirmed COVID-19 infection, hospitalized in National Scientific Medical Research Center, Nur-Sultan, Kazakhstan. Identification of isolates and antibiotic susceptibility testing were performed by Vitek-2 automated system. Results: During study period, 282 strains were isolated; of them, the most frequently isolated microorganisms were as follows: Streptococcus viridans group 51.6%, Candida sp. 24.8%, Acinetobacter baumannii 6.4% and Klebsiella pneumoniae 3.5% with high level of antibiotic resistance. Conclusion. Based on our results, we report fungal and gram - negative bacterial infection with high level of antibiotic resistance in patients with COVID-19 infection. All this prompts the conduct of microbiological monitoring in order to make changes in the strategy of administration and treatment of these patients in accordance with the principles of the rational use of antimicrobial drugs.

Текст научной работы на тему «МИКРОБИОЛОГИЧЕСКИЕ ПОКАЗАТЕЛИ ПАЦИЕНТОВ С ПОДТВЕРЖДЕННОЙ ИНФЕКЦИЕЙ COVID-19»

Получена: 4 ноября 2020 / Принята: 8 декабря 2020 / Опубликована online: 30 декабря 2020 DOI 10.34689/SH.2020.22.6.001 УДК 616.9(578.834)-093

МИКРОБИОЛОГИЧЕСКИЕ ПОКАЗАТЕЛИ ПАЦИЕНТОВ С ПОДТВЕРЖДЕННОЙ ИНФЕКЦИЕЙ COVID-19

Неля М. Бисенова1, http://orcid.org/0000-0001-8722-0398 Айгерим С. Ергалиева1, http://orcid.org/0000-0003-2111-9888

1АО «Национальный научный медицинский центр», Микробиологическая лаборатория, г. Нур-Султан, Республика Казахстан.

Резюме

Цель настоящего исследования - определить микробный пейзаж и антибиоитикочувствительность основных патогенов, выделенных от пациентов с COVID-19.

Материалы и методы: Проведено проспективное микробиологическое исследование микробного пейзажа и антибиотикочувствительность штаммов, выделенных от пациентов c подтвержденной COVID-19 инфекцией, госпитализированных в АО «Национальный научный медицинский центр», г.Нур-Султан. Идентификацию выделенных изолятов и их антибиотикочувствительность проводили на микробиологическом автоматическом анализаторе Vitek 2 - Compact.

Результаты: При исследовании микробного пейзажа клинического материала от данной категории пациентов всего выделено 282 штамма микроорганизма. Наибольшее количество выделенных микроорганизмов 51,6% (145) относились к стрептококкам, далее по частоте высеваемости Candida 24,8% (70). Грамотрицательные микроорганизмы в большинстве случаев были представлены штаммами A.baumanii 6,4% (18) и K.pneumoniae 3,5% (10). Выделенные штаммы обладали высоким уровнем резистентности к антимикробным препаратам.

Заключение: Результаты нашего проспективного микробиологического исследования показали высокий процент выделения грибов р. Candida. Бактериальные инфекции, вызванные грамотрицательной флорой, отличались множественной лекарственной устойчивостью. Все это побуждает проведение микробиологического мониторинга с целью внесения изменений в тактику введения и лечения данной категории пациентов в соответствии с принципами рационального использования противомикробных препаратов.

Ключевые слова: бактериальные инфекции, резистентность к антибиотикам, микробиологический мониторинг.

Abstract

MICROBIOLOGICAL INDICATORS OF PATIENTS WITH CONFIRMED INFECTION COVID-19

Nelya M. Bissenova1, http://orcid.org/0000-0001-8722-0398 Aigerim S. Yergaliyeva1, http://orcid.org/0000-0003-2111-9888

1JSC National Scientific Medical Research Center, Laboratory of Microbiology, Nur-Sultan, Republic of Kazakhstan

Background. The aim of this study was to identify etiological microorganisms and antibiotic resistance rates of bacterial infection in patients with COVID-19 infection.

