CC BY
220
Original articles
Оригинальные статьи
Russian Journal of Infection and Immunity = Infektsiya i immunitet Инфекция и иммунитет
2017, vol. 7, no. 2, pp. 181-192 2017, Т. 7, № 2, с. 181-192
КАРБАПЕНЕМАЗА- П РОДУЦИ РУЮЩИЕ ГРАМОТРИЦАТЕЛЬНЫЕ БАКТЕРИИ В СПЕЦИАЛИЗИРОВАННОМ СТАЦИОНАРЕ САНКТ-ПЕТЕРБУРГА
А.Г. Полищук, Е.И. Якубович, О.В. Полухина, В.В. Осовских, В.И. Евтушенко
ФГБУ Российский научный центр радиологии и хирургических технологий Минздрава России, Санкт-Петербург, Россия
Резюме. Охарактеризованы видовой состав, чувствительность к антимикробным препаратам, частота встречаемости и типы карбапенемаз карбапенемаза-продуцирующих грамотрицательных бактерий, выделеных в ФГБУ «РНЦРХТ» МЗ РФ с февраля 2014 г. по апрель 2016 г. Скрининг карбапенем-резистентных бактерий проводился путем посева биоматериала на хромогенные среды (CHROMagar KPC, DRG, Франция), а их видовая идентификация — методом матричной лазерной десорбционной времяпролетной масс-спектрометрии (MALDI-TOF MS) на анализаторе VITEK MS (bioMerieux, Франция). Чувствительность грамотрицательных бактерий к антимикробным препаратам определялась на анализаторе VITEK-2 (bioMerieux, Франция). Полученные результаты интерпретировались в соответствии с критериями EUCAST v. 6.0, 2016. Гены, кодирующие карбапенемазы групп КРС, ОХА-48/162, VIM, IMP, NDM, OXA-51, OXA40/24, OXA-23 и OXA-58 выявлялись методом мультиплексной ПЦР в реальном времени (АмплиСенс, Россия). Выделено 813 клинически значимых штаммов бактерий (602 пациента), в том числе 405 грамотрицательных, среди которых 5,1% (21 штамм от 16 пациентов) нечувствительных к меропенему и/или имипенему: Klebsiella pneumoniae (n = 5), Enterobacter cloacae (n = 2), Serratia marcescens (n = 1), Pseudomonas aeruginosa (n = 3), Acinetobacter baumannii (n = 10). Из клинического материала 4-х пациентов одновременно выделено до 3-х штаммов разных видов нечувствительных к карбапенемам бактерий. У 84% нечувствительных к карбапенемам изолятов обнаружены гены, кодирующие приобретенные карбапенемазы: у A. baumannii — OXA40/24 (n = 8); у K. pneumoniae — OXA-48 (n = 1), КРС (n = 1) и NDM (n = 2); у P. aeruginosa — VIM (n = 1) и KPC (n = 1); у E. cloacae — КРС (n = 1). OXA-48 карба-пенемаза обнаружена также в одном карбапенем-чувствительном штамме K. pneumoniae. Все карбапенема-за-продуцирующие штаммы имели фенотип множественной резистентности к антимикробным препаратам. Результаты исследования показали, что хотя доля карбапенем-нечувствительных штаммов среди грамотри-цательных бактерий сравнительно невелика, все они обладают множественной устойчивостью к антимикробным препаратам и в большинстве из них обнаружены гены приобретенных карбапенемаз. Видовой состав и типы обнаруженных приобретенных карбапанемаз характерны для территории России. У K. pneumoniae и P. aeruginosa не выявлено превалирования какого-либо одного типа карбапенемаз, в то время как у всех штаммов A. baumannii обнаружен ген OXA40/24 карбапенемазы.
Ключевые слова: карбапенемазы, чувствительность бактерий, грамотрицательные бактерии, MALDI-TOFMS, видовая идентификация, нозокомиальные инфекции.
Адрес для переписки:
Полищук Анна Генриховна
197758, Россия, Санкт-Петербург, п. Песочный,
ул. Ленинградская, 70, ФГБУ Российский научный центр
радиологии и хирургических технологий.
Тел.: 8 921 587-77-62 (моб.).
E-mail: [email protected]
Библиографическое описание:
Полищук А.Г, Якубович Е.И., Полухина О.В., Осовских В.В., Евтушенко В.И. Карбапенемаза-продуцирующие грамотрицательные бактерии в специализированном стационаре Санкт-Петербурга // Инфекция и иммунитет. 2017. Т. 7, № 2. С. 181-192. с1о1: 10.15789/22207619-2017-2-181-192
© Полищук А.Г. и соавт., 2017
Contacts:
Anna G. Polischouk
197758, Russian Federation, St. Petersburg, Pesochnyi village, Leningradskaya str., 70, Russian Research Centre of Radiology and Surgical Technologies. Phone: +7 921 587-77-62 (mobile). E-mail: [email protected]
Citation:
Polischouk A.G., Jakubovich E.I., Poluhina O.V., Osovskich V.V., Evtushenko V.I. Carbapenemase-producing gram-negative bacteria in a specialized hospital of St. Petersburg // Russian Journal of Infection and Immunity = Infektsiya i immunitet, 2017, vol. 7, no. 2, pp. 181-192. doi: 10.15789/2220-7619-2017-2-181-192
DOI: http://dx.doi.org/10.15789/2220-7619-2017-2-181-192
СARBAPENEMASE-PRODUCING GRAM-NEGATIVE BACTERIA IN A SPECIALIZED HOSPITAL OF ST. PETERSBURG
Polischouk A.G., Jakubovich E.I., Poluhina O.V., Osovskich V.V., Evtushenko V.I.
Russian Research Centre of Radiology and Surgical Technologies, St. Petersburg, Russian Federation
Abstract. Species composition, susceptibility to antimicrobial agents, incidence and type of carbapenemase of carbapene-mase-producing gram-negative bacteria, isolated in the Russian Research Centre of Radiology and Surgical Technologies from February 2014 to April 2016 were described. Screening of carbapenem-resistant bacteria was conducted by plating biomaterial on the chromogenic medium ("CHROMagar KPC", DRG, France), species identification by matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS) on the analyzer VITEK MS (bioMe-rieux, France). The sensitivity of gram-negative bacteria to antimicrobial drugs was determined on the analyzer VITEK-2 (bioMerieux), and the obtained results were interpreted in accordance with EUCAST criteria v.6.0, 2016. Genes encoding carbapenemase of KPC, OXA-48/162, VIM, IMP, NDM, OXA-51, 0XA40/24, OXA-23 and OXA-58 groups were detected by multiplex real-time PCR (AmpliSens, Russia). 813 clinically relevant bacteria (602 patients) were obtained, including 405 gram-negative, among which 5.2% (21 strain from 16 patients) non-susceptible to meropenem and/or imipenem: Klebsiella pneumoniae (n = 5), Enterobacter cloacae (n = 2), Serratia marcescens (n = 1), Pseudomonas aeruginosa (n = 3), Acinetobacter baumannii (n = 10). Clinical material from 4 patients was infected by up to 3 carbapenem-non-susceptible strains of different species of gram-negative bacteria at the same time. The genes encoding acquired carbapenemases were detected in 84% of the nonsusceptible to carbapenems isolates: in A. baumannii — OXA40/24 (n = 8); in K. pneumoniae — OXA-48 (n = 1), KPC (n = 1) and NDM (n = 2); in P. aeruginosa — VIM (n = 1) and KPC (n = 1); in E. cloacae — KPC (n = 1). OXA-48 carbapenemase was also detected in one carbapenem-sensitive strain of K. pneumonia. All carbapene-mase-producing strains had a phenotype of multidrug resistance. The results of the study showed that over the analyzed period, the prevalence of the carbapenem-nonsusceptible strains of gram-negative bacteria were relatively low, but all these strains were multidrug resistant and most of them possessed acquired carbapenemase genes. The species carbapenem-nonsusceptible gram-negative bacteria and the types of the detected acquired carbapenemase were typical for Russia. For K. pneumoniae and P. aeruginosa no predominance of any one type of carbapenemase was revealed, while in all strains of A. baumannii the gene of OXA40/24 carbapenemase was found.
