Научная статья на тему 'Генетическая характеристика вирусов из антигенного комплекса Тюлений (flaviviridae, Flavivirus): Тюлений (TYUV Tyuleniy virus), изолированного из облигатных эктопаразитов колониальных птиц клещей Ixodes (Ceratixodes) uriae White, 1852, собранных в высоких широтах Северной Евразии, и Кама (kamv Kama virus), изолированного из клещей Ixodes lividus Roch, 1844, собранных в норовых колониях птиц в средней части Русской равнины'

Генетическая характеристика вирусов из антигенного комплекса Тюлений (flaviviridae, Flavivirus): Тюлений (TYUV Tyuleniy virus), изолированного из облигатных эктопаразитов колониальных птиц клещей Ixodes (Ceratixodes) uriae White, 1852, собранных в высоких широтах Северной Евразии, и Кама (kamv Kama virus), изолированного из клещей Ixodes lividus Roch, 1844, собранных в норовых колониях птиц в средней части Русской равнины Текст научной статьи по специальности «Биологические науки»

CC BY
361
85
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
Журнал
Вопросы вирусологии
ВАК
CAS
RSCI
PubMed
Область наук
Ключевые слова
ВЫСОКИЕ ШИРОТЫ / РУССКАЯ РАВНИНА / КОЛОНИАЛЬНЫЕ МОРСКИЕ ПТИЦЫ / УБЕЖИЩНЫЕ БИОЦЕНОЗЫ / АНТИГЕННЫЙ КОМПЛЕКС ТЮЛЕНИЙ / ВИРУС ТЮЛЕНИЙ (TYUV) / TYULENIY VIRUS (TYUV) / ВИРУС КАМА (KAMV) / KAMA VIRUS (KAMV) / МЕТАГЕНОМНЫЙ АНАЛИЗ / HIGH LATITUDES / RUSSIAN PLANE / COLONIAL SEABIRDS / ALCIDAE / IXODIDAE / FLAVIVIRIDAE / FLAVIVIRUS / TYULENIY ANTIGENIC COMPLEX / METAGENOMIC ANALYSIS / COVERING BIOCENOSIS

Аннотация научной статьи по биологическим наукам, автор научной работы — Львов Дмитрий Константинович, Альховский Сергей Владимирович, Щелканов Михаил Юрьевич, Щетинин Алексей Михайлович, Дерябин Петр Григорьевич

Проведено генетическое изучение вирусов Тюлений (TYUV Tyuleniy virus) (iD GenBank KF815939), изолированных в высоких широтах от клещей Ixodes uriae White, 1852, собранных в гнездовьях чистиковых птиц (Alcidae Leach, 1820), и Кама (KAMAV Kama virus) (iD GenBank KF815940), изолированного от клещей I. lividus, собранных в гнездовых колониях птиц в средней части Русской равнины. Результаты сравнительного анализа полноразмерных последовательностей геномов выявили 70% гомологии KAMV и TYUV на нуклеотидном уровне и 74 % на аминокислотном. Таким образом, KAMV является новым вирусом комплекса TYUV, принадлежащего экологической группе передаваемых клещами вирусов морских птиц (STBVG seabird tick-borne virus group), род Flavivirus, сем. Flaviviridae. KAMV является самостоятельным видом и формирует отдельную филогенетическую ветвь вместе с вирусами TYUV, Мибан (MEAV Meaban virus) и Саумарец-Риф (SREV Saumarez Reef virus).

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по биологическим наукам , автор научной работы — Львов Дмитрий Константинович, Альховский Сергей Владимирович, Щелканов Михаил Юрьевич, Щетинин Алексей Михайлович, Дерябин Петр Григорьевич

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Genetic Characterization of viruses from the antigenic complex Tyuleniy (Flaviviridae, Flavivirus): Tyuleniy virus (TYUV) isolated from ectoparasites of colonial seabirds Ixodes (Ceratixodes) uriae White, 1852, ticks collected in the high latitudes of Northern Eurasia and Kama virus (KAMV) isolated from the Ixodes lividus Roch, 1844, collected in the digging colonies of the middle part of Russian Plane

Genetic research into the Tyuleniy virus (TYUV) (ID GenBank KF815939) isolated in high latitudes from the Ixodes uriae White, 1852, ticks collected in the nesting colonies of the Alcidae (Leach, 1820) birds and Kama virus (KAMV) (ID GenBank KF815940) isolated from the I. lividus ticks collected in the nesting bird colonies in the middle part of the Russian Plane was carried out. Full-genome comparative analysis revealed 70% homology between KaMv and TYUV on the nucleotide level and 74% on the amino acid level. Thus, KAMV is a new member of the TYUV complex belonging to the seabird tick-borne virus group (STBVG) of Flavivirus (Flaviviridae). KAMV is a separate virus and forms separate phylogenetic line together with the TYUV, Meaban virus (MEAV), and Saumarez Reef virus (SREV).

Текст научной работы на тему «Генетическая характеристика вирусов из антигенного комплекса Тюлений (flaviviridae, Flavivirus): Тюлений (TYUV Tyuleniy virus), изолированного из облигатных эктопаразитов колониальных птиц клещей Ixodes (Ceratixodes) uriae White, 1852, собранных в высоких широтах Северной Евразии, и Кама (kamv Kama virus), изолированного из клещей Ixodes lividus Roch, 1844, собранных в норовых колониях птиц в средней части Русской равнины»

Kaplina I.V Isolation of three Uukuniemi virus strains from ticks in Volgograd district. In: Chumakov M.P., ed. Proceeding of the Institute of poliomyelitis and viral encephalitis «Actual problems of virology and natural-foci viral infection». Moscow: Academy of Medical Science USSR; 1972: 283-4 (in Russian).

25. Bichkova M.V, Sarmanova E.S., Michailova I.S., Livanova G.P., Karavanov A.S., Moteyunas L.I. et al. Studies of Uukuniemi virus strains, isolated in Lithuanian SSR and Estonian SSR. In: Chumakov M.P., ed. Proceeding of the Institute of poliomyelitis and viral encephalitis «Actual problems of virology and natural-foci viral infection». Moscow: aMs USSR; 1972: 3o0 (in Russian).

26. Moteyunas L.I., Karaseova P.S., Vargin V.V. Immunological struture of the population of Lithuanian SSR for Uukuniemi virus. In: Chu-

makov M.P., ed. Proceeding of the Institute of poliomyelitis and viral encephalitis «Actual problems of virology and natural-foci viral in-fection». Moscow: AMS USSR; 1972: 302-3 (in Russian).

27. FilippovaN.A. About the species of Ixodes persulcatus (Parasit-iformes, Ixodidae) group. Parazitology. 1973; 7: 3-13 (in Russian).

28. LvovD.K., red. Organization of ecological-epidemiological monitoring in Russian Federation for anti-epidemic defense of the civilians and army. М.: Minzdrav RF, The Federal Office of Biomedical and Extreme Problems, The D.I. Ivanovsky Institute of Virology; 1993 (in Russian).

