Научная статья на тему 'Формирование ассоциаций облигатно-анаэробных бактерий Толстого кишечника человека'

Формирование ассоциаций облигатно-анаэробных бактерий Толстого кишечника человека Текст научной статьи по специальности «Биотехнологии в медицине»

CC BY
293
34
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
Ключевые слова
ОБЛИГАТНО-АНАЭРОБНЫЕ БАКТЕРИИ / МЕЖМИКРОБНЫЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ / АНТИЛИЗОЦИМНАЯ АКТИВНОСТЬ / БИОПЛЕНКООБРАЗОВАНИЕ / РОСТОВЫЕ СВОЙСТВА / АССОЦИАТИВНЫЙ СИМБИОЗ / OBLIGATE-ANAEROBIC BACTERIA / INTERMICROBIAL INTERACTIONS / ANTILYSOZYME ACTIVITY / BIOFILM FORMATION / GROWTH PROPERTIES / ASSOCIATIVE SYMBIOSIS

Аннотация научной статьи по биотехнологиям в медицине, автор научной работы — Бекпергенова Анастасия Владимировна, Хлопко Юрий Александрович, Иванова Елена Валерьевна, Перунова Наталья Борисовна

Рассмотрение инфекции как формы симбиотических отношений микроорганизмов и человека позволило обосновать представление об инфекции как модельной системе ассоциативного симбиоза. Микросимбиоценоз является одним из векторов ассоциативного симбиоза, где происходит формирование ассоциаций микроорганизмов с различными типами связей. Значительный вклад в понимание инфекционной симбиологии внесли новые методические подходы с использованием персистентного потенциала микробов в оценке микросимбиоценоза. Изучение механизмов межмикробных взаимодействий показало, что в основе формирования микросимбиоценоза лежат связи, обуславливающие характер взаимоотношений синергидные и антагонистические. Поскольку результаты экспериментов in vitro выявили, что под действием супернатантов происходит в разной степени как увеличение, так и снижение биологических свойств, а также наблюдается отсутствие изменения исследуемых показателей (индифферентный эффект), для установления синергидных и антагонистических связей полученный фактический материал был обработан с помощью дискриминантного анализа, который интегрировал исследуемые свойства: ростовые свойства, биопленкообразование, антилизоцимную активность. Это позволило выделить ассоциации с «синергидным» типом связи: B. bifidum/B. longum; B. longum/E. limosum; E. limosum/B. fragillis; C. perfringens/B. fragilis и «антагонистическим» E. limosum/C. perfringens. В естественных условиях подавляющее большинство микроорганизмов существует в виде ассоциаций, формирование которых дает определенное преимущество членам микробного сообщества при выживании в различных биотопах организма человека. Проведенные исследования позволили установить, что помимо ростовых свойств, в ассоциациях облигатно-анаэробных бактерий, происходит изменение биологических свойств (биопленкообразование, антилизоцимная активность), составляющих системообразующий фактор микросимбиоценоза, что вносит вклад в понимание механизмов формирования ассоциативного симбиоза человека и может иметь значение при создании микробных композиций новых синбиотиков.

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

Похожие темы научных работ по биотехнологиям в медицине , автор научной работы — Бекпергенова Анастасия Владимировна, Хлопко Юрий Александрович, Иванова Елена Валерьевна, Перунова Наталья Борисовна

iНе можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.