Materials and methods. A prospective microbiological study of the microbial landscape and antibiotic resistance of strains isolated from patients with confirmed COVID-19 infection, hospitalized in National Scientific Medical Research Center, Nur-Sultan, Kazakhstan. Identification of isolates and antibiotic susceptibility testing were performed by Vitek-2 automated system.

Results: During study period, 282 strains were isolated; of them, the most frequently isolated microorganisms were as follows: Streptococcus viridans group 51.6%, Candida sp. 24.8%, Acinetobacter baumannii 6.4% and Klebsiella pneumoniae 3.5% with high level of antibiotic resistance.

Conclusion. Based on our results, we report fungal and gram-negative bacterial infection with high level of antibiotic resistance in patients with COVID-19 infection. All this prompts the conduct of microbiological monitoring in order to make changes in the strategy of administration and treatment of these patients in accordance with the principles of the rational use of antimicrobial drugs.

Key words: bacterial infection, antibiotic resistance, microbiologic monitoring.

Тушндеме

COVID-19 ИНФЕКЦИЯСЫ РАСТАЛГАН ПАЦИЕНТТЕРД1Н МИКРОБИОЛОГИЯЛЫК К0РСЕТК1ШТЕР1

Неля М. Бисенова 1, http://orcid.org/0000-0001-8722-0398

Айгерим С. Ергалиева 1, http://orcid.org/0000-0003-2111-9888

1АК «¥лттык гылыми медициналык орталык», Микробиология зертханасы, Нур-Султан к-, Казакстан Республикасы.

Накты зерттеудщ максаты - COVID-19 пациенттерiнен о^шауланган Heri3ri козды^ыштардыщ микробтык epHeri мен антибиотикке сезiмталдыFын аныктау.

Эдiстер: Нур-Султан каласы^ы «¥лттык Fылыми медициналык орталык» А^ ауруханасына жаткызылFан COVID-19 инфекциясы pасталFан наукастардан окшауланFан штамдардыщ микробтык epнeгi мен антибиотикке сeзiмталдыFыньщ проспективш микробиологиялык зерттеу жYpгiзiлдi. ОкшауланFан изоляттарды ж8не олардыщ антибиотикке сeзiмталдыFын аныктау Vitek 2 - Compact микробиологиялык автоматты анализаторында жYpгiзiлдi.

Зерттеу материалдары мен эдiстерi: Клиникалык материалдыщ микробтык ернепн зерттеу кeзiндe наукастардыщ осы санатынан 282 штамм микроорганизм белУп алынды. ОкшауланFан микроорганизмдердщ кeпшiлiк саны 51,6% (145) стpeптококктаpFа тиeсiлi, одан кешн себу жиiлiгiнeн Candida 24,8% (70). Кеп жаFдайда гpамтepiс микроорганизмдер A.baumanii 6,4% (18) ж8не K.pneumoniae 3,5% (10) штамдарымен yсынылFан. ОкшауланFан штамдар микробка карсы пpeпаpаттаpFа жоFаpы дeнгeйдeгi тeзiмдiлiгiнe ие болды.

Корытынды: Бiздiи пpоспeктивтiк микробиологиялык зерттеудщ H8тижeлepi p. Candida окшаулауыныщ жоFаpы пайызын кepсeттi. Гpамтepiс флорадан туындаFан бактериялык инфекциялар кеп д8piлepгe тeзiмдi болды. Муныщ б8pi микробка карсы препараттарды утымды колдану каFидаттаpына с8йкес наукастардыщ осы санатын таFайындау ж8не емдеу тактикасына eзгepiстep eнгiзу максатында микробиологиялык бакылау жYpгiзугe итepмeлeйдi.

TYurndi свздер: бактериалдык инфекциялар, бактериялардыц турактылыт, микробиологиялык мониторинг.