Key words: carbapenemases, bacterial sensitivity, gram-negative bacteria, MALDI-TOF MS, species identification, nosocomial infections.
Введение
Карбапенемы являются препаратами выбора при лечении ряда серьезных госпитальных инфекций, вызванных мультирезистентны-ми штаммами грамотрицательных бактерий (ГОБ). Среди ГОБ наиболее частыми возбудителями госпитальных инфекций являются представители семейства Enterobacteriaceae, прежде всего Klebsiella pneumoniae, и нефер-ментирующие ГОБ — Acinetobacter baumannii и Pseudomonas aeruginosa [14].
Карбапенемы относятся к бета-лактамным антимикробным препаратам (АМП) и обладают наиболее широким спектром действия среди АМП этой группы. Устойчивость к бе-та-лактамным АМП может быть обусловлена уменьшенной проницаемостью бактериальной мембраны, активацией систем эффлюк-са и экспрессией бактериальных ферментов бета-лактамаз, гидролизующих карбапенемы, то есть карбапенемаз [8, 17]. Гены, кодирующие приобретенные карбапенемазы, большей частью локализуются на мобильных генетических элементах генома бактерий, что является
причиной их быстрого внутри- и межвидового распространения. В связи с этим, карбапене-маза-опосредованные механизмы устойчивости потенциально связаны с высоким риском возникновения вспышек госпитальных инфекций. В составе мобильных элементов часто присутствуют генные кассеты, несущие детерминанты устойчивости к АМП других классов, поэтому наличие у ГОБ генов карбапенемаз обычно связано с фенотипами множественной резистентности (MDR — multidrug resistant), экстремальной резистентности (XDR — extensively drug-resistant) или панрезистентно-сти (PDR — pandrug-resistant) к АМП [19, 20]. Наиболее эффективными с точки зрения уровня карбапенемазной активности и глобального распространения являются карбапенемазы групп KPC, VIM, IMP, NDM и OXA-48 [22, 24].
Начиная с 90-х гг. прошлого века, ГОБ с карбапенемазной активностью быстро распространились по всему миру и на настоящий момент представляют одну из наиболее значимых угроз мировому здравоохранению [1, 14, 22]. В этом аспекте Россия и страны ближнего зарубежья не являются исключением.
По данным исследования МАРАФОН, все госпитальные штаммы A. baumannii, полученные от пациентов 18 стационаров России к 2012 г., оказались нечувствительны к имипе-нему, в то время как в 2008 г. только 5% выделенных штаммов A. baumannii были нечувствительны к этому карбапенему [3, 6]. У половины нечувствительных к имипенему изолятов A. baumannii, выделенных к 2012 г., были обнаружены карбапенемазы, в основном OXA-40/24 типа. Большинство карбапенемаза-про-дуцирующих изолятов обладали MDR и XDR фенотипом (94 и 87% соответственно), а 1,2% из них (3 изолята) PDR фенотипом. Доля нечувствительных к имипенему и меропенему изолятов P. aeruginosa в 2012 г. также была высока: 88 и 67% соответственно. Среди нечувствительных к карбапенемам (КНЧ) изолятов P. aeruginosa больше половины обладали XDR фенотипом, а 0,3% (10 изолятов) PDR фенотипом. У 28% КНЧ штаммов был обнаружен ген карбапенемазы VIM типа [7]. Из выделенных в ходе исследования МАРАФОН (2012 г.) штаммов K. pneumoniae 22, 15 и 5% были нечувствительны к эртапенему, имипенему и меропене-му соответственно [5]. О значительно большей доле КНЧ штаммов K. pneumoniae сообщалось в московском исследовании 2013—2014 гг., где соответствующие цифры были 68, 65 и 44% [16]. Хотя доля карбапенемаза-продуцирующих штаммов K. pneumoniae была различна — 7% в исследовании МАРАФОН и 55% в московском исследовании — в обоих исследованиях основной обнаруженной карбапенемазой была OXA-48. Все карбапенемаза-продуцирующие штаммы в обоих исследованиях обладали MDR фенотипом.
Из других госпитальных ГОБ на территории России зафиксировано появление КНЧ штаммов Escherichia coli, Enterobacter cloacae, E. aerogenes и Proteus mirabilis. Хотя их доля среди КНЧ ГОБ была сравнительно невелика в 2012 г., некоторые из выделенных штаммов обладали PDR фенотипом.
Исследования эпидемиологической ситуации по резистентности ГОБ к карбапенемам в Санкт-Петербурге за 2012—2014 гг. показали распространение в стационарах города КНЧ штаммов K. pneumoniae, несущих ген карбапенемазы NDM-1. У 98% КНЧ штаммов K. pneumoniae, полученных от пациентов Санкт-Петербурга к началу 2013 г. был обнаружен ген карбапенемазы NDM-1 [2, 9, 10]. Наличие данной карбапенемазы у бактерий представляет особую опасность, поскольку, такие бактерии обычно резистентны почти ко всем используемым в клинике АМП, за исключе-
нием тигециклина и колистина [22]. В стационарах Санкт-Петербурга отмечен также рост частоты выделения карбапенем-резистентных (КР) штаммов А. baumannii. Согласно одному исследованию, объединившему 5 стационаров города, к 2014 г. совокупная доля госпитальных изолятов А. baumannii, резистентных хотя бы к одному карбапенему, приблизилась к 50%, при этом доля КР изолятов варьировала в зависимости от стационара от 2,5 до 62% [4]. Данные о количестве карбапенемаза-продуци-рующих штаммов А. baumannii в этом исследовании отсутствуют.
Особая эпидемиологическая опасность, которую представляют ГОБ, синтезирующие карбапенемазы, определяет необходимость их раннего выявления на основе постоянного мониторинга антибиотикорезистентности возбудителей инфекций у госпитализированных пациентов.
Целью данного исследования было определение частоты встречаемости, профиля чувствительности к АМП и типов карбапенемаз карбапенемаза-продуцирующих ГОБ у пациентов ФГБУ «РНЦРХТ» МЗ РФ.
Материалы и методы
Изоляты ГОБ, нечувствительные к карба-пенемам, были получены из клинического материала пациентов ФГБУ «РНЦРХТ» в период с февраля 2014 г. по апрель 2016 г.
Бактериальные изоляты. Посев клинического материала проводили в течение 2 ч после забора.