Поступила 16.10.13

© КОЛЛЕКТИВ АВТОРОВ, 2014 УДК 578.833.2:578.5].083.2

Д.К. Львов, С.В. Альховский, М.Ю. Щелканов, А.М. Щетинин, П.Г. Дерябин, Е.И. Самохвалов,

А.К. Гительман, А.Г. Ботиков

Генетическая характеристика вирусов из антигенного комплекса Тюлений (Flaviviridae, Flavivirus): Тюлений (TYUV -Tyuleniy virus), изолированного из облигатных эктопаразитов колониальных птиц - клещей Ixodes (Ceratixodes) uriae White, 1852, собранных в высоких широтах Северной Евразии, - и Кама (KAMV - Kama virus), изолированного из клещей Ixodes lividus Roch, 1844, собранных в норовых колониях птиц в средней части

Русской равнины

ФГБУ «НИИ вирусологии им. Д.И. Ивановского» Минздрава России, 123098, Москва

Проведено генетическое изучение вирусов Тюлений (TYUV - Tyuleniy virus) (iD GenBank KF815939), изолированных в высоких широтах от клещей Ixodes uriae White, 1852, собранных в гнездовьях чистиковых птиц (Alcidae Leach, 1820), и Кама (KAMAV - Kama virus) (iD GenBank KF815940), изолированного от клещей I. lividus, собранных в гнездовых колониях птиц в средней части Русской равнины. Результаты сравнительного анализа полноразмерных последовательностей геномов выявили 70% гомологии KAMV и TYUV на нуклеотидном уровне и 74 % - на аминокислотном. Таким образом, KAMV является новым вирусом комплекса TYUV, принадлежащего экологической группе передаваемых клещами вирусов морских птиц (STBVG - seabird tick-borne virus group), род Flavivirus, сем. Flaviviridae. KAMV является самостоятельным видом и формирует отдельную филогенетическую ветвь вместе с вирусами TYUV, Мибан (MEAV - Meaban virus) и Саумарец-Риф (SREV - Saumarez Reef virus).

Ключевые слова: высокие широты; Русская равнина; колониальные морские птицы; Alcidae; убежищные биоценозы; Ixodidae; Flaviviridae; Flavivirus; антигенный комплекс Тюлений; вирус Тюлений (TYUV); вирус Кама (KAMV); метагеномный анализ

Genetic characterization of viruses from the antigenic complex Tyuleniy (Flaviviridae, Flavivirus): Tyuleniy virus (TYUV) (ID GenBank KF815939) isolated from ectoparasites of colonial seabirds - Ixodes (Ceratixodes) uriae White, 1852, ticks collected in the high latitudes of Northern Eurasia - and Kama virus (KAMV) isolated from the Ixodes lividus Roch, 1844, collected in the digging colonies of the middle

part of Russian Plane

D. K. Lvov, S. V Alkhovsky, M. Yu. Shchelkanov, A. M. Shchetinin, P. G. Deryabin, E. I. Samokhvalov,

A. K. Gitelman, A. G. Botikov

D.I. Ivanovsky Institute of Virology, Ministry of Health of the Russian Federation, Moscow, Russia

Genetic research into the Tyuleniy virus (TYUV) (ID GenBank KF815939) isolated in high latitudes from the Ixodes uriae White, 1852, ticks collected in the nesting colonies of the Alcidae (Leach, 1820) birds and Kama virus (KAMV) (ID GenBank KF815940) isolated from the I. lividus ticks collected in the nesting bird colonies in the middle part of the Russian Plane was carried out. Full-genome comparative analysis revealed 70% homology between KaMv and TYUV on the nucleotide level and 74% on the amino acid level. Thus, KAMV is a new member of the TYUV complex belonging to the seabird tick-borne virus group (STBVG) of Flavivirus (Flaviviridae). KAMV is a separate virus and forms separate phylogenetic line together with the TYUV, Meaban virus (MEAV), and Saumarez Reef virus (SREV).

Key words: high latitudes; Russian Plane; colonial seabirds; Alcidae; covering biocenosis; Ixodidae; Flaviviridae; Flavivirus; Tyuleniy antigenic complex; Tyuleniy virus (TYUV); Kama virus (KAMV); metagenomic analysis

Контактная информация:

Львов Дмитрий Константинович, акад. РАН; e-mail: dk_lvov@mail.ru

18

Прототипный штамм LEIV-6C (депонент в Государственной коллекции вирусов № ГКВ-526; авторы Львов Д.К., Громашевский В.Л.) вируса тюлений (TYUV -Tyuleniy virus) был изолирован при зондировании территории Дальнего Востока из клещей Ixodes (Ceratixodes) uriae White, 1852, собранных в августе 1969 г. на острове тюлений в Охотском море (48°29' с.ш., 144°38' в.д.), в гнездовье чистиковых (Alcidae Leach, 1820) птиц [1-5]. На основании данных электронной микроскопии вирус был отнесен к сем. Flaviviridae, а в результате серологических исследований - к роду Flavivirus, антигенному комплексу Тюлений [2, 5]. К этому же антигенному комплексу относится и вирус Мибан (MEAV - Meaban virus), который изолирован из клещей Ornithodoros (Alectorobius) maritimus Vermeil, Marguet, 1967, собранных в июле 1981 г. в гнездовьях серебристых чаек (Lams argentatus Pontoppidan, 1763) в заливе Морбиан французской провинции Бретань (47°31' с.ш., 02°56' з.д.) [6, 7]; Саумарец-риф (SREV - Saumarez Reef virus), изолированных из клещей O. capensis, которые были собраны в августе 1974 г. в гнездовье крачек (Sterna fuscata Linnaeus, 1766) на коралловом острове Саумарец-Риф в австралийской провинции Квинсленд (22°00' ю.ш., 153°30' в.д.) [8, 9]; Гаджетс-Галли (GGyV - Gadget’s Gully virus), изолированный из клещей I. uriae, которые были собраны в декабре 1976 г. в гнездовье пингвинов на островах Маккуори (Австралия) в южной части Тихого океана между Новой Зеландией и Антарктидой (54°30' ю.ш., 159°00' в.д.) [10]. Однако позднее MEAV и SREV были включены в группу передаваемых клещами вирусов морских птиц (STBVG - seabird tick-borne virus group), а GGYV - в группу передаваемых клещами вирусов млекопитающих (MTBVG - mammalian tick-borne virus group) [11-13].

Вирус Кама (KAMV - Kama virus) был изолирован из клещей I. lividus Roch, 1844 - облигатных паразитов ласточек-береговушек (Riparia riparia Linnaeus, 1758), собранных в августе 1989 г. в Центральной части Русской равнины, на островах Волжско-Камского плеса Куйбышевского водохранилища (Республика татарстан) (55°20' с.ш., 49°40' в.д.) [14].

Штаммы TYUV изолированы из клещей I. uriae в бассейнах Охотского, Берингова и Баренцева морей, причем зараженность иксодид этим вирусом в тихоокеанской части ареала в 4,5 раза выше, чем в атлантической (табл. 1) [15-22].

В настоящей работе мы провели полногеномное сек-венирование геномов TYUV и KAMV. На основании результатов молекулярно-генетического и филогенетиче-

ского анализа мы показали, что KAMV является новым вирусом в составе комплекса TYUV, принадлежащего экологической STBVG, род Flavivirus, сем. Flaviviridae.

Материалы и методы

Прототипные штаммы вирусов TYUV/LEIV-6C и KAMV/LEIV-Tat20776 были получены из Государственной коллекции вирусов РФ ФГБУ НИИ вирусологии им. Д.И. Ивановского Минздрава России в виде лиофилизи-рованной мозговой суспензии. Восстановленной суспензией (0,2 мл) проводили интрацеребральное заражение новорожденных беспородных белых мышей. После развития симптомов поражения ЦНС (2-4-е сутки) мышей забивали в соответствии с правилами этичного содержания и использования лабораторных животных.

