Научная статья на тему 'Использование полиморфизмов локусов dys390 и ys393 y- хромосомы для популяционно-генетического анализа'

Использование полиморфизмов локусов dys390 и ys393 y- хромосомы для популяционно-генетического анализа Текст научной статьи по специальности «Биотехнологии в медицине»

CC BY
90
24
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по биотехнологиям в медицине , автор научной работы — Л. A. Цапкова, Е. В. Балановская, М. И. Чурносов

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Текст научной работы на тему «Использование полиморфизмов локусов dys390 и ys393 y- хромосомы для популяционно-генетического анализа»

Рис. 1. а - МР-проктограмма в покое в норме, сагиттальная проекция; б - ее схема, где 1 - прямая кишка, 2 - лонио-копчиковая линия, 3 - лоно, 4 - мочевой пузырь, 5 - матка, 6 - ано-ректальный угол; в - Яе-проктография. На МР-томограмме черной стрелкой показан контраст, заполнивший прямую кишку, белой стрелкой - мочевой пузырь, белой двойной стрелкой - матка, двойной белой стрелкой - аноректальная зона, белой линией - лонно-копчиковая линия, а также расстояния от последней до уретропузырного сегмента, маточношеечного перехода, ано-ректальной зоны.

На рис. 1(а) представлена сагиттальная МР-томограмма здоровой нерожавшей женщины в покое, а на рис. 1(6) - ее схема. При этом расстояние от лонно-копчиковой линии до уретро-пузырного сегмента составило 20 мм (18± 3,2 мм), до маточношеечного перехода - 28 мм (27±2,01 мм), до ано-ректальной зоны — 28 мм (- 10±2,3 мм) (лонно-копчиковая линия принята за нулевой уровень). Ано-ректальный угол составил 105±4,7°. При натуживании эти расстояния составили 12 мм (10,2±1,9 мм), 8 мм (10±3,1 мм) и -40 мм (-35,1 ±2,6 мм) соответственно, ано-ректальный угол -121° (110±1,9°), что подтверждало отсутствие тазового проляпса у данной больной. При произвольном сокращении мышц тазового дна (рис. 2) отмечалось увеличение этих показателей (расстояние от лонно-копчиковой линии до пузырно уретрального сегмента составило 27 мм (25±2,1 мм), до маточно-шеечного перехода 36 мм (33±2,9 мм), до аноректальной зоны 0±2,5 мм), т.е. подъем тазового дна, что свидетельствует о нормальной функции мышц. Аноректальный угол при этом становится более острым и составляет 80°(85±3,5°). В скобках приведены средние данные (п=20). Полученные результаты также полностью коррелируют с данными проктографии с натуживанием при их сравнении.

а б

Рис. 2. а - МР-проктограмма при максимальном произвольном сокращении мышц тазового дна; Ле-проктограмма при максимальном произвольном сокращении мышц.

Таким образом, компенсацию функции тазового дна можно оценивать не только по степени его опущения при максимальном натуживании, но и по степени его подъема при максимальном произвольном сокращении мышц. Все компоненты тазового дна и соотношения в расположении тазовых органов лучше визуализируются при МР-исследовании, по сравнению с рентгенологическим. Однако при натуживании между этими двумя исследованиями имеется разница в показателях расстояний от лонно-копчиковой линии до основных точек отсчета из-за разного положения пациента при обследовании. При максимальном произвольном сокращении мышц результаты практически идентичны. Это делает возможным не только использовать МР-проктографию как метод выбора при патологии тазового дна, но, учитывая другие ее особенности, но и закрепить за ней приоритетную роль.

ИСПОЛЬЗОВАНИЕ ПОЛИМОРФИЗМОВ ЛОКУСОВ БУ8390 И У8393 У- ХРОМОСОМЫ ДЛЯ ПОПУЛЯЦИОННО-ГЕНЕТИЧЕСКОГО АНАЛИЗА

Л.Л. Цапкова, Е.В. Балановская, М.И. Чурносов

Белгородский государственный университет, ГУ Медико-генетический научный центр РАМН

Проблема происхождения и этногенеза славян представляет живой интерес для многих поколений исследователей в различных отраслях знаний. Несмотря на то, что на сегодняшний день накоплен обширный этнический, лингвистический и археологический материал, до сих пор нет единого мнения как о этногенезе системы славянства в целом, так и относительно этногенеза русских и украинцев [7].