Для обнаружения ГОБ в крови и других в норме стерильных жидкостях использовали автоматический анализатор BacT/ALERT (bioMérieux, Франция) и флаконы со средой и активированным углем для выделения аэробных и анаэробных гемокультур BacT/ALERT FA и FN. Для обнаружения ГОБ в пробах мочи посев проводили по методу Голда, используя питательный агар с 5% бараньей кровью (Sredoff, Россия) и хромогенную неселективную среду «Уриселект агар» (Bio-Rad, Франция). Пробы с отделяемым ран и нижних дыхательных путей дополнительно засевали на агар Шед-лера (bioMérieux, Франция). Исследование микробной обсемененности фрагментов венозных катетеров проводили количественным методом, предложенным Brun-Buisson с нашей модификацией (Рацпредложение «Способ количественной оценки бактериальной обсеме-ненности венозного катетера», рег. № 12947/8 от 29.11.2011 г.). Смывы с фрагментов катетеров высевали на 5% кровяной агар и «Уриселект
Таблица 1. Клинические характеристики пациентов с карбапенемаза-продуцирующими грамотрицательными бактериями
Table 1. Clinical characteristics of patients with carbapenemase-producing gram-negative bacteria
ra е n т с га ф Пол Место жительства Основной диагноз Нахождение в стационаре Length of stay in the hospital Количество внутриполостных операций до получения
ц nei а it п ta P z m < о CQ Sex Place of residence Main diagnosis всего дней total days по отделениям by wards изолята Number of surgeries before isolation of bacteria
2014
1 38 М M Санкт-Петербург St. Petersburg Цирроз печени Hepatocirrhosis 39 ОРИТ/Хирург RICU/Surgical 2
2015
2 75 М M Санкт-Петербург St. Petersburg Ракободочной кишки Colon cancer 82 Хирург/ОРИТ Surgical/RICU 2
3 38 Ж F НД ND Рак почки Kidney cancer 50 Уролог/ОРИТ Urological/RICU НД ND
4 87 М M Санкт-Петербург St. Petersburg Рак мочевого пузыря Bladder cancer 26 Уролог/ОРИТ Urological/RICU 2
5 57 Ж F Санкт-Петербург St. Petersburg Цирроз печени Hepatocirrhosis 16 ОРИТ RICU 2
6 51 М M НД ND НД ND НД ND Хирург Surgical НД ND
7 70 М M Санкт-Петербург St. Petersburg Рак предстательной железы Prostate cancer 43 ОРИТ/Уролог RICU/Urological 1
8 65 Ж F Санкт-Петербург St. Petersburg Рак поджелудочной железы Pancreatic cancer 30 Хирург/ОРИТ Surgical/RICU 1
9 83 М M Санкт-Петербург St. Petersburg Атеросклероз аорты Atherosclerosis of aorta 97 Хирург/ОРИТ Surgical/RICU 3
10 78 Ж F Санкт-Петербург St. Petersburg Рак поджелудочной железы Pancreatic cancer 71 Хирург/ОРИТ Surgical/RICU 3
11 52 Ж F Санкт-Петербург St. Petersburg Раксигмовидной кишки Sigmoid colon cancer 7 Сосудистая хирургия Vascular surgery 1
12 61 М M Тверская обл. Tver region Рак мочевого пузыря Bladder cancer 18 Уролог/ОРИТ Urological/RICU 1
13 61 М M Мурманск Murmansk Рак поджелудочной железы Pancreatic cancer 41 Хирург/ОРИТ Surgical/RICU 4
14 77 Ж F Ленинградская обл. Leningrad region Эхинококкоз печени Liver echinococcosis 43 Хирург/ОРИТ Surgical/RICU 3
15 67 М M НД ND Рак мочевого пузыря Bladder cancer 59 ОРИТ RICU 3
2016
16 62 Ж F Санкт-Петербург St. Petersburg Цирроз печени Hepatocirrhosis 76 Хирург/ОРИТ Surgical/RICU 5
17 67 Ж F Санкт-Петербург St. Petersburg Рак поджелудочной железы Pancreatic cancer 45 Хирург/ОРИТ Surgical/RICU 2
18 46 Ж F Санкт-Петербург St. Petersburg Рак мочевого пузыря Bladder cancer 40 ОРИТ/Уролог RICU/Urological 1
Примечания. ОРИТ — отделение реанимации и интенсивной терапии; Уролог — урологическое; Хирург — хирургическое; НД — нет данных. Notes. RICU — Reanimation and Intensive Care Unit; ND — no data.
агар». Посевы инкубировали от 24 до 72 ч. Посевы на хромогенных средах инкубировали при 35°С. Посевы на агаре Шедлера термоста-тировали в анаэростате.
Клинически значимыми считали все случаи выделения микроорганизмов из проб крови, при посеве смывов с фрагментов катетеров — в концентрации 103 КОЕ/мл и более, проб раневого отделяемого — 105 КОЕ/мл, мокроты и аспирата трахеобронхиального дерева — 106 КОЕ/мл, бронхоальвеолярной жидкости — 104 КОЕ/мл. Клиническую значимость возбудителей, выделенных из мочи, оценивали в соответствии с критериями диагностики ИМП по рекомендациям IDSA/ESCMID от 2007 г.
Видовая идентификация. Видовая идентификация микроорганизмов проводилась методом матричной лазерной десорбцион-ной времяпролетной масс-спектрометрии (MALDI-TOF MS) на анализаторе VITEK MS, с использованием базы белковых спектров клинически значимых видов микроорганизмов и программы «Расширенный классификатор спектров» (bioMerieux, Франция).
Определение чувствительности бактерий к антимикробным препаратам. Для обнаружения ГОБ, резистентных к карбапенемам, при первичном посеве клинического материала использовали среду «CHROMagar KPC» (DRG, Франция). Определение чувствительности ГОБ к антимикробным препаратам (АМП) проводили автоматизированным методом с помощью анализатора VITEK 2 и карт, предназначенных для определения минимальных ингибирующих концентраций (МИК) АМП, актуальных для ГОБ — GNS-101 и 102 (bioMerieux, Франция). При необходимости проводили дополнительные исследования с помощью Е-тестов на агаре Мюллера-Хин-тон (bioMerieux, Франция). Полученные МИК интерпретировались в соответствии с критериями, установленными в 2016 г. Европейским комитетом по определению чувствительности микроорганизмов к АМП (The European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing — EUCAST) [25]. При определении чувствительности бактерий к АМП на анализаторе VITEK 2, использовалась экспертная программа Advanced Expert System (AES), способная предположить механизм устойчивости микроорганизмов к АМП. AES использует базу данных, состоящую из более чем 2000 фенотипов антимикробной резистентности различных патогенных микроорганизмов.
ПЦР детекция генов, кодирующих карбапене-мазы. Гены карбапенемаз выявлялись методом
мультиплексной ПЦР с гибридизационно-флуоресцентной детекцией продуктов амплификации в режиме реального времени с использованием наборов реагентов «АмплиСенс® MDR MBL-FL», «АмплиСенс® MDR Ab-OXA-FL», и «АмплиСенс® MDR KPC/OXA-48-FL» (Интерлабсервис, Москва). Выявлялись гены, кодирующие приобретенные сериновые кар-бапенемазы групп KPC и OXA-48-подобных (OXA-48 и OXA-162), OXA-карбапенемаз аци-нетобактеров групп OXA-23-, OXA-58-, OXA-40/24-подобных и видоспецифичные карба-пенемазы A. baumannii (OXA-51-подобные) и металло-бета-лактамазы с карбапенемазной активностью групп VIM, IMP и NDM.
Результаты
С февраля 2014 г. по апрель 2016 г. из клинического материала 602 пациентов ФГБУ «РНЦРХТ» было выделено 813 клинически значимых штаммов бактерий, среди которых 405 ГОБ, среди которых в свою очередь 68,6% было представлено штаммами Escherichia coli (21,8%), K. pneumoniae (17%), E. cloacae (7,1%), P. aeruginosa (12,6%) и A. baumannii (10,1%). При первичном посеве клинического материала на селективную среду для отбора ГОБ, нечувствительных к карбапенемам (КНЧ), получено 23 штамма КНЧ ГОБ от 18 пациентов.
Пациенты. Из 18 пациентов, 12 проходили хирургическое лечение по поводу метастатических форм рака, 3-м пациентам с циррозом печени была проведена трансплантация печени, один пациент находился в стационаре с диагнозом эхинококкоз печени и один с атеросклерозом аорты (табл. 1).
