Научная статья на тему 'ГЕННО-ИНЖЕНЕРНАЯ КОНСТРУКЦИЯ ДЛЯ ЗАМЕЩЕНИЯ ГЕНА WAP МЫШИ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬЮ КДНК ЛАКТОФЕРРИНА ЧЕЛОВЕКА МЕТОДОМ HDR С ПРИМЕНЕНИЕМ СИСТЕМЫ CRISPR / CAS9'

ГЕННО-ИНЖЕНЕРНАЯ КОНСТРУКЦИЯ ДЛЯ ЗАМЕЩЕНИЯ ГЕНА WAP МЫШИ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬЮ КДНК ЛАКТОФЕРРИНА ЧЕЛОВЕКА МЕТОДОМ HDR С ПРИМЕНЕНИЕМ СИСТЕМЫ CRISPR / CAS9 Текст научной статьи по специальности «Агробиотехнологии»

CC BY
86
14
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
Ключевые слова
ГЕННО-ИНЖЕНЕРНАЯ КОНСТРУКЦИЯ / ПЛАЗМИДЫ / PLASMIDS / WAP МЫШИ / MOUSE WAP / ЛАКТОФЕРРИН ЧЕЛОВЕКА / HUMAN LACTOFERRIN / CRISPR/CAS9 / HDR / GENETIC ENGINEERING CONSTRUCTIONS / HDR METHOD

Аннотация научной статьи по агробиотехнологии, автор научной работы — Колоскова Е.М., Езерский В.А., Белова Н.В., Кутьин И.В., Рябых В.П.

По результатам рестриктного анализа потенциальных компонентов генно-инженерной конструкции основным вектором-носителем была выбрана плазмида рJET1.2/blunt. ПЦР-амплификат кДНК чЛФ клонировали в рJET1.2/blunt с получением плазмиды рJET1.2hLf. фрагменты 3’WAP и 5’WAP, вырезанные из полученных ранее промежуточных плазмид pTZ5’WAP и pTZ3’WAP, были последовательно клонированы в рjet1.2hlf. Рестриктный и ПЦР-анализы подтвердили состав созданной плазмиды рWAPhLf. Линейная генная конструкция размером 4061 п.н. вырезается рестриктазами EagI (NotI) и ClaI, содержит 2136 п.н. кДНК чЛФ, левое и правое плечи гомологии гену кислого сывороточного белка мыши размером 945 и 980 п.н. соответственно. Полученную плазмиду (или линеаризованную генную конструкцию) предполагается использовать в качестве матрицы для замещения кодирующей последовательности гена mWAP на последовательность кДНК чЛФ по механизму прямой гомологичной рекомбинации с применением системы CRISPR/Cas9.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по агробиотехнологии , автор научной работы — Колоскова Е.М., Езерский В.А., Белова Н.В., Кутьин И.В., Рябых В.П.

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

GENETIC ENGINEERED CONSTRUCTION FOR SUBSTITUTION OF MOUSE WAP GENE BY СDNA OF HUMAN LACTOFERRIN BY HDR METHOD USING CRISPR/CAS9 SYSTEM

The plasmid pJET1.2/blunt was chosen as the main carrier vector by the results of the restriction analysis of the potential components of the genetic engineering structure. The PCR amplification of hLf cDNA was cloned into pJET1.2/blunt to obtain plasmid pJET1.2hLf. Fragments 3'WAP and 5'WAP, cut from the previously obtained intermediate plasmids pTZ5'WAP and pTZ3'WAP, were sequentially cloned into pJET1.2hLf. Restrictive and PCR assays confirmed the composition of the created plasmid pWAPhLF. Linear gene construction of 4061 bp is cut out by the restriction enzymes Eag I ( Not I) and Cla I, contains 2136 bp. cDNA hLF, left and right shoulders of homology to the mouse gene for acidic whey protein of the size 945 and 980 bp. respectively. The resulting plasmid (or linearized gene construct) is intended to be used as a template for replacing the coding sequence of the mWAP gene by the cDNA sequence of hLf by the direct homologous recombination mechanism using the CRISPR/Cas9 system.

Текст научной работы на тему «ГЕННО-ИНЖЕНЕРНАЯ КОНСТРУКЦИЯ ДЛЯ ЗАМЕЩЕНИЯ ГЕНА WAP МЫШИ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬЮ КДНК ЛАКТОФЕРРИНА ЧЕЛОВЕКА МЕТОДОМ HDR С ПРИМЕНЕНИЕМ СИСТЕМЫ CRISPR / CAS9»

_МОЛЕКУЛЯРНО-БИОЛОГИЧЕСКИЕ И КЛЕТОЧНЫЕ ТЕХНОЛОГИИ_

УДК 575:577.21 doi: 10.25687/1996-6733.prodanimbiol.2018.2.19-30

ГЕННО-ИНЖЕНЕРНАЯ КОНСТРУКЦИЯ ДЛЯ ЗАМЕЩЕНИЯ ГЕНА

WAP МЫШИ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬЮ кДНК ЛАКТОФЕРРИНА ЧЕЛОВЕКА МЕТОДОМ HDR С ПРИМЕНЕНИЕМ СИСТЕМЫ CRISPR / Cas9

Колоскова Е.М., Езерский В.А., Белова Н.В., Кутьин И.В., Рябых В.П., Трубицина Т.П., Максименко С.В.