FORMATION OF ASSOCIATIONS OF OBLIGATE-ANAEROBIC BACTERIA OF THE GUT HUMAN

Examination of infection as a form of symbiotic relationship between microorganisms and humans allowed to substantiate the idea of infection as a model system of associative symbiosis. Microsymbiocenosis is one of the vectors of associative symbiosis, where the formation of associations of microorganisms with different types of bonds takes place. A significant contribution to understanding infectious symbiology has been made by new methodological approaches using the persistent potential of microbes in the evaluation of microsymbiocenosis. The study of the mechanisms of intermicrobial interactions has shown that the basis of the formation of microsymbiocenosis is the relationship that determines the nature of the relationship synergistic and antagonistic. Since the results of the in vitro experiments revealed that under the action of supernatants, both the increase and decrease in biological properties occur to varying degrees, and there is no change in the indices studied (indifferent effect), to obtain synergistic and antagonistic relationships, the resulting factual material was processed with discriminant analysis, which integrated the investigated properties: growth properties, biofilm formation, antilisozime activity. This made it possible to single out associations with a “synergistic” type of bond: B. bifidum / B. longum; B. longum / E. limosum; E. limosum / B. fragillis; C. perfringens / B. fragilis and “antagonistic” E. limosum / C. perfringens. In natural conditions, the vast majority of microorganisms exist in the form of associations, the formation of which gives a certain advantage to members of the microbial community when surviving in various biotopes of the human body. The carried out researches made it possible to establish that in addition to the growth properties in the associations of obligate anaerobic bacteria, there is a change in biological properties (biofilm formation, antilisozime activity) that make up the system-forming factor of microsymbiocenosis, which contributes to understanding the mechanisms of the formation of associative symbiosis of man and can make a difference in the development of microbial compositions of new synbiotics.

Текст научной работы на тему «Формирование ассоциаций облигатно-анаэробных бактерий Толстого кишечника человека»

УДК 579.61

Бекпергенова А.В., Хлопко Ю.А., Иванова Е.В., Перунова Н.Б.

Институт клеточного и внутриклеточного симбиоза УрО РАН, г Оренбург, Россия

E-mail: [email protected]

ФОРМИРОВАНИЕ АССОЦИАЦИЙ ОБЛИГАТНО-АНАЭРОБНЫХ БАКТЕРИЙ ТОЛСТОГО КИШЕЧНИКА ЧЕЛОВЕКА

Рассмотрение инфекции как формы симбиотических отношений микроорганизмов и человека позволило обосновать представление об инфекции как модельной системе ассоциативного симбиоза. Микросимбиоценоз является одним из векторов ассоциативного симбиоза, где происходит формирование ассоциаций микроорганизмов с различными типами связей. Значительный вклад в понимание инфекционной симбиологии внесли новые методические подходы с использованием персистентного потенциала микробов в оценке микросимбиоценоза. Изучение механизмов межмикробных взаимодействий показало, что в основе формирования микросимбиоценоза лежат связи, обуславливающие характер взаимоотношений - синергидные и антагонистические.

Поскольку результаты экспериментов in vitro выявили, что под действием супернатантов происходит в разной степени как увеличение, так и снижение биологических свойств, а также наблюдается отсутствие изменения исследуемых показателей (индифферентный эффект), для установления синергидных и антагонистических связей полученный фактический материал был обработан с помощью дискриминантного анализа, который интегрировал исследуемые свойства: ростовые свойства, биопленкообразование, антилизоцимную активность. Это позволило выделить ассоциации с «синергидным» типом связи: B. bifidum/B. longum; B. longum/E. limosum; E. limosum/B. fragillis; C. perfringens/B. fragilis и «антагонистическим» - E. limosum/C. perfringens.

В естественных условиях подавляющее большинство микроорганизмов существует в виде ассоциаций, формирование которых дает определенное преимущество членам микробного сообщества при выживании в различных биотопах организма человека. Проведенные исследования позволили установить, что помимо ростовых свойств, в ассоциациях облигатно-анаэробных бактерий, происходит изменение биологических свойств (биопленкообразование, антилизоцимная активность), составляющих системообразующий фактор микросимбиоценоза, что вносит вклад в понимание механизмов формирования ассоциативного симбиоза человека и может иметь значение при создании микробных композиций новых синбиотиков.

Ключевые слова: облигатно-анаэробные бактерии, межмикробные взаимодействия, анти-лизоцимная активность, биопленкообразование, ростовые свойства, ассоциативный симбиоз.

Рассмотрение инфекции как формы симбиотических отношений микроорганизмов и человека позволило обосновать представление об инфекции как модельной системе ассоциативного симбиоза. Микросимбиоценоз является одним из векторов ассоциативного симбиоза, где происходит формирование ассоциаций микроорганизмов с различными типами связей [1]. Значительный вклад в понимание инфекционной симбиологии внесли новые методические подходы с использованием персистентного потенциала микробов в оценке микросимбиоценоза. Изучение механизмов межмикробных взаимодействий показало, что в основе формирования микро-симбиоценоза лежат связи, обуславливающие характер взаимоотношений - синергидные и антагонистические [2].

