Научная статья на тему 'Гены HLA II класса DRB1 и DQB1 у доноров регистра гемопоэтических стволовых клеток г. Ростова-на-Дону'

Гены HLA II класса DRB1 и DQB1 у доноров регистра гемопоэтических стволовых клеток г. Ростова-на-Дону Текст научной статьи по специальности «Фундаментальная медицина»

CC BY
118
21
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
Ключевые слова
Гены HLA II класса / гаплотипы / популяция / доноры ГСК / HLA class II genes / haplotypes / population / HSС donors

Аннотация научной статьи по фундаментальной медицине, автор научной работы — Ищенкова И. В., Кудинова Э. Е., Савченко О. А., Труфанова Т. И., Шатохин Ю. В.

Представлены результаты типирования генов HLA II класса DRB1, DQB1 у 694 доноров ГСК г. Ростова-на-Дону, считающих себя русскими. Рассмотрено распределение частоты аллельных семейств, двухлокусных гаплотипов, неравновесного сцепления DRB1, DQB1-генов. В ростовской популяции с высокой частотой встречались аллельные семейства гена HLA DRB1*11; HLA DRB1* 15; HLA DRB1*07; HLA DRB1*13; HLA DRB1*03; HLA DRB1*01; с низкой частотой встречались аллельные семейства DRB1*09, DRB1*12. В локусе DQB1 наиболее часто встречались HLA DQB1*02, DQB1*03, DQB1*06. Представлены результаты сравнения частоты аллельных семейств ростовской популяции с русскими популяциями России, и с популяциями других народов. Данный тип распределения генных частот позволяет отнести ростовскую популяцию к европеоидам. Отмечены особенности частоты аллельных семейств DRB1*01, DRB1*11 в ростовской популяции по сравнению с русскими жителями Европейских регионов России.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по фундаментальной медицине , автор научной работы — Ищенкова И. В., Кудинова Э. Е., Савченко О. А., Труфанова Т. И., Шатохин Ю. В.

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

HLA II CLASS DRB1 AND DQB1 GENES OF DONORS OF THE REGISTER OF HEMATOPOIETIC STEM CELLS OF THE ROSTOV-ON-DON

The results of typing of genes HLA II class DRB1, DQB1 of 694 donors of the HSC of Rostov-on-Don, who consider themselves to be Russian, are presented. The frequency distribution of allelic families, bipolar haplotypes, nonequilibrium cohesion of DRB1, DQB1-genes is considered. In Rostov population with a high frequency met allelic gene family DRB1 11; HLA DRB1 15; HLA DRB1 07; HLA DRB1 13; HLA DRB1 03; HLA DRB1 01. With a low frequency there were allelic families DRB1 09, DRB1 12. At the locus DQB1 the most frequently encountered HLA DQB1 02, DQB1 03, DQB1 06. The results of comparison of the frequency of allelic families of the Rostov population with Russian populations of Russia, and with populations of other nations are presented. This type of distribution of gene frequencies allows us to refer the Rostov population to Caucasoids. The peculiarities of the frequency of the allelic families DRB1 01, DRB1 11 in the Rostov population are compared with the Russian inhabitants of the European regions of Russia.

Текст научной работы на тему «Гены HLA II класса DRB1 и DQB1 у доноров регистра гемопоэтических стволовых клеток г. Ростова-на-Дону»

Ищенкова И. В.1, Кудинова Э. Е.1, Савченко О. А.1, Труфанова Т. И.1, Шатохин Ю. В.2, Рябикина Е. В.2, Снежко И. В.2, Алавердян А. И.2

1 Государственное бюджетное учреждение Ростовской области «Станция переливания крови»

2 Федеральное государственное бюджетное учреждение высшего образования «Ростовский государственный медицинский университет» Министерства здравоохранения Российской федерации

ГЕНЫ HLA II КЛАССА DRB1 И DQB1 У ДОНОРОВ РЕГИСТРА ГЕМОПОЭТИЧЕСКИХ СТВОЛОВЫХ КЛЕТОК Г. РОСТОВА-НА-ДОНУ

Ishenkova I. V.1, Kudinova E. E.1, Savchenko O. A.1, Trufanova T. I.1, Shatokhin Y. V.2, Ryabikina E. V.2, Snezhko I. V.2, Alaverdyan A. I.