Все пациенты перенесли внутриполостные операции в период их нахождения в ФГБУ «РНЦРХТ», причем в большинстве случаев более одной до момента получения КНЧ изо-лята. Период нахождения пациентов в стационаре варьировал от 7 до 97 дней, в течение которого большинство из них перемещалось между отделением реанимации и интенсивной терапии (ОРИТ) и другими отделениями стационара (рис. 1). Пациенты № 5 и № 15 находились только в ОРИТ, а пациент № 11 только в отделении сосудистой хирургии. КНЧ изоляты были получены во время пребывания пациентов в ОРИТ (пациенты № 1—5, 9—10, 13—15), отделении общей хирургии (№ 8), сосудистой хирургии (№ 11) и урологическом отделении (№ 12). Штамм K. pneumoniae № 7, продуцирующий NDM карбапенемазу, был выделен из мочи пациента в день его поступления в ОРИТ ФГБУ «РНЦРХТ» (конец апре-
Таблица 2. Чувствительность к антимикробным препаратам карбапенемаза-продуцирующих изолятов грамотрицательных бактерий
Table 2. Susceptibility to antimicrobial agents carbapenemase-producing isolates of gram-negative bacteria
Изолят Isolate Карбапенемаза Carbapenemase МИК*, мкг/мл MIC*, цд/ml Нечувствительность к категориям АМП** Non-susceptibility to category of AMA**
Амикацин Amikacin Гентамицин Gentamicin Нетилмицин Netilmecin Азтреонам Aztreonam Тигециклин Tigecycline Цефепим Cefepime Цефтазидим Ceftazidime Ципрофлоксацин Ciprofloxatin Колистин Colistin Имипенем Imipenem Меропенем Meropenem
K. pneumoniae
1 OXA48 2 1 1 64 Н/О|П0 64 64 1 0,5 2 1 2/6
5б 5b KPC 16 16 8 32 Н/О|П0 64 64 4 0,5 8 8 5/6
7 NDM 16 16 16 16 Н/О|П0 64 64 4 0,5 8 4 5/6
11 NDM 16 16 16 32 2 64 64 4 0,5 8 8 6/7
14а OXA48 4 16 32 Н/О|П0 64 64 2 0,5 16 4 5/6
18б 18b K*** C*** 16 16 16 32 Н/О|п0 64 64 4 0,5 16 16 5/6
S. marcescens
9 K C 8 8 8 32 Н/О|П0 32 32 4 16 8 16 6/6
E. cloacae
10б 10b KPC 16 16 16 32 4 64 64 4 16 8 8 7/7
18в 18c K C 2 16 4 32 Н/О|П0 64 64 4 0,5 2 16 5/6
P. aeruginosa
2 KPC 2 16 16 Н/О|П0 4 4 4 0,5 8 8 3/5
10а VIM 64 16 32 Н/О|П0 64 16 4 0,5 16 16 4/5
6 K C 4 4 4 н/О|п0 16 64 1 0,5 16 16 4/5
A. baumannii****
3 OXA51/40/24 16 16 16 32 0,5 64 64 4 0,5 16 16 3/4
4 OXA51/40/24 16 16 16 32 4 64 64 4 0,5 16 16 3/4
5а OXA51/40/24 16 16 16 32 32 64 64 4 0,5 16 16 3/4
8 К C 16 16 16 32 4 64 64 4 0,5 16 16 3/4
12 OXA51 16 16 16 32 4 64 64 4 0,5 1 0,25 2/4
13 OXA51/40/24 16 16 16 32 4 64 64 4 0,5 16 16 3/4
14б 14b OXA51/40/24 16 16 16 32 4 64 64 4 0,5 16 16 3/4
15 OXA51/40/24 64 16 16 32 4 64 64 4 0,5 16 16 3/4
16 OXA51/40/24 16 16 16 32 4 64 64 4 0,5 16 16 3/4
17 OXA51/40/24 16 16 32 64 4 64 64 4 0,5 16 16 3/4
18а OXA51/40/24 16 16 16 64 0,5 64 16 4 0,5 16 16 3/4
Примечания. *МИК-минимальная ингибирующая концентрация; н/о — не определялась. Жирным шрифтом выделены значения МИК АМП, соответствующие категории «нечувствительные» в соответствии с критериями EUCAST [25]. **В столбце указывается: количество категорий АМП с нечувствительностью бактерии хотя бы к одному препарату категории/количество протестированных категорий АМП. Категории в соответствии с Magiorakos et al. [19]. ***данные AES о наличии у изолята карбапенемазной активности. ****для АМП, выделенных серым фоном, пограничные значения МИК (MIC breakpoints) не определены [25].
Notes. *MIC-minimal inhibitory concentration; nd — not determined. MIC AMA corresponding category «nonsusceptible» according EUCAST criteria are given in bold [25]. In the column the following is indicated: number categories of AMA with non-susceptibility of the bacteria to at least one agent of the category/total number of the tested categories. The categories are given according to Magiorakos et al. [19]. "'information about carbapenemase activity of isolate is from AES. ****for AMA, highlighted with grey background, MIC breakpoints are not determined [25].
ля 2015). Поскольку пациент ранее не лечился в ФГБУ «РНЦРХТ», можно сделать вывод, что заражение пациента произошло вне данного стационара.
Клинический материал. Источниками выделения КНЧ штаммов ГОБ были кровь (n = 8), моча (n = 7), отделимое дыхательных путей (n = 5), ликвор (n = 1), отделяемое брюшной полости (n = 1) и желчь (n = 1).
Видовой состав КНЧ изолятов. Среди 23 КНЧ штаммов ГОБ 9 изолятов относятся к энтеробактериям (6 K. pneumoniae, 1 Serratia marcescens, 2 E. cloacae), 3 изолята P. aeruginosa и 11 изолятов A. baumannii (рис., табл. 2).
Чувствительность изолятов к карбапенемам. Минимальные ингибирующие концентрации АМП для выделенных штаммов ГОБ, полученные с помощью анализатора VITEK 2 приведены в табл. 2. Из 23 выросших на селективной среде КНЧ штаммов, 2 оказались
чувствительны к карбапенемам в соответствии с критериями EUCAST (МИК имипе-нема и меропенема < 2) — K. pneumoniae № 1 и A. baumannii № 12. Остальные штаммы эн-теробактерий либо резистентентны к карбапенемам (МИК выше 8 мкг/мл), либо уме-реннорезистентны к ним (2 < МИК < 8). Все 3 штамма P. aeruginosa умереннорезистентны к меропенему (1 < МИК < 16), в то время как 2 из них резистентны к имипенему (МИК > 8). Десять из 11 штаммов A. baumannii резистентны к карбапенемам (МИК > 8). Таким образом, суммарная доля КНЧ (резистентные + умереннорезистентные) штаммов составила 5,2% (21 штамм) от общего числа выделенных штаммов ГОБ (405 штаммов). У пациентов № 5, 10, 14 и 18 одновременно обнаружены несколько видов КНЧ ГОБ (см. рис.).
Карбапенемазы, выявленные у изолятов. ПЦР была проведена для 19 из 21 КНЧ штаммов ГОБ
п 2015 2016
н .