Ранее проведенные исследования взаимоотношений ассоциаций микроорганизмов кишечника проводились на моделях факультативно-анаэробных бактерий. Было установлено изменение персистентных свойств в зависимо-

сти от микроэкологического состояния кишечника человека [3]-[5].

Вместе с тем, отсутствуют работы по изменению биологических свойств облигатно-анаэробных бактерий в ассоциациях при участии их метаболитов, что и определило цель нашей работы.

Цель: определить характер взаимодействий микросимбионтов при формировании ассоциаций облигатно-анаэробных бактерий толстого кишечника человека под контролем ростовых свойств, биоплёнкообразования и антилизоцим-ной активности.

Материалы и методы

В работе по исследованию изменений биологических свойств в ассоциациях облигатно-анаэробных микроорганизмов были изучены по 6 штаммов каждого вида бактерий: Bifidobacterium bifidum, B. longum, B. adolescentis, B. catenulatum, Eubacterium limosum, E. con-tortum, Bacteroides fragillis, B. ovatus, Propionibacterium acnes, P.granulosum, Clostridium ram-

nosum, C. perfringens (коллекция лаборатории биологического мониторинга и молекулярно-генетических исследований Института клеточного и внутриклеточного симбиоза УрО РАН), ранее изолированные из микросимбиоценоза кишечника пациентов при обследовании на дисбиоз и верифицированные с помощью вре-мяпролетной масс-спектрометрии с использованием масс-спектрометра MALDI TOF MS серии Microflex LT c программным обеспечением Maldi BioTyper 3,0 (Bruker Da^on^s, Гер -мания).

Для изучения изменения биологических свойств в ассоциациях облигатно-анаэробных бактерий использовали супернатанты (экзо-метаболиты) микроорганизмов. Для этого воздействующие культуры облигатно-анаэробных бактерий выращивали в питательном бульоне Schaedler (BBL, США) в анаэробном термостате (Binder, Германия) при 370С в течение 48 часов. Конечная оптическая плотность бульонных культур облигатно-анаэробных микроорганизмов в среднем составляла 0,17±0,01 OD450. Далее, полученные культуры центрифугировали при 3000 об/мин в течение 20 минут и стерилизовали фильтрованием, пропуская через мембранные фильтры с диаметром пор 0,2 мкм (Millipore, Франция). Полученные супернатанты облигатно-анаэробных бактерий в количестве 0,1 мл соинкубировали с чистой культурой исследуемых анаэробов, инокулированных в 2,9 мл питательного бульона. В качестве контроля использовали бульонные культуры, выращенные без добавления метаболитов облигатно-анаэробных бактерий.

На заключительном этапе определяли показатели биологических свойств: ростовые свойства (РС) по оптической плотности бульонной культуры на фотометре iEMS-MF (Labsystem, Финляндия), антилизоцимную активность (АЛА) - фотометрическим методом по О.В. Бухарину с соавт. (1999), образование биоплёнок (БПО) на поверхности 96-луночной полисте-роловой стерильного планшета по OToole G. (1999).

Статистическую обработку материалов и графическое изображение результатов проводили с использованием программ: Primer of Biostatics Version 4.03 by Stanton A. Glantz 1998, Microsoft Office Excel 2003. Определяли

М - среднее арифметическое, m - среднюю ошибку среднего арифметического, при этом данные представлялись по форме М±т. Для выявления типов связей («синергидный» тип -«антагонистический» тип) между облигатно-анаэробными бактериями был применен «Дис-криминантный анализ».