Библиографическая ссылка:

Бисенова Н.М., Ергалиева А.С. Микробиологические показатели пациентов с подтвержденной инфекцией COVID-19 // Наука и Здравоохранение. 2020. 6 (Т.22). С. 5-10. doi:10.34689/SH.2020.22.6.001

Bissenova N.M., Yergaliyeva A.S. Microbiological indicators of patients with confirmed infection COVID-19 // Nauka i Zdravookhranenie [Science & Healthcare]. 2020, 6 (Vol.22), pp. 5-10. doi 10.34689/SH.2020.22.6.001

Бисенова Н.М., Ергалиева А.С. COVID-19 инфекциясы pасталFан пациенттердщ микробиологиялык кepсeткiштepi // Гылым ж8не Денсаулык сактау. 2020. 6 (Т.22). Б. 5-10. doi:10.34689/SH.2020.22.6.001

Введение

В условиях нарастающей

антибиотикорезистентности во всем мире и ажиотажным безрецептурном применением антибиотиков на фоне коронавирусной инфекции, важным является определение наличия вторичной бактериальной и грибковой инфекции у больных с ковидной и ковидоподобной пневмонией с целью этиотропного назначения антибиотиков и противогрибковых препаратов.

У пациентов с подтвержденной коронавирусной инфекцией антимикробная терапия играет важную роль в лечении предполагаемой или подтвержденной бактериальной респираторной инфекции. Как правило, такая терапия является эмпирической или направленной на пациентов, госпитализированных в стационаре, для лечения нозокомиальных инфекций, приобретенных во время госпитализации, таких как внутрибольничная пневмония или пневмония, связанная с аппаратом искусственной вентиляции легких. Пациенты также могут страдать от вторичных инфекций, не связанных с респираторными

проявлениями, например, инфекции мочевыводящих путей или кровотока [1].

Как известно, респираторные вирусные инфекции часто ассоциированы тяжелыми бактериальными и грибковыми инфекциями [2-3]. Многие исследователи отмечают увеличение развития вторичных бактериальных инфекций, вызванными Streptococcus pneumoniae, Staphylococcus aureus, Haemophilus influenzae, и Aspergillus sp. [4-5]. Однако таких данных о распространенности и тяжести сопутствующих вторичных бактериальных инфекций у госпитализированных пациентов с COVID-19 в настоящее время относительно мало.

Цель исследования - определить микробный пейзаж и антибиоитикочувствительность основных патогенов, выделенных от пациентов с COVID-19.

Материалы и методы

Дизайн исследования

Проведено проспективное микробиологическое исследование микробного пейзажа и антибиотикочувствительность штаммов, выделенных от пациентов c подтвержденной COVID-19 инфекцией,

госпитализированных в АО «Национальный научный медицинский центр», г.Нур-Султан в период с 24 июня по 15 августа 2020 года, который в данный период работал как инфекционный стационар. Сбор исследуемого материала Исследованию подвергался респираторный тракт (мазок из зева, мокрота, смыв с бронхов, содержимое трахеобронхиального дерева), кровь на стерильность, моча и мочевой катетер, интубационная трубка, содержимое аспирационного катетера, раневое отделяемое. Весь клинический материал собирался и транспортировался в микробиологическую лабораторию согласно методическим рекомендациям [6]. Культивирование образцов Количественный анализ исследуемого материала проводили с использованием дифференциально-диагностических и хромогенных питательных сред (кровяной агар, среда Эндо, желточно-солевой агар, Candida агар, Калина агар, шоколадный агар). Посевы культивировали 24 часа при 37°С. Идентификация изолятов Согласно методическим рекомендациям для идентификации изолятов изучались: морфологические свойства, окраска по Граму, оксидазный и каталазный тесты, тест на плазмокоагулазу, желчный тест, тест на

Характеристика пациентов с COVID-19.