ВНИИ физиологии, биохимии и питания животных, Боровск Калужской обл., Российская Федерация

По результатам рестриктного анализа потенциальных компонентов генно-инженерной конструкции основным вектором-носителем была выбрана плазмида рJET1.2/bLunt. ПЦР-амплификат кДНК чЛФ клонировали в рJET1.2/bLunt с получением плазмиды рJET1.2hLf. фрагменты 3'WAP и 5'WAP, вырезанные из полученных ранее промежуточных плазмид pTZ5'WAP иpTZ3'WAP, были последовательно клонированы в рjet1.2hLf.

Рестриктный и ПЦР-анализы подтвердили состав созданной плазмиды rWAPHLF. Линейная генная конструкция размером 4061 п.н. вырезается рестриктазами EagI (NotI) и ClaI, содержит 2136 п.н. кДНК чЛФ, левое и правое плечи гомологии гену кислого сывороточного белка мыши размером 945 и 980 п.н. соответственно. Полученную плазмиду (или линеаризованную генную конструкцию) предполагается использовать в качестве матрицы для замещения кодирующей последовательности гена mWAP на последовательность кДНК чЛФ по механизму прямой гомологичной рекомбинации с применением системы CRISPR/Cas9.

Ключевые слова: генно-инженерная конструкция, плазмиды, WAP мыши, лактоферрин человека, CRISPR/Cas9, HDR

Проблемы биологии продуктивных животных, 2018, № 2: 19-30

Введение

С появлением технологии CRISPR/Cas9 стали осуществимы одноступенчатые нокаут гена с возможностью его замены трансгеном, генерация мутаций в нескольких генах одновременно с участием одного или обоих аллелей (в том числе получение гомозиготных животных в F0 поколении), введение в геном сразу нескольких трансгенов.

Во всем мире, в том числе и в России, ожидается экспоненциальный рост количества трансгенных домашних животных (ТЖ), полученных по CRISPR/Cas9 технологии. Особенно актуально это для нашей страны: относительно низкая эффективность традиционного трансгеноза и высокие материальные затраты длительное время являлись лимитирующим фактором создания трансгенных сельскохозяйственных животных и животных-биомоделей.

Научные коллективы, добившиеся серьезных успехов в получении трансгенных животных-продуцентов рекомбинантных белков с молоком, заявили о планах применения новых технологий в своих исследованиях: почти одновременно появилось множество работ, посвященных осмыслению пройденного пути и эффективности полученных возможностей в решении сложных биотехнологических задач. Это работы ученых из США, около 10 лет посвятивших получению коз-продуцентов лизоцима человека (Cooper et al., 2015), Китая, получивших КРС с высокой экспрессией чЛФ и лизоцима с использованием BAC-конструкции (Lu D et al., 2016), бразильско-российский коллектив, добившийся серьезного успеха в создании чГ-КСФ-продуцирующих коз (Freitas et al., 2014).

Применение новых эндонуклеазных технологий с использованием механизма прямой гомологичной рекомбинации (HDR) - эффективный метод гуманизации молока замещением генов эндогенных молочных белков (МБ) у сельскохозяйственных животных генами таких же белков молока человека для улучшения его потребительских качеств. Можно исключить из состава молока какой-либо белок; заменить его белком фармакологического или диагностического назначения; модифицировать сами МБ с целью повышения их питательной ценности и усвояемости или переработки в разные молочные продукты для получения из них биологически активных пептидов в качестве вакцин (Whitelaw et al., 2016).

Промоторные области генов тканеспецифичных МБ - казеинов и сывороточных белков уже давно с переменным успехом используют в составе генных конструкций для создания ТЖ - продуцентов БАВ. Основные белки молочной сыворотки — а-лактальбумин, Р-лакто-глобулин и кислый сывороточный протеин (WAP) кодируются генами относительно небольшого размера, находящимися на разных хромосомах, тогда как гены казеинов имеют кластерную организацию на одной хромосоме. Промотор гена WAP мыши (mWAP) содержит два регуляторных региона: проксимальный (50-150 п.н.) и дистальный (530-630 п.н.) до начала сайта старта транскрипции, с которого начинается синтез РНК (Ozturk-Winder et al., 2002). Оба региона содержат ответственный за тканеспецифичную экспрессию гена WAP участок сайтов связывания семи факторов транскрипции (Li et al., 1995). Первые трансгенные мышь (Gordon et al., 1987) и коза (Ebert et al., 1991), были получены с применением ГИК, в составе которой была промоторная последовательность гена mWAP размером 2,5 т.п.н. Уровень рекомбинантного тканевого активатора плазминогена человека в молоке мыши был всего 300 нг/мл, в молоке козы — 3 мкг/мл. Использование в составе ГИК обеих фланкирующих областей гена mWAP ( 5'- и 3'- соответственно до 2,6 и 1,3 т.п.н.) существенно не изменило ситуацию: содержание Г-КСФ человека в молоке трансгенных мышей не превышало 250 нг/мл (Lu et al., 1999).