Результаты и обсуждения

Полученные экспериментальные данные по изменению биологических свойств микросимбионтов показали, что в ассоциациях облигатно-анаэробных бактерий происходит изменение ростовых свойств, биопленкообразования и антилизоцимной активности исследуемых микроорганизмов. Поскольку результаты проведенных экспериментов in vitro выявили, что под действием супернатантов происходит в разной степени как увеличение, так и снижение биологических свойств, а также наблюдается отсутствие изменения исследуемых показателей (индифферентный эффект), для установления синергидных и антагонистических связей нами была предпринята попытка систематизировать полученный фактический материал с помощью дискриминантного анализа. Для этого полученные экспериментальные данные были объединены в интегральный показатель по все трем биологическим свойствам и представлены в виде адекватного математического выражения:

Д = х1а1 + х2а2 + хза3 + С

где Д - дискриминантная функция, характеризующая искомый вариант взаимодействий между облигатно-анаэробными микроорганизмами; х1- различие между значением ростовых свойств в опыте (под действием супернатантов облигатных бактерий) и контроле (без влияния супернатантов исследуемых анаэробов) в %; х2 - различие между значением биопленкообра-зования в опыте (под действием супернатантов облигатных бактерий) и контроле (без влияния супернатантов исследуемых анаэробов) в %; х3 -различие между значением антилизоцимной активности в опыте (под действием супернатантов облигатных бактерий) и контроле (без влияния супернатантов исследуемых анаэробов) в %; а - коэффициент показателя; С - поправочная константа.

Бекпергенова А.В. и др.

Формирование ассоциаций облигатно-анаэробных бактерий...

В таблице 1 представлены коэффициенты (а) для каждого показателя и поправочные константы.

Для установления принадлежности исследуемых штаммов по направленности действия к «синергидным» или «антагонистическим» связям, находили разницу полученных у исследуемых штаммов облигатных бактерий количественных значений по показателям в опыте (различие между значением свойства в опыте (под действием супернатантов облигатных бактерий) и контроле (без влияния супернатантов исследуемых анаэробов), переводя их в проценты и используя для расчета дискриминантной функции по приведенной формуле [7]. Расчет проводили по всем строкам соответствующей таблицы.

Наибольшая величина дискриминантной функции из всех полученных будет в 82,4% случаев соответствовать обозначенному на данной строке результату (типу) направленности взаимодействий.

К примеру, исследуемый штамм B. longum характеризовался следующими признаками: РС - 0,74 ОБ450, БПО - 0,35 ед., АЛА - 0,8 мкг/ мл*ОБ, после воздействия экзометаболитов B. bifidum, исследуемые свойства B. longum изменились: РС - 0,9 ОБ450, БПО - 0,48 ед., АЛА - 1,0 мкг/мл*ОБ. Разница между опытным и контрольными значениями в процентах составила: РС - (+21%), БПО - (+37%), АЛА -(+20%). Расчет по формуле с использованием представленных в таблице коэффициентов показал, что:

Дс = 6,62144 • 21 + 6,36149 • 37 + 1,35796

• 20 + (-5,58339) = 395,96

Да = 5,76822 • 21 + 3,29663 • 37 + 0,56319

• 20 + (-3,39738) = 250,9

В результате проведенного расчета максимальная величина дискриминантной функции установлена на первой строке (Д ), что

позволило выявить «синергидный» тип связи между исследуемыми культурами B. bifidum и

B. longum.

Другой штамм C. perfringens характеризовался следующими признаками: РС - 0,8 ОБ450, БПО - 0,38 ед., АЛА - 0,59 мкг/мл*ОБ, после воздействия экзометаболитов B. bifidum, исследуемые свойства C. perfringens изменились: РС - 0,2 ОБ450, БПО - 0,1 ед., АЛА - 0,35 мкг/ мл*ОБ. Разница между опытным и контрольными значениями в процентах составила: РС -(- 75%), БПО - (- 74%), АЛА - (-41%). Расчет по формуле с использованием представленных в таблице коэффициентов показал, что:

Дс = 6,62144 • (-75) + 6,36149 • (-74) + 1,35796 • (-41) + (-5,58339) = -1028,48

Да = 5,76822 • (-63) + 3,29663 • (-52) + 0,56319 • (-51) + (-3,39738) = -703,08

В результате проведенного расчета максимальная величина дискриминантной функции установлена на второй строке (Да), что позволило выявить «антагонистический» тип связи между исследуемыми культурами B. bifidum и

C. perfringens. Помимо распространенности типов взаимодействий, мы находили медианы и квартили значений каждой отдельной группы ассоциаций облигатно-анаэробных бактерий.

