CC BY
14
УДК 616.928.8(675)
А.Ю.Попова1,2, В.А.Терновой3, о.В.Пьянков3, Е.В.Чаусов3, Ар.А.сергеев3, А.С.Кабанов3, с.А.Боднев3, р.Б.Баяндин3, В.М.Блинов3, N.F.Magassouba 4, В.В.Кутырев5, Ю.В.Демина1, Е.Б.Ежлова1,
А.П.Агафонов3, В.н.михеев3
изучение свойств изолятов ЭБолдвируСА заир 2014
'Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека, Москва, Российская Федерация; 2Российская медицинская академия последипломного образования, Москва, Российская Федерация; 3ФБУН «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор», п. Кольцово, Российская Федерация; 4Государственная больница «Донка», Конакри, Гвинейская Республика; 5ФКУЗ «Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб», Саратов,
Российская Федерация
Анализ 5 изолятов эболавируса Заир 2014, которые прошли пассажи на культурах клеток или мышах, показал в ряде случаев наличие уникальных мутаций в геномной РНК. Все идентифицированные нуклеотидные замены единичны, располагаются стохастически и являются либо синонимичными, либо приходятся на некодирующие участки генома эболавируса, не приводя к возникновению замен аминокислотных. Уровень вариабельности ну-клеотидных последовательностей составил 0,005-0,01 %, что подтверждает чрезвычайно высокую генетическую стабильность эболавируса Заир, вызвавшего вспышку. Подтвержден факт подавления накопления в вариантах эболавируса несинонимичных мутаций с течением времени. Обнаружены изменения в сайтах гликозилирования и муцин-подобном домене гликопротеина эболавируса.
Ключевые слова: эболавирус, Гвинея, геном вируса, мутации, мыши-сосунки.
A.Yu.Popova12, V.A.Ternovoy3, O.V.P'yankov3, E.V.Chausov3, Ar.A.Sergeev3, A.S.Kabanov3, S.A.Bodnev3, R.B.Bayandin3, V.M.Blinov3, N.F.Magassouba4, V.V.Kutyrev5, Yu.V.Demina1, E.B.Ezhlova1, A.P.Agafonov3, V.N.Mikheev3
Analysis of Ebola virus Zaire 2014 isolates
'Federal Service for Surveillance in the Sphere of Consumers Rights Protection and Human Welfare, Moscow, Russian Federation;2Russian Medical Academy for Post-Graduate Training, Moscow, Russian Federation;3 State Scientific Center of Virology and Biotechnology "Vector", Kol'tsovo, Russian Federation; 4Donka National Hospital, Conakry, Republic of Guinea;5Russian Research Anti-Plague Institute "Microbe", Saratov, Russian Federation
Analysis of 5 Ebola virus Zaire 2014 isolates passaged in cell cultures or in mice, demonstrated presence of unique mutations in the genome RNA in some cases. All identified nucleotide substitutions are singular, stochastically located, synonymous or fall within non-coding regions. Variability level of nucleotide sequences is equal to 0.005-0.01 %, suggesting extremely high genetic stability of Ebola virus Zaire, the causative agent of the outbreak. Confirmed is suppression of non-synonymous mutations accumulation in ebola-virus variants in the course of time. Detected are alterations in glycosilation sites and mucin-like domain of ebolavirus glycoprotein.
Key words: ebolavirus, Guinea, virus genome, mutations, suckling mice.
В деревне префектуры Гекеду на юге Гвинеи 26 декабря 2013 г. заболел 18-месячный мальчик. Считается, что он, заразившись от крылана или какого-либо другого дикого животного, стал первой жертвой начинающейся эпидемии, охватившей страны Западной Африки и ставшей крупнейшей и наиболее сложной в истории этой болезни. Эпидемия болезни, вызванной вирусом Эбола, начавшаяся в Гвинейской Республике в декабре 2013 г. в г. Мельянду (префектура Гекеду) [4], в 2014 г. стремительно распространилась и охватила соседние с Гвинеей страны - Либерию и Сьерра-Леоне [6]. Тем не менее, происхождение вируса в каждой из стран и время его передачи не известны, и в настоящее время проведение эпидемиологического анализа основано лишь на предположениях [10].
Широкомасштабная и интенсивная передача этой болезни оказала опустошительное воздействие на семьи и местные сообщества, подорвала систему
основных гражданских и медико-санитарных услуг и ослабила экономику 3 стран Западной Африки -Либерии, Гвинейской Республики и Сьерра-Леоне, где зарегистрировано в общей сложности более 27,5 тыс. больных и более 11 тыс. летальных исходов [1].
Эпидемию 2013-2015 гг. вызвал наиболее патогенный для человека эболавирус Заир [4]. Одной из главных задач, стоящих перед эпидемиологами, было получение ответа на вопрос, связано ли непрекращающееся распространение болезни по странам Западной Африки с изменением свойств эболавируса Заир.
В Гвинейскую Республику для оказания содействия в борьбе с БВВЭ направлен мобильный комплекс специализированной противоэпидемической бригады (МК СПЭБ) Роспотребнадзора РФ, основной задачей которого стала организация дифференциальной лабораторной диагностики лихорадки Эбола [2].
Целью данных исследований является выделение и изучение биологических свойств штаммов эбо-лавируса Заир 2014.
