Научная статья на тему 'Гены hla ii класса в казахской популяции'

Гены hla ii класса в казахской популяции Текст научной статьи по специальности «Фундаментальная медицина»

CC BY
567
186
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
Журнал
Иммунология
Scopus
ВАК
CAS
RSCI
Ключевые слова
ПОПУЛЯЦИОННЫЙ ПОЛИМОРФИЗМ / КАЗАХ / АЛЛЕЛИ / ГАПЛОТИПЫ / HLA-DRB / DQA / DQB / POPULATION POLYMORPHISM / KAZAKHS / HLA-DRB1 / DQA1 / DQB1 / ALLELES / HAPLOTYPES

Аннотация научной статьи по фундаментальной медицине, автор научной работы — Куранов А.Б., Вавилов М.Н., Абильдинова Г.Ж., Акильджанова А.Р., Искакова А.Н.

Казахстан населяют различные популяции, такие как казахи, русские, узбеки и др. В настоящем исследовании были изучены аллели генов HLA-DRB1, DQA1, DQB1 у казахов. Всего в 2010-2011 гг. было собрано 157 образцов крови от здоровых индивидуумов казахской национальности. Аллельный полиморфизм HLA-генов класса II был типирован методом прямого секвенирования (sequence based typing SBT). Казахскую популяцию сравнили с другими популяциями мира по частотам аллелей гена HLA-DRB1 и с помощью построения диаграмм на основании метода ближайших соседей и многомерного шкалирования. Статистический анализ выполнен с использованием программы Arlequin v. 3.11. Всего в локусе HLA-DRB1 было выявлено 34 алли, DQA1 17 аллелей и DQB1 19 аллелей. На дендрограмме HLA-DRB1, построенной на основе метода ближайших соседей, казахи вошли в кластер, общий с азиатскими и сибирскими популяциями, в отличие от средиземноморских, европейских и американских популяций. Полученные данные могут быть полезны для понимания генетической составляющей и происхождения казахской популяции. Полученные результаты могут быть использованы в дальнейших популяционных исследованиях и направлении «HLA и болезни».

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по фундаментальной медицине , автор научной работы — Куранов А.Б., Вавилов М.Н., Абильдинова Г.Ж., Акильджанова А.Р., Искакова А.Н.

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

HLA class II genes in the kazakh population

Kazakhstan has been inhabited by different peoples, such as the Kazakhs, Russians, Uzbeks and others. In the present study for their human leukocyte antigen (HLA)-DRB1 alleles in Kazakhs were studied. A total of 157 blood samples were collected in 2010-2011 from healthy adult Kazakh individuals. HLA-DRB1, allele polymorphisms were typed by sequencebased typing (SBT) method. Allele frequencies, neighbour joining dendrograms and multidimensional scaling analysis have been obtained with comparison with other Kazakhs and worldwide populations. Statistical analyses were performed using Arlequin v. 3.11. In total 34 alleles were detected at the HLA-DRB1 locus, 17 alleles at the HLA-DQA1 and 19 alleles at the HLA-DQB1 locus. HLA-DRB1 neighbor-joining tree shows how the Kazakhs cluster together with Asian and Siberian populations and are separate from Mediterranean populations and also from the European and American populations. The present data may be useful to further understand their genetic background and origination of Kazakh population. Our study is important for further research on population genetics and genetic related diseases in Kazakhs.

Текст научной работы на тему «Гены hla ii класса в казахской популяции»

МОЛЕКУЛЯРНАЯ ИММУНОЛОГИЯ И ИММУНОГЕНЕТИКА

© коллектив авторов, 2015 УдК 612.6:02.017.1:577.21

Куранов А.Б123, Вавилов М.Н.4, Абильдинова Г.Ж.5, Акильджанова А.Р.1, Искакова А.Н.1, Жолдыбаева Е.В.1, Болдырева М.Н.3, Янкевич Т.Э.3, Алексеев Л.П.3, Мюллер К.А.2, Момыналиев К.Т.1

гены HLA II класса Б КАзАХсКОЙ ПОПУЯЯцИИ

Национальный центр биотехнологии, Астана, Казахстан; 2Клиника медицинского университета, Тюбинген, Германия; 3ФГБУ ГНЦ - Институт иммунологии ФМБА России, Москва, 115478, Москва, РФ; 4ГБУЗ Челябинская станция переливания крови, 454076, Челябинск, РФ; Национальный исследовательский центр материнского и детского здоровья, Астана, Казахстан

Казахстан населяют различные популяции, такие как казахи, русские, узбеки и др. В настоящем исследовании были изучены аллели генов HLA-DRB1, DQA1, DQB1 у казахов. Всего в 2010-2011 гг. было собрано 157 образцов крови от здоровых индивидуумов казахской национальности. Аллельный полиморфизм HLA-генов класса II был типирован методом прямого секвенирования (sequence based typing - SBT). Казахскую популяцию сравнили с другими популяциями мира по частотам аллелей гена HLA-DRB1 и с помощью построения диаграмм на основании метода ближайших соседей и многомерного шкалирования. Статистический анализ выполнен с использованием программы Arlequin v. 3.11. Всего в локусе HLA-DRB1 было выявлено 34 алли, DQA1 - 17 аллелей и DQB1 - 19 аллелей. На дендрограмме HLA-DRB1, построенной на основе метода ближайших соседей, казахи вошли в кластер, общий с азиатскими и сибирскими популяциями, в отличие от средиземноморских, европейских и американских популяций. Полученные данные могут быть полезны для понимания генетической составляющей и происхождения казахской популяции. Полученные результаты могут быть использованы в дальнейших популяционных исследованиях и направлении «HLA и болезни».

Ключевые слова: популяционный полиморфизм; казах; HLA-DRB; DQA; DQB; аллели, гаплотипы.

Для цитирования: Иммунология. 2015;36(3): 132-139.

KuranovA.B.1,2,3, VavilovM.N.4, Abil'dinova G.Zh.5, Akil'dzhanovaA.R.1, IskakovaA.N.1, ZholdybaevaE.V.1, Boldyreva M.N.3, Yankevich T.E.3, Alexeev L.P.3, Myuller K.A.2, Momynaliev K.T.1 HLA CLASS II GENES IN THE KAZAKH POPULATION

1 National center for biotechnology, Astana, Kazakhstan; 2 Medical University Clinic, Tuebingen, Germany; 3 Institute of immunology FMBA of Russia, Moscow, 115478, Moscow, Russia; 4 Chelyabinsk station of blood transfusion, 454076, Chelyabinsk, Russia; 5 National research center for maternal and child health, Astana, Kazakhstan.

Kazakhstan has been inhabited by different peoples, such as the Kazakhs, Russians, Uzbeks and others. In the present study for their human leukocyte antigen (HLA)-DRBI alleles in Kazakhs were studied. A total of 157 blood samples were collected in 2010-2011 from healthy adult Kazakh individuals. HLA-DRB1, allele polymorphisms were typed by sequence-based typing (SBT) method. Allele frequencies, neighbour joining dendrograms and multidimensional scaling analysis have been obtained with comparison with other Kazakhs and worldwide populations. Statistical analyses were performed using Arlequin v. 3.11. In total 34 alleles were detected at the HLA-DRB1 locus, 17 alleles at the HLA-DQA1 and 19 alleles at the HLA-DQB1 locus. HLA-DRB1 neighbor-joining tree shows how the Kazakhs cluster together with Asian and Siberian populations and are separate from Mediterranean populations and also from the European and American populations. The present data may be useful to further understand their genetic background and origination of Kazakh population. Our study is important for further research on population genetics and genetic related diseases in Kazakhs.