1 State budgetary institution of the Rostov region «Blood transfusion station»

2 Federal State Budgetary Education Institution of Higher professional education «Rostov state medical University» of the Ministry of Healthcare of the Russian Federation,

HLA II CLASS DRB1 AND DQB1 GENES OF DONORS OF THE REGISTER OF HEMATOPOIETIC STEM CELLS OF THE ROSTOV-ON-DON

Резюме. Представлены результаты типи-рования генов ИЬЛ II класса ОЯБ1, DQB1 у 694 доноров ГСК г. Ростова-на-Дону, считающих себя русскими. Рассмотрено распределение частоты аллельных семейств, двухлокусных гаплотипов, неравновесного сцепления DRB1, DQB1-генов. В ростовской популяции с высокой частотой встречались аллельные семейства гена ИЬЛ DRB1*11; ИЬЛ DRB1* 15; ИЬЛ DRB1*07; ИЬЛ DRB1*13; ИЬЛ DRB1*03; ИЬЛ DRB1*01; с низкой частотой встречались ал-лельные семейства DRB1*09, DRB1*12. В ло-кусе DQB1 наиболее часто встречались ИЬЛ DQB1*02, DQB1*03, DQB1*06. Представлены результаты сравнения частоты аллельных семейств ростовской популяции с русскими популяциями России, и с популяциями других народов.

Данный тип распределения генных частот позволяет отнести ростовскую популяцию к европеоидам. Отмечены особенности частоты аллельных семейств DRB1*01, DRB1*11 в ростовской популяции по сравнению с русскими жителями Европейских регионов России.

Ключевые слова. Гены ИЬЛ II класса, га-плотипы, популяция, доноры ГСК.

Abstract. The results of typing of genes HLA II class DRB1, DQB1 of 694 donors of the HSC of Rostov-on-Don, who consider themselves to be Russian, are presented. The frequency distribution of allelic families, bipolar haplotypes, nonequilibrium cohesion of DRB1, DQB1-genes is considered. In Rostov population with a high frequency met allelic gene family DRB1x11; HLA DRB1x15; HLA DRB1x07; HLA DRB1x13; HLA DRB1x03; HLA DRB1x01. With a low frequency there were allelic families DRB1x09, DRB1x 12. At the locus DQB1 the most frequently encountered HLA DQB1x02, DQB1x03, DQB1x06. The results of comparison of the frequency of allelic families of the Rostov population with Russian populations of Russia, and with populations of other nations are presented.

This type of distribution of gene frequencies allows us to refer the Rostov population to Caucasoids. The peculiarities of the frequency of the allelic families DRB1x01, DRB1x11 in the Rostov population are compared with the Russian inhabitants of the European regions of Russia.

Key words. HLA class II genes, haplotypes, population, HSC donors.

Введение. На данный момент система HLA (Human Leukocyte Antigens) является самой изученной и самой полиморфной системой генома человека. Гены системы HLA представлены двумя основными классами: класс HLA I (гены HLA-A,— B,— C) и класс HLA II (гены HLA-DRB1, DQA1, DQB1). Гены, соответственно, кодируют молекулы класса I, которые экспрессируются на поверхности всех ядросодержащих клеток, а молекулы класса II находятся на макрофагах, активированных Т-лимфоцитах и В-лимфоцитах.

С момента появления молекулярно-гене-тических методов типирования появилась возможность получать о системе HLA информацию более высокого уровня, особенно для генов HLA II класса. Была доказана неоспоримая роль генов HLA II класса в иммунном ответе и определена их причастность к ассоциативной предрасположенности или устойчивости к некоторым видам патологии (например, сахарный диабет I типа).

Необычайный полиморфизм генов системы HLA определяется не только большим количеством аллельных семейств, но и существованием множественных аллелей (альтернативных вариантов) в каждом семействе.

Кроме того, специфичности HLA, являясь генами иммунного ответа, по-разному представлены в расах и имеют разную частоту, характерную для определенной этнической группы. То есть, популяционный полиморфизм носит выраженный межрасовый и межэтнический характер.

Согласно проведенным исследованиям, частота аллельных семейств и вариантов аллелей генов HLA в разных популяциях, даже одного этноса, имеет различия. Поэтому изучение HLA-профиля здорового населения популяций в пределах одной страны, в ее регионах и в разных странах мира является важным для практической медицины, и прежде всего, для целенаправленного поиска донора для неродственной аллогенной трансплантации костного мозга, для выявления маркеров предрасположенности или резистентности к различным заболеваниям, что в свою очередь может оказать помощь в диагностике.

Знание HLA-профиля позволяет определять генетические расстояния между любыми популяциями мира, а это важная информация для этнологии.