Хорошие результаты были получены с применением в ГИК промотора гена WAP кролика (rbWAP): у мышей, трансгенных по гену гормона роста человека под промотором rbWAP размером 6,3 т.п.н., содержание рекомбинантного белка (РБ) в молоке было 4-22 мг/мл (Devinoy et al 1994). Уровень РБ в молоке трансгенных мышей в аналогичном эксперименте с использованием гена бычьего гормона роста, был сопоставим: 1-16 мг/мл (Thepot et al., 1995). Но эритропоэтин человека в подобной конструкции оказался токсичным для трансгенных кроликов: смертность животных была высокой, следы гормона были найдены в крови независимо от возраста и пола, а содержание ЭПО в молоке не превышало 50 мкг/мл (Massoud et al., 1996). С использованием в составе ГИК промотора rbWAP размером 17,6 т.п.н. были получены мыши с содержанием а1 -антитрипсина человека в молоке до 10 мг/мл (Bichoff et al., 1992).

Более высокая эффективность работы промотора rbWAP, по сравнению с использованным ранее промотором mWAP размером 2,6 т.п.н., объясняется наличием мощного энхансера в положении 5,5 т.п.н. до начала точки транскрипции (Devinoy et al., 1991; Millot et al., 2001). Эффективность работы любого промотора может быть связана и со слитым с ним трансгеном, в составе интронов которых могут содержаться регуляторные последовательности, способствующие экспрессии.

Все это применимо и к mWAP промотору. Традиционной микроинъекцией гибридного гена mWAP-hLF были получены трансгенные мыши с очень высоким уровнем экспрессии чЛФ: 16.7-29.8 мг/мл молока у пяти линий (Shi et al., 2009). В ГИК геномная кодирующая последовательность mWAP была замещена полноразмерным геном лактоферрина человека (hLF) от стартового до стоп-кодона, при этом величины 5'- и 3'-mWAP составляли 13 и 8 т.п.н.

Эффективность работы любой новой технологии, генной конструкции в первую очередь оценивается в работе с мышами-моделями, после чего планируется их использование на более крупных животных. WAP — основной белок сыворотки молока мыши и кролика: при

среднем содержании белка около 125 г/л молока у мышей линии C57BL/6J доля WAP составляет 12% общего белка, или около 15 г/л (Boumahrou et al., 2009), столько же - у кролика (Baranyi et al., 1995). Ген кислого сывороточного белка, следовательно, перспективный кандидат для замены геном фармакологически активного белка при использовании системы CRISPR/Cas9: точное встраивание (замещение) трансгена, имеющего относительно короткие (до 1 т.п.н.) плечи гомологии к гену WAP, обеспечит его работу под управлением полноразмерных эндогенных регуляторных последовательностей.

Материал и методы

В работе использовали следующие ферменты и реактивы: FastAP Thermosensitive Alkaline Phosphatase, 1 ед/мкл; рестриктазы KpnI, Bsu15I (ClaI), NotI, SalI, EagI (10 ед/мкл); 10*Buffer Y+/ Tango, 10*Buffer O; T4 DNA Ligase (5 ед/мкл), 10*T4 DNA Ligase Buffer (Fermentas, Thermoscientific).

При проведении полимеразной цепной реакции (ПЦР) использовали смесь dNTP 2 мМ раствор (Fermentas), Taq-полимеразу 5 ед/мкл, ^xTaq-буфер с 25 mM MgCl2, Pfu-ДНК-полимеразу, 5 ед/мкл (Силекс). Временные и температурные параметры ПЦР были подобраны в зависимости от структуры праймеров. Последовательности и описание праймеров, использованных в работе, приведены в табл. 1. Праймеры заказывали и синтезировали в ЗАО «Синтол» <http://www.syntol.ru>. Процедуру ПЦР проводили на амплификаторе ДНК «Терцик» («ООО ДНК-Технология», Москва).

ПЦР-амплификат кДНК чЛФ клонировали в pJET1.2/blunt из набора CloneJET PCR Cloning Kit согласно рекомендациям поставщика. Все использованные наборы - фирмы Fermentas (Thermoscientific) <http://www.thermoscientific.com/fermentas>.

Трансформацию компетентных клеток E.coli Dh5a проводили по методике и с реагентами набора Transform-Aid Bacterial Transformation Kit. Трансформированные клетки высевали по 10-25 мкл на среду Лурия-Бертани (ЛБ), содержащую 100 мкг/мл ампициллина (Am+) и 1,5% агара. Выросшие клоны пересевали на такую же агаризованную ЛБ-Am+ среду. ДНК из клонов для ПЦР-анализа выделяли с помощью лизирующей смеси с протеиназой К. Подходящий клон нарабатывали в 100 мл ЛБ-Am среды. Выделение плазмидной ДНК проводили с использованием набора GeneJET Plasmid Miniprep Kit или классическим методом щелочного лизиса.