При анализе распространенности типов взаимодействий между исследуемыми штаммами облигатно-анаэробных бактерий все исследуемые группы микроорганизмов были представлены в виде графиков (рис. 1).

Как видно из рисунка, при влиянии суперна-тантов бифидобактерий на культуры B. bifidum в большинстве случаев (72±0,69%) наблюдался «синергидный» тип взаимодействий (630 [441; 720]). Такой же тип взаимодействий был характерен при действии супернатантов B. longum (в 94±0,33% случаев, 663 [542; 765]), B. adolescentis (в 82±1,02% случаев, 495 [344; 863]) и В. еагепи-1аШш (в 97±0,1% случаев, 721 [692; 750]). Реже

Таблица 1 - Коэффициенты показателей и поправочные константы для дифференциации «синергидных» и «антагонистических» связей облигатно-анаэробных бактерий

Связи Ростовые свойства БПО АЛА С

«синергидные» связи (Дс) 6,62144 6,36149 1,35796 -5,58339

«антагонистические» связи (Да) 5,76822 3,29663 0,56319 -3,39738

встречался «антагонистический» тип взаимодействий, который был выявлен не более чем в 27% случаев для штаммов B. bifidum.

Аналогичная картина наблюдалась при действии исследуемых супернатантов облигатно-анаэробных бактерий на культуры B. longum. «Синергидный» тип взаимодействий был характерен для 63±0,88% случаев (828 [625; 991]) при влиянии супернатантов B. bifidum на B. longum. Такой же тип взаимодействий наблюдался при действии супернатантов B. longum (в 91±0,41% случаев, 824 [552; 940]), B. ado-lescentis (в 72±0,69% случаев, 725 [568; 780]) и B. catenulatum (в 63±0,88% случаев, 739 [496; 750]). Напротив, «антагонистический» тип взаимодействий встречался реже и был выявлен в 37% случаев у штаммов B. longum.

При влиянии исследуемых супернатантов на культуры P. acnes был характерен «антагонистический» тип взаимодействий: в 76±1,22% случаев при влиянии экзометаболитов B. bifidum (-252 [-382; 154]), в 62±0,98% - при влиянии B. longum (-305 [-538; 269]) и в 67±1,92% - при действии супернатантов B. adolescentis (-315 [422; -151]). «Синергидный» тип наблюдался при взаимодействии супернатантов B. catenulatum и культур пропионибактерий в 97±0,1% случаев (519 [432; 606]).

При действии экзометаболитов B. bifidum, B. longum, B. adolescentis и B. catenulatum на культуры E. limosum «синергидный» тип взаимодействий наблюдался не более чем в 67% случаев. При влиянии супернатантов бифидо-

бактерий на культуры эубактерий в большинстве случаев (60±0,69%) наблюдался «синергидный» тип взаимодействий (630 [441; 720]). Такой же тип взаимодействий был характерен при действии супернатантов B. longum (в 67±0,33% случаев, 663 [542; 765]), B. adoles-centis (в 60±1,02% случаев, 495 [344;863]) и B. catenulatum (в 60±0,1% случаев, 721 [692;750]). Реже встречался «антагонистический» тип взаимодействий, который был выявлен не более чем у 40% штаммов эубактерий.

Напротив, для культур B. fragiШs и C. per-fringens чаще были характерны «антагонистические» взаимодействия с исследуемыми культурами бифидобактерий. При действии метаболитов B. catenulatum на бактероидов (-105 [238; 29] и клостридий (-112 [242; 19]) в 97±0,1% случаев наблюдался «антагонистический» тип. Напротив, «синергидный» тип взаимодействий был выявлен не более чем у 46±2,0% бактероидов и 47±1,67 клостридий % в зависимости от вида бифидобактерий.

При влиянии супернатантов клостридий на культуры B. bifidum в 73±1,57% (670 [468; 882] и B. longum в 97±0,1 % (236 [174; 421] наблюдался «синергидный» тип взаимодействий (рис. 2). Такой же тип был характерен при влиянии исследуемого экзометаболита на бактероидов (в 82±0,9 % случаев, 834 [618; 1016] и клостридий (в 87±0,93 % случаев, 877 [720; 1018].