»z январь март май июль сентябрь ноябрь январь март
zr-2 january march may July September november january march
P.a. KPC (2, кровь/blood)
If A.b. OXA51/4Q/24 (3, кровь/blood)
2 |_
3
4 |__jtj A.b. OXA51/40/24 (4, кровь/blood)
5» | TT X] A.b. OXA51/40/24, K.p. KPC (5a, 56, кровь/blood)
7 T | K.p. NDM (7, моча/urine)
8 | T | A.b. K** (8, кровь/blood)___
9 | T X s.m. K** (9, кровь/ od)
10 | ^ | P.a. VIM (10a, моча/urine), E.c. KPC (106, дренаж/drainage)
11 | K.p. NDM (11, моча/urine)
12 | T | A.b. OXA51 (12, моча/urine)
13 A.b. OXA51/40/24 (13, БАЛ/ВАЦ | T X s, maltophilia (кровь/blood)
14 K.p. OXA48 (14a, кровь/blood), A.b. OXA51/40/24 (146, БАЛ/ВАцГ ' Xl C. albicans (кровь/blood)
15 A.b. OXA51/40/24 (15, мокрота/sputum) [ T ,
16 A.b. OXA51/40/24 (16, мокрота/sputum) _
17 A.b. OXA51/40/24 (17, ликвор/CSF***) [ T X
18 A.b. QXA51/40/24, K.p. K*\ E.c. K** (18a, 186, 18b, моча/urine) | T
Пациент 1/Patient 1 (февраль-мэрт/february-march 2014) - K.p. OXA48 (1, мокрота/sputum) Пациент 6/Patient 6 (2015) - P.a. K" (6, желчь/bile)
продолжительность пребывания в стационаре/length of stay in the hospital нахождение в ОРИТ/length of stay in the Reanimation and Intensive Care Unit
день выделения штамма ГОБ, нечувствительного к карбэпенемам/date of Isolation of carbapenem-nonsusceptlble bacteria смерть/death
P.a. — P. aeruginosa, K.p. — K. pneumoniae, A.b. — A. baumannii, S.m. — S. marcescens, S. maltophilia — Stenotrophomonas maltophilia, E.c. — E. cloacae, C. albicans — Candida albicans
Рисунок. Распределение во времени и локализация пациентов, инфицированных карбапенемаза-продуцирующими грамотрицательными бактериями
Figure. Distribution in time and location of hospital stays of patients infected with carbapenemase-producing gramnegative bacteria
Примечания. После видового названия ГОБ, указано название выявленной карбапенемазы. В скобках указан номер изолята и источник его выделения. *Пациент поступил в ОРИТ ФГБУ «РНЦРХТ» из другого стационара. **Данные AES о наличии у изолята карбапенемазной активности.
Notes. After the species name the type of detected carbapenemase is given. The number and source of the isolate
is in parentheses. *Patient admitted to the RICU of RRCRST from another hospital. "Information about carbapenemase activity
of isolate is from AES. ***Cerebrospinal fluid.
(для штаммов № 8 и № 6 ПЦР не проводилась), в 16 из них (84%) были обнаружены гены кар-бапенемаз (рис. 1, табл. 2).
Во всех КНЧ штаммах A. baumannii, кроме № 12, был выявлен ген приобретенной карба-пенемазы OXA-40/24. OXA-48-карбапенемаза выявлена в 2-х КНЧ штаммах K. pneumoniae. У двух из 6-ти КНЧ штаммов K. pneumoniae была выявлена NDM карбапенемаза. Оба штамма были выделены из мочи пациентов, находившихся в ФГБУ «РНЦРХТ» в марте (№ 7, отделение урологии) и октябре (№ 11, отделение сосудистой хирургии) 2015 г.
Из других металло-бета-лактамаз (МБЛ), обнаружена VIM МБЛ в одном КНЧ штамме P. aeruginosa (№ 10а). КРС карбапенемаза обнаружена в 3-х КНЧ изолятах: K. pneumoniae, E. cloacae и P. aeruginosa. В штаммах № 18б, № 18в и № 10а экспертная программа AES предположила наличие карбапенемаз, однако, гены карбапенемаз KPC, VIM, IMP, NDM, OXA-48, 23, 58, 40/24 не выявлены. Возможно, что штаммы содержат карбапенемазы других типов.
Чувствительность изолятов к АМП других категорий. Все КНЧ штаммы ГОБ за исключением двух (K. pneumoniae № 1, A. baumannii № 12) обладают MDR фенотипом, поскольку нечувствительны одновременно к АМП по крайней мере трех категорий. Особо надо отметить 3 штамма: E. cloacae (№ 10б) нечувствительный ко всем протестированным АМП, включая колистин и тигециклин, штамм S. marcescens (№ 9), нечувствительный к колистину и один из двух NDM-продуцирующих штаммов K. pneumoniae (№ 11), нечувствительный к ти-гециклину.
Обсуждение
В настоящем исследовании были определены частота встречаемости, профиль чувствительности к АМП, видовой состав и типы карбапенемаз карбапенемаза-продуцирующих ГОБ.
Суммарная доля КНЧ штаммов составила 5,2% от общего числа выделенных в исследовании штаммов ГОБ. Видовой состав КНЧ штаммов соответствует таковому на территории России: K. pneumoniae, E. cloacae, P. aeruginosa и A. baumannii. Доля нечувствительных к ими-пенему и меропенему изолятов K. pneumoniae, E. cloacae, P. aeruginosa и A. baumannii среди всех выделенных штаммов этих видов значительно ниже, чем в других стационарах России и составляет 7,2; 6; 6,8 и 27% соответственно [2—7, 9, 10, 16, 22]. Нами выявлено три случая зара-
жения одного пациента несколькими видами карбапенем-нечувствительных ГОБ. Случаи одновременного обнаружения нескольких КНЧ видов бактерий у одного пациента описаны в литературе и возможно являются следствием увеличения суммарного количества и разнообразия КНЧ видов ГОБ как в окружающей среде отдельных стационаров так и по всему миру [12].
У КНЧ штаммов были выявлены карба-пенемазы типов NDM, VIM, КРС, ОХА-48 и OXA40/24. Ген blaNDM был обнаружен у двух из 6-ти КНЧ штаммов K. pneumoniae. Наличие гена blaNDM обычно ассоциируется с устойчивостью бактерии к большинству используемых в клинике АМП. NDM карбапенемаза впервые была обнаружена в 2008 г. в штамме K. pneumoniae, полученном из образца мочи пациента из Индии [27]. К 2015 г. она распространилась глобально и была идентифицирована у разных видов энтеробактерий, P. aeruginosa, A. baumannii и других менее вирулентных видов бактерий [21]. В Санкт-Петербурге почти все полученные к 2013 г. госпитальные КНЧ штаммы K. pneumoniae являлись носителями гена blaNDM-1 [2, 9]. 80% из них имели МИКи имипенема между 4 и 16 мкг/мл и меропенема между 16 и 64 мкг/ мл, остальные 20% выше данных значений [9]. Уровень резистентности к меропенему у штаммов в нашем исследовании значительно ниже 4—8 мкг/мл. В отличие от других исследований, проведенных в Санкт-Петербурге, мы не наблюдали превалирования NDM кар-бапенемазы у КНЧ штаммов K. pneumoniae. Кроме нее в 2-х КНЧ штаммах K. pneumoniae была выявлена OXA-48-карбапенемаза. OXA-48-карбапенемаза впервые идентифицирована у мультирезистентного нозокомиального штамма K. pneumoniae, выделенного в Турции в 2001 г. [11]. Начиная с 2010 г. она была обнаружена у госпитальных штаммов бактерий семейства Enterobacteriaceae в странах Среднего Востока, Северной Африки и Европе, а с 2011 г. в России [5, 23]. В 2012 г. OXA-48-карбапенемаза была выявлена у мультирези-стентного штамма K. pneumoniae, вызвавшего вспышку госпитальной инфекции в одном из стационаров Москвы [16]. В отношении уровня устойчивости к карбапенемам у OXA-48-продуцирующих штаммов K. pneumoniae, выделенных в России, наблюдается превалирование двух групп: одна с МИК имипенема 32 мкг/мл (~50% штаммов), другая — 4 мкг/мл (~30% штаммов). Также 2 группы существуют для меропенема: около половины штаммов имеют МИК 32 мкг/мл и около трети —
0,5 мкг/мл [5]. В нашем исследовании, из 2-х штаммов K. pneumoniae, несущих ген blaOXA_48, один нечувствителен к имипенему и меропе-нему, а второй чувствителен к обоим карбапе-немам. Различие в уровне чувствительности к карбапенемам может быть связано с функционированием различных механизмов резистентности как у наших штаммов, так и у выделенных в России другими исследователями. OXA-48 фермент имеет слабую активность в отношении карбапенемов, однако у мульти-резистентных энтеробактерий она часто сочетается с повышенной экспрессией бета-лакта-маз расширенного спектра (extended-spectrum ß-lactamase — ESBL), имеющих некоторую карбапенемазную активность (например, CTX-M бета-лактамаза), и уменьшенной проницаемостью наружной мембраны, чем может достигаться высокий уровень резистентности к карбапенемам у OXA-48 продуцентов [23].