индолообразование. Заключительная идентификация выделенных чистых культур микроорганизмов проводилась на микробиологическом анализаторе «Vitek 2 - Compact» (bioMerieux, Marcy I'Etoile, France). Исследование антибиотикочувствительности Антимикробная активность была исследована методом минимальных подавляющих концентраций на автоматическом анализаторе «Vitek 2 - Compact». Интерпретацию результатов определения чувствительности проводили согласно EUCAST 8.1 [7]. Статистическая обработка Статистическую обработку полученных данных проводили с помощью программы WhoNet 5.6 и Microsoft Excel, определяли среднюю величину, ошибку средней и 95% доверительный интервал. Результаты

В период с 24 июня по 15 августа 2020 года в АО «ННМЦ» было госпитализировано 700 больных, с положительным результатом ПЦР на COVID-19. Микробиологическому исследованию подвергался клинический материал, выделенный от 212 пациентов. Средний возраст пациента составил 58,7 лет, мужчины составляли 66,1% (140). В отделении ОАРИТ находилось 34 пациента, от которых получено 89 клинических образцов биоматериала (таблица 1).

Таблица 1.

Всего пациентов с COVID-19 (n=212) Всего пациентов с COVID-19 в ОАРИТ (n=34)

Мужчины 140 (66,1%) 22 (64,7%)

Женщины 72 (33,9%) 12 (35,2%)

Средний возраст 58,7 (возрастной диапазон 28-88 лет) 68,2 (возрастной диапазон 52-83 лет)

За исследуемый период при исследовании бактериальных инфекций системы кровотока у пациентов с COVID-19 было получено 49 образцов крови, клинические патогены были идентифицированы в 11 случаях, из которых 9 штаммов выявлены у пациентов ОАРИТ.

Микробиологическое исследование респираторного тракта проводилось у 205 пациентов, от которых

получено 183 образцов мокроты, 19 мазков из зева, 5 клинических материала при исследовании трахеобронхиального дерева. В 91,2% образцах мокроты обнаруживался рост микроорганизмов, среди которых зеленящие стрептококки занимали 62,8% (132), Candida sp. 22,8% (48), A.baumannii 4,2% (9) от всех выделенных микроорганизмов при исследовании респираторного тракта (таблица 2).

Микробиологическое исследование клинических образцов от пациентов с COVID-19.

Таблица 2.

Клинический материал Всего биоматериала Биоматериал с отделения ОАРИТ

Всего Бактериальный рост Всего Бактериальный рост

Мокрота 183 (53,1%) 167 (91,2%) 19 (21,3%) 17 (89,4%)

Мазок из зева 19 (5,5%) 16 (84,2%) 3 (3,3%) 3 (100%)

ТБД 5 (1,4%) 3 (60%) 5 (5,6%) 3 (60%)

Кровь на стерильность 49 (14,2%) 9 (18,3%) 27 (30,3) 6 (22,2%)

Моча и мочевой катетер 71 (20,6%) 31 (43,6%) 26 (29,2%) 17 (65,3%)

Раневое отделяемое 6 (1,7%) 4 (66,6%) 2 (2,2%) 2 (100%)

Прочее 11 (3,1%) 7 (63,3%) 7 (7,8%) 6 (85,7%)

Итого 344 239 (69,4%) 89 57 (64%)

У пациентов были получены 71 образцов мочи, из которых в 26 случаях были получены от пациентов, находящихся в ОАРИТ, бактериальный рост обнаруживался в 43,6%. В данном биоптате чаще других обнаруживались микроорганизмы рода Enterococcus 34,3% (11), а именно Enterococcus faecalis и Enterococcus faecium, и дрожжеподобные грибы р.Candida 50% (16).

При исследовании микробного пейзажа клинического материала от данной категории пациентов всего выделено 282 штамма микроорганизма, из которых 80,8% (228) получены из респираторного тракта (таблица 3).

Микробный пейзаж выделенных культур от пациентов с COVID-19 инфекцией.

Таблица 3.