«Синергидный» тип взаимодействий наблюдался при действии супернатантов бактероидов на B. bifidum (в 97±0,1% случаев, 385

Рисунок 1 - Распространенность типов взаимодействий между облигатно-анаэробными микроорганизмами под влиянием супернатантов В. Ы/Ыыш, В. ¡ощыш, В. айо1езсепйз и В. саЬепиШиш

Бекпергенова А.В. и др.

Формирование ассоциаций облигатно-анаэробных бактерий..

[384; 406]), B. longum (в 97±0,1% случаев, 596 [588; 603]), E. limosum (в 80±1,4% случаев, 612 [599; 671]), B. fragillis (в 80±2,0% случаев, 516 [493; 534]) и C. perfringens (в 60±2,83% случаев, 503 [471; 599]). «Антагонистический» тип был характерен для культур пропионибактерий в 97±0,1% случаев (-429 [-451; -333]).

Аналогичная картина наблюдалась при действии исследуемых супернатантов E. limosum на культуры B. bifidum в 60±2,83% случаев (600 [578; 741]), B. longum в 67±3,32% случаев (635 [611; 660]), P. acnes в 97±0,1% случаев (746 [718; 769]), E. limosum в 97±0,1% случаев (391 [338; 473] и B. fragillis в 60±2,83% случаев (873 [633; 977]). «Антагонистический» тип взаимодействий был характерен для 67±3,32 % случаев (-415 [-436; -395]) при влиянии супернатантов эубактерий на C. perfringens.

Заключение

В естественных условиях подавляющее большинство микроорганизмов существуют в виде ассоциаций, формирование которых дает определенное преимущество членам микробного сообщества при выживании в различных биотопах организма человека. Не стихающий интерес к изучению механизмов формирования микробных сообществ, особенно облигатно-анаэробных бактерий, также обусловлен их прикладным значением, поскольку данные микроорганизмы часто являются объектом биотехнологических производств и широко используются в составе пробиотических препаратов.

Ранее в работах по исследованию механизмов межмикробных взаимоотношений между различными видами облигатно-анаэробных бактерий было показано изменение ростовых характеристик бактерий. Так, Bartosch S. с соавторами [9] и Rey F.E. с соавторами [10] установили, что сокультивирование штаммов бифидобактерий (B. bifidum и B. ¡actis) приводило к увеличению их роста. В нашей работе, при исследовании ростовых свойств, вкупе с показателями адаптации бактерий (антилизо-цимная активность и биопленкообразование), также были показаны синергидные взаимодействия между различными видами бифидобактерий (B. bifidum/B. longum). В другой работе Bacteroides thetaiotaomicron стимулировал рост Bacteroides hydrogenotrophica. Кроме того, в ассоциации облигатно-анаэробных бактерий происходит обмен генетическим материалом как это было показано на примере Bacteroides spp. и Clostridium spp. [8]. Формирование синергидных связей при совместной утилизации питательных субстратов было исследовано на моделях B. ¡ongum/B. thetaiotaomicron; Bacteroides spp J Clostridium spp.; B. adolescentis/Roseburia spp. и B. adolescentis/E. rectale [11], [12], [13], что также подтверждает полученные нами результаты взаимодействия при влиянии метаболитов облигатно-анаэробных бактерий на их биологические свойства (C. perfringens/ B. fragilis; B. longum/E. limosum; E. limosum/B. fragillis).

Проведенные исследования позволили установить, что помимо ростовых свойств, в

Рисунок 2 - Распространенность типов взаимодействий между облигатно-анаэробными микроорганизмами под действием супернатантов C. perfringens, B. fragillis, E. limosum и P. acnes

ассоциациях облигатно-анаэробных бактерий, происходит изменение биологических свойств (биопленкообразование, антилизоцимная активность), составляющих системообразующий фактор микросимбиоценоза, что вносит вклад

в понимание механизмов формирования ассоциативного симбиоза человека и может иметь значение при создании микробных композиций новых синбиотиков.