Удобной контрольной группой для анализа HLA-профиля популяции могут быть доноры

крови, давшие согласие быть донорами ГСК, с учетом их этнической принадлежности. Эта контрольная группа представляет собой здоровую часть исследуемой популяции, ти-пирована по генам системы ИЬЛ I и II класса и полностью отражает ее структуру и имму-ногенетические характеристики [1,2,3,14].

Россия — пока еще не полностью исследованный по распределению генов ИЬЛ регион мира, но к настоящему времени изучено по-пуляционное разнообразие русских и других народов, проживающих в различных регионах России и ближнего зарубежья. В Ростовской области, расположенной на юге европейской части России, исследование генов ИЬЛ II класса не проводилось.

Первую половину XVI века считают временем возникновения донского казачества. С этого момента, после Золотой Орды, началось заселение низовьев Дона и Приазовья, которые находились за пределами основной государственной территории, за линией сторожевых укреплений. Заселяли новые земли в основном великорусские беглые крестьяне, которые стремились уйти от усиливающегося гнета и обрести экономическую и социальную свободу. В конце XVI и в XVII веке число беглых на Дон увеличилось. В основном бежали из Воронежской, Тамбовской, Рязанской и других губерний, кроме того переселялись татары, поляки, литовцы, запорожские казаки, калмыки. Донское казачество формировалось с XVI в основном из русских и украинцев. В конце XVIII в. произошло массовое переселение на Дон армян и греков [9,10].

Согласно Всероссийской переписи населения 2010 г. в г. Ростове-на-Дону проживают: русские 89,35%, армяне — 3,4%, украинцы — 1,5 %, азербайджанцы — 0,6 %, татары — 0,5 %, грузины — 0,4 %, белорусы — 0,3 %, евреи — 0,2 %. Кроме того, большие этнические группы представляют греки, чеченцы, турки, корейцы, молдаване, цыгане, удмурты и другие. 2005 человек из русских жителей г. Ростова относят себя к коренному населению — казакам.

Цель исследования. Установить распределение генов ИЬЛ II класса ОЯБ1* и DQB1* у доноров ГСК г. Ростова-на-Дону, проживающих в Южном федеральном округе и считающих себя русскими в 3 поколении. Провести сравнительный анализ с аналогичными исследованиями в популяциях русских и других народов, проживающих в различных регионах России и за рубежом.

Материалы и методы. Исследование проводили в Государственном бюджетном учреждении Ростовской области «Станция переливания крови» в Зональной лаборатории иммунологического типирования тканей.

На оборудовании и расходных материалах, предоставленных нам благотворительным фондом «Русфонд», в 2015-2017 гг. было проведено дНК-типирование 694 доноров крови, давших согласие быть донорами ГСК. Это — случайные, здоровые люди, считающие себя русскими, в возрасте от 18 до 42 лет. Из них— 358 — мужчины и 336 — женщины.

Геномную ДНК выделяли из венозной крови доноров (колоночным методом) реагентами «Protrans» (DNA Box 500). Молекуляр-но-генетическое типирование (базовое разрешение) проводили полимеразной цепной реакцией набором сиквенс-специфических праймеров (PCR-SSP). Детекцию проводили в 2 % агарозном геле с использованием электрофореза. Все исследования выполняли стандартными реактивами фирмы «Protrans» (Германия) по протоколу производителя.

Расчет основных иммуногенетических показателей: частоты (gf) 13 специфичностей гена HLA DRB1* и 5 специфичностей гена HLA DQB1*, частоты (HF) двухлокусных гаплоти-пов HLA DRB1* — HLA DQB1*, величины не-

равновесного сцепления (Б1) был проведен с использованием компьютерной программы Арлекин, версия 3.5.

Неравновесное сцепление (Б) или неслучайная ассоциация между аллелями разных локусов — величина, показывающая, реже или чаще встречается комбинация генов на хромосоме [3].

Достоверность различий между сравниваемыми группами оценивали с помощью критерия х2 (имелась возможность сравнить наши результаты с популяцией русских Челябинской области [7] и популяцией удмуртов северо-востока России [18]).

Полученные нами результаты сравнивали с данными литературы, анализируя следующие популяции: русские — жители Архангельской, Вологодской, Костромской, Смоленской и Челябинской областей; Астрахани, Москвы, Санкт-Петербурга [4,8,12,15]; белорусы [5]; украинцы [5]; армяне [5]; гагаузы [5]; курды [17]; татары [5,7,13]; калмыки [5]; казахи [6,14]; башкиры [7,11,16]; буряты [б]; саамы [6]; удмурты [5,16,18].