Keywords: population polymorphism, Kazakhs, HLA-DRB1, DQA1, DQB1, alleles, haplotypes.

citation: Immunologiya. 2015; 36(3): 132-139. (in Russian)

введение

Казахское ханство, первое казахское государство, было создано в 1456 г (1465/66 гг.) и располагалось на территории современной Республики Казахстан (рис. 1), на границе Европы и Азии, и исторически являлось областью пересечения больших транспортных маршрутов. Казахстан занимает территории, население которых характеризуется многообразием языков, религий и культур. Многие древние племена были во-

Для корреспонденции: Болдырева Маргарита Ииколаевна, m.n.boldyreva@mail.ru

For correspondence: Boldyreva Margarita Nikolaevna, m.n.boldyreva@mail.ru

влечены в формирование казахской национальности. Антропологи считают, что формирование казахского этноса началось в первом тысячелетии нашей эры. Есть мнения, что древний казахский антропологический тип включал характеристики европейских или средиземноморских антропологических типов. В последующие периоды, во время монгольских завоеваний, в результате интенсивного перемешивания, казахи приобрели монгольские черты [1]. На генофонд современной казахской популяции оказали влияние разные предшествующие этносы, включая тюркские племена (кипчаки, аргыны, хазар и т.д.), тюрко-монгольские племена (дулаты, жалайыры, найманы и т.д.), и другие азиатские племена. Даже при том, что Казахстан в основном характеризуется как полиэтническая страна, одним из основных этносов (более 60%) являются казахи.

Казахи - тюркоязычный народ, живущий в нескольких странах Центральной Азии, включая Казахстан, Узбекистан, Кыргызстан, Россию, Монголию, Китай и др.

Признано, что высокополиморфные гены HLA класса I и II являются основными компонентами адаптивного иммунного ответа. Актуальная версия специализированной базы данных последовательностей HLA (3.15.2013-07 из "IMGT/HLA Database''), номенклатурного комитета по HLA-системе Всемирной организации здравоохранения, включает более 10 000 аллелей [2]. Исследования HLA-полиморфизма в группах населения с разным этническим составом являются необходимой основой для развития в нескольких областях: популяционная генетика, клиническая трансплантология, диагностика заболеваний, идентификация личности. Все эти направления делают актуальными исследования HLA-разнообразия в популяциях Казахстана.

Цель исследования - изучение полиморфизма генов HLA-DRB1, DQA1 и DQB1 и их гаплотипов среди казахского населения, проживающего в новой столице Казахстана (Астана), в сравнении с другими мировыми популяциями в целях более глубокого понимания генетического фона и происхождения казахского населения.

Материалы и методы

Этическое соглашение

Исследование проводилось в соответствии с принципами гуманных и этических исследований Национального центра биотехнологии. Все 157 участников исследования были здоровыми, подписали информированное согласие на исследование и заполнили анкету-вопросник.

Исследуемая популяция

Было выполнено HLA-типирование представителей казахской национальности: 157 человек (69 мужчин и 88 женщин) из различных регионов Казахстана, живших в Астане в 2010-2011 гг. Все субъекты этой группы были отобраны случайным образом, не были связаны родственными узами, без клинических симптомов заболеваний. Группа состояла только из представителей казахской национальности и была классифицирована как моноэтническая в соответствии с характеристиками фенотипа исследованных субъектов и семейного происхождения [1]. Географическое расположение региона, в котором проживали участники исследования, представлены на карте (рис. 1).

Также в данной работе были использованы данные литературы о следующих популяциях из разных географических регионов: западноевропейские популяции - австрийцы [4], англичане [5], немцы [4], французы [6], итальянцы (Северная Италия) [4], голландцы [4], португальцы [4], испанцы (Мадрид) [7], испанцы (Гранада) [8]; восточно-европейские популяции - албанцы [9], башкиры [10], беларусы [11], болгары [12], чуваши [13], поляки [14], русские (Урал [10], Северо-Запад России [15]), сербы [4], словаки [16], украинцы [11]; средиземноморские популяции - армяне [17], греки [4, 18], грузины [19], итальянцы (Южная Италия) [4], евреи ашке-нази [20], арабы [21], курды [22], ливанцы [23], македонцы [24], палестинцы [25]; скандинавские популяции - финны [4], ханты-манси [26], коми [27], норвежцы [28], поморы [29], саамы [29], шведы [30]; сибирские популяции - алеуты [31], чукчи [32], эвенки (2 популяции) [26,32], кеты [32], коряки [32], буряты [26], недигал [26], ненцы [29], нивхи [32], нганасаны [33], тоджинцы [26], тофалары [26], тувинцы (2 популяции) [26, 34], удегейцы [26], ульчи [32]; азиатские популяции - монголы [4], китайцы [35], японцы [36], корейцы [37], казахи (Тарбагатай, Казахстан), казахи (Китай) [38],

Рис. 1. Географическое расположение региона исследования.

тайваньцы [4], уйгуры [39], малайцы [40], тайцы [4], вьеты [41], турки [42]; американские популяции - аргентинцы [4], мацатеканцы [43], ачи [44], эскимосы (2 популяции) [32, 45], Юпик [46].

HLA-генотипирование

HLA-типирование генов DRB1, DQB1 и DQA1 было выполнено с помощью метода прямого секвенирования (SBT) [3]. Геномную ДНК из образцов цельной крови выделяли с использованием набора для выделения ДНК (Wizard® genomic DNA Purification Kit, PROMEGA, Madison, WI) в соответствии с протоколом производителя. Концентрация ДНК составляла 50-100 нг/мл.

ПЦР и секвенирование выполняли для 2-го экзона генов HLA-DRB1, DQA1 и DQB1 в соответствии с литературными источниками [47-53]. Полимеразную цепную реакцию (ПЦР) проводили в 50 мкл реакционной смеси 100 мМ Tris-HCl (рН 8,0), 2,5 мМ MgCl2, 100 мМ каждого дНТФ, 10 пмоль каждого праймера, 2,0 U-полимеразы Taq-ДНК и исследуемой ДНК 50 нг/мл. Для амплификации применялся 96-луночный ам-плификатор "PTC-0240 DNA Engine Tetrad 2 Cycler" (BioRad, Hercules, CA). Режим термоциклирования для амплификации 2-го экзона генов HLA-DRB1, DQA1 и DQB1 был следующий: начальная денатурация в течение 5 мин при 94°C, а затем 10 циклов при 94°С в течение 30 с и 65°С в течение 50 с; затем 20 циклов, каждый из которых состоит из денатурации 94°С в течение 30 с, отжига праймеров 50 с при 62°С и элонгации 60 с при 72°C, с конечным удлинением в течение 5 мин при 72°C. Детекция результатов ПЦР проводилась на 2% ага-розном гель-электрофорезе. Секвенирование проводили на 96-капиллярном генетическом анализаторе 3730XL Genetic Analyzer (Applied Biosystem, Foster City, CA) с помощью Big-Dye Terminator v3.1 (Applied Biosystem). Аллели HLA были проанализированы с использованием HLA номенклатуры, релиз 3.7.0 (IMGT / базы данных HLA)[3].