Таблица 1. Последовательности и свойства использованных в работе праймеров

Праймер 5'-3' последовательность Направление Введенный сайт рестрикции

Lf1701 (LfF) ATGGTACC ATGAAACTTGTCTTCCTCGTCCT F KpnI

Lf1702 (LfR): GTCGAC TTACTTCCTGAGGAATTCACA R SalI

Т7 TAATACGACTCACTATAGGG F

W5'R CATGGTACC GGTGTCAGGCAAGTGACTG R KpnI

W1703 GTCGAC TGCATCAGATCCAAGTGCAGATACAATGTG F SalI

W1704 ATCGAT TCACCTCTGCTTCTAGCCTAGTCAG R ClaI

Качество и количество выделенных плазмид и фрагментов рестрикции оценивали визуально в УФ свете после электрофореза образцов в агарозном геле (АГ). Электрофорез проводили в горизонтальном АГ в ><0,5 Трис-боратном буфере (ТВЕ), рН 8,0, с бромистым этидием, используя набор оборудования фирмы Hoeffer (США). Препаративный электрофорез проводили в *1 Трис-ацетатном буфере (TAE), рН 8,0, с бромистым этидием. ДНК из агарозного геля выделяли с помощью набора Gene JET Gel Extraction Kit. Размер фрагментов ДНК в АГ оценивали, используя в качестве стандарта DNA Ladder Mix (Fermentas). Расщепление плазмидной ДНК рестриктазами проводили стандартными методами с учетом

активности и условий работы каждого фермента, описанных в сертификатах анализа или справочных каталогах ("Fermentas", "Invitrogen").

Результаты и обсуждение

Рестриктный анализ компонентов генно-инженерной конструкции и потенциальных плазмид для сборки.

В качестве потенциальных векторов-носителей для сборки ГИК рассматривали рТ257Я/Т и р№Т1.2/ЫпШ. В результате рестриктного анализа их сайтов мультиклонирования и компонентов конструкции (5'- и 3'WAP, кДНК hLf) в качестве основной плазмиды для клонирования была выбрана р^Т1.2/Ы1пп1.

1.1. Клонирование кДНК чЛФ, получение плазмиды рЗЕТ1.2НЬ/

ПЦР-амплификат кДНК чЛФ получали с плазмидыpaslLf (Езерский и др., 2004). В праймер Lf1702 ввели сайт для рестриктазы Sali, в праймер Lf1701 — сайт для KpnI. Был получен ПЦР-амплификат размером 2150 п.н. (из них 2136 - кДНК чЛФ).

Таблица 2. Состав препаративной ПЦР-смеси для получения амплификата кДНК чЛФ

Компоненты Объем, мкл

1 Taq buf x10 16

2 dNTP x10 (2 мМ) 12

3 Lf1701 (3 пМ/мкл) 8

4 Lf1702 (3 пМ/мкл) 8

5 paslLf (20 нг/мкл) 8

6 TaqPol (5 ед/мкл) 2,4

7 H2O 105,6

Итого 160

Режим амплификации: денатурация 94оС - 45 сек (в первом цикле - 3 мин.), отжиг праймеров 62оС - 60 с., элонгация 72оС - 2 мин. 30 с. (в последнем цикле — 3 мин); всего 26 циклов. После препаративного электрофореза ПЦР-амплификат очистили из агарозного геля (рис. 1), обработали blunting-экзонуклеазой и клонировали в pJET1.2/blunt. Выросшие на селективной среде клоны трансформированных компетентных клеток E. coli Dh 5а проверили ПЦР-анализом с праймерами Т7 и LfR (рис. 2).

1 2 3 4 5 6 1 2

|2|

А

Рис. 1. Препаративный электрофорез ПЦР-амплификата кДНК hLf (дор. А1-5); 0,8% агарозный гель, х] ТАЕ (А6), маркер размеров ДНК (Б1); выделенный из агарозного геля фрагмент Крп1-ИЬ/-8а11 (Б2).

■ 3000 ПН_

■2000 пн — — ■1000 пн —

■ 500 пн — Б

Рис. 2. Проверка бактериальных клонов праймерами T7 и LfR. 0,8% агарозный гель, *0,5 ТБЕ; дор. 1-10 - клоны 1-10 соответственно, дор.11 - маркер размеров ДНК, 12 - Н2О

Положительный клон, содержащий плазмиду рJET1.2hLf в правильной ориентации, наработали и провели проверочную рестрикцию выделеннной плазмиды рестриктазами ^п1 и SaЛ (рис. 3). Схема получения рJET1.2hLf представлена на рис. 4; рJET1.2hLf использовали далее для клонирования других компонентов ГИК.

Рис. 3. Проверочная рестрикция pJET1.2.hLf. 0,8% агарозный гель, *0,5 ТБЕ 1 - маркер размеров ДНК; 2 - рJET1.2.hLf; 3 - рJET1.2.hLf + Kpnl + Sali

Рис. 4. Схема получения плазмиды рJET1.2.hLf, содержащей кДНК чЛФ. Указаны основные рестриктные сайты для клонирования следующих фрагментов ГИК (сайт для рестриктазы МэЯ содержит последовательность для Eagl), сайты связывания используемых праймеров.

1.2. Клонирование 5'MWAP И 3'MWAP; получение плазмиды PWAPhLF

Ранее нами были созданы промежуточные плазмиды pTZ5'WAP и pTZ3'WAP, содержащие 5'WAP и 3'WAP фрагменты (размером 945 и 980 п.н. соответственно) гена кислого сывороточного белка мыши (Езерский и др., 2018). Один из клонов pTZ5'WAP по результатам секвенирования имел однонуклеотидную замену в положении 494, что соответствует записи NC_000077.6 для Mus musculus линии C57BL/6J, опубликованной в базе данных GenBank (http://www.ncbi.nlm.nih.gov) на 99,89%. Поскольку замена находится в некодирующей области, использовали этот клон, поскольку в другом секвенировванном клоне была найдена однонуклеотидная делеция в РНК-кодирующей последовательности. В последовательности 3'WAP отличий не обнаружили. Препаративную рестрикцию pTZ5'WAP иpTZ3'WAP проводили в условиях и в порядке, представленном в табл. 3.