Вид микроорганизма Кровь НДП ВДП МВП Рана Прочее Всего

n (%) n (%) n (%) n (%) n (%) n (%) n (%)

Staphylococcus aureus 1 (9,0) 3 (1,4) 4 (1,4)

КОС 3 (27,2) 1 (3,1) 1 (14,2) 5 (1,7)

Streptococcus sp. 132 (62,8) 13 (72,2) 145 (51,6)

Enterococcus sp. 1 (9,0) 2 (0,9) 11 (34,3) 2 (50) 16 (5,6)

Escherichia coli 1 (0,4) 2 (6,2) 1 (25) 4 (1,4)

Klebsiella pneumoniae 2 (18,1) 7 (3,3) 1 (14,2) 10 (3,5)

Enterobacter sp. 2 (0,9) 2 (0,7)

Acinetobacter baumannii 3 (27,2) 9 (4,2) 1 (5,5) 1 (3,1) 1 (25) 3 (42,8) 18 (6,4)

Pseudomonas aeruginosa 5 (2,3) 1 (3,1) 6 (2,1)

Stenotrophomonas maltophilia 1 (0,4) 1 (14,2) 2 (0,7)

Candida sp. 1 (9,0) 48 (22,8) 4 (22,2) 16 (50) 1 (14,2) 70 (24,8)

Всего 11 210 18 32 4 7 282

■ коагулазоотрицательные стафилококки; НДП - нижние дыхательные - верхние дыхательные пути; МВП - мочевыводящие пути;

пути;

Примечание: КОС ВДП

Наибольшее количество выделенных микроорганизмов 51,6% (145) относились к стрептококкам, далее по частоте высеваемости Candida 24,8% (70), который был представлен тремя видами -C.albicans, C.glabrata и C.tropicalis. Энтерококки занимают 5,6% (16) от общего количества выделенных изолятов. Грамотрицательные микроорганизмы в основном были представлены штаммами A.baumanii 6,4% (18) и Kpneumoniae 3,5% (10).

При исследовании микробного пейзажа в отделении ОАРИТ было установлено, что часто встречающимся патогеном являлись Candida sp. 29,8% (17), 7 штаммов, из которых высевались в ассоциациях, в 5 случаях с A.baumannii и в 2 случаях со стрептококками. Неферментирующие грамотрицательные бактерии заняли 26,3% (15) от общего количества выделенных

микроорганизмов в данном отделении, среди которых 22,8% (13) штаммов относились к Л.ЬаитаппИ. Энтерококки были представлены двумя видами (Е^аесаНэ и Е1аесшт) с общим количеством 17,3% (10). Зеленящие стрептококки заняли 12,2% (7) в таблице микробного пейзажа, а представители семейства Еп\еюЬас\епасае 8,7% (5), из которых К.рпеитвп1ае 4 штамма, на долю коагулазоотрицательных стафилококков пришлось 5,2% (3).

Результаты антибиотикочувствительности основных патогенов микробного пейзажа в нашем исследовании представлены в таблице 4.

Все выделенные штаммы Л.ЬаитаппИ устойчивы к хинолонам, чувствительность к карбапенемам и аминогликозидам на уровне 6,7%, к триметоприм/сульфаметоксазолу - 86,7%.

Результаты определения антибиотикочувствительности штаммов A.baumannii (n=18), пациентов с COVID-19.

Таблица 4. выделенных от

Наименование антибиотика Резистентные Умеренно- Чувствительные % 95% ДИ

% резистентные % % резистентных

Meropenem 93,3 0 6,7 66,0-99,6

Amikacin 93,3 0 6,7 66,0-99,6

Gentamicin 93,3 0 6,7 66,0-99,6

Ciprofloxacin 100 0 0 74,7-100

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

Levofloxacin 100 0 0 74,7-100

Trimetoprim/sulfamethoxazole 13,3 0 86,7 2,3-41,6

Наименование антибиотика Резистентные Умеренно- Чувствительные 95% ДИ

% резистентные % % % резистентных

Amphotericin B 24,6 0 75,4 15,4-36,7

Clotrimazole 26,1 0 73,9 16,6-38,3

Fluconazole 76,8 0 23,2 64,8-85,8

Intraconazole 97,1 0 2,9 89,0-99,5

Ketoconazole 82,6 0 17,4 71,2-90,3

Nystatin 11,6 0 88,4 4,3-25,8

Определение чувствительности штаммов Candida наименьшую к интраконазолу - 2,9%, чувствительность sp. к противогрибковым препаратам показало к флуконазолу на уровне 23,2% (таблица 5). наибольшую чувствительность к нистатину - 88,4%,

Таблица 5.