статистический анализ

Частоты аллелей HLA-DRB1-, DQB1- и DQA-локусов были оценены методом прямого подсчета. Для сравнения популяции казахов с некоторыми мировыми популяциями были использованы частоты аллелей, частоты гаплотипов, метод объединения ближайших соседей, построение дендрограмм и многомерное шкалирование. Статистический анализ проводился с использованием программы Arlequin ст. 3.11. Для оценки генетических расстояний вычисляли матрицу Эвкли-да [54, 55], используя программу PAST v.2.17. Частоты гаплотипов вычисляли с помощью программы Arlequin v3.11 методом максимального правдоподобия. Тот же пакет программ был использован для вычисления соответствия соотношению Харди-Вайнберга. Филогенетические дендрограммы были созданы с применением программы PHYLIP на основе ча-

Таблица 1

Гетерозиготность исследованных образцов по генам HLA класса II

Наблюдаемая и ожидаемая гетерозиготность

Локус гетерозиготность наблюдаемая гетерозиготность ожидаемая Р

HLA-DRB1 0,93631 0,94593 > 0,05

HLA-DQB1 0,91083 0,91758 > 0,05

HLA-DQA1 0,87898 0,91144 > 0,05

стот аллелей с использованием метода объединения соседей (N1) на основании генетических расстояний, вычисленных по Нею (http://evolution.gs.washington.edu/phylip.html).

ванием программы Arlequin v. 3.11. Для сравнения полученных данных HLA-типирования с различными популяциями была использована всемирная база данных частот аллелей HLA населения разных стран [4]. Самые частотные гаплоти-пы у казахского населения из Астаны наблюдались также в большинстве европейских и азиатских популяциях.

Наиболее распространенными среди казахского населения оказались пять DRBl-DQAl-DQBl-гаплоти-пов: DRB1*07:01-DQA1*02:01-DQB1*02:01/02:02 (8,0%), DRB1*03:01-DQA1*05:01-DQB1*02:01 (3,4%), DRB1*13:01-DQA1*01:03-DQB1*06:03 (2,9%), DRB1*14:01-DQA1*01:04-DQB1*05:02 (2,9%) и DRB1*13:01-DQA1*03:01-DQB1*03:01 (1,6%). Трехлокусные гаплотипы DRB1-DQB1-DQA1 с частотой >1,0% у казахского населения представлены в табл. 3, где частота этих гаплотипов дана в сравнении с различными группами населения мира.

Результаты

Настоящее исследование - первое, в котором был проведен анализ частот аллелей локу-са HLA-DRB1 у казахского населения в сравнении с средиземноморскими, европейскими, азиатскими и сибирскими популяциями.

В табл. 1 приведены данные о количестве HLA-DRB1-, DQB1-, и DQA1-аллелей в исследуемой популяции. В группе, включавшей 157 казахов из Астаны, были определены 34 аллели локуса HLA-DRB1, 19 аллелей локуса HLA-DQB1 и 17 аллелей локуса HLA-DQA1. Наблюдаемая гетерозиготность не отличалась от ожидаемой, что свидетельствовало о соответствии соотношению Харди-Вайнберга и таким образом об адекватном выборе субъектов для проведения генетических исследований.

Распределение частот аллелей HLA-DRB1-, DQA1- и DQB1-локусов у казахского населения из Астаны, приведены в табл. 2. Частоты аллелей DRB1*07:01 и DRB1*03:01 были наиболее высокими и наблюдались соответственно в 13,1 и 10,0%. Аллель DRB1*13:01 был обнаружен у казахов с частотой 8,6%. Частота шести HLA-DRB1 аллелей (DRB1*01:01, DRB1*09:01, DRB1*13:03-102, DRB1*14:01, DRB1*14:05-72 и DRB1*15:01) была выше 4%, а их суммарная частота составила 28,6%.

Локус HLA-DQB1 является вторым основным локусом генов HLA II класса, по которому было исследовано формирование генетической основы казахского населения. Самыми частотными аллелями у казахов оказались четыре HLA-DQB1-аллеля: DQB1*02:01 у 13,6%, DQB1*02:03 у 12,7%, DQB1*03:01 у 17,6%, DQB1*03:04/22 у 11,7%. Их суммарная частота в исследуемой популяции составила более 55%.

В DQA1-локусе было установлено, что наиболее частым был аллель DQA1*03:01 (13,3%), затем DQA1*01:02 (10,2%), DQA1*01:03 (9,6%), DQA1*02:01 (9,6%) и DQA1*05:01 (9,6%). Другие аллели встречались с частотой от 0,3 до 9,0%.

В ходе выполнения работы были установлены новые аллели, обозначения которым были официально присвоены номенклатурным комитетом Всемирной организации здравоохранения [56]. Новые аллели получили следующие обозначения: DRB1*03:56, DRB1*03:57, DRB1*13:102, DRB1*13:02:04, DRB1*13:103, DRB1*11:04:06 и DRB1*14:12:02 [57].

Частоты трехлокусных гаплотипов (DRB1-DQB1-DQA1 (табл. 3) вычислены с использо-

Таблица 2

Частоты аллелей генов HLA-DRB1, DQA1 и DQB1 в Казахской популяции

Аллели HLA-DRB1 Частота аллелей, % Аллели HLA-DQA1 Частота аллелей, % Аллели HLA-DQB1 Частота аллелей, %

*01:01 4,2 *01:01 3.5 *02:01 13.6

*01:02 0,3 *01:02 10.2 *02:02 6.3

*03:01 10,0 *01:03 9.6 *02:03 12.7

*03:02 0,3 *01:04 9.0 *02:04 2.4

*03:07 0,6 *02:01 9.6 *03:01 17.6

*03:12 0,3 *03:01 13.0 *03:02 7.5

*03:16 1,9 *03:02 8.3 *03:03 2.5

*03:29-56 0,6 *03:03 5.1 *03:04-22 11.7

*04:01 3,8 *04:01 2.6 *04:01 0.6

*04:02 0,6 *04:02-04 0.3 *04:02 2.6

*04:03 1,0 *05:01 9.6 *05:01 7.9

*04:04-32 3,8 *05:02 0.6 *05:02 4.8

*07:01 13,1 *05:03 1.0 *05:03 2.2

*08:01 1,0 *05:05 9.0 *05:04 1.0

*08:02 0,6 *05:06-10 5.7 *05:05 0.3

*08:03 1,6 *06:01 2.6 *06:01 2.5

*08:04-24 0,6 *06:02 0.3 *06:02 5.0

*09:01 4,5 *06:03 5.1

*09:02 0,3 *06:04-39 1.6

*10:01 1,3

*11:01 3,5

*11:04 3,8

*11:06-62 2,6

*12:01 2,6

*13:01 8,6

*13:02 2,9

*13:03-102 5,7

*14:01 4,9

*14:03 1,9

*14:04 1,9

*14:05-72 4,2

*15:01 5,1

*15:02 1,3

*16:01 0,6

Таблица 3

Наиболее частые из HLA-DRB1-DQA1-DQB1 гаплотипы и их частоты у казахского населения

Гаплотипы Частота, % Распространение в мире Возможное происхождение

DRB1*07:01-DA1*02:01-DQB1*02:01/02:02a 8,0 Очень часто Европейско/Азиатское

DRB1*03:01-DQA1*05:01-DQB1*02:01b 3,4 Очень часто То же

DRB1*13:01-DQA1*01:03-DQB1*06:03c 2,9 Очень часто " "