Материалы и методы
Материалом для исследования служили 6 образцов крови, 6 - грудного молока, 2 - смывов и по одному образцу семенной жидкости и мочи от больных с лабораторно подтвержденным диагнозом «лихорадка Эбола в острой стадии» (табл. 1). Забор материала осуществлен в госпитале Донка в соответствии с договором с Институтом Пастера Гвинеи. По данным ПЦР-исследования, во всех образцах содержался генетический материал эболавируса Заир. Для выделения вируса использовали культуры клеток Vero и 4647, полученные из отдела клеточных культур ФБУН ГНЦ ВБ «Вектор», мышей-сосунков линии BALB/c, полученных из питомника лабораторных животных ФБУН ГНЦ ВБ «Вектор». Животных содержали согласно ветеринарному законодательству и в соответствии с требованиями по гуманному содержанию и использованию животных в экспериментальных исследованиях [3]. Репликацию вируса в культуре клеток и органах и тканях животных подтверждали методом ПЦР.
Все эксперименты проведены в лаборатории с максимальным уровнем биологической защиты (BSL-4) с использованием изолирующих пневмоко-стюмов на базе ФБУН ГНЦ ВБ «Вектор».
Таблица 1
Клинические образцы, собранные в госпитале Донка, Гвинейская Республика, март—апрель 2015 г.
№ образца Тип образца Значение С в ПЦР (исходный образец) Биопроба
КК Мыши
Vero 4647
GVR02 Кровь 19,1 +1 отр. +
GVR03 Молоко 24,6 отр. отр. +
GVR04 Молоко 32,3 отр. отр. отр.
GVR05 смыв 24,2 +1 отр. +
GVR06 смыв 27,8 отр. отр. отр.
GVR07 Кровь 25,2 отр. отр. +1
GVR08 Молоко 20,8 + +1 +
GVR09 Кровь 26,2 +1 отр. +
GVR10 Моча 23,0 отр. отр. отр.
GVR11 Молоко 22,0 отр. отр. отр.
GVR12 Молоко 25,1 отр. отр. отр.
GVR13 семя 33,2 отр. отр. отр.
GVR14 Кровь 38,4 отр. отр. отр.
GVR15 Кровь2 18,1 + отр. +
GVR19 Молоко 23,7 отр. отр. отр.
GVR20 Кровь 31,2 отр. отр. отр.
Примечания: С( - параметр используется как показатель вирусной нагрузки в образце; КК - культура клеток; + - образец положительный в ПЦР, отр. - образец негативный в ПЦР.
'Секвенирование генома вируса Эбола осуществлено из вируса, прошедшего один пассаж на культуре клеток.
2Секвенирование генома вируса Эбола осуществлено из клинического материала.
Выделение тотальной РНК проводили с использованием набора реагентов для выделения РНК/ДНК из клинического материала «Рибо-Преп» (ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора, Москва) согласно инструкции производителя. построение кдНК проводили с использованием комплекта реагентов для получения кдНК на матрице РНК «Реверта-L» (ФБУН ЦНИИ эпидемиологии Роспотребнадзора, москва) согласно инструкции производителя. для диагностики лихорадки Эбола использовали зарегистрированные ПЦР-тест-системы отечественного производства «Вектор-ПЦРрв-Эбола-RG» (ФБУН ГНЦ ВБ «Вектор») и «АмплиСенс EBOVZair1-FL» (ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора, Москва). Образцы с высоким содержанием вирусного материала (Ct<25) были использованы для определения нуклеотидной последовательности геномной РНК вируса Эбола. Для секвенирования использовали панель праймеров для получения перекрывающихся фрагментов ДНК, составляющих полный геном вируса Эбола.
определение нуклеотидной последовательности выделенных ПЦР-фрагментов проводили на генетическом анализаторе ABI 3130х/ DNA Analysis System («Hitachi») с использованием набора «BigDye Terminator v3.1 Cycle cequencing Kit» (ABI, США). Филогенетический анализ осуществляли с использованием прикладных программ MEGA 5 (PSU) и DNASTAR Lasergene 9. Для анализа нуклеотидных последовательностей вируса Эбола нами использована электронная база данных GenBank.
Результаты и обсуждение
Заражение клиническими образцами монослой-ных культур клеток показало, что эффективность репликации эболавируса Заир 2014 в клетках Vero и 4647 невысока: только 6 образцов из 16 показали наличие генетического материала - РНК эболавируса Заир в лизате культур клеток. Внутримозговое заражение мышей-сосунков подтвердило способность эболавируса Заир к размножению в этих животных: 7 из 16 проб показали положительный результат в пЦР при анализе крови и мозговой ткани зараженных мышей. (табл. 1). Исходный образец крови GVR15, образцы лизата культур клеток (GVR02, GVR05, GVR08, GVR09) и гомогената мозга мыши GVR07 взяты для определения последовательности генома эболавируса Заир 2014.
полный геном из исходного образца получен только с использованием пробы GVR15. Проведенный анализ полной нуклеотидной последовательности геномной РНК позволил установить, что этот вариант эболавируса Заир наиболее близок к изоляту H.sapiens-wt/SLE/2014/ManoRiver-G3818. Сравнение гена, кодирующего наиболее важный, с точки зрения изменения биологических свойств, GP белок, с геном гликопротеина вируса Эбола Заир 1976 показал, что
Таблица 2
Сравнительная таблица аминокислотных замен в гликопротеине эболавируса Заир 2014 и вируса Эбола Заир 1976
Позиция а.о. в белке GP
Аминокислота в геноме эболавируса Заир 2014 (GVR15)
Аминокислота в геноме вируса Эбола Заир 1976 (AF086833.2)
82 262 310 315 331 336 359
377
378 382 405 411 422 430 441 443 446 455 503 544
V A A P E N K P P T G A P L A S L
V
V T
A T V A G T E S L P E T S P T F P H A I
ной РНК, которое могло повлиять на механизм репликации вируса [7].