КРС карбапенемаза обнаружена нами в 3-х КНЧ изолятах: K. pneumoniae, E. cloacae и P. aeruginosa. МИКи имипенема и меропене-ма у всех 3-х изолятов — 8 мкг/мл. Ген blaKPC-1 с плазмидной локализацией был идентифицирован в 2001 г. у госпитального штамма K. pneumoniae, выделенного в 1996 г. в Америке и имевшего МИКи имипенема и меропенема 16 мкг/мл [26]. В России до настоящего времени описаны единичные случаи обнаружения этой карбапенемазы.
Из металло-бета-лактамаз (МБЛ), кроме NDM карбапенемазы, нами обнаружена VIM МБЛ в одном штамме P. aeruginosa. VIM-продуцирующий штамм P. aeruginosa был впервые выделен из раны хирургического больного в 1997 г. в Италии [18]. К 2005 г. VIM МБЛ распространилась глобально [21]. В России количество штаммов P. aeruginosa, продуцирующих МБЛ, увеличилось с 0% в 1999 г. до 28% в 2012 г., причем единственной МБЛ, выявленной у P. aeruginosa в 2012 г. была МБЛ VIM-типа с МИК имипенема 128 мкг/мл и меропенема > 32 мкг/мл [7, 13]. VIM-продуцирующий штамм P. aeruginosa, выделенный в нашем исследовании, имеет значительно меньший уровень резистентности с МИК обоих карбапене-мов 16 мкг/мл.
У всех штаммов A. baumannii выявлен ген карбапенемазы OXA51, что соответствует литературным данным о том, что наличие гена blaOXA-51 в геноме A. baumannii является видовым признаком этой бактерии [15]. Ген blaOXA-51, имеет хромосомную локализацию, и если не изменен геномными перестройками в промоторной области, слабо экспрессирует-ся и не придает бактерии резистентный к кар-
бапенемам фенотип [15]. Этим может объясняться тот факт, что штамм № 12, в котором обнаружен только ген blaOXA-
51, чувствителен к обоим протестированным карбапенемам. Во всех штаммах A. baumannii, кроме № 12, был выявлен также ген OXA-40/24 карбапенемазы, что соответствует эпидемиологическим данным о широкой распространенности на территории России бета-лактамазы OXA-40/24 типа у нозокомиальных штаммов A. baumannii [3]. Поскольку в нашем исследовании не проводилось молекулярное типирование штаммов A. baumannii, сделать заключение о клональности распространения ОХА40/24-продуцентов затруднительно. Интересно заметить, что в отличие от OXA-40/24-продуцирующих штаммов A. baumannii, выделенных в стационарах России, которые в большинстве случаев имеют высокий уровень устойчивости к имипенему и меропе-нему с типичными МИК 128 мкг/мл, OXA-40/24-продуценты в нашем исследовании имеют сравнительно низкие значения МИК этих карбапенемов — 16 мкг/мл [6].
90% КНЧ штаммов в нашем исследовании обладают MDR фенотипом. В целях стандартизации описания и классификации бактерий, устойчивых одновременно ко многим АМП, экспертной группой Европейского общества по клинической микробиологии и инфекционным заболеваниям (European Society of Clinical Microbiology and Infectious Disease — ESCMID) для каждой бактерии или группы бактерий был предложен список «категорий» АМП для определения фенотипов MDR, XDR и PDR [19]. Для определения MDR, XDR и PDR у бактерий семейства Enterobacteriaceae предложено использовать 17 категорий АМП (содержащих 28 АМП), у P. aeruginosa — 8 категорий (17 АМП) и у A. baumannii — 9 категорий (22 АМП). В соответствии с выработанными экспертной группой критериями, бактерия обладает MDR фенотипом, если она нечувствительна как минимум к 3-м препаратам, относящимся к различным категориям АМП; XDR фенотипом, если она нечувствительна хотя бы к одному препарату всех кроме одной-двух категорий АМП и PDR фенотипом, если она нечувствительна ко всем препаратам всех категорий АМП [19]. В нашем исследовании тестировалась чувствительность карбапенемаза-продуцирующих изоля-тов к АМП 6—7 категорий АМП. Все штаммы бактерий за исключением двух (K. pneumoniae № 1, A. baumannii № 12) обладали MDR фенотипом, поскольку были нечувствительны одновременно к АМП по крайней мере трех
категорий. Обладал ли какой-либо изолят XDR/PDR фенотипом определить не удалось, так как для этого необходимы данные по чувствительности изолятов к большему количеству АМП, чем было протестировано в нашем исследовании.
Заключение
Исследование проводилось с февраля 2014 г. по апрель 2016 г. В течение этого периода было выделено 405 штаммов грамотрицательных бактерий из клинического материала пациентов. Выделен 21 штамм (суммарная доля 5,2% среди штаммов ГОБ), нечувствительных к имипенему и/или меропенему ГОБ, причем показано, что пациент одновременно может быть инфицирован карбапенем-нечувстви-тельными штаммами разных видов ГОБ. Уровень резистентности к имипенему и меропе-нему выделенных карбапенемаза-продуциру-ющих штаммов значительно ниже типичного для таких штаммов, выделенных в стационарах России. Видовой состав карбапенемаза-про-дуцирующих КНЧ ГОБ и типы обнаруженных приобретенных карбапанемаз характерны для территории России: K. pneumoniae, E. cloacae, P. aeruginosa, A. baumannii и КРС, ОХА-48, VIM,
NDM, OXA40/24 соответственно. Хотя у отдельных видов энтеробактерий и P. aeruginosa не обнаружено превалирования какого-либо одного типа карбапенемаз, все выявленные карбапенем-нечувствительные штаммы A. baumannii — продуценты OXA40/24 карбапе-немазы. 96% карбапенемаза-продуцирующих штаммов ГОБ имели фенотип множественной резистентности к антимикробным препаратам, причем три из них были нечувствительны к колистину и/или тигециклину.
В заключение следует заметить, что хотя суммарная доля карбапенем-нечувствитель-ных штаммов ГОБ, выделенных в исследовании, сравнительно невелика, все они обладают множественной устойчивостью к АМП и в большинстве из них обнаружены гены приобретенных карбапенемаз, что в совокупности делает эти штаммы особо эпидемиологически и клинически опасными.
Благодарность
Выражаем благодарность сотруднику ФБУН ЦНИИ эпидемиологии Роспотребнадзора, Москва, Савочкиной Ю.А. за предоставленный набор реагентов и методику для выявления генов OXA-карбапенемаз ацинетобактеров.