Выделение РНК. Фрагменты мозга (около 30 мг) помещали в 700 мкл лизирующего буфера RLT (QIAGEN, Германия) и гомогенизировали в гомогенизаторе Tys-sueLyser LT (QIAGEN, Германия). Далее РНК выделили набором “RNeasy mini kit” (QIAGEN, Германия) на автоматической станции QIAcube (QIAGEN, Германия) из 350 мкл буфера в соответствии с инструкцией. Концентрацию РНК измеряли с использованием флюориметра Qubit (“Invitrogen”, США).

Подготовка библиотек и секвенирование. Для депле-ции рибосомальной РНК использовали набор “GenRead rRNA depletion Kit” (QIAGEN, Германия) в соответствии с инструкцией. Для получения кДНК 50 нг деплециро-ванной РНК фрагментировали в 15 мкл реакционной смеси для обратной транскриптазы с гексапраймером при 85°С в течение 5 мин, после чего помещали в лед. К фрагментированной РНК добавляли 200 ед. фермента RevertAid Premium (“Thermo Scintific”, США) и 20 ед. ингибитора РНаз RNasin (“Promega”, США). Инкубировали при 25°С в течение 10 мин, далее при 42°С в течение 60 мин. Реакцию останавливали прогреванием при 70°С в течение 10 мин. Синтез второй цепи кДНК проводили с использованием набора “NEBNext® mRNA Second Strand Synthesis Module» (NEB, США) в соответствии с инструкцией. Полученную дцДНК очищали с использованием набора “MinElute PCR Purification Kit” (QIAGEN, Германия) на автоматической станции QIA-cube.

Для получения ДНК-библиотек из дцДНК использовали набор “TruSeq DNA Sample Prep Kits v2” (“Illumi-na”, США) в соответствии с инструкцией. Полученные библиотеки визуализировали на станции автоматического электрофореза “QIAxcel Advanced System” (QIA-GEN, Германия). Молярность полученных библиотек

Таблица 1

Зараженность TYUV клещей I uriae White, 1852 в гнездовьях чистиковых птиц (Alcidae Leach, 1820) в бассейнах Охотского, Берингова и баренцева морей

Результат обследования клещей Дальний Восток Европа

бассейн Охотского моря (Сахалинская область) бассейн Берингова моря бассейн Баренцева моря (Мурманская область)

Камчатский край Чукотский автономный округ

остров Тюлений (48°29' с.ш., 144°38' в.д.) остров Ионы (56°24' с.ш., 143°23' в.д.) остров Арий Камень (Командорские острова) (55°13' с.ш., 165°48' в.д.) побережье пролива Беринга (64°50' с.ш., 173°10' з.д.) остров Харлов близ Кольского полуострова (68°49' с.ш., 37°19' в.д.)

Количество штаммов 9 4 22 0 2

Уровень вирусофорности, % 0,066 0,205 0,116 0 0,022

И то го...

обследовано клещей 35 2

количество штаммов 34 569 8994

уровень вирусофорности, % 0,101 0,022

19

Дендрограмма, построенная методом присоединения соседей, на основе сравнения полноразмерных последовательностей генома флавивирусов.

определяли методом полимеразной цепной реакции в реальном времени (2-кратно SsoFast EvaGreen Supermix (“Bio-Rad”, США), прибор Bio-Rad CFX1000) согласно рекомендациям, изложенным в руководстве “Sequencing Library qPCR Quantification Guide” (“Illumina”, США). Секвенирование ДНК-библиотек проводили на приборе MiSeq (“Illumina”, США) с использованием набора “MiSeq Reagent Kits v2 (300PE)” по схеме, описанной ранее [23, 24].

Биоинформационный анализ. Обработку данных полногеномного секвенирования, сборку контигов и картирование ридов проводили, используя программу cLc Genomics Workbench 5.5 (“CLC bio”, США). Предварительный поиск гомологичных последовательностей проводили с помощью сервиса BLASTX (http://blast.ncbi. nlm.nih.gov). Для подбора праймеров, множественного выравнивания, анализа нуклеотидных и аминокислотных последовательностей использовали пакет программ “Lasergene Core Suite” (“DNAstar”, США). Выравнивание последовательностей осуществляли по алгоритму ClustalW [25]. Генетическую дистанцию определяли по модели p-distance с частичным удалением гэпов. Филогенетический анализ и построение дендрограмм проводили, используя программу MEGA5, по методу ближайшего соседа (модель p-distance) с 1000-кратным бутстреп-тестированием [26].

Результаты и обсуждение

Геномы TYUV и KAMV секвенировали в составе индексированной ДНК-библиотеки. Полученные данные индексировали и триммировали для удаления последовательностей, принадлежащих адаптерам, с помощью программы CLC Genomics Workbench 5.5. Обработан-

ные таким образом последовательности (риды) были собраны de novo с установленными по умолчанию параметрами. В результате обработки в составе полученных контигов обнаружили протяженные последовательности длиной 10 688 н.о. для KAMV и 10 269 н.о. для TYUV. Полученные последовательности соответствовали практически полноразмерным геномам изучаемых вирусов (GenBank ID: KF815939, KF815940).

Размер и структура генома KAMV и TYUV являются характерной для вирусов рода Flavivirus (Flaviviri-dae). Геном флавивирусов представлен одноцепочечной РНК позитивной полярности, которая имеет одну открытую рамку считывания (ОРС), кодирующую полипротеин -предшественник структурных и неструктурных белков. Длина ОРС у TYUV и KAMV имеет схожий размер - 3422 и 3419 а.о. соответственно. Длина ОРС у других вирусов ST-BVG также составляет около 3420 а.о. Интересно отметить, что у флавивирусов MTBVG полипротеин-предшественник имеет чуть меньший размер и включает в среднем 3415 а.о.

Генетическая дистанция, рассчитанная на основе полноразмерных последовательностей генома флави-вирусов, которые передаются клещами (“клещевые флавивирусы”), представлена в табл. 2. Генетически флавивирусы являются достаточно гетерогенной группой. Уровень дивергенции между клещевыми флавивирусами и передающимися комарами (“москитные флавивирусы”) составляет в среднем уровне. Критерием разделения клещевых вирусов на отдельные серогруппы в соответствии с их антигенными свойствами можно считать, вероятно, уровень дивергенции от 15 до 35%.

Генетическая дистанция между STBVG и MTBVG составляет в среднем 42% на нуклеотидном и аминокислотном уровне (см. табл. 2). При этом данное значение характерно для всех вирусов STBVG. Внутри STBVG все вирусы между собой имеют практически равный уровень гомологии, который не превышает 70% по нуклеотидным и 85% по аминокислотным последовательностям. Штамм TYUV / LEIV-61C, секвенированный в настоящей работе, имеет 86% гомологии по нуклеотидам и около 97% на аминокислотном уровне со штаммом TYUV/USA, изолированным на Тихоокеанском побережье США. Такой высокий уровень гомологии говорит о постоянном обмене вирусами между восточным и западным побережьями Тихого океана.