Результаты и обсуждение. Результаты ДНК-типирования генов ИЬЛ II класса БЯБ1 и DQB1 у доноров регистра ГСК г. Ростова-на-Дону, считающих себя русскими, представлены в таблице 1.

Таблица 1

Частота генов HLA DRB1* и HLA DQB1*у русских г. Ростова-на-Дону

Аллельное семейство'1 Кол-во b Частота аллеля (pf) Частота гена (gf) SE для (gf) c Гом d

DRB1*01 136 0,196 0,106 0,008 11

DRB1*03 105 0,151 0,081 0,007 7

DRB1*04 139 0,200 0,103 0,008 4

DRB1*07 170 0,245 0,132 0,009 13

DRB1*08 38 0,055 0,027 0,004 0

DRB1*09 13 0,019 0,009 0,003 0

DRB1*10 13 0,019 0,009 0,003 0

DRB1*11 198 0,285 0,159 0,01 22

DRB1*12 24 0,035 0,017 0,004 0

DRB1*13 169 0,244 0,131 0,009 13

DRB1*14 23 0,033 0,017 0,003 0

DRB1*15 182 0,262 0,142 0,009 15

DRB1*16 89 0,128 0,067 0,007 4

DQB1*02 225 0,324 0,178 0,010 22

DQB1*03 393 0,566 0,354 0,013 98

DQB1*04 37 0,053 0,027 0,004 1

DQB1*05 250 0,360 0,203 0,011 32

DQB1*06 283 0,408 0,238 0,011 47

ь — Количество положительных индивидуумов.

с — Стандартная ошибка (SE) для частоты гена

а — Количество обнаруженных гомозиготных индивидуумов.

С высокой частотой в ростовской популяции встречались аллельные семейства гена ИЬД 0ЯБ1*11(0,159), 0ЯБ1*15(0,142), 0КБ1*07(0,132), ОЯБ1*13(0,131),

ОЯБ1*01(0,106), 0КБ1*04(0,103).

С одинаковой частотой и редко встречались аллельные семейства ИЬД 0ЯБ1*09 и 0ЯБ1*10 (0,009), ОЯБ1*12 и 0ЯБ1*14(0,017); также снижена частота ИЬД 0ЯБ1*08 (0,027).

Так, частота ОЯБ1*11 в г.Ростове (0,159) оказалась значительно выше, чем в других популяциях русских. Например, по сравнению с жителями Челябинской области она достоверно выше (0,119; х2 - 36,5; р<0,01). И только в Смоленской области частота ОЯБ1*11 (0,173) выше, чем в г.Ростове. Мы предполагаем, что высокая частота ОЯБ1*11 у русских жителей Ростовской области может быть обусловлена влиянием средиземноморских популяций, у которых частота ОЯБ1*11 максимальна [5, 17].

Аллельное семейство 0ЯБ1*01 в ростовской популяции (0,106) имеет тенденцию к снижению по сравнению с другими популяциями русских. Его частота достоверно ниже, чем в Челябинской области (0,128; х2-9,2; р<0,05), однако, она выше, чем в г. Астрахани (0,079) и Смоленской области (0,064). 0ЯБ1*01 наиболее характерен для популяций финоугорской языковой семьи (саамов,

Частота специфичностей гена ИЬД ОЯБ1* у русских г. Ростова оказалась сопоставимой с его частотой в 8 популяциях русских (горожан и жителей областей) из разных регионов России (таблица 2). Однако, в ростовской популяции имеются особенности в частоте распределения некоторых аллельных семейств гена ОЯБ1*.

Таблица 2

мари, удмуртов), а также для популяций вол-го-уральского региона [5, 16, 18].

ЬЯБ1*07 встречается с частотой 0,132 так же как у восточно-славянских народов (русские, украинцы, белорусы), но ниже, чем у тюркских народов России (удмуртов, башкир [5, 6, 16, 18]).

Частота ОЯБ1*16 в популяции г. Ростова одинакова с таковой в г. Москве (0,067), но несколько выше, чем в остальных сравниваемых популяциях, и достоверно выше, чем в челябинской популяции русских (0,040; х2 - 37,6, р<0,01).

Кроме того, отмечается повышение частоты ОЯБ1*15 в Архангельской, Смоленской областях и г.Астрахани (0,197; 0,154; 0,159, соответственно); по сравнению с г. Ростовом (0,142).