Анализ остальных 5 изолятов эболавируса Заир 2014, которые прошли пассажи на культурах клеток или мышах, показал в ряде случаев наличие уникальных мутаций. В геноме изолята, выделенного из образца GVR09, обнаружены мутации А2575^Т (ген NP) и G6668^T (ген GP). Общее количество замен, отличающих этот вариант эболавируса Заир 2014 от консенсусной последовательности ближайших вариантов, оказалось равным 8 (уровень отличия 0,04 %). В геноме изолята, выделенного из образца GVR08, обнаружены мутации Л2577^С (ген NP) и Т6677^С (ген GP) и G6668^T (ген GP). В целом уровень отличия от консенсусной последовательности от ближайших вариантов, оказался равным 0,03 % (7 замен). В геноме изолята, выделенного из образца GVR05, обнару-
жены мутации Тг
С и т
G (некодирующая
в этом гене произошли мутации в 79 местах, 20 мутаций приводят к замене аминокислотного остатка в последовательности белка GP (табл. 2).
В остальных генах варианта эболавируса Заир 2014 образец GVR15 найдено следующее количество нуклеотидных замен при сравнении с генами вируса Эбола Заир 1976:
- в NP гене Эбола GVR15 найдено 99 нуклеотид-ных замен;
- в VP-24 гене - 58 нуклеотидных замен;
- в VP-30 гене - 37 нуклеотидных замен;
- в VP-35 гене - 25 нуклеотидных замен;
- в VP-40 гене - 40 нуклеотидных замен;
- в L гене вируса Эбола GVR15 - 175 нуклеотид-ных замен.
Важно отметить, что при сравнении эболави-руса Заир 2014 образец GVR15 с вирусом Эбола, вызвавшим вспышку болезни в Конго в 2012 г. (KC545396) [9] обнаружено, что образец GVR15 содержит в GP белке 17 сайтов гликозилирования (табл. 3.) в то время как штамм вируса Эбола, который был выделен в Конго в 2012 г. содержит 13 сайтов гликозилирования.
Прямое сравнение нуклеотидных последовательностей геномной РНК Заир эболавируса 1976 (AF086833.2) и варианта вируса Эбола GVR15 выявило гомологию нуклеотидных последовательностей на уровне 97 %, что составляет в среднем 500 нукле-отидных замен на геном.
В варианте эболавируса Заир 2014 (образец GVR15) не найдено укорочения 5'-концевой геном-
часть геномной РНК). По филогенетическому дереву изолят Эбола GVR05 относится к клайду известных последовательностей, выделеных в Сьера-Леоне в 2014 г. (рисунок).
С мая 2014 г. опубликовано более 230 полноразмерных последовательностей эболавируса Заир, вызвавшего эпидемию, охватившую страны Западной Африки. Сравнение их нуклеотидных и аминокислотных последовательностей свидетельствует об отсутствии появления критических мутаций в геноме вируса, способных потенциально привести к увеличению его вирулентности в процессе эпидемии [9]. Предположение о том, что вирус уже в процессе эпидемии 2013-2015 гг. приобрел повышенную вирулентность, а потому эпидемическая вспышка
Таблица 3
Сайты гликозилирования варианта эболавируса Заир 2014, образец
GVR15
Позиция сайта гликозилирования на гене GP
Нуклеотидная последовательность
Аминокислотная последовательность
6035 6153 6644 6717 6747 6804 6867 6920 6983 7031 7070 7190 7271 7350 7394 7418 7721 7886
ATGGGT... .. .TACAGGTTA... .. .ATGCAACGG... .ATGAGACAG. ...ATTTGACCT... .ATGAGACAA. ...ACCCCGAAA... ...ACCTCACTA... ...ACATCAGTG... ...ACACAACAA... ...ATTCCTCTGC... ...ACAGCACCCA... ...ACGACAGCA... ...ACACGAGTA... ...ACTACAGCG... ...ACAACACTC... ...ACGAAACGA... ...ACATAACAG...