Одной из основных задач настоящей работы является установление таксономического положения впервые секвенированного вируса KAMV. На нуклеотидном уровне KAMV имеет практически одинаковый уровень гомологии (70%) с вирусами, входящими в STBVG (MEAV, SREV, TYUV). На аминокислотном уровне KAMV обладает гомологией 74% с вирусами TYUV и SREV и 78% с MEAV соответственно. Таким образом, мы можем заключить, что KAMV является новым самостоятельным видом рода Flavivirus (Flaviviri-

20

Таблица 2

Генетическая дистанция (p-distance), рассчитанная на основе выровненных полноразмерных последовательностей генома «клещевых» флавивирусов

Вирус № п/п 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19

Kama 1 0,31 0,31 0,30 0,31 0,42 0,41 0,41 0,42 0,41 0,41 0,41 0,41 0,42 0,42 0,42 0,41 0,42 0,42

Tyleniy/ LEIV-6C 2 0,26 0,14 0,31 0,31 0,41 0,41 0,41 0,41 0,41 0,41 0,41 0,41 0,41 0,42 0,41 0,41 0,41 0,41

Tyuleniy (США) 3 0,26 0,03 0,32 0,31 0,41 0,41 0,42 0,41 0,41 0,41 0,41 0,41 0,41 0,42 0,41 0,42 0,41 0,42

Meaban (Франция) 4 0,22 0,26 0,26 0,31 0,41 0,41 0,41 0,42 0,41 0,41 0,41 0,41 0,42 0,42 0,42 0,41 0,42 0,42

Saumarez Reef (Австралия) 5 0,26 0,26 0,26 0,26 0,41 0,42 0,41 0,42 0,42 0,41 0,41 0,41 0,42 0,42 0,41 0,41 0,42 0,42

Alkhumra 6 0,42 0,42 0,43 0,43 0,43 0,08 0,40 0,31 0,29 0,29 0,29 0,29 0,34 0,32 0,29 0,29 0,34 0,30

Kyasanur forest disease 7 0,42 0,42 0,43 0,43 0,43 0,03 0,40 0,31 0,29 0,29 0,29 0,29 0,33 0,31 0,29 0,29 0,33 0,29

Kadam (Уганда) 8 0,43 0,42 0,43 0,42 0,43 0,40 0,40 0,41 0,41 0,41 0,41 0,41 0,41 0,41 0,41 0,41 0,41 0,41

Powassan 9 0,43 0,43 0,44 0,43 0,44 0,24 0,23 0,41 0,31 0,31 0,31 0,31 0,34 0,15 0,31 0,31 0,33 0,31

Tickborne encephalitis 10 0,42 0,42 0,43 0,42 0,43 0,21 0,20 0,41 0,23 0,18 0,15 0,15 0,34 0,31 0,20 0,18 0,33 0,18

Greek goat encephalitis 11 0,42 0,42 0,43 0,42 0,43 0,21 0,21 0,41 0,24 0,08 0,17 0,17 0,34 0,32 0,20 0,16 0,33 0,16

Tickborne encephalitis / EK328 12 0,42 0,42 0,43 0,42 0,43 0,20 0,20 0,41 0,23 0,05 0,07 0,04 0,34 0,31 0,20 0,17 0,32 0,17

Tickborne encephalitis / Est 13 0,42 0,42 0,43 0,42 0,43 0,21 0,20 0,41 0,23 0,05 0,07 0,01 0,33 0,31 0,19 0,17 0,32 0,17

Karshi 14 0,44 0,44 0,44 0,44 0,44 0,29 0,29 0,42 0,29 0,28 0,29 0,28 0,28 0,34 0,34 0,34 0,35 0,34

Deer tick 15 0,43 0,43 0,44 0,43 0,44 0,24 0,24 0,42 0,05 0,24 0,25 0,24 0,24 0,29 0,32 0,31 0,33 0,31

Omsk 16 0,43 0,43 0,43 0,42 0,43 0,21 0,21 0,41 0,24 0,10 0,11 0,09 0,09 0,28 0,25 0,21 0,33 0,21

Spanish sheep encephalitis 17 0,42 0,42 0,43 0,42 0,43 0,21 0,20 0,41 0,24 0,08 0,07 0,07 0,07 0,29 0,24 0,11 0,32 0,10

Gadgets Gully 18 0,43 0,43 0,43 0,44 0,43 0,28 0,28 0,41 0,27 0,28 0,28 0,28 0,28 0,30 0,28 0,28 0,28 0,33

Louping ill 19 0,43 0,43 0,43 0,43 0,43 0,21 0,21 0,41 0,24 0,08 0,08 0,08 0,08 0,29 0,25 0,11 0,05 0,29

Примечание. Правая верхняя часть - данные для нуклеотидных последовательностей, левая нижняя - данные для аминокислотных последовательностей. Серым фоном выделены вирусы, которые передаются клещами морских птиц (STBVG). № п/п - последовательность.

dae), входящим в STBVG.

Результаты филогенетического анализа, проведенного на основе полноразмерных геномов флавивирусов, представлены на рисунке, где видно, что KAMV вместе с MEAV, SREV и TYUV образует филогенетическую ветвь, отдельную от остальных клещевых вирусов MTBVG. Внутри STBVG KAMV также формирует отдельную ветвь, соответствующую самостоятельному виду в составе данной группы.

Экология TYUV изучена в восточной и западной частях ареала. При серологическом обследовании около 2500 птиц с помощью непрямой РСК на Дальнем Востоке положительные результаты наиболее часто были получены для толстоклювых (Uria lomvia Linnaeus, 1758) и тонкоклювых (U. aalge Pontopiddan, 1763) кайр и топорков (Fratercula cirrhata Pallas, 1769), реже - для берингийских бакланов (Phalacrocorax pelagicus Pallas, 1811), краснолицых бакланов (Ph. urile Gmelin, 1789), серокрылых чаек (Larus glaucescens Naumann, 1840), обыкновенных моевок (Rissa tridactyla Linnaeus, 1758), глупышей (Fulmarus glacialis Linnaeus, 1761), куликов

(Scolopacidae Vigors, 1825) [16-20, 27-29]. Серологические данные указывают на основное значение в поддержании природного очага среди птиц кайр U. aalge, U. lomvia, топорков и в меньшей степени - бакланов, чаек и глупышей. Находки антител (АТ) у куликов - круглоносого плавунчика (Pholaropus lobatus Linnaeus, 1758) и турухтана (Philomachus pugnax Linnaeus, 1758) - свидетельствуют о возможности заноса клещей I. uriae и вируса в Южное полушарие, тогда как чистиковые птицы в Северном и пингвины в Южном полушариях, вероятно, реализуют перенос клещей и вируса в циркумполярных направлениях [28-31]. Учитывая ежегодные миграции в Южное полушарие, полагаем, что TYUV может заноситься в этом направлении до ареала I. uriae в колониях пингвинов.

У 10% взрослых и 90% молодых морских котиков (Callorhinus ursinus Linnaeus, 1758) на Командорских островах обнаружены АТ к TYUV, что свидетельствует об активном вовлечении этих животных в циркуляцию вируса. Находки АТ у коров и коренного населения Командорских островов [15, 16] указывают на участие ко-

21

маров (вероятнее всего, Aedes communis, Ae. punctor и Ae. excrucians) в циркуляции TYUV в летний период с трансмиссивной передачей. TYUV изолирован на ЮгоВосточном побережье Чукотки (63° с.ш., 180° в.д.) от бе-рингийского (американского длиннохвостого) суслика (Citellus (Urocitellus) parryi Richardson, 1825). Это еще одно свидетельство выплеска вирусной популяции на материк с вовлечением грызунов в циркуляцию вируса. В дальневосточной части ареала, включая биологическую трансмиссию комарами [16], о такой возможности свидетельствуют и положительные результаты серологического обследования коренного населения тундры прибрежных районов Чукотки (8,4%), лесотундры побережий Охотского и Берингова морей (4,2%), тайги на острове Сахалин (7,4%) [16].