Высокая частота специфичностей ИЬД-БЯБ1*01, 0ЯБ1*03, 0ЯБ1*07, БЯБ1*11, ОЯБ1*13, ОЯБ1*15, и низкая —ИЬД-0ЯБ1*09,

Частота гена HLA DRB1 у русских г. Ростова-на-Дону и в популяциях русских различных регионов России

Аллельные семейства Частота гена DBR1*

г. Ростов (п-694) г. Астрахань (п-81) г. Москва (п-300) г. Санкт-Петербург (п-200) Челябинская область (п-591) Архангельская область (п-82) Вологодская область (п-121) Костромская область (п-126) Смоленская область (п-156)

йКВ1*01 0,106 0,079 0,095 0,122 0,128 0,130 0,124 0,174 0,064

йКВ1*03 0,081 0,061 0,075 0,095 0,099 0,093 0,074 0,123 0,093

йКВ1*04 0,103 0,091 0,115 0,142 0,106 0,166 0,141 0,119 0,103

йКВ1*07 0,132 0,165 0,143 0,120 0,135 0,123 0,149 0,142 0,173

йКВ1*08 0,027 0,024 0,018 0,038 0,023 0,037 0,054 0,040 0,032

йКВ1*09 0,009 0,030 0,007 0,012 0,016 0,031 0,025 0,008 0,006

йКВ1*10 0,009 0,019 0,013 0,010 0,011 0,012 0,004 0,012 0,006

йКВ1*11 0,159 0,146 0,142 0,110 0,119 0,056 0,095 0,060 0,173

йКВ1*12 0,017 0,006 0,028 0,028 0,025 0,025 0,012 0,020 0,023

йКВ1*13 0,131 0,201 0,142 0,125 0,145 0,099 0,149 0,120 0,106

йКВ1*14 0,017 0,000 0,023 0,024 0,014 0,012 0,012 0,016 0,032

йКВ1*15 0,142 0,159 0,132 0,132 0,140 0,197 0,144 0,138 0,154

йКВ1*16 0,067 0,019 0,067 0,043 0,040 0,019 0,017 0,028 0,035

БЯБ1*12 у русских жителей г.Ростова — типичный западноевропейский вариант частоты гена ИЬЛ БЯБ1* европеоидной расы, что позволяет отнести ростовскую популяцию к европеоидам.

Основным этносом Ростовской области являются русские, однако, ее относят к полиэтническому региону, учитывая ее историю заселения и географическое положение. Поэтому мы провели сравнение частоты генов ИЬЛ

Сравнительный анализ показал, что частота ИЬЛ БЯБ1* гена в г. Ростове сопоставима с его частотой в популяциях украинцев и белорусов. Однако аллельное семейство БЯБ1*11 в ростовской популяции ^-0,159) встречается реже по сравнению с двумя популяциями украинцев ^ - 0,185). Чаще, по сравнению с украинцами, встречается

II класса русских г. Ростова с ИЬЛ-профилями популяций этнических групп, проживающих в административном центре области, согласно последней переписи населения. В литературных источниках мы нашли результаты популяционных исследований по ряду групп, важных для сравнения. Прежде всего — это жители Восточной Европы — украинцы и белорусы (таблица 3).

Таблица 3

БЯБ1*15(0,142 и 0,098, 0,101, соответственно).

Полученные нами данные по частоте гена БЯБ1*, мы сравнили с его распределением в популяциях армян, гагаузов (самоопределившиеся жители Молдовы), курдов, татар, удмуртов и калмыков (таблица 4).

Таблица 4

Частота гена ИЬА йЯБ1*у русских и в этнических группах, проживающих в г. Ростове-на-Дону

Аллельные семейства Частота гена ИЬА РРБ1*

г. Ростов (п-694) Армяне (п-83) Гагаузы (п-225) Курды (п-209) Татары (п-87) Удмурты (п-101) Калмыки (п-136)

йКВ1*01 0,106 0,066 0,122 0,043 0,069 0,124 0,051

йКВ1*03 0,081 0,066 0,123 0,150 0,086 0,054 0,125

йКВ1*04 0,103 0,204 0,073 0,126 0,074 0,045 0,136

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

йКВ1*07 0,132 0,090 0,082 0,078 0,241 0,322 0,103

йКВ1*08 0,027 0 0,016 0,016 0,012 0,035 0,051

йКВ1*09 0,009 0 0,011 0,012 0,006 0,040 0,051

йКВ1*10 0,009 0,042 0,016 0,019 0,029 0 0,023

йКВ1*11 0,159 0,229 0,240 0,260 0,052 0,099 0,077

йКВ1*12 0,017 0,025 0,007 — 0,012 0,025 0,092

Частота гена ИЬА йЯБ1 у русских г. Ростова и в популяциях украинцев и белорусов

Аллельные семейства Частота гена ИЬА РРБ1*

г. Ростов (п-694) УКРАИНЦЫ БЕЛОРУСЫ

Львовская область (п-102) Хмельницкая область (п-70) Витебская область (с) (п-70) Брестская область (ю-з) (п-105) Гомельская область (ю-с) (п-100)