DRB1*14:01-DQA1*01:04-DQB1*05:02tl 2,9 Часто Азиатское

DRB1*13:01-DQA1*03:01-DQB1*03:01e 1,6 Не найдено Казахское

DRB1*15:01-DQA1*01:02-DQB1*06:02f 1,3 Очень часто Европейско/Азиатское

DRB1*07:01-DQA1*03:01-DQB1*02:02e 1,3 Не найдено Казахское

DRB1*15:01-DQA1*01:02-DQB1*06:02g 1,3 Очень часто Европейское

DRB1*07:01-DQA1*03:02-DQB1*02:02e 1,0 Не найдено Казахское

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

DRB1*15:01-DQA1*01:02-DQB1*06:03h 1,0 Редко Европейско/Азиатское

DRB1*15:02-DQA1*01:03-DQB1*06:01i 1,0 Очень часто То же

DRB1*03:01-DQA1*03:01-DQB1*03:02e 1,0 Не найдено Казахское

DRB1*09:01-DQA1*03:03-DQB1*02:02e 1,0 Не найдено То же

DRB1*14:03-DQA1*05:01-DQB1*03:01j 1,0 Часто Европейско/Азиатское

DRB1*13:01-DQA1*01:03-DQB1*06:04k 1,0 Очень редко Африканское

DRB1*13:02-DQA1*01:02-DQB1*06:04l 1,0 Часто Европейско/Азиатское

DRB1*04:01-DQA1*03:02-DQB1*03:01e 1,0 Не найдено Казахское

DRB1*13:01-DQA1*01:03-DQB1*05:01e 1.0 Не найдено То же

Примечание. а найдено у кучун-бурят (22,0%); у ханты-манси (16,9%), у казахов из Китая (8,3%); ь найдено у итальянцев (Южная Италия, 25,3%); у русских (Северо-Запад, 9,0%); у казахов из Китая (13,1%); снайдено у ханты-манси (8,1%); у итальянцев (Северная Италия, 7,6%), у тоджинцев (6,8%), у русских (Северо-Запад, 5,5%); у казахов из Китая (4,8%); 11 найдено у корейцев (2,9%); е не было обнаружено в других популяциях; найдено у тоджинцев (22,5%); у англичан (14,1%), у аборигенов Австралии (10,0%), у русских (Северо-Запад, 9.0%); у казахов из Китая (2,4%); gнайдено у итальянцев (Северная Италия, 14,1%); у словенцев (11.4%); 11 найдено у аборигенов Австралии (7.0%); шайдено у японцев (8,2%); у монголов (6,5%); у казахов из Китая (2,4%); ' найдено у ханты-манси (8.1%); у итальянцев (Северная Италия, 7,6%); у казахов из Китая (4,8%); к найдено у камерунцев (1,2%); 1 у итальянцев (Северная Италия, 1,9%); у тувинцев (1,1%).

Дендограмма, построенная с помощью метода ближайших соседей была создана на основе частот аллелей гена HLA-DRB1 в различных популяциях, включая казахскую (рис. 2). Сравнивались частоты аллелей DRB1 у казахского населения с другими мировыми популяционными группами (европейскими, скандинавскими, средиземноморскми, сибирскими и азиатскими). Результаты анализа показали четкую дивергенцию между мировыми популяциями, включенными в анализ. Дендрограмма генетических расстояний (см. рис. 2) показывает, что население Казахстана располагается в виде кластеров вместе с азиатскими и сибирскими популяциями отдельно от европейских, скандинавских и средиземноморских народов. Таким образом, по HLA-генам казахи оказались ближе всего к населению Азии и Сибири.

Анализ генетического родства 74 этнических групп на основе аллельных частот HLA-DRB1-локуса показан на рис. 3. Результаты показывают, что на основе генов системы HLA все анализируемые этнические группы можно разделить на пять кластеров: азиатско-сибирский, американский, скандинавский, европейский и средиземноморский. Казахи вошли в кластер, в который входят казахи Китая, уйгуры, монголы, тоджа, тувинцы, а также другие популяции Сибири и Азии.

Обсуждение

Цель исследования заключалась в определении полиморфизма HLA-генов класса II (DRB1, DQA1 и DQB1), а также поиска высокоспецифичных для казахского этноса аллелей и гаплотипов, которые имеют низкую частоту в других популяциях мира. Частоты HLA-аллелей были использованы для компьютерных расчетов двумерных генетических расстояний, метода объединения соседей, многомерного шкалирования (MDS) и расчета трехлокусных гаплотипов HLA (см. табл. 3).

Высокие частоты DRB1*07:01 (13,1%) и DRB1*03:01 (10,0%) выявлены в казахской популяции Астаны и в других

популяциях казахов [38]. Аллель DRB1*03:01 присутствует почти во всех европейских и азиатских популяциях [54], в частности у 13,1% казахов Китая [38] и 14% уйгурского населения [39]. DRB1*07:01 представлен почти во всех популяциях мира, например, у немцев 12,6%, русских (13,5% на Урале [10], 12% на Северо-Западе России [15]), у 10,7% казахов (Китай) [38], у 16,7% уйгуров [39] и 26% бурят [26].

Из других аллелей у казахов из Астаны высоко представлен аллель DRB1*13:01 (8,6%), который широко распространен среди ряда азиатских и сибирских популяций, в частности кетов (23,5%) [32], ханты-манси (12,5%) [26 ] и тоджинцев (9,1%) [26]. Таким образом, DRB1*13:01 присутствует больше в сибирских и азиатских популяциях, чем в европейских [58]. Типичные азиатские аллели, такие как DRB1*09:01 (4,5%), представлены относительно часто и среди казахов. Согласно данным литературы, этот аллель встречается в Азии примерно от 11,9% в китайской популяции [35] до 32% у малайцев [59]. Интересно, что у казахов, проживающих в Актюбинской области (Казахстан), этот аллель имеет частоту 3,9% [60], у казахов, проживающих в регионе Тарбагатая, который ближе к Китаю, частота этого аллеля составляет 4,8%, а казахи, проживающие в Китае, имеют частоту этого аллеля уже 7,1% [38]. У китайцев частота аллеля DRB1*09:01 составляет 11,9% [35], у монголов - 6,5% [4]. Таким образом, существует тенденция повышения частоты аллеля DRB1*09:0l среди групп казахов с запада на восток.

У казахского населения четко представлены как азиатские, так и неазиатские аллели. У казахов из Астаны определялся аллель DRB1*04:05, который встречается в азиатских популяциях с частотой 6-14% [58]. Этот аллель также характерен для популяций монгольского происхождения. В то же время аллели DRB1*11:01 и DRB1*11:04, характерные для арабских этнических групп [4], были найдены у казахов с частотами 3,5 и 3,8% соответственно.