M G V L Q V N A T N E T N L T N E T N P E N L T N I S N T T N S S N S T N D S N T S N Y S N N T N E T N I T
gi|833552691|gb|KR534526.11 Zaire ebolavims isolate Ebola \irus/H.sapiens-wt/GIN/2014/Makona-Forecariah-989 partial genome L gi|820743425|gb|KR534524 11 Zaire ebolavims isolate Ebola virus/H.sapiens-wt/GIN/2014/Makona-Coyah-955 partial genome I gi|820743955|gb|KR534577.11 Zaire ebolavims isolate Ebola wrus/H.sapiens-wt/GIN/2014/Makona-Conakry-1027 partial genome 1 gi|820744035|gb|KR534585.1| Zaire ebolavims isolate Ebola virus/H sapiens-wt/GIN/2014/Makona-Conakry-1250 partial genome gi|820743255|gb|KR534507.1| Zaire ebolavims isolate Ebola virus/H.sapiens-wt/GIN/2014/Makona-Conakry-505 partial genome
- gi|820743985|gb|KR534580.1| Zaire ebolavims isolate Ebola virus/H sapiens-wt/GIN/2014/Makona-Conakry-1 128 partial genome gi|820743345|gb|KR534516.1| Zaire ebolavims isolate Ebola virus/H .sapiens-wt/GIN/2014/Makona-Conakry-678 partial genome
■ gi|820743455|gb|KR534527.1| Zaire ebolavims isolate Ebola vims/H.sapiens-wt/GIN/2014/Makona-Conakry-t043 partial genome gi|667853322|gb|KM233115.1| Zaire ebolavirus isolate Ebola vims/H sapiens-wt/SLE/2014/Makona-G3857 complete genome gi|667852635|gb|KM233049.1| Zaire ebolavirus isolate Ebola vims/H.sapiens-wt/SLE/2014/Makona-G3707 complete genome
- gi|820744075|gb|KR534589 1| Zaire ebolavims isolate Ebola virus/H sapiens-wt/GIN/2014/Makona-Coyah-1279 partial genome gij667853311|gb|KM233114.11 Zaire ebolavirus isolate Ebola virus/H sapiens-wt/SlE/2014/Makona-G3856.3 complete genome gi|820743325|gb|KR534514.1| Zaire ebolavirus isolate Ebola virus/H sapiens-wt/GIN/2014/Makona-Conakry-653 partial genome
gi|667853103|gb|KM233094 1| Zaire ebolavims isolate Ebola virus/H sapiens-wt/SLE/2014/Makona-G3820 complete genome gi|667852819|gb|KM233067 1| Zaire ebolavims isolate Ebola vims/H sapiens-wt/SLE/2014/Makona-G3769.3 complete genome gi|667852893|gb|KM233074 1| Zaire ebolavirus isolate Ebola virus/H sapiens-wt/SLE/2014/Makona-G3787 complete genome gi|667852767|gb|KM233062.1| Zaire ebolavims isolate Ebola virus/H sapiens-wt/SLE/2014/Makona-G3758 complete genome -gi|820743735|gb|KR534555.1| Zaire ebolavims isolate Ebola virus/H.sapiens-wt/GIN/2014/Makona-Conakry-1371 partial genome gi|820743755|gb|KR534557.11 Zaire ebolavirus isolate Ebola virus/H sapiens-wt/GIN/2014/Makona-Coyah-1394 partial genome gi|820743935|gb|KR534575 1| Zaire ebolavims isolate Ebola vims/H.sapiens-wt/GIN/2014/Makona-Conakry-1481 partial genome gi|820744065|gb|KR534588.11 Zaire ebolavims isolate Ebola virus/H.sapiens-wt/GIN/2014/Makona-Conakiy-768 partial genome ,gi|820743485|gb|KR534530.1| Zaire ebolavirus isolate Ebola virus/H sapiens-wt/GIN/2014/Makona-Coyah-1063 partial genome Lgi|820743565|gb|KR534538.1| Zaire ebolavirus isolate Ebola virus/H sapiens-wt/GIN/2014/Makona-Conakry-1205 partial genome gi|820743795|gb|KR534561.11 Zaire ebolavirus isolate Ebola virus/H.sapiens-wt/GIN/2014/Makona-Conakry-1480 partial genome I gi|820743685|gb|KR534550 11 Zaire ebolavims isolate Ebola virus/H.sapiens-wt/GIN/2014/Makona-Coyah-1339 partial genome gi|820743705|gb|KR534552 11 Zaire ebolavims isolate Ebola virus/H sapiens-wt/GIN/2014/Makona-Conakry-1342 partial genome gi[820743695|gb|KR534551.1| Zaire ebolavims isolate Ebola vims/H sapiens-wt/GIN/2014/Makona-Conakry-1340 partial genome gi|820743715|gb|KR534553.11 Zaire ebolavims isolate Ebola virus/H.sapiens-wt/GIN/2014/Makona-Coyah-1355 partial genome
- gi|674810554|gb|KJ660348.2| Zaire ebolavims isolate H.sapiens-wt/GIN/2014/Makona-Gueckedou-C05 complete genome
, gi]820743595|gb|KR534541.11 Zaire ebolavirus isolate Ebola virus/H sapiens-wt/GIN/2014/Makona-Conakry-1249 partial genome Jgi|820743625|gb|KR534544.1| Zaire ebolawrus isolate Ebolavims/H.sapiens-wt/GIN/2014/Makona-Coyah-1278 partial genome lgi|820744015|gb|KR534583 1| Zaire ebolavims isolate Ebola vims/H sapiens-wt/GIN/2014/Makona-Conakry-1213 partial genome gi|820743615|gb|KR534543.1| Zaire ebolavirus isolate Ebola virus/H sapiens-wt/GIN/2014/Makona-Coyah-1277 partial genome
- gi]820743675|gb|KR534549.11 Zaire ebolavirus isolate Ebola virus/H sapiens-wt/GIN/2014/Makona-Coyah-1333 partial genome gi|820743995|gb|KR534581.11 Zaire ebolavims isolate Ebola virus/H.sapiens-wt/GIN/2014/Makona-Conakiy-1129 partial genome
Филогенетическое дерево, построенное на основе полноразмерных нуклеотидных последовательностей эболавируса. Анализ проведен методом «объединения ближайших соседей» с использованием 2 параметрической модели Кимуры. Приведены оригинальные названия штаммов эболавирусов, депонированных в базе данных GenBank
БВВЭ оказалась столь масштабной, не подтверждается. Полное определение первичной последовательности геномной РНК эболавируса Заир, выделенной весной 2014 г. и осенью 2015 г. в Гвинее, Сьерра-Леоне и Либерии, подтверждает высокую генетическую стабильность вируса, вызвавшего вспышку болезни в Западной Африке [5]. Ранее определенные замены нуклеотидной и аминокислотной последовательности у выделенных изолятов эболавируса, в дальнейшем, у других выделенных позже изолятов эболавируса, больше не регистрируютя, отсутствуют сцепленные мутации. По данным Европейской мобильной лаборатории, эболавирус из гвинеи попал в Сьерра-Леоне в апреле или в начале мая 2014 г. [8].