Специфические противовирусные АТ (до 9,1%) обнаружены и у коренного населения (саами, коми, ненцы) в тундровом поясе на побережье Кольского полуострова. Положительные результаты также отмечены у КРС (28,1%), круглоносого плавунчика, пуночки (Plectrophenax nivalis Linnaeus, 1758), турухтана, грызунов - полевок-экономок (Microtus oeconomus Pallas, 1776) [16]. Эти находки свидетельствуют о выплеске вирусной популяции из мест гнездовий на материк и в атлантической части ареала. В этом процессе принимают участие комары Ae. communis, Ae. punctor, Ae. excrucians - их зараженность в конце июля - начале августа достигает 0,3% в местах гнездовий морских птиц и 0,1% на побережье.

Экспериментальная инфекция TYUV на модели Ae. aegypti показала наличие вируса с 4-х по 31-е сутки после инокуляции. Титры вируса достигали 1,5-2 lg LD50/10 мкл на 4-17-е сутки, 3-3,5 lg LD50/10 мкл на 23-27-е сутки и снижались до 1,5 lg LD50/10 мкл к 31-м суткам. Трансмиссивная передача в процессе кормления вирусофорных комаров на новорожденных мышах установлена с 7-х по 19-е сутки после заражения. В комарах Culex pipiens molestus вирус обнаруживали на 5-21-е сутки (период наблюдения) после заражения в титрах 1-2 lg LD50/10 мкл [17].

При экспериментальном заражении обыкновенных моевок (Rissa tridactyla Linnaeus, 1758), серебристых чаек (Larus argentatus Pontoppidan, 1763) и толстоклювых кайр (Uria lomvia Linnaeus, 1758) развивались клинические признаки поражения ЦНС, иногда с летальным исходом [32].

У человека при посещении мест сбора полевого материала развивалось общелихорадочное заболевание [33].

Зараженность нимф и личинок I. uriae в 2-20 раз меньше по сравнению с таковой имаго. Зараженность имаго самок и самцов (имеют рудиментарный гипостом, не напитываются кровью) одного порядка [16]. Эти данные свидетельствуют о наличии трансстадийной и трансовариальной передачи TYUV (~5%) в процессе метаморфоза I. uriae. Вместе с тем TYUV не был изолирован от I. signatus Birula, 1895.

Занос TYUV из Северного в Южное полушарие осуществляется птицами примерно 20 видов, главным образом куликами (например, камнешарками Arenaria interpres Linnaeus, 1758), которые гнездятся на севере Азии, а зимуют в Австралии и Новой Зеландии. Буревестники (Puffinus pacificus Gmelin, 1789) гнездятся в Южном полушарии и совершают ежегодный круиз вдоль побережий Тихого океана вплоть до Северной Евразии и Северной Америки [20, 34].

Генетическая близость TYUV и KAMV пока не имеет четкого объяснения, поскольку в настоящее время не существует экологических связей между популяциями чистиковых птиц севера умеренного пояса и в субаркти-ке с популяциями ласточек-береговушек в центральной

части Русской равнины. Изоляция KAMV, антигенно и генетически близкого TYUV, свидетельствует о древних связях флавивирусов с иксодовыми клещами - облигатными паразитами колониальных птиц и птиц норово-убежищных биоценозов - не только на прибрежной океанической, но и на материковой частях ареала [15, 20, 29, 34-36].

MEAV и SREV, генетически близкие TYUV, в эволюционном плане, вероятно, являются промежуточными звеньями между передаваемыми клещами вирусами морских птиц и позднее сформировавшимися передаваемыми клещами вирусами млекопитающих [11, 12].

Основной переносчик TYUV в субарктике - I. uriae, адаптированный к морским птицам, в условиях субтропиков-тропиков замещается аргасовыми клещами комплекса Ornithodoros capensis и в ряде случаев Argas loculosum [19]. Северная граница ареала клещей рода Argas ограничена изотермой июля 15-20°С, а рода Ornithodoros - 20-25°С в Европе и 25-30°С в Азии [21, 22, 29, 37].

Переносчик KAMV I. lividus имеет транспалеаркти-ческое распространение - от Британских островов на западе до Японских островов на востоке, а с севера на юг - от 62° с.ш. до 43° с.ш. Этот вид клещей отличается экстразональной приуроченностью и обитает в гнездах ласточек-береговушек (Riparia riparia Linnaeus, 1758) в обрывах мягкого грунта по берегам рек и озер в поясах тайги, лиственных лесов, лесостепи и степи. I. lividus яв-ляется типичным гнездово-норовым паразитом и строго соответствует жизненному циклу хозяина: после прилета птиц в мае в гнездах на них нападают личинки; в июне нимфы питаются на птенцах; самки имаго (самцы не питаются) тоже питаются на птенцах и в начале августа откладывают яйца, из которых в конце августа появляются личинки [38].

Зондирование территорий высоких широт и Русской равнины проводили в рамках Программы по биобезопасности и изучению биоразнообразия в экосистемах Северной Евразии [21, 22, 29, 39].

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.

Работа выполнена при финансовой поддержке РФФИ, проект № 13-04-01749а.

ЛИТЕРАТУРА

1. Львов Д.К., Тимофеева А.А., Громашевский В.Л., Червонский В.И. Изоляция арбовирусов от клещей Ixodes (Ceratixodes) pu-tus Pick.-Camb. 1878, собранных в колонии птиц на о. Тюлений, Охотское море. Вопросы вирусологии. 1970; 15 (4): 440-4.

2. Львов Д.К., Тимофеева А.А., Червонский В.И., Громашевский В.Л., Клисенко Г.А. Вирус Тюлений: предположительно новый арбовирус из группы В. Вопросы вирусологии. 1971; 16 (2): 180-4.

3. Lvov D.K., Chervonski VI., Gostinshchikova I.N., Zemit A.S., Gro-mashevski V.L., Tsyrkin Y.M., Veselovskaya O.V Isolation of Tyuleniy virus from ticks Ixodes (Ceratixodes) putus Pick.-Camb. 1878 collected on Commodore Islands. Arch. Ges. Virusforsch. 1972; 38 (2): 139-42.

4. Lvov D.K., Timopheeva A.A., Chervonski V.I., Gromashevski V.L., Klisenko G.A., Gostinshchikova G.V, Kostyrko I.N. Tuleniy virus. A new Group B arbovirus isolated from Ixodes (Ceratixodes) putus Pick.-Camb. 1878 collected on Tuleniy Island, Sea of Okhotsk. Am. J. Trop. Med. Hyg. 1971; 20 (3): 456-60.

5. Tyuleniy virus. In: Karabatsos N., ed. International Catalogue of arboviruses and some others viruses of vertebrates. San Antonio (Texas): American Society of Tropical Medicine and Hygiene; 1985: 1045-6.