—с —с

Аргентинцы Немцы Португальцы Испанцы (Гранада) Испанцы (Мадрид) Русские (Урал) Австрийцы

Русские (Северо-Запад)

Поляки

Французы

Шведы

Финны

Поморы

Саамы

Норвежцы

Англичане

Голландцы

Сербы

Белорусы

Украинцы

Словаки

Коми

Евреи Ашкенази

Чуваши

Палестинцы

Арабы

Армяне

Грузины

Итальянцы (Северная Италия)

Итальянцы (Южная Италия)

Греки (Крит)

Курды

Ливанцы

Турки

Болгары

Албанцы

Греки

Македонцы

Уйгуры

Башкиры

Ханты-Манси

Буряты

Алеуты

Казахи (Астана) Казахи (Тарбагатай) Казахи (Китай)

Тоджинцы Тувинцы 1 Тувинцы 2 Монголы

Китайцы (Ханьцы)

Тофапары

Тайцы

Корейцы

Японцы

Эскимосы 1

Мацатеканцы

Ачи

Юпик (Аляска)

Эскимосы 2

Чукчи

Коряки

Нивхи

Удегейцы

Ненцы

Нганасаны

Эвенки (Охотск)

Недигалы

Эвенки

Ульчи

Тайваньцы

Кеты

Малайцы

Вьеты

Рис. 2. Дендрограмма генетических расстояний в основе частот аллелей гена HLA-DRB1 в различных популяциях, включая казахскую.

Что касается гена HLA-DQB1, то среди казахов были обнаружены 19 аллелей (см. табл. 2). Среди казахского населения два аллеля суммарно превышали частоту в 30%: DQB1*02:01 (13,6%) и DQB1* 03:01(17,6%). Аллель DQB1*02:01 был выявлен также и в других азиатских популяциях: у казахов из Китая (23,8%) [38], монголов (11,5%) [4], тоджа (4,5%) [26] и тувинцев из России (10,2%) [26,34]. Аллель DQB1*03:01 у казахов из Астаны встречался немного реже (17,6%), чем у казахов из Китая (21,4%) [38], монголов (25,5%) [4], тоджин-цев (36,4%) [26 ] и тувинцев (28,4%) [26,34].

У казахов были найдены несколько гаплотипов, которые могут быть уникальными, потому что пока не найдены в дру-

гих популяциях мира (см. табл. 3): DRB1*07:01-DQA1*03:02-DQB1*02:02;DRB1*14:01-DQA1*01:04-DQB1*05:01;DRB1* 13:01-DQA1*01:03-DQB1*05:01; DRB1*11:01-DQA1*05:01-DQB1*03:04 и DRB1*03:01-DQA1*03:01-DQB1*03:02.

Г. Березина и соавт. (2011) при исследовании полиморфизма митохондриальной ДНК (мтДНК) показали, что у казахского населения присутствуют 55% гаплогрупп мтДНК из Западной Евразии и 41% гаплогрупп мтДНК из Восточной Евразии. Авторы выяснили, что линии мтДНК Восточной Евразии (55% всего генофонда) в современном генофонде казахов представлены гаплогруппами D, С, G и Z (36,2%), A и F (6,9%) и другими гаплогруппами азиатского происхождения (11,9%). Линии Западной Евразии (41% от общего генофонда) представлены гаплогруппами H (14,1%), K (2,6%), J (3,6%), Т (5,5%), U5 (3%) и другими (12,2%). Было высказано предположение, что между населением России и казахским населением Северо-Запада, Севера, Северо-Востока и Востока Казахстана произошел интенсивный обмен генами [61]. Однако результаты анализа нерекомбинирующего региона Y-хромосомы (NRY) не показали связи между казахами и русскими. Наиболее частые гаплогруппы, присутствущие в южной России, принадлежат R1a, Шс и I1b [62]. Хотя гаплогруппа R1a и представлена у алтайских казахов, гаплогруппы N1c и I1b не найдены ни в одной из казахских популяций. Таким образом, показатели мтДНК свидетельствуют об обмене генов с русскими, однако данные по NRY позволяют предполагать ограниченное взаимодействие данных групп. Предположение о взаимодействии коренного населения Азии и Сибири подтверждается данными о том, что казахстанские маркеры Y-хромосомы принадлежат в основном к С3+-, С3С- и 03-гаплогруппам, которые были получены ими от населения юга Сибири или по происхождению являются монгольскими [63]. Самые высокие частоты С3*-кластера, который приписывается потомкам Чингисхана, наблюдались у алтайских казахов [64]. Частоты гаплогруппы С очень распространены в Монголии (15%) и популяциях Центральной Азии (7-18%) [65].

В 1991 г. было проведено изучение разнообразия HLA-аллелей среди некоторых европейских, монгольских и смешанных этнических групп, проживающих на территории бывшего СССР. Авторы исследования пришли к выводу, что данные по HLA-полиморфизму в целом согласуются с антропологической информацией [66]. Казахи характеризуются наличием HLA-аллелей, которые присутствуют и у европейцев, и у азиатов, хотя каждая из этих популяций имеет свой особый профиль HLA-генов. Распределение HLA-аллелей у казахов согласуется с аналогичными данными по популяциям из Монголии. Эти данные подтверждают гипотезу о существовании потока генов между европейскими, азиатскими и сибирскими народами, что может быть связано с миграцией народов из Азии и/или Сибири в Европу. Культурные особенности населения Евразии подтверждают генетические контакты между Азией и Сибирью. Исходя из этих результатов можно предположить, что популяции казахов генетически смешаны с народами Европы, Сибири и Азии. Казахи, уйгуры, буряты, монголы и жители Северного Китая представляют определенную промежуточную группу, которая постепенно теряя HLA-специфичности, характерные для европейских популяци-онных групп, накапливает HLA-аллели, характерные для населения Юго-Восточной Азии [67, 68].

Дендрограмма, построенная на основании метода объеди-ненияближайших соседей по частотамаллелей DRB1-локуса, показывает генетическое родство казахского населения с мировыми популяциями (см. рис. 3). Популяции сгруппированы в две основные ветви, которые связаны между собой. С одной стороны, группируются казахи (Астана), казахи (Тарбагатай), монголы, казахи Китая, тувинцы и тоджин-цы; с другой - европейские, средиземноморские и скандинавские этнические группы. Казахское население Астаны показывает тесную генетическую связь с сибиряками и

Рис. 3. Многомерное шкалирование 74 популяций (HLA-DRB1).

■ - Азия (1-13): 1) казахи (Астана), 2) казахи (Тарбагатай), 3) монголы,4) китайцы (ханьцы), 5) японцы, 6) казахи (Китай), 7) корейцы, 8) тайваньцы, 9) уйгуры, 10) малайцы, 11) тайцы, 12) вьеты, 13) турки.

А - Сибирь (13-30): 14) алеуты, 15) чукчи, 16) эвенки, 17) кеты, 18) коряки, 19) буряты, 20) недигалы, 21) ненцы, 22) нивхи, 23) нганасаны, 24) эвенки (Охотск), 25) тоджи, 26) тофала-ры, 27) тувинцы 1, 28) тувинцы-2, 29) удэгейцы, 30) ульчи.

♦ - Америка (31-36): 31) аргентинцы, 32) мацатеканцы, 33) ачи, 34) эскимосы-1, 35) эскимосы-2, 36) юпик-аляска.

о - Европа (37-56): 37) австрийцы, 38) англичане, 39) немцы, 40) французы, 41) итальянцы (Северная Италия), 42) голландцы, 43) португальцы, 44) испанцы (Мадрид), 45) испанцы (Гранада), 46) албанцы, 47) башкиры, 48) беларусы, 49) болгары, 50) чуваши, 51) поляки, 52) русские (Северо-Запад), 53) русские (Урал), 54) сербы, 55) словаки, 56) украинцы. о - Средиземноморье (57-67): 57) армяне, 58) греки (Крит), 59) грузины, 60) греки, 61) итальянцы (Южная Италия), 62) арабы, 63) евреи Ашкенази, 64) курды, 65) ливанцы, 66) македонцы, 67) палестинцы.