Таблица 3. Препаративная рестрикция pTZ5'WAP и pTZ3'WAP

Компонент Смесь для 5'WAP Смесь для 3 'WAP

Объем, мкл Объем, мкл

pTZ5'WAP (50 нг/мкл) 60

pTZ3'WAP (60 нг/мкл) 30

10* Tango буфер * 15 10

KpnI (10 ед/мкл) 5 -

ClaI (10 ед/мкл) - 2,5

вода 70 52

Итого: 150 мкл 100 мкл

Инкубировали при 37оС 3 часа 3 часа

10* Tango буфер * * 19 13

EagI (10 ед/мкл) 3 -

SalI (10 ед/мкл) - 3

Инкубировали при 37оС 1,5 часа 3 часа

Примечания: * в буфере 1* Tango активность KpnI : 20-50% , ClaI: 100% ; ** в буфере 2* Tango активность EagI : 20-50%, SalI: 50-100%.

Рестриктные смеси разделяли в агарозном геле. Из вырезанных полос геля, соответствующих 1000 п.н. выделили фрагменты Eagl-5'WAP-Kpnl и Sall-3'WAP-Clal (рис. 5).

Рис. 5. Препаративный электрофорезрестриктных смесей (А) и выделенных из агарозного геля фрагментов (Б). Слева: рTZ5'WAP+Eagl+Kpnl, Eagl-5'WAP-Kpnl. Справа: рTZ3'WAP+Clal+Sall, Sall-3'WAP-Clal; 0,8% агарозный гель, ТАЕ; Б1 - маркер размеров ДНК. На уровне 4000 п.н. - недорезанные плазмиды.

Фрагмент Eagl-5'WAP-Kpnl клонировали в предварительно подготовленную плазмиду pJET1.2hLf . Выросшие из трансформированных лигазной смесью клеток E.coli Dh5a клоны проверили на наличие вставки ПЦР с праймерами Т7 и W5'R. Положительный клон, содержащий плазмиду, обозначенную как pJET5'WhLf, наработали. Фрагмент Sal\-3'WAP-Clal клонировали в предварительно подготовленную плазмидуpJET5'WhLf.

Таблица 4. Состав лигазных смесей для последовательного клонирования фрагментов 5'ЖАР и З^АР

Компоненты 5'WAP Объём, мкл 3'WAP Объём, мкл

1 pJEThLf /EagI/KpnI/AlkPh (=50 нг/мкл) 1,5 -

2 fJET5'WhLf/SalI/ClaI/AlkPh (=15 нг/мкл) - 1,5

3 5 х лигазный буфер 4 4

4 EagI-5'WAP-KpnI (=40 нг/мкл) 6 -

5 SalI-3 'WAP-ClaI (=50 нг/мкл) - 4

6 Н2О 7,5 9,5

7 Т4 ДНК-лигаза (5 ед/мкл) 1 1

Итого: 20 20

Выросшие клоны проверили ПЦР с праймерами W1703-W1704 и LfF-LfR (рис. 6).

Рис.6. Проверка трансформированных бактериальных клонов ПЦР с праймерами W1703- W1704 (1-5) и LfF-LfR (7-11), 0,8% агарозный гель, х0,5 ТБЕ. Дор. 1-4, 7-10 -клоны 1, 2, 4, 5 соответственно; 5 и 11 -Н2О; 6 - маркер размеров ДНК,

Таблица 5. Рестриктный анализpWAPhLf, выделенной из клонов 1и 2

Рестриктазы

Размеры фрагментов рестрикции рWAPhLf, п.н.

Ожидаемые

Фактические

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

1 EagI+ ClaI

2 KpnI +SalI

2885+4061 2138+4808

=3000; =4000 =2000; =5000

Клон №1 наработали и выделили pWAPhLf, из которой ИБЯ-конструкция вырезается рестриктазами EagI (или МэЯ) и СМ (рис. 7). Схема получения плазмиды рWAPhLf представлена на рис. 8.

Рис. 7. Рестриктный анализ клонов рWAPhLf 0,8% агарозный гель, 0,5*ТБЕ. 1 - маркер размеров ДНК; 2 -рWAPhLf/1; 3 - рWAPhLf/2; 4 - рWAPhLf/1 + EagI+ ClaI; 5

- çWAPhLf/2 + EagI+ ClaI; 6 - çWAPhLf/1 + KpnI +SalI; 7

- рWAPhLf/2 + KpnI +SalI; На дор. 6,7 присутствует недорезанная плазмида.

Рис. 8. Схема получения плазмиды pWAPhLf, содержащей кДНК чЛФ, 5 'WAP и 3 'WAP плечи гомологии к гену mWAP. Указаны основные сайты рестрикции.

Заключение

Создана плазмида рWAPhLf, из которой рестриктазами EagI (ША) и СМ вырезается линейная ГИК размером 4061 п.н., содержащая 2136 п.н. кДНК чЛФ, левое и правое плечи гомологии гену кислого сывороточного белка мыши (mWAP) размером 945 и 980 п.н. соответственно. Полученная плазмида (или вырезанная ГИК) может быть использована в

качестве матрицы для замещения кодирующей последовательности гена mWAP на последовательность кДНК чЛФ по механизму гомологичной рекомбинации в процессе репарации геномной ДНК эмбриона мыши, разрезанной эндонуклеазой Cas9 в сайтах гена mWAP, узнанных gRNA(s) (компонентов CRISPR/Cas9 системы).