02.10.2017

Исследование выполнено при финансовой поддержке Фонда содействия развитию малых форм предприятий в научно-технической сфере (проект конкурса «УМНИК») и инновационных научно-исследовательских и опытно-конструкторских работ аспирантов (соглашение № 24)

Список литературы:

1. Симбиоз и его роль в инфекции / О.В. Бухарин, Е.С. Лобакова, Н.Б. Перунова [и др.]. - Уральский центр академического обслуживания Екатеринбург, 2011. - 300 с.

2. Бухарин, О.В. Микросимбиоценоз / О.В. Бухарин, Н.Б. Перунова. - Екатеринбург, 2014. - 257 с.

3. Перунова, Н.Б. Характеристика биологических свойств микроорганизмов в бактериально-грибковых ассоциациях кишечника человека / Н.Б. Перунова. - Автореф. дис. ... канд. мед. наук.- Оренбург, 2003. - 25 с.

4. Елагина Н.Н. Факторы персистенции неспорообразующей анаэробной микрофлоры кишечника человека. Автореф. дис. ... канд. мед. наук. Оренбург, 2000. - 24 с.

5. Иванова, Е.В. Биологические свойства бифидобактерий и их взаимодействие с микросимбионтами кишечной микрофлоры человека / Е.В. Иванова. - Дис. ... канд. мед. наук. - Оренбург, 2010. - 128 с.

6. O'Toob, G.A. Biofilm formation as microbial development / G.A. O'Toob, H.B. Kaplan, R. Kolter // Ann Rev Microbiol. - 1999. -No. 54. - P. 49-79.

7. Алгоритмы: построение и анализ. Introduction to Algorithms / Т. Кормен, Ч. Лейзерсон, Р. Ривест [и др.]. - М.: Вильямс, 2005. -1296 с.

8. Evidence for extensive resistance gene transfer among Bacteroides spp. and among Bacteroides and other genera in the human colon / N.B. Shoemaker, H. Vlamakis, K. Hayes [et al] // Appl. Environ. Microbiol. - 2001. - No. 67. - P. 561-568.

9. Microbiological effects of consuming a synbiotic containing Bifidobacterium bifidum, Bifidobacterium lactis, and oligofructose in elderly persons, determined by real-time polymerase chain reaction and counting of viable bacteria / S. Bartosch, E.J. Woodmansey, Paterson [et al] // Clin Infect Dis. - 2005. - No 70 (6). - Р. 28-37.

10. Dissecting the in vivo metabolic potential of two human gut acetogens / F.E. Rey, J.J. Faith, J. Bain [et al] // The Journal of biological chemistry. 2010. - No 285 (29) - Р. 22082-22090.

11. Амерханова, А.М. Научно-производственная разработка новых препаратов-синбиотиков и клинико-лабораторная оценка их эффективности / А.М. Амерханова. - Дис. ... д-ра биол. наук. - М., 2009. - 260 с.

12. Шестаков, С.В. Метагеномика микробиома человека / С.В. Шестаков // Успехи современной биологии. - 2010. - Т. 30. - № 6. - С. 531-543.

13. Small intestinal bacterial overgrowth syndrome / J.G. Banwell, L.A. Kistler, R.A. Giannella [et al] // Gastroenterology. - 1981. - No. 80. - P. 834-845.

Сведения об авторах:

Бекпергенова Анастасия Владимировна, научный сотрудник, аспирант Института клеточного и

внутриклеточного симбиоза УрО РАН

460000, г. Оренбург, ул. Пионерская, 11, тел.: 775417; e-mail: [email protected]

Хлопко Юрий Александрович, ведущий научный сотрудник Института клеточного и внутриклеточного симбиоза УрО РАН; д.т.н., 460000, г. Оренбург, ул. Пионерская, 11, тел.: 775417; e-mail: [email protected]

Иванова Елена Валерьевна, доцент, ведущий научный сотрудник Института клеточного и внутриклеточного симбиоза УрО РАН; к.м.н.

460000, г. Оренбург, ул. Пионерская, 11, тел.: 775417; e-mail: [email protected]

Перунова Наталья Борисовна, заведующий лабораторией Института клеточного и внутриклеточного симбиоза УрО РАН; д.м.н.

460000, г. Оренбург, ул. Пионерская, 11, тел.: 775417; e-mail: [email protected]

i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.