о - Скандинавия (68-74): 68) финны, 69) ханты-манси, 70) коми, 71) норвежцы, 72) поморы, 73) саамы, 74) шведы. Стресс значение = 0,10.

казахов позволит также в будущем использовать полученные результаты для поиска HLA-совместимых доноров, например для трансплантации гемопоэтических стволовых клеток, что предопределяет клиническую значимость настоящего исследования.

Конфликт интересов.

Авторы заявляют об отсутствии конфликта интересов.

ЛИТЕРАТУРА

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

I. Толстов С.П., Жданко Т.А., Абрамзон С.А., Кислякова Н.А. Народы Средней Азии и Казахстана. М.: Издательство АН СССР. 1963; Ч. 2.

II. Болдырева M. H., Гуськова И. А., Богатова О. В. и др. HLA-генетическое разнообразие населения России и СНГ. II. Народы Европейской части. Иммунология. 2006; 27 (4): 198-202.

27. Хидиятова И.М., Ишмухаметова А.Т., Лук-манова Г.И., Хуснутдинова Э.К. Анализ полиморфизма гена HLA-DRB1 в популяциях Волго-Уральского региона. Генетика. 2004; 2: 267-71. 60. Болдырева М.Н. HLA (класс II) и естественный отбор. "Функциональный " генотип, гипотеза преимущества "функциональной" гетеро-зиготности. Дисс. ... д-ра мед. наук. М.; 2007. 64. Деренко М.В., Малярчук Б.А., Возняк М., Денисова Г.А., Дамбуева И.К. и др. Распределение мужских линий потомков Чингисхана в северных евразийских популяциях. Генетика. 2007; 43 (3): 422-6.

Поступила 05.10.14

REFERENCES

азиатами. Исследование НЬА-полиморфизма подтверждает исторические и другие генетические данные, что для населения Казахстана характерны черты азиатского антропологического типа, хотя формировалось оно под влиянием различных этнических групп: азиатских, сибирских и европейских. Миграции и смешение различных этносов являются основным фактором, определяющим генетическое разнообразие казахского населения. Наконец, казахи генетически отличаются от других азиатов (см. рис. 2 и 3), так как их НЬА-генофонд включает аллели из Европы, Азии и Сибири. Казахи из Астаны генетически связаны с казахами Тарбагатая, Китая и уйгурами (см. рис. 3). Генетическая кластеризация соответствует географическому месту проживания популяций.

Следует отметить, что относительно высокая степень неоднородности в азиатских и сибирских популяциях по сравнению с европейскими может быть связана с их более широким ареалом проживания. Азиатские и особенно сибирские народы в большей мере изолированы друг от друга, в то время как европейские популяции живут более компактно на ограниченной территории, что обеспечивает им возможность более интенсивных контактов.

Полученные результаты о значительном генетическом разнообразии НЬА-локусов и гаплотипов в казахской популяции могут быть использованы в качестве контрольных для любого исследования по направлению «НЬА и болезни», например, при исследовании туберкулеза в казахской популяции [3]. Данные о распределении НЬА-аллелей у

1. Tolstov S.P., Zhdanko T.A., Abramzon C.A., Kislyakova N.A. The Peoples of Central Asia and Kazakhstan. Moscow: Izdatel'stvo AN SSSR. 1963; Ch. 2. (in Russian)

2. Marsh S.G., Albert E.D., Bodmer W.F.,

- Bontrop R.E., Dupont B. et al. An update to HLA

nomenclature. Bone Marrow Transplant. 2010; 45(5): 846-8.

3. Kuranov A.B., Kozhamkulov U.A., Vavilov M.N., Belova E.S., Bismilda V.L. et al. HLA-class II alleles in patients with drug-resistant pulmonary tuberculosis in Kazakhstan. Tissue Antigens. 2014; 83(2): 106-12.

4. Gonzalez-Galarza F.F., Christmas S., Middleton D., Jones A.R. Allele frequency net: a database and online repository for immune gene frequencies in worldwide populations. Nucleic Acid Res. 2011; 39: D913-9.

5. Doherty D.G., Vaughan R.W., Donaldson P.T., Mowat A.P. HLA DQA, DQB, and DRB genotyping by oligonucleotide analysis: distribution of alleles and haplotypes in British caucasoids. Hum. Immunol. 1992; 34(1): 53-63.

6. Bera O., Cesaire R., Quelvennec E., Quillivic F., de Chavigny V. et al. HLA class I and class II allele and haplotype diversity in Martinicans. Tissue Antigens. 2001; 57(3): 200-7.

7. Mas A., Blanco E., Moñux G., Urcelay E., Serrano F.J. et al. DRB1-TNF-alpha-TNF-beta haplotype is strongly associated with severe aortoiliac occlusive disease, a clinical form of atherosclerosis. Hum. Immunol. 2005; 66(10): 1062-7.

8. Pascual M., Nieto A., López-Nevot M.A., Ramal L., Matarán L. et al. Rheumatoid arthritis in southern Spain: toward elucidation of a unifying role of the HLA class II region in disease predisposition. Arthr. and Rheum. 2001; 44(2): 307-14.

9. Sulcebe G., Sanchez-Mazas A., Tiercy J.-M., Shyti E., Mone I. et al. HLA allele and haplotype frequencies in the Albanian population and their relationship with the other European populations. Int. J. Immunogenet. 2009; 36: 337-43.

10. Suslova T.A., Burmistrova A.L., Chemova M.S., Khromova

E.B., Lupar E.I. et al. HLA gene and haplotype frequencies in Russians, Bashkirs and Tatars, living in the Chelyabinsk Region (Russian South Urals). Int. J. Immunogenet. 2012; 39(5): 394-408.

11. Boldyreva M. N., Gus'kova I. A., Bogatova O. V. et al. The HLA-genetic diversity the population of Russia and the CIS. II. The nations of European part. Immunologiya. 2006; 27(4): 198-202. (in Russian)

12. Ivanova M., Rozemuller E., Tyfekchiev N., Michailova A., Tilanus M. et al. HLA polymorphism in Bulgarians defined by high-resolution typing methods in comparison with other populations.Tissue Antigens. 2002; 60: 496-504.

13. Arnaiz-Villena A., Martinez-Laso J., Moscoso J., Livshits G., Zamora J. et al. HLA genes in the Chuvashian population from European Russia: admixture of Central European and Mediterranean populations. Hum. Biol. 2003; 75(3): 375-92.

14. Nowak J., Mika-Witkowska R., Polak M., Zajko M., Rogatko-Koros M. et al. Allele and extended haplotype polymorphism of HLA-A, -C, -B, -DRB1 and -DQB1 loci in Polish population and genetic affinities to other populations. Tissue Antigens. 2008; 71(3): 193-205.

15. Kapustin S., Lyshchov A., Alexandrova J., Imyanitov E., Blinov M. HLA class II molecular polymorphisms in healthy Slavic individuals from North-Western Russia. Tissue Antigens. 1999; 54(5): 517-20.

16. Cechová E., Fazekasová H., Ferencík S., Shawkatová I., Buc M. HLA-DRB1, -DQB1 and -DPB1 polymorphism in the Slovak population. Tissue Antigens. 1998; 51(5): 574-6.

17. Matevosyan L., Chattopadhyay S., Madelian V., Avagyan S., Nazaretyan M. et al. HLA-A, HLA-B, and HLA-DRB1 allele distribution in a large Armenian population sample. Tissue Antigens. 2011; 78(1): 21-30.