нами установлено, что треть вариантов вируса, выявленных в ходе текущей вспышки, делятся меж-
ду собой на 2 подгруппы, отличающиеся наличием 4 сцепленных мутаций в позициях 800 (ген NP), 8928 (ген УР30), 15963 и 17142 (ген Ц). Учитывая высокую генетическую стабильность вируса в течение всего периода наблюдения можно предположить, что в человеческую популяцию одновременно попали два близкородственных варианта эболавируса из различных источников. Эти данные подтверждаются анализом вирусных последовательностей определенных в августе-октябре 2014 г. [11]. Есть свидетельство о том, что существуют два варианта эболавируса (вариант гвинея и вариант Сьерра-Леоне), которые передавались независимо друг от друга в пределах Гвинеи [11]. Установлены подтвержденные случаи передачи вируса от человек к человеку и при этом, после первоначального введе-
ния карантинных мероприятий, не обнаружено никаких доказательств импорта или экспорта эболави-руса через национальные границы. При секвениро-вании вирусных последовательностей наблюдали как host-host передачу эболавируса, так и периодические появления intrahost генетических вариантов эболавируса [11].
таким образом, все нуклеотидные замены, идентифицированные нами, единичны, располагаются стохастически и являются либо синонимичными, либо приходятся на некодирующие участки генома эболавируса, не приводя к возникновению замен аминокислотных. Уровень вариабельности нуклеотидных последовательностей составил 0,005-0,01 %, что подтверждает чрезвычайно высокую генетическую стабильность эболавируса Заир, вызвавшего вспышку. Наши данные подтверждают факт подавления накопления в вариантах эболавируса несинонимичных мутаций с течением времени. обнаружены изменения в сайтах гликозилирования и муцин-подобном домене гликопротеина эболавируса, которые заслуживают дальнейшего изучения.
Авторы подтверждают отсутствие конфликта финансовых/нефинансовых интересов, связанных с написанием статьи.
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ
1. Болезнь, вызванная вирусом Эбола. Инф. Бюл. ВОЗ № 103. http://www.who.int/mediacentre/factsheets/fs103/ru/ (дата обращения 17.04.2015).
2. Попова А.Ю., Сафронов В.А., Магасуба Н.Ф., Уткин Д.В., Одиноков Г.Н., Пьянков О.В., Сергеев А.С., Боднев С.А., Кабанов А.С., Куклев В.Е., Лопатин А.А., Раздорский А.С., Никифоров К.А., Щербакова С.А., Терновой В.А., Агафонов
A.П., Михеев В.Н., КУтырев В.В. Организация и проведение диагностических исследований на базе мобильного комплекса специализированной противоэпидемической бригады в Республике Гвинея в период эпидемии лихорадки Эбола в 2014 г. Пробл. особо опасных инф. 2014; 4:5-8.
3. Руководство по содержанию и использованию лабораторных животных. Washington, D.C.: National Akademy Press; 1996. 138 р.
4. Baize S., Pannetier D., Oestereich L., Rieger T., Koivogui L., Magassouba N.F., Soropogui B., Sow M.S., Keita S., De Clerck H., Tiffany A., Domínguez G., Loua M., Traoré A., Kolié M., Malano
E.R., Heleze E., Bocquin A., Mély S., Raoul H Caro V., Cadar D., Gabriel M., Pahlmann M., Tappe D., Schmidt-Chanasit J., Impouma
B., Diallo A.K., Formenty P., Van Herp M Günther S. Emergence of Zaire Ebola Virus Disease in Guinea - preliminary report. N. Engl. J. Med. 2014; 371:1418-25.