йКВ1*01 0,106 0,123 0,098 0,100 0,105 0,129

йКВ1*03 0,081 0,078 0,054 0,070 0,090 0,107

йКВ1*04 0,103 0,113 0,112 0,075 0,128 0,100

йКВ1*07 0,132 0,152 0,145 0,105 0,105 0,107

йКВ1*08 0,027 0,039 0,036 0,055 0,029 0,036

йКВ1*09 0,009 0,015 0,004 0 0,019 0

йКВ1*10 0,009 0 0,011 0 0,005 0,007

йКВ1*11 0,159 0,185 0,185 0,150 0,133 0,157

йКВ1*12 0,017 0,010 0,022 0,040 0,038 0,007

йКВ1*13 0,131 0,108 0,123 0,165 0,119 0,100

йКВ1*14 0,017 0,020 0,022 0,010 0,029 0,050

йКВ1*15 0,142 0,098 0,101 0,185 0,133 0,121

йКВ1*16 0,067 0,059 0,087 0,045 0,067 0,079

Продолжение таблицы

Аллельные семейства Частота гена HLA DRB1*

г. Ростов (п-694) Армяне (п-83) Гагаузы (п-225) Курды (п-209) Татары (п-87) Удмурты (п-101) Калмыки (п-136)

йКВ1*13 0,131 0,055 0,071 0,096 0,190 0,090 0,136

йКВ1*14 0,017 0,054 0,060 0,064 0,028 0,010 0,055

йКВ1*15 0,142 0,103 0,053 0,110 0,155 0,159 0,092

йКВ1*16 0,067 0,036 0,126 0,026 0,046 0 0,008

Оказалось, что частота 0ЯБ1*11 в популяциях армян (0,229), гагаузов (0,240), курдов (0,260) была значительно выше по сравнению с русскими жителями г. Ростова (0,159), а у татар, удмуртов и калмыков (0,052, 0,099, 0,077) она была значительно снижена. Частота аллельного семейства 0ЯБ1*01 у армян и калмыков (0,066;0,051 соответственно)

Частота гена HLA DQB1*у русских г. 1

оказалась ниже, чем в ростовской популяции (0,106).

Распределение частоты гена ИЬЛ DQБ1* у русских г. Ростова, г. Санкт-Петербурга, Челябинской области и в популяциях народов, этнические группы которых длительно проживают на Дону, представлены в таблице 5.

Таблица 5

стова и в популяциях других этносов

Аллельное семейство Частота гена DQB1

Ростов-на-Дону (п=694) Санкт-Петербург (п=200) Челябинская область (п=591) Удмурты (п=101) Курды Ирана (п=110) Казахи (п=157) Саамы (п=107)

0ЦВ1*02 0,178 0,175 0,201 0,326 0,222 0,238 0,111

0ЦВ1*03 0,354 0,36 0,334 0,278 0,425 0,394 0,513

0ЦВ1*04 0,027 0,04 0,022 0,015 0,009 0,032 0,049

0ЦВ1*05 0,203 0,22 0,196 0,133 0,174 0,191 0,179

0ЦВ1*06 0,238 0,205 0,247 0,248 0,167 0,144 0,155

Результаты типирования показывают, что в ростовской популяции чаще встречаются аллельные семейства гена DQБ1*03 ^ -0,354) и значительно реже DQБ1*04 ^ -0,027).

Анализ сравнения частоты гена DQБ1* русских г. Ростова с русскими г. Санкт-Петербурга и Челябинской области показал, что частота гена сопоставима во всех трех популяциях (особенно близка к популяции г. Санкт-Петербурга): чаще встречаются специфичности DQБ1*03, реже — DQB1*04. Частота DQБ1*02 оказалась почти одинаковой в городах Ростове (0,178) и Санкт-Петербурге (0,175), но была достоверно снижена по сравнению с русскими Челябинской области (0,201; х2-10,76; р<0,05) и была выше, чем у саамов (0,111).

В заключение можно отметить, что имму-ногенетическая структура популяции г. Ростова, состоящая из доноров регистра ГСК,

считающих себя русскими, характеризует ее как европеоидную популяцию. Это предположение подтверждается совпадением ее характеристик с популяциями русских, проживающих в Европейских регионах России, а также белорусов и украинцев.