Результаты определения антибиотикочувствительности штаммов Candida sp. (n=69), выделенных от пациентов с COVID-19.

КОС

Streptococcus

Enterococcus

Enterobacteriace

НГОБ

Candida

Ассоциации с Candida

Примечание: КОС - коагулазоотрицательные стафилококки;

НГОБ - неферментирующие грамотрицательные бактерии

Обсуждение

Данное проспективное микробиологическое исследование показало низкий процент лабораторно подтвержденных бактериальных инфекций у пациентов с COVID-19. Из всех полученных образцов крови было выделено только несколько клинически важных инвазивных патогенов: из грамотрицательных - 3 штамма A.baumannii и 2 штамма K.pneumoniae, также один случай кандедемии и 3 штамма коагулазоотрицательных стафилококка при контаминации, таким образом, уровень бактеримии составил 18,3%, а в отделении реанимации этот показатель составил 22,2%, полученные данные совпадают с результатами других исследований [8].

Среди пациентов с подтвержденным COVID-19 при исследовании респираторного тракта штаммов Streptococcus pneumoniae не было обнаружено. Более 62% всех выделенных микроорганизмов относились к зеленящим стрептококкам. Мы констатируем высокий процент выделения Candida sp. 22,8%, например по сравнению с другими исследованиями [9-10]. В данном случае возможно предположение о чрезмерном назначении и употреблении противомикробных препаратов на амбулаторном уровне. Среди истиных патогенов в образцах мокроты были обнаружены A.baumannii (n=9), K.pneumoniae (n=7), P.aeruginosa (n=5).

Результаты нашего исследования показали, что после госпитализации и интубации в отделении ОАРИТ пациенты с COVID-19 имеют предрасположенность к колонизации и инфекциям, вызванным внутрибольничными патогенами, которые известны при внутрибольничных и вентилятор-ассоциированных

пневмониях. Микроорганизмы, обнаруженные в нашем исследовании, были схожи в некоторых отношениях с другими опубликованными данными [11], однако отличались от аналогичного исследования, проводимом в Китае, где основными патогенами являлись пневмококк и гемофильная палочка [12]. Из всех выделенных штаммов A.baumannii, более 72% относились к реанимационным изолятам, таким образом, это основной патоген микробного пейзажа данной категории пациентов. Литературные данные по бактериальным инфекциям у пациентов с COVID-19 показывают высокий уровень резистентности, в виду высоких показателей использования антибиотиков [1314] как и в нашем исследовании все выделенные штаммы A.baumannii характеризовалить 100% резистентностью к хинолонам и аминогликозидам, 94,5% были карбапенемазопродуцирующими, а штаммы K.pneumoniae ESBL положительными.

Наше исследование имеет ряд ограничений. Проспективный дизайн, так или иначе, ведет к снижению контроля над множеством факторов полученных данных. Данное исследование ограниченно только одним медицинским учреждением с коротким периодом наблюдения. Тем не менее, полученные данные необходимы для разработки оптимального менеджмента введения пациентов с COVID-19, что несомненно, позволит сократить длительные курсы антибиотикотерапии, сдержать развитие патогенов с множественной лекарственной устойчивостью и сэкономить ресурсы стационара.