5. Carroll M.W., Matthews D.A., Hiscox J.A., Elmore M.J., Pollakis G., Rambaut A., Hewson R., García-Dorival I., Bore J.A., Koundouno R., Abdellati S., Afrough B., Aiyepada J., Akhilomen P., Asogun D., Atkinson B., Badusche M., Bah A., Bate S., Baumann J., Becker D., Becker-Ziaja B., Bocquin A., Borremans B., Bosworth A., Boettcher J.P., Cannas A., Carletti F., Castilletti C., Clark S., Colavita
F., Diederich S., Donatus A., Duraffour S., Ehichioya D., Ellerbrok H., Fernandez-Garcia M.D., Fizet A., Fleischmann E., Gryseels S., Hermelink A., Hinzmann J., Hopf-Guevara U., Ighodalo Y., Jameson L., Kelterbaum A., Kis Z., Kloth S., Kohl C., Korva M., Kraus A., Kuisma E., Kurth A., Liedigk B., Logue C.H., Lüdtke A., Maes P., McCowen J., Mély S., Mertens M., Meschi S., Meyer B., Michel J., Molkenthin P., Muñoz-Fontela C., Muth D., Newman E.N., Ngabo D., Oestereich L., Okosun J., Olokor T., Omiunu R., Omomoh E., Pallasch E., Pályi B., Portmann J., Pottage T., Pratt C., Priesnitz S., Quartu S., Rappe J., Repits J., Richter M., Rudolf M., Sachse A., Schmidt K.M., Schudt G., Strecker T., Thom R., Thomas S., Tobin E., Tolley H., Trautner J., Vermoesen T., Vitoriano I., Wagner M., Wolff S., Yue C., Capobianchi M.R., Kretschmer B., Hall Y, Kenny J.G., Rickett N.Y., Dudas G., Coltart C.E., Kerber R Steer D., Wright
C., Senyah F., Keita S., Drury P., Diallo B., de Clerck H., Van Herp M., Sprecher A., Traore A., Diakite M., Konde M.K., Koivogui L., Magassouba N., Avsic-Zupanc T., Nitsche A., Strasser M., Ippolito
G., Becker S., Stoecker K., Gabriel M., Raoul H., Di Caro A., Wölfel R., Formenty P., Günther S. Temporal and spatial analysis of
the 2014-2015 Ebola virus outbreak in West Africa. Nature. 2015; 524(7563):97-101. DOI: 10.1038/nature14594.
6. Ebola Response Team. Ebola virus disease in West Africa-the first 9 months of the epidemic and forward projections. N. Engl. J. Med. 2014; 371(16):1481-95. DOI: 10.1056/NEJMoa1411100.
7. Hoenen T., Groseth A., Feldmann F., Marzi A., Ebihara H., Kobinger G., Gunther S., Feldmann H. Complete genome sequences of three Ebola virus isolates from the 2014 outbreak in west Africa. Genome Announc. 2014; 2(6):pii e01331-14. DOI: 10.1128/ genomeA.01331-14.
8. Kugelman J.R., Wiley M.R., Mate S., Ladner J.T., Beitzel
B., Fakoli L., Taweh F., Prieto K., Diclaro J.W., Minogue T., Schoepp R.J., Schaecher K.E., Pettitt J., Bateman S., Fair J., Kuhn J.H., Hensley L., Park D.J., Sabeti P.C., Sanchez-Lockhart M., Bolay F.K., Palacios G. Monitoring of Ebola Virus Makona Evolution through Establishment of Advanced Genomic Capability in Liberia. Emerg. Infect. Dis. 2015; 21(7):1135-43. DOI: 1(I3201/eid2107.150522.
9. Outbreak news. Ebola, Democratic Republic of the Congo. Wkly. Epidemiol. Rec. 2012; 87(44):421.
10. Park D.J., Dudas G., Wohl S., Goba A., Whitmer S.L., Andersen K.G., Sealfon R.S., Ladner J.T., Kugelman J.R., Matranga
C.B., Winnicki S.M., Qu J., Gire S.K., Gladden-Young A., Jalloh S., Nosamiefan D., Yozwiak N.L., Moses L.M., Jiang P.P., Lin A.E., Schaffner S.F., Bird B Towner J., Mamoh M., Gbakie M., Kanneh L Kargbo D., Massally J.L., Kamara F.K., Konuwa E., Sellu J., Jalloh A.A., Mustapha I., Foday M., Yillah M., Erickson B.R., Sealy T., Blau D., Paddock C., Brault A., Amman B., Basile J., Bearden S., Belser J., Bergeron E., Campbell S., Chakrabarti A., Dodd K., Flint M., Gibbons A., Goodman C., Klena J., McMullan L., Morgan L., Russell B., Salzer J., Sanchez A., Wang D., Jungreis I., Tomkins-Tinch C., Kislyuk A., Lin M.F., Chapman S., Macffinis B., Matthews A., Bochicchio J., Hensley L.E., Kuhn J.H., Nusbaum C., Schieffelin J.S., Birren B.W., Forget M., Nichol S.T., Palacios G.F., Ndiaye
D., Happi C., Gevao S.M., Vandi M.A., Kargbo B., Holmes E.C., Bedford T., Gnirke A., Ströher U., Rambaut A., Garry R.F., Sabeti P.C. Ebola Virus Epidemiology, Transmission, and Evolution during Seven Months in Sierra Leone. Cell. 2015; 161(7):1516-26. DOI: 10.1016/j.cell.2015.06.007.
11. Tong Y.G., Shi W.F., Liu D., Qian J., Liang L., Bo X.C., Liu J., Ren H.G., Fan H., Ni M., Sun Y., JinY., Teng Y.,Xi Z., Kargbo D., Dafae F., Kanu A., Chen C.C., Lan Z.H., Jiang H., Luo Y., Lu H.J., Zhang X.G., Yang F., Hu Y., Cao Y.X., Deng Y.Q., Su H.X., Sun Y., Liu W.S., Wang Z., Wang C.Y., Bu Z.Y., Guo Z.D., Zhang L.B., Nie W.M., Bai C.Q., Sun C.H., An X.P., Xu P.S., Zhang X.L., Huang Y., Mi Z.Q., Yu D., Yao H.W., Feng Y., Xia Z.P., Zheng X.X., Yang S.T., Lu B., Jiang J.F., Kargbo B., He F.C., Gao G.F., Cao W.C. China Mobile Laboratory Testing Team in Sierra Leone. Genetic diversity and evolutionary dynamics of Ebola virus in Sierra Leone. Nature. 2015; 524(7563):93-6. DOI: 10.1038/nature14490.