6. Meaban virus. In: Karabatsos N., ed. International Catalogue of arboviruses and some others viruses of vertebrates. San Antonio (Texas): American Society of Tropical Medicine and Hygiene; 1985: 675-6.

7. Chastel C., Main A.J., Guiguen C., leLay G., QuillienM.C., Monnat J.Y., Beaucournu J.C. The isolation of Meaban virus, a new Flavivi-rus from the seabird tick Ornithodoros (Alectorobius) maritimus in France. Arch. Virol. 1985; 83 (3-4): 129-40.

8. Saumarez Reef virus. In: Karabatsos N., ed. International Catalogue of arboviruses and some others viruses of vertebrates. San Antonio (Texas): American Society of Tropical Medicine and Hygiene; 1985:

22

913-4.

9. St George T.D., StandfastH.A., Doherty R.L., Carley J.G., Fillipich C., Brandsma J. The isolation of Saumarez Reef virus, a new flavivi-rus, from bird ticks Ornithodoros capensis and Ixodes eudyptidis in Australia. Aust. J. Exp. Biol. Med. Sci. 1977; 55 (5): 493-9.

10. Gadget’s Gully virus. In: Karabatsos N., ed. International Catalogue of arboviruses and some others viruses of vertebrates. San Antonio (Texas): American Society of Tropical Medicine and Hygiene; 1985: 407-8.

11. Zanotto PM., Gao G.F., Gritsun T., MarinM.S., Jiang W.R., Venugo-palK. et al. An arbovirus cline across the northern hemisphere. Virology. 1995; 210 (1): 152-9.

12. Grard G., Moureau G., Charrel R.N., Lemasson J.J., Gonzalez J.P., Gallian P. et al. Genetic characterization of tick-borne flaviviruses: new insights into evolution, pathogenetic determinants and taxonomy. Virology. 2007; 361 (1): 80-92.

13. SimmondsP., BecherP., CollettM.S., GouldE.A., HeinzF.X., Mergers G. et al. Flaviviridae. In: King A.M.Q., Adams M.J., Carstens E.B., Lefkowitz E.J., eds. Virus taxonomy. 9-th ed. Elsevier Academic Press; 2012: 1003-20.

14. Львов Д.К., АристоваВ.А., Громашевский В.Л., Скворцова Т.М., Бойко В.А., Мельникова Е.Э. и др. Новый вирус Кама (Flaviviridae, Flavivirus, антигенная группа Тюлений), изолированный из клещей Ixodes lividus. Вопросы вирусологии. 1998; 43 (2): 71-4.

15. Lvov D.K., Timopheeva A.A., Smirnov V.A., Gromashevsky V.L., Sidorova G.A., NikiforovL.P. et al. Ecology of tick-borne viruses in colonies of birds in the USSR. Med. Biol. 1975; 53 (5): 325-30.

16. Lvov S.D. Natural virus foci in high latitudes of Eurasia. In: Sov. Med. Rev. Sec. E: Virol. Rev. Harwood (USA): Ac. Publ. GmbH; 1993; 3: 137-85.

17. Львов С.Д. Арбовирусы в высоких широтах. В кн.: Львов Д.К., Клименко С.М., Гайдамович С.Я. Арбовирусы и арбовирусные инфекции. М.: Медицина; 1989: 269-89.

18. LvovD.K., Gromashevski VL., Skvortsova TM., BerezinaL.K., Gofman Y.P., Zhdanov V.M. et al. Arboviruses of high latitudes in the USSR. In: Kurstak E., ed. Arctic and tropical arboviruses. New York, San-Francis-co, London: Harcourt Brace Jovanovich Publ.; 1979: 21-38.

19. Львов Д.К. Природные очаги связанных с птицами арбовирусов СССР. В кн.: Львов Д.К., Ильичев В.Д. Миграции птиц и перенос возбудителей инфекции. М.: Наука; 1979: 37-101.

20. Тимофеева А.А., Погребенко А.Г., Громашевский В.Л., Щербина Р.Д., Евсеева Т.И., Львов Д.К., Сазонов А.А. Очаговость природных инфекций на острове Ионы в Охотском море. Зоологический журнал. 1974; 53 (6): 906-11.

21. Львов Д.К., Дерябин П.Г., Аристова В.А., Бутенко А.М., Галкина И.В., Громашевский В.Л. и др. Атлас распространения возбудителей природно-очаговых вирусных инфекций на территории Российской Федерации. М.: МЗ РФ; 2001.

22. Щелканов М.Ю., Громашевский В.Л., Львов Д.К. Роль экологовирусологического районирования в прогнозировании влияния климатических изменений на ареалы арбовирусов. Вестник РАМН. 2006; (2): 22-5.

23. Альховский С.В., Щетинин А.М., Львов Д.К., Щелканов М.Ю., Дерябин П.Г., Львов Д.Н. и др. Вирус Хурдун (KHURV): новый вирус рода Orthobunyaviridae (Bunyaviridae). Вопросы вирусологии. 2013; 58 (4): 10-3.

24. Альховский С.В., Львов Д.К., Щелканов М.Ю., Щетинин А.М., Краснослободцев К.Г., Дерябин П.Г. и др. Молекулярногенетическая характеристика вирусов Бханджа (BHAV) и Раздан (RAZV) (Bunyaviridae, Phlebovirus), изолированных от иксодовых клещей Rhipicephalus bursa Canestrini et Fanzago, 1878 и Dermacentor marginatus Sulzer, 1776 в Закавказье. Вопросы вирусологии. 2013; 58 (4): 14-9.

25. Thompson J.D., HigginsD.G., Gibson T.J. CLUSTAL W: improving the sensitivity of progressive multiple sequence alignment through sequence weighting, position-specific gap penalties and weight matrix choice. Nucl. Acids Res. 1994; 22 (22): 4673-80.

26. Tamura K., Peterson D., Peterson N., Stecher G., Nei M., Kumar S. MEGA 5: molecular evolutionary genetics analysis using maximum likelihood, evolutionary distance, and maximum parsimony methods. Mol. Biol. Evol. 2011; 28 (10): 2731-9.

27. Clifford C.M., Yunker C.E., Thomas L.A., Easton E.R., Corwin D. Isolation of a group B arbovirus from Ixodes uriae collected on Three Arch Rocks national wildlife refuge, Oregon. Am. J. Trop. Med. Hyg. 1971; 20 (3): 461-8.

28. Balashov Yu.S. Bloodsucking ticks (Ixodoidea) - vectors of diseases of men and animals. In: Hoogstraal H., ed. Medical zoology dep. USA Nav. Med. Res. Unit. Cairo (Egypt); 1968.

29. Львов Д.К. Экология вирусов. В кн.: Львов Д.К., ред. Руководство по вирусологии. Вирусы и вирусные инфекции. М.: МИА; 2013: 68-86.

30. Clifford C.M. Tick-borne viruses in sea-birds. In: Kurstak E., ed. Arctic and tropical arboviruses. New York, San-Francisco, London: Harcourt Brace Jovanovich Publ.; 1979: 83-100.

31. Thomas L.A., Clifford C.M., Yunker C.E., Keirans J.E., Patzer E.R.,

Monk G.E., Easton E.R. Tickborne viruses in western North America. I. Viruses isolated from Ixodes uriae in coastal Oregon in 1970. J. Med. Entomol. 1973; 10 (2): 165-8.