Некоторые особенности в распределении частоты гена DRB1* могут быть объяснены историей заселения Дона, постоянной близостью проживания и контактами с другими большими этническими группами г. Ростова. Можно предположить, что повышенная частота DRB1*11 в ростовской популяции (0,159), по сравнению с русскими, проживающими в других регионах России, оказалась таковой из-за возможного влияния популяций украинцев, армян, гагаузов, курдов, имеющих повышенную частоту этой специфичности (0,185; 0,229; 0,240; 0,260 —соответственно).

В ростовской популяции отмечено некоторое снижение частоты DRB1*01 (0,106)

по сравнение с другими популяциями русских (0,122-0,174). Возможно, это — следствие сниженного контакта с финскими этническими группами и влияния этносов с низкой частотой данной специфичности, длительно проживающих на Дону — армян (0,066) и калмыков (0,051).

Частота гаплотипов в популяциях русских г. Ростова-

В таблице 6 представлены данные по частоте гаплотипов и величине неравновесного сцепления (Б') двухлокусных гаплотипов БЯБ1* - DQБ1* (встречающихся с частотой 0,009 и выше у русских г. Ростова) и, для сравнения, у русских Челябинской области.

Таблица 6

ИЬА БЯБ1*- ИЬА йдБ1* на-Дону и Челябинской области

г. Ростов-на-Дону Челябинская область

Гаплотип +/+ Частота Частота, % Р' +/+ Частота, % Р'

ЭКВ1*01 ЭЦВ1*05 145 0,104 10,4 1 149 12,61 0,98

ЭКВ1*03 ЭЦВ1*02 107 0,077 7,7 0,95 114 9,64 0,97

ЭКВ1*04 ЭЦВ1*03 134 0,097 9,7 0,9 122 10,32 0,96

ЭКВ1*07 ЭЦВ1*02 133 0,096 9,6 0,67 120 10,15 0,69

ЭКВ1*08 ЭЦВ1*04 33 0,024 2,4 0,86 25 2,12 0,96

ЭКВ1*09 ЭЦВ1*03 13 0,009 0,9 1 19 1,61 1

ЭКВ1*10 ЭЦВ1*05 12 0,009 0,9 0,9 13 1,1 1

ЭКВ1*11 ЭЦВ1*03 214 0,154 15,4 0,96 140 11,84 0,99

ЭКВ1*12 ЭЦВ1*03 22 0,016 1,6 0,87 29 2,45 1

ЭКВ1*13 ЭЦВ1*06 130 0,094 9,4 0,63 129 10,91 0,67

ЭКВ1*14 ЭЦВ1*05 22 0,016 1,6 0,95 17 1,44 1

ЭКВ1*15 ЭЦВ1*06 186 0,134 13,4 0,93 160 13,54 0,95

ЭКВ1*16 ЭЦВ1*05 88 0,063 6,3 0,93 47 3,98 1

Наиболее характерными для ростовской популяции являются гаплотипы:

ЭКВ1*11 — ЭЦВ1*03 (ИР-0,154; Э' — 0,96),

ЭКВ1*15 — ЭЦВ1*06 (ИР - 0,134; Э' — 0,93),

ЭКВ1*01 — ЭЦВ1*05 (ИР - 0,104; Э' — 1,0),

ЭКВ1*04 — ЭЦВ1*03 (ИР - 0,097; Э' — 0,9).

Анализ двухлокусных гаплотипов популяций русских г. Ростова и Челябинской области [8], не выявил различий по частоте неравновесного сцепления, обе популяции имели высокую частоту (Б'>0,9 - 1,0).

Отмечено незначительное отклонение в частоте гаплотипа DRБ1*11-DQБ1*03. В ростовской популяции он встречался несколько чаще (15,4%) чем в челябинской области (11,84%).

Результаты межпопуляционного анализа иммуногенетических характеристик генов ИЬЛ II класса русских г. Ростова-на-Дону подтвердили сходство с анализируемыми популяциями русских в других регионах России.

Выводы:

1. Установлена частота распределения генов ИЬЛ II класса DRB1*, DQвl*, гаплотипов ИЬЛ DRB1* — DQB1*, величина

их неравновесного сцепления у русских жителей г. Ростова-на-Дону (доноры регистра ГСК).

2. Характер распределения генов ИЬЛ DRB1*, DQB1*, двухлокусных гаплотипов у жителей г. Ростова-на-Дону соответствует аналогичным данным для лиц европейской расы, и это позволяет отнести ростовскую популяцию к европеоидам.