References
1. [Ebola Virus Disease]. WHO Information Bulletin N 103 [cited 17 Apr 2015]. Available from: http://www.who.int/mediacentre/factsheets/ fs103/ru.
2. Popova A.Yu., Safronov V.A., Magasuba N.F., Utkin D.V., Odinokov G.N., P'yankov O.V., Sergeev A.S., Bodnev S.A., Kabanov A.S., Kuklev V.E., Lopatin A.A., Razdorsky A.S., Nikiforov K.A., Shcherbakova S.A., Ternovoy V.A., Agafonov A.P., Mikheev V.N., Kutyrev V.V. [Management and performance of diagnostic investigations on the platform of the Specialized Anti-Epidemic Team Mobile Complex during EVD epidemics in 2014 in the Republic of Guinea]. Probl. Osobo Opasn. Inkfek. 2014; 4: 5-8.
3. Guide for the Care and Use of Laboratory Animals. Washington,
D.C.: 1996. 137 p.
4. Baize S., Pannetier D., Oestereich L., Rieger T., Koivogui L., Magassouba N.F., Soropogui B., Sow M.S., Keita S., De Clerck H., Tiffany
A., Dominguez G., Loua M., Traore A., Kolie M., Malano E.R., Heleze E., Bocquin A., Mely S., Raoul H., Caro V., Cadar D., Gabriel M., Pahlmann M., Tappe D., Schmidt-Chanasit J., Impouma B., Diallo A.K., Formenty P., Van Herp M., Günther S. Emergence of Zaire Ebola Virus Disease in Guinea - preliminary report. N. Engl. J. Med. 2014; 371:1418-25.
5. Carroll M.W., Matthews D.A., Hiscox J.A., Elmore M.J., Pollakis G., Rambaut A., Hewson R., Garcia-Dorival I., Bore J.A., Koundouno R., Abdellati S., Afrough B., Aiyepada J., Akhilomen P., Asogun D., Atkinson
B., Badusche M., Bah A., Bate S., Baumann J., Becker D., Becker-Ziaja B., Bocquin A., Borremans B., Bosworth A., Boettcher J.P., Cannas A., Carletti F., Castilletti C., Clark S., Colavita F., Diederich S., Donatus A., Duraffour S., Ehichioya D., Ellerbrok H., Fernandez-Garcia M.D., Fizet A., Fleischmann
E., Gryseels S., Hermelink A., Hinzmann J., Hopf-Guevara U., Ighodalo Y., Jameson L., Kelterbaum A., Kis Z., Kloth S., Kohl C., Korva M., Kraus A., Kuisma E., Kurth A., Liedigk B., Logue C.H., Lüdtke A., Maes P., McCowen J., Mely S., Mertens M., Meschi S., Meyer B., Michel J., Molkenthin P., Munoz-Fontela C., Muth D., Newman E.N., Ngabo D., Oestereich L., Okosun J., Olokor T., Omiunu R., Omomoh E., Pallasch E., Palyi B., Portmann J., Pottage T., Pratt C., Priesnitz S., Quartu S., Rappe J., Repits J., Richter M., Rudolf M., Sachse A., Schmidt K.M., Schudt G., Strecker T., Thom R., Thomas S., Tobin E., Tolley H., Trautner J., Vermoesen T., Vitoriano I., Wagner M., Wolff S., Yue C., Capobianchi M.R., Kretschmer B., Hall Y., Kenny J.G., Rickett N.Y., Dudas G., Coltart C.E., Kerber R., Steer D., Wright
C., Senyah F., Keita S., Drury P., Diallo B., de Clerck H., Van Herp M., Sprecher A., Traore A., Diakite M., Konde M.K., Koivogui L., Magassouba N., Avsic-Zupanc T., Nitsche A., Strasser M., Ippolito G., Becker S., Stoecker
K., Gabriel M., Raoul H., Di Caro A., Wölfel R., Formenty P., Günther S. Temporal and spatial analysis of the 2014-2015 Ebola virus outbreak in West Africa. Nature. 2015; 524(7563):97-101. DOI: 10.1038/nature14594.
6. Ebola Response Team. Ebola virus disease in West Africa-the first 9 months of the epidemic and forward projections. N. Engl. J. Med. 2014; 371(16):1481-95. DOI: 10.1056/NEJMoa1411100.
7. Hoenen T., Groseth A., Feldmann F., Marzi A., Ebihara H., Kobinger G., Gunther S., Feldmann H. Complete genome sequences of three Ebola virus isolates from the 2014 outbreak in west Africa. Genome Announc. 2014; 2(6):pii e01331-14. DOI: 10.1128/genomeA.01331-14.
8. Kugelman J.R., Wiley M.R., Mate S., Ladner J.T., Beitzel B., Fakoli L., Taweh F., Prieto K., Diclaro J.W., Minogue T., Schoepp R.J., Schaecher K.E., Pettitt J., Bateman S., Fair J., Kuhn J.H., Hensley L., Park D.J., Sabeti P.C., Sanchez-Lockhart M., Bolay F.K., Palacios G. Monitoring of Ebola Virus Makona Evolution through Establishment of Advanced Genomic Capability in Liberia. Emerg Infect Dis. 2015; 21(7):1135-43. DOI: 10.3201/ eid2107.150522.