Плазмида pWAPhLf может быть использована в качестве кассеты для вставки любых других фрагментов ДНК по уникальным сайтам рестрикции KpnI и SalI (вместо кДНК чЛФ, в случае отсутствия таковых сайтов во встраиваемой ДНК).

ЛИТЕРАТУРА

1. Езерский В.А., Иванова Л.Б., Шевченко В.Г. Получение плазмиды, содержащей структурный ген лактоферрина человека под контролем регуляторных элементов гена asl-казеина быка // Сборник научных трудов ВНИИФБиП. - 2004. - Т. 43. - С. 52-67 .

2. Езерский В.А., Колоскова Е.М., Белова Н.В., Кутьин И.В., Рябых В.П. Клонирование нуклеотидных последовательностей 5' - и 3'-областей гена кислого сывороточного белка мыши для использования в генно-инженерных конструкциях, создаваемых на основе системы CRISPR/Cas9 // Проблемы биологии продуктивных животных. - 2018. - Т. 1. - С. 19-28

3. Baranyi M., Brignon G., Anglage P., Ribadeau-Dumas B. New data on the protein of rabbit (Oryctolagus cuniculus) milk // Comp. Biochem. Physiol. - 1995. - Vol. 111B. - P. 407-415.

4. Bichoff R., Degzuse E., Perraud F., Dalemans W., Ali-Hadji D., Thepot D., Devinoy E., Houdebine L.M., Pavirani A.. A 17,6 kb region located upstream of the rabbit WAP gene direct high-level expression of a functional human protein variant in transgenic mouser milk // FEBS. - 1992. - Vol. 305. - P. 265-268.

5. Boumahrou N., Andrei S., Miranda G., Henry C., Panthier J.J., Martin P., Bellier S.. The major protein fraction of mouse milk revisited using proven proteomic tools // J. Physiol. Pharmac. - 2009. - Vol. 60. -Suppl. 3. - P. 113-118.

6. Cooper C.A, Maga E.A, Murray J.D. Production of human lactoferrin and lysozyme in the milk of transgenic dairy animals: past, present, and future // Transgenic Res. - 2015. - Vol. 24. - No. 4. - P. 605614. doi: 10.1007/s11248-015-9885-5.

7. Devinoy E., Malienou-N'Gassa R., Thepot D., Puissant C., Houdebine L.M. Hormone responsive elements within the upstream sequences of the rabbit whey acidic protein (WAP) gene direct chloramphenicol transferase (CAT) reporter gene expression in transfected rabbit mammary cells // Mol. Cell. Endocrin. -1991. - Vol. 81. - P. 185-193.

8. Devinoy E., Thepot D., Stinnakre M.-G., Fontaine M.-L., Grabowski H., Puissant C., Pavirani A., Houdebine L.-M. High level production of human growth hormone in the milk of transgenic mice: the upstream region of the rabbit whey acidic protein (WAP) gene targets transgene expression to the mammary gland // Transg. Res. - 1994. - Vol. 3. - No. 2. - Р. 79-89.

9. Ebert K.M., Tullio P.Di, Barry C.A., Schindler J.E., Ayres S.L., Smith T.E., Pellerin L.J., Meade H.M., Denman J., Roberts B.. Induction of human tissue plasminogen activator in the mammary gland of transgenic goats // Nature Biotechn. - 1994. - Vol. 12. - Р. 699-702. doi:10.1038/nbt0794-699

10. Ebert K.M., Selgrath J.P., DiTullio P., Denman J., Smith T.E. et al. Transgenic production of a variant of human tissue-type plasminogen activator in goat milk: generation of transgenic goats and analysis of expression // Biotechnology (NY). - 1991. - Vol. 9. - Р. 835-838.

11. Freitas V.J.F., Melo L.M., Batista R.I.T.P., Souza-Fabjan J.M.G., Teixeira D.I.A., Serova I. A., Andreeva L.E., Burkov I.A., Serov O.L. Goats (Capra hircus) as bioreactors for production of recombinant proteins interesting to pharmaceutical industry // Clon. Transgen. - 2014. - Vol. 3. - Р. 130. doi:10.4172/2168-9849.1000130

12. Gordon K., Lee E., Vitale J.A., Smith A.E., Westphal H., Hennighausen L. Production of human tissue plasminogen activator in transgenic mouse milk // Nature Biotechn. - 1987. - Vol. 5. - Р. 1183 - 1187. doi:10.1038/nbt1187-1183

13. Li S., Rosen J.M.. Nuclear factor I and mammary gland factor (STAT5) play a critical role in regulating rat whey acidic protein gene expression in transgenic mice // Mol. Cell Biol. - 1995. - Vol. 15. - Р. 20632070.

14. Lu D., Liu S., Ding F., Wang H., Li J., Li L., Dai Y., Li N.. Large-scale production of functional human lysozyme from marker-free transgenic cloned cows // Sci. Rep. - 2016. - Vol. 6. - Р.22947. doi: 10.1038/srep22947

15.Lu Y., Tian C., Deng J., Cheng X., Huang P. Establishment of La-tPA/G-CSF dual transgenic mice and expression in their mammary gland // Science in China (Series C). - 1999. - Vol. 42. - No 3. - P. 330-336.