18. Arnaiz-Villena A., Iliakis P., González-Hevilla M., Longás J., Gómez-Casado E. et al. The origin of Cretan populations as determined by characterization of HLA alleles. Tissue Antigens. 1999; 53(3): 213-26.

19. Sánchez-Velasco P., Leyva-Cobián F. The HLA class I and class II allele frequencies studied at the DNA level in the Svanetian population (Upper Caucasus) and their relationships to Western European populations. Tissue Antigens. 2001; 58: 223-33.

20. Martinez-Laso J., Gazit E., Gomez-Casado E., Morales P., Mar-tinez-Quiles N. et al. HLA DR and DQ polymorphism in Ashke-nazi and non-Ashkenazi Jews: comparison with other Mediterraneans. Tissue Antigens. 1996; 47(1): 63-71.

21. Amar A., Kwon O.J., Motro U., Witt C.S., Bonne-Tamir B. et al. Molecular analysis of HLA class II polymorphisms among different ethnic groups in Israel. Hum. Immunol. 1999; 60(8): 723-30.

22. Farjadian S., Ghaderi A. HLA class II similarities in Iranian Kurds and Azeris. Int. J. Immunogenet. 2007; 34(6): 457-63.

23. Samaha H., Rahal E.A., Abou-Jaoude M., Younes M., Dacchache J. et al. HLA class II allele frequencies in the Lebanese population. Mol. Immunol. 2003; 39(17-18): 1079-81.

24. Arnaiz-Villena A., Dimitroski K., Pacho A., Moscoso J., Gómez-Casado E., Silvera-Redondo C. et al. HLA genes in Macedonians and the sub-Saharan origin of the Greeks. Tissue Antigens. 2001; 57(2): 118-27.

25. Arnaiz-Villena A., Elaiwa N., Silvera C., Rostom A., Moscoso J. et al. The origin of Palestinians and their genetic relatedness with other Mediterranean populations. Hum. Immunol. 2001; 62(9): 889-900.

26. Uinuk-Ool T.S., Takezaki N., Sukernik R.I., Nagl S., Klein J. Origin and affinities of indigenous Siberian populations as revealed by HLA class II gene frequencies. Hum. Genet. 2002; 110(3): 209-26.

27. Khidiyatova I.M., Ishmukhametova A.T., Lukmanova G.I., Khusnutdinova E.K. Polymorphism analysis HLA-DRB1 gene in populations of the Volga-Ural. Genetika. 2004; 2: 267-71. (in Russian)

28. R0nningen K.S., Spurkland A., Markussen G., Iwe T., Vartdal

F. et al. Distribution of HLA class II alleles among Norwegian Caucasians. Hum. Immunol. 1990; 29(4): 275-81.

29. Evseeva I., Spurkland A., Thorsby E., Smerdel A., Tranebjaerg L. et al. HLA profile of three ethnic groups living in the NorthWestern region of Russia. Tissue Antigens. 2002; 59: 38-43.

30. Brynedal B., Duvefelt K., Jonasdottir G., Roos I.M., Akesson E.

et al. HLA-A confers an HLA-DRB1 independent influence on the risk of multiple sclerosis. PLoS One. 2007; 2(7): e664.

31. Moscoso J., Crawford M.H., Vicario J.L., Zlojutro M., Serrano-Vela J.I. et al. HLA genes of Aleutian Islanders living between Alaska (USA) and Kamchatka (Russia) suggest a possible southern Siberia origin. Mol. Immunol. 2008; 45(4): 1018-26.

32. Grahovac B., Sukernik R.I., O'hUigin C., Zaleska-Rutczynska Z., Blagitko N. et al. Polymorphism of the HLA class II loci in Siberian populations. Hum. Genet. 1998; 102(1): 27-43.

33. Uinuk-Ool T.S., Takezaki N., Derbeneva O.A., Volodko N.V., Sukernik R.I. Variation of HLA class II genes in the Nganasan and Ket, two aboriginal Siberian populations. Eur. J. Immunogenet. 2004; 31(1): 43-51.

34. Martinez-Laso J., Sartakova M., Allende L., Konenkov V., Moscoso J. et al. HLA molecular markers in Tuvinians: a population with both Oriental and Caucasoid characteristics. Ann. Hum. Genet. 2001; 65(Pt 3): 245-61.

35. Shen C.M., Zhu B.F., Ye S.H., Liu M.L., Yang G. et al. Allelic diversity and haplotype structure of HLA loci in the Chinese Han population living in the Guanzhong region of the Shaanxi province. Hum. Immunol. 2010; 71(6): 627-33.

36. Matsumura Y., Kinouchi Y., Nomura E., Negoro K., Kakuta Y., Endo K. et al. HLA-DRB1 alleles influence clinical phenotypes in Japanese patients with ulcerative colitis. Tissue Antigens. 2008; 71(5): 447-52.

37. Song E.Y., Park M.H., Kang S.J., Park H.J., Kim B.C. et al. HLA class II allele and haplotype frequencies in Koreans based on 107 families. Tissue Antigens. 2002; 59(6): 475-86.

38. Mizuki M., Ohno S., Ando H., Sato T., Imanishi T. et al. Major histocompatibility complex class II alleles in Kazak and Han populations in the Silk Route of northwestern China. Tissue Antigens. 1997; 50(5): 527-34.

39. Mizuki N., Ohno S., Ando H., Sato T., Imanishi T, et al. Major histocompatibility complex class II alleles in an Uygur population in the Silk Route of Northwest China. Tissue Antigens. 1998; 51(3): 287-92.

40. Mack S.J., Bugawan T.L., Moonsamy P.V., Erlich J.A., Trachtenberg E.A. et al. Evolution of Pacific/Asian populations inferred from HLA class II allele frequency distributions. Tissue Antigens. 2000; 55(5): 383-400.

41. Vu-Trieu A., Djoulah S., Tran-Thi C., Ngyuyen-Thanh T., Le Monnier De Gouville I. et al. HLA-DR and -DQB1 DNA polymorphisms in a Vietnamese Kinh population from Hanoi. Eur. J. Immunogenet. 1997; 24(5): 345-56.

42. Arnaiz-Villena A., Karin M., Bendikuze N., Gomez-Casado E., Moscoso J. et al. HLA alleles and haplotypes in the Turkish population: relatedness to Kurds, Armenians and other Mediterraneans. Tissue Antigens. 2001; 57(4): 308-17.

43. Arnaiz-Villena A., Vargas-Alarcón G., Granados J., Gómez-Casado E., Longas J. et al. HLA genes in Mexican Mazatecans, the peopling of the Americas and the uniqueness of Amerindians. Tissue Antigens. 2000; 56(5): 405-16.

44. Tsuneto L.T., Probst C.M., Hutz M.H., Salzano F.M., Rodriguez-Delfin L.A. et al. HLA class II diversity in seven Amerindian populations. Clues about the origins of the Aché. Tissue Antigens. 2003; 62(6): 512-26.

45. Welinder L., Graugaard B., Madsen M. HLA antigen and gene frequencies in Eskimos of East Greenland. Eur. J. Immunogenet. 2000; 27(2): 93-7.

46. Leffell M.S., Fallin M.D., Erlich H.A., Fernandez-Vina M., Hildebrand W.H. et al. HLA antigens, alleles and haplotypes among the Yup'ik Alaska natives: report of the ASHI Minority Workshops, Part II. Hum. Immunol. 2002; 63(7): 614-25.