3. Полученные данные могут быть использованы для успешного поиска неродственных доноров костного мозга и в качестве контрольной группы в научных исследованиях по теме «ИЬЛ и болезни», в этнологии для определения генетического родства между популяциями.

ЛИТЕРАТУРА

1. Хаитов Р. M., Алексеев Л. П., Болдырева M. H., Сароянц Л. В. Полиморфизм генов иммунного ответа и его роль в противоинфекционной защите //Иммунология. 2013. № 3. С. 132 - 143

2. Алексеев Л. П., Дедов И. И., Болдырева M. H. и др. HLA-гены-маркеры инсулинозависимого сахарного диабета, этнические аспекты. //Иммунология. 2003. № S. С. 308 - 311.

3. Зарецкая Ю. M. Циническая иммуногенетика. M. 1983.

4. Болдырева M. H., Алексеев Л. П., Хаитов Р. M. Генетическое разнообразие России и I. Русские. //Иммунология. 200S. № S. С. 260 - 267.

5. Болдырева M. H., Гуськова И.А., Богатова О. В. и др. HLA-генетическое разнообразие населения России и II. бродов европейской части. //Иммунология. 2006. № 4. С. 98 - 102.

6. Болдырева M. H., Гуськова И. А., Богатова О. В. HLA-генетическое разнообразие России и ŒR III ^роды Евразии. //Иммунология. 2006. № 6. С. 324 - 329.

7. Суслова Т. А., Бурмистрова А. Л., Хромова Е. Б. Частота генов HLA-A,— D, DR в популяциях татар Челябинской области в сравнении с другими этносами региона. //Вестник Челябинского государственного университета. 2013. № 7. Биология. Вып. 2. С. 14 - 17.

8. Суслова Т. А., Вавилов M. H., Сташкевич Д. С. «и др.». Иммуногенетический профиль (HLA-A, HLA-B, HLA-C, HLA-DRB1, HLA-DQB1) популяции русских Челябинской области. // Гематология и трансфузиология. 201S. № 3. С. 2S - 3S.

9. Знакомьтесь: народы Дона. Ростов-на-Дону. Изд. АП^ С^Ц ВШ ЮФУ 2009. С. 244.

10. Пронштейн А. П.. История Дона с древнейших времен до Великой Октябрьской Социалистической революции. Издательство Ростовского-на-Дону государственного университета, 196S.

11. БурмистроваА.Л., Девальд И. В., Черешнев В.А. «и др.». Иммуногенетический анализ башкирской этнической группы Южно-Уральского региона и ассоциация генов HLA I и II классов с ревматоидным артритом у башкир //Иммунология. 200S. № 2. С. 68 - 71.

12. ^пустин С. И. Особенности аллельного полиморфизма генов HLA в здоровой популяции Санкт-Петербурга и больных тяжелой апластической анемей. Автореф. дис. ... канд. мед. наук. СПб, 1998.

13. ЧерноваM.С.Иммуногенетический профиль популяций Челябинской области (русские, татары, башкиры, нагайбаки) в структуре мировых популяций. Автореф. дис. ... канд. биолог. наук, Челябинск, 2014.

14. ^рановА. Б.Аллельный полиморфизм генов HLA класса II в казахской популяции и его прогностическое значение при ревматоидном артрите и туберкулезе. Дисс. канд. биолог. наук. Mосква, 201S.

15. Хамаганова Е. Г., ^зьминова Е. П., ЧаповаР.С. и др. HLA-A^/В^/С*/ DRB1*/DQB1* — гены и гаплотипы костного мозга регистра ФГБУ «Гематологический научный центр» Mинздрава России, самоопределившиеся как русские. //Гематология и трансфузиология. 2017. №2. С. 6S-70.

16. Хидятова И. M., Ишмухаметова А. Т., Лукманова Г. И., Хуснутдинова Э. K. «и др.». Полиморфизм гена HLA DRB1 в популяции волго-уральского региона. //Генетика. 2004. №2. С. 267-271.

17. Antonio Arnaiz-Villena, Jose Palacio-Gruber, Ester Muniz et al. Genetic HLA study of Kurds in Iraq, Iran and Tbilisi (Caucasus, Georgia): Relatedness and Medical Implications. Plos ONE (12)1: e0169929. doi: 101371/journal.pone.0169929.

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

18. ПоздееваО.С., БолдыреваM.H., ЯнкевичТ.Э., АлексеевЛ.П.. Гены гистосовместимости II класса в популяции удмуртов. //Иммунология. 2014. № 2. С. 60 - 63.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.