Современное описание молекулярной филогении У-хромосомы (последовательности происхождения гаплотипов) основано на типировании аллельного состояния стандартного набора 8ЫР- и 8Т11-локусов.

Изучение коротких тандемных повторов (8ТЯ) У-хромосомы вызывает большой интерес у исследователей в связи с высокой вариабельностью и полиморфизмом [5]. Уникальные свойства У-хромосомы, такие как передача только по отцовской линии и отсутствие рекомбинации в негомологичной Х-хромосоме части У-хромосомы, позволяют прослеживать отцовские линии по гаплотипам, композиция которых представляет собой уникальную «запись» мутационных событий в предыдущих поколениях. По при-

чине гаплоидности У-хромосома в большей своей части не рекомбинируется в ходе мейоза и передается как целое от отца к сыну. Поэтому каждый конкретный набор ло-кусов, составляющих нерекомбинируемую часть У-хромосомы, рассматривается как единый гаплотип. У-хромосома в большей степени подвержена влиянию дрейфа генов, так как эффективный размер популяции по У-хромосоме равняется 1/4 от аналогичной величины по аутосомам [3]. Благодаря вышеперечисленным характеристикам, исторические изменения в ДНК У-хромосомы, легче прослеживаются чем в ДНК аутосом.

За последние годы было проведено изучение ряда популяций человека с использованием полиморфизма 8ТЯ-локусов У-хромосомы. Наиболее часто эти локусы используют для сравнительного анализа «близкородственных» популяций. Использование У-8ТЯ-локусов доказывает высокую степень генетической гетерогенности между некоторыми близкими популяциями, которую нельзя было обнаружить ранее, применяя классические белковые и аутосомные ДНК маркеры [3, 5].

Следует отметить, что до настоящего времени полиморфизм У-хромосомы в популяциях России остается мало изученным. Коренное население Белгородской области в своем большинстве представлено славянской группой народов. На долю русских приходится 93% населения, на долю украинцев - 5%, белорусов -0,4%, татары, армяне, цыгане, немцы, молдаване, евреи, узбеки и др. составляют 1,6% населения [2].

Целью работы явилось изучение популяционной структуры русских и украинцев Белгородской области с использованием двух 8ТЯ полиморфизмов У хромосомы фУ8390 и ЭУ8393).

МЛ ТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ

Материалом для исследования послужили образцы ДНК, выделенные из цельной крови методом фенол-хлороформной экстракции, 83 коренных русских жителей Крас-ненского рнайона, 107 коренных русских жителей Прохоровского района, 138 коренных русских жителей Яковлевского района, 17 коренных украинских жителей Грайво-ронского и 20 коренных украинских жителей Красногвардейского района Белгородской области. Общий объем выборки составил 365 человек. Образцы крови для выборки были взяты у неродственных лиц, рожденных на данной территории, родители которых относятся соответственно к русскому или украинскому этносам. Кроме того, учитывались места рождения всех бабушек и дедушек индивидуума. Это позволят учесть в выборке только наиболее устойчивые миграции, генетический след которых сохранился в популяции по прошествии двух поколений и исключить влияние случайных миграций. Нами был проведен анализ аллельного полиморфизма микросателлитных локусов ЭУ8390, ЭУ8393. Амплификацию ДНК проводили методом полимеразной цепной реакции с использованием стандартных олигонуклеотидных праймеров:

ЭУ8390: Б: 5'"ТАТАТТТТАСАСАТТТТТСООСС-3'

Я: 5 -ТОАСАвТААААТвААСАСАТГСС-З

ЭУ8393: Б: 5'-ОТСОТСТТСТАСТТСТСТСААТАС-3'

Я: 5 - А АСТС А АСТС С А А А А А АТв Авв-З

Амплификацию проводили в 12,5 мкл реакционной смеси следующего состава: 1,25 мкл буфера, 0,2 мкл сПЧТР, по 0,4 мкл каждого праймера, 1 ед. Тас1-полимеразы, 1 мкл исследуемой ДНК.