9. Outbreak news. Ebola, Democratic Republic of the Congo. Wkly. Epidemiol. Rec. 2012; 87(44):421.
10. Park D.J., Dudas G., Wohl S., Goba A., Whitmer S.L., Andersen K.G., Sealfon R.S., Ladner J.T., Kugelman J.R., Matranga C.B., Winnicki S.M., Qu J., Gire S.K., Gladden-Young A., Jalloh S., Nosamiefan D., Yozwiak N.L., Moses L.M., Jiang P.P., Lin A.E., Schaffner S.F., Bird B., Towner J., Mamoh M., Gbakie M., Kanneh L., Kargbo D., Massally J.L., Kamara F.K., Konuwa E., Sellu J., Jalloh A.A., Mustapha I., Foday M., Yillah M., Erickson B.R., Sealy T., Blau D., Paddock C., Brault A., Amman B., Basile J., Bearden S., Belser J., Bergeron E., Campbell S., Chakrabarti A., Dodd K., Flint M., Gibbons A., Goodman C., Klena J., McMullan L., Morgan L., Russell B., Salzer J., Sanchez A., Wang D., Jungreis I., Tomkins-Tinch C., Kislyuk A., Lin M.F., Chapman S., MacInnis B., Matthews A., Bochicchio J., Hensley L.E., Kuhn J.H., Nusbaum C., Schieffelin J.S., Birren B.W., Forget M., Nichol S.T., Palacios G.F., Ndiaye D., Happi C., Gevao S.M., Vandi M.A., Kargbo
B., Holmes E.C., Bedford T., Gnirke A., Ströher U., Rambaut A., Garry R.F., Sabeti P.C. Ebola Virus Epidemiology, Transmission, and Evolution during Seven Months in Sierra Leone. Cell. 2015; 161(7):1516-26. DOI: 10.1016/j. cell.2015.06.007.
11. Tong Y.G., Shi W.F., Liu D., Qian J., Liang L., Bo X.C., Liu J., Ren H.G., Fan H., Ni M., Sun Y., Jin Y., Teng Y., Li Z., Kargbo D., Dafae F., Kanu A., Chen C.C., Lan Z.H., Jiang H., Luo Y., Lu H.J., Zhang X.G., Yang F., Hu Y., Cao Y.X., Deng Y.Q., Su H.X., Sun Y., Liu W.S., Wang Z., Wang
C.Y., Bu Z.Y., Guo Z.D., Zhang L.B., Nie W.M., Bai C.Q., Sun C.H., An X.P., Xu P.S., Zhang X.L., Huang Y., Mi Z.Q., Yu D., Yao H.W., Feng Y., Xia Z.P., Zheng X.X., Yang S.T., Lu B., Jiang J.F., Kargbo B., He F.C., Gao G.F., Cao W.C. China Mobile Laboratory Testing Team in Sierra Leone. Genetic diversity and evolutionary dynamics of Ebola virus in Sierra Leone. Nature. 2015; 524(7563):93-6. DOI: 10.1038/nature14490.
Authors:
Popova A.Yu. Federal Service for Surveillance in the Sphere of Consumers Rights Protection and Human Welfare; 18, Bld. 5 and 7, Vadkovsky Pereulok, Moscow, 127994, Russian Federation. Russian Medical Academy for Post-Graduate Training; 2/1, Barrikadnaya St., Moscow, 125993, Russian Federation.
Ternovoy V.A., P'yankov O.V., Chausov E.V., Sergeev Ar.A., Kabanov A.S., Bodnev SA., BayandinR.B., Blinov V.M., Agafonov A.P., Mikheev V.N. State Research Centre of Virology and Biotechnology "Vector". Kol'tsovo, Novosibirsk Region, 630559, Russian Federation. E-mail: vector@vector.nsc.ru
Magassouba N.F. Donka National Hospital, Conakry, Republic of Guinea.
Kutyrev V.V. Russian Research Anti-Plague Institute "Microbe". 46, Universitetskaya St., Saratov, 410005, Russian Federation. E-mail: rusrapi@ microbe.ru
Demina Yu.V., Ezhlova E.B. Federal Service for Surveillance in the Sphere of Consumers Rights Protection and Human Welfare. 18, Bld. 5 and 7, Vadkovsky Pereulok, Moscow, 127994, Russian Federation.
Об авторах:
ПоповаА.Ю. Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека; Российская Федерация, 127994, Москва, Вадковский переулок, дом 18, строение 5 и 7. Российская медицинская академия последипломного образования; Российская Федерация, 125993, Москва, ул. Баррикадная, 2/1.
Терновой В.А., Пьянков О.В., Чаусов Е.В., Сергеев Ар.А., Кабанов
A.С., Боднев С.А., Баяндин Р.Б., Блинов В.М., Агафонов А.П., Михеев
B.Н. Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор». Российская Федерация, 630559, Новосибирская обл., п. Кольцово. E-mail: vector@vector.nsc.ru
Magassouba N.F. Государственная больница «Донка». Гвинейская Республика, конакри.
Кутырев В.В. Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб». Российская Федерация, 410005, Саратов, ул. Университетская, 46. E-mail: rusrapi@microbe.ru
Демина Ю.В., Ежлова Е.Б. Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека. Российская Федерация, 127994, Москва, Вадковский переулок, дом 18, строение 5 и 7.
Поступила 04.09.15.