Заключение

Результаты нашего проспективного

микробиологического исследования показали высокий

процент выделения грибов р. Candida, что является результатом применения антибиотиков широкого спектра действия на амбулаторном этапе. Бактериальные инфекции, вызванные

грамотрицательной флорой, отличались

множественной лекарственной устойчивостью.

Все это побуждает проведение микробиологического мониторинга с целью внесения изменений в тактику введения и лечения данной категории пациентов в соответствии с принципами рационального использования противомикробных препаратов.

Вклад авторов:

Бисенова Н.М. - научное руководство, концепция исследования;

Ергалиева А.С. - критический анализ, научное сопровождение статьи;

Финансирование. Источников финансирования нет. Конфликта интересов нет.

Литература:

1. Priya Nori et al. Bacterial and fungal coinfections in COVID-19 patients hospitalized during the New York City pandemic surge // Infect Contr and Hospital Epid, 2020. 1-5

2. MacIntyre C.R., Chughtai A.A., Barnes M, et al. The role of pneumonia and secondary bacterial infection in fatal and serious outcomes of pandemic influenza a (H1N) // BMC Infect Dis. 2018.18:637.doi.org/10.1186/s12879-018-3548-0.

3. Morris D.E., Cleary D.W., Clarke S.C. Secondary bacterial infections associated with influenza pandemics // Front Microbiol 2017.8:1041

4. Mulcany M.E., McLoughlin R.M. Staphylococcus aureus and influenza A virus: patterns and coinfecrions. VBio. 2016. 7:e02068-16

5. Canning B., Sennyake R.V., Burns D., Moran E, Dedicoat M. Post-influenza aspergillus ventriculitis // Clin Infect Pract 2020:100026. doi:10.1016/j.clinpr.2020.100026

6. Guidelines of standards for microbiologic tests in the laboratory of clinical microbiology. National scientific medical research center, Astana, 2008.P.11-12

7. The European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing. Breakpoints tables for interpretation of MICs and zone diameters. 2018. Version 8.1.

8. Hughes S. et al. Bacterial and fungal coinfection among hospitalized patients with COVID-19: a retrospective cohort study in a UK secondary care-setting // Clinical Micro and Infect 2020.(26).P.1395-99

9. Youngs J., Wyncoll D., Hopkins P., Arnold A., Ball J., Bicanic T. Improving antibiotic stewardship in COVID-19:Bacterial co-infection is less common than with inuenza // J Infect 2020.81 (3):55-57

10. Timothy M.R., Luke S.P., Nina Zhu, et al. Bacterial and fungal coinfection in individuals with coronavirus: A rapid review to support COVID-19 antimicrobial prescribing // Clinical Infectious Diseases. doi.org/10.1093/cid/ciaa530

11. Verroken A.., Scohy A.., Gerard L., et al. Co-infections in COVID-19 critically ill and antibiotic management: A prospective cohort analysis // Crit Care. 2020.24:410. doi.org/10.1186/s13054-020-03135-7

12. Hans H. Liu et al. Bacterial and fungal growth in sputum cultures from 165 COVID-19 pneumonia patients requiring intubation: evidence for antimicrobial resistance development and analysis of risk factors. doi: 10.21203/rs.3.rs-79487/v1

13. Zhou P., Liu Z., Chen Y., et al. Bacterial and fungal infections in COVID-19 patients: A matter of concern // Infect Control Hosp Epidemiology. 2020. doi:10.1017/ice.2020.156.

14. Cheng B., Hu J., Zuo X., et al. Predictors of progression from moderate to severe coronavirus disease 2019: A retrospective cohort // Clin Micro Infect. 2020. doi.org/10.1016/j.cmi.2020.06.033.

Контактная информация:

Ергалиева Айгерим Сакеновна - ст.ординатор микробиологической лабораторией АО «Национальный научный

медицинский центр». г.Нур-Султан, Республика Казахстан

Почтовый индекс: Республика Казахстан, 010009, г.Нур-Султан, пр.Абылайхана, 42

Email: ergaliaigerim@gmail.com

Телефон: +77752031270

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.