ПЦР локуса ЭУ8393 проводили в следующем режиме: денатурация 95°С-11 мин., затем 32 цикла: 95°С - 30 с, 59°С - 1 мин, 42°С - 20 с; и 72°С - 10 мин. Режим для локуса ЭУ8390 был следующим: денатурация 94°С - 3 мин, 32 цикла: 94°С-30с, 55°С-30с, 72°С-40с.

Продукты амплификации разделяли в 8% поликриламидном геле, результаты анализировали в проходящем ультрафиолетовом свете, предварительно окрасив гель бромистым этидием.

РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ

В таблице 1 представлены частоты локусов ОУ8390, ОУ8393. Наиболее частыми аллелями в выборках русских и украинцев оказались ОУ8393*13 и ЭУ8390*25. Второе ранговое место по распространению заняли аллели ОУ8393*14 и ОУ8390*24. В Прохо-ровском районе Белгородской области нами был обнаружен редкий аллель 11, он встречался с частотой 0,94%, в Красненском районе Белгородской области встречался редкий аллель 15, его частота составила 1,23%.

Таблица 1

Частоты аллелей локусов БУ8390 и БУ8393 в популяциях русских и украинцев

Белгородской области

Русские Русские

Локус Аллель Яковлевский Прохоровский р-он Красненский в целом

р-он р-он Украинцы

ЭУ8393 11 0,000 0,009 0,000 0,003 0,000

12 0,079 0,037 0,012 0,049 0,068

13 0,797 0,841 0,853 0,826 0,844

14 0,123 0,113 0,123 0,109 0,086

15 0,000 0,000 0,012 0,003 0,000

ЭУ8390 22 0,021 0,009 0,012 0,018 0,027

23 0,181 0,132 0,160 0,158 0,054

24 0,231 0,235 0,246 0,235 0,3784

25 0,528 0,584 0,567 0,555 0,514

26 0,036 0,037 0,024 0,034 0,027

В таблице №2 приведены гаплотипы, сформированные на основе распределения аллелей локусов ЭУ8390 и ЭУ8393. Среди 365 обследованных выявлено 14 гаплоти-пов. Наиболее частым в общей выборке оказался гаплотип №1, который встречался с частотой 51,23%. Вторым по распространенности был гаплотип №2 (21,37%), причем в украинских популяциях его удельный вес оказался значительно выше (35,14%) чем среди русского населения (19,81%).

Таблица 2

Частота встречаемости (%) гаплотипов в популяциях русских и украинцев __Белгородской области_

Гаплотип Частота встречаемости в популяциях, %

№ га- пло типа I II русские украинцы итого

Красненский р-он Прохоровский р-он Яковлевский р-он в целом

1 13 25 53,01 51,40 49,27 50,91 45,94 51,23

2 13 24 21,68 22,43 16,66 19,81 35,14 21,37

3 14 23 8,43 7,47 7,25 7,62 0,00 6,85

4 13 23 7,23 5,61 7,25 6,78 5,41 6,57

5 13 26 2,41 3,74 3,62 3,35 2,70 3,28

6 14 25 2,41 1,87 2,17 2,13 5,41 2,46

7 14 24 1,20 0,93 4,35 2,44 2,70 2,46

8 12 24 1,20 0,00 3,62 1,83 0,00 1,64

9 12 25 0,00 3,74 1,45 1,83 0,00 1,64

10 13 22 1,20 0,93 2,17 1,52 0,00 1,37

11 12 23 0,00 0,00 2,17 0,91 0,00 0,82

12 14 22 0,00 0,93 0,00 0,30 2,70 0,55

13 15 23 1,20 0,00 0,00 0,30 0,00 0,27

14 11 23 0,00 0,93 0,00 0,30 0,00 0,27

Примечание: 1-локус ЭУ8393, П-локус ЭУ8390

Нами были построены медианные сети по выявленным гаплотипам, которые позволяют определить связи гаплотипов между собой (рис.1).

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.