47. Hoppe B., Salama A. Sequencing-based typing of HLA. Meth. Mol. Med. 2007; 134: 71-80.

48. Kotsch K., Wehling J., Blasczyk R. Sequencing of HLA class II genes based on the conserved diversity of the non-coding regions: sequencing based typing of HLA-DRB genes. Tissue Antigens. 1999; 53: 486-97.

49. Sayer D., Whidborne R., Brestovac B., Trimboli F., Witt C. et al. HLA-DRB1 DNA sequencing based typing: an approach suitable for high throughput typing including unrelated bone marrow registry donors. Tissue Antigens. 2001; 57: 46-54.

50. Dunn P.P., Day S., Williams S., Bendukidze N. DNA sequencing as a tissue-typing tool. Meth. Mol. Med. 2004; 91: 233-46.

51. Voorter C.E., van den Berg-Loonen E.M. Sequence-based typing of the complete coding sequence of DQA1 and phenotype

frequencies in the Dutch Caucasian population. Hum. Immunol. 2006; 67: 756-63.

52. Rajalingam R., Ge P., Reed E.F. A sequencing-based typing method for HLA-DQA1 alleles. Hum. Immunol. 2004; 65: 373-9.

53. Dunn P.P., Day S., Williams S., Bendukidze N. HLA-DQB1 sequencing-based typing using newly identified conserved nucleotide sequences in introns 1 and 2. Tissue Antigens. 2005; 66: 99-106.

54. Kruskal J.B. Nonmetric multidimensional scaling: a numerical method. Psychometrika. 1964; 29: 115-29.

55. Johansson A., Ingman M., Mack S.J., Erlich H., Gyllensten U. Genetic origin of the Swedish Sami inferred from HLA class I and class II allele frequencies. Eur. J. Hum. Genet. 2008; 16(11): 1341-9.

56. Marsh S.G.E., Albert E.D., Bodmer W.F. et al. Nomenclature for factors of the HLA system, 2010. Tissue Antigens. 2010; 75: 291-455.

57. Kuranov A.B., Mukhamedyarov D.A., Momynaliev K.T. Identification of new HLA-DRB1 alleles in Kazakh individuals. Tissue Antigens. 2011; 77(3): 263-4.

58. Acland A., Agarwala R., Barrett T. et al. Database resources of the National Center for Biotechnology Information. Nucleic Acids Res. 2014; 42: 7-17.

59. Jinam T.A., Saitou N., Edo J., Mahmood A., Phipps M.E. Molecular analysis of HLA Class I and Class II genes in four indigenous Malaysian populations. Tissue Antigens. 2010; 75 (2): 151-8.

60. Boldyreva M.N. HLA (class II) and Natural Selection. "Functional" Genotype Hypothesis and Advantages of "Functional" Heterozygosity. [HLA (klass II) i estestvennyy ot-bor. "Funktsional'nyy" genotip, gipoteza, preimushchestva "funktsional'noy" geterozigotnosti]: Diss. Moscow; 2007. (in Russian)

61. Berezina G. M., Svyatova G. S., Makhmutova Zh. "The analysis of the genetic structure of the Kazakh population as estimated from mitochondrial DNA polymorphism. Med. Hlth Sci. J. (MHSJ). 2011; 6: 2-6.

62. Balanovsky O., Rootsi S., Pshenichnov A., Kivisild T., Churn-osov M. et al. Two sources of the Russian patrilineal heritage in their Eurasian context. Am. J. Hum. Genet. 2008; 82: 236-50.

63. Dulik M.C., Osipova L.P., Schurr T.G. Y-chromosome variation in Altaian kazakhs reveals a common paternal gene pool for Kazakhs and the influence of mongolian expansions. PLoS One. 2011; 6: e17548.

64. Derenko M.V., Malyarchuk B.A., Voznyak M., Denisova G.A., Dambueva I.K. et al. Distribution of Genghis Khan descendants of male lineage in the northern Eurasian populations. Genetika. 2007; 43 (3): 422-6. (in Russian)

65. Derenko M., Malyarchuk B., Grzybowski T., Denisova G., Rogalla U. et al. Origin and post-glacial dispersal of mitochondrial DNA haplogroups C and D in northern Asia. PLoS One. 2010; 5(12): e15214.

66. Alexeev L.P. Petranji G. HLA in eight ethnic groups from the former USSR. In: Proceedings of the 11-th International Histo-compability Workshop and Conference .Oxford: Oxford University Press; 1991; vol. 1: 666- 73.

67. Chen R.B., Ye G.Y., Geng Z.C. et al. HLA polymorphism of the principal minority nationalities in mainland China. In: Tsuji K., Aizawa M., Sasazuki T., eds. HLA 1991: Proceedings of the 11th International Histocompatibility Workshop Conference. Oxford: Oxford University Press: 1992; vol 1: 676-9.

68. Shen C.M., Zhu B.F., Deng Y.J., Ye S.H., Yan J.W. et al. Allele polymorphism and haplotype diversity of HLA-A, -B and -DRB1 loci in sequence-based typing for Chinese Uyghur ethnic group. PLoS One. 2010; 5(11): e13458.

Received 05.10.14

КЛЕТОЧНАЯ ИММУНОЛОГИЯ

© ЖЕРЕБЯТЬЕБ а. с., КАМЫШНЫЙ А. М., 2015 УДК 616.34-002-018.1-092:612.017.1]-085.275.4-092.9

Жеребятьев А. С., Камышный А. М.

транскрипционные РЕГУЛЯТОРЫ ДИФФЕРЕНЦИРОБКИ Т-ЛИМФОЦИТОБ и паттерн-распознающие рецепторы — экспрессия ЛИМФОЦИТАМИ кишечника при оксазолоновом колите у крыс и после ВВЕДЕНИЯ

ИНГИБИТОРА 3-ГИДРОКсИ-3-МЕТИЛГЛУТАРИЛ КОЭНЗИМ А-РЕДУКТАЗЫ И антагониста РЕЦЕПТОРОВ ИНТЕРЛЕЙКИНА-1

Запорожский государственный медицинский университет, 69035, Запорожье, Украина

Мы изучили возможность применения симвастатина и антагониста рецепторов интерлейкина-1 (АРИЛ-1)для коррекции экспериментального колита у крыс с акцентом на исследование экспрессии TLR2, TLR4, NOD2, RIG-I и транскрипционных факторов T-bet, GATA-3, RORyt и Foxp3 лимфоцитами толстой кишки. Иммунопозитив-ные лимфоциты были идентифицированы с помощью метода прямой и непрямой иммунофлюоресценции с использованием моноклональных антител крысы. Симвастатин и АРИЛ-1 благоприятно влияют на исход и течение оксазолониндуцированного колита через модулирование экспрессии образраспознающих рецепторов на лимфоцитах и баланса между различными субпопуляциями Т-хелперов толстой кишки.

Ключевые слова: копит; образраспознающие рецепторы; антагонист рецепторов интерлейкина-1 (АРИЛ-1); симвастатин.

Для цитирования: Иммунология. 2015; 36(3): 139-144.

Для корреспонденции: Жеребятьев Александр Сергеевич, Gerya2009@yandex.ru For correspondence: Zherebiatiev Aleksandr Sergeevich, Gerya2009@yandex.ru

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.