32. БерезинаЛ.К., СмирновВ.А., ЗеленскийВ.А. Экспериментальная инфекция птиц при заражении вирусом тюлений. В кн.: Львов Д.К., ред. Экология вирусов. М.: РАМН; 1974: 13-7.

33. Вотяков В.И., Воинов И.Н., Самойлова Т.И., Лешко С.Т., Гем-битский А.С., Смирнов В.А. Выделение арбовирусов от колониальных птиц Баренцева моря. В кн.: Материалы симпозиума по экологии вирусов, связанных с птицами. Минск; 1974: 42-4.

34. Львов С.Д. Концепция циркумполярного распространения арбовирусов. В кн.: Материалы 18-го съезда общества микробиологов, эпидемиологов и паразитологов. Алма-Ата; 1989: 224-5.

35. ЕфремоваГ.А. Роль обитателей гнезд ласточек в резервации природноочаговых инфекций. В кн.: Материалы 12-й Всесоюзной конференции по природной очаговости болезней. Новосибирск; 1989: 79-80.

36. Бабенко Л.В. Ixodes lividus Koch как представитель иксодовых клещей норово-убежищного комплекса. В кн.: Познание фауны и флоры СССР. 1956; вып. 3: 21-105.

37. ФилипповаН.А. Фауна СССР. Паукообразные. М.; Л.: АН СССР; 1966: 4 (3): Аргасовые клещи (Argasidae).

38. ФилипповаН.А. Фауна СССР. Л.: Наука; 1977: 4 (4): Паукообразные. Иксодовые клещи подсем. Ixodinae.

39. Львов Д.К, ред. Организация эколого-эпидемиологического мониторинга территории Российской Федерации с целью противоэпидемической защиты населения и войск. Методические рекомендации. М.: МЗ РФ, Федеральное управление медикобиологических и экстремальных проблем, НИИ вирусологии им. Д.И. Ивановского РАМН; 1993.

REFERENCES

1. L’vov D.K., Timofeeva A.A., Gromashevskii V.L., Chervonskii V.I. Isolation of arboviruses from Ixodes (Ceratixodes) putus Pick-Cambr. ticks collected in a bird colony on the island of Tiulenii in the Sea of Okhotsk. Voprosy virusologii. 1970; 15 (4): 440-4 (in Russian).

2. L’vov D.K., Timofeeva A.A., Gromashevskii V.L., Chervonskii V.I. Proposed new arbovirus “Tulenii” isolated from Ixodes putus ticks from a bird colony in the Okhotsk sea. Voprosy Virusologii. 1971; 16 (2): 180-4 (in Russian).

3. Lvov D.K., Chervonski V.I., Gostinshchikova I.N., Zemit A.S., Gromashevski V.L., Tsyrkin Y.M., Veselovskaya O.V Isolation of Tyuleniy virus from ticks Ixodes (Ceratixodes) putus Pick.-Camb. 1878 collected on Commodore Islands. Arch. Ges. Virusforsch. 1972; 38 (2): 139-42.

4. Lvov D.K., Timopheeva A.A., Chervonski VI., Gromashevski VL., Klisenko G.A., Gostinshchikova G.V, Kostyrko I.N. Tuleniy virus. A new Group B arbovirus isolated from Ixodes (Ceratixodes) putus Pick.-Camb. 1878 collected on Tuleniy Island, Sea of Okhotsk. Am. J. Trop. Med. Hyg. 1971; 20 (3): 456-60.

5. Tyuleniy virus. In: Karabatsos N., ed. International Catalogue of arboviruses and some others viruses of vertebrates. San Antonio (Texas): American Society of Tropical Medicine and Hygiene; 1985: 1045-6.

6. Meaban virus. In: Karabatsos N., ed. International Catalogue of arboviruses and some others viruses of vertebrates. San Antonio (Texas): American Society of Tropical Medicine and Hygiene; 1985: 675-6.

7. Chastel C., MainA.J., Guiguen C., leLay G., QuillienM.C., Monnat J.Y., Beaucournu J.C. The isolation of Meaban virus, a new Flavivi-rus from the seabird tick Ornithodoros (Alectorobius) maritimus in France. Arch. Virol. 1985; 83 (3-4): 129-40.

8. Saumarez Reef virus. In: Karabatsos N. (ed.) International Catalogue of arboviruses and some others viruses of vertebrates. San Antonio (Texas): American Society of Tropical Medicine and Hygiene; 1985: 913-4.

9. St George T.D., StandfastH.A., Doherty R.L., Carley J.G., Fillipich C., Brandsma J. The isolation of Saumarez Reef virus, a new flavivi-rus, from bird ticks Ornithodoros capensis and Ixodes eudyptidis in Australia. Aust. J. Exp. Biol. Med. Sci. 1977; 55 (5): 493-9.

10. Gadget’s Gully virus. In: Karabatsos N., ed. International Catalogue of arboviruses and some others viruses of vertebrates. San Antonio (Texas): American Society of Tropical Medicine and Hygiene; 1985: 407-8.

11. Zanotto PM., Gao G.F., Gritsun T., Marin M.S., Jiang W.R., Venugo-palK., et al. An arbovirus cline across the northern hemisphere. Virology. 1995; 210 (1): 152-9.

12. Grard G., Moureau G., Charrel R.N., Lemasson J.J., Gonzalez J.P., Gallian P., et al. Genetic characterization of tick-borne flaviviruses: new insights into evolution, pathogenetic determinants and taxonomy. Virology. 2007; 361 (1): 80-92.

13. SimmondsP., BecherP., CollettM.S., GouldE.A., HeinzF.X., Mergers G. et al. Flaviviridae. In: King A.M.Q., Adams M.J., Carstens E.B., Lefkowitz E.J., eds. Virus taxonomy. 9-th ed. Elsevier Academic Press; 2012: 1003-20.

14. L’vov D.K., Aristova V.A., Gromashevskii V.L., Skvortsova T.M., Boiko V.A., Mel’nikovaE.E. et al. Kama, a new virus (Flaviviridae,

23

Flavivirus, Tiulenii antigenic group), isolated from Ixodes lividus ticks. Voprosy Virusologii. 1998 Mar-Apr; 43 (2):71-4 (in Russian).

15. LvovD.K., TimopheevaA.A., Smirnov V.A., Gromashevsky V.L., Sidorova G.A., NikiforovL.P. et al. Ecology of tick-borne viruses in colonies of birds in the USSR. Med. Biol. 1975; 53 (5): 325-30 (in Russian).

16. Lvov S.D. Natural virus foci in high latitudes of Eurasia. In: Sov. Med. Rev. Sec. E: Virol. Rev. Harwood (USA): Ac. Publ. GmbH; 1993; 3: 137-85.

17. Lvov S.D. Arboviruses in high latitudes. In.: Lvov D.K., Klimenko S.M., Gaidamovich S.Y. (reds.) Arboviruses and arbovirus infection. М.: Meditcina; 1989: 269-89 (in Russian).

18. LvovD.K., Gromashevski V.L., Skvortsova T.M., BerezinaL.K., Gofman Y.P., Zhdanov V.M, et al. Arboviruses of high latitudes in the USSR. In: Kurstak E., Ed. Arctic and tropical arboviruses. New York, San-Francis-co, London: Harcourt Brace Jovanovich Publ.; 1979; 21-38.

19. Lvov D.K. Natural foci of arboviruses, associated with the birds in USSR. In.: Lvov D.K., Ilyichev V.D. Migration of the birds and transduction of contagium. М.: Nauka; 1979; 37-101 (in Russian).