Список литературы/References
1. Бабенко Д.Б., Лавриненко А.В., Захарова Е.А., Шамбилова Н.А., Азизов И.С. Лабораторная детекция карбапенемаза-продуцирующих энтеробактерий // Лабораторная медицина. 2012—2013. Т. 1—2, № 4. С. 47—61. [Babenko D.B., Lavrinenko A.V., Zakharova E.A., Shamilova N.A., Azizov I.S. Laboratory detection of carbapenemase-producing enterobacte-ria. Laboratornaya meditsina = Laboratory Medicine, 2012—2013, vol. 1—2, no. 4, pp. 47—61. (In Russ.)]
2. Егорова С.А., Кафтырева Л.А., Липская Л.В., Коноваленко И.Б., Пясетская М.Ф., Курчикова Т.С., Ведерникова Н.Б., Морозова О.Т., Смирнова М.В., Попенко Л.Н., Любушкина М.И., Савочкина Ю.А., Макарова М.А., Сужаева Л.В., Останкова Ю.В., Иванова М.Н., Павелкович А.М., Наабер П., Сепп Э., Кыльялг С., Mицюлявичeне И., Балоде А. Штаммы энтеробактерий, продуцирующие бета-лактамазы расширенного спектра и металло-Р-лактамазу NDM-1, выделены в стационарах в странах Балтийского региона // Инфекция и иммунитет. 2013. Т. 3, № 1. С. 29—36. [Egorova S.A., Kaftyreva L.A., Lipskaya L.V., Konovalenko I.B., Pyasetskaya M.F., Kurchikova T.S., Vedernikova N.B., Morozova O.T., Smirnova M.V., Popenko L.N., Lubushkina M.I., Savochkina J.A., Makarova M.A., Suzhaeva L.V., Ostankova J.V., Ivanova M.N., Pavelkovich A.M., Naaber P., Sepp E., Koljalg S., Miciuleviciene J., Balode A. Enterobacteriacae, producing ESBLs and metallo-P-lactamase NDM-1, isolated in hospitals of Baltic region countries. Infektsiya i immunitet = Russian Journal of Infection and Immunity, 2013, vol. 3, no. 1, pp. 29-36. doi: 10.15789/2220-7619-2013-1-29-36 (In Russ.)]
3. Мартинович А.А., Эйдельштейн М.В. Рост нечувствительности к карбапенемам и частоты продукции карбапенемаз у нозокомиальных штаммов Acinetobacter spp. в России в 2002—2012 гг. // Вестник Смоленской Государственной Медицинской Академии. 2014. Т. 13, № 2. С. 34—39. [Martinovich A.A., Edelstein M.V. Increase of carbapenem-non-sus-ceptibility and carbapenemase production rate in nosocomial Acinetobacter spp. in Russia in 2002—2012. Vestnik Smolenskoi Gosudarstvennoi Meditsinskoi Akademii = Herald of the Smolensk State Academy, 2014, vol. 13, no. 2, pp. 34-39. (In Russ.)]
4. Светличная Ю.С. Распространение карбапенем устойчивых штаммов А. baumannii в многопрофильных стационарах Санкт-Петербурга // Медицинский альманах. 2015. Т. 5, № 40. С. 102—105. [Svetlichnaya Yu.S. Spread of carbapanem-resistant strains of A. baumannii in multipurpose day-and-night clinics of Saint Petersburg. Meditsinskii al'manakh = Medical Almanac, 2015, vol. 5, no. 40, pp. 102-105. (In Russ.)]
5. Сухорукова М.В., Эйдельштейн М.В., Склеенова Е.Ю., Иванчик Н.В., Тимохова А.В., Шек Е.А., Дехнич А.В., Козлов Р.С. Антибиотикорезистентность нозокомиальных штаммов Enterobacteriaceae в стационарах России: результаты многоцентрового эпидемиологического исследования МАРАФОН в 2011—2012 гг. // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2014. Т. 16, № 4. С. 254—265. [Sukhorukova МУ, Edelstein МУ, Skleenova E.Yu., Ivanchik N.V., Timokhova АУ, Sheck Е.А., Dekhnich АУ, Kozlov R.S., «MARATHON» Study Group. Antimicrobial resis-
tance of nosocomial Enterobacteriaceae isolates in Russia: results of national multicenter surveillance study «MARATHON» 2011—2012. Klinicheskaya mikrobiologiya i antimikrobnaya khimioterapiya = Clinical Microbiology and Antimicrobial Chemotherapy, 2014, vol. 16, no. 4, pp. 254-265. (In Russ.)]
6. Сухорукова М.В., Эйдельштейн М.В., Склеенова Е.Ю., Иванчик Н.В., Тимохова А.В., Шек Е.А., Дехнич А.В., Козлов Р.С. и исследовательская группа «МАРАФОН». Антибиотикорезистентность нозокомиальных штаммов Acinetobacter spp. в стационарах России: результаты многоцентрового эпидемиологического исследования МАРАФОН в 2011—2012 гг. // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2014. Т. 16, № 4. С. 266—272. [Sukhorukova МУ, Edelstein МУ, Skleenova E.Yu., Ivanchik N.V., Timokhova АУ, Sheck Е.А., Dekhnich АУ, Kozlov R.S., «MARATHON» Study Group. Antimicrobial resistance of nosocomial Acinetobacter spp. isolates in Russia: results of national multicenter surveillance study «MARATHON» 2011—2012. Klinicheskaya mikrobiologiya i antimikrobnaya khimioterapiya = Clinical Microbiology and Antimicrobial Chemotherapy, 2014, vol. 16, no. 4, pp. 266-272. (In Russ.)]
7. Сухорукова М.В., Эйдельштейн М.В., Склеенова Е.Ю., Иванчик Н.В., Тимохова А.В., Шек Е.А., Дехнич А.В., Козлов Р.С. Антибиотикорезистентность нозокомиальных штаммов Pseudomonas aeruginosa в стационарах России: результаты многоцентрового эпидемиологического исследования МАРАФОН в 2011—2012 гг. // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2014. Т. 16, № 4. С. 273—279. [Sukhorukova М.У, Edelstein МУ, Skleenova E.Yu., Ivanchik N.V., Timokhova АУ, Sheck Е.А., Dekhnich АУ, Kozlov R.S., «MARATHON» Study Group. Antimicrobial Resistance of Nosocomial Pseudomonas aeruginosa isolates in Russia: results of national multicenter surveillance study «MARATHON» 2011—2012. Klinicheskaya mikrobiologiya i antimikrobnaya khimioterapiya = Clinical Microbiology and Antimicrobial Chemotherapy, 2014, vol. 16, no. 4, pp. 273-279. (In Russ.)]
8. Тапальский Д.В., Осипов В.А., Жаворонок С.В. Карбапенемазы грамотрицательных бактерий: распространение и методы детекции // Медицинский журнал. 2012. Т. 2, № 40. С. 10—15. [Tapalski D.V., Osipov V.A., Zhavoronok S.V. Carbapenemases of gram-negative pathogens: spread and methods of detection. Meditsinskii zhurnal = Medical Journal, 2012, vol. 2, no. 40, pp. 10-15. (In Russ.)]
9. Ageevets V.A., Partina I.V., Lisitsyna E.S., Ilina E.N., Lobzin Yu.V., Shlyapnikov S.A., Sidorenko S.V. Emergence of carbapene-mase-producing Gram-negative bacteria in Saint Petersburg, Russia. Int. J. Antimicrob. Agents, 2014, vol. 44, no. 2, pp. 152-155.
10. Barantsevich E.P., Churkina I.V., Barantsevich N.E., Pelkonen J., Schlyakhto E.V., Woodford N. Emergence of Klebsiella pneumoniae producing NDM-1 carbapenemase in Saint Petersburg, Russia. J. Antimicrob. Chemother., 2013, vol. 68, no. 5, pp. 12041206.