16. Massoud M., Attal J., Thepot D., Pointu H., Stinnakre M.G., Theron M.C., Lopez C.,. Houdebine L.M. The deleterious effects of human erythropoietin gene driven by the rabbit whey acidic protein gene promoter in transgenic rabbits // Reprod. Nutr. Dev. - 1996. - Vol. 36. - P. 555-563.

17. Millot B., Fontaine M.L., Thepot D., Devinoy E. A distal region, hypersensitive to DNase I, plays a key role in regulating rabbit whey acidic protein gene expression // Biochem. J. - 2001. - Vol. 359. -- P. 557565.

18. Öztürk-Winder F., Renner M., Klein D., Müller M., Salmons B., Gunzburg WH. The murine whey acidic protein promoter directs expression to human mammary tumors after retroviral transduction // Cancer Gene Ther. - 2002. - Vol. 9. - P. 421-431.

19. Shi G., Chen H., Wu X., Zhou Y., Liu Z., Zheng T., Huang P. A mWAP-hLF hybrid gene locus gave extremely high level expression of human lactoferrin in the milk of transgenic mice // Transgenic Res. -2009. - Vol. 18. - P. 573-582.

20. Thepot D., Devinoy E., Fontaine M.L., Stinnakre M.G., Massoud M., Kann G., Houdebine L.M.. Rabbit whey acidic protein gene upstream region controls high-level expression of bovine growth hormone in the mammary gland of transgenic mice // Mol. Reprod. Dev. - 1995. - Vol. 42. - No. 3. - P. 261-267.

21. Whitelaw C.B.A., Sheets T.P., Lillico S.G., Telugu B.P. Engineering large animal models of human disease // J. Pathol. - 2016. - Vol. 238. - P. 247-256.

REFERENCES

1. Baranyi M., Brignon G., Anglage P., Ribadeau-Dumas B. New data on the protein of rabbit (Oryctolagus cuniculus) milk. Comp. Biochem. Physiol. 1995, 111B: 407-415.

2. Bichoff R., Degzuse E., Perraud F., Dalemans W., Ali-Hadji D., Thepot D., Devinoy E., Houdebine L.M., Pavirani A. A 17,6 kb region located upstream of the rabbit WAP gene direct high-level expression of a functional human protein variant in transgenic mouser milk. FEBS. 1992, 305: 265-268.

3. Boumahrou N., Andrei S., Miranda G., Henry C., Panthier J.J., Martin P., Bellier S.. The major protein fraction of mouse milk revisited using proven proteomic tools. J. Physiol. Pharmac. 2009, 60(Suppl. 3): 113-118.

4. Cooper C.A, Maga E.A, Murray J.D. Production of human lactoferrin and lysozyme in the milk of transgenic dairy animals: past, present, and future. Transgenic Res. 2015, 24(4): 605-614. doi: 10.1007/s11248-015-9885-5

5. Devinoy E., Malienou-N'Gassa R., Thepot D., Puissant C., Houdebine L.M. Hormone responsive elements within the upstream sequences of the rabbit whey acidic protein (WAP) gene direct chloramphenicol transferase (CAT) reporter gene expression in transfected rabbit mammary cells. Mol. Cell. Endocrin. 1991, 81: 185-193.

6. Devinoy E., Thepot D., Stinnakre M.-G., Fontaine M.-L., Grabowski H., Puissant C., Pavirani A., Houdebine L.-M. High level production of human growth hormone in the milk of transgenic mice: the upstream region of the rabbit whey acidic protein (WAP) gene targets transgene expression to the mammary gland. Transg. Res. 1994, 3(2): 79-89.

7. Ebert K.M., Tullio P.Di, Barry C.A., Schindler J.E., Ayres S.L., Smith T.E., Pellerin L.J., Meade H.M., Denman J., Roberts B.. Induction of human tissue plasminogen activator in the mammary gland of transgenic goats. Nature Biotechn. 1994, 12: 699-702. doi:10.1038/nbt0794-699

8. Ebert K.M., Selgrath J.P., DiTullio P., Denman J., Smith T.E. et al. Transgenic production of a variant of human tissue-type plasminogen activator in goat milk: generation of transgenic goats and analysis of expression. Biotechnology (NY). 1991, 9: 835-838.

9. Ezerskii V.A., Ivanova L.B., Shevchenko V.G. [The preparation of a plasmid containing a structural human lactoferrin gene under the control of the regulatory elements of the cows as1-casein]. Sbornik nauchnykh trudov VNIIFBiP (Collection of scientific papers VNIIFBiP). 2004, 43: 52-67. (In Russian)

10. Ezerskii V.A., Koloskova E.M., Belova N.V., Kut'in I.V., Ryabykh V.P. [Cloning of the nucleotide sequences of the 5'- and 3'-regions of the gene for the acidic mouse whey protein for the use in genetically engineered constructs based on the CRISPR / Cas9 system]. Problemy biologii productivnykh zhivotnykh -Problems of Productive Animal Biology. 2018, 1: 19-28. (In Russian)

11. Freitas V.J.F., Melo L.M., Batista R.I.T.P., Souza-Fabjan J.M.G., Teixeira D.I.A., Serova I.A., Andreeva L.E., Burkov I.A., Serov O.L. Goats (Capra hircus) as bioreactors for production of recombinant proteins interesting to pharmaceutical industry. Clon. Transgen. 2014, 3: 130. doi:10.4172/2168-9849.1000130

12. Gordon K., Lee E., Vitale J.A., Smith A.E., Westphal H., Hennighausen L. Production of human tissue plasminogen activator in transgenic mouse milk. Nature Biotechn. 1987, 5: 1183-1187. doi:10.1038/nbt1187-1183

13. Li S., Rosen J.M. Nuclear factor I and mammary gland factor (STAT5) play a critical role in regulating rat whey acidic protein gene expression in transgenic mice. Mol. Cell. Biol. 1995, 15: 2063-2070.