20. Timofeeva А.А., Pogrebenko А.G., Gromashevskii V.L., Scherbina Р.Д., Евсеева Т.И., Львов Д.К., Сазонов А.А. Natural foci of infection on the Iona island in Okhotsk sea. Zoologicheskiy Journal. 1974; 53 (6): 906-11 (in Russian).

21. LvovD.K., DeryabinP.G., Aristova V.A., ButenkoA.M., GalkinaI.V., Gromashevsky V.L. et al. Atlas of distribution of natural-focal viruses infection on the territory of Russian Federation. М.: Minzdrav RF; 2001 (in Russian).

22. SchelkanovM. Yu., Gromashevsky V. L., LvovD.K. The role of ecovi-rological zoning in prediction of the influence of climatic changes on arbovirus habitats. Vestnik Ross. Acad. Med. Nauk. 2006; (2): 22-5 (in Russian).

23. Alkhovsky S.V., Shchetinin A.M., Lvov D.K., Shchelkanov M.Yu., DeryabinP.G., LvovD.N. et al. Khurdun virus (KHURV): a new representative of orthobunyavirus (bunyaviridae). Voprosy Virusologii. 2013; 58(4): 10-3 (in Russian).

24. Alkhovsky S.V., Lvov D.K., Shchelkanov M.Yu., Shchetinin A.M., Krasnoslobodtsev K.G., Deryabin P.G. et al. Molecular - Genetic Characterization of Bhanja Virus (BHAV) and Razdan Virus (RAZV) (Bunyaviridae, Phlebovirus), Isolated from Ixodes Tiks Rhipicepha-lus Bursa Canestrini & Fanzago, 1878, And Dermacentor Marginatus Sulzer, 1776, In Transcaucasus. Voprosy Virusologii. 2013; 58 (4): 14-9 (in Russian).

25. Thompson J.D., HigginsD.G., Gibson T.J. CLUSTAL W: improving the sensitivity of progressive multiple sequence alignment through sequence weighting, position-specific gap penalties and weight matrix choice. Nucl. Acids Res. 1994; 22 (22): 4673-80.

26. TamuraK., Peterson D., PetersonN., Stecher G., NeiM. andKumar

S. MEGA5: molecular evolutionary genetics analysis using maximum likelihood, evolutionary distance, and maximum parsimony methods. Mol. Biol. Evol. 2011; 28 (10): 2731-9.

27. Clifford C.M., Yunker C.E., Thomas L.A., Easton E.R., Corwin D. Isolation of a group B arbovirus from Ixodes uriae collected on Three Arch Rocks national wildlife refuge, Oregon. Am. J. Trop. Med. Hyg. 1971; 20 (3): 461-8.

28. Balashov Yu.S., Bloodsucking ticks (Ixodoidea) - vectors of diseases of men and animals. In: Hoogstraal H., ed. Medical zoology dep. USA Nav. Med. Res. Unit. Cairo (Egypt); 1968.

29. Lvov D.K. Ecology of the Viruses. In.: Lvov D.K., ed. Guidance on Virology. Viruses and viral Infections. М.: MIA; 2013: 68-86 (in Russian).

30. Clifford C.M. Tick-borne viruses in sea-birds. In: Kurstak E., ed. Arctic and tropical arboviruses. New York, San-Francisco, London: Harcourt Brace Jovanovich Publ.; 1979: 83-100.

31. Thomas L.A., Clifford C.M., Yunker C.E., Keirans J.E., Patzer E.R., Monk G.E., Eatson E.R. Tick-borne viruses in western North America. I. Viruses isolated from Ixodes uriae in coastal Oregon in 1970. J. Med. Entomol. 1973;10 (2): 165-8.

32. BerezinaL.K., Smirnov КА., Zelensky КА. Experimental infection of birds with Tulenii virus. In.: L’vov D.K., ed. Ecology of Viruses. М.: Russian Acad. Med. Nauk; 1974: 13-7 (in Russian).

33. Votyakov V.I., Voinov I.N., Samoilova T.I., Leshko S.Т., Gembitskii A.S., Smirnov V.A. Isolation of arboviruses from colonial birds in Barentsev sea. In.: Proceeding of the symposium for ecology of the viruses, associated with birds. Minsk; 1974: 42-4 (in Russian).

34. Lvov S.D. Concept of circumpolar distribution of arboviruses. In.: Proceeding of 18 Congress of Society of Microbiologists, Epidemiologists and Parasitologistes. Alma-Ata; 1989: 224-5 (in Russian).

35. Efremova G.A. The role of the swallows nests inhabitants in reservation of natural-focal infections. In: Proceeding 12th All-Union conference for natural-focal illness. Navosibirsk, 1989: 79-80 (in Russian).

36. BabenkoL.V Ixodes lividus Koch as a representative of ixodes ticks of hole-asylum complex. In: Cognition of Flora and Fauna of USSR. 1956; Vol. 3: 21-105 (in Russian).

37. Filippova N.A. Fauna of USSR. M.; L.: AS USSR; 1966; 4 (3): Arachnida. Argas ticks (Argasidae) (in Russian).

38. Filippova N.A. Fauna of USSR. L.: Nauka; 1977: 4 (4): Arachnida. Ixodes ticks subfamily Ixodinae (in Russian).

39. Lvov D.K., ed. Organization of ecological-epidemiological monitoring in Russian Federation for anti-epidemic defense civilians and army. М.: Minzdrav RF, The Federal Office of Biomedical and Extreme Problems, The D.I. Ivanovsky Institute of Virology; 1993 (in Russian).

Поступила 26.09.13

© КОЛЛЕКТИВ АВТОРОВ, 2014 УДК 578.833.11:578.5].083.2

Д.К. Львов, С.В. Альховский, М.Ю. Щелканов, А.М. Щетинин, П.Г. Дерябин, Е.И. Самохвалов,

А.К. Гительман, А.Г. Ботиков

Генетическая характеристика вируса Каспий (CASV - Caspiy virus) (Bunyaviridae, Nairovirus), изолированного от чайковых (Laridae Vigors, 1825) и крачковых (Sternidae Bonaparte, 1838) птиц и аргасовых клещей Ornithodoros Capensis Neumann, 1901 (Argasidae Koch, 1844), на западном и восточном побережьях Каспийского моря

ФГБУ «НИИ вирусологии им. Д.И. Ивановского» Минздрава России, 123098, Москва

Полногеномное секвенирование вируса Каспий (CASV - Caspiy virus) (iD GenBank KF801658) показало его принадлежность к роду Nairovirus сем. Bunyaviridae в качестве самостоятельного вида. cAsV формирует отдельную ветвь, наиболее близкую к вирусам групп Хьюз (HUGV - Hughes virus) и Сахалин (SakV -Sakhalin virus), представители которых связаны с морскими птицами и паразитирующими на них клещами и распространены в шельфовых и островных экосистемах Северной Евразии, а также Северной и Южной Америки.

Ключевые слова: колониальные морские птицы; чайковые - Laridae; крачковые - Sternidae; Argasidae; Ornithodoros; Bunyaviridae; Nairovirus; вирус Каспий - CASV' Каспийское море; метагеномный анализ

Контактная информация:

Львов Дмитрий Константинович, акад. РАН; e-mail: dk_lvov@mail.ru

24

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.