11. Carrer A., Poirel L., Eraksoy H., Cagatay A.A., Badur S., Nordmann P. Spread of OXA-48-positive carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae isolates in Istanbul, Turkey. Antimicrob. Agents Chemother., 2008, vol. 52, no. 8, pp. 2950-2954. doi: 10.1128/ AAC.01672-07
12. Creighton J., Heffernan H., Howard J. Isolation of seven distinct carbapenemase-producing gram-negative organisms from a single patient. J. Antimicrob. Chemother., 2017, vol. 72, no. 1, pp. 317-319. doi: 10.1093/jac/dkw378
13. Edelstein M.V., Skleenova E.N., Shevchenko O.V., D'souza J.W., Tapalski D.V., Azizov I.S., Sukhorukova M.V., Pavlukov R.A., Kozlov R.S., Toleman M.A., Walsh T.R. Spread of extensively resistant VIM-2-positive ST235 Pseudomonas aeruginosa in Belarus, Kazakhstan, and Russia: a longitudinal epidemiological and clinical study. Lancet Infect. Dis., 2013, vol. 13, no. 10, pp. 867-876. doi: 10.1016/S1473-3099(13)70168-3
14. European Centre for Disease Prevention and Control. Carbapenemase-producing bacteria in Europe: interim results from the European Survey on carbapenemase-producing Enterobacteriaceae (EuSCAPE) project. Stockholm: ECDC 2013. URL: http:// www.ecdc. europa.eu
15. Evans B.A., Amyes S.G. OXA ß-lactamases. Clin. Microbiol. Rev., 2014, vol. 27, no. 2, pp. 241-263. doi: 10.1128/CMR.00117-13
16. Fursova N.K., Astashkin E.I., Knyazeva A.I., Kartsev N.N., Leonova E.S., Ershova O.N., Alexandrova I.A., Kurdyumova N.V., Sazikina S.Yu., Volozhantsev N.V., Svetoch E.A., Dyatlov I.A. The spread of bla OXA-48 and bla OXA-244 carbapenemase genes among Klebsiella pneumoniae, Proteus mirabilis and Enterobacter spp. isolated in Moscow, Russia. Ann. Clin. Microbiol. Antimicrob., 2015, vol. 14, pp. 46-53.
17. Gutkind G., Di Conza J., Power P., Radice M. ß-lactamase-mediated resistance: a biochemical, epidemiological and genetic overview. Curr. Pharm. Des., 2013, vol. 19, no. 2, pp. 164-208.
18. Lauretti L., Riccio M., Mazzariol A., Cornaglia G., Amicosante G., Fontana R., Rossolini G.M. Cloning and characterization of blaVIM, a new integron-borne metallo-beta-lactamase gene from a Pseudomonas aeruginosa clinical isolate. Antimicrob. Agents Chemother., 1999, vol. 43, no. 7, pp. 1584-1590.
19. Magiorakos A.P., Srinivasan A., Carey R.B., Carmeli Y., Falagas M.E., Giske C.G., Harbarth S., Hindler J.F., Kahlmeter G., Olsson-Liljequist B., Paterson D. L., Rice L.B., Stelling J., Struelens M.J., Vatopoulos A., Weber J.T., Monnet D.L. Multidrug-resistant, extensively drug-resistant and pandrug-resistant bacteria: an international expert proposal for interim standard definitions for acquired resistance. Clin. Microbiol. Infect., 2012, vol. 18, pp. 268-281. doi: 10.1111/j.1469-0691.2011.03570.x
20. Meletis G. Carbapenem resistance: overview of the problem and future perspectives. Ther. Adv. Infect. Dis., 2016, vol. 3, no. 1, pp. 15-21. doi: 10.1177/2049936115621709
21. Nordmann P. Carbapenemase-producing Enterobacteriaceae: overview of a major public health challenge. Med. Mal. Infect., 2014, vol. 44, no. 2, pp. 51-56. doi: 10.1016/j.medmal.2013.11.007
22. Nordmann P., Poirel L. The difficult-to-control spread of carbapenemase producers among Enterobacteriaceae worldwide. Clin. Microbiol. Infect., 2014, vol. 20, pp. 821-830. doi: 10.1111/1469-0691.12719
23. Poirel L., Potron A., Nordmann P. OXA-48-like carbapenemases: the phantom menace. J. Antimicrob. Chemother., 2012, vol. 67, no. 7, pp. 1597-1606. doi: 10.1093/jac/dks121
24. Queenan A.M., Bush K. Carbapenemases: the versatile ß-lactamases. Clin. Microbiol. Rev., 2007, vol. 20, no. 3, pp. 440-458. doi: 10.1128/CMR.00001-07
25. The European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing (EUCAST). Breakpoint tables for interpretation of MICs and zone diameters. Version 6.0, 2016. URL: http://www.eucast.org
26. Yigit H., Queenan A.M., Anderson G.J., Domenech-Sanchez A., Biddle J.W., Steward C.D., Alberti S., Bush K., Tenover F.C. Novel carbapenem-hydrolyzing beta-lactamase, KPC-1, from a carbapenem-resistant strain of Klebsiella pneumoniae. Antimicrob. Agents Chemother., 2001, vol. 45, no. 4, pp. 1151-1161. doi: 10.1128/AAC.45.4.1151-1161.2001
27. Yong D., Toleman M.A., Giske C.G., Cho H.S., Sundman K., Lee K., Walsh T.R. Characterization of a new metallo-beta-lacta-mase gene, bla(NDM-l), and a novel erythromycin esterase gene carried on a unique genetic structure in Klebsiella pneumoniae sequence type 14 from India. Antimicrob. Agents Chemother., 2009, vol. 53, no. 12, pp. 5046-5054. doi: 10.1128/AAC.00774-09
Авторы:
Полищук А.Г., к.б.н., старший научный сотрудник лаборатории генной инженерии ФГБУ Российский научный центр радиологии и хирургических технологий МЗ РФ, Санкт-Петербург, Россия; Якубович Е.И., к.б.н., ведущий научный сотрудник лаборатории генной инженерии ФГБУ Российский научный центр радиологии и хирургических технологий МЗ РФ, Санкт-Петербург, Россия; Полухина О.В., к.м.н, зав. бактериологической лабораторией ФГБУ Российский научный центр радиологии и хирургических технологий МЗ РФ, Санкт-Петербург, Россия; Осовских В.В., к.м.н., руководитель группы анестезиологии и реаниматологии ФГБУ Российский научный центр радиологии и хирургических технологий МЗ РФ, Санкт-Петербург, Россия; Евтушенко В.И., д.б.н., руководитель лаборатории генной инженерии ФГБУ Российский научный центр радиологии и хирургических технологий МЗ РФ, Санкт-Петербург, Россия.
Поступила в редакцию 23.11.2016 Принята к печати 16.01.2017
Authors:
Polischouk A.G., PhD (Biology), Senior Researcher, Laboratory of Gene Engineering, Russian Research Centre of Radiology and Surgical Technologies, St. Petersburg, Russian Federation; Jakubovich E.I., PhD (Biology), Leading Researcher Laboratory of Gene Engineering, Russian Research Centre of Radiology and Surgical Technologies, St. Petersburg, Russian Federation; Poluhina O.V., PhD (Medicine), Head of Bacteriological Laboratory, Russian Research Centre of Radiology and Surgical Technologies, St. Petersburg, Russian Federation;
Osovskich V.V., PhD (Medicine), Head of Anesthesiology and Rheumatology Group, Russian Research Centre of Radiology and Surgical Technologies, St. Petersburg, Russian Federation; Evtushenko V.I., PhD, MD (Biology), Head of Laboratory of Gene Engineering, Russian Research Centre of Radiology and Surgical Technologies, St. Petersburg, Russian Federation.
Received 23.11.2016 Accepted 16.01.2017