14. Lu D., Liu S., Ding F., Wang H., Li J., Li L., Dai Y., Li N. Large-scale production of functional human lysozyme from marker-free transgenic cloned cows. Sci. Rep. 2016, 6: 22947. doi: 10.1038/srep22947

15.Lu Y., Tian C., Deng J., Cheng X., Huang P. Establishment of La-tPA/G-CSF dual transgenic mice and expression in their mammary gland. Science in China (Series C). 1999, 42(3): 330-336.

16. Massoud M., Attal J., Thepot D., Pointu H., Stinnakre M.G., Theron M.C., Lopez C., Houdebine L.M. The deleterious effects of human erythropoietin gene driven by the rabbit whey acidic protein gene promoter in transgenic rabbits. Reprod. Nutr. Dev. 1996, 36: 555-563.

17. Millot B., Fontaine M.L., Thepot D., Devinoy E. A distal region, hypersensitive to DNase I, plays a key role in regulating rabbit whey acidic protein gene expression. Biochem. J. 2001, 359: 557-565.

18. Öztürk-Winder F., Renner M., Klein D., Müller M., Salmons B., Gunzburg WH. The murine whey acidic protein promoter directs expression to human mammary tumors after retroviral transduction. Cancer Gene Ther. 2002, 9: 421-431.

19. Shi G., Chen H., Wu X., Zhou Y., Liu Z., Zheng T., Huang P. A mWAP-hLF hybrid gene locus gave extremely high level expression of human lactoferrin in the milk of transgenic mice. Transgenic Res. 2009, 18: 573-582.

20. Thepot D., Devinoy E., Fontaine M.L., Stinnakre M.G., Massoud M., Kann G., Houdebine L.M. Rabbit whey acidic protein gene upstream region controls high-level expression of bovine growth hormone in the mammary gland of transgenic mice. Mol. Reprod. Dev. 1995, 42(3): 261-267.

21. Whitelaw C.B.A., Sheets T.P., Lillico S.G., Telugu B.P. Engineering large animal models of human disease. J. Pathol. 2016, 238: 247-256.

Genetic engineered construction for substitution of mouse WAP gene by сDNA of human lactoferrin by HDR method using CRISPR/Cas9 system

Koloskova E.M., Ezerskii V.A., Belova N.V., Kutyin I.V., Ryabykh V.P., Trubitsina T.P., Maksimenko S.V.

Institute of Animal Physiology, Biochemistry and Nutrition, Borovsk, Kaluga oblast, Russian Federation

ABSTRACT. The plasmid pJET1.2/blunt was chosen as the main carrier vector by the results of the restriction analysis of the potential components of the genetic engineering structure. The PCR amplification of hLf cDNA was cloned into pJET1.2/blunt to obtain plasmid pJET1.2hLf. Fragments 3'WAP and 5'WAP, cut from the previously obtained intermediate plasmids pTZ5WAP and pTZ3'WAP, were sequentially cloned into pJET1.2hLf.

Restrictive and PCR assays confirmed the composition of the created plasmid pWAPhLF. Linear gene construction of 4061 bp is cut out by the restriction enzymes EagI (NotI) and ClaI, contains 2136 bp. cDNA hLF, left and right shoulders of homology to the mouse gene for acidic whey protein of the size 945 and 980 bp. respectively. The resulting plasmid (or linearized gene construct) is intended to be used as a template for replacing the coding sequence of the mWAP gene by the cDNA sequence of hLf by the direct homologous recombination mechanism using the CRISPR/Cas9 system.

Keywords: genetic engineering constructions, plasmids, mouse WAP, human lactoferrin, CRISPR/Cas9, HDR method

Problemy biologii productivnykh zhivotnykh - Problems of Productive Animal Biology, 2018, 2: 19-30

Поступило в редакцию: 03.05.2018 Получено после доработки: 18.05.2018

Колоскова Елена Михайловна, к.б.н., с.н.с., тел. 9105909283, heleko3@yandex.ru

Езерский Вадим Александрович, с.н.с., тел. 9066425992, ez.vadim@yandex.ru

Белова Надежда Викторовна, асп., тел. 9534682694, navikbel@mail.ru

Кутьин Иван Владимирович, асп., тел. 9533328647, kurookami@mail.ru

Рябых Владимир Павлович, д.б.н., зав. лаб., тел. 9605157960, vladimirryabykh@rambler.ru

Трубицина Татьяна Петровна, к.б.н., с.н.с., тел. 9066411572, trubitsina.tp@yandex.ru

Максименко Сергей Васильевич, к.б.н., с.н.с., тел. 9066450252, vx136@rambler.ru

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.